| Predicted mutation | |||||||
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| RA | NC_000913 | 1,457,530 | G→T | 5.1% | V12L (GTA→TTA) ‡ | paaF → | putative 2,3‑dehydroadipyl‑CoA hydratase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_000913 | 1,457,530 | 0 | G | T | 5.1% | 526.3 / 9.6 | 155 | V12L (GTA→TTA) ‡ | paaF | putative 2,3‑dehydroadipyl‑CoA hydratase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (68/78); new base T (2/6); total (70/85) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.93e-01 | |||||||||||
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Only 100 of 156 total aligned reads displayed.
ATGGAAACCAATTACAGTCTGGAACCGGATGAACTGGCCGCAGGTTATGTGTTGAGTTGCCAGGCACTGCCGCTGACCAGCGATGTGGTGGTTGACTTTGACGCGAAGGGGATGGCATGAGCGAACTGATCGTCAGCCGTCAGCAACGAGTATTGTTGCTGACCCTTAACCGTCCCGCCGCACGTAATGCGCTAAATAATGCCCTGCTGATGCAACTGGTAAATGAACTGGAAGCTGCGGCTACCGATACCAGCATTTCGGTCTGTGTGATTACCGGTAATGCACGCTTTTTTGCCGC > NC_000913/1457381‑1457678 | aTGGAAACCAATTACAGTCTGGAACCGGATGAACTGGCCGCAGGTTATGTGTTGAGTTGCCAGGCACTGCCGCTGACCAGCGATGTGGTGGTTGACTTTGACGCGAAGGGGATGGCATGAGCGAACTGATCGTCAGCCGTCAGCAACGAg > 1:894103/1‑150 (MQ=255) gAAACCAAATACAGTCTGGAACCGGCTCAACTGGCCGCAGGTTATGTGTTGAGTTGCCAGGCACTGCCGCTGACCAGCGAGGTGGTGGGTGACTTTGACGCGAAGGGGATGGCATGAGCGAACTGATCGTCAGCCGGCCGCAACGAGTAt < 2:105644/150‑1 (MQ=255) aaaCCAATTACAGTCTGGAACCGGATGAACTGGCCGCAGGTTATGTGTTGAGTTGCCAGGCACTGCCGCTGCCCAGCGATGTGGTGGTTGACTTTGACGCGAAGGGGATGGCATGAGCGAACTGATCGTCAGCCGTCAGCAACGAGTAtt > 2:1060189/1‑150 (MQ=255) 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ggATGGCATGAGCGAACTGATCGTCAGCCGTCAGCAACGAGTATTGTTGCTGACCCTTAACCGTCCCGCCGCACGTAATGCGCTAAATAATGCCCTGCTGATGCAACTGGTAAATGAACTGGAAGCTGCGGCTACCGATACCAGCATTTc < 1:1167595/150‑1 (MQ=255) aTGGCATGAGCGAACTGATCGTCAGCCGTCAGCAACGAGTATTGTTGCTGACCCTTAACCGTCCCGCCGCACGTAATGCGCTAAATAATGCCCTGCTGATGCAACTGGTAAATGAACTGGAAGCTGCGGCTACCGATACCAGCATTTCgg < 2:646013/150‑1 (MQ=255) tGGCATGAGCGAACTGATCGTCAGCCGTCAGCAACGAGTATTGTTGCTGACCCTTAACCGTCCCGCCGCACGTAATGCGCTAAATAATGCCCTGCTGATGCAACTGGTAAATGAACTGGAAGCTGCGGCTACCGATACCAGCATTTCGGt > 2:466065/1‑150 (MQ=255) tGAGCGAACTGATCGTCAGCCGGCAGCAACGAGTATTGTTGCTGACCCTAAACCGTCCCGCCGCACGTAATGCGCTAAATAATGCCCTGCTGATGCAACTGGTAAATGAACTGGAAGCTGCGGCTACCGATACCAGCATTTCGGTCtgtg < 2:1408073/150‑1 (MQ=255) aGCGAACTGATCGTCAGCCGTCAGCAACGAGTATTGTTGCTGACCCTTAACCGTCCCGCCGCACGTAATGCGCTAAATAATGCCCTGCTGATGCAACTGGTAAATGAACTGGAAGCTGCGGCTACCGATACCAGCATTTCGGTCtgtgtg > 2:522904/1‑150 (MQ=255) gCGAACTGATCGTCAGCCGTCAGCAACGAGTATTGTTGCTGACCCTTAACCGTCCCGCCGCACGTAATGCGCTAAATAATGCCCTGCTGATGCAACTGGTAAATGAACTGGAAGCTGCGGCTAcc > 1:498306/1‑125 (MQ=255) cTGATCGTCAGCCGTCAGCAACGAGTATTGTTGCTGACCCTTAACCGTCCCGCCGCACGTAATGCGCTAAATAATGCCCTGCTGATGCAACTGGTAAATGAACTGGAAGCTGCGGCTACCGATACCAGCATTTCGGTCTGTGTGATTAcc < 1:961196/150‑1 (MQ=255) tGATCGTCAGCCGTCAGCAACGAGTATTGTTGCTGACCCTTAACCGTCCCGCCGCACGTAATGCGCTAAATAATGCCCTGCTGATGCAACTGGTAAATGAACTGGAAGCTGCGGCTACCGATACCAGCATTTCGGTCTGTGTGATTACCg > 1:1362953/1‑150 (MQ=255) tGATCGTCAGCCGTCAGCAACGAGTATTGTTGCTGACCCTTAACCGTCCCGCCGCACGTAATGCGCTAAATAATGCCCTGCTGATGCAACTGGTAAATGAACTGGAAGCTGCGGCTACCGATACCAGCATTTCGGTCTGTGTGATTACCg > 1:1182771/1‑150 (MQ=255) tGATCGTCAGCCGTCAGCAACGAGTATTGTTGCTGACCCTTAACCGTCCCGCCGCACGTAATGCGCTAAATAATGCCCTGCTGATGCAACTGGTAAATGAACTGGAAGCTGCGGCTACCGATACCAGCATTTCGGTCTGTGTGATTACCg > 2:1082514/1‑150 (MQ=255) gtcagccgtcagcAACGAGTATTGTTGCTGACCCTTAACCGTCCCGCCGCACGTAATGCGCTAAATAATGCCCTGCTGATGCAACTGGTAAATGAACTGGAAGCTGCGGCTACCGATACCAGCATTTCGGTCTGTGTGATTACCGGTAAt < 2:195933/150‑1 (MQ=255) gtcagccgtcagcAACGAGTATTGTTGCTGACCCTTAACCGTCCCGCCGCACGTAATGCGCTAAATAATGCCCTGCTGATGCAACTGGTAAATGAACTGGAAGCTGCGGCTACCGATACCAGCATTTCGGTCTGTGTGATTACCGGTAAt > 1:309739/1‑150 (MQ=255) gccgtcagcAACGAGTATTGTTGCTGACCCTTAACCGTCCCGCCGCACGTAATGCGCTAAATAATGCCCTGCTGATGCAACTGGTAAATGAACTGGAAGCTGCGGCTACCGATACCAGCATTTCGGTCTGTGTGATTACCGGTAATGCAc > 2:361508/1‑150 (MQ=255) ggtcagcAACAATACTCGTTGCTGACCCTTAACCGTCCCGCCGCACGTAATGCGCTAAATAATGCCCTGCTGATGCAACTGGTAAATGAACTGGAAGCTGCGGCTACCGATACCAGCATTTCGGTCTGTGTGATTACCGGTAATGCACGc > 1:256420/2‑150 (MQ=255) ggtcagcAACAATACTCGTTGCTGACCCTTAACCGTCCCGCCGCACGTAATGCGCTAAATAATGCCCTGCTGATGCAACTGGTAAATGAACTGGAAGCTGCGGCTACCGATACCAGCATATCGGTCTGTGTGATTACCGGTAATGCACGc > 1:923435/2‑150 (MQ=255) cagcAACGAGTATTGTTGCTGACCCTTAACCGTCCCGCCGCACGTAATGCGCTAAATAATGCCCTGCTGATGCAACTGGTAAATGAACTGGAAGCTGCGGCTACCGATACCAGCATTTCGGTCTGTGTGATTACCGGTAATGCACGCttt < 2:1068688/150‑1 (MQ=255) cAACGAGTATTGTTGCTGACCCTTAACCGTGCCGCCGCACGTAATGCGCTAAATAATGCCCTTCTTATTCAACTTGTAAATGAACTGGTAGCTGCGGCTACCGATTCCAGCATTTCGGTCTGTGTGATTACCGGTAATGCACGCtttttt < 1:1103432/150‑1 (MQ=255) aaCGAGTATTGTTGCTGACCCTTAACCGTCCCGCCGCACGTAATGCGCTAAATAATGCCCTGCTGATGCAACTGGTAAATGAACTGGAAGCTGCGGCTACCGATACCAGCATTTCGGTCTGTGTGATTACCGGTAATGCa < 2:1348651/140‑1 (MQ=255) aaCGAGTATTGTTGCTGACCCTTAACCGTCCCGCCGCACGTAATGCGCTAAATAATGCCCTGCTGATGCAACTGGTAAATGAACTGGAAGCTGCGGCTACCGATACCAGCATTTCGGTCTGTGTGATTACCGGTAATGCACGCTTTTTTg < 2:309739/150‑1 (MQ=255) aCGAGTATTGTTGCTGACCCTTAACCGTCCCGCCGCACGTAATGCGCTAAATAATGCCCTGCTGATGCAACTGGTAAATGAACTGGAAGCTGCGGCTACCGATACCAGCATTTCGGTCTGTGTGATTACCGGTAATGCACGCTTTTTTGc < 2:952515/150‑1 (MQ=255) aGTATTGTTGCTGACCCTTAACCGTCCCGCCGCACGTAATGCGCTAAATAATGCCCTGCTGATGCAACTGGTAAATGAACTGGAAGCTGCGGCTACCGATACCAGCATTTCGGGCTGGGTGATTACCGGTAATGCACGCTTTTTTGCCGc < 2:979590/150‑1 (MQ=255) | ATGGAAACCAATTACAGTCTGGAACCGGATGAACTGGCCGCAGGTTATGTGTTGAGTTGCCAGGCACTGCCGCTGACCAGCGATGTGGTGGTTGACTTTGACGCGAAGGGGATGGCATGAGCGAACTGATCGTCAGCCGTCAGCAACGAGTATTGTTGCTGACCCTTAACCGTCCCGCCGCACGTAATGCGCTAAATAATGCCCTGCTGATGCAACTGGTAAATGAACTGGAAGCTGCGGCTACCGATACCAGCATTTCGGTCTGTGTGATTACCGGTAATGCACGCTTTTTTGCCGC > NC_000913/1457381‑1457678 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |