Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 1,526,598 | G→A | 5.7% | A118T (GCT→ACT) | yncG → | putative glutathione S‑transferase YncG |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 1,526,598 | 0 | G | A | 5.7% | 222.9 / 2.6 | 70 | A118T (GCT→ACT) | yncG | putative glutathione S‑transferase YncG |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (30/36); new base A (2/2); total (32/38) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.85e-01 |
GGCGATTGCATTGATGGTTCTCGATCGTCGCCCGGACCTTGCGCCACCGGTTGGGCGCGCCGAACGTCAGCTGTTTCAACGGCTATTGGTCTGGCTGGTTGCTAATGTCTATCCAACATTCACTTTCGCCGATTACCCTGAGCGTTGGGCTCCTGACGCACCTGAACAGTTAAAGAAGAATGTTATTGAATATCGAAAATCGCTTTATATCTGGTTGAATTCGCAGCTCACTGCTGAACCTTATGCGTTTGGTGAGCAACTAACGCTGGTGGACTGTTATCTTTGCACTATGC > NC_000913/1526450‑1526742 | ggcgATTGCATTGATGGTTCTCGATCGTCGCCCGGACCTTGCGCCACCGGTTGGGCGCGCCGAACGTCAGCTGTTTCAACGGCTATTGGTCTGGCTGGTTGCTAATGTCTATCCAACATTCACTTTCGCCGATTACCCTGAGCGTTGGGc > 1:1270604/1‑150 (MQ=255) gATTGCATTGATGGTTCTCGATCGTCGCCCGGACCTTGCGCCACCGGTTGGGCGCGCCGAACGTCAGCTGTTTCAACGGCTATTGGTCTGGCTGGTTGCTAATGTCTATCCAACATTCACTTTCGCCGATTACCCTGAGCGTTGGGCTcc < 2:1088918/150‑1 (MQ=255) gATTGCATTGATGGTTCTCGATCGTCGCCCGGACCTTGCGCCACCGGTTGGGCGCGCCGAACGTCAGCTGTTTCAACGGCTATTGGTCTGGCTGGTTGCTAATGTCTATCCAACATTCACTTTCGCCGATTACCCTGAGCGTTGGGCTcc < 1:921000/150‑1 (MQ=255) ttGATGGTTCTCGATCGTCGCCCGGACCTTGCGCCACCGGTTGGGCGCGCCGAACGTCAGCTGTTTCAACGGCAATTGGTCAGGCTGGTTGCTAAAGTCTATCCAACATTGACATTCGCCGATTACCCAGAGCGTTGGGCTCCTGACGCa > 2:1081185/1‑150 (MQ=255) tctcGATCGTCGCGCGGACCTTGCGCCACCGGTTGGGCGCGCCGAACGTCAGCTGTTTCAACGGCTATTGGTCTGGCTGGTTGCTAATGTCTATCCAACATTCAGTTTCGCCGATTACCCTGAGCGTTGGGCTCCTGACGCACCTGAACa < 2:336212/150‑1 (MQ=255) tcGATCGTCGCCCGGACCTTGCGCCACCGGTTGGGCGCGCCGAACGTCAGCTGTTTCAACGGCTATTGGTCTGGCTGGTTGCTAATGTCTATCCAACATTCACTTTCGCCGATTACCCTGAGCGTTGGGCTCCTGACGCACCTGAACAGt > 1:917390/1‑150 (MQ=255) gATCGTCGCCCGGACCTTGTGCCACCGGTTGGGCGCGCCGAACGTCAGCTGTTTCAACGGCTATTGGTCTGGCTGGTTGCTAATGTCTATCCAACATTCACTTTCGCCGATTACCCTGAGCGTTGGGCTCCTGACGCACCTGAACAGTTa > 2:1170945/1‑150 (MQ=255) tcgtcgCCCGGACCTTGCGCCACCGGTTGGGCGCGCCGAACGTCAGCTGTTTCAACGGCTATTGGTCTGGCTGGTTGCTAATGTCTATCCAACATTCACTTTCGCCGATTACCCTGAGCGTTGGGCTCCTGACGCACCTGAACAGTTaaa < 2:444830/150‑1 (MQ=255) tcgCCCGGACCTTGCGCCACCGGTTGGGCGCGCCGAACGTCAGCTGTTTCAACGGCTATTGGTCTGGCTGGTTGCTAATGTCTATCCAACATTCACTTTCGCCGTTTACCCTGAGCGTTGGGCTCCTGACGCACCTGAACAGTTAaagaa < 2:1295062/150‑1 (MQ=255) ccGGACCTTGCGCCACCGGTTGGGCGCGCCGAACGTCAGCTGTTTCAACGGCTATTGGTCTGGCTGGTTGCTAATGTCTATCCAACATTCACTTTCGCCGATTACCCTGAGCGTTGGGCTCCTGACGCACCTGAACAGTTAAAGAAGAAt > 1:1283203/1‑150 (MQ=255) cGGACCTTGCGCCACCGGTTGGGCGCGCCGAACGTCAGCTGTTTCAACGGCTATTGGTCTGGCTGGTTGCTAATGTCTATCCAACATTCACTTTCGCCGATTAGCCTGAGCGTTGGGCTCCTGACGCACCTGTTCAGTTAAAGAAGAATg < 2:636469/150‑1 (MQ=255) ggACCTTGCGCCACCGGTTGGGCGCGCCGAACGTCAGCTGTTTCAACGGCTATTGGTCTGGCTGGTTGCTAATGTCTATCCAACATTCACTTTCGCCGATTACCCTGAGCGTTGGGCTCCTGACGCACCTGAACAGTTAAAGAAGAATGt < 1:39968/150‑1 (MQ=255) gACCTTGCGCCACCGGTTGGGCGCGCCGAACGTCAGCTGTTTCAACGGCTATTGGTCTGGCTGGTTGCTAATGTCTATCCAACATTCACTTTCGCCGATTACCCTGAGCGTTGGGCTCCTGACGCACCTGAACAGTTAAAGAAGAATGtt < 2:13907/150‑1 (MQ=255) aCCTTGCGCCACCGGTTGGGCGCGCCGAACGTCAGCTGTTTCAACGGCTATTGGTCTGGCTGGTTGCTAATGTCTATCCAACATTCACTTTCGCCGATTACCCTGAGCGTTGGGCTCCTGACGCACCTGAACAGTTAAAGAAGAATGTTa < 1:175318/150‑1 (MQ=255) ccTTGCGCCACCGGTTGGGCGCGCCGAACGTCAGCTGTTTCAACGGCTATTGGTCTGGCTGGTTGCTAATGTCTATCCAACATTCACTTTCGCCGATTACCCTGAGCGTTGGGCTCCTGACGCACCTGAACAGTTAAAGAAGAATGTTAt > 1:655293/1‑150 (MQ=255) ttGCGCCACCGGTTGGGCGCGCCGAACGTCAGCTGTTTCAACGGCTATTGGTCTGGCTGGTTGCTAATGTCTATCCAACATTCACTTTCGCCGATTACCCTGAGCGTTGGGCTCCTGACGCACCTGAACAGTTAAAGAAGAATGTTATTg < 2:1270604/150‑1 (MQ=255) gcgcCACCGGTTGGGCGCGCCGAACGTCAGCTGTTTCAACGGCTATTGGTCTGGCTGGTTGCTAATGTCTATCCAACATTCACTTTCGCCGATTACCCTGAGCGTTGGGCTCCTGACGCACCTGAACAGTTAAAGAAGAATGTTATTGaa < 2:584966/150‑1 (MQ=255) cACCGGTTGGGCGCGCCGAACGTCAGCTGTTTCAACGGCTATTTGTCTGGCTGTTTGCTAATGTCTATCCAACATTCACTTTCGCCGATTACCCTGAGCGTTGGGCTCCTGACGCACCTGAACAGTTAAAGAAGAATGTTATTGAATATc < 1:546627/150‑1 (MQ=255) ccGGTTGGGCGCGCCGAACGTCAGCTGTTTCAACGGCTATTGGTCTGGCTGGTTGCTAATGTCTATCCAACATTCACTTTCGCCGATTACCCTGAGCGTTGGGCTCCTGACGCACCTGAACAGTTAAAGAAGAATGTTATTGAATATCGa < 2:782962/150‑1 (MQ=255) ggTTGGGCGCGCCGAACGTCAGCTGTTTCAACGGCTATTGGTCTGGCTGGTTGCTAATGTCTATCCAACATTCACTTTCGCCGATTACCCTGAGCGTTGGGCTCCTGACGCACCTGAACAGTTAAAGAAGAATGTTATTGAATATCGaaa < 2:394347/150‑1 (MQ=255) gggCGCGCCGAACGTCAGCTGTTTCAACGGCTATTGGTCTGGCTGGTTGCTAATGTCTATCCAACATTCACTTTCGCCGATTACCCTGAGCGTTGGGCTCCTGACGCACCTGAACAGTTAAAGAAGAATGTTATTGAATATCGAAAATCg < 1:1039162/150‑1 (MQ=255) cgcgcCGAACGTCAGCTGTTTCAACGGCTATTGGTCTGGCTGGTTGCTAATGTCTATCCAACATTCACTTTCGCCGATTACCCTGAGCGTTGGGCTCCTGACGCACCTGAACAGTTAAAGAAGAATGTTATTGAATATCGAAAATCGCtt < 1:1332967/150‑1 (MQ=255) cgcgcCGAACGTCAGCTGTTTCAACGGCTATTGGTCTGGCTGGTTGCTAATGTCTATCCAACATTCACTTTCGCCGATTACCCTGAGCGTTGGACTCCTGACGCACCTGAACAGTTAAAGAAGAATGTTATTGAATATCGAAAATCGCtt > 2:165743/1‑150 (MQ=255) cgcgcCGAACGTCAGCTGTTTCAACGGCTATTGGTCTGGCTGGTTGCTAATGTCTATCCAACATTCACTTTCGCCGATTACCCTGAGCGTTGGACTCCTGACGCACCTGAACAGTTAAAGAAGAATGTTATTGAATATCGAAAATCGCtt > 2:381271/1‑150 (MQ=255) cgcgcCGAACGTCAGCTGTTTCAACGGCTATTGGTCTGGCTGGTTGCTAATGTCTATCCAACATTCACTTACGCCGATTACCCTGAGCGTTGGGCTCCTGACGCACCTGAACAGTTAAAGAAGAATGTTATTGAATATCGAAAATCGCtt > 1:730804/1‑150 (MQ=255) gcgcCGAACGTCAGCTGTTTCAACGGCTATTGGTCTGGCTGGTTGCTAATGTCTATCCAACATTCACTTTCGCCGATTACCCTGAGCGTTGGGCTCCTGACGCACCTGAACAGTTAAAGAAGAATGTTATTGAATATCGAAAATCGCttt < 1:1331595/150‑1 (MQ=255) gTCAGCTGTTTCAACGGCTATTGGTCTGGCTGGTTGCTAATGTCTATCCAACATTCACTTTCGCCGATTACCCTGAGCGTTGGGCTCCTGACGCAACTGAACAGTTAAAGAAGAATGTTATTGAATATCGAAAATCGCTTTATATCTGGt > 1:782161/1‑150 (MQ=255) tCAGCTGTTTCAACGGCTATTGGTCTGGCTGGTTGCTAATGTCTATCCAACATTCACTTTCGCCGATTACCCTGAGCGTTGGGCTCCTGACGCACCTGAACAGTTAAAGAAGAATGTTATTGAATATCGAAAATCGCTTTATATCTGGtt < 1:159352/150‑1 (MQ=255) cAGCTGTTTCAACGGCTATTGGTCTGGCTGGTTGCTAATGTCTATCCAACATTCACTTTCGCCGATTACCCTGAGCGTTGGGCTCCTGACGCACCTGAACAGTTAAAGAAGAATGTTATTGAATATCGAAAATCGCTTTATATCTGGTTg < 1:879151/150‑1 (MQ=255) tGTTTCAACGGCTATTGGTCTGGCTGGTTGCTAATGTCTATCCAACATTCACTTTCGCCGATTACCCTGAGCGTTGGGCTCCTGACGCACCTGAACAGTTAAAGAAGAATGTTATTGAATATCGAAAATCGCTTTATATCTGGTTGAAtt > 1:230454/1‑150 (MQ=255) gTTTCAACGGCTATTGGTCTGGCTGGTTGCTAATGTCTATCCAACATTCACTTTCGCCGATTACCCTGAGCGTTGGGCTCCTGACGCACCTGAACAGTTAAAGAAGAATGTTATTGAATATCGAAAATCGCTTTATATCTGGTTGAATTc < 1:686992/150‑1 (MQ=255) tCAACGGCTATTGGTCTGGCTGGTTGCTAATGTCTATCCAACATTCACTTTCGCCGATTACCCTGAGCGTTGGGCTCCTGACGCACCTGAACAGTTAAAGAAGAATGTTATTGAATATCGAAAATCGCTTTATATCTGGTTGAATTCGCa < 2:917390/150‑1 (MQ=255) tCAACGGCTATTGGTCTGGCTGGTTGCTAATGTCTATCCAACATTCACTTTCGCCGATTACCCTGAGCGTTGGGCTCCTGACGCACCTGAACAGTTAAAGAAGAATGTTATTGAATATCGAAAATCGCTTTATATCTGGTTGAATTCGCa < 2:913461/150‑1 (MQ=255) tCAACGGCTATTGGTCTGGCTGGTTGCTAATGTCTATCCAACATTCACTTTCGCCGATTACCCTGAGCGTTGGGCTCCTGACGCACCTGAACAGTTAAAGAAGAATGTTATTGAATATCGAAAATCGCTTTATATCTGGTTGAATTCGCa < 1:976686/150‑1 (MQ=255) aaCGGCTATTGGTCTGGCTGGTTGCTAATGTCTATCCAACATTCACTTTCGCCGATTACCCTGAGCGTTGGGCTCCTGACGCACCTGAACAGTTAAAGAAGAATGTTATTGAATATCGAAAATCGCTTTATATCTGGTTGAATTCGCAGc > 1:658984/1‑150 (MQ=255) aCGGCTATTGGTCTGGCTGGTTGCTAATGTCTATCCAACATTCACTTTCGCCGATTACCCTGAGCGTTGGGCTCCTGACGCACCTGAACAGTTAAAGAAGAATGTTATTGAATATCGAAAATCGCTTTATATCTGGTTGAATTCGCAGCt > 1:102117/1‑150 (MQ=255) cGGCTATTGGTCTGGCTGGTTGCTAATGTCTATCCAACATTCACTTTCGCCGATTACCCTGAGCGTTGGGCTCCTGACGCACCTGAACAGTTAAAGAAGAATGTTATTGAATATCGAAAATCGCTTTATATCTGGTTGAATTCGCAGCTc > 1:1186676/1‑150 (MQ=255) ggTCTGGCTGGTTGCTAATGTCTATCCAACATTCACTTTCGCCGATTACCCTGAGCGTTGGGCTCCTGACGCACCTGAACAGTTAAAGAAGAATGTTATTGAATATCGAAAATCGCTTTATATCTGGTTGAATTCGCAGCTCACTGCTGa > 1:679925/1‑150 (MQ=255) ggTCTGGCTGGTTGCTAATGTCTATCCAACATTCACTTTCGCCGATTACCCTGAGCGTTGGGCTCCTGACGCACCTGAACAGTTAAAGAAGAATGTTATTGAATATCGAAAATCGCTTTATATCTGGTTGAATTCGCAGCTCACTGCTGa > 1:1123442/1‑150 (MQ=255) ctggctggTTGCTAATGTCTATCCAACATTCACTTTCGCCGATTACCCTGAGCGTTGGGCTCCTGACGCACCTGAACAGTTAAAGAAGAATGTTATTGAATATCGAAAATCGCTTTATATCTGGTTGAATTCGCAGCTCACTGCTGAAcc > 2:152857/1‑150 (MQ=255) ggctggTTGCTAATGTCTATCCAACATTCACTTTCGCCGATTACCCTGAGCGTTGGGCTcc < 2:272310/61‑1 (MQ=255) ggctggTTGCTAATGTCTATCCAACATTCACTTTCGCCGATTACCCTGAGCGTTGGGCTcc > 1:272310/1‑61 (MQ=255) gTTGCTAATGTCTATCCAACATTCACTTTCGCCGATTACCCTGAGCGTTGGGCTCCTGACGCACCTGAACAGTTAAAGAAGAATGTTATTGAATATCGAAAATCGCTTTATATCTGGTTGAATTCGCAGCTCACTGCTGAACCTTATGCg > 2:88931/1‑150 (MQ=255) gCTAATGTCTATCCAACATTCACTTTCGCCGATTACCCTGAGCGTTGGGCTCCTGACGCACCTGAACAGTTAAAGAAGAATGTTATTGAATATCGAAAATCGCTTTATATCTGGTTGAATTCGCa < 2:582575/125‑1 (MQ=255) gCTAATGTCTATCCAACATTCACTTTCGCCGATTACCCTGAGCGTTGGGCTCCTGACGCACCTGAACAGTTAAAGAAGAATGTTATTGAATATCGAAAATCGCTTTATATCTGGTTGAATTCGCa > 1:582575/1‑125 (MQ=255) cTAATGTCTATCCAACATTCACTTTCGCCGATTACCCTGAGCGTTGGGCTCCTGACGCACCTGAACAGTTAAAGAAGAATGTTATTGAATATCGAAAATCGCTTTATATCTGGTTGAATTCGCAGCTCACTGCTGAACCTTATGCGTTTg > 1:1205692/1‑150 (MQ=255) tAATGTCTATCCAACATTCACTTTCGCCGATTACCCTGAGCGTTGGGCTCCTGACGCACCTGAACAGTTAAAGAAGAATGTTATTGAATATCGAAAATCGCTTTATATCTGGTTGAATTCGCAGCTCACTGCTGAACCTTATGCGTTTgg < 1:152857/150‑1 (MQ=255) aaTGTCTATCCAACATTCACTTTCGCCGATTACCCTGAGCGTTGGGCTCCTGACGCACATGAACAGTTAAAGAAGAATGTTATTGAATATCGAAAATCGCTTTATATCTGGTTGAATTCGCAGCTCACTGCTGAACCTTATGCGTTTGGt > 2:456724/1‑150 (MQ=255) aTGTCTATCCAACATTCACTTTCGCCGATTACCCTGAGCGTTGGGCTCCTGACGCACCTGAACAGTTAAAGAAGAATGTTATTGAATATCGAAAATCGCTTTATATCTGGTTGAATTCGCAGCGCACTGCTGAACCTTATGCGTTTGGTg < 2:1348781/150‑1 (MQ=255) cTATCCAACATTCACTTTCGCCGATTACCCTGAGCGTTGGGCTCCTGACGCACCTGAACAGTTAAAGAAGAATGTTATTGAATATCGAAAATCGCTTTATATCTGGTTGAATTCGCAGCTCACTGCTGAACCTTATGCGTTTGGTGAGCa > 1:962953/1‑150 (MQ=255) ccAACATTCACTTTCGCCGATTACCCTGAGCGTTGGGCTCCTGACGCACCTGAACAGTTAAAGAAGAATGTTATTGAATATCGAAAATCGCTTTATATCTGGTTGAATTCGCAGCTCACTGCTGAACCTTATGCGTTTGGTGAGCAACTa > 2:252180/1‑150 (MQ=255) ccAACATTCACTTTCGCCGATTACCCTGAGCGTTGGGCTCCTGACGCACCTGAACAGTTAAAGAAGAATGTTATTGAATATCGAAAATCGCTTTATATCTGGTTGAATTCGCAGCTCACTGCTGAACCTTATGCGTTTGGTGAGCAACTa < 2:590102/150‑1 (MQ=255) cAACATTCACTTTCGCCGATTACCCTGAGCGTTGGGCTCCTGACGCACCTGAACAGTTAAAGAAGAATGTTATTGAATATCGAAAATCGCTTTATATCTGGTTGAATTCGCAGCTCACTGCTGAACCTTATGCGTTTGGTGAGCAACTaa > 2:29136/1‑150 (MQ=255) aCATTCACTTTCGCCGATTACCCTGAGCGTTGGGCTCCTGACGCACCTGAACAGTTAAAGAAGAATGTTATTGAATATCGAAAATCGCTTTATATCTGGTTGAATTCGCAGCTCACTGCTGAACCTTATGCGTTTGGTGAGCAACTAACg < 2:132543/150‑1 (MQ=255) aTTCACTTTCTCCTATTACCATGAGCGTTGGGCTACTGACGCACCTGAACAGTTAAAGAAGAATTTTATTGAATATCGAAAATCGCTTTATATCTGGTTGAATTCGCAGCTCACTGCTGAACCTTTTGCGTTTGGTGAGCAACTAACGCt < 2:1266873/150‑1 (MQ=255) ttCACTTTCGCCGATTACCCTGAGCGTTGGGCTCCTGACGCACCTGAACAGTTAAAGAAGAATGTTATTGAATATCGAAAATCGCTTTATATCTGGTTGAATTCGCAGCTCACTGCTGAACCTTATGCGTTTGGTGAGCAACTAACGCtg > 1:165940/1‑150 (MQ=255) tCACTTTCGCCGATTACCCTGAGCGTTGGACTCCTGACGCACCTGAACAGTTAAAGAAGAATGTTATTGAATATCGAAAATCGCTTTATATCTGGTTGAATTCGCAGCTCACTGCTGAACCTTATGCGTTTGGTGAGCAACTAACGCtgg < 1:165743/150‑1 (MQ=255) tCACTTTCGCCGATTACCCTGAGCGTTGGACTCCTGACGCACCTGAACAGTTAAAGAAGAATGTTATTGAATATCGAAAATCGCTTTATATCTGGTTGAATTCGCAGCTCACTGCTGAACCTTATGCGTTTGGTGAGCAACTAACGCtgg < 1:381271/150‑1 (MQ=255) aCTTTCGCCGATTACCCTGAGCGTTGGGCTCCTGACGCACCTGAACAGTTAAAGAAGAATGTTATTGAATATCGAAAATCGCTTTATATCTGGTTGAATTCGCAGCTCACTGCTGAACCTTATGCGTTTGGTGAGCAACTAACGCtggtg < 1:1227141/150‑1 (MQ=255) ccGATTACCCTGAGCGTTTGGCTCCTGACGCACCTGAACAGTTAAAGAAGAATGTTATTGAATATCGAAAATCGCTTTATATCTGGTTGAATTCGCAGCTCACTGCTGAACCTTATGCGTTTGGTGAGCAACTAACGCTGGTGGACTGtt < 2:962953/150‑1 (MQ=255) ccGATTACCCTGAGCGTTGGGCTCCTGACGCACCTGAACAGTTAAAGAAGAATGTTATTGAATATCGAAAATCGCTTTATATCTGGTTGAATTCGCAGCTCACTGCTGAACCTTATGCGTTTGGTGAGCAACTAACGCTGGTGGACTGtt < 2:1283203/150‑1 (MQ=255) aCCCTGAGCGTTGGGCTCCTGACGCACCTGAACAGTTAAAGAAGAATGTTATTGAATATCGAAAATCGCTTTATATCTGGTTGAATTCGCAGCTCACTGCTGAACCTTATGCGTTTGGTGAGCAACTAACGCTGGTGGACTGTTATCttt > 1:805031/1‑150 (MQ=255) aCCCTGAGCGTTGGGCTCCTGACGCACCTGAACAGTTAAAGAAGAATGTTATTGAATATCGAAAATCGCTTTATATCTGGTTGAATTCGCAGCTCACTGCTGAACCTTATGCGTTTGGTGAGCAACTAACGCTGGTGGACTGTTATCttt > 1:965666/1‑150 (MQ=255) cccTGAGCGTTGGGCTCCTGACGCACCTGAACAGTTAAAGAAGAATGTTATTGAATATCGAAAATCGCTTTATATCTGGTTGAATTCGCAGCTCACTGCTGAACCTTATGCGTTTGGTGAGCAACTAACGCTGGTGGACTGTTATCTTTg > 1:2217/1‑150 (MQ=255) cccTGAGCGTTGGGCTCCTGACGCACCTGAACAGTTAAAGAAGAATGTTATTGAATATCGAAAATCGCTTTATATCTGGTTGAATTCGCAGCTCACTGCTGAACCTTATGCGTTTGGTGAGCAACTAACGCTGGTGGACTGTTATCTTTg > 1:565400/1‑150 (MQ=255) cTGAGCGTTGGGCTCCTGACGCACCTGAACAGTTAAAGAAGAATGTTATTGAATATCGAAAATCGCTTTATATCTGGTTGAATTCGCAGCTCACTGCTGAACCTTATGCGTTTGGTGAGCAACTAACGCTGGTGGACTGTTATCTTTGCa < 2:102117/150‑1 (MQ=255) cTGAGCGTTGGGCTCCTGACGCACCTGAACAGTTAAAGAAGAATGTTATTGAATATCGAAAATCGCTTTATATCTGGTTGAATTCGCAGCTCACTGCTGAACCTTATGCGTTTGGTGAGCAACTAACGCTGGTGGACTGTTATCTTTGCa < 2:1205692/150‑1 (MQ=255) tGAGCGTTGGGCTCCTGACGCACCTGAACAGTTAAAGAAGAATGTTATTGAATATCGAAAATCGCTTTATATCTGGTTGAATTCGCAGCTCACTGCTGAACCTTATGCGTTTGGTGAGCAACTAACGCTGGTGGACTGTTATCTTTGCAc < 1:1170945/150‑1 (MQ=255) gCGTTGGGCTCCTGACGCACCTGAACAGTTAAAGAAGAATGTTATTGAATATCGAAAATCGCTTTATATCTGGTTGAATTCGCAGCTCACTGCTGAACCTTATGCGTTTGGTGAGCAACTAACGCTGGTGGACTGTTATCTTTGCACTAt > 1:1045578/1‑150 (MQ=255) gTTGGGCTCCTGACGCACCTGAACAGTTAAAGAAGAATGTTATTGAATATCGAAAATCGCTTTATATCTGGTTGAATTCGCAGCTCACTGCTGAACCTTATGCGTTTGGTGAGCAACTAACGCTGGTGGACTGTTATCTTTGCACTATgc > 2:535099/1‑150 (MQ=255) | GGCGATTGCATTGATGGTTCTCGATCGTCGCCCGGACCTTGCGCCACCGGTTGGGCGCGCCGAACGTCAGCTGTTTCAACGGCTATTGGTCTGGCTGGTTGCTAATGTCTATCCAACATTCACTTTCGCCGATTACCCTGAGCGTTGGGCTCCTGACGCACCTGAACAGTTAAAGAAGAATGTTATTGAATATCGAAAATCGCTTTATATCTGGTTGAATTCGCAGCTCACTGCTGAACCTTATGCGTTTGGTGAGCAACTAACGCTGGTGGACTGTTATCTTTGCACTATGC > NC_000913/1526450‑1526742 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |