Predicted mutation | |||||||
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RA | NC_000913 | 2,993,896 | T→A | 8.6% | intergenic (+40/‑43) | ygeI → / → pbl | protein YgeI/transglycosylase domain‑containing protein Pbl |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_000913 | 2,993,896 | 0 | T | A | 8.6% | 464.9 / 27.4 | 164 | intergenic (+40/‑43) | ygeI/pbl | protein YgeI/transglycosylase domain‑containing protein Pbl |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (90/60); new base A (8/6); total (98/66) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 4.55e-01 |
Only 100 of 174 total aligned reads displayed.
GATACAGATCAAATACAAGCATTTATAGTTTCAACATGGATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAATCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCAAATAAATCATAACGAGATACTTTTATAATAGTATCTCGTTCCTTTCATTCAATCCTCACACATGAAAAAATATGCGCTCACCAAAAGTTAAATTCTTAACCATCTTCACGTTTTGTATATTTATTACAAAAATGTCTTTCGCCAGCAACTCTTGCTCTAATGAAGCAGGAACAATGT > NC_000913/2993746‑2994044 | gATACAGATCAAATACAAGCATTTATAGTTTCAACATGGATGGCGCC‑TTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAATCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCAAATAAATCATAACGAGATACTTTTataat > 1:846127/1‑150 (MQ=255) tACAGATCAAATACAAGCATTTATAGTTTCAACATGGATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAATCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCAAATAAATCATAACGAGATACTTTTataata > 1:674914/1‑150 (MQ=255) tACAGATCAAATACAAGCATTTATAGTTTCAACATGGATCGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAATCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGTTAGACGATTGACCAAATAAATCATAACGAGATACTTTTataata > 1:911953/1‑150 (MQ=255) 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tataATAGTATCTCGTTACTTTCATTCAATCCTCACACATGAAAAAATATGCGCTCACCAAAAGTTAAATTCTTAACAATCTTAACGTTTTGTATATTTATTACAAAAATGTCTTTCGCCAGCAACTCTTGCTCTAATGAAGCAGGAACa > 2:311567/1‑150 (MQ=255) | GATACAGATCAAATACAAGCATTTATAGTTTCAACATGGATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAATCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCAAATAAATCATAACGAGATACTTTTATAATAGTATCTCGTTCCTTTCATTCAATCCTCACACATGAAAAAATATGCGCTCACCAAAAGTTAAATTCTTAACCATCTTCACGTTTTGTATATTTATTACAAAAATGTCTTTCGCCAGCAACTCTTGCTCTAATGAAGCAGGAACAATGT > NC_000913/2993746‑2994044 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |