| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 2,561,012 | A→T | 14.3% | intergenic (+114/‑356) | yffL → / → yffM | CPZ‑55 prophage; uncharacterized protein YffL/CPZ‑55 prophage; uncharacterized protein YffM |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 2,561,012 | 0 | A | T | 14.3% | 119.5 / 2.4 | 56 | intergenic (+114/‑356) | yffL/yffM | CPZ‑55 prophage; uncharacterized protein YffL/CPZ‑55 prophage; uncharacterized protein YffM |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (28/19); new base T (5/3); total (33/23) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
ACCAGTTATTATTCAAGCCGTACAACATGAAATAACGGAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCCGGTCGGTCATAGAGAGTCGCCTAGAGTTAAACAGAAGAATTATTTCGCCGCCTGATAGGTCGGCTG > NC_000913/2560864‑2561161 | aCCAGTTATTATTCAAGCCGTACAACATGAAATAACGGAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAg > 1:478235/1‑150 (MQ=255) ccAGTTATTATTCAAGCCGTACAACATGAAATAAAGGAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGACGTTAGTGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTAAAAAGt > 1:710177/1‑150 (MQ=255) aGTTATTATTCAAGCCGTACAACATGAAATAACGTAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTg < 1:351406/150‑1 (MQ=255) aGTTATTATTCAAGCCGTACAACATGAAATAACGGAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTg < 1:346053/150‑1 (MQ=255) ttattaTTGAAGCCGTATAACATGAAATAACGGAATCAGGCTTGCAATTTTTCCGCCTTTTGTTTTCCTTTATTCCATGAATTCAGGTGGGTAAAATTTTGCCGTTTGTGGTGGGTCAAAAGTTGCCTTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGcc < 2:478235/150‑1 (MQ=25) attattCAAGCCGTACAACATGAAATAACGGAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTTGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGt > 1:693410/1‑150 (MQ=255) tattCAAGCCGTACAACATGAAATAACGGAATCAGGCTGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTa < 1:1119191/150‑1 (MQ=255) attCAAGCCGTACAACATGAAATAACGGAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGGTAAAATTTTGCCGTGTAGGAGGGGCAATTGTTGGCgggaa > 1:1313835/1‑146 (MQ=255) cAAGCCGTACAACATGAAATAACGGAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGt > 1:1327556/1‑150 (MQ=255) cAAGCCGTACAACATGAAATAACGGAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCAATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGGTCAAAATTAGCCGTTAAGGTGGGTCAAATGTTGACGTTAAGGt > 1:470236/1‑150 (MQ=255) aaGCCGTACATCATGAAATTACGGAATAAGGCGGGCAATGTTCCCTCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAATTTGCCGTTAGTGGTGGGTCAAAAGTTTCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTg < 2:1143931/150‑1 (MQ=255) tccttACAAGATTAAATAACGGAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCATTTTCTTTGCCTTATTTCCATGAATTCAGGTGGGTTAAAATTTGGCGTTAGTGTTGGGTAAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTggg < 2:1327556/146‑1 (MQ=38) gCCGTACAACATGAATTATCGGATTCAGGCGTGCATTGTTCCCTAATTTTCTTTGACTTTATTCCATGAATTCAGTTGGGGAAAAAGTTGCCGTTAGTGGTTGGTTAATAGTTTCCGTTTAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTggg < 2:662837/150‑1 (MQ=255) cGTACAACATCAAATAACGGAATCCGTCGGGCACTTTTCCCGCCTTTTGTTTGCCATAAATCCATGAATTCTGGTGGGTAAAAATTTGCCTTTATTGGTGGGTCAAAAGTTGCCTTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTc < 2:1172300/150‑1 (MQ=25) caTGAAATAACGGAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTGAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTGAAGGTGGGGGAAATGtt > 1:915710/1‑150 (MQ=255) caTGAAATAACGGAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGGTAAAAAGTTGACGTTAAGGTGGGTCAAATGTTGGAGTGTAGGGGGGTCGAAAGtt > 1:421856/1‑150 (MQ=255) caTGAAATAACGGAATCAGGCCGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTTCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGtt < 1:277123/150‑1 (MQ=255) tGAAATAACGGAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTACTGGTGGGTCAAAAGTAGCCGTTAAGGAGGGTCAAATGTTGAAGTTAAGGTGGGGCAAAAGTAGc > 1:582687/1‑150 (MQ=255) aaaTAACGGAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGGGGGTCAAAATTTGCAGTTTAGGTGGGTGAAATGTTgagg > 1:580197/1‑147 (MQ=255) gAATCCGGCGGGCAATCTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGGGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGaa < 1:974407/150‑1 (MQ=255) ggCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTGAAAAGTTGAATAGTAAGAATTctaa > 1:107099/1‑149 (MQ=255) cAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGGTCAAAATTTGCATTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCAGTAAACGTGGGTCAAAATTTGAAGAGTAAGAATTGTAAAATTaa > 2:22656/1‑150 (MQ=25) tCCAGCCTTTTGTTTTCCTTTAATTAATGAATTCAGGTTGGTCAAAAGCTGGCTTTTTTTTTGGGTAATAACTTGCCTTTAAGGTGGGTAAAATGTTGCCTTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTc < 2:1185419/150‑1 (MQ=255) cccGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTATTGTTGGGTCAAAAGTTGCATTTAAGGAGGCTCAAATTTTGGCGTATAGGTGGGGGAAATGTTGACTAGTAAGAATTGTACTATTATTAAttgt > 1:8906/1‑148 (MQ=255) ccGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGACGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTa > 1:547398/1‑150 (MQ=255) gCCTTTTGTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGCTGCCGTTAGGGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAgg < 2:951515/150‑1 (MQ=255) ccTTTTCTTTTGCTTAATTCCATGAATTCAGGTTGGTAAAAAGTAGCCTTTACTGGTGGGTCAAAAGTTGCCTTTAAGGTGTGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGc < 1:917971/150‑1 (MQ=37) tttCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGGTAAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCAGTTAAGGTGGGTGAAAATTTGCAGAGTAAGAATTGTTCTTTTAAGATTTCTAGGCGag > 1:846745/1‑149 (MQ=37) tCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACAATTAAGAATTCTAGGCGACgg > 2:775929/1‑150 (MQ=255) cTTTCCCTTAATTCCATGAATTCAGTGGGGTCAAAAGAACCCCTTATGGGTGGGTCAAATCCTGCCTTTACGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACggg < 1:1248752/150‑1 (MQ=25) ttAATTACATGAATTCTGTTGGGTTATTTTTTGGCCTTTTTGTTGGCTAATATGTTGCCTTTTAGGTGGGTTAAAAGTTGCCTTTAAGGTGTGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGttttt < 2:337768/150‑1 (MQ=255) ttCCATGAATTCAGGTGGGTCAACAGTTGCCGTTAGTGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAGGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGc < 1:1150410/150‑1 (MQ=255) ttCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAATTTGCAGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGCATTCTACGATTATGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAga > 1:1347753/1‑149 (MQ=38) tCCATGAATTCCGGCGCGTCCAAATTTCGCCTTCCGGGGGGGTCACAAGCGGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGcc < 1:125523/150‑1 (MQ=25) cATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGGTCAAATGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTTAGGGGGGGGAAATTTTGCCGCGTAAGAATTGTACTATTAAGATTTCTTGGCGGCGTGAGTTTTTTAgggtt > 1:448256/1‑146 (MQ=21) aTGAATTCAGGTGCGTCAAAATATGCCGTTCCGGGGGGGTCAAAAGCTGCCTTTTAGTTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTcc < 1:824589/150‑1 (MQ=37) aaTTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGGGGGTGAAAAGTTGGCGAGTAAGAATTCTAGTTTTAAGAATTGTACGGGACGGGAGTTAATTAGCATGCcgg > 1:990166/1‑150 (MQ=25) cAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAATTTGCCGTTAAGGTGGGGCAAAAGTTGACGAGTAAGAATTCTACAATTAAGAATTCTACGCGACGGGAGTTTTTTAGCATCCcggtcgg > 1:47729/1‑150 (MQ=37) gTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCCGGTCGGTCATaga > 1:18545/1‑150 (MQ=255) gTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCCGGTCGGTCATaga > 1:626594/1‑150 (MQ=255) cAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTGAAAAGTTGACGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGAAGGGAGTTTTTTAGCCTCCCGGTCGGTCATagaga > 2:614607/1‑150 (MQ=255) aGTTGCCGTTAGTGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCCGGTCGGTCATAGAGAGTCg > 1:409927/1‑150 (MQ=255) gtggtgGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCCGGTCGGTCATAGAGAGTCGCCTAGAGTTaa > 1:894963/1‑150 (MQ=255) ggtggGTCAAAAGTTGCCTTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCCGGTCGGTCATAGAGAGTCGCCTAGAGTTAAAc < 2:278052/150‑1 (MQ=255) ggtggGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCCGGTCGGTCATAGAGAGTCGCCTAGAGTTAAAc > 1:1050637/1‑150 (MQ=255) ggtggGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCCGGTCGGTCATAGAGAGTCGCCTAGAGTTAAAc > 2:1330956/1‑150 (MQ=255) gtggGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCCGGTCGGTCATAGAGAGTCGCCTAGAGTTAAACa < 2:626594/150‑1 (MQ=255) tGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCCGGTCGGTCATAGAGAGTCGCCTAGAGTTAAACAGAAGAATTATTTc > 2:1053486/1‑150 (MQ=255) gTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCCGGTCGGTCATAGAGAGTCGCCTAGAGTTAAACAGAAGAATTATTTcgccg > 1:328861/1‑150 (MQ=255) tatgTGGGTCAAATGTTGGCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCCGGTCGGTCATAGAGAGTCGCCTAGAGTTAAACAGAAGAATTATTTCGCCGCCt < 2:8906/147‑1 (MQ=255) tGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCCGGTCGGTCATAGAGAGTCGCCTAGAGTTAAACAGAAGAATTATTTCGCCGCCTGATa > 2:1053818/1‑150 (MQ=255) gggTCAAATGTTGCCTTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTATACTTAATGTCTGTGATAGATAGTAGATTATATTTAAACATAAGAATTTTTTCTCAGGATGATAg < 2:470236/150‑1 (MQ=255) gTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCCGGTCGGTCATAGAGAGTCGACTAGAGTTAAACAGAAGAATTATTTCGCCGACTGATAGGt > 1:1372224/1‑150 (MQ=255) gTCAAAAGTTGCAGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGACTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGCCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCCGGTCGGTCATAGAGAGTCGACTACAGTTAAACAGAAGAATTAATTCGCCGCCTGATacgg > 1:170511/1‑147 (MQ=255) tCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCCGGTCGGTCATAGAGAGTCGCCTAGAGTTAAACAGAAGAATTATTTCGCCGCCTGATAGGTc < 1:427/150‑1 (MQ=255) cAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCCGGTCGGTCATAGAGAGTCGCCTAGAGTTAAACAGAAGAATTATTTCGCCGCCTGATAGGTCg > 2:387321/1‑150 (MQ=255) aaaaGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATCCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCCGGTCGGTCATAGAGAGTCGCCTAGAGTTAAACAGAAGAATTATTTCGCCGCCTGATAGGTCgg > 2:751701/1‑150 (MQ=255) aaaGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCCGGTCGGTCATAGAGAGTCGCCTAGAGTTAAACAGAAGAATTATTTCGCCGCCTGATAGGTCGGc < 2:1050637/150‑1 (MQ=255) aaaGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAG‑‑TTTTAGCCTCCCGGTCGGTCATAGAGAGTCGCCTAGAGTTAAACAGAAGAATTATTTCGCCGCCTGATAGGTCGGCTg < 1:1182145/150‑1 (MQ=255) aaGTTGCCGTTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCCGGTCGGGCATAGAGAGTCGCCTAGAGTTAAACAGAAGAATTATTTCGCCGCCTGATAGGTCGGCt < 2:519358/150‑1 (MQ=255) aGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCCGGTCGGTCATAGAGAGTCGCCTAGAGTTAAACAGAAGAATTATTTCGCCGCCTGATa > 2:398244/1‑141 (MQ=255) aGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCCGGTCGGTCATAGAGAGTCGCCTAGAGTTAAACAGAAGAATTATTTCGCCGCCTGATa < 1:398244/141‑1 (MQ=255) aGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCCGGTCGGTCATAGAGAGTCGCCTAGAGTTAAACAGAAGAATTATTTCGCCGCCTGATAGGTCGGCTg < 2:399164/150‑1 (MQ=255) | ACCAGTTATTATTCAAGCCGTACAACATGAAATAACGGAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCCGGTCGGTCATAGAGAGTCGCCTAGAGTTAAACAGAAGAATTATTTCGCCGCCTGATAGGTCGGCTG > NC_000913/2560864‑2561161 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |