| Predicted mutation | |||||||
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_000913 | 1,212,476 | 0 | G | C | 5.4% | 500.3 / 13.7 | 147 | intergenic (‑172/+64) | ymgK/ymgL | protein YmgK/protein YmgL |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (65/74); new base C (2/6); total (67/80) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.91e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.15e-01 | |||||||||||
Only 100 of 155 total aligned reads displayed.
GATAATAATGAATATAAGCATGACATGAGAATAAGGTTTCAATTTTTGAGTTATATAGGAATGATTTAACCTGTTCCTGGCTAAAATACATATAACCGGATGATGACTAAACCAAAATACATGTGCGTTAAGTATTGAAACGGACGTGTGGCACGGCCGTTGTTTTTATAAATATGTTAACCGTTATAAAATAACGTATCAAAAGTCAAGTGATCACATTTCAAATATCAAGTTGATAGTATTAGTCTGGTGATTATTTATGGGTGACAATAAAAAGACAGTATTAATCATCCATAGAG > NC_000913/1212327‑1212625 | gATAATAATGAATATAAGCATGACATGAGAATAAGGTTTCAATTTTTGAGTTATATAGGAATGATTTAACCTGTTCCTGGCTAAAATACATATAACCGGATGATGACTAAACCAAAATACATGTGCGTTAAGTATTGAAACGGACGtgtg < 1:819757/150‑1 (MQ=255)gATAATAATGAATATAAGCATGACATGAGAATAAGGTTTCAATTTTTGAGTTATATAGGAATGATTTAACCTGTTCCTGGCTAAAATACATATAACCGGATGATGACTAAACCAAAATACATGTGCGTTAAGTATTGAAACGGACGtgtg < 1:896069/150‑1 (MQ=255)gATAATAATGAATATAAGCATGACATGAGAATAAGGTTTCAATTTTTGAGTTATATAGGAATGATTTAACCTGTTCCTGGCTAAAATACATATAACCGGATGATGACTAAACCAAAATACATGTGCGTTAAGTATTGAAACGGACGtgtg < 2:340050/150‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |