New junction evidence | |||||||||||
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TGCATCTATATCGTTTTCGGCGGTATGGCGATTTGGGCGATTTCACTGGTCGGGATCGGTCCAATCTTTGACTACATTCCGAGCGGTATTCAGAAAGCAGAAAACGGTGGCTTCCTGTTCCTGGTGGTGATTAACGCGGTAGTTGCG‑‑‑‑GTCTGGGCGGCACCGGCGGTGAGCGCATCCGACTTTACGCAAAACGCCCACTCGTTTCGTGAGCAGGCGCTGGGGCAAACGCTGGGTTTAGTTGTGGCCTATATTCTGTTTGCGGTCGCCGGGGTATGTATTATTGCCGGAGCCAGTATTCA > NC_000913/538200‑538498 | tGCATCTATATCGTTTTCGGCGGTATGGCGATTTGGGCGATTTCACTGGTCGGGATCGGTCCAATCTTTGACTACATTCCGAGCGGTATTCAGAAAGCAGAAAACGGTGGCTTCCTGTTCCTGGTGGTGATTAACGCGGTAGTTGCG‑‑‑‑GTC > 2:1243753‑M1/1‑150 (MQ=255) tGCATCTATATCGTTTTCGGCGGTATGGCGATTTGGGCGATTTCACTGGTCGGGATCGGTCCAATCTTTGACTACATTCCGAGCGGTATTCAGAAAGCAGAAAACGGTGGCTTCCTGTTCCTGGTGGTGATTAACGCGGTAGTTGCG‑‑‑‑GTC < 2:1252710‑M1/150‑1 (MQ=255) cATCTATATCGTTTTCGGCGGTATGGCGATTTGGGCGATTTCACTGGTCGGGATCGGTCCAATCTTTGACTACATTCCGAGCGGTATTCAGAAAGCAGAAAACGGTGGCTTCCTGTTCCTGGTGGTGATTAACGCGGTAGTTGCG‑‑‑‑GTCTg > 1:858783/1‑150 (MQ=255) 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atatCGTTTTCGGCGGTATGGCGATTTGGGCGATTTCACTGGTCGGGATCGGTCCAATCTATGACTACATTCCGAGCGCTATTCAGAAAGCAGAAAACGGTGGCTTCCTGTTCCTGGTGGTGATTAACGCGGTAGTTGCG‑‑‑‑GTCTGggcgg > 2:369132/1‑150 (MQ=255) tatCGTTTTCGGCGGTATGGCGATTTGGGCGATTTCACTGGTCGGGATCGGTCCAATCTTTGACTACATTCCGAGCGGTATTCAGAAAGCAGAAAACGGTGGCTTCCTGTTCCTGGTGGTGATTAACGCGGTAGTTGCG‑‑‑‑GTCTGggcggc > 2:1180443/1‑150 (MQ=255) tatCGTTTTCGGCGGTATGGCGATTTGGGCGATTTCACTGGTCGGGATCGGTCCAATCTTTGACTACATTCCGAGCGGTATTCAGAAAGCAGAAAACGGTGGCTTCCTGTTCCTGGTGGTGATTAACGCGGTAGTTGCG‑‑‑‑GTCTGggcggc < 1:209216/150‑1 (MQ=255) tatCGTTTTCGGCGGTATGGCGATTTGGGCGATTTCACTGGTCGGGATCGGTCCAATCTTTGACTACATTCCGAGCGGTATTCAGAAAGCAGAAAACGGTGGCTTCCTGTTCCTGGTGGTGATTAACGCGGTAGTTGCG‑‑‑‑GTCTGggcggc < 1:1114138/150‑1 (MQ=255) atCGTTTTCGGCGGTATGGCGATTTGGGCGATTTCACTGGTCGGGATCGGTCCAATCTTTGACTACATTCCGAGCGGTATTCAGAAAGCAGAAAACGGTGGCTTCCTGTTCCTGGTGGTGATTAACGCGGTAGTTGCG‑‑‑‑GTCTGGGCGGCa < 2:146141/150‑1 (MQ=255) 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tAGTTGCG‑‑‑‑GTCTGGGCGGCACCGGCGGTGAGCGCATCCGACTTTACGCAAAACGCCCACTCGTTTCGTGAGCAGGCGCTGGGGCAAACGCTGGGTTTAGTTGTGGCCTATATTCTGTTTGCGGTCGCCGGGGTATGTATTATTGCCGGAg > 1:455529/1‑150 (MQ=255) aGTTGCG‑‑‑‑GTCTGGGCGGCACCGGCGGTGAGCGCATCCgaccgcaactaccgcgttaatcaccaccaggaacaggaagccaccgttttctgctttctgaataccgctcggaatgtagtcaaagattggaccgatcccgcccagtgaaatcg < 1:1318629‑M2/150‑114 (MQ=255) tGCG‑‑‑‑GTCTGGGCGGCACCGGCGGTGAGCGCATCCGACTTTACGCAAAACGCCCACTCGTTTCGTGAGCAGGCGCTGGGGCAAACGCTGGGTTTAGTTGTGGCCTATATTCTGTTTGCGGTCGCCGGGGTATGTATTATTGCCGGAGCCAg > 2:386959/1‑150 (MQ=255) gTCggatgcgctcaccgccggtgccgcccagaccgcaactaccgcgttaatcaccaccaggaacaggaagccaccgttttctgctttctgaataccgctcggaatgtagtcaaagattggaccgatcccgaccagtgaaatcgcccaaat > 2:257843‑M1/1‑3 (MQ=255) cggatgcgctcaccgccggtgccgcccagaccgcaactaccgcgttaatcaccaccaggaacaggaagccaccgttttctgctttctgaataccgctcggaatgtagtcaaagattggagcgatcccgaccagtgaaatcgcccaaatcg > 1:1426021‑M1/1‑1 (MQ=255) | TGCATCTATATCGTTTTCGGCGGTATGGCGATTTGGGCGATTTCACTGGTCGGGATCGGTCCAATCTTTGACTACATTCCGAGCGGTATTCAGAAAGCAGAAAACGGTGGCTTCCTGTTCCTGGTGGTGATTAACGCGGTAGTTGCG‑‑‑‑GTCTGGGCGGCACCGGCGGTGAGCGCATCCGACTTTACGCAAAACGCCCACTCGTTTCGTGAGCAGGCGCTGGGGCAAACGCTGGGTTTAGTTGTGGCCTATATTCTGTTTGCGGTCGCCGGGGTATGTATTATTGCCGGAGCCAGTATTCA > NC_000913/538200‑538498 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |