| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 1,827,811 | T→G | 6.3% | K150T (AAA→ACA) | astB ← | N‑succinylarginine dihydrolase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 1,827,811 | 0 | T | G | 6.3% | 199.1 / 4.7 | 63 | K150T (AAA→ACA) | astB | N‑succinylarginine dihydrolase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (30/29); new base G (2/2); total (32/31) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.91e-01 | |||||||||||
CGCCCGTAGACAAAAAGTTGCATACCCGGTTCACCGTAATGACCGCCGAGACGATTGTGGTTTGCCGCCCCCTCATCACCGAGCAACGCTACCTGTGGCAACGCCGAATGGACGCTAAATTTCTCTTCGTCGTTAAAAATCGCTTTTAACAGCGATTCAGTGACGGGCGCTTCCAGCGAACGGTGAAATTTATTGTTCAGGTTGGCAACGGTGAGATGCACTTTGCCATCCAGCGTATCGGCAGATGGCGCGATCGTTGCCGCATTGGCTACCCACATTGGCGAAGCGGAAC > NC_000913/1827667‑1827958 | cGCCCGTAGACAAAAAGTTGCATACCCGGTTCACCGTAATGACCGCCGAGACGATTGTGGTTTGCCGCCCCCTCATCACCGAGCAACGCTACCTGTGGCAACGCCGAATGGACGCTAAATTTCTCTTCGTCGTTAAAAATCGCTTTTAAc < 2:1356243/150‑1 (MQ=255)cGCCCGTAGACAAAAAGTTGCATACCCGGTTCACCGTAATGACCGCCGAGACGATTGTGGTTTGCCGCCCCCTCATCACCGAGCAACGCTACCTGTGGCAACGCCGAATGGACGCTAAATTTCTCTTCGTCGTTAAAAATCGCTTTTAAc > 1:61348/1‑150 (MQ=255) tAGACAAAAAGTTGCATACCCGGTTCACCGTAATGACCGCCGAGACGATTGTGGTTTGCCGCCCCCTCATCACCGAGCAACGCTACCTGTGGCAACGCCGAATGGACGCTAAATTTCTCTTCGTCGTTAAAAATCGCTTTTAACAGCGAt > 2:206957/1‑150 (MQ=255) gACAAAAAGTTGCATACCCGGTTCACCGTAATGACCGCCGAGACGATTGTGGTTTGCCGCCCCCTCATCACCGAGCAACGCTACCTGTGGCAACGCCGAATGGACGCTAAATTTCTCTTCGTCGTTAAAAATCGCTTTTAACAGCGATTc < 2:11406/150‑1 (MQ=255) aCAAAAAGTTGCATACCCGGTTCACCGTAATGACCGCCGAGACGATTGTGGTTTGCCGCCCCCTCATCACCGAGCAACGCTACCTGTGGCAACGCCGAATGGACGCTAAATTTCTCTTCGTCGTTAAAAATCGCTGTTAAAAGCGAtttt < 1:1202515/150‑3 (MQ=255) cAAAAAGTTGCATACCCGGTTCACCGTAATGACCGCCGAGACGATTGTGGTTTGCCGCCCCCTCATCACCGAGCAACGCTACCTGTGGCAACGCCGAATGGACGCTAAATTTCTCTTCGTCGTTAAAAATCGCTTTTAACAGCGATTCAg < 2:820699/150‑1 (MQ=255) cAAAAAGTTGCATACCCGGTTCACCGTAATGACCGCCGAGACGATTGTGGTTTGCCGCCCCCTCATCACCGAGCAACGCTACCTGTGGCAACGCCGAATGGACGCTAAATTTCTCTTCGTCGTTAAAAATCGCTTTTAACAGCGATTCAg > 1:1173841/1‑150 (MQ=255) cAAAAAGTTGCATACCCGGTTCACCGTAATGACCGCCGAGACGATTGTGGTTTGCCGCCCCCTCATCACCGAGCAACGCTACCTGTGGCAACGCCGAATGGACGCTAAATTTCTCTTCGTCGTTAAAAATCGCTTTTAACAGCGATTCAg > 2:464863/1‑150 (MQ=255) cAAAAAGTTGCATACCCGGTTCACCGTAATGACCGCCGAGACGATTGTGGTTTGCCGCCCCCTCATCACCGAGCAACGCTACCTGTGGCAACGCCGAATGGACGCTAAATTTCTCTTCGTCGTTAAAAATCGCTGTTAAAAGCGAttttt < 1:467213/150‑4 (MQ=255) gCATACCCGGTTCACCGTAATGACCGCCGAGACGATTGTGGTTTGCCGCCCCCTCATCACCGAGCAACGCTACCTGTGGCAACGCCGAATGGACGCTAAATTTCTCTTCGTCGTTAAAAATCGCTTTTAACAGCGATTCAGTGACGGgcg < 2:594843/150‑1 (MQ=255) cccGGTTCACCGTAATGACCGCCGAGACGATTGTGGTTTGCCGCCCCCTCATCACCGAGCAACGCTACCTGTGGCAACGCCGAATGGACGCTAAATTTCTCTTCGTCGTTAAAAATCGCTTTTAACAGCGATTCAGTGACGGGCGCTTcc > 1:783405/1‑150 (MQ=255) cccGGTTCACCGTAATGACCGCCGAGACGATTGTGGTTTGCCGCCCCCTCATCACCGAGCAACGCTACCTGTGGCAACGCCGAATGGACGCTAAATTTCTCTTCGTCGTTAAAAATCGCTTTTAACAGCGATTCAGTGACGGGCGCTTcc > 1:602796/1‑150 (MQ=255) ggTTCACCGTAATGACCGCCGAGACGATTGTGGTTTGCCGCCCCCTCATCACCGAGCAACGCTACCTGTGGCAACGCCGAATGGACGCTAAATTTCTCTTCGTCGTTAAAAATCGCTTTTAACAGCGATTCAGTGACGGGCGCTTCCAGc < 1:1223584/150‑1 (MQ=255) cacattAATGACCGCCGAGACGATTGTGGTTTTCCGCCCCCTCATCACCGAGCAACGCTACCTGTGGCAACGCCGAATGGACGCTAAATTTCTCTTCGTCGTTAAAAATCGCTTTTAACAGCGATTCAGTGACGGGCGCTTCCAGCGAAc > 2:196495/6‑150 (MQ=255) ccGTAATGACCGCCGAGACGATTGTGGTTTGCCGCCCCCTCATCACCGAGCAACGCTACCTGTGGCAACGCCGAATGGACGCTAAATTTCTCTTCGTCGTTAAAAATCGCTTTTAACAGCGATTCAGTGACGGGCGCTTCCAGCGAACgg > 1:1165983/1‑150 (MQ=255) aTGACCGCCGAGACGATTGTGGTTTGCCGCCCCCTCATCACCGAGCAACGCTACCTGTGGCAACGCCGAATGGACGCTAAATTTCTCTTCGTCGTTAAAAATCGCTTTTAACAGCGATTCAGTGACGGGCGCTTCCAGCGAACGGTGaaa < 1:508266/150‑1 (MQ=255) aTGACCGCCGAGACGATTGTGGTTTGCCGCCCCCTCATCACCGAGCAACGCTACCTGTGGCAACGCCGAATGGACGCTAAATTTCTCTTCGTCGTTAAAAATCGCTTTTAACAGCGATTCAGTGACGGGCGCTTCCAGCGAACGGTGaaa < 2:105567/150‑1 (MQ=255) tGACCGCCGAGACGATTGTGGTTTGCCGCCCCCTCATCACCGAGCAACGCTACCTGTGGCAACGCCGAATGGACGCTAAATTTCTCTTCGTCGTTAAAAATCGCTTTTAACAGCGATTCAGTGACGGGCGCTTCCAGCGAACGGTGAAAt < 1:223519/150‑1 (MQ=255) 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tcaCCGAGCAACGCTACCTGTGGCAACGCCGAATGGACGCTAAATTTCTCTTCGTCGTTAAAAATCGCTTTTAACAGCGATTCAGTGACGGGCGCTTCCAGCGAACGGTGAAATTTATTGTTCAGGTTGGCAACGGTGAGATGCACTTTg < 2:1173841/150‑1 (MQ=255) caCCGAGCAACGCTACCTGTGGCAACGCCGAATGGACGCTAAATTTCTCTTCGTCGTTAAAAATCGCTTTTAACAGCGATTCAGTGACGGGCGCTTCCAGCGAACGGTGAAATTTATTGTTCAGGTTGGCAACGGTGAGATGCACTTTGc < 1:933478/150‑1 (MQ=255) caCCGAGCAACGCTACCTGTGGCAACGCCGAATGGACGCTAAATTTCTCTTCGTCGTTAAAAATCGCTTTTAACAGCGATTCAGTGACGGGCGCTTCCAGCGAACGGTGAAATTTATTGTTCAGGTTGGCAACGGTGAGATGCACTTTGc > 2:83614/1‑150 (MQ=255) caCCGAGCAACGCTACCTGTGGCAACGCCGAATGGACGCTAAATTTCTCTTCGTCGTTAAAAATCGCTTTTAACAGCGATTCAGTGACGGGCGCTTCCAGCGAACGGTGAAATTTATTGTTCAGGTTGGCAACGGGGAGATGCACTTTGc < 1:1183815/150‑1 (MQ=255) aCCGAGCAACGCTACCTGTGGCAACGCCGAATGGACGCTAAATTTCTCTTCGTCGTTAAAAATCGCTTTTAACAGCGATTCAGTGACGGGCGCTTCCAGCGAACGGTGAAATTTATTGTTCAGGTTGGCAACGGTGAGATGCACTTTGcc > 1:198762/1‑150 (MQ=255) 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ggACGCTAAATTTCTCTTCGTCGTTAAAAATCGCTTTTAACAGCGATTCAGTGACGGGCGCTTCCAGCGAACGGTGAAATTTATTGTTCAGGTTGGCAACGGTGAGATGCACTTTGCCATCCAGCGTATCGGCAGATGGCGCGATCGTTg < 1:412973/150‑1 (MQ=255) cGCTAAATTTCTCTTCGTCGTTAAAAATCGCTTTTAACAGCGATTCAGTGACGGGCGCTTCCAGCGAACGGTGAAATTTATTGTTCAGGTTGGCAACGGTGAGATGCACTTTGCCATCCAGCGTATCGGCAGATGGCGCGATCGTTGCCg < 1:675707/150‑1 (MQ=255) cTAAATTTCTCTTCGTCGTTAAAAATCGCTTTTAACAGCGATTCAGTGACGGGCGCTTCCAGCGAACGGTGAAATTTATTGTTCAGGTTGGCAACGGTGAGATGCACTTTGCCATCCAGCGTATCGGCAGATGGCGCGATCGTTGCCGCa > 2:1384590/1‑150 (MQ=255) tttCTCTTCGTCGTTAAAAATCGCTTTAAACAGCGATTCAGTGACGGGCGCTTCCAGCGAACGGTGAAATTTATTGTTCAGGTTGGCAACGGTGAGATGCACTTTGCCATCCAGCGTATCGGCAGATGGCGCGATCGTTGCCGCATTGGc > 2:244766/1‑150 (MQ=255) tctcTTCGTCGTTAAAAATCGCTTTTAACAGCGATTCAGTGACGGGCGCTTCCAGCGAACGGTGAAATTTATTGTTCAGGTTGGCAACGGTGAGATGCACTTTGCCATCCAGCGTATCGGCAGATGGCGCGATCGTTGCCGCATTGGCTa > 1:700900/1‑150 (MQ=255) 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CGCCCGTAGACAAAAAGTTGCATACCCGGTTCACCGTAATGACCGCCGAGACGATTGTGGTTTGCCGCCCCCTCATCACCGAGCAACGCTACCTGTGGCAACGCCGAATGGACGCTAAATTTCTCTTCGTCGTTAAAAATCGCTTTTAACAGCGATTCAGTGACGGGCGCTTCCAGCGAACGGTGAAATTTATTGTTCAGGTTGGCAACGGTGAGATGCACTTTGCCATCCAGCGTATCGGCAGATGGCGCGATCGTTGCCGCATTGGCTACCCACATTGGCGAAGCGGAAC > NC_000913/1827667‑1827958 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |