Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 2,892,552 | C→T | 7.7% | T113T (ACC→ACT) ‡ | queD → | 6‑carboxy‑5,6,7,8‑tetrahydropterin synthase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 2,892,552 | 0 | C | T | 7.7% | 192.1 / 4.9 | 65 | T113T (ACC→ACT) ‡ | queD | 6‑carboxy‑5,6,7,8‑tetrahydropterin synthase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (27/32); new base T (3/2); total (30/35) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.59e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 5.51e-01 |
CCAACCTACGAGCGCCTCGATCACCATTATCTCAATGATATTCCAGGTCTGGAAAACCCAACCAGCGAGGTTTTAGCAAAATGGATTTGGGATCAGGTTAAACCCGTTGTGCCGCTGTTAAGTGCGGTGATGGTAAAAGAAACCTGCACCGCAGGTTGTATCTATCGCGGCGAATGATAAGAGTGTGTCGGCGGTCAATTTCCCTTAAGTAACGCTATGTTAGGGTGTTGTGTTCTGGATATCTGGGGCATGACATGGAAGACGACTGCGACATTATTATTATTGGTGCCGGTATTGCA > NC_000913/2892403‑2892701 | ccaaccTACGAGCGCCTCGATCACCATTATCTCAATGATATTCCAGGTCTGGAAAACCCAACCAGCGAGGTTTTAGCAAAATGGATTTGGGATCAGGTTAAACCCGTTGTGCCGCTGTTAAGTGCGGTGATGGTAAAAGAAACCTGCAcc > 1:96357/1‑150 (MQ=255) tcgcCTCGATCACCATTATCTCAATGATATTCCAGGTCTGGAAAACCCAACCAGCGAGGTTTTAGCAAAATGGATTTGGGATCAGGTTAAACCCGTTGTGCCGCTGTTAAGTGCGGTGATGGTAAAAGAAACCTGCGGTGCAGGtttctt < 2:121611/149‑5 (MQ=255) cgcCTCGATCACCATTATCTCAATGATATTCCAGGTCTGGAAAACCCAACCAGCGAGGTTTTAGCAAAATGGATTTGGGATCAGGTTAAACCCGGTGTGCCGCTGTTAAGTGCGGTGATGGTAAAAGAAACCTGCACCGCAGGTTGtatc < 1:408916/150‑1 (MQ=255) gcCTCGATCACCATTATCTCAATGATATTCCAGGTCTGGAAAACCCAACCAGCGAGGTTTTAGCAAAATGGATTTGGGATCAGGTTAAACCCGTTGTGCCGCTGTTAAGTGCGGTGATGGTAAAAGAAACCTGCGGTGCAGGtttctttt < 1:480117/150‑7 (MQ=255) ccTCGATCACCATTATCTCAATGATATTCCAGGTCTGGAAAACCCAACCAGCGAGGTTTTAGCAAAATGGATTTGGGATCAGGTTAAACCCGTTGTGCCGCTGTTTAGTGCGGTGATGGTAAAAGAAACCTGCACCGCAGGTTGtatcta > 2:1258062/1‑150 (MQ=255) cACCATTATCTCAATGATATTCCAGGTCTGGAAAACCCAACCAGCGAGGTTTTAGCAAAATGGATTTGGGATCAGGTTAAACCCGTTGTGCCGCTGTTAAGTGCGGTGATGGTAAAAGAAACCTGCATCGCAGGTTGTATCTATCgcggc < 1:1015936/150‑1 (MQ=255) aCCATTATCTCAATGATATTCCAGGTCTGGAAAACCCAACCAGCGAGGTTTTAGCAAAATGGATTTGGGATCAGGTTAAACCCGTTGTGCCGCTGTTAAGTGCGGTGATGGTAAAAGAAACCTGCACCGCAGGTTGTATCTATCgcggcg > 1:1374772/1‑150 (MQ=255) ccATTATCTCAATGATATTCCAGGTCTGGAAAACCCAACCAGCGAGGTTTTAGCAAAATGGATTTGGGATCAGGTTAAACCCGTTGTGCCGCTGTTAAGTGCGGTGATGGTAAAAGAAACCTGCACCGCAGGTTGTATCTATCGCGGCGa > 2:998429/1‑150 (MQ=255) ccATTATCTCAATGATATTCCAGGTCTGGAAAACCCAACCAGCGAGGTTTTAGCAAAATGGATTTGGGATCAGGTTAAACCCGTTGTGCCGCTGTTAAGTGCGGTGATGGTAAAAGAAACCTGCACCGCAGGTTGTATCTATCGCGGCGa > 2:144373/1‑150 (MQ=255) aTTATCTCAATGATATTCCAGGTCTGGAAAACCCAACCAGCGAGGTTTTAGCAAAATGGATTTGGGATCAGGTTAAACCCGTTGTGCCGCTGTTAAGTGCGGTGATGGTAAAAGAAACCTGCACCGCAGGTTGTATCTATCGCGGCGAAt > 2:1355779/1‑150 (MQ=255) ctcAATGATATTCCAGGTCTGGAAAACCCAACCAGCGAGGTTTTAGCAAAATGGATTTGGGATCAGGTTAAACCCGTTGTGCCGCTGTTAAGTGCGGTGATGGTAAAAGAAACCTGCACCGCAGGTTGTATCTATCGCGGCGAATGATaa < 2:677844/150‑1 (MQ=255) aaTGATATTCCAGGTCTGGAAAACCCAACCAGCGAGGTTTTAGCAAAATGGATTTGGGATCAGGTTAAACCCGTTGTGCCGCTGTTAAGTGCGGTGATGGTAAAAGAAACCTGCACCGCAGGTTGTATCTATCGCGGCGAATGATAagag < 1:1333623/150‑1 (MQ=255) aTGATATTCCAGGTCTGGAAAACCCAACCAGCGAGGTTTTAGCAAAATGGATTTGGGATCAGGTTAAACCCGTTGTGCCGCTGTTAAGTGCGGTGATGGTAAAAGAAACCTGCACCGCAGGTTGTATCTATCGCGGCGAATGATAAGAgt > 1:1334161/1‑150 (MQ=255) tGATATTCCAGGCCTGGAAAACCCAACCAGCGAGGTTTTAGCAAAATGGATTTGGGATCAGGTTAAACCCGTTGTGCCGCTGTTAAGTGCGGTGATGGTAAAAGAAACCTGCACCGCAGGTTGTATCTATCGCGGCGAATGATAAGAgtg < 2:261573/150‑1 (MQ=255) ggttttCCAGACCTGGAAAACCCAACCAGCGAGGTTTTAGCAAAATGGATTTGGGATCAGGTTAAACGCGTTGTGCCGCTGTTAAGTGCGGTGATGGTAAAAGAAACCTGCACCGGAGGTTGTATCTATCGCGGCGATTGATAAGAgtgt > 1:162903/5‑150 (MQ=255) atatTCCAGGTCTGGAAAACCCAACCAGCGAGGTTTTAGCAAAATGGATTTGGGATCAGGTTAAACCCGTTGTGCCGCTGTTAAGTGCGGTGATGGTAAAAGAAACCTGCACCGCAGGTTGTATCTATCGCGGCGAATGATAAGAgtgtg < 1:998429/150‑1 (MQ=255) ttCCAGGTCTGGAAAACCCAACCAGCGAGGTTTTAGCAAAATGGATTTGGGATCAGGTTAAACCCGTTGTGCCGCTGTTAAGTGCGGTGATGGTAAAAGAAACCTGCACCGCAGGTTGTATCTATCGCGGCGAATGATAAGAGTGTGTcg > 1:622199/1‑150 (MQ=255) ttCCAGGTCTGGAAAACCCAACCAGCGAGGTTTTAGCAAAATGGATTTGGGATCAGGTTAAACCCGTTGTGCCGCTGTTAAGTGCGGTGATGGTAAAAGAAACCTGCACCGCAGGTTGTATCTATCGCGGCGAATGATAAGAGTGTGTcg < 2:1279896/150‑1 (MQ=255) tCCAGGTCTGGAAAACCCAACCAGCGAGGTTTTAGCAAAATGGATTTGGGATCAGGTTAAACCCGTTCTGCCGCTGTTAAGTGCGGTGATGGTAAAAGAAACCTGCACCGCAGGTTGTATCTATCGCGGCGAATGATAAGAGTGTGTcgg > 1:527020/1‑150 (MQ=255) aGGTCTGGAAAACCCAACCAGCGAGGTTTTAGCAAAATGGATTTGGGATCAGGTTAAACCCGTTGTGCCGCTGTTAAGTGCGGTGATGGTAAAAGAAACCTGCACCGCAGGTTGTATCTATCGCGGCGAATGATAAGAGTGTGTcggcgg < 2:172902/150‑1 (MQ=255) gTCTGGAAAACCCAACCAGCGAGGTTTTAGCAAAATGGATTTGGGATCAGGTTAAACCCGTTGTGCCGCTGTTAAGTGCGGTGATGGTAAAAGAAACCTGCACCGCAGGTTGTATCTATCGCGGCGAATGATAAGAGTGTGTCGGCGGTc < 1:1361631/150‑1 (MQ=255) tCTGGAAAACCCAACCAGCGAGGTTTTAGCAAAATGGATTTGGGATCAGGTTAAACCCGTTGTGCCGCTGTTAAGTGCGGTGATGGTAAAAGAAACCTGCACCGCAGGTTGTATCTATCGCGGCGAATGATAAGAGTGTGTCGGCGGTCa < 1:617291/150‑1 (MQ=255) ggAAAACCCAACCAGCGAGGTTTTAGCAAAATGGATTTGGGATCAGGTTAAACCCGTTGTGCCGCTGTTAAGTGCGGTGATGGTAAAAGAAACCTGCACCGCAGGTTGTATCTATCGCGGCGAATGATAAGAGTGTGTCGGCGGTCAAtt > 2:340532/1‑150 (MQ=255) aaaaCCCAACCAGCGAGGTTTTAGCAAAATGGATTTGGGATCAGGTTAACCCCGTTGTGCCGCTGTTAAGTGCGGGGATGGTAAAAGAAACCTGCACCGCAGGGTGTATCTATCGCGGCGAATGATAAGAGTGCGCCGGCGGTCAATTTc < 2:892878/150‑1 (MQ=255) aaaaCCCAACCAGCGAGGTTTTAGCAAAATGGATTTGGGATCAGGTTAAACCCGTTGTGCCGCTGTTAAGTGCGGTGATGGTAAAAGAAACCTGCACCGCAGGTTGTATCTATCGCGGCGAATGATAAGAGTGTGTCGGCGGTCAATTTc < 1:636395/150‑1 (MQ=255) aaCCCAACCAGCGAGGTTTTAGCAAAATGGATTTGGGATCAGGTTAAACCCGTTGTGCCGCTGTTAAGTGCGGTGATGGTAAAAGAAACCTGCACCGCAGGTTGTATCTATCGCGGCGAATGATAAGAGTGTGTCGGCGGTCAATTTccc < 1:546183/150‑1 (MQ=255) ccAGCGAGGGGTTAGCAAAATGGATTTGGGAGCAGGTTAAACCCGTTGTGCCGCTGTTAAGTGCGGTGATGGTAAAAGAACCCTGCACCGCAGGTTGTATCTCTCGCGGCGAATGATAAGAGTGAGGCGGCGGTCAATTTCCCTTAAGTa < 2:156519/150‑1 (MQ=255) gAGGTTTTAGCAAAATGGATTTGGGATCAGGTTAAACCCGTTGTGCCGCTGTTAAGTGCGGTGATGGTAAAAGAAACCTGCACCGCAGGTTGta > 2:75653/1‑94 (MQ=255) gAGGTTTTAGCAAAATGGATTTGGGATCAGGTTAAACCCGTTGTGCCGCTGTTAAGTGCGGTGATGGTAAAAGAAACCTGCACCGCAGGTTGta < 1:75653/94‑1 (MQ=255) aGCAAAATGGATTTGGGATCAGGTTAAACCCGTTGTGCCGCTGTTAAGTGCGGTGATGGTAAAAGAAACCTGCACCGCAGGTTGTATCTATCGCGGCGAATGATAAGAGTGTGTCGGCGGt < 1:1211031/121‑1 (MQ=255) aGCAAAATGGATTTGGGATCAGGTTAAACCCGTTGTGCCGCTGTTAAGTGCGGTGATGGTAAAAGAAACCTGCACCGCAGGTTGTATCTATCGCGGCGAATGATAAGAGTGTGTCGGCGGt > 2:1211031/1‑121 (MQ=255) gCAAAATGGATTTGGGATCAGGTTAAACCCGTTGTGCCGCTGTTAAGTGCGGTGATGGTAAAAGAAACCTGCACGGGAGGTTGTATCTATCGCGGCGAATGATAAGAGTGTGTCGGGGGTGAATTTCCCTTAAGTAACGCTATGTTAggg < 2:529557/150‑1 (MQ=255) gCAAAATGGATTTGGGATCAGGTTAAACCCGTTGTGCCGCTGTTAAGTGCGGTGATGGTAAAAGAAACCTGCACCGCAGGTTGTATCTATCGCGGCGAATGATAATAGTGTGTCGGCGGTCAATTTCCCTTAAGTAACGCTATGTTAggg < 2:941858/150‑1 (MQ=255) gCAAAATGGATTTGGGATCAGGTTAAACCCGTTGTGCCGCTGTTAAGTGCGGTGATGGTAAAAGAAACCTGCACCGCAGGTTGTATCTATCGCGGCGAATGATAAGAGTGTGTCGGCGGTCAATTTCCCTTAAGTAACGCTATGTTAggg > 2:150734/1‑150 (MQ=255) ggATTTGGGATCAGGTTAAACCCGTTGTGCCGCTGTTAAGTGCGGTGATGGTAAAAGAAACCTGCACCGCAGGTTGTATCTATCGCGGCGAATGATAAGAGTGTGTCGGCGGTCAATTTCCCTTAAGTAACGCTATGTTAGGgtgttgtg > 2:86907/1‑150 (MQ=255) ggATTTGGGATCAGGTTAAACCCGTTGTGCCGCTGTTAAGTGCGGTGATGGTAAAAGAAACCTGCACCGCAGGTTGTATCTATCGCGGCGAATGATAAGAGTGTGTCGGCGGTCAATTTCCCTTAAGTAACGCTATGTTAGGgtgttgtg < 2:796829/150‑1 (MQ=255) tGGGATCAGGTTAAACCCGTTGTGCCGCTGTTAAGTGCGGTGATGGTAAAAGAAACCTGCACCGCAGGTTGTATCTATCGCGGCGAATGATAAGAGTGTGTCGGCGGTCAATTTCCCTTAAGTAACGCTATGTTAGGGTGTTGTGTTCTg > 2:494351/1‑150 (MQ=255) gggATCAGGTTAAACCCGTTGTGCCGCTGTTAAGTGCGGTGATGGTAAAAGAAACCTGCACCGCAGGTTGTATCTATCGCGGCGAATGATAAGAGTGTGTCGGCGGTCAATTTCCCTTAAGTACCGCTATGTTAGGGTGTTGTGTTCTgg > 1:184691/1‑150 (MQ=255) ggATCAGGTTAAACCCGTTGTGCCGCTGTTAAGTGCGGTGATGGTAAAAGAAACCTGCACCGCAGGTTGTATCTATCGCGGCGAATGATAAGAGTGTGTCGGCGGTCAATTTCCCTTAAGTAACGCTATGTTAGGGTGTTGTGTTCTGGa < 2:96357/150‑1 (MQ=255) aTCAGGTTAAACCCGTTGTGCCGCTGTTAAGTGCGGTGATGGTAAAAGAAACCTGCACCGCAGGTTGTATCTATCGCGGCGAATGATAAGAGTGTGTCGGCGGTCAATTTCCCTTAAGTAACGCTATGTTAGGGTGTTGTGTTCTGGata < 2:1374772/150‑1 (MQ=255) gTTAAACCCTTTGTGCCGCGGTTAAGTGCGGTGATGGTAAAAGAAACCTGCACCGCAGGTTGTATCTATCGCGGCGAATGATAAGAGTGTGTCGGCGGTCAATTTCCCTTAAGTAACGCTATGTTAGGGTGTTGTGTTCTGGATATCTgg < 2:484458/150‑1 (MQ=255) gTTAAACCCGTTGTGCCGCTGTTAAGTGCGGTGATGGTAAAAGAAACCTGCACCGCAGGTTGTATCTATCGCGGCGAATGATAAGAGTGTGTCGGCGGTCAATTTCCCTTAAGTAACGCTATGTTAGGGTGTTGTGTTCTGGATATCTgg > 1:451393/1‑150 (MQ=255) ttAAACCCGTTGTGCCGCTGTTAAGTGCGGTGATGGTAAAAGAAACCTGCACCGCAGGTTGTATCTATCGCGGCGAATGATAAGAGTGTGTCGGCGGTCAATTTCCCTTAAGTAACGCTATGTTAGGGTGTTGTGTTCTGGATATCTggg < 2:1012196/150‑1 (MQ=255) ttAAACCCGTTGTGCCGCTGTTAAGTGCGGTGATGGTAAAAGAAACCTGCACCGCAGGTTGTATCTATCGCGGCGAATGATAAGAGTGTGTCGGCGGTCAATTTCCCTTAAGTAACGCTATGTTAGGGTGTTGTGTTCTGGATATCTggg < 2:411578/150‑1 (MQ=255) aaaCCCGTTGTGCCGCTGTTAAGTGCGGTGATGGTAAAAGAAACCTGCACCGCAGGTTGTATCTATCGCGGCGAATGATAAGAGTGTGTCGGCGGTCAATTTCCCTTAAGTAACGCTATGTTAGGGTGTTGTGTTCTGGATATCTGGGGc < 1:805805/150‑1 (MQ=255) aaCCCGTTGTGCCGCTGTTAAGTGCGGTGATGGTAAAAGAAACCTGCACCGCAGGTTGTATCTATCGCGGCGAATGATAAGAGTGTGTCGGCGGTCAATTTCCCTTAAGTAACGCTATGTTAGGGTGTTGTGTTCTGGATATCTGGGGCa < 1:725408/150‑1 (MQ=255) aaCCCGTTGTGCCGCTGTTAAGTGCGGTGATGGTAAAAGAAACCTGCACCGCAGGTTGTATCTATCGCGGCGAATGATAAGAGTGTGTCGGCGGTCAATTTCCCTTAAGTAACGCTATGTTAGGGTGTTGTGTTCTGGATATCTGGGGCa < 1:340532/150‑1 (MQ=255) aCCCGTTGTGCCGCTGTTAAGTGCGGTGATGGTAAAAGAAACCTGCACCGCAGGTTGTATCTATCGCGGCGAATGATAAGAGTGTGTCGGCGGTCAATTTCCCTTAAGTAACGCTATGTTAGGGTGTTGTGTTCTGGATATCTGGGGCAt > 2:855797/1‑150 (MQ=255) gCCGCTGTTAAGTGCGGTGATGGTAAAAGAAACCTGCACCGCAGGTTGTATCTATCGCGGCGAATGATAAGAGTGTGTCGGCGGTCAATTTCCCTTAAGTAACGCTATGTTAGGGTGTTGTGTTCTGGATATCTGGGGCATGACATGGaa > 2:666302/1‑150 (MQ=255) cTGTTATGTGCGGTGATGGTAAAAGAAACCTGCACCGCAGGTTGTATCTATCGGGGCGAATGATAAGAGTGTGGCGGGGGTCAATTTCCCTTAAGTAACGCTATGTTAGGGTGTTGTGTTCTGGATATCTGGGGCATGACATGGAAgacg < 2:764394/150‑1 (MQ=255) cTGTTAAGTGCGGTGATGGTAAAAGAAACCTGCACCGCAGGTTGTATCTATCGCGGCGAATGATAAGAGTGTGTCGGCGGTCAATTTCCCTTAAGTAACGCTATGTTAGGGTGTTGTGTTCTGGATATCTGGGGCATGACATGGAAgacg < 2:622199/150‑1 (MQ=255) gCGGTGATGGTAAAAGAAACCTGCACCGCAGGTTGTATCTATCGCGGCGAATGATAAGAGTGTGTCGGCGGTCAATTTCCCTTAAGTAACGCTATGTTAGGGTGTTGTGTTCTGGATATCTGGGGCATGACATGGAAGACGACTGCGACa > 2:411242/1‑150 (MQ=255) gTGATGGTAAAAGAAACCTGCACCGCAGGTTGTATCTATCGCGGCGAATGATAAGAGTGTGTCGGCGGTCAATTTCCCTTAAGTAACGCTATGTTAGGGTGTTGTGTTCTGGATATCTGGGGCATGACATGGAAGACGACTGCGACatta < 1:1258062/150‑1 (MQ=255) aTGGTAAAAGAAACCTGCACCGCAGGTTGTATCTATCGCGGCGAATGATAAGAGTGTGTCGGCGGTCAATTTCCCTTAAGTAACGCTATGTTAGGGTGTTGTGTTCTGGATATCTGGGGCATGACATGGAAGACGACTGCGACattatta < 1:855797/150‑1 (MQ=255) ggTAAAAGAAACCTGCACCGCAGGTTGTATCTATCGCGGCGAATGATAAGAGTGTGTCGGCGGTCAATTTCCCTTAAGTAACGCTATGTTAGGGTGTTGTGTTCTGGATATCTGGGGCATGACATGGAAGACGACTGCGACattattatt > 1:898652/1‑150 (MQ=255) tAAAAGAAACCTGCACCGCAGGTTGTATCTATCGCGGCGAATGATAAGAGGGTGTCGGCGGTCAATTTCCCTTAAGTAACGCTATGTTAGGGTGTTGTGTTCTGGATATCTGGGGCATGACATGGAAGACGACTGCGACattattattat < 1:1149940/150‑1 (MQ=255) aaaaGAAACCTGCACCGCAGGTTGTATCTATCGCGGCGAATGATAAGAGTGTGTCGGCGGTCAATTTCCCTTAAGTAACGCTATGTTAGGGTGTTGTGTTCTGGATATCTGGGGCATGACATGGAAGACGACTGCGACattattattatt > 2:545314/1‑150 (MQ=255) atacaaCCTGCGGTGCAGGTTGTATCTATCGCGGCGAATGATAAGAGTGTGTCGGCGGTCAATTTCCCTTAAGTAACGCTATGTTAGGGTGTTGTGTTCTGGATATCTGGGGCATGACATGGAAGACGCCTGCGACATTATTATTATTgg > 2:725831/5‑150 (MQ=255) tacaaCCTGCGGTGCAGGTTGTATCTATCGCGGCGAATGATAAGAGTGTGTCGGCGGTCAATTTCCCTTAAGTAACGCTATGTTAGGGTGTTGTGTTCTGGATATCTGGGGCATGACATGGAAGACGACTGCGACATTATTATTATTGGt > 1:763840/4‑150 (MQ=255) tacaaCCTGCGGTGCAGGTTGTATCTATCGCGGCGAATGATAAGAGTGTGTCGGCGGTCAATTTCCCTTAAGTAACGCTATGTTAGGGTGTTGTGTTCTGGATATCTGGGGCATGACATGGAAGACGACTGCGACATTATTATTATTGGt > 1:758719/4‑150 (MQ=255) gAAACCTGCACCGCAGGTTGTATCTATCGCGGCGAATGATAAGAGTGTGTCGGCGGTCAATTTCCCTTAAGTAACGCTATGTTAGGGTGTTGTGTTCTGGATATCTGGGGCATGACATGGAAGACGCCTGCGACATTATTATTATTGGTg > 1:1070368/1‑150 (MQ=255) cTGCACCGCAGGTTGTATCTATCGCGGCGAATGATAAGAGTGTGTCGGCGGTCAATTTCCCTTAAGTAACGCTATGTTAGGGTGTTGTGTTCTGGATATCTGGGGCATGACATGGAAGACGACTGCGACATTATTATTATTGGTGCCGGt < 2:451393/150‑1 (MQ=255) tGCACCGCAGGTTGTATCTATCGCGGCGAATGATAAGAGTGTGTCGGCGGTCAATTTCCCTTAAGTAACGCTATGTTAGGGTGTTGTGTTCTGGATATCTGGGGCATGACATGGAAGACGACTGCGACATTATTATTATTGGTGCCGGTa > 1:842189/1‑150 (MQ=255) tGCACCGCAGGTTGTATCTATCGCGGCGAATGATAAGAGTGTGTCGGCGGTCAATTTCCCTTAAGTAACGCTATGTTAGGGTGTTGTGTTCTGGATATCTGGGGCATGACATGGAAGACGACTGCGACATTATTATTATTGGTGCCGGTa > 1:369619/1‑150 (MQ=255) gCACCGCAGGTTGTATCTATCGCGGCGAATGATAAGAGTGTGTCGGCGGTCAATTTCCCTTAAGTAACGCTATGTTAGGGTGTTGTGTTCTGGATATCTGGGGCATGACATGGAAGACGACTGCGACATTATTATTATTGGTGCCGGTAt > 1:862288/1‑150 (MQ=255) aCCGCAGGTTGTATCTATCGCGGCGAATGATAAGAGTGTGTCGGCGGTCAATTTCCCTTAAGTAACGCTATGTTAGGGTGTTGTGTTCTGGATATCTGGGGCATGACATGGAAGACGACTGCGACATTATTATTATTGGTGCCGGTATTg > 1:1340506/1‑150 (MQ=255) ccGCAGGTTGTATCTATCGCGGCGAATGATAAGAGTGTGTCGGCGGTCAATTTCCCTTAAGTAACGCTATGTTAGGGTGTTGTGTTCTGGATATCTGGGGCATGACATGGAAGACGACTGCGACATTATTATTATTGGTGCCGGTATTGc < 1:1355779/150‑1 (MQ=255) ccGCAGGTTGTATCTATCGCGGCGAATGATAAGAGTGTGTCGGCGGTCAATTTCCCTTAAGTAACGCTATGTTAGGGTGTTGTGTTCTGGATATCTGGGGCATGACATGGAAGACGACTGCGACATTATTATTATTGGTGCCGGTATTGc > 2:1149080/1‑150 (MQ=255) cGCAGGTTGTATCTATCGCGGCGAATGATAAGAGTGTGTCGGCGGTCAATTTCCCTTAAGTAACGCTATGTTAGGGTGTTGTGTTCTGGATATCTGGGGCATGACATGGAAGACGACTGCGACATTATTATTATTGGTGCCGGTATTGCa < 1:739696/150‑1 (MQ=255) | CCAACCTACGAGCGCCTCGATCACCATTATCTCAATGATATTCCAGGTCTGGAAAACCCAACCAGCGAGGTTTTAGCAAAATGGATTTGGGATCAGGTTAAACCCGTTGTGCCGCTGTTAAGTGCGGTGATGGTAAAAGAAACCTGCACCGCAGGTTGTATCTATCGCGGCGAATGATAAGAGTGTGTCGGCGGTCAATTTCCCTTAAGTAACGCTATGTTAGGGTGTTGTGTTCTGGATATCTGGGGCATGACATGGAAGACGACTGCGACATTATTATTATTGGTGCCGGTATTGCA > NC_000913/2892403‑2892701 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |