Predicted mutation | |||||||
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Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_000913 | 1,567,467 | 0 | G | T | 6.7% | 300.0 / 5.2 | 89 | intergenic (‑248/+37) | yddY/yddW | protein YddY/putative lipoprotein YddW |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (38/45); new base T (2/4); total (40/49) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.87e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.74e-01 |
TTATTTTTCGGTGACAGCGAATATCGTATGGTTTTTCATATTCATACATTTTTATTAGGGATTTATGGCTGTTTAACTAAGTGTGGTTAATTTGACTTAAGTAAGCATGATTATTAGTGGGATAGTTTAAGAGGGTAACAAGCCGGTGGGTAAAGCACCGGCTTGTTACAAAGTAAGAATGGGAGTTTAACTGCCCCAGCGACTTTGCAGATAGCTGACCGCTTGTTGAGTCTGCGGTTTATTCAGATAGTCCTCACGGAACAAGATGGTGCCGCTAATTTCGGGCACAGCATCGTTAA > NC_000913/1567318‑1567616 | ttattCTTCGGTCACAGCGAATATCCTATCGATTTTCATATTCATACATTTTTATTAGGGATTTATCTCGGTTTAACTAACTCGGGTTACTTTGACTTAAGTAAGCATGATTATTAGTGGGATAGTTTAAGAGCGTAACACGCCGGTggg < 2:1281582/150‑1 (MQ=255) attTTTCGGTGACAGCGAATATCGTATGGGTTTTCATATTCATACATTTTTATTAGGGATTTATGGCTGTTTAACTAAGTGTGGTTAATTTGACTTAAGTAAGCATGATTATTAGTGGGATAGTTTAAGAGGGTAACAAGCCGGTGGGTa < 2:1150644/150‑1 (MQ=255) ttttCGGTGACAGCGAATATCGTATGGTTTTTCATATTCATACATTTTTATTAGGGATTTATGGCTGTTTAACTAAGTGTGGTTAATTTGACTTAAGTAAGCATGATTATTAGTGGGATAGTTTAAGAGGGTAACAAGCCGGTGGGTaaa > 2:77659/1‑150 (MQ=255) 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TTATTTTTCGGTGACAGCGAATATCGTATGGTTTTTCATATTCATACATTTTTATTAGGGATTTATGGCTGTTTAACTAAGTGTGGTTAATTTGACTTAAGTAAGCATGATTATTAGTGGGATAGTTTAAGAGGGTAACAAGCCGGTGGGTAAAGCACCGGCTTGTTACAAAGTAAGAATGGGAGTTTAACTGCCCCAGCGACTTTGCAGATAGCTGACCGCTTGTTGAGTCTGCGGTTTATTCAGATAGTCCTCACGGAACAAGATGGTGCCGCTAATTTCGGGCACAGCATCGTTAA > NC_000913/1567318‑1567616 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |