New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | = 1522204 | 75 (0.860) | 6 (0.070) | 4/256 | NT | 8.3% | coding (862/2103 nt) | yncD | putative TonB‑dependent outer membrane receptor |
? | NC_000913 | = 1522222 | 63 (0.780) | coding (844/2103 nt) | yncD | putative TonB‑dependent outer membrane receptor |
Only 100 of 102 total aligned reads displayed.
GTCTATTCCCTGGTAATGGCGTTGCAGGGTAATCACGCCGCCCGCATGTGACGGGTTAAGTTGTGGTGCCATGGGTATTGACTGGTACTGGGTCGTTTCTCGCTCTCCGGCATACATCATCACACTCATATCATCCCGCGAACTCAGGCTACGCTCATAGCGCAACCCAGCCTGAGTTTGCTTGATGGTTTTTCGCGTGTCGTACTGTTCTGCACGAGGCGCTTGTTGTGGATTAGCCTTCCATTCTGCTTTGGTTAGCCCACCTGGGTCATCTGCTTTGATATCCACACTATTGA > NC_000913/1522055‑1522350 | gTCTATTCCCTGGTAATGGCGTTGCAGGGTAATCACGCCGCCCGCATGTGACGGGTTAAGTTGTGGTGCCATGGGTATTGACTGGTACTGGGTCGTTTCTCGCTCTCCGGCATACATCATCACACTCATATCATCCCGCGAACTCAGGCT > 1:169871‑M1/1‑150 (MQ=255) tATTCCCTGGTAATGGCGTTGCAGGGTAATCACGCCGCCCGCATGTGACGGGTTAAGTTGTGGTGCCATGGGTATTGACTGGTACTGGGTCGTTTCTCGCTCTCCGGCATACATCATCACACTCATATCATCCCGCGAACTCAGGCTACg < 2:594161/150‑1 (MQ=255) aTTCCCTGGTAATGGCGTTGCAGGGTAATCACGCCGCCCGCATGTGACGGGTTAAGTTGTGGTGCCATGGGTATTGACTGGTACTGGGTCGTTTCTCGCTCTCCGGCATACATCATCACACTCATATCATCCCGCGAACTCAGGCTACGc < 2:760585/150‑1 (MQ=255) tCCCTGGTAATGGCGTTGCAGGGTAATCACGCCGCCCGCATGTGACGGGTTAAGTTGTGGTGCCATGGGTATTGACTGGTACTGGGTCGTTTCTCGCTCTCCGGCATACATCATCACACTCATATCATCCCGCGAACTCAGGCTACGCTc > 2:1027265/1‑150 (MQ=255) cccTGGTAATGGCGTTGCAGGGTAATCACGCCGCCCGCATGTGACGGGTTAAGTTGTGGTGCCATGGGTATTGACTGGTACTGGGTCGTTTCTCGCTCTCCGGCATACATCATCACACTCATATCATCCCGCGAACTCAGGCTACGCTCa > 2:13676/1‑150 (MQ=255) cTGGTAATGGCGTTGCAGGGTAATCACGCCGCCCGCATGTGACGGGTTAAGTTGTGGTGCCATGGGTATTGACTGGTACTGGGTCGTTTCTCGCTCTCCGGCATACATCATCACACTCATATCATCCCGCGAACTCAGGCTACGCTCATa < 1:75965/150‑1 (MQ=255) tGGTAATGGCGTTGCAGGGTAATCACGCCGCCCGCATGTGACGGGTTAAGTTGTGGTGCCATGGGTATTGACTGGTACTGGGTCGTTTCTCGCTCTCCGGCATACATCATCACACTCATATCATCCCGCGAACTCAGGCTACGCTCATAg < 1:1169872/150‑1 (MQ=255) tGGTAATGGCGTTGCAGGGTAATCACGCCGCCCGCATGTGACGGGTTAAGTTGTGGTGCCATGGGTATTGACTGGTACTGGGTCGTTTCTCGCTCTCCGGCATACATCATCACACTCATATCATCCCGCGAACTCAGGCTACGCTCATAg > 2:17889/1‑150 (MQ=255) gTAATGGCGTTGCAGGGTAATCACGCCGCCCGCATGTGACGGGTTAAGTTGTGGTGCCATGGGTATTGACTGGTACTGGGTCGTTTCTCGCTCTCCGGCATACATCATCACACTCATATCATCCCGCGAACTCAGGCTACGCTCATAgcg < 1:815056/150‑1 (MQ=255) gTAATGGCGTTGCAGGGTAATCACGCCGCCCGCATGTGACGGGTTAAGTTGTGGTGCCATGGGTATTGACTGGTACTGGGTCGTTTCTCGCTCTCCGGCATACATCATCACACTCATATCATCCCGCGAACTCAGGCTACGCTCATAgcg < 2:156586/150‑1 (MQ=255) tAATGGCGTTGCAGGGTAATCACGCCGCCCGCATGTGACGGGTTAAGTTGTGGTGCCATGGGTATTGACTGGTACTGGGTCGTTTCTCGCTCTCCGGCATACATCATCACACTCAAATCATCCCGCGAACTCAGGCTACGCTCATAgcgc > 1:400081/1‑150 (MQ=255) aaTGGCGTTGCAGGGTAATCACGCCGCCCGCATGTGACGGGTTAAGTTGTGGTGCCATGGGTATTGACTGGTACTGGGTCGTTTCTCGCTCTCCGGCATACATCATCACACTCATATCATCCCGCGAACTCAGGCTACGCTCATAGCGCa > 1:1223160/1‑150 (MQ=255) tGGCGTTGCAGGGTAATCACGCCGCCCGCATGTGACGGGTTAAGTTGTGGTGCCATGGGTATTGACTGGTACTGGGTCGTTTCTCGCTCTCCGGCATACATCATCACACTCATATCATCCCGCGAACTCAGGCTACGCTCATAGCGCAAc < 2:6904/150‑1 (MQ=255) ggCGTTGCAGGGTAATCACGCCGCCCGCATGTGACGGGTTAAGTTGTGGTGCCATGGGTATTGACTGGTACTGGGTCGTTTCTCGCTCTCCGGCATACATCATCACACTCATATCATCCCGCGAACTCAGGCTACGCTCATAGCGCAAcc > 2:17801/1‑150 (MQ=255) tGCAGGGTAATCACGCCGCCCGCATGTGACGGGTTAAGTTGTGGTGCCATGGGTATTGACTGGTACTTGGTCGTTTCTCGCTCTCCGGCATACATCATCACACTCATATCATCCCGCGAACTCAGGCTACGCTCATAGCGCAACCCagcc > 2:493455‑M2/1‑146 (MQ=255) tGCAGGGTAATCACGCCGCCCGCATGTGACGGGTTAAGTTGTGGTGCCATGGGTATTGACTGGTACTGGGTCGTTTCTCGCTCTCCGGCATACATCATCACACTCATATCATCCCGCGAACTCAGGCTACGCTCATAGCGCAACCCagcc < 1:710013‑M2/150‑5 (MQ=255) tGCAGGGTAATCACGCCGCCCGCATGTGACGGGTTAAGTTGTGGTGCCATGGGTATTGACTGGTACTGGGTCGTTTCTCGCTCTCCGGCATACATCATCACACTCATATCATCCCGCGAACTCAGGCTACGCTCATAGCGCAACCCagcc < 1:1488896‑M2/150‑5 (MQ=255) gggTAATCACGCCGCCCGCATGTGACGGGTTAAGTTGTGGTGCCATGGGTATTGACTGGTACTGGGTCGTTTCTCGCTCTCCGGCATACATCATCACACTCATATCATCCCGCGAACTCAGGCTACGCTCATAGCGCAACCCagcctgag > 2:1279297‑M2/1‑142 (MQ=255) 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aTCACGCCGCCCGCATGTGACGGGTTAAGTTGTGGTGCCATGGGTATTGACTGGTACTGGGTCGTTTCTCGCTCTCCGGCATACATCATCACACTCATATCATCCCGCGAACTCAGGCTACGCTCATAGCGCAACCCAGCCTGAGTTTGc > 1:873648/1‑150 (MQ=255) aTCACGCCGCCCGCATGTGACGGGTTAAGTTGTGGTGCCATGGGTATTGACTGGTACTGGGTCGTTTCTCGCTCTCCGGCATACATCATCACACTCATATCATCCCGCGAACTCAGGCTACGCTCATAGCGCAACCCAGCCTGAGTTTGc > 2:736845/1‑150 (MQ=255) tCACGCCGCCCGCATGTGACGGGTTAAGTTGTGGTGCCATGGGTATTGACTGGTACTGGGTCGTTTCTCGCTCTCCGGCATACATCATCACACTCATATCATCCCGCGAACTCAGGCTACGCTCATAGCGCAACCCAGCCTGAGTTTGCt > 2:484524/1‑150 (MQ=255) tCACGCCGCCCGCATGTGACGGGTTAAGTTGTGGTGCCATGGGTATTGACTGGTACTGGGTCGTTTCTCGCTCTCCGGCATACATCATCACACTCATATCATCCCGCGAACTCAGGCTACGCTCATAGCGCAACCCAGCCTGAGTTTGCt > 1:295034/1‑150 (MQ=255) cACGCCGCCCGCATGTGACGGGTTAAGTTGTGGTGCCATGGGTATTGACTGGTACTGGGTCGTTTCTCGCTCTCCGGCATACATCATCACACTCATATCATCCCGCGAACTCAGGCTACGCTCATAGCGCAACCCAGCCTGAGTTTGCtt < 2:947220/150‑1 (MQ=255) cACGCCGCCCGCATGTGACGGGGTAAGTTGTGGTGCCATGGGTATTGACTGGTACTGGGTCGTTTCTCGCTCTCCGGCATACATCATCACACTCATATCATCCCGCGAACTCAGGCTgggttgcgctatgagcgtagcctgagttcgcgg < 2:184574‑M1/150‑34 (MQ=255) aCGCCGCCCGCATGTGACGGGTTAAGTTGTGGTGCCATGGGTATTGACTGGTACTGGGTCGTTTCTCGTTCTCCGGCATACATCATCACACTCATATCATCCCGCGAACTCAGGCTACGCTCATAGCGCAACCCAGCCTGAGTTTGCTTg < 1:1034059/150‑1 (MQ=255) aCGCCGCCCGCATGTGACGGGTTAAGTTGTGGTGCCATGGGTATTGACTGGTACTGGGTCGTTTCTCGCTCTCCGGCATACATCATCACACTCATATCATCCCGCGAACTCAGGCTACGCTCATAGCGCAACCCAGCCTGAGTTTGCTTg < 1:537446/150‑1 (MQ=255) aCGCCGCCCGCATGTGACGGGTTAAGTTGTGGTGCCATGGGTATTGACTGGTACTGGGTCGTTTCTCGCTCTCCGGCATACATCATCACACTCATATCATCCCGCAAACTCAGGCTgggttgcgctatgagcgtagcctgagttcgcggg < 1:693798‑M1/150‑35 (MQ=255) ccgcccgcATGTGACGGGTTAAGTTGTGGTGCCATGGGTATTGACTGGTACTGGGTCGTTTCTCGCTCTCCGGCATACATCATCACACTCATATCATCCCGCGAACTCAGGCTACGCTCATAGCGCAACCCAGCCTGAGTTTGCTTGATg < 1:1143099/150‑1 (MQ=255) cgcccgcATGTGACGGGTTAAGTTGTGGTGCCATGGGTATTGACTGGTACTGGGTCGTTTCTCGCTCTCCGGCATACATCATCACACTCATATCATCCCGCGAACTCAGGCTACGCTCATAGCGCAACCCAGCCTGAGTTTGCTTGATgg < 2:512587/150‑1 (MQ=255) cgcccgcATGTGACGGGTTAAGTTGTGGTGCCATGGGTATTGACTGGTACTGGGTCGTTTCTCGCTCTCCGGCATACATCATCACACTCATATCATCCCGCGAACTCAGGCTACGCTCATAGCGCAACCCAGCCTGAGTTTGCTTGATgg < 1:156581/150‑1 (MQ=255) cccgcATGTGACGGGTTAAGTTGTGGTGCCATGGGTATTGACTGGTACTGGGTCGTTTCTCGCTCTCCGGCATACATCATCACACTCATATCATCCCGCGAACTCAGGCTACGCTCATAGCGCAACCCAGCCTGAGTTTGCTTGATGGtt > 2:1199786/1‑150 (MQ=255) cgcATGTGACGGGTTAAGTTGTGGTGCCATGGGTATTGACTGGTACTGGGTCGTTTCTCGCTCTCCGGCATACATCATCACACTCATATCATCCCGCGAACTCAGGCTACGCTCATAGCGCAACCCAGCCTGAGTTTGCTTGATGGtttt < 1:1418077/150‑1 (MQ=255) cATGTGACGGGGTAAGGTGGGGTGCCATGGGTATTGACTGGTACGGGGGCGGTTCTCGCGCTCCGGCATACATCATCACACTCATATCATCCCGCGAACTCAGGCTgggttgcgctatgagcgtagcctgagttcgcgggatgatatgag < 1:120179‑M1/150‑45 (MQ=255) 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tcatcaCACTCATATCATCCCGCGAACTCAGGCTACGCTCATAGCGCAACCCAGCCTGAGTTTGCTTGATGGTTTTTCGCGTGTCGTACTGTTCTGCACGAGGCGCTTGTTGTGGATTAGCCTTCCATTCTGCTTTGGTTAGCCCACCTg < 1:736845/150‑1 (MQ=255) catcaCACTCATATCATCCCGCGAACTCAGGCTACGCTCATAGCGCAACCCAGCCTGAGTTTGCTTGATGGTTTTTCGCGTGTCGTACTGTTCTGCACGAGGCGCTTGTTGTGGATTAGCCTTCCATTCTGCTTTGGTTAGCCCACCTgg > 2:161646/1‑150 (MQ=255) atcaCACTCATATCATCCCGCGAACTCAGGCTACGCTCATAGCGCAACACACCATCAGTATGCTTGATGGTTTTTCCCGAGTCGTACTGTTCTCCACGAGGCGCTTGTTGTGGATTAGACTTCAATTCTTCTATCGTTAGCACAACAggg > 2:1447237/1‑150 (MQ=255) acacTCATATCATCCCGCGAACTCAGGCTACGCTCATAGCGCAACCCAGCCTGAGTTTGCTTGATGGTTTTTCGCGTGTCGTACTGTTCTGCACGAGGCGCTTGTTGTGGAtt < 1:960078/113‑1 (MQ=255) cacTCATATAATCCCGCGAACTCAGGCTACGCTCATAGCGCAACCAAGCCTGAGTTTGCTTGATGGTTTTTCGCGTGTCGTACTGTTCTGCACGAGGCGCTTGTTGTGGATTAGCCTTCCATTCTGCTTTGGTTAGCCCACCTGGGTCAt > 2:1479051/1‑150 (MQ=255) cTCATATCATCCCGCGAACTCAGGCTACGCTCATAGCGCAACCCagcctgagttcgcgggatgatatgagtgtgatgatgtatgccggagcgcgagaaccgcccccgtaccagtcaatacccatggcaccccaccttaccccgtcacatg < 1:120179‑M2/150‑107 (MQ=255) cTCATATCATCCCGCGAACTCAGGCTACGCTCATAGCGCAACCCAGCCTGAGTTTGCTTGATGGTTTTTCGCGTGTCGTACTGTTCTGCACGAGGCGCTTGTTGTGGATTAGCCTTCCATTCTGCTTTGGTTAGCCCACCTGGGTCATCt < 2:873648/150‑1 (MQ=255) tatCATCCCGCGAACTCAGGCTACGCTCATAGCGCAACCCAGCCTGAGTTTGCTTGATGGTTTTTCGCGTGTCGTACTGTTCTGCACGAGGCGCTTGTTGTGGATTAGCCTTCCATTCTGCTTTGGTTAGCCAACCTGGGTCATCTGCtt > 2:826025/1‑150 (MQ=255) catcCCGCGAACTCAGGCTACGCTCATAGCGCAACCCAGCCTGAGTTTGCTTGATGGTTTTTCGCGTGTCGTACTGTTCTGCACGAGGCGCTTGTTGTGGATTAGCCTTCCATTCTGCTTTGGTTAGCCCACCTGGGTCATCTGCTTTGa < 2:169871/150‑1 (MQ=255) catcCCGCGAACTCAGGCTACGCTCATAGCGCAACCCAGCCTGAGTTTGCTTGATGGTTTTTCGCGTGTCGTACTGTTCTGCACGAGGCGCTTGTTGTGGATTAGCCTTCCATTCTGCTTTGGTTAGCCCACCTGGGTCATCTGCTTTGa > 2:331301/1‑150 (MQ=255) catcCCGCGAACTCAGGCTACGCTCATAGCGCAACCCAGCCTGAGTTTGCTTGATGGTTTTTCGCGTGTCGTACTGTTCTGCACGAGGCGCTTGTTGTGGATTAGCCTTCCATTCTGCTTTGGTTAGCCCACCTGGGTCATCTGCTTTGa > 2:420481/1‑150 (MQ=255) cccGCGAACTCAGGCTACGCTCATAGCGCAACCCagcctgagtttgcgggatgatatgagtgtgatgatgtatgccggagagcgagaaacgacccagtaccagtcaatacccatggcaccacaacttaacccgtcacatgcgggcggcgt < 1:693798‑M2/150‑117 (MQ=255) ccGCGAACTCAGGCTACGCTCATAGCGCAACCCagcctgagttcgcgggatgatatgagtgtgatgatgtatgccggagagcgagaaacgacccagtaccagtcaatacccatggcaccacaacttaccccgtcacatgcgggcggcgtg < 2:184574‑M2/150‑118 (MQ=255) cgcgAACTCAGGCTACGCTCATAGCGCAACCCAGCCTGAGTTTGCTTGATGGTTTTTCGCGTGTCGTACTGTTCTGCACGAGGCGCTTGTTGTGGATTAGCCTTCCATTCTGCTTTGGTTAGCCCACCTGGGTCATCTGCTTTGATATcc < 2:432816/150‑1 (MQ=255) gcgAACTCAGGCTACGCTCATAGCGCAACCCAGCCTGAGTTTGCTTGATGGTTTTTCGCGTGTCGTACTGTTCTGCACGAGGCGCTTGTTGTGGATTAGCCTTCCATTCTGCTTTGGTTAGCCCACCTGGGTCATCTGCTTTGATATCca > 1:215741/1‑150 (MQ=255) cgAACTCAGGCTACGCTCATAGCGCAACCCagcctgagtttgcttgatgatatgagtgtgatgatgtatgccggagagcgagaaacgacccagtaccagtcaatacccatggcaccacaacttaacccgtcacatgcgggcggcgtgatt < 1:351939‑M2/150‑121 (MQ=255) cgAACTCAGGCTACGCTCATAGCGCAACCCagcctgagttcgcgggatgatatgagtgtgatgatgtatgccggagagcgagaaacgacccagtaccagtcaatacccatggcaccacaacttaccccgtcacatgcgggcggcgtgatt < 2:806492‑M2/150‑121 (MQ=255) cgAACTCAGGCTACGCTCATAGCGCAACCCagcctgagttcgcgggatgatatgagtgtgatgatgtatgccggagagcgagaaacgacccagtaccagtcaatacccatggcaccacaacttaacccgtcacatgcgggcggcgtgatt < 2:946174‑M2/150‑121 (MQ=255) cTCAGGCTgggttgcgctatgagcgtagcctgagttcgcgggatgatatgagtgtgatgatgtatgccggagagcgagaaacgacccagtaccagtcaatacccatggcaccacaacttaacccgtcacatgcgggcggcgtgattaccc > 2:1279297‑M1/1‑8 (MQ=255) cTCAGGCTgggttgagctatgagcgtagcctgagttcgctggatgatatgagtgtgatgatgtatgccggagagcgagaaacgacccagtaccagtcaatacccatggcaccacaacttaacccgtcacatgcgggcggcgttattaccc < 2:1139772‑M1/150‑143 (MQ=255) cTCAGGCTACGCTCATAGCGCAACCCAGCCTGAGTTTGCTTGATGGTTTTTCGCGTGTCGTACTGTTCTGCACGAGGCGCTTGTTGTGGATTAGCCTTCCATTCTGCTTTGGTTAGCCCACCTGGGTCATCTGCTTTGATATCCACACTa > 1:732954/1‑150 (MQ=255) cAGGCTACGCTCATAGCGCAACCCAGCCTGAGTTTGCTTGATGGTTTTTCGCGTGTCGTACTGTTCTGCACGAGGCGCTTGTTGTGGATTAGCCTTCCATTCTGCTTTGGTTAGCCCACCTGGGTCATCTGCTTTGATATCCACACTAtt > 2:1518945/1‑150 (MQ=255) aGGCTACGCTCATATCGCAACCCAGCCTGAGTTTGCTTGATGGTTTTTCGCGTGTCGTACTGTTCTGCACGAGGCGCTTGTTGTTGATTAGCCTTCCATTCTGCTTTGGTTAGCCCACCTGGGTCATCTGCTTTGATATCCACACTATTg < 2:1223160/150‑1 (MQ=255) ggCTgggttgcgctatgagcgtagcctgagttcgcgggatgatatgagtgtgatgatgtatgccggagagcgagaaacgacccagtaccagtcaatacccatggcaccacaacttaacccgtcacatgcgggcggcgtgattaccctgca < 1:1488896‑M1/150‑147 (MQ=255) ggCTgggttgcgctatgagcgtagcctgagttcgcgggatgatatgagtgtgatgatgtatgccggagagcgagaaacgacccagtaccagtcaatacccatggcaccacaacttaacccgtcacatgcgggcggcgtgattaccctgca < 1:710013‑M1/150‑147 (MQ=255) ggCTgggttgcgctatgagcgtagcctgagttcgcgggatgatatgagtgtgatgatgtatgccggagagcgagaaacgaccaagtaccagtcaatacccatggcaccacaacttaacccgtcacatgcgggcggcgtgattaccctgca > 2:493455‑M1/1‑4 (MQ=255) | GTCTATTCCCTGGTAATGGCGTTGCAGGGTAATCACGCCGCCCGCATGTGACGGGTTAAGTTGTGGTGCCATGGGTATTGACTGGTACTGGGTCGTTTCTCGCTCTCCGGCATACATCATCACACTCATATCATCCCGCGAACTCAGGCTACGCTCATAGCGCAACCCAGCCTGAGTTTGCTTGATGGTTTTTCGCGTGTCGTACTGTTCTGCACGAGGCGCTTGTTGTGGATTAGCCTTCCATTCTGCTTTGGTTAGCCCACCTGGGTCATCTGCTTTGATATCCACACTATTGA > NC_000913/1522055‑1522350 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |