| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 2866289 | 74 (0.850) | 5 (0.060) | 5/262 | NT | 6.4% | coding (1189/1365 nt) | ygbN | putative transporter YgbN |
| ? | NC_000913 | = 2866315 | 76 (0.920) | coding (1215/1365 nt) | ygbN | putative transporter YgbN | |||||
TTATTATTTCACTGGCGCTGCGTGCATCGCAGGGGTCAGCAACCGTAGCAATACTGACAACCGGCGGGTTACTCTCAGAAGCGGTGATGGGATTGAATCCGATTCAGTGCGTATTGGTGACGCTGGCAGCCTGCTTTGGTGGGCTTGGTGCGTCACATATTAATGACTCAGGGTTCTGGATTGTGACCAAATATCTGGGGTTGTCGGTAGCAGACGGTCTGAAAACCTGGACAGTGTTAACGACCATTCTCGGTTTTACCGGATTCTTAATTACCTGGTGCGTATGGGCGGTA > NC_000913/2866167‑2866459 | ttattaTTTCACTGGCGCTGCGTGCATCGCAGGGGTCAGCAACCGTAGCAATACTGACAACCGGCGGGTTACTCTCAGAAGCGGTGATGGGATTGAATCCGATTCAGTGCGTATTGGTGACGCTGGCAGCCTGCTTTGGTGGGCTTGGTg > 2:1524271‑M2/1‑149 (MQ=255)ttattaTTTCACTGGCGCTGCGTGCATCGCAGGGGTCAGCAACCGTAGCAATACTGACAACCGGCGGGTTACTCTCAGAAGCGGCGATGGGATTGAATCCGATTCAGTGCGTATTGGTGACGCTGGCAGCCTGCTTTGGTGGGCTTGGTg > 2:385609‑M2/1‑149 (MQ=255) ttattTCACTGGCGCTGTGTGCATCGCAGGGGTCAGCAACCGTAGCAATACTGACAACCGGCGGGTTACTCTCAGAAGCGGTGATGGGATTGAATCCGATTCAGTGCGTATTGGTGACGCTGGCAGCCTGCTTTGGTGGGCTTGGTgcgt > 1:442059‑M2/1‑146 (MQ=255) ttattTCACTGGCGCTGCGTGCATCGCAGGGGTCAGCAACCGTAGCAATACTGACAACCGGCGGGTTACTCTCAGAAGCGGTGATGGGATTGAATCCGATTCAGTGCGTATTGGTGACGCTGGCAGCCTGCTTTGGTGGGCTTGGTgcgt < 1:1526890‑M2/150‑5 (MQ=255) tctttcaCTGGCGCTGCGTGCATCGCAGGGGTCAGCAACCGTAGCAATACTGACAACCGGCGGGTTACTCTCAGAAGCGGTGATGGGATTGAATCCGATTCAGTGCGTATTGGTGACGCTGGCAGCCTGCTTTGGTGGGCTTGGTgcgtc > 2:890863‑M2/3‑145 (MQ=255) tCACTGGCGCTGCGTGCATCGCAGGGGTCAGCAACCGTAGCAATACTGACAACCGGCGGGTTACTCTCAGAAGCGGTGATGGGATTGAATCCGATTCAGTGCGTATTGGTGACGCTGGCAGCCTGCTTTGGTGGGCTTGGTGCGTCACat < 2:377023/150‑1 (MQ=255) tCACTGGCGCTGCGTGCATCGCAGGGGTCAGCAACCGTAGCAATACTGACAACCGGCGGGTTACTCTCAGAAGCGGTGATGGGATTGAATCCGATTCAGTGCGTATTGGTGACGCTGGCAGCCTGCTTTGGTGGGCTTGGTGCGTCACat > 1:1331118/1‑150 (MQ=255) cTGGCGCTGCGTGCATCGCAGGGGTCAGCAACCGTAGCAATACTGACAACCGGCGGGTTACTCTCAGAAGCGGTGATGGGATTGAATCCGATTCAGTGCGTATTGGTGACGCTGGCAGCCTGCTTTGGTGGGCTTGGTGCGTCACATAtt < 1:1107492/150‑1 (MQ=255) cTGGCGCTGCGTGCATCGCAGGGGTCAGCAACCGTAGCAATACTGACAACCGGCGGGTTACTCTCAGAAGCGGTGATGGGATTGAATCCGATTCAGTGCGTATTGGTGACGCTGGCAGCCTGCTTTGGTGGGCTTGGTGCGTCACATAtt < 2:411680/150‑1 (MQ=255) cTGGCGCTGCGTGCATCGCAGGGGTCAGCAACCGTAGCAATACTGACAACCGGCGGGTTACTCTCAGAAGCGGTGATGGGATTGAATCCGATTCAGTGCGTATTGGTGACGCTGGCAGCCTGCTTTGGTGGGCTTGGTGCGTCACATAtt < 1:242161/150‑1 (MQ=255) ggCGCTGCGTGCATCGCAGGGGTCAGCAACCGTAGCAATACTGACAACCGGCGGGTTACTCTCAGAAGCGGTGATGGGATTGAATCCGATTCAGTGCGTATTGGTGACGCTGGCAGCCTGCTTTGGTGGGCTTGGTGCGTCACATATTaa < 1:377822/150‑1 (MQ=255) cgcTGCGTGCATCGCAGGGGTCAGCAACCGTAGCAATACTGACAACCGGCGGGTTACTCTCAGAAGCGGTGATGGGATTGAATCCGATTCAGTGCGTATTGGTGACGCTGGCAGCCTGCTTTGGTGGGCTTGGTGCGTCACATAtt < 1:471666/146‑1 (MQ=255) cgcTGCGTGCATCGCAGGGGTCAGCAACCGTAGCAATACTGACAACCGGCGGGTTACTCTCAGAAGCGGTGATGGGATTGAATCCGATTCAGTGCGTATTGGTGACGCTGGCAGCCTGCTTTGGTGGGCTTGGTGCGTCACATAtt > 2:471666/1‑146 (MQ=255) cTGCGTGCATCGCAGGGGTCAGCAACCGTAGCAATACTGACAACCGGCGGGTTACTCTCAGAAGCGGTGATGGGATTGAATCCGATTCAGTGCGTATTGGTGACGCTGGCAGCCTGCTTTGGTGGGCTTGGTGCGTCACATATTAATGAc < 2:1331118/150‑1 (MQ=255) cGTGCATCGCAGGGGTCAGCAACCGTAGCAATACTGACAACGGGCTGGTTACTCTCATAAGCGGTGATGGGATTGAATCCGTTTCATTGCGTATTGGTGTCGCTGGGAGCCTGCTTTGGTGGGCTTGGTGCGTCACATATTAATGACTCa < 2:623130/150‑1 (MQ=255) gTGCATCGCAGGGGTCAGCAACCGTAGCAATACTGACAACCGGCGGGTTACTCTCAGAAGCGGTGATGGGATTGAATCCGATTCAGTGCGTATTGGTGACGCTGGCAGCCTGCTTTGGTGGGCTTGGTGCGTCACATATTAATGACTCAg > 1:1497212/1‑150 (MQ=255) tGCATCGCAGGGGTCAGCAACCGTAGCAATACTGACAACCGGCGGGTTACTCTCAGAAGCGGTGATGGGATTGAATCCGATTCAGTGCGTATTGGTGACGCTGGCAGCCTGCTTTGGTGGGCTTGGTGCGTCACATATTAATGACTCAgg < 1:1223810/150‑1 (MQ=255) gCATCGCAGGGGTCAGCAACCGTAGCAATACTGACAACCGGCGGGTTACTCTCAGAAGCGGTGATGGGATTGAATCCGATTCAGTGCGTATTGGTGACGCTGGCAGCCTGCTTTGGTGGGCTTGGTGCGTCACATATTAATGACTCAggg > 2:419628/1‑150 (MQ=255) gCATCGCAGGGGTCAGCAACCGTAGCAATACTGACAACCGGCGGGTTACTCTCAGAAGCGGTGATGGGATTGAATCCGATTCAGTGCGTATTGGTGACGCTGGCAGCCTGCTTTGGTGGGCTTGGTGCGTCACATATTAATGACTCAggg < 2:1247564/150‑1 (MQ=255) cATCGCAGGGGTCAGCAACCGTAGCAATACTGACAACCGGCGGGTTACTCTCAGAAGCGGTGATGGGATTGAATCCGATTCAGTGCGTATTGGTGACGCTGGCAGCCTGCTTTGGTGGGCTTGGTGCGTCACATATTAATGACTCAGGGt < 1:1145420/150‑1 (MQ=255) aTCGCAGGGGTCAGCAACCGTAGCAATACTGACAACCGGCGGGTTACTCTCAGAAGCGGTGATGGGATTGAATCCGATTCAGTGCGTATTGGTGACGCTGGCAGCCTGCTTTGGTGGGCTTGGTGCGTCACATATTAATGACTCAGGGtt > 2:367427/1‑150 (MQ=255) gCAGGGGTCAGCAACCGTAGCAATACTGACAACCGGCGGGTTACTCTCAGAAGCGGTGATGGGATTGAATCCGATTCAGTGCGTATTGGTGACGCTGGCAGCCTGCTTTGGTGGGCTTGGTGCGTCACATATTAATGACTCAGGGTTCTg > 2:1159231/1‑150 (MQ=255) ggTCAGCAACCGTAGCAATACTGACAACCGGCGGGTTACTCTCAGAAGCGGTGATGGGATTGAATCCGATTCAGTGCGTATTGGTGACGCTGGCAGCCTGCTTTGGTGGGCTTGGTGCGTCACATATTAATGACTCAGGGTTCTGGATtg < 1:1273661/150‑1 (MQ=255) aGCAACCGTAGCAATACTGACAACCGGCGGGTTACTCTCAGAAGCGGTGATGGGATTGAATCCGATTCAGTGCGTATTGGTGACGCTGGCAGCCTGCTTTGGTGGGCTTGGTGCGTCACATATTAATGACTCAGGGTTCTGGATTGTGAc > 2:67522/1‑150 (MQ=255) gCAACCGTAGCAATACTGACAACCGGCGGGTTACTCTCAGAAGCGGTGATGGGATTGAATCCGATTCAGTGCGTATTGGTGACGCTGGCAGCCTGCTTTGGTGGGCTTGGTGCGTCACATATTAATGACTCAGGGTTCTGGATTGTGAcc < 2:681511/150‑1 (MQ=255) gCAACCGTAGCAATACTGACAACCGGCGGGTTACTCTCAGAAGCGGTGATGGGATTGAATCCGATTCAGTGCGTATTGGTGACGCTGGCAGCCTGCTTTGGTGGGCTTGGTGCGTCACATATTAATGACTCAGGGTTCTGGATTGTGAcc > 1:619344/1‑150 (MQ=255) cAACCGTAGCAATACTGACAACCGGCGGGTTACTCTCAGAAGCGGTGATGGGATTGAATCCGATTCAGTGCGTATTGGTGACGCTGGCAGCCTGCTTTGGTGGGCTTGGTGCGTCACATATTAATGACTCAGGGTTCTGGATTGTGACCa < 2:1217409/150‑1 (MQ=255) tAGCAATACTGACAACCGGCGGGTTACTCTCAGAAGCGGTGATGGGATTGAATCCGATTCAGTGCGTATTGGTGACGCTGGCAGCCTGCTTTGGTGGGCTTGGTGCGTCACATATTAATGACTCAGGGTTCTGGATTGTGACCAAATATc > 1:1145019/1‑150 (MQ=255) aaTACTGACAACCGGCGGGTTACTCTCAGAAGCGGTGATGGGATTGAATCCGATTCAGTGCGTATTGGTGACGCTGGCAGCCTGCTTTGGTGGGCTTGGTGCGTCACATATTAATGACTCAGGGTTCTGGATTGTGACCAAATATCTggg < 2:866270/150‑1 (MQ=255) tACTGACAACCGGCGGGTTACTCTCAGAAGCGGTGATGGGATTGAATCCGATTCAGTGCGTATTGGTGACGCTGGCAGCCTGCTTTGGTGGGCTTGGTgcgtcac > 2:1169105‑M2/1‑98 (MQ=255) tACTGACAACCGGCGGGTTACTCTCAGAAGCGGTGATGGGATTGAATCCGATTCAGTGCGTATTGGTGACGCTGGCAGCCTGCTTTGGTGGGCTTGGTgcgtcac < 1:1169105‑M2/105‑8 (MQ=255) tACTGACAACCGGCGGGTTACTCTCAGAAGCGGTGATGGGATTGAATCCGATTCAGTGCGTATTGGTGACGCTGGCAGCCTGCTTTGGTGGGCTTGGTGCGTCACATATTAATGACTCAGGGTTCTGGATTGTGACCAAATATCTGGGGt < 1:1238914/150‑1 (MQ=255) cTGACAACCGGCGGGTTACTCTCAGAAGCGGTGATGGGATTGAATCCGATTCAGTGCGTATTGGTGACGCTGGCAGCCTGCTTTGGTGGGCTTGGTGCGTCACATATTAATGACTCAGGGTTCTGGATTGTGACCAAATATCTGGGGTTg > 1:233069/1‑150 (MQ=255) cTGACAACCGGCGGGTTACTCTCAGAAGCGGTGATGGGATTGAATCCGATTCAGTGCGTATTGGTGACGCTGGCAGCCTGCTTTGGTGGGCTTGGTGCGTCACATATTAATGACTCAGGGTTCTGGATTGTGACCAAATATCTGGGGTTg > 2:1269897/1‑150 (MQ=255) gACAACCGGCGGGTTACTCTCAGAAGCGGTGATGGGATTGAATCCGATTCAGTGCGTATTGGTGACGCTGGCAGCCTGCTTTGGTGGGCTTGGTGCGTCACATATTAATGACTCAGGGTTCTGGATTGTGACCAAATATCTGGGGTTGTc > 1:994597/1‑150 (MQ=255) cAACCGGCGGGTTACTCTCAGAAGCGGTGATGGGATTGAATCCGATTCAGTGCGTATTGGTGACGCTGGCAGCCTGCTTTGGTGGGCTTGGTGCGTCACATATTAATGACTCAGGGTTCTGGATTGTGACCAAATATCTGGGGTTGTCgg < 1:1365608/150‑1 (MQ=255) aaCCGGCGGGTTACTCTCAGAAGCGGTGATGGGATTGAATCCGATTCAGTGCGTATTGGTGACGCTGGCAGCCTGCTTTGGTGGGCTTGGTGCGTCACATATTAATGACTCAGGGTTCTGGATTGAGACCAAATATCTGGGGTTGTCGGt > 1:189964/1‑150 (MQ=255) aCCGGCGGGTTACTCTCAGAAGCGGTGATGGGATTGAATCCGATTCAGTGCGTATTGGTGACGCTGGCAGCCTGCTTTGGTGGGCTTGGTGCGTCACATATTAATGACTCAGGGTTCTGGATTGTGACCAAATATCTGGGGTTGTCGGTa > 2:494057/1‑150 (MQ=255) aCCGGCGGGTTACTCTCAGAAGCGGTGATGGGATTGAATCCGATTCAGTGCGTATTGGTGACGCTGGCAGCCTGCTTTGGTGGGCTTGGTGCGTCACATATTAATGACTCAGGGTTCTGGATTGTGACCAAATATCTGGGGTTGTCGGTa < 2:85491/150‑1 (MQ=255) 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aGCCTGCTTTGGTGGGCTTGGTGCGTCACATATTAATGACTCAGGGTTCTGGATTGTGACCAAATATCTGGGGTTGTCGGTAGCAGACGGTCTGAAAACCTGGACAGTGTTAACGACCATTCTCGGTTTTACCGGATTCTTAATTACCTg > 2:933746/1‑150 (MQ=255) gCCTGCTTTGGTGGGCTTGGTGCGTCACATATTAATGACTCAGGGTTCTGGATTGTGACCAAATATCTGGGGTTGTCGGTAGCAGACGGTCTGAAAACCTGGACAGTGTTAACGACCATTCTCGGTTTTACCGGATTCTTAATTACCTgg < 1:933746/150‑1 (MQ=255) ccTGCTTTGGTGGGCTTGGTGCGTCACATATTAATGACTCAGGGTTCTGGATTGTGACCAAATATCTGGGGTTGTCGGTAGCAGACGGTCTGAAAACCTGGACAGTGTTAACGACCATTCTCGGTTTTACCGGATTCTTAATTACCTGGt > 1:1253426/1‑150 (MQ=255) cTGCTTTGGTGGGCTTGGTGCGTCACATATTAATGACTCAGGGTTCTGGATTGTGACCAAATATCTGGGGTTGTCGGTAGCAGACGGTCTGAAAACCTGGACAGTGTTAACGACCATTCTCGGTTTTACCGGATTCTTATTTACATGGTg > 2:768895/1‑150 (MQ=255) tGCTTTGGTGGGCTTGGTGCGTCACATATTAATGACTCAGGGTTCTGGATTGTGACCAAATATCTGGGGTTGTCGGTAGCAGACGGTCTGAAAACCTGGACAGTGTTAACGACCATTCTCGGTTTTACCg < 1:353279/130‑1 (MQ=255) tGCTTTGGTGGGCTTGGTGCGTCACATATTAATGACTCAGGGTTCTGGATTGTGACCAAATATCTGGGGTTGTCGGTAGCAGACGGTCTGAAAACCTGGACAGTGTTAACGACCATTCTCGGTTTTACCg < 1:353282/130‑1 (MQ=255) tGCTTTGGTGGGCTTGGTGCGTCACATATTAATGACTCAGGGTTCTGGATTGTGACCAAATATCTGGGGTTGTCGGTAGCAGACGGTCTGAAAACCTGGACAGTGTTAACGACCATTCTCGGTTTTACCg > 2:353282/1‑130 (MQ=255) tGCTTTGGTGGGCTTGGTGCGTCACATATTAATGACTCAGGGTTCTGGATTGTGACCAAATATCTGGGGTTGTCGGTAGCAGACGGTCTGAAAACCTGGACAGTGTTAACGACCATTCTCGGTTTTACCg > 2:353279/1‑130 (MQ=255) tGCTTTGGTGGGCTTGGTGCGTCACATATTAATGACTCAGGGTTCTGGATTGTGACCAAATATCTGGGGTTGTCGGTAGCAGACGGTCTGAAAACCTGGACAGTGTTAACGACCATTCTCGGTTTTACCGGATTCTTAATTACCTGGTGc > 1:1099945/1‑150 (MQ=255) gCTTTGGTGGGCTTGGTGCGTCACATATTAATGACTCAGGGTTCTGGATTGTGACCAAATATCTGGGGTTGTCGGTAGCAGACGGTCTGAAAACCTGGACAGTGTTAACGACCATTCTCGGTTTTACAGGATTCTTAATTACAAGGTGCg > 1:647578/1‑150 (MQ=255) gCTTTGGTGGGCTTGGGGCGTCACATATTAATGACTCAGGGTTCTGGATTGTGACCAAATATCTGGGGTTGTCGGTAGCAGACGGTCTGAAAACCTGGACAGTGTTAACGACCATTCTCGGTTTTACCGGATTCTTAATTACCTGGTGCg < 2:1526348/150‑1 (MQ=255) cTTTGGTGGGCTTGGTGCGTCACATATTAATGACTCAGGGTTCTGGATTGTGACCAAATATCTGGGGTTGTCGGTAGCAGACGGTCTGAAAACCTGGACAGTGTTAACGACCATTCTCGGTTTTACCGGATTCTTAATTACCTGGTGCGt > 2:95806/1‑150 (MQ=255) ttGGTGGGCTTGGTGCGTCACATATTAATGACTCAGGGTTCTGGATTGTGACCAAATATCTGGGGTTGTCGGTAGCAGACGGTCTGAAAACCTGGACAGTGTTAACGACCATTCTCGGTTTTACCGGATTCTTAATTACCTGGTGCGTAt > 1:596102/1‑150 (MQ=255) cTTGGTGCGTCACATATTAATGACTCAGGGTTCTGGATTGTGACCAAATATCTGGGGTTGTCGGTAGCAGACGGTCTGAAAACCTGGACAGTGTTAACGACCATTCTCGGTTTTACCGGATTCTTAATTACCTGGTGCGTATGGGCGGTa < 2:596102/150‑1 (MQ=255) cTTGGTGCGTCACATATTAATGACTCAGGGTTCTGGATTGTGACCAAATATCTGGGGTTGTCGGTAGCAGACGGTCTGAAAACCTGGACAGTGTTAACGACCATTCTCGGTTTTACCGGATTCTTAATTACCTGGTGCGTATGGGCGGTa > 2:1338089/1‑150 (MQ=255) cTTGGTGCGTCACATATTAATGACTCAGGGTTCTGGATTGTGACCAAATATCTGGGGTTGTCGGTAGCAGACGGTCTGAAAACCTGGACAGTGTTAACGACCATTCTCGGTTTTACCGGATTCTTAATTACCTGGTGCGTATGGGCGGTa < 1:808014/150‑1 (MQ=255) | TTATTATTTCACTGGCGCTGCGTGCATCGCAGGGGTCAGCAACCGTAGCAATACTGACAACCGGCGGGTTACTCTCAGAAGCGGTGATGGGATTGAATCCGATTCAGTGCGTATTGGTGACGCTGGCAGCCTGCTTTGGTGGGCTTGGTGCGTCACATATTAATGACTCAGGGTTCTGGATTGTGACCAAATATCTGGGGTTGTCGGTAGCAGACGGTCTGAAAACCTGGACAGTGTTAACGACCATTCTCGGTTTTACCGGATTCTTAATTACCTGGTGCGTATGGGCGGTA > NC_000913/2866167‑2866459 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |