| New junction evidence | |||||||||||
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| ? | NC_000913 | 2513657 = | 96 (1.120) | coding (616/1203 nt) | nupC | nucleoside:H(+) symporter NupC | |||||
Only 100 of 119 total aligned reads displayed.
TATCCTCGGCAAAATCTCCCGTAATCGTATGTACACCATGGCTGCCACGGCAATGTCCACCGTGTCGATGTCCATCGTTGGTGCATACATGACCATGCTGGAACCGAAATACGTCGTTGCTGCGCTGGTACTGAACATGTTCAGCACCTTTATCGTGCTGTCGCTGATCAATCCTTACCGTGTTGATGCCAGTGAAGAAAACATCCAGATGTCCAACCTGCACGAAGGTCAGAGCTTCTTCGAAATGCTGGGTGAATACATTCTGGCAGGTTTCAAAGTTGCCATTATCGTTGCCGC > NC_000913/2513509‑2513805 | tatCCTCGGCAAAATCTCCCGTAATCGTATGTACACCATGGCTGCCACGGCAATGTCGACCGTGTCGATGTCCATCGTTTGTGCATACATTACCATGCTGGAACCGAAATAGGTCGTTGCTGCGCTGGTACTGAACATGTTCAGCACCtt < 2:366025/150‑1 (MQ=255) atCCTCGGCAAAATCTCCCGTAATCGTATGTACACCATGGCTGCCACGGCAATGTCCACCGTGTCGATGTCCATCGTTTGTGCATACATGACCATGCTGGAACCGAAATACGTCGTTGCTGCGCTGGTACTGTACATGTTCAGCACCttt < 2:105799/150‑1 (MQ=255) cTCGGCAAAATCTCCCGTAATCGTATGTACACCATGGCTGCCACGGCAATGTCCACCGTGTCGATGTCCATCGTTGGTGCATACATGACCATGCTGGAACCGAAATACGTCGTTGCTGCGCTGGTACTGAACATGTTCAGCACCTTTATc < 2:1300956/150‑1 (MQ=255) tCGGCAAAATCTCCCGTAATCGTATGTACACCATGGCTGCCACGGCAATGTCCACCGTGTCGATGTCCATCGTTGGTGCATACGTGACCATGCTGGAACCGAAATACGTCGTTGCTGCGCTGGTACTGAACATGTTCAGCACCTTTATCg < 1:525540/150‑1 (MQ=255) tCGGCAAAATCTCCCGTAATCGTATGTACACCATGGCTGCCACGGCAATGTCCACCGTGTCGATGTCCATCGTTGGTGCATACATGACCATGCTGGAACCGAAATACGTCGTTGCTGCGCTGGTACTGAACATGTTCAGCACCTTTATCg < 2:1327961/150‑1 (MQ=255) tCGGCAAAATCTCCCGTAATCGTATGTACACCATGGCTGCCACGGCAATGTCCACCGTGTCGATGTCCATCGTTGGTGCATACATGACCATGCTGGAACCGAAATACGTCGTTGCTGCGCTGGTACTGAACATGTTCAGCACCTTTATCg < 2:1333295/150‑1 (MQ=255) ctgccagaatgtattcacccagcatttcgaagaagctctgaccttcgtgcaggttggacatctggatgttttcttcactggcatcaacacggtaaggattgatcagcgacagcacgataaaggtgctgaacatgttcagtaccTTTATCg < 1:864699‑M2/7‑1 (MQ=255) tgccagaatgtattcacccagcatttcgaagaagctctgaccttcgtgcaggttggacatctggatgttttcttcactggcatcaacacggtaaggattgatcagcgacagcacgataaaGGTACTGAACATGTTCAGCACCTTTATCg < 1:277732‑M1/29‑1 (MQ=255) 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cgcTGGTACTGAACATGTTCAGCACCTTTATCGTGCTGTCGCTGATCAATCCTTACCGTGTTGATGCCAGTGAAGAAAACATCCAGATGTCCAACCTGCACGAAGGTCAGAGCTTCTTCGAAATGCTGGGTGAATACATTCTGGCAGGtt < 2:882705/150‑1 (MQ=255) cTGGTACTGAACATGTTCAGCACCTTTATCGTGCTGTCGCTGATCAATCCTTACCGTGTTGATGCCAGTGAAGAAAACATCCAGATGTCCAACCTGCACGAAGGTCAGAGCTTCTTCGAAATGCTGGGTGAATACATTCTGGCAGGTTTc < 2:145559/150‑1 (MQ=255) tGGTACTGAACATGTTCAGCACCTTTATCGTGCTGTCGCTGATCAATCCTTACCGTGTTGATGCCAGTGAAGAAAACATCCAGATGTCCAACCTGCACGAAGGTCAGAGCTTCTTCGAAATGCTGGGTGAATACATTCTGGCAGGTTTCa < 1:1092295/150‑1 (MQ=255) ggtgctgaacatgttcagtaccTTTATCGTGCTGTCGCTGATCAATCCTTACCGTGTTGATGCCAGTGAAGAAAACATCCAGATGTCCAACCTGCACGAAGGTCAGAGCTTCTTCGAAATGCTGGGTGAATACATTCTGGCAGGTTTCaa > 1:1239069‑M2/23‑150 (MQ=255) GTACTGAACATGTTCAGCACCTTTATCGTGCTGTCGCTGATCAATCCTTACCGTGTTGATGCCAGTGAAGAAAACATCCAGATGTCCAACCTGCACGAAGGTCAGAGCTTCTTCGAAATGCTGGGTGAATACATTCTGGCAGGTTTCaaa < 1:936639‑M1/150‑1 (MQ=255) cagAACATGTTCAGCACCTTTATCGTGCTGTCGCTGATCAATCATTACCGTGTTGATGCCACTGAAGAAAACAACCAGATGTCCAACCTGCACGAAGGTCAGAGCTTCTTCGAAAAGCACCGTGAATACATACTGGCACGTTTCAAAGtt > 2:921915/3‑150 (MQ=255) cTGAACATGTTCAGCACCTTTATCGTGCTGTCGCTGATCAATCCTTACCGTGTTGATGCCAGTGAAGAAAACATCCAGATGTCCAACCTGCACGAAGGTCAGAGCTTCTTCGAAATGCTGGGTGAATACATTCTGGCAGGTTTCAAAGtt > 2:1020644/1‑150 (MQ=255) cTGAACATGTTCAGCACCTTTATCGTGCTGTCGCTGATCAATCCTTACCGTGTTGATGCCAGTGAAGAAAACATCCAGATGTCCAACCTGCACGAAGGTCAGAGCTTCTTCGAAATGCTGGGTGAATACATTCTGGCAGGTTTCAAAGtt > 1:1477839/1‑150 (MQ=255) aCATGTTCAGCACCTTTATCGTGCTGTCGCTGATCAATCCTTACCGTGTTGATGCCAGTGAAGAAAACATCCAGATGTCCAACCTGCACGAAGGTCAGAGCTTCTTCGAAATGCTGGGTGAATACATTCTGGCAGGTTTCAAAGTTGCCa > 2:1420962/1‑150 (MQ=255) catgttcagtaccTTTATCGTGCTGTCGCTGATCAATGCTTACCGTGTTGATGCCAGTGAAGAAAACATCCAGATGTCCAACCTGCACGAAGGTCAGAGCTTCTTCGAAATGCTGGGTGAATACATTCTGGCAGGTTTCAAAGTTGCCAt > 2:276046‑M2/14‑150 (MQ=255) tGTTCAGCACCTTTATCGTGCTGTCGCTGATCAATCCTTACCGTGTTGATGCCAGTGAAGAAAACATCCAGATGTCCAACCTGCACGAAGGTCAGAGCTTCTTCGAAATGCTGGGTGAATACATTCTGGCAGGTTTCAAAGTTGCCATTa > 1:153516/1‑150 (MQ=255) tGTTCAGCACCTTTATCGTGCTGTCGCTGATCAATCCTTACCGTGTTGATGCCAGTGAAGAAAACATCCAGATGTCCAACCTGCACGAAGGTCAGAGCTTCTTCGAAATGCTGGGTGAATACATTCTGGCAGGTTTCAAAGTTGCCATTa < 1:177023/150‑1 (MQ=255) ttCAGCACCTTTATCGTGCTGTCGCTGATCAATCCTTACCGTGTTGATGCCAGTGAAGAAAACATCCAGATGTCCAACCTGCACGAAGGTCAGAGCTTCTTCGAAATGCTGGGTGAATACATTCTGGCAGGTTTCAAAGTTGCCATTATc > 1:846314/1‑150 (MQ=255) tCAGCACCTTTATCGTGCTGTCGCTGATCAATCCTTACCGTGTTGATGCCAGTGAAGAAAACATCCAGATGTCCAACCTGCACGAAGGTCAGAGCTTCTTCGAAATGCTGGGTGAATACATTCTGGCAGGTTTCAAAGTTGCCATTATCg > 1:285859/1‑150 (MQ=255) ccTTTATCGTGCTGTCGCTGATCAATCCTTACCGTGTTGATGCCAGTGAAGAAAACATCCAGATGTCCAACCTGCACGAAGGTCAGAGCTTCTTCGAAATGCTGGGTGAATACATTCTGGCAGGTTTCAAAGTTGCCATTATCGTTGCcg > 1:1220994‑M2/3‑150 (MQ=255) cTTTATCGTGCTGTCGCTGATCAATCCTTACCGTGTTGATGCCAGTGAAGAAAACATCCAGATGTCCAACCTGCACGAAGGTCAGAGCTTCTTCGAAATGCTGGGTGAATACATTCTGTCAGGTTTCAAAGTTGCCATTATCGTTGCcgc < 1:1408899‑M2/149‑1 (MQ=255) | TATCCTCGGCAAAATCTCCCGTAATCGTATGTACACCATGGCTGCCACGGCAATGTCCACCGTGTCGATGTCCATCGTTGGTGCATACATGACCATGCTGGAACCGAAATACGTCGTTGCTGCGCTGGTACTGAACATGTTCAGCACCTTTATCGTGCTGTCGCTGATCAATCCTTACCGTGTTGATGCCAGTGAAGAAAACATCCAGATGTCCAACCTGCACGAAGGTCAGAGCTTCTTCGAAATGCTGGGTGAATACATTCTGGCAGGTTTCAAAGTTGCCATTATCGTTGCCGC > NC_000913/2513509‑2513805 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |