| Predicted mutation | |||||||
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| RA | NC_000913 | 2,266,051 | T→C | 5.9% | intergenic (+29/‑194) | yeiP → / → yeiQ | elongation factor P family protein/putative dehydrogenase, NAD‑dependent |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 2,266,051 | 0 | T | C | 5.9% | 311.8 / 7.1 | 101 | intergenic (+29/‑194) | yeiP/yeiQ | elongation factor P family protein/putative dehydrogenase, NAD‑dependent |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (50/45); new base C (2/4); total (52/49) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.28e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 6.67e-01 | |||||||||||
Only 100 of 101 total aligned reads displayed.
GTAACAAACCGGCGACATTGAGCACTGGTCTGGTGATTCAGGTACCAGAATACTTAAGCCCGGGCGAAAAAATTCGTATCCATATCGAAGAACGCCGTTATATGGGGCGTGCTGACTAACTTCAGCCGCATGCAGAAAAGGGATAGCTCAGGCTGTCCCTTTTTTAATTTATTATACCAATCTTCTATTTTGCGCTTCCTGAACACCTTACGCCCTCAATTTTCACTCGTTGATTGATCGCCCTCACACTTCATCGCATTAACAATCCAGACCAATTTCAATTGCTGTCATATAAC > NC_000913/2265904‑2266199 | gTAACAAACCGGCGACATTGAGCACTGGTCTGGTGATTCAGGTACCAGAATACTTAAGCCCGGGCGAAAAAATTCGTATCCATATCGAAGAACGCCGTTATATGGGGCGTGCTGACTAACTTCAGCCGCATGCAGAAAAGGGATAGCTCa < 2:580554/150‑1 (MQ=255)gTAACAAACCGGCGACATTGAGCACTGGTCTGGTGATTCAGGTACCAGAATACTTAAGCCCGGGCGAAAAAATTCGTATCCATATCGAAGAACGCCGTTATATGGGGCGTGCTGACTAACTTCAGCCGCATGCAGAAAAGGGATAGCTCa > 1:692986/1‑150 (MQ=255) aCAAACCGGCGACATTGAGCACTGGTCTGGTGATTCAGGTACCAGAATACTTAAGCCCGGGCGAAAAAATTCGTATCCATATCGAAGAACGCCGTTATATGGGGCGTGCTGACTAACTTCAGCCGCATGCAGAAAAGGGATAGCTCAGGc > 2:871896/1‑150 (MQ=255) 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taaaaaaGGGACAGCCTGAGCTATCCCTTTTTTAATTTATTATACCAATCTTCTATTTTGCGCTTCCTGAACACCTTACGCCCTCAATTTTCACTCGTTGATTGATCGCCCTCACACTTCATCGCATTAACAATCCAGACCAATTTCAAt > 1:974489/4‑150 (MQ=255) cAGAAAAGGGATAGCTCAGGCTGTCCCTTTTTTAATTTATTATACCAATCTTCTATTTTGCGCTTCCTGAACACCTTACGCCCTCAATTTTCACTCGTTGATTGATCGCCCTCACACTTCATCGCATTAACAATCCAGACCAATTTCAAt < 1:719317/150‑1 (MQ=255) aGAAAAGGGATAGCTCAGGCTGTCCCTTTTTTAATTTATTATACCAATCTTCTATTTTGCGCTTCCTGAACACCTTACGCCCTCAATTTTCACTCGTTGATTGATCGCCCTCCCACTTCATCGCATTAACAATCCAGACCAATTTCAAtt > 2:750170/1‑150 (MQ=255) aGAAAAGGGATAGCTCAGGCTGTCCCTTTTTTAATTTATTATACCAATCTTCTATTTTGCGCTTACTGAACACCTTACGCCCTCAATTTTCACTCGTTGATTGATCGCCCTCACACTTCATCGCATTAACAATCAAGACCAATTTCAAtt > 2:1265738/1‑150 (MQ=255) aaaaGGGATAGCTCAGGCTGTCCCTTTTTTAATTTATTATACCAATCTTCTATTTTGCGCTTCCTGAACACCTTACGCCCTCAATTTTCACTCGTTGATTGATCGCCCTCACACTTCATCGCATTAACAATCCAGACCAATTTCAATTGc > 2:601942/1‑150 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |