| Predicted mutation | |||||||
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| RA | NC_000913 | 1,692,976 | T→C | 8.5% | T430A (ACG→GCG) | uidB ← | glucuronide:H(+) symporter |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_000913 | 1,692,976 | 0 | T | C | 8.5% | 340.6 / 16.9 | 119 | T430A (ACG→GCG) | uidB | glucuronide:H(+) symporter |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (58/50); new base C (4/6); total (62/57) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.15e-01 | |||||||||||
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Only 100 of 119 total aligned reads displayed.
GGCCATGGCCACTATTTTTCTCATAGTTGCACCTTTGATGTTCTGATTATTTTTATTGAATATTAATTAGTGATATCGCTGATTAATTGCTGCTGCACTTTTTTACGATTATCAATTTCAACCACGATTTCTTTGAATTTTTTATCCGTGAGCGGATAAAACCAGATAATAACGAATGCCAGTAGCATAAATCCGCAAGGTACTAAGGCAATTGATGTGCGGATGCCCATAATAACTTCCGGCGTTTGCACCTGATTGGCGATATATCCGCTTAACCCCAAAATAAAGGCAGGAA > NC_000913/1692828‑1693122 | ggCCATGGCCACTATTTTTCTCATAGTTGCACCTTTGATGTTCTGATTATTTTTATTGAATATTAATTAGTGATATCGCTGATTAATTGCTGCTGCACTTTTTTACGATTATCAATTTCAACCACGATTTCTTTGAATTTTTTATCCGTg < 2:1324425/150‑1 (MQ=255) gCCATGGCCACTATTTTTCTCATAGTTGCACCTTTGATGTTCTGATTATTTTTATTGAATATTAATTAGTGATATCGCTGATTAATTGCTGCTGCACTTTTTTACGATTATCAATTTCAACCACGATTTCTTTGAATTTTTTATCCGTGa > 1:298652/1‑150 (MQ=255) cATGGCCACTATTTTTCTCATAGTTGCACCTTTGATGTTCTGATTATTTTTATTGAATATTAATTAGTGATATCGCTGATTAATTGCTGCTGCACTTTTTTACGATTATCAATTTCAACCACGATTTCTTTGAATTTTTTATCCGTGAGc < 2:125963/150‑1 (MQ=255) 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cACGATTTCTTTGAATTTTTTATCCGTGAGCGGATAAAACCAGATAATAACGAATGCCAGTAGCATAAATCCGCAAGGTACTAAGGCAATTGATGTGCGGATGCCCATAATAACTTCCGGCGTTTGCACCTGATTGGCGATATATCCGCt < 2:569934/150‑1 (MQ=255) cACGATTTCTTTGAATTTTTTATCCGTGAGCGGATAAAACCAGATAATAACGAATGCCAGTAGCATAAATCCGCAAGGTACTAAGGCAATTGATGTGCGGATGCCCATAATAACTTCCGGCGTTTGCACCTGATTGGCGATATATCCGCt > 2:943419/1‑150 (MQ=255) tttCTTTGAATTTTTTATCCGTGAGCGGATAAAACCAGATAATAACGAATGCCAGTAGCATAAATCCGCAAGGTACTAAGGCAATTGATGTGCGGATGCCCATAATAACTTCCGGCGTTTGCACCTGATTGGCGATATATCCGCTTAAcc > 2:487291/1‑150 (MQ=255) ttCTTTGAATTTTTTATCCGTGAGCGGATAAAACCAGATAATAACGAATGCCAGTAGCATAAATCCGCAAGGTACTAAGGCAATTGATGTGCGGATGCCCATAATAACTTCCGGCGTTTGCACCTGATTGGCGATATATCCGCTTAAccc < 1:1331477/150‑1 (MQ=255) cTTTGAATTTTTTATCCGTGAGCGGATAAAACCAGATAATAACGAATGCCAGTAGCATAAATCCGCAAGGTACTAAGGCAATTGATGTGCGGATGCCCATAATAACTTCCGGCGTTTGCACCTGATTGGCGATATATCCGCTTAACCCCa > 1:1422310/1‑150 (MQ=255) 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tttATCCGTGAGCGGATAAAACCAGATAATAACGAATGCCAGTAGCATAAATCCGCAAGGTACTAAGGCAATTGATGTGCGGATGCCCATAATAACTTCCGGCGTTTGCACCTGATTGGCGATATATCCGCTTAACCCCAAAATAAAGGc < 2:611298/150‑1 (MQ=255) ccGTGAGCGGATAAAACCAGATAATAACGAATGCCAGTAGCATAAATCCGCAAGGTACTAAGGCAATTGATGTGCGGATGCCCATAATAACTTCCGGCGTTTGCACCTGATTGGCGATATATCCGCTTAACCCCAAAATAAAGGCAGGaa > 2:1418582/1‑150 (MQ=255) | GGCCATGGCCACTATTTTTCTCATAGTTGCACCTTTGATGTTCTGATTATTTTTATTGAATATTAATTAGTGATATCGCTGATTAATTGCTGCTGCACTTTTTTACGATTATCAATTTCAACCACGATTTCTTTGAATTTTTTATCCGTGAGCGGATAAAACCAGATAATAACGAATGCCAGTAGCATAAATCCGCAAGGTACTAAGGCAATTGATGTGCGGATGCCCATAATAACTTCCGGCGTTTGCACCTGATTGGCGATATATCCGCTTAACCCCAAAATAAAGGCAGGAA > NC_000913/1692828‑1693122 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |