| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 2664261 | 93 (1.060) | 11 (0.130) | 10/258 | NT | 10.8% | intergenic (+16/‑129) | suhB/yfhR | inositol‑phosphate phosphatase/putative peptidase |
| ? | NC_000913 | = 2664267 | 95 (1.160) | intergenic (+22/‑123) | suhB/yfhR | inositol‑phosphate phosphatase/putative peptidase | |||||
GGCATCGTCAGCGACTTCACCGGTGGTCATAACTACATGCTGACCGGTAACATCGTTGCTGGTAACCCGCGCGTTGTTAAAGCCATGCTGGCGAACATGCGTGACGAGTTAAGCGACGCTCTGAAGCGTTAATGACTCAGGCGGGTGA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/2664114‑2664261‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ggcgggtgaGTGATATCACCCGCCTGAGTCATTAACGCTTCAGAGCGTCGCTTAACTCGTCACGCATGTTCGCCAGCATGGCTTTAACAACGCGCGGGTTACCAGCAACGATGTTACCGGTCAGCATGTAGTTATGACCACCGGTGAAGTCGCTGACG < NC_000913/2664267‑2664119 GGCATCGTCAGCGACTTCACCGGTGGTCATAACTACATGCTGACCGGTAACATCGTTGCTGGTAACCCGCGCGTTGTTAAAGCCATGCTGGCGAACATGCGTGACGAGTTAAGCGACGCTCTGAAGCGTTAATGACTCAGGCGGG < 1:1032963/145‑1GGCATCGTCAGCGACTTCACCGGTGGTCATAACTACATGCTGACCGGTAACATCGTTGCTGGTAACCCGCGCGTTGTTAAAGCCATGCTGGCGAACATGCGTGACGAGTTAAGCGACGCTCTGAAGCGTTAATGACTCAGGCGGG > 2:1032963/1‑145 CTTCACCGGTGGTCATAACTACATGCTGACCGGTAACATCGTTGCTGGTAACCCGCGCGTTGTTAAAGCCATGCTGGCGAACATGCGTGACGAGTTAAGCGACGCTCTGAAGCGTTAATGACTCAGGCGGGTGAGTGATATCACCCGCCT < 2:341804/150‑1 TTCACCGGTGGTCATAACTACATGCTGACCGGTAACATCGTTGCTGGTAACCCGCGCGTTGTTAAAGCCATGCTGGCGAACATGCGTGACGAGTTAAGCGACGCTCTGAAGCGTTAATGACTCAGGCGGGTGAGTGATATCACCCGCCTG < 2:1043042/150‑1 ACCGGTGGTCATAACTACATGCTGACCGGTAACATCGTTGCTGGTAACCCGCGCGTTGTTAAAGCCATGCTGGCGAACATGCGTGACGAGTTAAGCGACGCTCTGAAGCGTTAATGACTCAGGCGGGTGAGTGATATCACCCGCCTGAGT < 2:837771/150‑1 GGTCATAACTACATGCTGACCGGTAACATCGTTGCTGGTAACCCGCGCGTTGTTAAAGCCATGCTGGCGAACATGCGTGACGAGTTAAGCGACGCTCTGAAGCGTTAATGACTCAGGCGGGTGAGTGATATCACCCGCCTG > 1:276590/1‑141 GGTCATAACTACATGCTGACCGGTAACATCGTTGCTGGTAACCCGCGCGTTGTTAAAGCCATGCTGGCGAACATGCGTGACGAGTTAAGCGACGCTCTGAAGCGTTAATGACTCAGGCGGGTGAGTGATATCACCCGCCTG < 2:276590/141‑1 TAACTACATGCTGACCGGTAACATCGTTGCTGGTAACCCGCGCGTTGTTAAAGCCATGCTGGCGAACATGCGTGACGAGTTAAGCGACGCTCTGAAGCGTTAATGACTCAGGCGGGTGAGTGATATCACCCGCC < 2:1371751/134‑1 TAACTACATGCTGACCGGTAACATCGTTGCTGGTAACCCGCGCGTTGTTAAAGCCATGCTGGCGAACATGCGTGACGAGTTAAGCGACGCTCTGAAGCGTTAATGACTCAGGCGGGTGAGTGATATCACCCGCC > 1:1371751/1‑134 CTACATGCTGACCGGTAACATCGTTGCTGGTAACCCGCGCGTTGTTAAAGCCATGCTGGCGAACATGCGTGACGAGTTAAGCGACGCTCTGAAGCGTTAATGACTCAGGCGGGTG > 1:766269/1‑115 CTACATGCTGACCGGTAACATCGTTGCTGGTAACCCGCGCGTTGTTAAAGCCATGCTGGCGAACATGCGTGACGAGTTAAGCGACGCTCTGAAGCGTTAATGACTCAGGCGGGTG < 2:766269/115‑1 TGACCGGTAACATCGTTGCTGGTAACCCGCGCGTTGTTAAAGCCATGCTGGCGAACATGCGTGACGAGTTAAGCGACGCTCTGAAGCGTTAATGACTCGGGCGGGTGAGTGATATCACCCGCCTGAGTCATTAACGCTTCAGAGCGTCGC < 1:247508/150‑1 GACCGGTAACATCGTTGCTGGTAACCCGCGCGTTGTTAAAGCCATGCTGGCGAACATGCGTGACGAGTTAAGCGACCCTCTGAAGCGTTAATGACTCAGGCGGGTTTGTGATATCACCCGCCTGAGTCATTAACGCTTCAGAGCGTCGCT < 2:38101/150‑1 CCGGTAACATCGTTGCTGGTAACCCGCGCGTTGGTAAAGCCATGCTGGCGAACATGCGTGACGAGTTAAGCGACGCTCTGAAGCGTTAATGACTCAGGCGGGTGAGGGATATCACCCGCCTGAGTCATTAACGCTTCAGAGCGTCGCTTA < 1:618566/150‑1 AAAGCCATGCTGGCTAACATGCGTGACGAGTTAAGCGACGCTCTGAAGCGTTAATGACTCAGGCGGGTGAGTGATATCACCCGCCTGAGTCATTAACGCTTCAGAGCGTCGCTTAACTCGTCACGCATGTTCGCCAGCATGGCTTTAACA < 2:1414071/150‑1 GGGTGAGTGATATCACCCGCCTGAGTCATTAACGCTTCAGAGCGTCGCTTAACTCGTCACGCATGTTCGCCAGCATGGCTTTAACAACGCGCGGGTTACCAGCAACGATGTTACCGGTCAGCATGTAGTTATGACCACCGGTGAAGTCGC < 1:111540/150‑1 GGTGAGTGATATCACCCGCCTGAGTCATTAACGCTTCAGAGCGTCGCTTAACTCGTCACGCATGTTCGCCAGCATGGCTTTAACAACGCGCGGGTTACCAGCAACGATGTTACCGGTCAGCATGTAGTTATGACCACCGGTGAAGTCGCT < 1:80640/150‑1 GGTGAGTGATATCACCCGCCTGAGTCATTAACGCTTCAGAGCGTCGCTTAACTCGTCACGCATGTTCGCCAGCATGGCTTTAACAACGCGCGGGTTACCAGCAACGATGTTACCGGTCAGCATGTAGTTATGACCACCGGTGAAGTCGCT > 2:447934/1‑150 AGTGATATCACCCGCCTGAGTCATTAACGCTTCAGAGCGTCGCTTAACTCGTCACGCATGTTCGCCAGCATGGCTTTAACAACGCGCGGGTTACCAGCAACGATGTTACCGGTCAGCATGTAGTTATGACCACCGGTGAAGTCGCTGACG < 2:780630/150‑1 GGCATCGTCAGCGACTTCACCGGTGGTCATAACTACATGCTGACCGGTAACATCGTTGCTGGTAACCCGCGCGTTGTTAAAGCCATGCTGGCGAACATGCGTGACGAGTTAAGCGACGCTCTGAAGCGTTAATGACTCAGGCGGGTGA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/2664114‑2664261‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ggcgggtgaGTGATATCACCCGCCTGAGTCATTAACGCTTCAGAGCGTCGCTTAACTCGTCACGCATGTTCGCCAGCATGGCTTTAACAACGCGCGGGTTACCAGCAACGATGTTACCGGTCAGCATGTAGTTATGACCACCGGTGAAGTCGCTGACG < NC_000913/2664267‑2664119 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |