| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 3400186 = | 74 (0.850) | 9 (0.110) | 8/270 | NT | 11.4% | coding (902/1044 nt) | mreB | dynamic cytoskeletal protein MreB |
| ? | NC_000913 | 3400224 = | 68 (0.800) | coding (864/1044 nt) | mreB | dynamic cytoskeletal protein MreB | |||||
TGTCGATCATTTCCAGCGCTTTGCCGCCACCGCGCGCCACACAGGTCAGCGGGTCTTCAGCAACAACGACTGGAATGCCGGTTTCTTCCATTAACAAACGGTCAAGGTTACGCAGCAGTGCGCCACCACCGGTGAGCACCATGCCGCGCTCGGAGATGTCGGAAGCCAGTTCCGGCGGGCACTGTTCCAGTGCAACCATTACCGCGCTCACAATACCGGTCAGCGGTTCCTGCAGTGCTTCGAGGATTTCATTGGAGTTCAGGGTAAAACCGCGTGGAACACCTTCTGCCAGGT > NC_000913/3400076‑3400369 | actccaatgaaatcctcgaagcactgcaggaaccgctgagcggtattgtgagcgcggtaatggttgcactggatcagtgcccgccggatctggcttccgacatctccgagCGCAGCAGTGCGCCACCACCGGTGAGCACCATGCCGCGCt > 2:424877‑M1/111‑150 (MQ=255) gATCATTTCCAGCGCTTTGCCGCCACCGCGCGCCACACAGGTCAGCGGGTCTTCAGCAACAACGACTGGAATGCCGGTTTCTTCCATTAACAAACGGTCAAGGTTACGCAGCAGTGCGCCACCACCGGTGCGCACCATGCCGCGCTCGga > 1:542270/1‑150 (MQ=255) gATCATTTCCAGCGCTTTGCCGCCACCGCGCGCCACACAGGTCAGCGGGTCTTCAGCAACAACGACTGGAATGCCGGTTTCTTCCATTAACAAACGGTCAAGGTTACGCAGCAGTGCGCCACCACCGGTGAGCACCATGCCGCGCTCGga > 2:713748/1‑150 (MQ=255) caatgaaatcctcgaagcactgcaggaaccgctgaccggtattgtgagcgcggtaatggttgcactggaacagtgcccgccggaactggcttccgacatctccgagCGCAGCAGTGCGCCACCACCGGTGAGCACCATGCCGCGCTCgg < 2:973200‑M1/43‑1 (MQ=255) caatgaaatcctcgaagcactgcaggaaccgctgaccggtattgtgagcgcggtaatggttgcactggaacagtgcccgccggaactggcttccgacatctccgagCGCAGCAGTGCGCCACCACCGGTGAGCACCATGCCGCGCTCgg > 1:973200‑M1/107‑149 (MQ=255) aTCATTTCCAGCGCTTTGCCGCCACCTCGCGCCACACAGGTCAGCTGGTCTTCAGCAACAACGACTGGAATGCCGGTTTCTTCCATTAACAAACGGTCAAGGTTACGCAGCAGTGCGCCACCACCGGTGAGCACCATGCCGCGCTCGgag < 2:434661/150‑1 (MQ=255) tCATTTCCAGCGCTTTGCCGCCACCGCGCGCCACACAGGTCAGCGGGTCTTCAGCAACAACGACTGGAATGCCGGTTTCTTCCATTAACAAACGGTCAAGGTTACGCAGCAGTGCGCCACCACCGGTGAGCACCATGCCGCGCTCGgaga < 1:598040/150‑1 (MQ=255) ccAGCGCTTTGCCGCCACCGCGCGCCACACAGGTCAGCGGGTCTTCAGCAACAACGACTGGAATGCCGGTTTCTTCCATTAACAAACGGTCAAGGTTACGCAGCAGTGCGCCACCACCGGTGAGCACCTTGCCGCGCTCGGAGATGTCgg > 1:342779/1‑150 (MQ=255) cctcgaagcactgcaggaaccgctgaccggtattgtgagcgcggtaatggttgcactggaacagtgcccgccggaactggcttccgacatctccgagCGCAGCAGTGCGCCACCACCGGTGAGCACCATGCCGCGCTCgg < 1:435878‑M1/43‑1 (MQ=255) cctcgaagcactgcaggaaccgctgaccggtattgtgagcgcggtaatggttgcactggaacagtgcccgccggaactggcttccgacatctccgagCGCAGCAGTGCGCCACCACCGGTGAGCACCATGCCGCGCTCgg > 2:435878‑M1/98‑140 (MQ=255) cAGCGCTTTGCCGCCACCGCGCGCCACACAGGTCAGCGGGTCTTCAGCAACAACGACTGGAATGCCGGTTTCTTCCATTAACAAACGGTCAAGGTTACGCAGCAGTGCGCCACCACCGGTGAGCACCATGCCGCGCTCGGAGATGTCGGa < 2:1351759/150‑1 (MQ=255) tcgaagcactgcaggaaccgctgaccggtattgtgagcgcggtaatggttgcactggaacagtgcccgccggaactggcttccgacatctccgagCGCAGCAGTGCGCCACCACCGGTGAGCACCATGCCGCGCTCGGAGATGTCGGAAg > 1:324406‑M1/96‑150 (MQ=255) gcgcTTTGCCGCCACCGCGCGCCACACAGGTCAGCGGGTCTTCAGCAACAACGACTGGAATGCCGGTTTCTTCCATTAACAAACGGTCAAGGTTACGCAGCAGTGCGCCACCACCGGTGAGCACCATGCCGCGCTCGGAGATGTCGGAAg < 2:1314679/150‑1 (MQ=255) gcgcTTTGCCGCCACCGCGCGCCACACAGGTCAGCGGGTCTTCAGCAACAACGACTGGAATGCCGGTTTCTTCCATTAACAAACGGTCAAGGTTACGCAGCAGTGCGCCACCACCGGTGAGCACCATGCCGCGCTCGGAGATGTCGGAAg < 2:516090/150‑1 (MQ=255) cTTTGCCGCCACCGCGCGCCACACAGGTCAGCGGGTCTTCAGCAACAACGACTGGAATGCCGGTTTCTTCCATTAACAAACGGTCAAGGTTACGCAGCAGTGCGCCACCACCGGTGAGCACCATGCCGCGCTCGGAGATGTCGGAAGCCa < 1:1294711/150‑1 (MQ=255) gccgccACAGCGCGCCACACACGTCAGCGGGTCTTCAGCAACAACGAATGGAATGACGGTATCATCCATTAACAAACGGTCAACGTTACGCAGCAGTGCGCCACCACCGGAAACCACCATGCCGCGCTCGGAGATGTCGGAAGCCAGTTc > 2:1002274/1‑150 (MQ=255) cgccACCGCGCGCCACACAGGTCAGCGGGTCTTCAGCAACAACGACTGGAATGCCGGTTTCTTCCATTAACAAACGGTCAAGGTTACGCAGCAGTGCGCCACCACCGGTGAGCACCATGCCGCGCTCGGAGATGTCGGAAGCCAGTTCcg > 2:1276905/1‑150 (MQ=255) gccACCGCGCGCCACACAGGTCAGCGGGTCTTCAGCAACAACGACTGGAATGCCGGTTTCTTCCATTAACAAACGGTCAAGGTTACGCAGCAGTGCGCCACCACCGGTGAGCACCATGCCGCGCTCGGAGATGTCGGAAGCCAGTTCcgg < 2:1120717/150‑1 (MQ=255) 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tgAATGCCGGTTTCTTCCATTAACAAACGGTCAAGGTTACGCAGCAGTGCGACACCACCGGTGAGCACCATGCCGCGCTCGGAGATGTCGGAAGCCAGTTCCGGCGGGCACTGTTCCAGTGCAACCATTACCGCGCTCACAATACCGGTc < 2:1141922/149‑1 (MQ=255) aaTGCCGGTTTCTTCCATTAACAAACGGTCAAGGTTACGCAGCAGTGCGCCACCACCGGTGAGCACCATGCCGCGCTCGGAGATGTCGGAAGCCAGTTCCGGCGGGCACTGTTCCAGTGCAACCATTACCGCGCTCACAATACCGGTCAg > 2:730198/1‑150 (MQ=255) gCCGGTTTCTTCCATTAACAAACGGTCAAGGTTACGCAGCAGTGCGCCACCACCGGTGAGCACCATGCCGCGCTCGGAGATGTCGGAAGCCAGTTCCGGCGGGCACTGTTCCAGTGCAACCATTACCGCGCTCACAATACCGGTCAGCgg > 1:1073532/1‑150 (MQ=255) gCCGGTTTCTTCCATTAACAAACGGTCAAGGTTACGCAGCAGTGCGCCACCACCGGTGAGCACCATGCCGCGCTCGGAGATGTCGGAAGCCAGTTCCGGCGGGCACTGTTCCAGTGCAACCATTACCGCGCTCACAATACCGGTCAGCgg > 1:824239/1‑150 (MQ=255) ccGGTTTCTTCCATTAACAAACGGTCAAGGTTACGCAGCAGTGCGCCACCACCGGTGAGCACCATGCCGCGCTCGGAGATGTCGGAAGCCAGTTCCGGCGGGCACTGTTCCAGTGCAACCATTACCGCGCTCACAATACCGGTCAGCGGt > 1:110823/1‑150 (MQ=255) 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cAAACGGTCAAGGTTACGCAGCAGTGCGCCACCACCGGTGAGCACCATGCCGCGCTCGGAGATGTCGGAAGCCAGTTCCGGCGGGCACTGTTCCAGTGCAACCATTACCGCGCTCACAATACCGGTCAGCGGTTCCTGCAGTGCTTCGAg < 2:941075/150‑1 (MQ=255) aaaCGGTCAAGGTTACGCAGCAGTGCGCCACCACCGGTGAGCACCATGCCGCGCTCGGAGATGTCGGAAGCCAGTTCCGGCGGGCACTGTTCCAGTGCAACCATTACCGCGCTCACAATACCGGTCAGCGGTTCCTGCAGTGCTTCGAgg < 1:792241/150‑1 (MQ=255) aaaCGGTCAAGGTTACGCAGCAGTGCGCCACCACCGGTGAGCACCATGCCGCGCTCGGAGATGTCGGAAGCCAGTTCCGGCGGGCACTGTTCCAGTGCAACCATTACCGCGCTCACAATACCGGTCAGCGGTTCCTGCAGTGCTTCGAgg < 1:189819/150‑1 (MQ=255) ggTCAAGGTTACGCAGCAGTGCGCCACCACCGGTGAGCACCATGCCGCGCTCGGAGATGTCGGAAGCCAGTTCCGGCGGGCACTGTTCCAGTGCAACCATTACCGCGCTCACAATACCGGTCAGCGGTTCCTGCAGTGCTTCGAGGAttt > 1:930259/1‑150 (MQ=255) gTCAAGGTTACGCAGCAGTGCGCCACCACCGGTGAGCACCATGCCGCGCTCGGAGATGTCGGAAGCCAGTTCCGGCGGGCACTGTTCCAGTGCAACCATTACCGCGCTCACAATACCGGTCAGCGGTTCCTGCAGTGCTTCGAGGATTTc > 1:1352389/1‑150 (MQ=255) gTCAAGGTTACGCAGCAGTGCGCCACCACCGGTGAGCACCATGCCGCGCTCGGAGATGTCGGAAGCCAGTTCCGGCGGGCACTGTTCCAGTGCAACCATTACCGCGCTCACAATACCGGTCAGCGGTTCCTGCAGTGCTTCGAGGATTTc < 1:831379/150‑1 (MQ=255) cAAGGTTACGCAGCAGTGCGCCACCACCGGTGAGCACCATGCCGCGCTCGGAGATGTCGGAAGCCAGTTCCGGCGGGCACTGTTCCAGTGCAACCATTACCGCGCTCACAATACCGGTCAGCGGTTCCTGCAGTGCTTCGAGGATTTCAt < 1:1386582/150‑1 (MQ=255) aGGTTACGCAGCAGTGCGCCACCACCGGTGAGCACCATGCCGCGCTCGGAGATGTCGGAAGCCAGTTCCGGCGGGCACTGTTCCTGTGGAACGATTACCGCGCTCACAATACCGTTCAGCGGTTCCTGCAGTGCTTCGAGGATTTCATTg < 2:319558/150‑1 (MQ=255) aGGTTACGCAGCAGTGCGCCACCACCGGTGAGCACCATGCCGCGCTCGGAGATGTCGGAAGCCAGTTCCGGCGGGCACTGTTCCAGTGCAACCATTACCGCGCTCACAATACCGGTCAGCGGTTCCTGCAGTGCTTCGAGGATTTCATTg < 1:63012/150‑1 (MQ=255) ccgagcgcggcatggtgctcaccggtggtggcgcactgctgcgCTCGGAGATGTCGGAAGCCAGTTCCGGCGGGCACTGTTCCAGTGCAACCATTACCGCGCTCACAATACCGGTCAGCGGTTCCTGCAGTGCTTCGAgg > 2:435878‑M2/44‑140 (MQ=255) 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accaccGGTGAGCACCATGCCGCGCTCGGAGATGTCGGAAGCCAGTTCCGGCGGGCACTGTTCCAGTGCAACCATTACCGCGCTCACAATACCGGTCAGCGGTTCCTGCAGTGCTTCGAGGATTTCATTGGAGTTCAggg < 2:698502/140‑1 (MQ=255) accaccGGTGAGCACCATGCCGCGCTCGGAGATGTCGGAAGCCAGTTCCGGCGGGCACTGTTCCAGTGCAACCATTACCGCGCTCACAATACCGGTCAGCGGTTCCTGCAGTGCTTCGAGGATTTCATTGGAGTTCAGGGTAAAACcgcg < 2:182974/150‑1 (MQ=255) ccGGTGAGCACCATGCCGCGCTCGGAGATGTCGGAAGCCAGTTCCGGCGGGCACTGTTCCAGTGCAACCATTACCGCGCTCACAATACCGGTCAGCGGTTCCTGCAGTGCTTCGAGGATTTCATTGGAGTTCAGGGTAAAACCGCGTGGa < 1:484192/150‑1 (MQ=255) tggtggcgcactgctgcgCTCGGAGATGTCGGAAGCCAGTTCCGGCGGGCACTGTTCCAGTGCAACCATTACCGCGCTCACAATACCGGTCAGCGGTTCCTGCAGTGCTTCGAGGATTTCATTGGAGTTCAGGGTAAAACCGCGTGGAac < 2:324406‑M2/132‑1 (MQ=255) ggTTAGCACCATGCCGCGCTCGGAGTTGTCGGAAGCCAGTTCCGGCGGGGACTGTTCCAGCGCAACCATTACCGGGCTCACAATACCGGTCAGCGGTTCCTGCAGTGCTTCGAGGATTTCATTGGAGTTCAGGGTAAAACCGCGTGGAac < 1:1002274/150‑1 (MQ=255) gTGAGCACCATGCCGCGCTCGGAGATGTCGGAAGCCAGTTCCGGCGGGCACTGTTCCAGTGCAACCATTACCGCGCTCACAATACCGGTCAGCGGTTCCTGCAGTGCTTCGAGGATTTCATTGGAGTTCAGGGTAAAACCGCGTGGAaca < 1:1115265/150‑1 (MQ=255) tgggCACCATGCCGCGCTCGGAGATGTCGGAAGCCAGTTCCGGCGGGCACTGTTCCAGTGCAACCATTACCGCGCTCACAATACCGGTCAGCGGTTCCTGCAGTGCTTCGAGGATTTCATTGGAGTTCAGGGTAAAACCGCGTGGAacac > 1:1113823/4‑150 (MQ=255) aCCATGCCGCGCTCGGAGATGTCGGAAGCCAGTTCCGGCGGGCACTGTTCCAGTGCAACCATTACCGCGCTCACAATACCGGTCAGCGGTTCCTGCAGTGCTTCGAGGATTTCATTGGAGTTCAGGGTAAAACCGCGTGGAACACCTTCt > 2:1065216/1‑150 (MQ=255) aCCATGCCGCGCTCGGAGATGTCGGAAGCCAGTTCCGGCGGGCACTGTTCCAGTGCAACCATTACCGCGCTCACAATACAGGTCAGCGGTTCCTGCAGTGCTTCGAGGATTTCATTGGAGTTCAGGGTAAAACCGCGTGTAACACCTTCt < 2:542270/150‑1 (MQ=255) ccATGCCGCGCTCGGAGATGTCGGAAGCCAGTTCCGGCGGGCACTGTTCCAGTGCAACCATTACCGCGCTCACAATACCGGTCAGCGGTTCCTGCAGTGCTTCGAGGATTTCATTGGAGTTCAGGGTAAAACCGCGTGGAACACCTTCTg > 1:181767/1‑150 (MQ=255) aTGCCGCGCTCGGAGATGTCGGAAGCCAGTTCCGGCGGGCACTGTTCCAGTGCAACCATTACCGCGCTCACAATACCGGTCAGCGGTTCCTGCAGTGCTTCGAGGATTTCATTGGAGTTCAGGGTAAAACCGCGTGGAACACCTTCTGcc > 2:800639/1‑150 (MQ=255) tGCCGCGCTCGGAGATGTCGGAAGCCAGTTCCGGCGGGCACTGTTCCAGTGCAACCATTACCGCGCTCACAATACCGGTCAGCGGTTCCTGCAGTGCTTCGAGGATTTCATTGGAGTTCAGGGTAAAACCGCGTGGAACACCTTCTGCCa < 2:852300/150‑1 (MQ=255) gCCGCGCTCGGAGATGTCGGAAGCCAGTTCCGGCGGGCACTGTTCCAGTGCAACCATTACCGCGCTCACAATACCGGTCAGCGGTTCCTGCAGTGCTTCGAGGATTTCATTGGAGTTCAGGGTAAAACCGCGTGGAACACCTTcgccatc > 1:1272961/1‑144 (MQ=255) gCCGCGCTCGGAGATGTCGGAAGCCAGTTCCGGCGGGCACTGTTCCAGTGCAACCATTACCGCGCTCACAATACCGGTCAGCGGTTCCTGCAGTGCTTCGAGGATTTCATTGGAGTTCAGGGTAAAACCGCGTGGAACACCTTCTGCCAg > 2:27485/1‑150 (MQ=255) ccGCGCTCGGAGATGTCGGAAGCCAGTTCCGGCGGGCACTGTTCCAGTGCAACCATTACCGCGCTCACAATACCGGTCAGCGGTTCCTGCAGTGCTTCGAGGATTTCATTGGAGTTCAGGGTAAAACCGCGTGGAACACCTTCTGCCAgg < 2:840142/150‑1 (MQ=255) ccGCGCTCGGAGATGTCGGAAGCCAGTTCCGGCGGGCACTGTTCCAGTGCAACCATTACCGCGCTCACAATACCGGTCAGCGGTTCCTGCAGTGCTTCGAGGATTTCATTGGAGTTCAGGGTAAAACCGCGTGGAACACCTTCTGCCAgg > 1:7078/1‑150 (MQ=255) ccGCGCTCGGAGATGTCGGAAGCCAGTTCCGGCGGGCACTGTTCCAGTGCAACCATTACAGCGCTCACAATACCGGTCAGCGGTTCCTGCAGTGCTTCGAGGATTTCATTGGAGTTCAGTGTAAAACCGCGTGGAACACCTTCTGCCAgg < 2:419882/150‑1 (MQ=255) cgcgCTCGGAGATGTCGGAAGCCAGTTCCGGCGGGCACTGTTCCAGTGCAACCATTACCGCGCTCACAATACCGGTCAGCGGTTCCTGCAGTGCTTCGAGGATTTCATTGGAGTTCAGGGTAAAACCGCGTGGAACACCTTCTGCCAGGt > 2:884126/1‑150 (MQ=255) | TGTCGATCATTTCCAGCGCTTTGCCGCCACCGCGCGCCACACAGGTCAGCGGGTCTTCAGCAACAACGACTGGAATGCCGGTTTCTTCCATTAACAAACGGTCAAGGTTACGCAGCAGTGCGCCACCACCGGTGAGCACCATGCCGCGCTCGGAGATGTCGGAAGCCAGTTCCGGCGGGCACTGTTCCAGTGCAACCATTACCGCGCTCACAATACCGGTCAGCGGTTCCTGCAGTGCTTCGAGGATTTCATTGGAGTTCAGGGTAAAACCGCGTGGAACACCTTCTGCCAGGT > NC_000913/3400076‑3400369 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |