| New junction evidence | |||||||||||
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accaactggaagtttgatatgtggctggaaaattcaccagtttcatatcctttaactggcttgcgctgcatcaactggtacgctgggtgtaatatgaccacaagtcttatcctgccgcaaaccaccgacgccagtgtattttatggcgcg < 1:916372‑M1/4‑1 (MQ=255) ccTGATCCTTACAGCGTGCGCCGCTGCTGGCGTCATAGTTCACAGAGGTCTGGCAGGCATTGATGGTCATTGTAAAGCTGCTGCCGACGGGCATTTGTTGCATATACTGGTAAAACGCGTCTGACAACATGCCGTGCATCCACTTCgcgc > 2:654718/1‑150 (MQ=255) ccTGATCCTTACAGCGTGCGCCGCTGCTGGCGTCATAGTTCACAGAGGTCTGGCAGGCATTGATGGTCATTGTAAAGCTGCTGCCGACGGGCATTTGTTGCATATACTGGTAAAACGCGTCTGACAACATGCCGTGCATCCACTTCgcgc > 1:292997/1‑150 (MQ=255) ccTGATCCTTACAGCGTGCGCCGCTGCTGGCGTCATAGTTCACAGAGGTCTGGCAGGCATTGATGGTCATTGTAAAGCTGCTGCCGACGGGCATTTGTTGCATATACTGGTAAAACGCGTCTGACAACATGCCGTGCATCCACTTCgcgc > 2:18497/1‑150 (MQ=255) ccTGATCCTTACAGCGTGCGCCGCTGCTGGCGTCATAGTTCACAGAGGTCTGGCAGGCATTGATGGTCATTGTAAAGCTGCTGCCGACGGGCATTTGTTGCATATACTGGTAAAACGCGTCTGACAACATGCCGTGCATCCACTTCgcgc < 1:1111155/150‑1 (MQ=255) 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gACAACATGCCGTGCATCCACTTCGCGCCGCCGCTGGTCACCGTCGCGCCATAAAATCCACTGGCGTCGGTGGTTTGCGGCAGGATAAGACTGGTGGTCATATTACACCCAGCGTACCAGTTGATGCAGCGCAAGCCAGTTAAAGGAGAt > 1:1404904/1‑150 (MQ=255) aacaTGCCGTGCATCCACTTCGCGCCGCCGCTGGTCACCGTCGCGCCATAAAATCCACTGGCGTCGGTGGTTTGCGGCAGGATAAGACTGGTGGTCATATTACACCCAGCGTACCAGTTGATGCAGCGCAAGCCAGTTAAAGGAGATGaa > 1:945875/1‑150 (MQ=255) caTGCCGTGCATCCACTTCGCGCCGCCGCTGGTCACCGTCGCGCCATAAAATCCACTGGCGTCGGTGGTTTGCGGCAGGATAAGACTGGTGGTCATATTACACCCAGCGTACCAGTTGATGCAGCGCGAGCCAGTTAAAGGAGATGAAAc < 2:1143342/150‑1 (MQ=255) tGCCGTGCATCCACTTCGCGCCGCCGCTGGTCACCGTCGCGCCATAAAATCCACTGGCGTCGGTGGTTTGCGGCAGGATAAGACTGGTGGTCATATTACACCCAGCGTACCAGTTGATGCAGCGCAAGCCAGTTAAAGGAGATGAAACTg > 2:1537667/1‑150 (MQ=255) tGCCGTGCATCCACTTCGCGCCGCCGCTGGTCACCGTCGCGCCATAAAATCCACTGGCGTCGGTGGTTTGCGGCAGGATAAGACTGGTGGTCATATTACACCCAGCGTACCAGTTGATGCAGCGCAAGCCAGTTAAAGGAGATGAAACTg < 1:913748/150‑1 (MQ=255) ccGTGCATCCACTTCGCGCCGCCGCTGGTCACCGTCGCGCCATAAAATCCACTGGCGTCGGTGGTTTGCGGCAGGATAAGACTGGTGGTCATATTACACCCAGCGTACCAGTTGATGCAGCGCAAGCCAGTTAAAGGAGATGAAACTGGt > 2:631148/1‑150 (MQ=255) tcaaCTTCGCGCCGCCGCTGGTCACCGTCGCGCCATAAAATCCACTGGCGTCGGTGGTTTGCGGCAGGATAAGACTGGTGGTCATATTACACCCAGCGTACCAGTTGATGCAGCGCAAGCCAGTTAAAGGAGATGAAACTGGTGAAtttt > 1:869786/4‑150 (MQ=255) cACTTCGCGCCGCCGCTCGTCAACGTCGCGCCATAAAATCCACTGGCGTCGGTGGTTTGCGGCAGGATAAGACTGGTGGTCATATTACACCCAGCGGACCAGTTGATGCAGCGCAAGCCAGTTAAAGGAGATGAAACTGGTGAATTTTcc < 2:997052/150‑1 (MQ=255) aCTTCGCGCCGCCGCTGGTCACCGTCGCGCCATAAAATCCACTGGCGTCGGTGGTTTGCGGCAGGATAAGCCTGGTGGTCATATTACACCCAGCGTACCAGTTGATGCAGCGCAAGCGAGTTAAAGGAGATGAAACTGGTGaagtgtcga > 2:277121/1‑143 (MQ=255) cTTCGCGCCGCCGCTGGTCACCGTCGCGCCATAAAATCCACTGGCGTCGGTGGTTTGCGGCAGGATAAGACTGGTGGTCATATTACACCCAGCGTACCAGTTGATGCAGCGCAAGCCAGTTAAAGGAGATGAAACTGGTGAATTTTCCAg < 2:551908/150‑1 (MQ=255) ttCGCGCCGCCGCTGGTCACCGTCGCGCCATAAAATCCACTGGCGTCGGTGGTTTGCGGCAGGATAAGACTGGTGGTCATATTACACCCAGCGTACCAGTTGATGCAGCGCAAGCCAGTTAAAGGAGATGAAACTGGTGAATTTTCCAGc < 2:392875/150‑1 (MQ=255) tCGCGCCGCCGCTGGTCACCGTCGCGCCATAAAATCCACTGGCGTCGGTGGTTTGCGGCAGGATAAGACTGGTGGTCATATTACACCCAGCGTACCAGTTGATGCAGCGCAAGCCAGTTAAAGGAGATGAAACTGGTGAATTTTCCAGcc > 2:107669/1‑150 (MQ=255) | GAGGCCTGATCCTTACAGCGTGCGCCGCTGCTGGCGTCATAGTTCACAGAGGTCTGGCAGGCATTGATGGTCATTGTAAAGCTGCTGCCGACGGGCATTTGTTGCATATACTGGTAAAACGCGTCTGACAACATGCCGTGCATCCACTTCGCGCCGCCGCTGGTCACCGTCGCGCCATAAAATCCACTGGCGTCGGTGGTTTGCGGCAGGATAAGACTGGTGGTCATATTACACCCAGCGTACCAGTTGATGCAGCGCAAGCCAGTTAAAGGAGATGAAACTGGTGAATTTTCCAGCC > NC_000913/306213‑306510 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |