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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_000913 | 2,470,480 | 0 | A | T | 9.8% | 418.0 / 25.5 | 141 | intergenic (+18/+597) | yfdI/yfdK | CPS‑53 (KpLE1) prophage; serotype specific glucosyl transferase/CPS‑53 (KpLE1) prophage; putative tail fiber assembly protein YfdK |
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Only 100 of 141 total aligned reads displayed.
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aCTAAGTTTAAATTGCGCGCCAATCATGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAATTTCTCCTCCTCTTAGAGTGACTATATCTCCTGATAGAATTGCGGTATTGACTATCAAATGCCCTGATTCGTTGTTTATTGTAATATCTCctct < 1:1016247/150‑1 (MQ=255) cTAAGTTTAAATTGCGCGCCAATCATGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAATTTCTCCTCCTCTTAGAGTGACTATATCTCCTGATAGAATTGCGGTATTGACTATCAAATGCCCTGATTCGTTGTTTATTGTAATATCTCCTCTa < 1:1305920/150‑1 (MQ=255) cTAAGTTTAAATTGCGCGCCAATCATGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAATTTCTCCTCCTCTTAGAGTGACTATATCTCCTGATAGAATTGCGGTATTGACTATCAAATGCCCTGATTCGTTGTTTATTGTAATATCTCCTCTa < 1:118190/150‑1 (MQ=255) cTAAGTTTAAATTGCGCGCCAATCATGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAATTTCTCCTCCTCTTAGAGTGACTATATCTCCTGATAGAATTGCGGTATTGACTATCAAATGCCCTGATTCGTTGTTTATTGTAATATCTCCTCTa < 1:840255/150‑1 (MQ=255) aGTTTAAATTGCGCGCCAATCATGGGGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAATTTCTCCTCCTCTTAGAGTGACTATATCTCCTGATAGAATTGCGGTATTGACTATCAAATGCCCTGATTCGTTGTTTATTGTAATATCTCCTCTATCt < 2:177083/150‑1 (MQ=255) gTTTAAATTGCGCGCCAATCATGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAATTTCTCCTCCTCTTAGAGTGACTATATCTCCTGATAGAATTGCGGTATTGACTATCAAATGCCCTGATTCGTTGTTTATTGTAATATCTCCTCTATCTg > 1:1137007/1‑150 (MQ=255) tgtGCGCGCCATGATTGGCGCGCGCAGGCTATAATGCCAGCCTAATTTCTCCTCCTCTTAGCGTGGCTATAGCTCCGGATAGAGTTGGGGTATTGACGATCAAGTGCGCTGCTTCGTTGTGTATTGTATGATCTCCTGTAGCTGCGGagg > 2:1219396/3‑148 (MQ=255) tgtGCGCGCCATGATTGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAATTTCTCCTCCTCTTAGAGTGACTATATCTCCTGATAGAATTGCGGTATTGACTATCAAATGCCCTGATTCGTTGTTTATTGTAATATCTCCTCTATCTGCAGACg > 2:276588/3‑150 (MQ=255) aTTGCGCGCCAATCATGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAATTTCTCCTCCTCTTAGAGTGACTATATCTCCTGATAGAATTGCGGTATTGACTATCAAATGCCCTGATTCGTTGTTTATTGTAATATCTCCTCTATCTGCAGACg > 2:8275/1‑150 (MQ=255) ttGCGCGCCAATCATGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAATTTCTCCTCCTCTTAGAGTGACTATATCTCCTGATAGAATTGCGGTATTGACTATCAAATGCCCTGATTCGTTGTTTATTGTAATATCTCCTCTATCTGCAGACGa > 1:538717/1‑150 (MQ=255) 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TAGAGATTTAAGCAAGCATTTATTTGGAATGTATTTTTCGTTCGACCTTTGCTTATACATAACAGTCGTTTTTTTAATTTATAAAATAATTCAAAGAAATCAAGACAATAGCGATGTAAAGCACTAAGTTTAAATTGCGCGCCAATCATGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAATTTCTCCTCCTCTTAGAGTGACTATATCTCCTGATAGAATTGCGGTATTGACTATCAAATGCCCTGATTCGTTGTTTATTGTAATATCTCCTCTATCTGCAGACGATAACTTA > NC_000913/2470336‑2470626 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |