| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | ? | NC_000913 | 3173706 = | 105 (1.200) | 5 (0.060) | 3/258 | NT | 5.0% | coding (1691/1893 nt) | parE | DNA topoisomerase IV subunit B |
| ? | NC_000913 | 3173747 = | 91 (1.110) | coding (1650/1893 nt) | parE | DNA topoisomerase IV subunit B | |||||
Only 100 of 122 total aligned reads displayed.
TCAGTACGCTGATCGTCTTCATCATCGATAGTCAACTGCACCAGACGGCGAGTGTTCGGATCAAGCGTGGTTTCGCGCAATTGCATCGGGTTCATTTCCCCCAGACCTTTAAAACGCTGGACGTTCGGCTTGCCTTTCTTGCGTTTTAATTGCTCAAGTACGCCCTCTTTCTCTTCTTCCGTCAGCGCGTAATAAACCTCTTTCCCGAGATCAATACGGTAGAGCGGTGGCAGTGCGACGTAAACGTGACCGTGTTTCACCAACGCGCGGAAATGTTTTACGAACAAAGCGCAGAG > NC_000913/3173598‑3173893 | tCAGTACGCTGATCGTCTTCATCATCGATAGTCAACTGCACCAGACGGCGAGTGTTCGGATCAAGCGTGGTTTCGCGCAATTGCATCGGGTTCATTTCCCCCAGACCTTTAAAACGCTGGACGTTCGGCTTGCCTTTCTTGCGTTTTAAt < 2:1403689/150‑1 (MQ=255)aaacacggtcacgtttacgtcgcactgccaccgctctaccgtattgatctcgggaaagaggtttattacgcgctgacggaagaagagaaagagggcgtacttgagcaaTTAAAACGCTGGACGTGCGGCTTGCCTTTCTTGCGTTTTAAt > 1:1055228‑M1/109‑150 (MQ=255) gTACGCTGATCGTCTTCATCATCGATAGTCAACTGCACCAGACGGCGAGTGTTCGGATCAAGCGTGGTTTCGCGCAATTGCATCGGGTTCATTTCCCCCTGACCTTTAAAACGCTGGACGTTCGGCTTGCCTTTCTTGCGTTTTAATTGc < 1:924041/150‑1 (MQ=255) gTACGCTGATCGTCTTCATCATCGATAGTCAACTGCACCAGACGGCGAGTGTTCGGATCAAGCGTGGTTTCGCGCAATTGCATCGGGTTCATTTCCCCCAGACCTTTAAAACGCTGGACGTTCGGCTTGCCTTTCTTGCGTTTTAATTGc < 2:1381640/150‑1 (MQ=255) gTACGCTGATCGTCTTCATCATCGATAGTCAACTGCACCAGACGGCGAGTGTTCGGATCAAGCGTGGTTTCGCGCAATTGCATCGGGTTCATTTCCCCCAGACCTTTAAAACGCTGGACGTTCGGCTTGCCTTTCTTGCGTTTTAATTGc > 1:1029676/1‑150 (MQ=255) cacggtcacgtttacgtcgcactgccaccgctctaccgtattgatctcgggaaagaggtttattacgcgctgacggaagaagagaaagagggcgtacttgagcaaTTAAAACGCTGGACGTTCGGCTTGCCTTTCTTGCGTTTTAATTGc > 1:708597‑M1/106‑150 (MQ=255) cacggtcacgtttacgtcgcactgccaccgctctaccgtattgatctcgggaaagaggtttattacgcgctgacggaagaagagaaagagggcgtacttgagcaaTTAAAACGCTGGACGTTCGGCTTGCCTTTCTTGCGTTTTAATTGc > 1:1535486‑M1/106‑150 (MQ=255) cGCTGATCGTCTTCATCATCGATAGTCAACTGCACCAGACGGCGAGTGTTCGGATCAATCGTGGTTTCGCGCAATTGCATCGGGTTCATTTCCCCCAGACCTTTAAAACGCTGGACGTTCGGCTTGCCTTTCTTGCGTTTTAATTGCTCa < 2:11228/150‑1 (MQ=255) gTCTTCATCATCGATAGTCAACTGCACCAGACGGCGAGTGTTCGGATCAAGCGTGGTTTCGCGCAATTGCATCGGGTTCATTTCCCCCAGACCTTTAAAACGCTGGACGTTCGGCTTGCCTTTCTTGCGTTTTAATTGCTCAAGTACGcc < 2:196070/150‑1 (MQ=255) cTTCATCATCGATAGTCAACTGCACCAGACGGCGAGTGTTCGGATCAAGCGTGGTTTCGCGCAATTGCATCGGGTTCATTTCCCCCAGACCTTTAAAACGCTGGACGTTCGGCTTGCCTTTCTTGCGTTTTAATTGCTCAAGTACGcccg > 2:1407038/1‑149 (MQ=255) cTTCATCATCGATAGTCAACTGCACCAGACGGCGAGTGTTCGGATCAAGCGTGGTTTCGCGCAATTGCATCGGGTTCATTTCCCCCAGACCTTTAAAACGCTGGACGTTCGGCTTGCCTTTCTTGCGTTTTAATTGCTCAAGTACGCCct < 1:451392/150‑1 (MQ=255) tcatcaTCGATAGTCAACTGCACCAGACGGCGAGTGTTCGGATCAAGCGTGGTTTCGCGCAATTGCATCGGGTTCATTTCCCCCAGACCTTTAAAACGCTGGACGTTCGGCTTGCCTTTCTTGCGTTTTAATTGCTCAAGTACGCCctct > 1:403841/1‑150 (MQ=255) tcatcaTCGATAGTCAACTGCACCAGACGGCGAGTGTTCGGATCAAGCGTGGTTTCGCGCAATTGCATCGGGTTCATTTCCCCCAGACCTTTAAAACGCTGGACGTTCGGCTTGCCTTTCTTGCGTTTTAATTGCTCAAGTACGCCctct < 1:950004/150‑1 (MQ=255) catcatCGATAGTCAACTGCACCAGACGGCGAGTGTTCGGATCAAGCGTGGTTTCGCGCAATTGCATCGGGTTCATTTCCCCCAGACCTTTAAAACGCTGGACGTTCGGCTTGCCTTTCTTGCGTTTTAATTGCTCAAGTACGCCCTCtt < 2:727557/150‑1 (MQ=255) catcatCGATAGTCAACTGCACCAGACGGCGAGTGTTCGGATCAAGCGTGGTTTCGCGCAATTGCATCGGGTTCATTTCCCCCAGACCTTTAAAACGCTGGACGTTCGGCTTGCCTTTCTTGCGTTTTAATTGCTCAAGTACGCCCTCtt > 2:1506286/1‑150 (MQ=255) catcatCGATAGTCAACTGCACCAGACGGCGAGTGTTCGGATCAAGCGTGGTTTCGCGCAATTGCATCGGGTTCATTTCCCCCAGACCTTTAAAACGCTGGACGTTCGGCTTGCCTTTCTTGCGTTTTAATTGCTCAAGTACGCCCTCtt > 2:668951/1‑150 (MQ=255) catcatCGATAGTCAACTGCACCAGACGGCGAGTGTTCGGATCAAGCGTGGTTTCGCGCAATTGCATCGGGTTCATTTCCCCCAGACCTTTAAAACGCTGGACGTTCGGCTTGCCTTTCTTGCGTTTTAATTGCTCAAGTACGCCCTCtt > 2:1096788/1‑150 (MQ=255) tcatcGATAGTCAACTGCACCAGACGGCGAGTGTTCGGATCAAGCGTGGTTTCGCGCAATTGCATCGGGTTCATTTCCCCCAGACCTTTAAAACGCTGGACGTTCGGCTTGCCTTTCTTGCGTTTTAATTGCTCAAGTACGCCCTCTTtc < 2:749331/150‑1 (MQ=255) 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gTCAACTGCACCAGACGGCGAGTGTTCGGATCAAGCGTGGTTTCGCGCAATTGCATCGGGTTCATTTCCCCCAGACCTTTAAAACGCTGGACGTTCGGCTTGCCTTTCTTGCGTTTTAATTGCTCAAGTACGCCCTCTTTCTCTTCTTcc < 1:816628/150‑1 (MQ=255) tCAACTGCACCAGACGGCGAGTGTTCGTATCAAGCGTGGTTTCGCGCAATTGCATCGGGTTCATTTCCCCCAGACCTTTAAAACGCTGGACGTTCGGCTTGCCTTTCTTGCGTTTTAATTGCTCAAGTACGCCCTCTTTCTCTTCTTCCg < 1:845238/150‑1 (MQ=255) cAACTGCACCAGACGGCGAGTGTTCGGATCAAGCGTGGTTTCGCGCAATTGCATCGGGTTCATTTCCCCCAGACCTTTAAAACGCTGGACGTTCGGCTTGCCTTTCTTGCGTTTTAATTGCTCAAGTACGCCCTCTTTCTCTTCTTCCGt > 2:540443/1‑150 (MQ=255) cTGCACCAGACGGCGAGTGTTCGGATCAAGCGTGGTTTCGCGCAATTGCATCGGGTTCATTTCCCCCAGACCTTTAAAACGCTGGACGTTCGGCTTGCCTTTCTTGCGTTTTAATTGCTCAAGTACGCCCTCTTTCTCTTCTTCCGTCAg < 2:1202840/150‑1 (MQ=255) gCACCAGACGGCGAGTGTTCGGATCAAGCGTGGTTTCGCGCAATTGCATCGGGTTCATTTCCCCCAGACCTTTAAAACGCTGGACGTTCGGCTTGCCTTTCTTGCGTTTTAATTGCTCAAGTACGCCCTCTTTCTCTTCTTCCGTCAgcg < 1:373015/150‑1 (MQ=255) 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attaaaacgcaagaaaggcaagccgcacgtccagcgttttaaTTGCTCAAGTACGCCCTCTTTCTCTTCTTCCGTCAGCGCGTAATAAACCTCTTTCCCGAGATCAATACGGTAGAGCGGTGGCAGTGCGACGTAAACGTGACCGTGttt > 1:1055228‑M2/43‑150 (MQ=255) TTAAAACGCTGGACGTTCGGCTTGCCTTTCTTGCGTTTTAATTGCTCAAGTACGCCCTCTTTCTCTTCTTCCGTCAGCGCGTAATAAACCTCTTTCCCGAGATCAATACGGTAGAGCGGTGGCAGTGCGACGTAAACGTGACCGTGTTTc > 1:510428‑M1/1‑150 (MQ=255) TTAAAACGCTGGACGTTCGGCTTGCCTTTCTTGCGTTTTAATTGCTCAAGTACGCCCTCTTTCTCTTCTTCCGTCAGCGCGTAATAAACCTCTTTCCCGAGATCAATACGGTAGAGCGGTGGCAGTGCGACGTAAACGTGACCGTGTTTc < 1:742727‑M1/150‑1 (MQ=255) TAAAACGCTGGACGTTCGGCTTGCCTTTCTTGCGTTTTAATTGCTCAAGTACGCCCTCTTTCTCTTCTTCCGTCAGCGCGTAATAAACCTCTTTCCCGAGATCAATACGGTAGAGCGGTGGCAGTGCGACGTAAACGTGACCGTGTTTCa < 2:374771‑M1/150‑1 (MQ=255) AAACGCTGGACGTTCGGCTTGCCTTTCTTGCGTTTTAATTGCTCAAGTACGCCCTCTTTCTCTTCTTCCGTCAGCGCGTAATAAACCTCTTTCCCGAGATCAATACGGTAGAGCGGTGGCAGTGCGACGTAAACGTGACCGTGTTTCAcc < 2:626124‑M1/150‑1 (MQ=255) AACGCTGGACGTTCGGCTTGCCTTTCTTGCGTTTTAATTGCTCAAGTACGCCCTCTTTCTCTTCTTCCGTCAGCTCTTAATAAAGCTCTTTCCCGAGATCAATACGGTAGAGCGGTGGCAGTGCGACGTAAACGTGACCGTGTTTCACCa > 2:1194108‑M1/1‑150 (MQ=255) CGCTGGACGTTCGGCTTGCCTTTCTTGCGTTTTAATTGCTCAAGTACGCCCTCTTTCTCTTCTTCCGTCAGCGCGTAATAAACCTCTTTCCCGAGATCAATACGGTAGAGCGGTGGCAGTGCGACGTAAACGTGACCGTGTTTCACCAAc < 1:111287‑M1/150‑1 (MQ=255) GCTGGACGTTCGGCTTGCCTTTCTTGCGTTTTAATTGCTCAAGTACGCCCTCTTTCTCTTCTTCCGTCAGCGCGTAATAAACCTCTTTCCCGAGATCAATACGGTAGAGCGGTGGCAGTGCGACGTAAACGTGACCGTGTTTCACCAAcg < 1:145476‑M1/150‑1 (MQ=255) gACGTTCGGCTTGCCTTTCTTGCGTTTTAATTGCTCAAGTACGCCCTCTTTCTCTTCTTCCGTCAGCGCGTAATAAACCTCTTTCCCGAGATCAATACGGTAGAGCGGTGGCAGTGCGACGTAAACGTGACCGTGTTTCACCAAcgcgcg < 1:947163/150‑1 (MQ=255) aCGTTCGGCTTGCCTTTCTTGCGTTTTAATTGCTCAAGTACGCCCTCTTTCTCTTCTTCCGTCAGCGCGTAATAAACCTCTTTCCCGAGATCAATACGGTAGAGCGGTGGCAGTGCGACGTAAACGTGACCGTGTTTCACCAACGCGCgg < 1:1163577/150‑1 (MQ=255) gCCTTTCTTGCGTTTTAATTGCTCAAGTACGCCCTCTTTCTCTTCTTCCGTCAGCGCGTAATAAACCTCTTTCCCGAGATCAATACGGTAGAGCGGTGGCAGTGCGACGTAAACGTGACCGTGTTTCACCAACGCGCGGAAATGTTTTAc < 1:1268304/150‑1 (MQ=255) ccTTTCTTGCGTTTTAATTGCTCAAGTACGCCCTCTTTCTCTTCTTCCGTTAGTGCGTAATAAACCTCTTTCCCGAGATCAATACGGTAGAGCGGTGGCAGTGCGACGTAAACGTGACCGTGTTTCACCAACGCGCGGAAATGTTTTACg < 2:403841/150‑1 (MQ=255) cTTTCTTGCGTTTTAATTGCTCAAGTACGCCCTCTTTCTCTTCTTCCGTCAGCGCGTAATAAACCTCTTTCCCGAGATCAATACGGTAGAGCGGTGGCAGTGCGACGTAAACGTGACCGTGTTTCACCAACGCGCGGAAATGTTTTACGa < 1:1253903/150‑1 (MQ=255) cTTTCTTGCGTTTTAATTGCTCAAGTACGCCCTCTTTCTCTTCTTCCGTCAGCGCGTAATAAACCTCTTTCCCGAGATCAATACGGTAGAGCGGTGGCAGTGCGACGTAAACGTGACCGTGTTTCACCAACGCGCGGAAATGTTTTACGa < 2:838787/150‑1 (MQ=255) cTTTCTTGCGTTTTAATTGCTCAAGTACGCCCTCTTTCTCTTCTTCCGTCAGCGCGTAATAAACCTCTTTCCCGAGATCAATACGGTAGAGCGGTGGCAGTGCGACGTAAACGTGACCGTGTTTCACCAACGCGCGGAAATGTTTTACGa < 2:93274/150‑1 (MQ=255) ttCTTGCGTTTTAATTGCTGAAGTACGCCCTCTTTCTCTTCTTCCGTCAGCGCGTAATAAACCTCTTTCCCGAGATCAATACGGTAGAGCGGTGGCAGTGCGACGTAAACGTGACCGTGTTTCACCAACGCGCGGAAATGTTTTACGAAc < 2:1180220/150‑1 (MQ=255) cTTGCGTTTTAATTGCTCAAGTACGCCCTCTTTCTCTTCTTCCGTCAGCGCGTAATAAACCTCTTTCCCGAGATCAATACGGTAGAGCGGTGGCAGTGCGACGTAAACGTGACCGTGTTTCACCAACGCGCGGAAATGTTTTACGAACaa > 1:1536378/1‑150 (MQ=255) tGCGTTTTAATTGCTCAAGTACGCCCTCTTTCTCTTCTTCCGTCAGCGCGTAATAAACCTCTTTCCCGAGATCAATACGGTAGAGCGGTGGCAGTGCGACGTAAACGTGACCGTGTTTCACCAACGCGCGGAAATGTTTTACGAACAAAg < 1:1167306/150‑1 (MQ=255) gcgttttaaTTGCTCAAGTACGCCCTCTTTCTCTTCTTCCGTCAGCGCGTAATAAACCTCTTTCCCGAGATCAATACGGTAGAGCGGTGGCAGTGCGACGTAAACGTGACCGTGTTTCACCAACGCGCGGAAATGTTTTACGAACAAAgc < 2:1136713‑M2/141‑1 (MQ=255) tttaaTTGCTCAAGTACGCCCTCTTTCTCTTCTTCCGTCAGCGCGTAATAAACCTCTTTCCCGAGATCAATACGGTAGAGCGGTGGCAGTGCGACGTAAACGTGACCGTGTTTCACCAACGCGCGGAAATGTTTTACGAACAAAGCGCag < 1:626124‑M2/145‑1 (MQ=255) tttaaTTGCTCAAGTACGCCCTCTTTCTCTTCTTCCGTCAGCGCGTAATAAACCTCTTTCCCGAGATCAATACGGTAGAGCGGTGGCAGTGCGACGTAAACGTGACCGTGTTTCACCAACGCGCGGAAATGTTTTACGAACAAAGCGCag > 1:361436‑M2/6‑150 (MQ=255) taaTTGCTCAAGTACGCCCTCTTTCTCTTCTTCCGTCAGCGCGTAATAAACCTCTTTCCCGAGATCAATACGGTAGAGCGGTGGCAGTGCGACGTAAACGTGACCGTGTTTCACCAACGCGCGGAAATGTTTTACGAACAAAGCGCagag > 1:1257358‑M2/4‑150 (MQ=255) | TCAGTACGCTGATCGTCTTCATCATCGATAGTCAACTGCACCAGACGGCGAGTGTTCGGATCAAGCGTGGTTTCGCGCAATTGCATCGGGTTCATTTCCCCCAGACCTTTAAAACGCTGGACGTTCGGCTTGCCTTTCTTGCGTTTTAATTGCTCAAGTACGCCCTCTTTCTCTTCTTCCGTCAGCGCGTAATAAACCTCTTTCCCGAGATCAATACGGTAGAGCGGTGGCAGTGCGACGTAAACGTGACCGTGTTTCACCAACGCGCGGAAATGTTTTACGAACAAAGCGCAGAG > NC_000913/3173598‑3173893 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |