| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 2,507,110 | G→C | 10.8% | A262G (GCA→GGA) | fryC ← | putative PTS enzyme IIC component FryC |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 2,507,110 | 0 | G | C | 10.8% | 197.4 / 14.3 | 65 | A262G (GCA→GGA) | fryC | putative PTS enzyme IIC component FryC |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (34/24); new base C (2/5); total (36/29) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.27e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.86e-01 | |||||||||||
GCGTTGAACAGGCGTTTGCCGGTTAAACGACGGTCGATAATGGTCGCCAGCCCCAGACCAATCGGCGGAATAACGATAGCGATAGAACGAGCGGTGACCGGTAATACGTGGTCAGTGGTAAAGCTGAAGGCAACAAAACCTGCGGCTTTGTTGATCGGGCCACCAAGGTCGATTGCTGTCGCCGCGGCGATCCCCATTGCGTACATCAGCGCGCCCTTCTCACCTGCGGCAGTCAGCACAGTACGGATACCGCCGTTGATCCAGCCACCAAAGGGGGTGATGACGTAG > NC_000913/2506969‑2507256 | gCGTTGAACAGGCGTTTGCCGGTTAAACGACGGTCGATAATGGTCGCCAGCCCCAGACCAATCGGCGGAATAACGATAGCGATAGAACGAGCGGTGACCGGTAATACGTGGTCAGTGGTAAAGCTGAAGGCAACAAAACCTGCGGCTttg > 2:512376/1‑150 (MQ=255) ttGAACAGGCGTTTGCCGGTTAAACGACGGTCGATAATGGTCGCCAGCCCCAGACCAATCGGCGGAATAACGATAGCGATAGAACGAGCGGTGACCGGTAATACGTGGTCAGTGGTAAAGCTGAAGGCAACAAAACCTGCGGCTttgttg < 2:1329609/150‑1 (MQ=255) tGAACAGGCGTTTGCCGGTTAAACGACGGTCGATAATGGTCGCCAGCCCCAGACCAATCGGCGGAATAACGATAGCGATAGAACGAGCGGTGACCGGTAATACGTGGTCAGTGGTAAAGCTGAAGGCAACAAAGCCGCAGGTTttgttg < 1:575001/149‑1 (MQ=255) tGAACAGGCGTTTGCCGGTTAAACGACGGTCGATAATGGTCGCCAGCCCCAGACCAATCGGCGGAATAACGATAGCGATAGAACGAGCGGTGACCGGTAATACGTGGTCAGTGGTAAAGCTGAAGGCAACAAAGCCGCAGGTTttgttg > 2:575001/1‑149 (MQ=255) gAACAGGCGTTTGCCGGTTAAACGACGGTCGATAATGGTCGCCAGCCCCAGACCAATCGGCGGAATAACGATAGCGATAGAACGAGCGGTGACCGGTAATACGTGGTCAGTGGTAAAGCTGAAGGCAACAAAACCTGCGGCTTTGTTGAt < 1:960934/150‑1 (MQ=255) accAGGCGTGTGCCGGTTAAACGACGGGCGATAATGGTCGCCAGCCCCAGACCAATCGGCGGAATAACGATAGCGATAGAACGAGCGGTGACCGGTAATACGTTGTCAGTTGTAAAGCTGAAGGCAACAAAACCTGCGGCTTTGTTGATc < 2:575021/148‑1 (MQ=255) aaCAGGCGTTTGCCGGTTAAACGACGGTCGATAATGGTCGCCAGCCCCAGACCAATCGGCGGAATAACGATAGCGATAGAACGAGCGGTGACCGGTAATACGTGGTCAGTGGTAAAGCTGAAGGCAACAAAACCTGCg > 2:472181/1‑138 (MQ=255) aaCAGGCGTTTGCCGGTTAAACGACGGTCGATAATGGTCGCCAGCCCCAGACCAATCGGCGGAATAACGATAGCGATAGAACGAGCGGTGACCGGTAATACGTGGTCAGTGGTAAAGCTGAAGGCAACAAAACCTGCg < 1:472181/138‑1 (MQ=255) aGGCGTTTGCCGGTTAAACGACGGTCGATAATGGTCGCCAGCCCCAGACCAATCGGCGGAATAACGATAGCGATAGAACGAGCGGTGACCGGTAATACGTGGTCAGTGGTAAAGCTGAAGGCAACAAAGCCGCAGGTTttgttgccttca < 1:1305508/150‑7 (MQ=255) aGGCGTTTGCCGGTTAAACGACGGTCGATAATGGTCGCCAGCCCCAGACCAATCGGCGGAATAACGATAGCGATAGAACGAGCGGTGACCGGTAATACGTGGTCAGTGGTAAAGCTGAAGGCAACAAAACCTGCGGCTTTGTTGATCggg < 2:576947/150‑1 (MQ=255) ggCGTTTGCCGGTTAAACGACGGTCGATAATGGTCGCCAGCCCCAGACCAATCGGCGGAATAACGATAGCGATAGAACGAGCGGTGACCGGTAATACGTGGTCAGTGGTAAAGCTGAAGGCAACAAAGCCGCAGGTTttgttgccttcag < 1:282171/150‑8 (MQ=255) ggCGTTTGCCGGTTAAACGACGGTCGATAATGGTCGCCAGCCCCAGACCAATCGGCGGAATAACGATAGCGATAGAACGAGCGGTGACCGGTAATACGTGGTCAGTGGTAAAGCTGAAGGCAACAAAACCTGCGGCTTTGTTGATCGGGc > 1:801143/1‑150 (MQ=255) tGCCGGTTAAACGACGGTCGATAATGGTCGCCAGCCCCAGACCAATCGGCGGAATAACGATAGCGATAGAACGAGCGGTGACCGGTAATACGTGGTCAGTGGTAAAGCTGAAGGCAACAAAACCTGCGGCTTTGTTGATCGGGCCACCaa > 2:113072/1‑150 (MQ=255) ggTTAAACGACGGTCGATAATGGTCGCCAGCCCCAGACCAATCGGCGGAATAACGATAGCGATAGAACGAGCGGTGACCGGTAATACGTGGTCAGTGGTAAAGCTGAAGGCAACAAAACCTGCGGCTTTGTTGATCGGGCCACCAAGGTc > 1:1222284/1‑150 (MQ=255) ggTTAAACGACGGTCGATAATGGTCGCCAGCCCCAGACCAATCGGCGGAATAACGATAGCGATAGAACGAGCGGTGACCGGTAATACGTGGTCAGTGGTAAAGCTGAAGGCAACAAAACCTGCGGCTTTGTTGATCGGGCCACCAAGGTc < 2:1181897/150‑1 (MQ=255) ggTTAAACGACGGTCGATAATGGTCGCCAGCCCCAGACCAATCGGCGGAATAACGATAGCGATAGAACGAGCGGTGACCGGTAATACGTGGTCAGTGGTAAAGCTGAAGGCAACAAAACCTGCGGCTTTGTTGATCGGGCCACCAAGGTc > 2:781820/1‑150 (MQ=255) tAAACGACGGTCGATAATGGTCGCCAGCCCCAGACCAATCGGCGGAATAACGATAGCGATAGAACGCGCGGTGACCGGTAATACGTGGTCAGTGGTAAAGCTGAAGGCAACAAAACCTGCGGCTTTGTTGATCGGGCCACCAAGGTCGAt > 2:909933/1‑150 (MQ=255) aaCGACGTTCGATAATGGTCGCCAGCCCCAGACCTATCGGCGGAATAACGATAGCGTGAGAACGAGCGGTGAGCGGTAATACGTGGTGAGTGGTAAAGCTGATGGCAACAAAACCTGCGGCTTTGTTGATGGGGCCAGCAAGGTCGATTg < 2:117333/150‑1 (MQ=255) acgacgGTCGATAATGGTCGCCAGCCCCAGACCAATCGGCGGAATAACGATAGCGATAGAACGAGCGGTGACCGGTAATACGTGGTCAGTGGTAAAGCTGAAGGCAACAAAACCTGCGGCTTTGTTGATCGGGCCACCAAGGTCGATTGc < 2:322643/150‑1 (MQ=255) acgacgGTCGATAATGGTCGCCAGCCCCAGACCAATCGGCGGAATAACGATAGCGATAGAACGAGCGGTGACCGGTAATACGTGGTCAGTGGTAAAGCTGAAGGCAACAAAACCTGCGGCTTTGTTGATCGGGCCACCAAGGTCGATTGc < 1:1289626/150‑1 (MQ=255) acgacgGTCGATAATGGTCGCCAGCCCCAGACCAATCGGCGGAATAACGATAGCGATAGAACGAGCGGTGACCGGTAATACGTGGTCAGTGGTAAAGCTGAAGGCAACAAAACCTGCGGCTTTGTTGATCGGGCCACCAAGGTCGATTGc < 2:666501/150‑1 (MQ=255) cgacgGTCTATAATGGTCGCCAGCCCAAGACCAATCGGCGGAATAACCATAGCGATAGAACGAGCGGTGACCGGTAATACGTGGTCAGTGGTAAAGCTGAAGGCAACAAAACCTGCGGCTTTGTTGATCGGGCCACCAAGGTCGATTGCt > 2:1171052/1‑150 (MQ=255) tAATGGTCGCCAGCCCCAGACCAATCGGCGGAATAACGATAGCGATAGAACGAGCGGTGACCGGTAATACGTGGTCAGTGGTAAAGCTGAAGGCAACAAAACCTGCGGCTTTGTTGATCGGGCCACCAAGGTCGATTGCTGTCGCCgcgg > 2:285047/1‑150 (MQ=255) tGGTCGCCAGCCCCAGACCAATCGGCGGAATAACGATAGCGATAGAACGAGCGGTGACCGGTAATACGTGGTCAGTGGTAAAGCTGAAGGCAACAAAACCTGCGGCTTTGTTGATCGGGCCACCAAGGTCGATTGCTGTCGCCGCGGCGa > 1:11879/1‑150 (MQ=255) gTCGCCAGCCCCAGACCAATCGGCGGAATAACGATAGCGATAGAACGAGCGGTGACCGGTAATACGTGGTCAGTGGTAAAGCTGAAGGCAACAAAACCTGCGGCTTTGTTGATCGGGCCACCAAGGTCGATTGCTGTCGCCGCGGCGATc > 2:1193807/1‑150 (MQ=255) cAGCCCCAGACCAATCGGCGGAATAACGATAGCGATAGAACGAGCGGTGACCGGTAATACGTGGTCAGTGGTAAAGCTGAAGGCAACAAAACCTCCGGCTTTGTTGATCGGGCCACCAAGGTCGATTGCTGTCGCCGCGGCGATCCCCAt > 2:293693/1‑150 (MQ=255) ccccAGACCAATCGGCGGAATAACGATAGCGATAGAACGAGCGGTGACCGGTAATACGTGGTCAGTGGTAAAGCTGAAGGCAACAAAACCTGCGGCTTTGTTGATCGGGCCACCAAGGTCGATTGCTGTCGCCGCGGCGATCCCCATTGc < 1:688469/150‑1 (MQ=255) ccccAGACCAATCGGCGGAATAACGATAGCGATAGAACGAGCGGTGACCGGTAATACGTGGTCAGTGGTAAAGCTGAAGGCAACAAAACCTGCGGCTTTGTTGATCGGGCCACCAAGGTCGATTGCTGTCGCCGCGGCGATCCCCATTGc < 2:282649/150‑1 (MQ=255) gACCAATCGGCGGAATAACGATAGCGATAGAACGAGCGGTGACCGGTAATACGTGGTCAGTGGTAAAGCTGAAGGCAACAAAACCTGCGGCTTTGTTGATCGGGCCACCAAGGTCGATTGCTGTCGCCGCGGCGATCCCCATTGCGTACa > 2:894996/1‑150 (MQ=255) cAATCGGCGGAATAACGATAGCGATAGAACGAGCGGTGACCGGTAATACGTGGTCAGTGGTAAAGCTGAAGGCAACAAAACCTGCGGCTTTGTTGATCGGGCCACCAAGGTCGATTGCTGTCGCCGCGGCGATCCCCATTGCGTACATCa > 2:1223999/1‑150 (MQ=255) aaTCGGCGGAATAACGATAGCGATAGAACGAGCGGTGACCGGTAATACGTGGTCAGTGGTAAAGCTGAAGGCAACAAAACCTGCGGCTTTGTTGATCGGGCCACCAAGGTCGATTGCTGTCGCCGCGGCGATCCCCATTGCGTACATCAg < 1:594802/150‑1 (MQ=255) ggcggAATAACGATAGCGATAGAACGAGCGGTGACCGGTAATACGTGGTCAGTGGTAAAGCTGAAGGCAACAAAACCTGCGGCTTTGTTGATCGGGCCACCAAGGTCGATTGc > 2:254040/1‑113 (MQ=255) ggcggAATAACGATAGCGATAGAACGAGCGGTGACCGGTAATACGTGGTCAGTGGTAAAGCTGAAGGCAACAAAACCTGCGGCTTTGTTGATCGGGCCACCAAGGTCGATTGc < 1:254040/113‑1 (MQ=255) gAATAACGATAGCGATAGAACGAGCGGTGACCGGTAATACGTGGTCAGTGGTAAAGCTGAAGGCAACAAAACCTGCGGCTTTGTTGATCGGGCCACCAAGGTCGATTGCTGTCGCCGCGGCGATCCCCATTGCGTACATCAGCGCGCCCt > 2:1335624/1‑150 (MQ=255) aaCGATAGCGATAGAACGAGCGGTGACCGGTAATACGTGGTCAGTGGTAAAGCTGAAGGCAACAAAACCTGCGGCTTTGTTGATCGGGCCACCAAGGTCGATTGCTGTCGCCGCGGCGATCCCCATTGCGTACATCAGCGCGCCCTtctc > 1:581630/1‑150 (MQ=255) cgatagcgatagAACGAGCGGTGACCGGTAATACGTGGTCAGTGGTAAAGCTGAAGGCAACAAAACCTGCGGCTTTGTTGATCGGGCCACCAAGGTCGATTGCTGTCGCCGCGGCGATCCCCATTGCGTACATCAGCGCGCCCTTCTCAc < 2:428605/150‑1 (MQ=255) tagcgatagAACGAGCGGTGACCGGTAATACGTGGTCAGTGGTAAAGCTGAAGGCAACAAAACCTGCGGCTTTGTTGATCGGGCCACCAAGGTCGATTGCTGTCGCCGCGGCGATCCCCATTGCGTACATCAGCGCGCCCTTCTCACCTg > 2:34762/1‑150 (MQ=255) cgatagAACGAGCGGTGACCGGTAATACGTGGTCAGTGGTAAAGCTGAAGGCAACAAAACCTGCGGCTTTGTTGATCGGGCCACCAAGGTCGATTGCTGTCGCCGCGGCGATCCCCATTGCGTACATCAGCGCGCCCTTCTCACCTGCgg > 1:76188/1‑150 (MQ=255) tagAACGAGCGGTGACCGGTAATACGTGGTCAGTGGTAAAGCTGAAGGCAACAAAACCTGCGGCTTTGTTGATCGGGCCACCAAGGTCGATTGCTGTCGCCGCGGCGATCCCCATTGCGTACATCAGCGCGCCCTTCTCACCTGCGGCAg < 1:583159/150‑1 (MQ=255) gAACGAGCGGTGACCGGTAATACGTGGTCAGTGGTAAAGCTGAAGGCAACAAAACCTGCGGCTTTGTTGATCGGGCCACCAAGGTCGATTGCTGTCGCCGCGGCGATCCCCATTGCGTACATCAGCGCGCCCTTCTCACCTGCGGCAGTc < 1:1335624/150‑1 (MQ=255) gAACGAGCGGTGACCGGTAATACGTGGTCAGTGGTAAAGCTGAAGGCAACAAAACCTGCGGCTTTGTTGATCGGGCCACCAAGGTCGATTGCTGTCGCCGCGGCGATCCCCATTGCGTACATCAGCGCGCCCTTCTCACCTGCGGCAGTc > 1:375618/1‑150 (MQ=255) cGAGCGGTGACCGGTAATACGTGGTCAGTGGTAAAGCTGAAGGCAACAAAACCTGCGGCTTTGTTGATCGGGCCACCAAGGTCGATTGCTGTCGCCGCGGCGATCCCCATTGCGTACATCAGCGCGCCCTTCTCACCTGCGGCAGTCAGc > 1:1168809/1‑150 (MQ=255) cGAGCGGTGACCGGTAATACGTGGTCAGTGGTAAAGCTGAAGGCAACAAAACCTGCGGCTTTGTTGATCGGGCCACCAAGGTCGATTGCTGTCGCCGCGGCGATCCCCATTGCGTACATCAGCGCGCCCTTCTCACCTGCGGCAGTCAGc < 1:781820/150‑1 (MQ=255) ggTAATACGTGGTCAGTGGTAAAGCTGAAGGCAACAAAACCTGCGGCTTTGTTGATCGGGCCACCAAGGTCGATTGCTGTCGCCGCGGCGATCCCCATTGCGTACGTCAGCGCGCCCTTCTCACCTGCGGCAGTCAGCACAGTACGGATa > 2:733742/1‑150 (MQ=255) ggTAATACGTGGTCAGTGGTAAAGCTGAAGGCAACAAAACCTGCGGCTTTGTTGATCGGGCCACCAAGGTCGATTGCTGTCGCCGCGGCGATCCCCATTGCGTACATCAGCGCGCCCTTCTCACCTGCGGCAGTCAGCACAGTACGGATa > 1:73949/1‑150 (MQ=255) ggTAATACGTGGTCAGTGGTAAAGCTGAAGGCAACAAAACCTGCGGCTTTGTTGATCGGGCCACCAAGGTCGATTGCTGTCGCCGCGGCGATCCCCATTGCGTACATCAGCGCGCCCTTCTCACCTGCGGCAGTCAGCACAGTACGGATa > 2:662905/1‑150 (MQ=255) tAATACGTGGTCAGTGGTAAAGCTGAAGGCAACAAAACCTGCGGCTTTGTTGATCGGGCCACCAAGGTCGATTGCTGTCGCCGCGGCGATCCCCATTGCGTACATCAGCGCGCCCTTCTCACCTGCGGCAGTCAGCACAGTACGGATAcc < 2:581630/150‑1 (MQ=255) tGGTCAGTGGTAAAGCTGAAGGCAACAAAACCTGCGGCTTTGTTGATCGGGCCACCAAGGTCGATTGCTGTCGCCGCGGCGATCCCCATTGCGTACATCAGCGCGCCCTTCTCACCTGCGGCAGTCAGCACAg > 2:826552/1‑133 (MQ=255) tGGTCAGTGGTAAAGCTGAAGGCAACAAAACCTGCGGCTTTGTTGATCGGGCCACCAAGGTCGATTGCTGTCGCCGCGGCGATCCCCATTGCGTACATCAGCGCGCCCTTCTCACCTGCGGCAGTCAGCACAg < 1:826552/133‑1 (MQ=255) ggTCAGTGGTAAAGCTGAAGGCAACAAAACCTGCGGCTTTGTTGATCGGGCCACCAAGGTCGATTGCTGTCGCCGCGGCGATCCCCATTGCGTACATCAGCGCGCCCTTCTCCCCTGCGGCAGTCAGCACAGTACGGATACCGCCGTTGa > 2:58663/1‑150 (MQ=255) tCAGTGGTAAAGCTGAAGGCAACAAAACCTGCGGCTTTGTTGATCGGGCCACCAAGGTCGATTGCTGTCGCCGCGGCGATCCCCATTGCGTACATCAGCGCGCCCTTCTCGCCTGCGGCAGTCAGCACAGTACGGATACCGCCGTTGATc > 2:194670/1‑150 (MQ=255) cAGTGGTAAAGCTGAAGGCAACAAAACCTGCGGCTTTGTTGATCGGGCCACCAAGGTCGATTGCTGTCGCCGCGGCGATCCCCATTGCGTACATCAGCGCGCCCTTCTCACCTGCGGCAGTGAGCACAGTACGGATACCGCCGTTGATcc > 1:474084/1‑150 (MQ=255) cAGTGGTAAAGCTGAAGGCAACAAAACCTGCGGCTTTGTTGATCGGGCCACCAAGGTCGATTGCTGTCGCCGCGGCGATCCCCATTGCGTACATCAGCGCGCCCTTCTCACCTGCGGCAGTCAGCACAGTACGGATACCGCCGTTGATcc > 1:1213282/1‑150 (MQ=255) gTGGTAAAGCTGAAGGCAACAAAACCTGCGGCTTTGTTGATCGGGCCACCAAGGTCGATTGCTGTCGCCGCGGCGATCCCCATTGCGTACATCAGCGCGCCCTTCTCACCTGCGGCAGTCAGCACAGTACGGATACCGCCGTTGATCCAg > 2:893396/1‑150 (MQ=255) ggTAAAGCTGAAGGCAACAAAACCTGCGGCTTTGTTGATCGGGCCACCAAGGTCGATTGCTGTCGCCGCGGCGATCCCCATTGCGTACATCAGCGCGCCCTTCTCACCTGCGGCAGTCAGCACAGTACGGATACCGCCGTTGATCCAGcc > 2:280067/1‑150 (MQ=255) gCTGAAGGCAACAAAACCTGCGGCTTTGTTGATCGGGCCACCAAGGTCGATTGCTGTCGCCGCGGCGATCCCCATTGCGTACATCAGCGCGCCCTTCTCACCTGCGGCAGTCAGCACAGTACGGATACCGCCGTTGATCCAGCCACCaaa < 1:909933/150‑1 (MQ=255) atcctcaacaaAGCCGCAGGTTTTGTTGATCGGGCCACCAAGGTCGATTGCTGTCGCCGCGGCGATCCCCATTGCGTACATCAGCGCGCCCTTCTCACCTGCGGCAGTCAGCACAGTACGGATACCGCCGTTGATCCAGCCACCAAAggg < 1:1156103/145‑1 (MQ=255) aGGCAACAAAACCTGCGGCTTTGTTGATCGGGCCACCAAGGTCGATTGCTGTCGCCGCGGCGATCCCCATTGCGTACATCAGCGCGCCCTTCTCACCTGCGTCAGTCAGCACAGTACGGATACCGCCGTTGATCCAGCCACCAAAggggg < 1:1171052/150‑1 (MQ=255) aGGCAACAAAACCTGCGGCTTTGTTGATCGGGCCACCAAGGTCGATTGCTGTCGCCGCGGCGATCCCCATTGCGTACATCAGCGCGCCCTTCTCACCTGCGGCAGTCAGCACAGTACGGATACCGCCGTTGATCCAGCCACCAAAggggg < 2:801143/150‑1 (MQ=255) caacaaAACCTGCGGCTTTGTTGATCGGGCCACCAAGGTCGATTGCTGTCGCCGCGGCGATCCCCATTGCGTACATCAGCGCGCCCTTCTCACCTGCGGCAGTCAGCACAGTACGGATACCGCCGTTGATCCAGCCACCAAAGGGGGtga > 1:177777/1‑150 (MQ=255) caacaaAACCTGCGGCTTTGTTGATCGGGCCACCAAGGTCGATTGCTGTCGCCGCGGCGATCCCCATTGCCTACATCAGCGCGCCCTTCTCACCTGCGGCAGTCAGCACAGTACGGATACCGCCGTTGATCCAGCCACCAAAGGGGGtga > 2:463435/1‑150 (MQ=255) aaaCCTGCGGCTTTGTTGATCGGGCCACCAAGGTCGATTGCTGTCGCCGCGGCGATCCCCATTGCGTACATCAGCGCGCCCTTCTCACCTGCGGCAGTCAGCACAGTACGGATACCGCCGTTGATCCAGCCACCAAAGGGGGTGATGACg > 2:137624/1‑150 (MQ=255) aaCCTGCGGCTTTGTTGATCGGGCCACCAAGGTCGATTGCTGTCGCCGCGGCGATCCCCATTGCGTACATCAGCGCGCCCTTCTCACCTGCGGCAGTCAGCACAGTACGGATACCGCCGTTGATCCAGCCACCAAAGGGGGTGATGACgt < 1:285047/150‑1 (MQ=255) aaCCTCCGGCTTTGTTGATCGGGCCACCAAGGTCGATTGCTGTCGCCGCGGCGATCCCCATTGCGTACATCAGCGCGCCCTTCTCACCTGCGGCAGTCAGCACAGTACGGATACCGCCGTTGATCCAGCCACCAAAGGGGGTGATGACgt < 1:293693/150‑1 (MQ=255) ccTGCGGCTTTGTTGATCGGGCCACCAAGGTCGATTGCTGTCGCCGCGGCGATCCCCATTGCGTACATCAGCGCGCCCTTCTCACCTGCGGCAGTCAGCACAGTACGGATACCGCCGTTGATCCAGCCACCAAAGGGGGTGATGACgtag > 1:1300758/1‑150 (MQ=255) | GCGTTGAACAGGCGTTTGCCGGTTAAACGACGGTCGATAATGGTCGCCAGCCCCAGACCAATCGGCGGAATAACGATAGCGATAGAACGAGCGGTGACCGGTAATACGTGGTCAGTGGTAAAGCTGAAGGCAACAAAACCTGCGGCTTTGTTGATCGGGCCACCAAGGTCGATTGCTGTCGCCGCGGCGATCCCCATTGCGTACATCAGCGCGCCCTTCTCACCTGCGGCAGTCAGCACAGTACGGATACCGCCGTTGATCCAGCCACCAAAGGGGGTGATGACGTAG > NC_000913/2506969‑2507256 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |