| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 2,455,143 | A→T | 7.4% | A168A (GCT→GCA) ‡ | yfcV ← | putative fimbrial protein YfcV |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 2,455,143 | 0 | A | T | 7.4% | 196.8 / 4.4 | 68 | A168A (GCT→GCA) ‡ | yfcV | putative fimbrial protein YfcV |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (37/26); new base T (2/3); total (39/29) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.44e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.92e-01 | |||||||||||
TCAGGCATACACGTTTTTATCCGTTTTTATTCTTGTTCGGTCAAAATCCATTTAAATACCCCATAGCAGTGTCGCTATGGGGGTATGCCTTACAGGTAAGTAATCTGGAAGGTGGTATTTGCTTCGAAATTACCCAGATCTGGCGCATCAGCTGCGCCGACCAGCCAGGCTTTAAAGTTCAGAGTCTGCTTCGCTTTGCCTTTATTAGTGGCAGTATCTTTCACGATTTTCTGGTCAATACCCATGCCGCTTTTGTAAGAGGTACCCAGAGAGTCACCGATCGCCAGGCTAACATTGT > NC_000913/2454994‑2455291 | tCAGGCATACACGTTTTTATCCGTTTTTATTCTTGTTCGGTCAAAATCCATTTAAATACCCCATAGCAGTGTCGCTATGGGGGTATGCCTTACAGGTAAGTAATCTGGAAGGTGGTATTTGCTTCGAAATTACCCAGATCTGGCGCATCa < 1:297854/150‑1 (MQ=255) ggCATACACGTTTTTATCCGTTTTTATTCTTGTTCGGTCAAAATCCATTTAAATACCCCATAGCAGTGTCGCTATGGGGGTATGCCTTACAGGTAAGTAATCTGGAAGGTGGTATTTGCTTCGAAATTACCCAGATCTGGCGCATCAGCt > 1:787833/1‑150 (MQ=255) ggCATACACGTTTTTATCCGTTTTTATTATTGTTCGGTCAAAATCCATTTAAATACCCCATAGCAGTGTCGCTATGGGGTTATGCCTAACATGTAATTAATAGGGAAGGTGGTATTTGCTTAGAAATTACCCAGATCAGGCGCATCAGca > 2:1194001/1‑149 (MQ=255) tACACGTTTTTATCCGTTTTTATTCTTGTTCGGTCAAAATCCATTTAAATACCCCATAGCAGTGTCGCTATGGGGGTATGCCTTACAGGTAAGTAATCTGGAAGGTGGTATTTGCTTCGAAATTACCCAGATCTGGCGCATCAGCTgcgc > 1:1222375/1‑150 (MQ=255) cacGTTTTTATCCGTTTTTATTCTTGTTCGGTCAAAATCCATTTAAATACCCCATAGCAGTGTCGCTATGGGGGTATGCCTTACAGGTAAGTAATCTGGAAGGTGGTATTTGCTTCGAAATTACCCAGATCTGGCGCATCAGCTGCGCCg > 2:787026/1‑150 (MQ=255) acGTTTTTATCCGTTTTTATTCTTGTTCGGTCAAAATCCATTTAAATACCCCATAGCAGTGTCGCTATGGGGGTATGCCTTACAGGTAAGTAATCTGGAAGGTGGTATTTGCTTCGAAATTACCCAGATCTGGCGCATCAGCTGCGCCGa < 1:256312/150‑1 (MQ=255) acGTTTTTATCCGTTTTTATTCTTGTTCGGTCAAAATCCATTTAAATACCCCATAGCAGTGTCGCTATGGGGGTATGCCTTACAGGTAAGTAATCTGGAAGGTGGTATTTGCTTCGAAATTACCCAGATCTGGCGCAGCTGATGCGccag < 2:357310/150‑3 (MQ=255) cGTTTTTATCCGTTTTTATTCTTGTTCGGTCAAAATCCATTTAAATACCCCATAGCAGTGTCGCTATGGGGGTATGCCTTACAGGTAAGTAATCTGGAAGGTGGTATTTGCTTCGAAATTACCCAGATCTGGCGCAGCTGTTGCGccaga < 2:1117931/150‑4 (MQ=255) gTTTTTATCCGTTTTTATTCTTGTTCGGTCAAAATCCATTTAAATACCCCATAGCAGTGTCGCTATGGGGGTATGCCTTACAGGTAAGTAATCTGGAAGGTGGTATTTGCTTCGAAATTACCCAGATCTGGCGCATCAGCTGCGCCGAcc < 2:1271230/150‑1 (MQ=255) tATCCGTTTTTATTCTTGTTCGGTCAAAATCCATTTAAATACCCCATAGCAGTGTCGCTATGGGGGTATGCCTTACAGGTAAGTAATCTGGAAGGTGGTATTTGCTTCGAAATTACCCAGATCTGGCGCATCAGCTGCGCCGAccagcca < 2:908748/150‑1 (MQ=255) tCCGTTTTTATTCTTGTTCGGTCAAAATCCATTTAAATACCCCATAGCAGTGTCGCTATGGGGGTATGCCTTACAGGAAAGTAATCTGGAAGGTGGTATTTGCTTCGAAATTACCCAGATCTGGCGCATCAGCTGCGCCGACCAGCCAgg > 1:342484/1‑150 (MQ=255) ccGTTTTTATTCTTGTTCGGTCAAAATCCATTTAAATACCCCATAGCAGTGTCGCTATGGGGGTATGCCTTACAGGTAAGTAATCTGGAAGGTGGTATTTGCTTCGAAATTACCCAGATCTGGCGCATCAGCTGCGCCGACCAGCCAGGc < 1:228796/150‑1 (MQ=255) tttttATTCTTGTTCGGTCAAAATCCATTTAAATACCCCATAGCAGTGTCGCTATGGGGGTATGCCTTACAGGTAAGTAATCTGGAAGGTGGTATTTGCTTCGAAATTACCCAGATCTGGCGCATCAGCTGCGCCGACCAGCCAGGCttt < 2:477773/150‑1 (MQ=255) tATTCTTGTTCGGTCAAAATCCATTTAAATACCCCATAGCAGTGTCGCTATGGGGGTATGCCTTACAGGTAAGTAATCTGGAAGGTGGTATTTGCTTCGAAATTACCCAGATCTGGCGCATCAGCTGCGCCGACCAGCCAGGCTTTAAAg < 1:1009531/150‑1 (MQ=255) tCAAAATCCATTTAAATACCCCATAGCAGTGTCGCTATGGGGGTATGCCTTACAGGTAAGTAATCTGGAAGGTGGTATTTGCTTCGAAATTACCCAGATCTGGCGCATCAGCTGCGCCGACCAGCCAGGCTTTAAAGTTCAGAGTCTGCt < 1:1342332/150‑1 (MQ=255) aaTCCATTTAAATACCCCATAGCAGTGTCGCTATGGGGGTATGCCTTACAGGTAAGTAATCTGGAAGGTGGTATTTGCTTCGAAATTACCCAGATCTGGCGCATCAGCTGCGCCGACCAGCCAGGCTTTAAAGTTCAGAGTCTGCTTCGc > 1:84403/1‑150 (MQ=255) tCCATTTAAATACCCCATAGCAGTGTCGCTATGGGGGTATGCCTTACAGGTAAGTAATCTGGAAGGTGGTATTTGCTTCGAAATTACCCAGATCTGGCGCATCAGCTGCGCCGACCAGCCAGGCTTTAAAGTTCAGAGTCTGCTTCGCtt < 2:1352051/150‑1 (MQ=255) aTTTAAATACCCCATAGCAGTGTCGCTATGGGGGTATGCCTTACAGGTAAGTAATCTGGAAGGTGGTATTTGCTTCGAAATTACCCAGATCTGGCGCATCAGCTGCGCCGACCAGCCAGGCTTTAAAGTTCAGAGTCTGCTTCGCTTTGc > 2:721171/1‑150 (MQ=255) tAAATACCCCATAGCAGTGTCGCTATGGGGGTATGCCTTACAGGTAAGTAATCTGGAAGGTGGTATTTGCTTCGAAATTACCCAGATCTGGCGCATCAGCTGCGCCGACCAGCCAGGCTTTAAAGTTCAGAGTCTGCTTCGCTTTGCCtt > 2:463349/1‑150 (MQ=255) aaaTACCCCATAGCAGTGTCGCTATGGGGGTATGCCTTACAGGTAAGTAATCTGGAAGGTGGTATTTGCTTCGAAATTACCCAGATCTGGCGCATCAGCTGCGCCGACCAGCCAGGCTTTAAAGTTCAGAGTCTGCTTCGCTTTGCCttt > 1:791795/1‑150 (MQ=255) ccATAGCAGTGTCGCTATGGGGGTATGCCTTACAGGTAAGTAATCTGGAAGGTGGTATTTGCTTCGAAATTACCCAGATCTGGCGCATCAGCTGCGCCGACCAGCCAGGCTTTAAAGTTCAGAGTCTGCTTCGCTTTGCCTTTATTAGTg > 2:529217/1‑150 (MQ=255) aGTGTCGCTATGGGGGTATGCCTTACAGGTAAGTAATCTGGAAGGTGGTATTTGCTTCGAAATTACCCAGATCTGGCGCATCAGCTGCGCCGACCAGCCAGGCTTTAAAGTTCAGAGTCTGCTTCGCTTTGCCTTTATTAGTGGCAGTAt > 2:1161359/1‑150 (MQ=255) tgtCGCTATGGGGGTATGCCTTACAGGTAAGTAATCTGGAAGGTGGTATTTGCTTCGAAATTACCCAGATCTGGCGCATCAGCTGCGCCGACCAGCCAGGCTTTAAAGTTCAGAGTCTGCTTCGCTTTGCCTTTATTAGTGGCAGTATCt < 2:787833/150‑1 (MQ=255) gtCGCTATGGGGGTATGCCTTACAGGTAAGTAATCTGGAAGGTGGTATTTGCTTCGAAATTACCCAGATCTGGCGCATCAGCTGCGCCGACCAGCCAGGCTTTAAAGTTCAGAGTCTGCTTCGCTTTGCCTTTATTAGTGGCAGTATCtt > 2:803870/1‑150 (MQ=255) cGCTATGGGGGTATGCCTTACAGGTAAGTAATCTGGAAGGGGGTATTTGCTTCGAAATTACCCAGATCTGGCGCATCAGCTGCGCCGACCAGCCAGGCTTTAAAGTTCAGAGTCTGCTTCGCTTTGCCTTTATTAGTGGCAGTATCTTTc < 2:904538/150‑1 (MQ=255) gCTATGGGGGTATGCCTTACAGGTAAGTAATCTGGAAGGTGGTATTTGCTTCGAAATTACCCAGATCTGGCGCATCAGCTGCGCCGACCAGCCAGGCTTTAAAGTTCAGAGTCTGCTTCGCTTTGCCTTTATTAGTGGCAGTATCTTTCa > 2:994017/1‑150 (MQ=255) cTATGGGGGTATGCCTTACAGGTAAGTAATCTGGAAGGTGGTATTTGCTTCGAAATTACCCAGATCTGGCGCATCAGCTGCGCCGACCAGCCAGGCTTTAAAGTTCAGAGTCTGCTTCGCTTTGCCTTTATTAGTGGCAGTATCTTTCAc < 1:73023/150‑1 (MQ=255) cTATGGGGGTATGCCTTACAGGTAAGTAATCTGGAAGGTGGTATTTGCTTCGAAATTACCCAGATCTGGCGCATCAGCTGCGCCGACCAGCCAGGCTTTAAAGTTCAGAGTCTGCTTCGCTTTGCCTTTATTAGTGGCAGTATCTTTCAc > 2:383835/1‑150 (MQ=255) tATGGGGGTATGCCTTACAGGTAAGTAATCTGGAAGGTGGTATTTGCTTCGAAATTACCCAGATCTGGCGCATCAGCTGCGCCGACCAGCCAGGCTTTAAAGTTCAGAGTCTGCTTCGCTTTGCCTTTATTAGTGGCAGTATCTTTCACg < 1:463349/150‑1 (MQ=255) tGGGGGTATGCCTTACAGGTAAGTAATCTGGAAGGTGGTATTTGCTTCGAAATTACCCAGATCTGGCGCATCAGCTGCGCCGACCAGCCAGGCTTTAAAGTTCAGAGTCTGCTTCGCTTTGCCTTTATTAGTGGCAGTATCTTTCACGAt > 1:276670/1‑150 (MQ=255) gTATGCCTTACAGGTAAGTAATCTGGAAGGTGGTATTTGCTTCGAAATTACCCAGATCTGGCGCATCAGCTGCGCCGACCAGCCAGGCTTTAAAGTTCAGAGTCTGCTTCGCTTTGCCTTTATTAGTGGCAGTATCTTTCACGATTTTCt < 2:922703/150‑1 (MQ=255) tATGCCTTACAGGTAAGTAATCTGGAAGGTGGTATTTGCTTCGAAATTACCCAGATCTGGCGCATCAGCTGCGCCGACCAGCCAGGCTTTAAAGTTCAGAGTCTGCTTCGCTTTGCCTTTATTAGTGGCAGTATCTTTCACGATTTTCTg > 2:1339583/1‑150 (MQ=255) gCCTTACAGGTAAGTAATCTGGAAGGTGGTATTTGCTTCGAAATTACCCAGATCTGGCGCATCAGCTGCGCCGACCAGCCAGGCTTTAAAGTTCAGAGTCTGCTTCGCTTTGCCTTTATTAGTGGCAGTATCTTTCACGATTTTCTGGTc < 1:1000280/150‑1 (MQ=255) gCCTTACAGGTAAGTAATCTGGAAGGTGGTATTTGCTTCGAAATTACCCAGATCTGGCGCATCAGCTGCGCCGACCAGCCAGGCTTTAAAGTTCAGAGTCTGCTTCGCTTTGCCTTTATTAGTGGCAGTATCTTTCACGATTTTCTGGTc > 1:143290/1‑150 (MQ=255) ccTTACAGGTAAGTAATCTGGAAGGTGGTATTTGCTTCGAAATTACCCAGATCTGGCGCATCAGCTGCGCCGACCAGCCAGGCTTTAAAGTTCAGAGTCTGCTTCGCTTTGCCTTTATTAGTGGCAGTATCTTTCACGATTTTCTGGTCa < 2:1222375/150‑1 (MQ=255) aCAGGTAAGTAATCTGGAAGGTGGTATTTGCTTCGAAATTACCCAGATCTGGCGCATCAGCTGCGCCGACCAGCCAGGCTTTAAAGTTCAGAGTCTGCTTCGCTTTGCCTTTATTAGTGGCAGTATCTTTCACGATTTTCTGGTCAATAc > 1:743536/1‑150 (MQ=255) taagtaaTCTGGAAGGTGGTATTTGCTTCGAAATTACCCAGATCTGGCGCATCAGCTGCGCCGACCAGCCAGGCTTTAAAGTTCAGAGTCTGCTTCGCTTTGCCTTTATTAGTGGCAGTATCTTTCACGATTTTCTGGTCAATACCCATg < 2:276670/150‑1 (MQ=255) taagtaaTCTGGAAGGTGGTATTTGCTTCGAAATTACCCAGATCTGGCGCATCAGCTGCGCCGACCAGCCAGGCTTTAAAGTTCAGAGTCTGCTTCGCTTTGCCTTTATTAGTGGCAGTATCTTTCACGATTTTCTGGTCAATACCCATg > 2:149386/1‑150 (MQ=255) tCTGGAAGGTGGTATTTGCTTCGAAATTACCCAGATCTGGCGCATCAGCTGCGCCGACCAGCCAGGCTTTAAAGTTCAGAGTCTGCTTCGCTTTGCCTTTATTAGTGGCAGTATCTTTCACGATTTTCTGGTCAATACCCATGCCGCttt < 1:1161359/150‑1 (MQ=255) tCTGGAAGGTGGTATTTGCTTCGAAATTACCCAGATCTGGCGCATCAGCTGCGCCGACCAGCCAGGCTTTAAAGTTCAGAGTCTGCTTCGCTTTGCCTTTATTAGTGGCAGTATCTTTCACGATTTTCTGGTCAATACCCATGCCGCttt > 1:1413466/1‑150 (MQ=255) cTGGAAGGTGGTATTTGCTTCGAAATTACCCAGATCTGGCGCATCAGCTGCGCCGACCAGCCAGGCTTTAAAGTTCAGAGTCTGCTTCGCTTTGCCTTTATTAGTGGCAGTATCTTTCACGATTTTCTGGTCAATACCCATGCCGCtttt > 2:257830/1‑150 (MQ=255) cTGGAAGGTGGTATTTGCTTCGAAATTACCCAGATCTGGCGCATCAGCTGCGCCGACCAGCCAGGCTTTAAAGTTCAGAGTCTGCTTCGCTTTGCCTTTATTAGTGGCAGTATCTTTCACGATTTTCTGGTCAATACCCATGCCGCtttt > 2:392155/1‑150 (MQ=255) tGGAAGGTGGTATTTGCTTCGAAATTACCCAGATCTGGCGCATCAGCTGCGCCGACCAGCCAGGCTTTAAAGTTCAGAGTCTGCTTCGCTTTGCCTTTATTAGTGGCAGTATCTTTCACGATTTTCTGGTCAATACCCATGCCGCTTTTg > 1:170648/1‑150 (MQ=255) ggAAGGTGGTATTTGCTTCGAAATTACCCAGATCTGGCGCATCAGCTGCGCCGACCAGCCAGGCTTTAAAGTTCAGAGTCTGCTTCGCTTTGCCTTTATTAGTGGCAGTATCTTTCACGATTTTCTGGTCAATACCCATGCCGCTTTTGt > 1:146026/1‑150 (MQ=255) ggAAGGTGGTATTTGCTTCGAAATTACCCAGATCTGGCGCATCAGCTGCGCCGACCAGCCAGGCTTTAAAGTTCAGAGTCTGCTTCGCTTTGCCTTTATTAGTGGCAGTATCTTTCACGATTTTCTGGTCAATACCCATGCCGCTTTTGt > 1:140956/1‑150 (MQ=255) gAAGTTGGTATTTGCTTCGAAATTACCCAGATCTGGCGCATCAGCTGCGCCGACCAGCCAGGCTTTAAAGTTCAGAGTCTGCTTCGCTTTGCCTTTATTAGTGGCAGTATCTTTCACGATTTTCTGGTCAATACCCATGCCGCTTTTGTa < 1:1194001/150‑1 (MQ=255) aGGTGGGATTTGCTTCGAAATTACCCAGATCTGGCGCATCAGCTGCGCCGACCAGCCACGCTTTAAAGTTCAGAGTCTGCTTCGGTTTGCCTTTATTAGTGGCAGTATCTTTCACGATTTTCTGGTCAATACCCATGCCGCTTTTGTAag < 2:465869/150‑1 (MQ=255) ggtATTTGCTTCGAAATTACCCAGATCTGGCGCATCAGCTGCGCCGACCAGCCAGGCTTTAAAGTTCAGAGTCTGCTTCGCTTTGCCTTTATTAGTGGCAGTATCTTTCACGATTTTCTGGTCAATACCCATGCCGCTTTTGTAAGAGGt < 2:1413466/150‑1 (MQ=255) tATTTGCTTCGAAATTACCCAGATCTGGCGCATCAGCTGCGCCGACCAGCCAGGCTTTAAAGTTCAGAGTCTGCTTCGCTTTGCCTTTATTAGTGGCAGTATCTTTCACGATTTTCTGGTCAATACCCATGCCGCTTTTGTAAGAGGTAc < 1:95873/150‑1 (MQ=255) aTTTGCTTCGAAATTACCCAGATCTGGCGCATCAGCTGCGCCGACCAGCCAGGCTTTAAAGTTCAGAGTCTGCTTCGCTTTGCCTTTATTAGTGGCAGTATCTTTCACGATTTTCTGGTCAATACCAATGCCGCTTTTGTAAGAGGTAcc > 1:674684/1‑150 (MQ=255) tGCTTCGAAATTACCCAGATCTGGCGCATCAGCTGCGCCGACCAGCCAGGCTTTAAAGTTCAGAGTCTGCTTCGCTTTGCCTTTATTAGTGGCAGTATCTTTCACGATTTTCTGGTCAATACCCATGCCGCTTTTGTAAGAGGTACCCag > 2:806532/1‑150 (MQ=255) gCTTCGAAATTACCCAGATCTGGCGCATCAGCTGCGCCGACCAGCCAGGCTTTAAAGTTCAGAGTCTGCTTCGCTTTGCCTTTATTAGTGGCAGTATCTTTCACGATTTTATGGTCAATACCCATGCCGCTTTTGTAAGAGGTACCCaga > 2:434756/1‑150 (MQ=255) cTTCGAAATTACCCAGATCTGGCGCATCAGCTGCGCCGACCAGCCAGGCTTTAAAGTTCAGAGTCTGCTTCGCTTTGCCTTTATTAGTGGCAGTATCTTTCACGATTTTCTGGTCAATACCCATGCCGCTTTTGTAAGAGGTACCCagag > 1:871217/1‑150 (MQ=255) cTTCGAAATTACCCAGATCTGGCGCATCAGCTGCGCCGACCAGCCAGGCTTTAAAGTTCAGAGTCTGCTTCGCTTTGCCTTTATTAGTGGCAGTATCTTTCACGATTTTCTGGTCAATACCCATGCCGCTTTTGTAAGAGGTACCCagag > 2:1325100/1‑150 (MQ=255) ttCGAAATTACCCAGATCTGGCGCATCAGCTGCGCCGACCAGCCAGGCTTTAAAGTTCAGAGTCTGCTTCGCTTTGCCTTTATTAGTGGCAGTATCTTTCACGATTTTCTGGTCAATACCCATGCCGCTTTTGTAAGAGGTACCCagaga > 2:579538/1‑150 (MQ=255) aaaTTACCCAGATCTGGCGCATCAGCTGCGCCGACCAGCCAGGCTTTAAAGTTCAGAGTCTGCTTCGCTTTGCCTTTATTAGTGGCAGTATCTTTCACGATTTTCTGGTCAATACCCATGCCGCTTTTGTAAGAGGTACCCAGAGAGTCa > 2:1060161/1‑150 (MQ=255) tACCCAGATCTGGCGCATCAGCTGCGCCGACCAGCCAGGCTTTAAAGTTCAGAGTCTGCTTCGCTTTGCCTTTATTAGTGGCAGTATCTTTCACGATTTTCTGGTCAATACCCATGCCGCTTTTGTAAGAGGTACCCAGAGAGTCACCGa > 2:167498/1‑150 (MQ=255) cccAGATCTGGCGCATCAGCTGCGCCGACCAGCCAGGCTTTAAAGTTCAGAGTCTGCTTCGCTTTGCCTTTATTAGTGGCAGTATCTTTCACGATTTTCTGGTCAATACCCATGCCTCTTTTGTAAGAGGTACCCAGAGAGTCACCGATc > 1:777094/1‑150 (MQ=255) cccAGATCTGGCGCATCAGCTGCGCCGACCAGCCAGGCTTTAAAGTTCAGAGTCTGCTTCGCTTTGCCTTTATTAGTGGCAGTATCTTTCACGATTTTCTGGTCAATACCCATGCCGCTTTTGTAAGAGGTACCCAGAGAGTCACCGATc > 1:603028/1‑150 (MQ=255) gATCTGGCGCATCAGCTGCGCCGACCAGCCAGGCTTTAAAGTTCAGAGTCTGCTTCGCTTTGCCTTTATTAGTGGCAGTATCTTTCACGATTTTCTGGTCAATACCCATGCCGCTTTTGTAAGAGGTACCCAGAGAGTCACCGATCGCCa < 1:392155/150‑1 (MQ=255) gtcggCGCAGCTGATGCGCCGACCAGCCAGGCTTTAAAGTTCAGAGTCTGCTTCGCTTTGCCTTTATTAGTGGCAGTATCTTTCACGATTTTCTGGTCAATACCCATGCCGCTTTTGTAAGAGGTACCCagagag > 1:457585/4‑135 (MQ=255) gtcggCGCAGCTGATGCGCCGACCAGCCAGGCTTTAAAGTTCAGAGTCTGCTTCGCTTTGCCTTTATTAGTGGCAGTATCTTTCACGATTTTCTGGTCAATACCCATGCCGCTTTTGTAAGAGGTACCCagagag < 2:457585/132‑1 (MQ=255) gtcggCGCAGCTGATGCGCCGACCAGCCAGGCTTTAAAGTTCAGAGTCTGCTTCGCTTTGCCTTTATTAGTGGCAGTATCTTTCACGATTTTCTGGTCAATACCCATGCCGCTTTTGTAAGAGGTACCCAGAGAGTCACCGATCGCCAgg > 1:825539/4‑150 (MQ=255) ggCGCATCAGCTGCGCCGACCAGCCAGGCTTTAAAGTTCAGAGTCTGCTTCGCTTTGCCTTTATTAGTGGCAGTATCTTTCACGATTTTCTGGTCAATACCCATGCCGCTTTTGTAAGAGGTACCCAGAGAGTCACCGATCGCCAGGCTa > 1:48336/1‑150 (MQ=255) cgcATCAGCTGCGCCGACCAGCCAGGCTTTAAAGTTCAGAGTCTGCTTCGCTTTGCCTTTATTAGTGGCAGTATCTTTCACGATTTTCTGGTCAATACCCATGCCGCTTTTGTAAGAGGTACCCAGAGAGTCACCGATCGCCAGGCTAAc < 2:791795/150‑1 (MQ=255) gcATCAGCTGCGCCGACCAGCCAGGCTTTAAAGTTCAGAGTCTGCTTCGCTTTGCCTTTATTAGTGGCAGTATCTTTCACGATTTTCTGGTCAATACCCATGCCGCTTTTGTAAGAGGTACCCAGAGAGTCACCGATCGCCAGGCTAACa > 1:761192/1‑150 (MQ=255) gcATCAGCTGCGCCGACCAGCCAGGCTTTAAAGTTCAGAGTCTGCTTCGCTTTGCCTTTATTAGTGGCAGTATCTTTCACGATTTTCTGGTCAATACCCATGCCGCTTTTGTAAGAGGTACCCAGAGAGTCACCGATCGCCAGGCTAACa < 1:787026/150‑1 (MQ=255) cATCAGCTGCGCCGACCAGCCAGGCTTTAAAGTTCAGAGTCTGCTTCGCTTTGCCTTTATTAGTGGCAGTATCTTTCACGATTTTCTGGTCAATACCCATGCCGCTTTTGTAAGAGGTACCCAGAGAGTCACCGATCGCCAGGCTAACAt < 1:1339583/150‑1 (MQ=255) cAGCTGCGCCGACCAGCCATGCTTTAAAGTTCAGAGTCTGCTTCGCTTTGCCTTTATTAGTGGCAGTATCTTTCACGATTTTCTGGTCAATACCCATGCCGATTTTGTAAGAGGTACCGAGAGAGTCACCGATCGCCAGGCTAACATTGt < 2:1292804/150‑1 (MQ=255) | TCAGGCATACACGTTTTTATCCGTTTTTATTCTTGTTCGGTCAAAATCCATTTAAATACCCCATAGCAGTGTCGCTATGGGGGTATGCCTTACAGGTAAGTAATCTGGAAGGTGGTATTTGCTTCGAAATTACCCAGATCTGGCGCATCAGCTGCGCCGACCAGCCAGGCTTTAAAGTTCAGAGTCTGCTTCGCTTTGCCTTTATTAGTGGCAGTATCTTTCACGATTTTCTGGTCAATACCCATGCCGCTTTTGTAAGAGGTACCCAGAGAGTCACCGATCGCCAGGCTAACATTGT > NC_000913/2454994‑2455291 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |