Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 1,822,072 | A→T | 5.9% | I62N (ATC→AAC) ‡ | osmE ← | osmotically‑inducible lipoprotein OsmE |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 1,822,072 | 0 | A | T | 5.9% | 272.2 / 5.3 | 84 | I62N (ATC→AAC) ‡ | osmE | osmotically‑inducible lipoprotein OsmE |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (42/37); new base T (2/3); total (44/40) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.65e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.33e-01 |
CGCAGCCTGTGGATCAGTGTCGTATTCAGCACAGGTCTGATAACCGGAGTTGATGACATGTCCGGTATCATCTAACGCGACAAAGTAGGTTTCTGCTTTACCATCACGTTGACCCAGGATGTAGGTCTGGCAAGTACCGCGAGCATGGATCATGCTCACTTCAGACGAAGGTTTACCCGCAATTTGTGCAACCTGCGCCCGGCTCATGCCTTTTTTGACGTCTTTCACCACAGGCTGTACAAACTGGTCTTTGGTACGATCATAAGCCGTACAACCCGCCAGCATGGTTAATACCGCC > NC_000913/1821924‑1822221 | cGCAGCCTGTGGATCAGTGTCGTATTCAGCACAGGTCTGATAACCGGAGTTGATGACATGTCCGGTATCATCTAACGCGACAAAGTAGGTTTCTGCTTTACCATCACGTTGACCCAGGATGTAGGTCTGGCAAGTACCGCGAGCATGGAt > 2:272177/1‑150 (MQ=255) gCCTGTGGATCAGTGTCGTATTCAGCACAGGTCTGATAACCGGAGTTGATGACATGTCCGGTATCATCTAACGCGACAAAGTAGGTTTCTGCTTTACCATCACGTTGACCCAGGATGTAGGTCTGGCAAGTACCGCGAGCATGGATCATg > 2:599527/1‑150 (MQ=255) cTGTGGATCAGTGTCGTATTCAGCACAGGTCTGATAACCGGAGTTGATGACATGTCCGGTATCATCTAACGCGACAAAGTAGGTTTCTGCTTTACCATCACGTTGACCCAGGATGTAGGTCTGGCAAGTACCGCGAGCATGGATc < 1:718512/145‑1 (MQ=255) cTGTGGATCAGTGTCGTATTCAGCACAGGTCTGATAACCGGAGTTGATGACATGTCCGGTATCATCTAACGCGACAAAGTAGGTTTCTGCTTTACCATCACGTTGACCCAGGATGTAGGTCTGGCAAGTACCGCGAGCATGGATc > 2:718512/1‑145 (MQ=255) ggATCAGTGTCGTATTCAGCACAGGTCTGATAACCGGAGTTGATGACATGTCCGGTATCATCTAACGCGACAAAGTAGGTTTCTGCTTTACCATCACGTTGACCCAGGATGTAGGTCTGGCAAGTACCGCGAGCATGGATCATACTCACt < 2:24409/150‑1 (MQ=255) ggATCAGTGTCGTATTCAGCACAGGTCTGATAACCGGAGTTGATGACATGTCCGGTATCATCTAACGCGACAAAGTAGGTTTCTGCTTTACCATCACGTTGACCCAGGATGTAGGTCTGGCAAGTACCGCGAGCATGATCCATGCTcgcg < 2:331898/150‑4 (MQ=255) gATCAGTGTCGTATTCAGCACAGGTCTGATAACCGGAGTTGATGACATGTCCGGTATCATCTAACGCGACAAAGTAGGTTTCTGCTTTACCATCACGTTGACCCAGGATGTAGGTCTGGCAAGTACCGCGAGCATGATCCATGCTcgcgg < 2:1180285/150‑5 (MQ=255) aTCAGTGTCGTATTCAGCACAGGTCTGATAACCGGAGTTGATGACATGTCCGGTATCATCTAACGCGACAAAGTAGGTTTCTGCTTTACCATCACGTTGACCCAGGATGTAGGTCTGGCAAGTACCGCGAGCATGGATCATGCTCACTTc < 1:1165959/150‑1 (MQ=255) aTCAGTGTCGTATTCAGCACAGGTCTGATAACCGGAGTTGATGACATGTCCGGTATCATCTAACGCGACAAAGTAGGTTTCTGCTTTACCATCACGTTGACCCAGGATGTAGGTCTGGCAAGTACCGCGAGCATGATCCATGCTcgcggt < 2:442850/150‑6 (MQ=255) cAGTGTCGTATTCAGCACAGGTCTGATAACCGGAGTTGATGACATGTCCGGTATCATCTAACGCGACAAAGTAGGTTTCTGCTTTACCATCACGTTGACCCAGGATGTAGGTCTGGCAAGTACCGCGAGCATGGATCATGCTCACTTCAg < 2:1084487/150‑1 (MQ=255) gtgtCGTATTCAGCACAGGTCTGATAACCGGAGTTGATGACATGTCCGGTATCATCTAACGCGACAAAGTAGGTTTCTGCTTTACCATCACGTTGACCCAGGATGTCGGTCTGGCAAGTACCGCGAGCATGGATCATGCTCACTTCAGAc < 2:740872/150‑1 (MQ=255) aTTCAGCACAGGTCTGATAACCGGAGTTGATGACATGTCCGGTATCATCTAACGCGACAAAGTAGGTTTCTGCTTTACCATCACGTTGACCCAGGATGTAGGTCTGGCAAGTACCGCGAGCATGGATCATGCTCACTTCAGACGAAGGtt > 2:319415/1‑150 (MQ=255) tCAGCACAGGTCTGATAACCGGAGTCGATGACATGTCCGGTATCATCTAACGCGACAAAGTAGGTTTCTGCTTTACCATCACGTTGACCCAGGATGTAGGTCTGGCAAGTACCGCGAGCATGGATCATGCTCACTTCAGACGAAGGTTTa < 1:272177/150‑1 (MQ=255) caGGTCTGATAACCGGAGTTGATGACATGTCCGGTATCATCTAACGCGACAAAGTAGGTTTCTGCTTTACCATCACGTTGACCCAGGATGTAGGTCTGGCAAGTACCGCGAGCATGGATCATGCTCACTTCAGACGAAGGTTTACCCGCa < 1:268436/150‑1 (MQ=255) gATAACCGGAGTTGATGACATGTCCGGTATCATCTAACGCGACAAAGTAGGTTTCTGCTTTACCATCACGTTGACCCAGGATGTAGGTCTGGCAAGTACCGCGAGCATGGATCATGCTCACTTCAGACGAAGGTTTACCCGCAATTtgtg > 1:1257423/1‑150 (MQ=255) gATAACCGGAGTTGATGACATGTCCGGTATCATCTAACGCGACAAAGTAGGTTTCTGCTTTACCATCACGTTGACCCAGGATGTAGGTCTGGCAAGTACCGCGAGCATGGATCATGCTCACTTCAGACGAAGGTTTACCCGCAATTtgtg < 2:1257918/150‑1 (MQ=255) gATAACCGGAGTTGATGACATGTCCGGTATCATCTAACGCGACAAAGTAGGTTTCTGCTTTACCATCACGTTGACCCAGGATGTAGGTCTGGCAAGTACCGCGAGCATGGATCATGCTCACTTCAGACGAAGGTTTACCCGCAATTtgtg > 1:1255423/1‑150 (MQ=255) gATAACCGGAGTTGATGACATGTCCGGTATCATCTAACGCGACAAAGTAGGTTTCTGCTTTACCATCACGTTGACCCAGGATGTAGGTCTGGCAAGTACCGCGAGCATGGATCATGCTCACTTCAGACGAAGGTTTACCCGCAATTtgtg > 2:891053/1‑150 (MQ=255) gATAACCGGAGTTGATGACATGTCCGGTATCATCTAACGCGACAAAGTAGCTTTCTGCTTTACCATCACGTTGACCCAGGATGTAGGTCTGGCAAGTAACGCGATAATGGATCATGCTAACTTCAGACGAAGTTTTACCCGCAATTtctg > 2:973576/1‑150 (MQ=255) aTAACCGGAGTTGATGACATGTCCGGTATCATCTAACGCGACAAAGTAGGTTTCTGCTTTACCATAACGTTGACCCAGGATGTAGGTCTGGCAAGTACCGCGAGAATGGATCATGCTCACTTCAGACGAAGGTTTACCCGCAATTTGTGc > 2:470562/1‑150 (MQ=255) tAACCGGAGTTGATGACATGTCCGGTATCATCTAACGCGACAAAGTAGGTTTCTGCTTTACCATCACGTTGACCCAGGATGTAGGTCTGGCAAGTACCGCGAGCATGGATCATGCTCACTTCAGACGAAGGTTTACCCGCAATTTGTGCa < 1:1053319/150‑1 (MQ=255) ccGGAGTTGATGACATGTCCGGTATCATCTAACGCGACAAAGTAGGTTTCTGCTTTACCATCACGTTGACCCAGGATGTAGGTCTGGCAAGTACCGCGAGCATGGATCATGCTCACTTCAGACGAAGGTTTACCCGCAATTTGTGCAAcc > 2:518892/1‑150 (MQ=255) ccGGAGTTGATGACATGTCCGGTATCATCTAACGCGACAAAGTAGGTTTCTGCTTTACCATCACGTTGACCCAGGATGTAGGTCTGGCAAGTACCGCGAGCATGGATCATGCTCACTTCAGACGAAGGTTTACCCGCAATTTGTGCAAcc > 1:296708/1‑150 (MQ=255) tgaCATGTCCGGTATCATCTAACGCGACAAAGTAGGTTTCTGCTTTACCATCACGTTGACCCAGGATGTAGGTCTGGCAAGTACCGCGAGCATGGATCATGCTCACTTCAGACGAAGGTTTACCCGCAATTTGTGCAACCTGCGCCCGGc > 2:140793/1‑150 (MQ=255) gaCATGTCCGGTATCATCTAACGCGACAAAGTAGGTTTCTGCTTTACCATCACGTTGACCCAGGATGTAGGTCTGGCAAGTACCGCGAGCATGGATCATGCTCACTTCAGACGAAGGTTTACCCGCAATTTGTGCAACCTGCGCCCGGCt < 1:891053/150‑1 (MQ=255) gaCATGTCCGGTATCATCTAACGCGACAAAGTAGGTTTCTGCTTTACCATCACGTTGACCCAGGATGTAGGTCTGGCAAGTACCGCGAGCATGGATCATGCTCACTTCAGACGAAGGTTTACCCGCAATTTGTGCAACCTGCGCCCGGCt < 2:282273/150‑1 (MQ=255) aCATGTCCGGTATCATCTAACGCGACAAAGTAGGTTTCTGCTTTACCATCACGTTGACCCAGGATGTAGGTCTGGCAAGTACCGCGAGCATGGATCATGCTCACTTCAGACGAAGGTTTACCCGCAATTTGTGCAACCTGCGCCCGGCTc < 2:759345/150‑1 (MQ=255) cATGTCCGGTATCATCTAACGCGACAAAGTAGGTTTCTGCTTTACCATCACGTTGACCCAGGATGTAGGTCTGGCAAGTACCGCGAGCATGGATCATGCTCACTTCAGACGAAGGTTTACCCGCAATTTGTGGAACCTGCGCCCGGCTCa > 2:693588/1‑150 (MQ=255) aTGTCCGGTATCATCTAACGCGACAAAGTAGGTTTCTGCTTTACCATCACGTTGACCCAGGATGTAGGTCTGGCAAGTACCGCGAGCATGGATCATGCTCACTTCAGACGAAGGTTTACCCGCAATTTGTGCAACCTGCGCCCGGCTCAt < 1:9540/150‑1 (MQ=255) aTGTCCGGTATCATCTAACGCGACAAAGTAGGTTTCTGCTTTACCATCACGTTGACCCAGGATGTAGGTCTGGCAAGTACCGCGAGCATGGATCATGCTCACTTCAGACGAAGGTTTACCCGCAATTTGTGCAACCTGCGCCCGGCTCAt < 2:727104/150‑1 (MQ=255) gTCCGGTATCATCTAACGCGACAAAGTAGGTTTCTGCTTTACCATCACGTTGACCCAGGATGTAGGTCTGGCAAGTACCGCGAGCATGGATCATGCTCACTTCAGACGAAGGTTTACCCGCAATTTGTGCAACCTGCGCCCGGc > 2:1181368/1‑144 (MQ=255) gTCCGGTATCATCTAACGCGACAAAGTAGGTTTCTGCTTTACCATCACGTTGACCCAGGATGTAGGTCTGGCAAGTACCGCGAGCATGGATCATGCTCACTTCAGACGAAGGTTTACCCGCAATTTGTGCAACCTGCGCCCGGc < 1:1181368/144‑1 (MQ=255) gTCCGGTATCATCTAACGCGACAAAGTAGGTTTCTGCTTTACCATCACGTTGACCCAGGATGTAGGTCTGGCAAGTACCGCGAGCATGGATCATGCTCACTTCAGACGAAGGTTTACCCGCAATTTGTGCAACCTGCGCCCGGCTCATGc > 2:393119/1‑150 (MQ=255) gTCCGGTATCATCTAACGCGACAAAGTAGGTTTCTGCTTTACCATCACGTTGACCCAGGATGTAGGTCTGGCAAGTACCGCGAGCATGGATCATGCTCACTTCAGACGAAGGTTTACCCGCAATTTGTGCAACCTGCGCCCGGCTCATGc > 2:1313957/1‑150 (MQ=255) tATCATCTAACGAGACAAAGTAGGTTTCTGCTTTACCATCACGTTGACCCAGGATGTAGGGCTGGCAAGTACCGCGAGCATGGATCATGCTCACTTCAGACGAAGGTTTACCCGCAATTTGTGCAACCTGCGCCCGGCTCATGCCttttt < 1:333193/150‑1 (MQ=255) atcatcTAACGCGACAAAGTAGGTTTCTGCTTTACCATCACGTTGACCCAGGATGTAGGTCTGGCAAGTACCGCGAGCATGGATCATGCTCACTTCAGACGAAGGTTTACCCGCAATTTGTGCAACCTGCGCCCGGCTCATGCCtttttt > 1:420847/1‑150 (MQ=255) tcatcTAACGCGACAAAGTAGGTTTCTGCTTTACCATCACGTTGACCCAGGATGTAGGTCTGGCAAGTACCGCGAGCATGGATCATGCTCACTTCAGACGAAGGTTTACCCGCAATTTGTGCAACCTGCGCCCGGCTCATGCCTTTTTTg < 2:137548/150‑1 (MQ=255) tcatcTAACGCGACAAAGTAGGTTTCTGCTTTACCATCACGTTGACCCAGGATGTAGGTCTGGCAAGTACCGCGAGCATGGATCATGCTCACTTCAGACGAAGGTTTACCCGCAATTTGTGCAACCTGCGCCCGGCTCATGCCTTTTTTg < 2:399025/150‑1 (MQ=255) catcTAACGCGACAAAGTAGGTTTCTGCTTTACCATCACGTTGACCCAGGATGTAGGTCTGGCAAGTACCGCGAGCATGGATCATGCTCACTTCAGACGAAGGTTTACCCGCAATTTGTGCAACCTGCGCCCGGCTCATGCCTTTTTTGa > 1:1017007/1‑150 (MQ=255) atcTAACGCGACAAAGTAGGTTTCTGCTTTACCATCACGTTGACCCAGGATGTAGGTCTGGCAAGTACCGCGAGCATGGATCATGCTCACTTCAGACGAAGGTTTACCCGCAATTTGTGCAACCTGCGCCCGGCTCATGCCTTTTTTGAc > 1:454512/1‑150 (MQ=255) atcTAACGCGACAAAGTAGGTTTCTGCTTTACCATCACGTTGACCCAGGATGTAGGTCTGGCAAGTACCGCGAGCATGGATCATGCTCACTTCAGACGAAGGTTTACCCGCAATTTGTGCAACCTGCGCCCGGCTCATGCCTTTTTTGAc > 2:551305/1‑150 (MQ=255) tcTAACGCGACAAAGTAGGTTTCTGCTTTACCATCACGTTGACCCAGGATGTAGGTCTGGCAAGTACCGCGAGCATGGATCATGCTCACTTCAGACGAAGGTTTACCCGCAATTTGTGCAACCTGCGCCCGGCTCATGCCTTTTTTGACg < 2:1174020/150‑1 (MQ=255) gcgACAAAGTAGGTTTCTGCTTTACCATCACGTTGACCCAGGATGTAGGTCTGGCAAGTACCGCGAGCATGGATCATGCTCACTTCAGACGAAGGTTTACCCGCAATTTGTGCAACCTGCGCCCGGCTCATGCCTTTTTTGACGTCTTTc < 1:259178/150‑1 (MQ=255) aaaaGTAGGTTTCTGCTTTACCATCACGTGGACCCAGTTTGAAGGGCTGGCAAGTA‑CGCGAGCATGGATCATGCTCACTTCAGACGAAGGTTTACCCGCAATTTGTGCAACCTGCGCCCGGCTCATACCTTTTTTGACGTCTTTcaccac < 1:922225/149‑1 (MQ=255) aaaGTAGGTTTCTGCTTTACCATCACGTTGACCCAGGATGTAGGTCTGGCAAGTACCGCGAGCATGGATCATGCTCACTTCAGACGAAGGTTTACCCGCAATTTGTGCAACCTGCGCCCGGCTCATGCCCTTTTTGACGTCTTTcaccac < 2:296708/150‑1 (MQ=255) gTTTCTGCTTTACCATCACGTTGACCCAGGATGTAGGTCTGGCAAGTACCGCGAGCATGGATCATGCTCACTTCAGACGAAGGTTTACCCGCAATTTGTGCAACCTGCGCCCGGCTCATGCCTTTTTTGACGTCTTTCACCACAGGCTGt > 1:542667/1‑150 (MQ=255) tttCTGCTTTACCATCACGTTGACCCAGGATGTAGGTCTGGCAAGTACCGCGAGCATGGATCATGCTCACTTCAGACGAAGGTTTACCCGCAATTTGTGCAACCTGCGCCCGGCTCATGCCTTTTTTGACGTCTTTCACCACAGGCTGTa < 1:599527/150‑1 (MQ=255) ttCTGCTTTACCATCACGTTGACCCAGGATGTAGGTCTGGCAAGTACCGCGAGCATGGATCATGCTCACTTCAGACGAAGGTTTACCCGCAATTAGTGCAACCTGCGCCCGGCTCATGCCTTTTTTGACGTCTTTCACCACAGGCTGTAc > 1:575800/1‑150 (MQ=255) cTGCTTTACCATCACGTTGACCCAGGATGTAGGTCTGGCAAGTACCGCGAGCAAGGATCAAGCTCACTTCAGACGAAGGTTTACCCGCAATTTGTGCAACATGCCCCCGGCTCATGCATTTTTTGACCTCTTTCACCACAGGAAGTACaa > 2:1299850/1‑150 (MQ=255) tGCTTTACCATCACGTTGACCCAGGATGTAGGTCTGGCAAGTACCGCGAGCATGGATCATGCTCACTTCAGACGAAGGTTTACCCGCAATTTGTGCAACCTGCGCCCGGCTCATGCCTTTTTTGACGTCTTTCACCACAGGCTGTACaaa > 1:731453/1‑150 (MQ=255) gCTTTACCATCACGTTGACCCAGGATGTAGGTCTGGCAAGTACCGCGAGCATGGATCATGCTCACTTCAGACGAAGGTTTACCCGCAATTTGTGCAACCTGCGCCCGGCTCATGCCTTTTTTGACGTCTTTCACCACAGGCTGTACAAAc > 2:624987/1‑150 (MQ=255) ttACCATCACGTTGACCCAGGATGTAGGTCTGGCAAGTACCGCGAGCATGGATCATGCTCACTTCAGACGAAGGTTTACCCGCAATTTGTGCAACCTGCGCCCGGCTCATGCCTTTTTTGACGTCTTTCACCACAGGCt < 2:1249470/139‑1 (MQ=255) ttACCATCACGTTGACCCAGGATGTAGGTCTGGCAAGTACCGCGAGCATGGATCATGCTCACTTCAGACGAAGGTTTACCCGCAATTTGTGCAACCTGCGCCCGGCTCATGCCTTTTTTGACGTCTTTCACCACAGGCt > 1:1249470/1‑139 (MQ=255) aCCATCACGTTGACCCAGGATGTAGGTCTGGCAAGTACCGCGAGCATGGATCATGCTCACTTCAGACGAAGGTTTACCCGCAATTTGTGCAACCTGCGCCCGGCTCATGCCTTTTTTGACGTCTTTCACCACAGGCTGTACAAACTGGTc < 1:973576/150‑1 (MQ=255) cATCACGTTGACCCAGGATGTAGGTCTGGCAAGTACCGCGAGCATGGATCATGCTCACTTCAGACGAAGGTTTACCCGCAATTTGTGCAACCTGCGCCCGGCTCATGCCTTTTTTGACGTCTTTCACCACAGGCTGTACAAACTGGTCtt > 2:54880/1‑150 (MQ=255) aTCACGTTGACCCAGGATGTAGGTCTGGCAAGTACCGCGAGCATGGATCATGCTCACTTCAGACGAAGGTTTACCCGCAATTTGTGCAACCTGCGCCCGGCTCATGCCTTTTTTGACGTCTTTCACCACAGGCTGTACAAACTGGTCttt > 1:742422/1‑150 (MQ=255) cACGTTGACCCAGGATGTAGGTCTGGCAAGTACCGCGAGCATGGATCATGCTCACTTCAGACGAAGGTTTACCCGCAATTTGTGCAACCTGCGCCCGGCTCATGCCTTTTTTGACGTCTTTCACCACAGGCTGTACAAACTGGTCTTTgg < 1:1368415/150‑1 (MQ=255) aCGTTGACCCAGGATGTAGGTCTGGCAAGTACCGCGAGCATGGATCATGCTCACTTCAGACGAAGGTTTACCCGCAATTTGTGCAACCTGCGCCCGGCTCATGCCTTTTTTGACGTCTTTCACCACAGGCTGTACAAACTGGTCTTTGGt < 1:1063120/150‑1 (MQ=255) cGTTCACCCAGGATGTAGGTCTGGCAAGTACCGCGAGCATGGATCATGCTCACTTCAGACGAAGGTTTACCCGCAATTTGTGCCACCTGCGCCCGGCTCATGCCTTTTTTGACGTCTTTCACCACAGGCTGTACAAACTGGTCTTTGGTa > 2:409390/1‑150 (MQ=255) aCCCAGGATGTAGGTCTGGCAAGTACCGCGAGCATGGATCATGCTCACTTCAGACGAAGGTTTACCCGCAATTTGTGCAACCTGCGCCCGGCTCATGCCTTTTTTGACGTCTTTCACCACAGGCTGTACAAACTGGTCTTTGGTACGATc < 2:477178/150‑1 (MQ=255) ccAGGATGTAGGTCTGGCAAGTACCGCGAGCATGGATCATGCTCACTTCAGACGAAGGTTTACCCGCAATTTGTGCAACCTGCGCCCGGCTCATGCCTTTTTTGACGTCTTTCACCACAGGCTGTACAAACTGGTCTTTGGTACGATCAt < 2:731453/150‑1 (MQ=255) ccAGGATGTAGGTCTGGCAAGTACCGCGAGCATGGATCATGCTCACTTCAGACGAAGGTTTACCCGCAATTTGTGCAACCTGCGCCCGGCTCATGCCTTTTTTGACGTCTTTCACCACAGGCTGTACAAACTGGTCTTTGGTACGATCAt < 2:420847/150‑1 (MQ=255) tGTAGGTCTGGCAAGTACCGCGAGCATGGATCATGCTCACTTCAGACGAAGGTTTACCCGCAATTTGTGCAACCTGCGCCCGGCTCATGCCTTTTTTGACGTCTTTCACCACAGGCTGTACAAACTGGTCTTTGGTACGATCATAAGCCg > 1:454533/1‑150 (MQ=255) ggTCTGGCAAGTACCGCGAGCATGGATCATGCTCACTTCAGACGAAGGTTTACCCGCAATTTGTGCAACCTGCGCCCGGCTCATGCCTTTTTTGACGTCTTTCACCACAGGCTGTACAAACTGGTCTTTGGTACGATCATAAGCCGTACa > 1:1422671/1‑150 (MQ=255) ggTCTGGCAAGTACCGCGAGCATGGATCATGCTCACTTCAGACGAAGGTTTACCCGCAATTTGTGCAACCTGCGCCCGGCTCATGCCTTTTTTGACGTCTTTCACCACAGGCTGTACAAACTGGTCTTTGGTACGATCATAAGCCGTACa < 2:742422/150‑1 (MQ=255) tGGCAAGTACCGCGAGCATGGATCATGCTCACTTCAGACGAAGGTTTACCCGCAATTTGTGCAACCTGCGCCCGGCTCATGCCTTTTTTGACGTCTTTCACCACAGGCTGTACAAACTGGTCTTTGGTACGATCATAAGCCGTACAAccc > 1:1252715/1‑150 (MQ=255) ggCAAGTACCGCGAGCATGGATCATGCTCACTTCAGACTAAGGTTTACCCGCAATTTGTGCAACCTGCGCCCGGCTCATGCCTTTTTTGACGTCTTTCACCACAGGCTGTACAAACTGGTCTTTGGTACGATCATAAGCCGTACAACCCg > 2:1159277/1‑150 (MQ=255) ggCAAGTACCGCGAGCATGGATCATGCTCACTTCAGACGAAGGTTTACCCGCAATTTGTGCAACCTGCGCCCGGCTCATGCCTTTTTTGACGTCTTTCACCACAGGCTGTACAAACTGGTCTTTGGTACGATCATAAGCCGTACAACCCg > 2:173807/1‑150 (MQ=255) ggCAAGTACCGCGAGCATGGATCATGCTCACTTCAGACGAAGGTTTACCCGCAATTTGTGCAACCTGCGCCCGGCTCATGCCTTTTTTGACGTCTTTCACCACAGGCTGTACAAACTGGTCTTTGGTACGATCATAAGCCGTACAACCCg > 2:594543/1‑150 (MQ=255) aGTACCGCGAGCATGGATCATGCTCACTTCAGACGAAGGTTTACCCGCAATTTGTGCAACCTGCGCCCGGCTCATGCCATTTTTGACGTCTTTCACCACAGGCTGTACAAACTGGTCTTTCCTACGATCATAAGCCGTACAACCCGCCac > 2:697199/1‑149 (MQ=255) tgaagtgAGCATGATCCATGCTCACTTCAGACGAAGGTTTACCCGCAATTTGTGCAACCTGCGCCCGGCTCATGCCTTTTTTGACGTCTTTCACCACAGGCTGTACAAACTGGTCTTTGGTACGATCATAAGCCGTACAACCCGCCAGCa > 1:475075/7‑150 (MQ=255) tACCGCGAGCATGGATCATGCTCACTTCAGACGAAGGTTTACCCGCAATTTGTGCAACCTGCGCCCGGCTCATGCCTTTTTTGACGTCTTTCACCACAGGCTGTACAAACTGGTCTTTGGTACGATCATAAGCCGTACAACCCGCCAGCa > 2:85454/1‑150 (MQ=255) ccGCGAGCATGGATCATGCTCACTTCAGACGAAGGTTTACCCGCAATTTGTGCAACCTGCGCCCGGCTCATGCCTTTTTTGACGTCTTTCACCACAGGCTGTACAAACTGGTCTTTGGTACGATCATAAGCCGTACAACCCGCCAGCATg > 1:789908/1‑150 (MQ=255) cgcgAGCATGGATAATGCTCACTTCAGACGAAGGTTTACCAGCAATTTGTGCAACCTGCGCCCGGCTCATGCCTTTTTTGACGTCTTTCACCACAGGCTGTACAAACTGGTCTTTGGTACGATCATAAGCCGTACAACCCGCCAGCATgg > 2:388081/1‑150 (MQ=255) gtgAGCATGATCCATGCTCACTTCAGACGAAGGTTTACCCGCAATTTGTGCAACCTGCGCCCGGCTCATGCCTTTTTTGACGTCTTTCACCACAGGCTGTACAAACTGGTCTTTGGTACGATCATAAGCCGTACAACCCGCCAGCATGGt > 2:161840/3‑150 (MQ=255) gcgAGCATGGATCATGCTCACTTCAGACGAAGGTTTACCCGCAATTTGTGCAACCTGCGCCCGGCTCATGCCTTTTTTGACGTCTTTCACCACAGGCTGTACAAACTGGTCTTTGGTACGATCATAAGCCGTACAACCCGCCAGCATGGt > 1:1071000/1‑150 (MQ=255) cgAGCATGGATCATGCTCACTTCAGACGAAGGTTTACCCGCAATTTGTGCAACCTGCGCCCGGCTCATGCCTTTTTTGACGTCTTTCACCACAGGCTGTACAAACTGGTCTTTGGTACGATCATAAGCCGTACAACCCGCCAGCATGGtt < 1:594543/150‑1 (MQ=255) gAGCATGGATCATGCTCACTTCAGACGAAGGTTTACCCGCAATTTGTGCAACCTGCGCCCGGCTCATGCCTTTTTTGACGTCTTTCACCACAGGCTGTACAAACTGGTCTTTGGTACGATCATAAGCCGTACAACCCGCCAGCATGGTTa < 1:1313957/150‑1 (MQ=255) gAGCATGGATCATGCTCACTTCAGACGAAGGTTTACCCGCAATTTGTGCAACCTGCGCCCGGCTCATGCCTTTTTTGACGTCTTTCACCACAGGCTGTACAAACTGGTCTTTGGTACGATCATAAGCCGTACAACCCGCCAGCATGGTTa < 1:393119/150‑1 (MQ=255) gAGCATGGATCATGCTCACTTCAGACGAAGGTTTACCCGCAATTTGTGCAACCTGCGCCCGGCTCATGCCTTTTTTGACGTCTTTCACCACAGGCTGTACAAACTGGTCTTTGGTACGATCATAAGCCGTACAACCCGCCAGCATGGTTa < 1:140793/150‑1 (MQ=255) aGCATGGATCATGCTCACTTCAGACGAAGGTTTACCCGCAATTTGTGCAACCTGCGCCCGGCTCATGCCTTTTTTGACGTCTTTCACCACAGGCTGTACAAACTGGTCTTTGGTACGATCATAAGCCGTACAACCCGCCAGCATGGTTaa > 1:339839/1‑150 (MQ=255) cATGGATCATGCTCACTTCAGACGAAGGTTTACCCGCAATTTGTGCAACCTGCGCCCGGCTCATGCCTTTTTTGACGTCTTTCACCACAGGCTGTACAAACTGGTCTTTGGTACGATCATAAGCCGTACAACCCGCCAGCATGGTTAATa > 2:54375/1‑150 (MQ=255) cATGGATCATGCTCACTTCAGACGAAGGTTTACCCGCAATTTGTGCAACCTGCGCCCGGCTCATGCCTTTTTTGACGTCTTTCACCACAGGCTGTACAAACTGGTCTTTGGTACGATCATAAGCCGTACAACCCGCCAGCATGGTTAATa < 1:697199/150‑1 (MQ=255) ggATCATGCTCACTTCAGACGAAGGTTTACCCGCAATTTGTGCAACCTGCGCCCGGCTCATGCCTTTTTTGACGTCTTTCACCACAGGCTGTACAAACTGGTCTTTGGTACGATCATAAGCCGTACAACCCGCCAGCATGGTTAATAccg < 1:319415/150‑1 (MQ=255) aTCATGCTCACTTCAGACGAAGGTTTACCCGCAATTTGTGCAACCTGCGCCCGGCTCATGCCTTTTTTGACGTCTTTCACCACAGGCTGTACAAACTGGTCTTTGGTACGATCATAAGCCGTACAACCCGCCAGCATGGTTAATAccgcc < 2:1215856/150‑1 (MQ=255) aTCATGCTCACTTCAGACGAAGGTTTACCCGCAATTTGTGCAACCTGCGCCCGGCTCATGCCTTTTTTGACGTCTTTCACCACAGGCTGTACAAACTGGTCTTTGGTACGATCATAAGCCGTACAACCCGCCAGCATGGTTAATAccgcc > 1:288197/1‑150 (MQ=255) | CGCAGCCTGTGGATCAGTGTCGTATTCAGCACAGGTCTGATAACCGGAGTTGATGACATGTCCGGTATCATCTAACGCGACAAAGTAGGTTTCTGCTTTACCATCACGTTGACCCAGGATGTAGGTCTGGCAAGTACCGCGAGCATGGATCATGCTCACTTCAGACGAAGGTTTACCCGCAATTTGTGCAACCTGCGCCCGGCTCATGCCTTTTTTGACGTCTTTCACCACAGGCTGTACAAACTGGTCTTTGGTACGATCATAAGCCGTACAACCCGCCAGCATGGTTAATACCGCC > NC_000913/1821924‑1822221 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |