| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 3700154 = | 93 (1.060) | 5 (0.060) | 3/264 | NT | 5.3% | noncoding (19/64 nt) | rdlD | antisense regulatory RNA RdlD |
| ? | NC_000913 | 3700196 = | 91 (1.090) | noncoding (61/64 nt) | rdlD | antisense regulatory RNA RdlD | |||||
Only 100 of 115 total aligned reads displayed.
CATGCCAGAAGGCCATGCCCAGCTCTGCGAACGTCATATAGCCGCCTGTGTTGTAATGACAACGTTTCGCGGCTATTCTTGAGTGGTCTAGAGTCAAGATTAGCCCCCGTGGTGTTGTCAGGTGCATACCTGCAACGTGCGGGGGTTTTCTCTCTCCAGCAACCAATGCCACCAGGGATAAAGCCCCCGCAACATTGCGCCTCACCGGAACCTTTCCGGCTTGCCGCTGATTCTACGATTGCTTTTTACTGTCAGCACCCGGCAATCTTCCTCATTGCGCGATGCCTTCCAGCTT > NC_000913/3700051‑3700345 | cATGCCAGAAGGCCATGCCCAGCTCTGCGAACGTCATATAGCCGCCTGTGTTGTAATGACAACGTTTCGCGGCTATTCTTGAGTGGTCTAGAGTCAAGATTAGCCCCCGTGGTGTTGTCAGGTGCATACCTGCAACGTGCGGGGGTTTtc < 2:366830/150‑1 (MQ=255) aaaagcaatcgtagaatcagcggcaagccggaaaggttccggtgaggcgcaatgttgcgggggctttatccctggtggcattggttgctggagagagaaaaCCCCCGTGGTGTTGTCAGGTGCATACCTGCAACGTGCGGGGGTTTtctc > 2:481280‑M1/102‑150 (MQ=255) gCCAGAAGGCCATGCCCAGCTCTGCGAACGTCATATAGCCGCCTGTGTTGTAATGACAACGTTTCGCGGCTATTCTTGAGTGGTCTAGAGTCAAGATTAGCCCCCGTGGTGTTGTCAGGTGCATACCTGCAACGTGCGGGGGTTTtctct > 1:134009/1‑150 (MQ=255) aacgcaatcgtagaatcagcggcaagccggccaggtgccggtgaggcgcaatgttgcgggggctttatccctgggggcattggttgctggagagagaacaCCCCCGTGGTGTTGCCAGGTGCATACCTGCAACGTGCGGGGGTTTtctct > 2:1527688‑M1/101‑150 (MQ=255) aaagcaatcgtagactcagcggcaagccggaaaggttccggtgaggcgcaatgttgcgggggctttatccctggtggcattggttgctggatatagaaaaCACCCGTGGTGTTGACAGGTGCATACATGCAACGTGAGGTGGTtttctat > 2:1532991‑M1/101‑148 (MQ=255) cAGAAGGCCATGCCCAGCTCTGCGAACGTCATATAGCCGCCTGTGTTGTAATGACAACGTTTCGCGGCTATTCTTGAGTGGTCTAGAGTCAAGATTAGCCCCCGTGGTGTTGTCAGGTGCATACCTGCAACGTGCGGGGGTTTtctctct < 2:1326322/150‑1 (MQ=255) aGGCCATGCCCAGCTCTGCGAACGTCATATAGCCGCCTGTGTTGTAATGACAACGTTTCGCGGCTATTCTTGAGTGGTCTAGAGTCAAGATTAGCCCCCGTGGTGTTGTCAGGTGCATACCTGCAACGTGCGGGGGTTTTCTCTCTCCAg < 1:208628/150‑1 (MQ=255) ccATGCCCAGCTCTGCGAACGTCATATAGCCGCCTGTGTTGTAATGACAACGTTTCGCGGCTATTCTTGAGTGGTCTAGAGTCAAGATTAGCCCCCGTGGTGTTGTCAGGTGCATACCTGCAACGTGCGGGGGTTTTCTCTCTCCAGCaa > 2:161975/1‑150 (MQ=255) gCCCAGCTCTGCGAACGTCATATAGCCGCCTGTGTTGTAATGACAACGTTTCGCGGCTATTCTTGAGTGGTCTAGAGTCAAGATTAGCCCCCGTGGTGTTGTCAGGTGCATACCTGCAACGTGCGGGGGTTTTCTCTCTCCAGCAACCaa > 2:1396494/1‑150 (MQ=255) gCCCAGCTCTGCGAACGTCATATAGCCGCCTGTGTTGTAATGACAACGTTTCGCGGCTATTCTTGAGTGGTCTAGAGTCAAGATTAGCCCCCGTGGTGTTGTCAGGTGCATACCTGCAACGTGCGGGGGTTTTCTCTCTCCAGCAACCaa > 2:1513995/1‑150 (MQ=255) cccAGCTCTGCGAACGTCATATAGCCGCCTGTGTTGTAATGACAACGTTTCGCGGCTATTCTTGAGTGGTCTAGAGTCAAGATTAGCCCCCGTGGTGTTGTCAGGTGCATACCTGCAACGTGCGGGGGTTTTCTCTCTCCAGCAACCAAt > 2:1307410/1‑150 (MQ=255) aGCTCTGCGAACGTCATATAGCCGCCTGTGTTGTAATGACAACGTTTCGCGGCTATTCTTGAGTGGTCTAGAGTCAAGATTAGCCCCCGTGGTGTTGTCAGGTGCATACCTGCAACGTGCGGGGGTTTTCTCTCTCCAGCAACCAATGcc < 1:304145/150‑1 (MQ=255) ctGCGAACGTCATATAGCCGCCTGTGTTGTAATGACAACGTTTCGCGGCTATTCTTGAGTGGTCTAGAGTCAAGATTAGCCCCCGTGGTGTTGTCAGGTGCATACCTGCAACGTGCGGGGGTTTTCTCTCTCCAGCAACCAATGccacca > 2:163849/1‑150 (MQ=255) 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gtAATGACAACGTTTCGCGGCTATTCTTGAGTGGTCTAGAGTCAAGATTAGCCCCCGTGGTGTTGTCAGGTGCATACCTGCAACGTGCGGGGGTTTTCTCTCTCCAGCAACCAATGCCACCAGGGATAAAGCCCCCGCAACATTGCGCCt > 2:758231/1‑150 (MQ=255) gACAACGTTTCGCGGCTATTCTTGAGTGGTCTAGAGTCAAGATTAGCCCCCGTGGTGTTGTCAGGTGCATACCTGCAACGTGCGGGGGTTTTCTCTCTCCAGCAACCAATGCCACCAGGGATAAAGCCCCCGCAACATTGCGCCTCACCg < 2:80878/150‑1 (MQ=255) cAACGTTTCGCGGCTATTCTTGAGTGGTCTAGAGTCAAGATTAGCCCCCGTGGTGTTGTCAGGTGCATACCTGCAACGTGCGGGGGTTTTCTCTCTCCAGCAACCAATGCCACCAGGGATAAAGCCCCCGCAACATTGCGCCTCACCGGa > 1:1061372/1‑150 (MQ=255) cGTTTCGCGGCTATTCTTGAGTGGTCTAGAGTCAAGATTAGCCCCCGTGGTGTTGTCAGGTGCATACCTGCAACGTGCGGGGGTTTTCTCTCTCCAGCAACCAATGCCACCAGGGATAAAGCCCCCGCAACATTGCGCCTCACCGGAAcc > 2:1073507/1‑150 (MQ=255) cgcgGCTATTCTTGAGTGGTCTAGAGTCAAGATTAGCCCCCGTGGTGTTGTCAGGTGCATACCTGCAACGTGCGGGGGTTTTCTCTCTCCAGCAACCAATGCCACCAGGGATAAAGCCCCCGCAACATTGCGCCTCACCGGAACCTTTcc > 1:1074061/1‑150 (MQ=255) 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cATACCTGCAACGTGCGGGGGTTTTCTCTCTCCAGCAACCAATGCCACCAGGGATAAAGCCCCCGCAACATTGCGCCTCACCGGAACCTTTCCGGCTTGCCGCTGATTCTACGATTGCTTTTTACTGTCAGCACCCGGCAATCTTCCTCa < 2:721539/150‑1 (MQ=255) tACCTGCAACGTGCGGGTGTTTTCTCTCTCCAGCAACCAATGCCACCAGGGATAAAGCCCCCGCAACATTGCGCCTCACCGGAACCTTTCCGGCTTGCCGCTGATTCTACGATTGCTTTTTACTGTCAGCACCCGGCAATCTTCCTCAtt < 2:134231/150‑1 (MQ=255) tACCTGCAACGTGCGGGGGTTTTCTCTCTCCAGCAACCAATGCCACCAGGGATAAAGCCCCCGCAACATTGCGCCTCACCGGAACCTTTCCGGCTTGCCGCTGATTCTACGATTGCTTTTTACTGTCAGCACCCGGCAATCTTCCTCAtt > 1:1335083/1‑150 (MQ=255) ccTGCAACGTGCGGGGGTTTTCTCTCTCCAGCAACCAATGCCACCAGGGATAAAGCCCCCGCAACATTGCGCCTCACCGGAACCTTTCCGGCTTGCCGCTGATTCTACGATTGCTTTTTACTGTCAGCACCCGGCAATCTTCCTCATTgc < 1:7684/150‑1 (MQ=255) cTGCAACGTGCGGGGGTTTTCTCTCTCCAGCAACCAATGCCACCAGGGATAAAGCCCCCGCAACATTGCGCCTCACCGGAACCTTTCCGGCTTGCCGCTGATTCTACGATTGCTTTTTACTGTCAGCACCCGGCAATCTTCCTCATTgcg > 2:100580/1‑150 (MQ=255) tGCAACGTGCGGGGGTTTTCTCTCTCCAGCAACCAATGCCACCAGGGATAAAGCCCCCGCAACATTGCGCCTCACCGGAACCTTTCCGGCTTGCCGCTGATTCTACGATTGCTTTTTACTGTCAGCACCCGGCAATCTTCCTCATTgcgc < 1:1146289/150‑1 (MQ=255) tGCAACGTGCGGGGGTTTTCTCTCTCCAGCAACCAATGCCACCAGGGATAAAGCCCCCGCAACATTGCGCCTCACCGGAACCTTTCCGGCTTGCCGCTGATTCTACGATTGCTTTTTACTGTCAGCACCCGGCAATCTTCCTCATTgcgc > 1:948470/1‑150 (MQ=255) cAACGTGCGGGGGTTTTCTCTCTCCAGCAACCAATGCCACCAGGGATAAAGCCCCCGCAACATTGCGCCTCACCGGAACCTTTCCGGCTTGCCGCTGATTCTACGATTGCTTTTTACTGTCAGCACCCGGCAATCTTCCTCATTGCGCGa < 2:116966/150‑1 (MQ=255) aCGTGCGGGGGTTTTCTCTCTCCAGCAACCAATGCCACCAGGGATAAAGCCCCCGCAACATTGCGCCTCACCGGAACCTTTCCGGCTTGCCGCTGATTCTACGATTGCTTTTTACTGTCAGCACCCGGCAATCTTCCTCATTGCGCGATg < 1:1186150/150‑1 (MQ=255) aCGTGCGGGGGTTTTCTCTCTCCAGCAACCAATGCCACCAGGGATAAAGCCCCCGCAACATTGCGCCTCACCGGAACCTTTCCGGCTTGCCGCTGATTCTACGATTGCTTTTTACTGTCAGCACCCGGCAATCTTCCTCATTGCGCGATg < 1:1049529/150‑1 (MQ=255) gTGCGGGGGTTTTCTCTCTCCAGCAACCAATGCCACCAGGGATAAAGCCCCCGCAACATTGCGCCTCACCGGAACCTTTCCGGCTTGCCGCTGATTCTACGATTGCTTTTTACTGTCAGCACCCGGCAATCTTCCTCATTGCGCGATGcc < 1:1437766/150‑1 (MQ=255) ggggTTTTCTCTCTCCAGCAACCAATGCCACCAGGGATAAAGCCCCCGCAACATTGCGCCTCACCGGAACCTTTCCGGCTTGCCGCTGATTCTACGATTGCTTTTTACTGTCAGCACCCGGCAATCTTCCTCATTGCGCGATGCCTTCCa < 1:1418232‑M2/146‑1 (MQ=255) gggTTTTCTCTCTCCAGCAACCAATGCCACCAGGGATAAAGCCCCCGCAACATTGCGCCTCACCGGAACCTTTCCGGCTTGCCGCTGATTCTACGATTGCTTTTTACTGTCAGCACCCGGCAATCTTCCTCATTGCGCGATGCCTTCCAg > 1:1164287‑M2/4‑150 (MQ=255) gTTTTCTCTCTCCAGCAACCAATGCCACCAGGGATAAAGCCCCCGCAACATTGCGCCTCACCGGAACCTTTCCGGCTTGCCGCTGATTCTACGATTGCTTTTTACTGTCAGCACCCGGCAATCTTCCTCATTGCGCGATGCCTTCCAGCt < 1:494622‑M2/149‑1 (MQ=255) ttttCTCTCTCCAGCAACCAATGCCACCAGGGATAAAGCCCCCGCAACATTGCGCCTCACCGGAACCTTTCCGGCTTGCCGCTGATTCTACGATTGCTTTTTACTGTCAGCACCCGGCAATCTTCCTCATTGCGCGATGCCTTCCAGCtt > 1:563085/1‑150 (MQ=255) | CATGCCAGAAGGCCATGCCCAGCTCTGCGAACGTCATATAGCCGCCTGTGTTGTAATGACAACGTTTCGCGGCTATTCTTGAGTGGTCTAGAGTCAAGATTAGCCCCCGTGGTGTTGTCAGGTGCATACCTGCAACGTGCGGGGGTTTTCTCTCTCCAGCAACCAATGCCACCAGGGATAAAGCCCCCGCAACATTGCGCCTCACCGGAACCTTTCCGGCTTGCCGCTGATTCTACGATTGCTTTTTACTGTCAGCACCCGGCAATCTTCCTCATTGCGCGATGCCTTCCAGCTT > NC_000913/3700051‑3700345 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |