Predicted mutation | |||||||
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RA | NC_000913 | 1,457,532 | A→C | 5.2% | V12V (GTA→GTC) ‡ | paaF → | putative 2,3‑dehydroadipyl‑CoA hydratase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_000913 | 1,457,532 | 0 | A | C | 5.2% | 483.8 / 15.2 | 154 | V12V (GTA→GTC) ‡ | paaF | putative 2,3‑dehydroadipyl‑CoA hydratase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (68/77); new base C (2/6); total (70/84) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.91e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.31e-01 |
Only 100 of 156 total aligned reads displayed.
GGAAACCAATTACAGTCTGGAACCGGATGAACTGGCCGCAGGTTATGTGTTGAGTTGCCAGGCACTGCCGCTGACCAGCGATGTGGTGGTTGACTTTGACGCGAAGGGGATGGCATGAGCGAACTGATCGTCAGCCGTCAGCAACGAGTATTGTTGCTGACCCTTAACCGTCCCGCCGCACGTAATGCGCTAAATAATGCCCTGCTGATGCAACTGGTAAATGAACTGGAAGCTGCGGCTACCGATACCAGCATTTCGGTCTGTGTGATTACCGGTAATGCACGCTTTTTTGCCGCTGG > NC_000913/1457383‑1457681 | ggAAACCAATTACAGTCTGGAACCGGATGAACTGGCCGCAGGTTATGTGTTGAGTTGCCAGGCACTGCCGCTGACCAGCGATGTGGTGGTTGACTTTGACGCGAAGGGGATGGCATGAGCGAACTGATCGTCAGCCGTCAGCAACGAGTa < 2:200425/150‑1 (MQ=255) gAAACCAATTACACTCTGCAACAGCATGAACTGGCAGCAGGTTATGTGTTGAGTTGCCAGGCACTTCCGATGACCAGAGATGTGCTCGTTGACATTGCCGCGAAGCGGATGGCATGAGCGAACTGATCGTCAGCCGTCAGCAACGAGTAt > 2:1167595/1‑150 (MQ=255) aaaCCAATTACAGTCTGGAACCGGATGAACTGGCCGCAGGTTATGTGTTGAGTTGCCAGGCACTGCCGCTGCCCAGCGATGTGGTGGTTGACTTTGACGCGAAGGGGATGGCATGAGCGAACTGATCGTCAGCCGTCAGCAACGAGTAtt > 2:1060189/1‑150 (MQ=255) ccAATTACAGTCTGGAACCGGATGAACTGGCCGCAGGTTATGTGTTGAGTTGCCAGGCACTGCCGCTGACCAGCGATGTGGTGGTTGACTTTGACGCGAAGGGGATGGCATGAGCGAACTGATCGTCAGCCGTCAGCAACGAGTAttgtt > 1:77181/1‑150 (MQ=255) cAATTACAGTCTGGAACCGGATGAACTGGCCGCAGGTTATGTGTTGAGTTGCCAGGCACTGCCGCTGACCAGCGATGTGGTGGTTGACTTTGACGCGAAGGGGATGGCATGAGCGAACTGATCGTCAGCCGTCAGCAACGAGTAttgttg < 1:407074/150‑1 (MQ=255) tACAGTCTGGAACCGGATGAACTGGCCGCAGGTTATGTGTTGAGTTGCCAGGCACTGCCGCTGACCAGCGATGTGGTGGTTGACTTTGACGCGAAGGGGATGGCATGAGCGAACTGATCGTCAGCCGTCAGCAACGAGTATTGTTGCTGa < 1:78584/150‑1 (MQ=255) aCAGTCTGGACCCGGATGAACTGGCCGCAGGTTATGTGTTGAGTTGCCAGGCACTGCCGCTGACCAGCGATGTGGTTGTTGACTTTGACGCGAAGGGGATGGCATGAGCGAACTGATCGTCAGCCGTCAGCAACAATACTCGTTGCTGAc < 2:1065254/150‑1 (MQ=255) aCAGTCTGGAACCGGATGAACTGGCCGCAGGTTATGTGTTGAGTTGCCAGGCACTGCCGCTGACCAGCGATGTGGTGGTTGACTTTGACGCGAAGGGGATGGCATGAGCGAACTGATCGTCAGCCGTCAGCAACGAGTATTGTTGCTGAc < 1:152941/150‑1 (MQ=255) aCAGTCTGGAACCGGATGAACTGGCCGCAGGTTATGTGTTGAGTTGCCAGGCACTGCCGCTGACCAGCGATGTGGTGGTTGACTTTGACGCGAAGGGGATGGCATGAGCGAACTGATCGTCAGCCGTCAGCAACGAGTATTGTTGCTGAc < 2:1176529/150‑1 (MQ=255) aCAGTCTGGAACCGGATGAACTGGCCGCAGGTTATGTGTTGAGTTGCCAGGCACTGCCGCTGACCAGCGATGTGGTGGTTGACTTTGACGCGAAGGGGAGGGCATGAGCGAACTGATCGTCAGCCGTCAGCAACAATACTCGTTGCTGAc < 1:1081498/150‑1 (MQ=255) cAGTCTGGAACCGGATGAACTGGCCGCAGGTTATGTGTTGAGTTGCCAGGCACTGCCGCTGACCAGCGATGTAGTGGTTGACTTTGACGCGAAGGGGATGGCATGAGCGAACTGATCGTCAGCCGTCAGCAACAATACTCGTTGCTGAcg < 2:274542/150‑2 (MQ=255) aGTCTGGAACCGGATGAACTGGCCGCAGGTTATGTGTTGAGTTGCCAGGCACTGCCGCTGACCAGCGATGTGGTGGTTGACTTTGACGCGAAGGGGATGGCATGAGCGAACTGATCGTCAGCCGTCAGCAACGAGTATTGTTGCTGAccc < 1:110969/150‑1 (MQ=255) aGTCTGGAACCGGATGAACTGGCCGCAGGTTATGTGTTGAGTTGCCAGGCACTGCCGCTGACCAGCGATGTGGTGGTTGACTTTGACGCGAAGGGGATGGCATGAGCGAACTGATCGTCAGCCGTCAGCAACAATACTCGTTGCTGAcgg < 1:483272/150‑3 (MQ=255) gTCTGGAACCGGATGAACTGGCCGCAGGTTATGTGTTGAGTTGCCAGGCACTGCCGCTGACCAGCGATGTGGTGGTTGACTTTGACGCGAAGGGGATGGCATGAGCGAACTGATCGTCAGCCGTCAGCAACGAGTATTGTTGCTGACCCt > 1:213793/1‑150 (MQ=255) gTCTGGAACCGGATGAACTGGCCGCAGGTTATGTGTTGAGATGCCAGGCACTGCCGCTGACCAGCGATGTGGTGGTTGACTTTGACGCGAAGGGGATGGCATGAGCGAACTGATCGTCAGCCGTCAGCAACGAGTATTGTTGCTGACCCt > 2:427168/1‑150 (MQ=255) tGGAACCGGATGAACTGGCCGCAGGTTATGTGTTGAGTTGCCAGGCACTGCCGCTGACCAGCGATGTGGTGGTTGACTTTGACGCGAAGGGGATGGCATGAGCGAACTGATCGTCAGCCGTCAGCAACGAGTATTGTTGCTGACCCTTaa < 1:239626/150‑1 (MQ=255) ggAACCGGATGAACTGGCCGCAGGTTATGTGTTGAGTTGCCAGGCACTGCCGCTGACCAGCGATGTGGTGGTTGACTTTGACGCGAAGGGGATGGCATGAGCGAACTGATCGTCAGCCGTCAGCAACGAGTATTGTTGCTGACCCTTAAc < 1:37689/150‑1 (MQ=255) aCCGGATGAACTGGCCGCAGGTTATGTGTTGAGTTGCCAGGCACTGCCGCTGACCAGCGATGTGGTGGTTGACTTTGACGCGAAGGGGATGGCATGAGCGAACTGATCGTCAGCCGTCAGCAACGAGTATTGTTGCTGACCCTTAACCGt < 2:21789/150‑1 (MQ=255) 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ccGCAGGTTATGTGTTGAGTTGCCAGGCACTGCCGCTGACCAGCGATGTGGTGGTTGACTTTGACGCGAAGGGGATGGCATGAGCGAACTGATCGTCAGCCGTCAGCAACGAGTATTGTTGCTGACCCTTAACCGTCCCGCCGCACGTaa > 2:249690/1‑150 (MQ=255) cAGTTTATGTGTTGAGTTGCCAGGCACTGCCGCTTACCAGCTTTGTGGTGTTTGACTTTGAGGCGATGGGGATGGCTTGTGCTAATTTATCGTCAGCCGTCAGCAACGAGTTTTGTTGCTGACCCTTAACCGTCCCGCCGCACTTAATgc < 2:1243609/150‑1 (MQ=255) ggTTATGTGTTGAGTTGCCAGGCACTGCCGCTGACCAGCGATGTGGTGGTTGACTTTGACGCGAAGGGGATGGCATGAGCGAACTGATCGTCAGCCGTCAGCAACGAGTATTGTTGCTGACCCTTAACCGTCCCGCCGCACGTAATgcgc > 2:664753/1‑150 (MQ=255) tATGTGTTGAGTTGCCAGGCACTGCCGCTGACCAGCGATGTGGTGGTTGACTTTGACGCGAAGGGGATGGCATGAGCGAACTGATCGTCAGCCGTCAGCAACGAGTATTGTTGCTGACCCTTAACCGTCCCGCCGCACGTAATGCGCTaa < 1:1027600/150‑1 (MQ=255) tgtgTTGAGTTGCCAGGCACTGCCGCTGACCAGCGATGTGGTGGTTGACTTTGACGCGAAGGGGATGGCATGAGCGAACTGATCGTCAGCCGTCAGCAACGAGTATTGTTGCTGACCCTTAACCGTCCCGCCGCACGTAATGCGCTAaat < 2:172337/150‑1 (MQ=255) 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cTGATCGTCAGCCGTCAGCAACGAGTATTGTTGCTGACCCTTAACCGTCCCGCCGCACGTAATGCGCTAAATAATGCCCTGCTGATGCAACTGGTAAATGAACTGGAAGCTGCGGCTACCGATACCAGCATTTCGGTCTGTGTGATTAcc > 1:92380/1‑150 (MQ=255) cTGATCGTCAGCCGTCAGCAACGAGTATTGTTGCTGACACTTAACCGTCCCGCCGCACGTAATGCGCTAAATAATGCCCTGCTGATGCAACTGGTAAATGAACTGGAAGCTGCGGCTACCGATACCAGCATTTCGGTCTGTGTGATTAcc > 2:1032215/1‑150 (MQ=255) tGATCGTCAGCCGTCAGCAACGAGTATTGTTGCTGACCCTTAACCGTCCCGCCGCACGTAATGCGCTAAATAATGCCCTGCTGATGCAACTGGTAAATGAACTGGAAGCTGCGGCTACCGATACCAGCATTTCGGTCTGTGTGATTACCg < 2:28969/150‑1 (MQ=255) tGATCGTCAGCCGTCAGCAACGAGTATTGTTGCTGACCCTTAACCGTCCCGCCGCACGTAATGCGCTAAATAATGCCCTGCTGATGCAACTGGTAAATGAACTGGAAGCTGCGGCTACCGATACCAGCATTTCGGTCTGTGTGATTACCg > 1:1362953/1‑150 (MQ=255) tGATCGTCAGCCGTCAGCAACGAGTATTGTTGCTGACCCTTAACCGTCCCGCCGCACGTAATGCGCTAAATAATGCCCTGCTGATGCAACTGGTAAATGAACTGGAAGCTGCGGCTACCGATACCAGCATTTCGGTCTGTGTGATTACCg > 2:1082514/1‑150 (MQ=255) cgtcagccgtcagcAACGAGTATTGTTGCTGACCCTTAACCGTCCCGCCGCACGTAATGCGCTAAATAATGCCCTGCTGATGCAACTGGTAAATGAACTGGAAGCTGCGGCTACCGATACCAGCATTTCGGTCTGTGTGATTACCGGTaa > 1:606058/1‑150 (MQ=255) gtcagccgtcagcAACGAGTATTGTTGCTGACCCTTAACCGTCCCGCCGCACGTAATGCGCTAAATAATGCCCTGCTGATGCAACTGGTAAATGAACTGGAAGCTGCGGCTACCGATACCAGCATTTCGGTCTGTGTGATTACCGGTAAt < 2:195933/150‑1 (MQ=255) gccgtcagcAACGAGTATTGTTGCTGACCCTTAACCGTCCCGCCGCACGTAATGCGCTAAATAATGCCCTGCTGATGCAACTGGTAAATGAACTGGAAGCTGCGGCTACCGATACCAGCATTTCGGTCTGTGTGATTACCGGTAATGCAc > 2:361508/1‑150 (MQ=255) ggtcagcAACAATACTCGTTGCTGACCCTTAACCGTCCCGCCGCACGTAATGCGCTAAATAATGCCCTGCTGATGCAACTGGTAAATGAACTGGAAGCTGCGGCTACCGATACCAGCATTTCGGTCTGTGTGATTACCGGTAATGCACGc > 1:256420/2‑150 (MQ=255) gtcagcAACGAGTATTGTTGCTGACCCTTAACCGTCCCGCCGCACGTAATGCGCTAAATAATGCCCTGCTGATGCAACTGGTAAATGAACTGGAAGCTGCGGCTACCGATACCAGCATTTCGGTCTGTGTGATTACCGGTAATGCCCGCt > 2:320570/1‑150 (MQ=255) gctaCGACTATTGTTGCTGACCCTTAACCGTCCGGCCGCACGTAATGCGCTAATTAATGCCGTGCTGATGCAAGTGGTAAATGAACTGGAAGCTGCGGCTACCGATACCAGCTTTTCGGGCTGTGTGATTACCGGTAATGCACGCttttt < 2:479515/147‑1 (MQ=255) gcAACGAGTATTGTTGCTGACCCTTAACCGTCCCGCCGCACGTAATGCGCTAAATAATGCCCTGCTGATGCAACTGGTAAATGAACTGGAAGCTGCGGCTACCGATACCAGCATTTCGGTCTGTGTGATTACCGGTAATGCACGCttttt < 1:249690/150‑1 (MQ=255) cAACGAGTATTGTTGCTGACCCTTAACCGTGCCGCCGCACGTAATGCGCTAAATAATGCCCTTCTTATTCAACTTGTAAATGAACTGGTAGCTGCGGCTACCGATTCCAGCATTTCGGTCTGTGTGATTACCGGTAATGCACGCtttttt < 1:1103432/150‑1 (MQ=255) aaCGAGTATTGTTGCTGACCCTTAACCGTCCCGCCGCACGTAATGCGCTAAATAATGCCCTGCTGATGCAACTGGTAAATGAACTGGAAGCTGCGGCTACCGATACCAGCATTTCGGTCTGTGTGATTACCGGTAATGCa > 1:1348651/1‑140 (MQ=255) aaCGAGTATTGTTGCTGACCCTTAACCGTCCCGCCGCACGTAATGCGCTAAATAATGCCCTGCTGATGCAACTGGTAAATGAACTGGAAGCTGCGGCTACCGATACCAGCATTTCGGTCTGTGTGATTACCGGTAATGCACGCTTTTTTg < 2:309739/150‑1 (MQ=255) aCGAGTATTGTTGCTGACCCTTAACCGTCCCGCCGCACGTAATGCGCTAAATAATGCCCTGCTGATGCAACTGGTAAATGAACTGGAAGCTGCGGCTACCGATACCAGCATTTCGGTCTGTGTGATTACCGGTAATGCACGCTTTTTTGc < 2:952515/150‑1 (MQ=255) cGAGTATTGTTGCTGACCCTTAACCGTCCCGCCGCACGTAATGCGCTAAATAATGCCCTGCTGATGCAACTGGTAAATGAACTGGAAGCTGCGGCTACCGATACCAGCATTTCGGTCTGTGTGATTACCGGTAATGCACGCTTTTTTGcc < 2:131580/150‑1 (MQ=255) aGTATTGTTGCTGACCCTTAACCGTCCCGCCGCACGTAATGCGCTAAATAATGCCCTGCTGATGCAACTGGTAAATGAACTGGAAGCTGCGGCTACCGATACCAGCATTTCGGTCTGTGTGATTACCGGTAATGCACGCTTTTTTGCCGc > 1:661538/1‑150 (MQ=255) aGTATTGTTGCTGACCCTTAACCGTCCCGCCGCACGTAATGCGCTAAATAATGCCCTGCTGATGCAACTGGTAAATGAACTGGAAGCTGCGGCTACCGATACCAGCATTTCGGGCTGGGTGATTACCGGTAATGCACGCTTTTTTGCCGc < 2:979590/150‑1 (MQ=255) tATTGTTGCTGACCCTTAACCGTCCCGCCGCACGTAATGCGCTAAATAATGCCCTGCTGATGCAACTGGTAAATGAACTGGAAGCTGCGGCTACCGATACCAGCATTTCGGTCTGTGTGATTACCGGTAATGCACGCTTTTTTGCCGCTg < 2:935484/150‑1 (MQ=255) aTTGTTGCTGAACCTTAACCGTCCCGCCGCACGTAATGCGCTAAATAATGCCCTGCTGATGCAACTGGTAAATGAACTGGAAGCTGCGGCTACCGATACCAGCATTTCGGTCTGTGTGATTACCGGTAATGCACGCTTTTTTGCCGCTgg < 1:1164527/150‑1 (MQ=255) | GGAAACCAATTACAGTCTGGAACCGGATGAACTGGCCGCAGGTTATGTGTTGAGTTGCCAGGCACTGCCGCTGACCAGCGATGTGGTGGTTGACTTTGACGCGAAGGGGATGGCATGAGCGAACTGATCGTCAGCCGTCAGCAACGAGTATTGTTGCTGACCCTTAACCGTCCCGCCGCACGTAATGCGCTAAATAATGCCCTGCTGATGCAACTGGTAAATGAACTGGAAGCTGCGGCTACCGATACCAGCATTTCGGTCTGTGTGATTACCGGTAATGCACGCTTTTTTGCCGCTGG > NC_000913/1457383‑1457681 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |