| New junction evidence | |||||||||||
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Only 100 of 129 total aligned reads displayed.
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aGCTCGCATTTCCCAGGGAGTTACGCTTGTTAACTCCCAgggaaatgcgagcttaaccactcaggggttagctttattacttagaaacggtcagacgagcgcggcctttagcacgacgacgtgccagaacctgacgaccattttta < 1:66947‑M2/146‑108 (MQ=255) gCTCGCATTTCCCAGGGAGTTACGCTTGTTAAATCCCAGTCAATTCACATTCGTCTTCCAGCAGCCACAACGGGCTGGCACGCCGAAAATTACCATTCTCGGCCGCCTGAATTCGCTGGGGCATCCCCGTATAGGTCTTACAGTCGCCaa > 2:1133854/1‑150 (MQ=255) cTCGCATTTCCCAGGGAGTTACGCTTGTTAACTCCCAGTCAATTCACATTCGTCTTCCAGCAGCCACAACGGGCTGGCACGCCGCAAATTACCATTCTCGGCCGCCTGAATTCGCTGGGGCATCCCCGTATCGGTCTTACAGTCGCCAAg < 2:1033326/150‑1 (MQ=255) tttCCCAGGGAGTTACGCTTGTTAACTCCCTgggaaatgcgagcttaaccactcaggggttagctttattacttagaaacggtcagacgagcgcggcctttagcacgacgacgtgccagaacctgacgaccatttttagtagccatacga < 1:1530813‑M2/150‑120 (MQ=255) tCCCAGGGAGTTATGCTTGTTAACTCCCAGTCAATTCACATTCGTCTTCCAGCAGCCACAACGGGCTGGCACGCCGCAAATTACCATTCTCGGCCGCCTGAATTCGCTGGGGCATCCCCGTATCGGTCTTACAGTCGCCAAGAAAAACGt > 1:334940/1‑150 (MQ=255) tCCCAGGGAGTTACGCTTGTTAACTCCCAGTCAATTCACATTCGTCTTCCAGCAGCCACAACGGGCTGGCACGCCGCAAATTACCATTCTCGGCCGCCTGAATTCGCTGGGGCATCCCCGTATCGGTCTTACAGTCGCCAAGAAAAACGt > 2:1355652/1‑150 (MQ=255) ccAGGGAGTTACGCTTGTTAACTCCCTgggaaatgcgagcttaaccactcaggggttagctttattacttagaaacggtcagacgagcgcggcctttagcacgacgacgtgccagaacctgacgaccatttttagtagccatacgagcac < 2:440178‑M2/150‑124 (MQ=255) ccAGGGAGTTACGCTTGTTAACTCCCAGTCAATTCACATTCGTCTTCCAGCAGCCACAACGGGCTGGCACGCCGCAAATTACCATTCTCGGCCGCCTGAATTCGCTGGGGCATCCCCGTATCGGTCTTACAGTCGCCAAGAAAAACGTTc > 2:172341/1‑150 (MQ=255) ccAGGGAGTTACGCTTGTTAACTCCCAGTCAATTCACATTCGTCTTCCAGCAGCCACAACGGGCTGGCACGCCGCAAATTACCATTCTCGGCCGCCTGAATTCGCTGGGGCATCCCCGTATCGGTCTTACAGTCGCCAAGAAAAACGTTc > 2:1133718/1‑150 (MQ=255) cAGGGAGTTACGCTTGTTAACTCCCAGTCAATTCACATTCGTCTTCCAGCAGCCACACCGGGCTGGCACGCCGCAAATTACCATTCTCGGCCGCCTGAATTCGCTGGGGCATCCCCGTATCGGTCTTACAGTCGCCAAGAAAAACGTTCg > 2:81222/1‑150 (MQ=255) cAGGGAGTTACGCTTGTTAACTCCCAGTCAATTCACATTCGTCTTCCAGCAGCCACAACGGGCTGGCACGCCGCAAATTACCATTCTCGGCCGCCTGAATTCGCTGGGGCATCCCCGTATCGGTCTTACAGTCGCCAAGAAAAACGTTCg > 2:604020/1‑150 (MQ=255) cAGGGAGTTACGCTTGTTAACTCCCAGTCAATTCACATTCGTCTTCCAGCAGCCACAACGGGCTGGCACGCCGCAAATTACCATTCTCGGCCGCCTGAATTCGCTGGGGCATCCCCGTATCGGTCTTACAGTCGCCAAGAAAAACGTTCg < 1:827548/150‑1 (MQ=255) cAGGGAGTTACGCTTGTTAACTCCCAGTCAATTCACATTCGTCTTCCAGCAGCCACAACGGGCTGGCACGCCGCAAATTACCATTCTCGGCCGCCTGAATTCGCTGGGGCATCCCCGTATCGGTCTTACAGTCGCCAAGAAAAACGTTCg > 2:1010037/1‑150 (MQ=255) cAGGGAGTTACGCTTGTTAACTCCCAGTCAATTCACATTCGTCTTCCAGCAGCCACAACGGGCTGGCACGCCGCAAATTACCATTCTCGGCCGCCTGAATTCGCTGGGGCATCCCCGTATCGGTCTTACAGTCGCCAAGAAAAACGTTCg > 2:1295197/1‑150 (MQ=255) cAGGGAGTTACGCTTGTTAACTCCCAGACAATTCACATTCGTCTTCCAGCAGCCACAACGGGCTGGCACGACCCAAATTACCATTCTCGGCCGCCTGAATTCGCTGGGGCATCCCCGTATCGGTCTTACAGTCGCCAAGAAAAACGTTCg > 2:86826/1‑150 (MQ=255) | TGAAGCGCAACCGTTCTCACGGCTTCCGTGCTCGTATGGCTACTAAAAATGGTCGTCAGGTTCTGGCACGTCGTCGTGCTAAAGGCCGCGCTCGTCTGACCGTTTCTAAGTAATAAAGCTAACCCCTGAGTGGTTAAGCTCGCATTTCCCAGGGAGTTACGCTTGTTAACTCCCAGTCAATTCACATTCGTCTTCCAGCAGCCACAACGGGCTGGCACGCCGCAAATTACCATTCTCGGCCGCCTGAATTCGCTGGGGCATCCCCGTATCGGTCTTACAGTCGCCAAGAAAAACGTTCG > NC_000913/3884364‑3884662 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |