| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | NC_000913 | 2078520 = | 86 (0.980) | 11 (0.140) | 8/256 | NT | 12.3% | intergenic (+386/‑55) | yeeW/yoeF | CP4‑44 prophage; putative uncharacterized protein YeeW/CP4‑44 prophage; putative uncharacterized protein YoeF |
| ? | NC_000913 | 2078552 = | 77 (0.950) | intergenic (+418/‑23) | yeeW/yoeF | CP4‑44 prophage; putative uncharacterized protein YeeW/CP4‑44 prophage; putative uncharacterized protein YoeF | |||||
Only 100 of 112 total aligned reads displayed.
CAGTGGAGGTGCGTTATGGCCGTTTTAACGATTAGCATTGACCTGACAAAAAATGAATTCCAAATCCACGGTCTGGGTAGGAACAGAAAAATCTAAGCTCAGAAAACGGATTAAAGTAAGCGTCAACGGAGCACCGTATTGACGCTTATTTATTGGTGAGAACTACGTTCCATGGCAGGAGTTCGTCAACACGGTTGGAGGGCCATTCCGGCAGTATGCTCAGAATATGGCGCAGATACGCTTCCGGATCGATACCGTTCAGACGGCAGGTGCCTGCTTTTCTGGCAACAAGCAGG > NC_000913/2078404‑2078699 | gtctgaacggtatcgatccggaagcgtatctgcgccatattctgagcatactgccggaatggccctccaaccgtgttgacgaactcctgccatggaacgtagttctcaccaataaaTAAGCGTCAACGGAGCACCGTATTGACGCttatt > 1:647549‑M1/117‑150 (MQ=255)gtctgaacggtatcgatccggaagcgtatctgcgccatattctgagcatactgccggaatggccctccaaccgtgttgacgaactcctgccatggaacgtagttctcaccaataaaTAAGCGTCAACGGAGCACCGTATTGACGCttatt > 2:1208161‑M1/117‑150 (MQ=255)cAGTGGAGGTGCGTTATGGCCGTTTTAACGATTAGCATTGACCTGACAAAAAATGAATTCCAAATCCACGGTCTGGGTAGGAACAGAAAAATCTAAGCTCAGAAAACGGATTAAAGTAAGCGTCAACGGAGCACCGTATTGACGCttatt > 1:1183134/1‑150 (MQ=255) 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aGGTGCGTTATGGCCGTTTTAACGATTAGCATTGACCTGACAAAAAATGAATTCCAAATCCACGGTCTGGGTAGGAACAGAAAAATCTAAGCTCAGAAAACGGATTAAAGTAAGCGTCAACGGAGCACCGTATTGACGCTTATTTATTgg < 1:865164/150‑1 (MQ=255) ggTGCGTTATGGCCGTTTTAACGATTAGCATTGACCTGACAAAAAATGAATTCCAAATCCACGGTCTGGGTAGGAACAGAAAAATCTAAGCTCAGAAAACGGATTAAAGTAAGCGTCAACGGAGCACCGTATTGACGCTTATTTATTGGt > 2:1463568/1‑150 (MQ=255) gTGCGTTATGGCCGTTTTAACGATTAGCATTGACCTGACAAAAAATGAATTCCAAATCCACGGTCTGGGTAGGAACAGAAAAATCTAAGCTCAGAAAACGGATTAAAGTAAGCGTCAACGTAGCTCCGTATTGACGCTTATTTATTGGTg < 2:88221/150‑1 (MQ=255) gTGCGTTATGGCCGTTTTAACGATTAGCATTGACCTGACAAAAAATGAATTCCAAATCCACGGTCTGGGTAGGAACAGAAAAATCTAAGCTCAGAAAACGGATTAAAGTAAGCGTCAACGGAGCACCGTATTGACGCTTATTTATTGGTg < 1:279564/150‑1 (MQ=255) gCGTTATGGCCGTTTTAACGATTAGCATTGACCTGACAAAAAATGAATTCCAAATCCACGGTCTGGGTAGGAACAGAAAAATCTAAGCTCAGAAAACGGATTAAAGTAAGCGTCAACGGAGCACCGTATTGACGCTTATTTATTGGTgag < 2:1004909/150‑1 (MQ=255) 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taTTTATTGGTGAGAACTACGTTCCATGGCAGGAGTTCGTCAACACGGTTGGAGGGCCATTCCGGCAGTATGCTCAGAATATGGCGCAGATACGCTTCCGGATCGATACCGTTCAGACGGCAGGTGCCTGCTTTTCTGGCAACAAGCAgg < 2:1469902‑M2/148‑1 (MQ=255) | CAGTGGAGGTGCGTTATGGCCGTTTTAACGATTAGCATTGACCTGACAAAAAATGAATTCCAAATCCACGGTCTGGGTAGGAACAGAAAAATCTAAGCTCAGAAAACGGATTAAAGTAAGCGTCAACGGAGCACCGTATTGACGCTTATTTATTGGTGAGAACTACGTTCCATGGCAGGAGTTCGTCAACACGGTTGGAGGGCCATTCCGGCAGTATGCTCAGAATATGGCGCAGATACGCTTCCGGATCGATACCGTTCAGACGGCAGGTGCCTGCTTTTCTGGCAACAAGCAGG > NC_000913/2078404‑2078699 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |