| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 3726887 = | 65 (0.740) | 7 (0.090) | 7/254 | NT | 10.0% | intergenic (+5/+37) | wecH/yiaA | O‑acetyltransferase WecH/conserved inner membrane protein YiaA |
| ? | NC_000913 | 3726917 = | 66 (0.820) | intergenic (+35/+7) | wecH/yiaA | O‑acetyltransferase WecH/conserved inner membrane protein YiaA | |||||
TATCCATGCGCTGCGCACCCGGGGAATTGAGCTTAAAAATTGGCCAATACTGGATATTATTTGGATCTTTTGCGCGACGTTGGCAGCGAGTTTGTTACTTTCTATGCTGGTACAACGAATCGACAGAAACAGATTAGTGAGTTAAGTAAAAGCCCGGTCACATTGGACTGACCGGGCTTACGTGAGTTATTCGCTGTATTCTTCCTGGGTAACCTGTGTTTCTTTTGGTGGGTTTATTCCGGCATCACGAATATTTTTCTGCACCGCTACTGCACCAAACAAGCTTAAGAAGAAAGCCA > NC_000913/3726738‑3727036 | attactcagcgaaaaaggtttttatggactggctttcttcttaagcttgtttggtgcagtagcggtgcagaaaaatattcgtgatgccggaataaacccaccaaaagaaacacaggttacccaggaagaatacagcgaataactcacgta > 1:1433706‑M1/150‑150 (MQ=255) tactcagcgaaaaaggtttttatggactggctttcttcttaagcttgtttggtgcagtagcggtgcagaaaaatattcgtgatgccggaataaacccaccaaaagaaacacaggttacccaggaagaatacagcgaataactcacgtAAg < 2:1090653‑M1/3‑1 (MQ=255) ccATGCGCTGCGCACCCGGGGAATTGAGCTTAAAAATTGGCCAATACTGGATATTATTTGGATCTTTTGCGCGACGTTGGCAGCGAGTTTGTTACTTTCTATGCTGGTACAACGAATCGACAGAAACAGATTAGTGAGTTAAGTAAAAGc > 2:1014636/1‑150 (MQ=255) ctcagcgaaaaaggtttttatggactggctttcttcttaagcttgtttggtgcagtagcggtgcagaaaaatattcgtgatgccggaataaacccaccaaaagaaacacaggttacccaggaagaatacagcgaataactcacgtAAGcc < 1:136977‑M1/5‑1 (MQ=255) cATGCGCTGCGCACCCGGGGAATTGAGCTTAAAAATTGGCCAATACTGGATATTATTTGGATCTTTTGCGCGACGTTGGCAGCGAGTTTGTTACTTTCTATGCTGGTACAACGAATCGACAGAAACAGATTAGTGAGTTAAGTAAAAGcc > 2:1339188/1‑150 (MQ=255) cagcgaaaaaggtttttatggactggctttcttcttaagcttgtttggtgcagtagcggtgcagaaaaatattcgtgatgccggaataaacccaccaaaagaaacacaggttacccaggaagaatacagcgaataactcacgtAAGCCCg < 2:787487‑M1/7‑1 (MQ=255) cagcgaaaaaggtttttatggactggctttcttcttaagcttgtttggtgcagtagcggtgcagaaaaatattcgtgatgccggaataaacccaccaaaagaaacacaggttacccaggaagaatacagcgaataactcacgtAAGCCCg < 2:1511382‑M1/7‑1 (MQ=255) cagcgaaaaaggtttttatggactggctttcttcttaagcttgtttggtgcagtagcggtgcagaaaaatattcgtgatgccggaataaacccaccaaaagaaacacaggttacccaggaagaatacagcgaataactcacgtAAGCCCg < 2:1211355‑M1/7‑1 (MQ=255) gcgctgcgcACCCGGGGAATTGAGCTTAAAAATTGGCCAATACTGGATATTATTTGGATCTTTTGCGCGACGTTGGCAGCGAGTTTGTTACTTTCTATGCTGGTACAACGAATCGACAGAAACAGATTAGTGAGTTAAGTAAAAGCCCgg < 2:754612/150‑1 (MQ=255) cgaaaaaggtttttatggactggctttcttcttaagcttgtttggtgcagtagcggtgcagaaaaatattcgtgatgccggaataaacccaccaaaagaaacacaggttacccaggaagaatacagcgaataactcacgtAAGCCCGGTc < 2:931159‑M1/10‑1 (MQ=255) cgaaaaaggtttttatggactggctttcttcttaagcttgtttggtgcagtagcggtgcagaaaaatattcgtgatgccggaataaacccaccaaaagaaacacaggttacccaggaagaatacagcgaataactcacgtAAGCCCGGTc > 2:381495‑M1/141‑150 (MQ=255) aCCCGGGGAATTGAGCTTAAAAATTGGCCAATACTGGATATTATTTGGATCTTTTGCGCGACGTTGGCAGCGAGTTTGTTACTTTCTATGCTGGTACAACGAATCGACAGAAACAGATTAGTGAGTTAAGTAAAAGCCCGGTCACATTgg < 1:407960/150‑1 (MQ=255) ccGGGGAATTGAGCTTAAAAATTGGCCAATACTGGATATTATTTGGATCTTTTGCGCGACGTTGGCAGCGAGTTTGTTACTTTCTATGCTGGTACAACGAATCGACAGAAACAGATTTGTGAGTTAAGTAAAAGCCCGGTCACATTGGAc < 1:293915/150‑1 (MQ=255) cGGGGAATTGAGCTTAAAAATTGGCCAATACTGGATATTATTTGGATCTTTTGCGCGACGTTGGCAGCGAGTTTGTTACTTTCTATGCTGGTACAACGAATCGACAGAAACAGATTAGTGAGTTAAGTAAAAGCCCGGTCACATTGGACt > 2:827234/1‑150 (MQ=255) gactggctttcttcttaagcttgtttggtgcagtagcggtgcagaaaaatattcgtgatgccggaataaacccaccaaaagaaacacaggttacccaggaagaatacagcgaataactcacgtAAGCCCGGTCACATTGGACTGACCggg > 2:1134548‑M1/124‑150 (MQ=255) actggctttcttcttaagcttgtttggtgcagtagcggtgcagaaaaatattcgtgatgccggaataaacccaccaaaagaaacacaggttacccaggaagaatacagctaataactcacgtAAGCCCGGTCACATTGGACTGACCGGGc > 1:1220356‑M1/123‑150 (MQ=255) gAGCTTAAACATTGGCCAATACTGGATATTATTTGGATCTTTTGCGCGACGTTGGCAGCGAGTTTGTTACTTTCTATGCTGGTACAACGAATCGACAGAAACAGATTAGTGAGTTAAGTAAAAGCCCGGTCACATTGGACTGACCGGGCt < 2:704223/150‑1 (MQ=255) ggctttcttcttaagcttgtttggtgcagtagcggtgcagaaaaatattcgtgatgccggaataaacccaccaaaagaaacacaggttacccaggaagaatacagcgaataactcacgtAAGCCCGGTCACATTGGACTGACCGGGCTTa < 2:1428792‑M1/31‑1 (MQ=255) gCTTAAAAATTGGCCAATACTCGATATTATTTGGATCTTTTGCGCGACGTTGGCAGCGAGTTTGTTACTTTCTATGCTGTTACAACGATTCTAATGAAACAGATTAGTGAGTTAAGTAAAAGCCCGGTCACTTTGGACTTACCGGTCTTa < 2:637740/150‑1 (MQ=255) cTTAAAAATTGGCCAATACTGGATATTATTTGGATCTTTTGCGCGACGTTGGCAGCGAGTTTGTTACTTTCTATGCTGGTACAACGAATCGACAGAAACAGATTAGTGAGTTAAGTAAAAGCCCGGTCACATTGGACTGACCGGGCTTAc > 1:1470243/1‑150 (MQ=255) ttAAAAATTGGCCAATACTGGATATTATTTGGATCTTTTGCGCGACGTTGGCAGCGAGTTTGTTACTTTCTATGCTGGTACAACGAATCGACAGAAACAGATTAGTGAGTTAAGTAAAAGCCCGGTCACATTGGACTGACCGGGCTTACg < 2:1048409/150‑1 (MQ=255) tAAAAATTGGCCAATACTGGATATTATTTGGATCTTTTGCGCGACGTTGGCAGCGAGTTTGTTACTTTCTATGCTGGTACAACGAATCGACAGAAACAGATTAGTGAGTTAAGTAAAAGCCCGGTCACATTGGACTGACCGGGCTTACGt > 2:760198/1‑150 (MQ=255) aaaTTGGCCAATACTGGATATTATTTGGATCTTTTGCGCGACGTTGGCAGCGAGTTTGTTACTTTCTATGCTGGTACAACGAATCGACAGAAACAGATTAGTGAGTTAAGTAAAAGCCCGGTCACATTGGACTGACCGGGCTTa > 2:1364933/1‑144 (MQ=255) aaaTTGGCCAATACTGGATATTATTTGGATCTTTTGCGCGACGTTGGCAGCGAGTTTGTTACTTTCTATGCTGGTACAACGAATCGACAGAAACAGATTAGTGAGTTAAGTAAAAGCCCGGTCACATTGGACTGACCGGGCTTa < 1:1364933/144‑1 (MQ=255) ttcttaagcttgtttggtgcagtagcggtgcagaaaaatattcgtgatgccggaataaacccaccaaaagaaacacaggttacccaggaagaatacagcgaataactcacgtAAGCCCGGTCACATTGGACTGACCGGGCTTACGTGAGt < 2:872034‑M1/38‑1 (MQ=255) ggCCAATACTGGATATTATTTGGATCTTTTGCGCGACGTTGGCAGCGAGTTTGTTACTTTCTATGCTGGTACAACGAATCGACAGAAACAGATTAGTGAGTTAAGTAAAAGCCCGGTCACATTGGACTGACCGGGCTTACGTGAGTTAtt > 2:1331469/1‑150 (MQ=255) ggCCAATACTGGATATTATTTGGATCTTTTGCGCGACGTTGGCAGCGAGTTTGTTACTTTCTATGCTGGTACAACGAATCGACAGAAACAGATTAGTGAGTTAAGTAAAAGCCCGGTCACATTGGACTGACCGGGCTTACGTGAGTTAtt > 2:1421050/1‑150 (MQ=255) ggCCAATACTGGATATTATTTGGATCTTTTGCGCGACGTTGGCAGCGAGTTTGTTACTTTCTATGCTGGTACAACGAATCGACAGAAACAGATTAGTGAGTTAAGTAAAAGCCCGGTCACATTGGACTGACCGGGCTTACGTGAGTTAtt > 1:171993/1‑150 (MQ=255) ggCCAATACTGGATATTATTTGGATATTTTGCGCGACGTTGGCAGCGAGTTTGTTACTTTCTATGCTGGTACAACGAATCGACAGAAACAGATTAGTGAGTTAAGTAAAAGCCCGGTCACATTGGACTGACCGGGCTTACGTGAGTTAtt < 2:105866/150‑1 (MQ=255) gCCAATACTGGATATTATTTGGATCTTTTGCGCGACGTTGGCAGCGAGTTTGTTACTTTCTATGCTGGTACAACGAATCAACAGAAACAGATTAGTGAGTTAAGTAAAATCCCGGTCACATTGGACTGACCTGGCTTACGTTAGTTATTc > 2:1423699/1‑150 (MQ=255) ccAATACTGGATATTATTTGGATCTTTTGCGCGACGTTGGCAGCGAGTTTGTTACTTTCTATGCTGGTACAACGAATCGACAGAAACAGATTAGTGAGTTAAGTAAAAGCCCGGTCACATTGGACTGACCGGGCTTACGTGAGTTATTCg < 2:1211058/150‑1 (MQ=255) tACTGGATATTATTTGGATCTTTTGCGCGACGTTGGCAGCGAGTTTGTTACTTTCTATGCTGGTACAACGAATCGACAGAAACAGATTAGTGAGTTAAGTAAAAGCCCGGTCACATTGGACTGACCGGGCTTACGTGAGTTATTCGCTGt < 2:1470243/150‑1 (MQ=255) tACTGGATATTATTTGGAGCTTTTGCGCGACGTTGGCAGCGAGTTTGTTACTTTCTATGCTGGTACAACGAATCGACAGAAACAGATTAGTGAGTTAAGTAAAAGCCCGGTCACATTGGACTGACCGGGCTTACGTGAGTTATTCGCTGt < 1:503911/150‑1 (MQ=255) gcagtagcggtgcagaaaaatattcgtgatgccggaataaacccaccaaaagaaacacaggttacccaggaagaatacagcgaataactcacgtAAGCCCGGTCACATTGGACTGACCGGGCTTACGTGAGTTATTCGCTGTATTCTTcc > 1:227317‑M1/95‑150 (MQ=255) tattTGGATCTTTTGCGCGACGTTGGCAGCGAGTTTGTTACTTTCTATGCTGGTACAACGAATCGACAGAAACAGATTAGTGAGTTAAGTAAAAGCCCGGTCACATTGGACTGACCGGGCTTACGTGAGTTATTCGCTGTATTCTTCCTg < 2:1184477/150‑1 (MQ=255) attTGGATCTTTTGCGCGACGTTGGCAGCGAGTTTGTTACTTTCTATGCTGGTACAACGAATCGACAGAAACAGATTAGTGAGTTAAGTAAAAGCCCGGTCACATTGGACTGACCGGGCTTACGTGAGTTATTCGCTGTATTCTTCCTgg > 2:71455/1‑150 (MQ=255) tttGGATCTTTTGCGCGACGTTGGCAGCGAGTTTGTTACTTTCTATGCTGGTACAACGAATCGACAGAAACAGATTAGTGAGTTAAGTAAAAGCCCGGTCACATTGGACTGACCGGGCTTACGTGAGTTATTCGCTGTATTCTTCCTggg > 2:174473/1‑150 (MQ=255) tttGGATCTTTTGCGCGACGTTGGCAGCGAGTTTGTTACTTTCTATGCTGGTACAACGAATCGACAGAAACAGATTAGTGAGTTAAGTAAAAGCCCGGTCACATTGGACTGACCGGGCTTACGTGAGTTATTCGCTGTATTCTTCCTggg < 2:171993/150‑1 (MQ=255) 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aaaGCCCGGTCACATTGGACTGACCGGGCTTACGTGAGTTATTCGCTGTATTCTTCCTGGGTAACCTGTGTTTCTTTTGGTGGGTTTATTCCGGCATCACGAATATTTTTCTGCACCGCTACTGCACCAAACAAGCTTAAGAAGAAAGcc > 2:325740/1‑150 (MQ=255) aaaGCCCGGTCACATTGGACTGACCGGGCTTACGTGAGTTATTCGCTGTATTCTTCCTGGGTAACCTGTGTTTCTTTTGGTGGGTTTATTCCGGCATCACGAATATTTTTCTGCACCGCTACTGCACCAAACAAGCTTAAGAAGAAAGcc < 1:827234/150‑1 (MQ=255) aaaGCCCGGTCACATTGGACTGACCGGGCTTACGTGAGTTATTCGCTGTATTCTTCCTGGGTAACCTGTGTTTCTTTTGGTGGGTTTATTCCGGCATCACGAATATTTTTCTGCACCGCTACTGCACCAAACAAGCTTAAGAAGAAAGcc < 2:688899/150‑1 (MQ=255) AAGCCCGGTCACATTGGACTGACCGGGCTTACGTGAGTTATTCGCTGTATTCTTCCTGGGTAACCTGTGTTTCTTTTGGTGGGTTTATTCCGGCATCACGAATATTTTTCTGCACCGCTACTGCACCAAACAAGCTTAAGAAGAAAGCCa < 1:1511382‑M1/150‑1 (MQ=255) AAGCCCGGTCACATTGGACTGACCGGGCTTACGTGAGTTATTCGCTGTATTCTTCCTGGGTAACCTGTGTTTCTTTTGGTGGGTTTATTCCGGCATCACGAATATTTTTCTGCACCGCTACTGCACCAAACAAGCTTAAGAAGAAAGCCa < 1:1259411‑M1/150‑1 (MQ=255) | TATCCATGCGCTGCGCACCCGGGGAATTGAGCTTAAAAATTGGCCAATACTGGATATTATTTGGATCTTTTGCGCGACGTTGGCAGCGAGTTTGTTACTTTCTATGCTGGTACAACGAATCGACAGAAACAGATTAGTGAGTTAAGTAAAAGCCCGGTCACATTGGACTGACCGGGCTTACGTGAGTTATTCGCTGTATTCTTCCTGGGTAACCTGTGTTTCTTTTGGTGGGTTTATTCCGGCATCACGAATATTTTTCTGCACCGCTACTGCACCAAACAAGCTTAAGAAGAAAGCCA > NC_000913/3726738‑3727036 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |