| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 3998036 | 74 (0.850) | 8 (0.090) | 7/272 | NT | 9.8% | coding (54/2163 nt) | uvrD | ssDNA translocase and dsDNA helicase ‑ DNA helicase II |
| ? | NC_000913 | = 3998077 | 75 (0.870) | coding (95/2163 nt) | uvrD | ssDNA translocase and dsDNA helicase ‑ DNA helicase II | |||||
TTTGGCGGAGGGCGTTGCGCTTCTCCGCCCAACCTATTTTTACGCGGCGGTGCCAATGGACGTTTCTTACCTGCTCGACAGCCTTAATGACAAACAGCGCGAAGCGGTGGCCGCGCCACGCAGCAACCTTCTGGTGCTGGCGGGCGCGGGCAGTGGTAAGACGCGCGTACTGGTGCATCGTATCGCCTGGTTGATGAGCGTGGAAAACTGCTCGCCATACTCGATTATGGCGGTGACGTTTACCAACAAAGCGGCGGCGGAGATGCGTCATCGTATCGGGCAACTGATGGGCAC > NC_000913/3997928‑3998221 | ttgggCGGAGGGCGTTGCGCTTCTCCGCCCAACCTATTTTTACGCGGCGGTGCCAATGGACGTTTCTTACCTGCTCGACAGCCTTAATGACAAACAGCGCGAAGCGGTGGCCGCGCCACGCAGCAACCTTCTGGTGCTGgcgggcgcggg < 2:523014/147‑1 (MQ=255) ttGGCGGAGGGCGTTGCGCTTCTCCGCCCAACCTATTTTTACGCGGCGGTGCCAATGGACGTTTCTTACCTGCTCGACAGCCTTAATGACAAACAGCGCGAAGCGGTGGCCGCGCCACGCAGCAACCTTCTGGTGCTGGCGGGCGCGGGc > 1:701200‑M2/1‑149 (MQ=255) ttGGCGGAGGGCGTTGCGCTTCTCCGCCCAACCTATTTTTACGCGGCGGTGCCAATGGACGTTTCTTACCTGCTCGACAGCCTTAATGACAAACAGCGCGAAGCGGTGGCCGCGCCACGCAGCAACCTTCTGGTGCTGGCGGGCGCGGGc > 1:1476365‑M2/1‑149 (MQ=255) ttGGCGGAGGGCGTTGCGCTTCTCCGCCCAACCTATTTTTACGCGGCGGTGCCAATGGACGTTTCTTACCTGCTCGACAGCCTTAATGACAAACAGCGCGAAGCGGTGGCCGCGCCACGCAGCAACCTTCTGGTGCTGGCGGGCGCGGGc > 1:1377398‑M2/1‑149 (MQ=255) ggCGGAGGGCGTTGCGCTTCTCCGCCCAACCTATTTTTACGCGGCGGTGCCAATGGACGTTTCTTACCTGCTCGACAGCCTTAATGACAAACAGCGCGAAGCGGTGGCCGCGCCACGCAGCAACCTTCTGGTGCTGGCGGGCGCGGGCAg > 2:417539/1‑150 (MQ=255) gCGGAGGGCGTTGCGCTTCTCCGCCCAACCTATTTTTACGCGGCGGTGCCAATGGACGTTTCTTACCTGCTCGACAGCCTTAATGACAAACAGCGCGAAGCGGTGGCCGCGCCACGCAGCAACCTTCTGGTGCTGGCGGGCGCGGGCAGt < 1:370848/150‑1 (MQ=255) cgggCGTTGCGCTGCTCCGCCCAACCTATTTTTACGCGGCGGTGCCAATGGACGTTTCTTACCTGCTCGACAGCCTTAATGACAAACAGCGCGAAGCGGTGGCCGCGCCACGCAGCAACCTTCTGGGGCTGGCGGGCGCGGGCAGTGGTa < 1:388842/149‑1 (MQ=255) gCGTTGCGCTTCTCCGCCCAACCTATTTTTACGCGGCGGTGCCAATGGACGTTTCTTACCTGCTCGACAGCCTTAATGACAAACAGCGCGAAGCGGTGGCCGCGCCACGCAGCAACCTTCTGGTGCTGGCGGGCGCGGGCAGTGGTAAgc > 2:1103061/1‑149 (MQ=255) gCGTTGCGCTTCTCCGCCCAACCTATTTTTACGCGGCGGTGCCAATGGACGTTTCTTACCTGCTCGACAGCCTTAATGACAAACAGCGCGAAGCGGTGGCCGCGCCACGCAGCAACCTTCTGGTGCTGGCGGGCGCGGGCAGTGGTAAGa > 2:1453514/1‑150 (MQ=255) gCGTTGCGCTTCTCCGCCCAACCTATTTTTACGCGGCGGTGCCAATGGACGTTTCTTACCTGCTCGACAGCCTTAATGACAAACAGCGCGAAGCGGTGGCCGCGCCACGCAGCAACCTTCTGGTGCTGGCGGGCGCGGGCAGTGGTAAGa < 2:52096/150‑1 (MQ=255) cGTTGCGCTTCTCCGCCCAACCTATTTTTACGCGGCGGTGCCAATGGACGTTTCTTACCTGCTCGACAGCCTTAATGACAAACAGCGCGAAGCGGTGGCCGCGCCACGCAGCAACCTTCTGGTGCTGGCGGGCGCGGGCAGTGGTAAgcc > 1:1241273/1‑148 (MQ=255) gcgcTGCTCCGCCCAACCTATTTTTACGCGGCGGTGCCAATGGACGTTTCTTACCTGCTCGACAGCCTTAATGACAAACAGCGCGAAGCGGTGGCCGCGCCACGCAGCAACCTTCTGGTGCTGGCGGGCGCGGGCAGTGGTAAGAcgcgc < 1:330520/150‑1 (MQ=255) cgcTTCTCCGCCCAACCTATTTTTACGCGGCGGTGCCAATGGACGTTTCTTACCTGCTCGACAGCCTTAATGACAAACAGCGCGAAGCGGTGGCCGCGCCACGCAGCAACCTTCTGGTGCTGGCGGGCGCGGGCAGTGGTAAGAcgcgcg > 1:1173528/1‑150 (MQ=255) tctcCGCCCAACCTATTTTTACGCGGCGGTGCCAATGGACGTTTCTTACCTGCTCGACAGCCTTAATGACAAACAGCGCGAAGCGGTGGCCGCGCCACGCAGCAACCTTCTGGTGCTGGCGGGCGCGGGCAGTGGTAAGACGCGCGTACt < 1:1525574/150‑1 (MQ=255) ctcCGCCCAACCTATTTTTACGCGGCGGTGCCAATGGACGTTTCTTACCTGCTCGACAGCCTTAATGACAAACAGCGCGAAGCGGTGGCCGCGCCACGCAGCAACCTTCTGGTGCTGGCGGGCGCGGGCAGTGGTAAGACGCGCGTACTg < 1:518710/150‑1 (MQ=255) ccGCCCAACCTATTTTTACGCGGCGGTGCCAATGGACGTTTCTTACCTGCTCGACAGCCTTAATGACAAACAGCGCGAAGCGGTGGCCGCGCCACGCAGCAACCTTCTGGTGCTGGCGGGCGCGGGCAGTGGTAAGACGCGCGTACTGGt > 2:1260761/1‑150 (MQ=255) cGCCCAACCTATTTTTACGCGGCGGTGCCAATGGACGTTTCTTACCTGCTCGACAGCCTTAATGACAAACAGCGCGAAGCGGTGGCCGCGCCACGCAGCAACCTTCTGGTGCTGGCGGGCGCGGGCAGTGGTAAGACGCGCGTACTGGTg < 1:1215118/150‑1 (MQ=255) cGCCCAACCTATTTTTACGCGGCGGTGCCAATGGACGTTTCTTACCTGCTCGACAGCCTTAATGACAAACAGCGCGAAGCGGTGGCCGCGCCACGCAGCAACCTTCTGGTGCTGGCGGGCGCGGGCAGTGGTAAGACGCGCGTACTGGTg < 1:1105764/150‑1 (MQ=255) 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cGCAGCAACCTTCTGGTGCTGCGTGGCGCGGCcaccgcttcgcgctgtttgtcattaaggctgtcgagcaggtaagaaacgtccattggcaccgccgcgtaaaaataggttgggcggagaagcgcaacgccctccgccaaaaagctgggt < 1:614158‑M2/150‑119 (MQ=255) gcagcaACCTTCTGGTGCTGGCGGGCGCGGGcaccgcttcgcgctgtttgtcattaaggctgtcgagcaggtaagaaacgtccattggcaccgccgcgtaaaaataggttgggcggagaagcgcaacgccctccgccaaaaagctgggta > 1:1224583‑M2/1‑31 (MQ=255) cagcaACCTTCTGGTGCTGGCGGGCGCGGGCAGTGGTAAGACGCGCGTACTGGTGCATCGTATCGCCTGGTTGATGAGCGTGGAAAACTGCTCGCCATACTCGATTATGGCGGTGACGTTTACCAACAAAGCGGCGGCGGAGATGCGTCa > 1:38461/1‑150 (MQ=255) agcaACCTTCTGGTGCGGGCGGGGGCGGGCAGTGGTAAGACGCGCGTACTGGTGCATCGTATCGCCTGGTTGATGAGCGTGGAAAACTGCTCGCCATACTCGATTATGGCGGTGACGTTTACCAACAAAGCGGCGGCGGAGATGCGTCAt < 2:1396189/150‑1 (MQ=255) gcaACCTTCTGGTGCTGGCGGGCGCGGGCAGTGGTAAGACGCGCGTACTGGTGCATCGTATCGCCTGGTTGATGAGCGTGGAAAACTGCTCGCCATACTCGATTATGGCGGTGACGTTTACCAACAAAGCGGCGGCGGAGATGCGTCATc > 1:211503/1‑150 (MQ=255) aaaCCTTCTGCTGCTGGAGGGCGCGGGCAGTGGTAAGAAGCGCGTACTGGTGCATCGTATCGCCTGGTTGATGAGCGTGGAAAACTGCTCGCCATACTCGATTATGGCGGTGACGTTTACCAACAAAGCGGCGGCGGAGATGCGTCATCg > 2:246553/2‑150 (MQ=255) tCTGGTGCTGGCGGGCGCGGGCAGTGGTAAGACGCGCGTACTGGTGCATCGTATCGCCTGGTTGATGAGCGTGGAAAACTGCTCGCCATACTCGATTATGGCGGTGACGTTTACCAACAAAGCGGCGGCGGAGATGCGTCATCGTATCgg < 2:1490492/150‑1 (MQ=255) ggcgggcgCGGGCAGTGGTAAGACGCGCGTACTGGTGCATCGTATCGCCTGGTTGATGAGCGTGGAAAACTGCTCGCCATACTCGATTATGGCGGTGACGTTTACCAACAAAGCGGCGGCGGAGATGCGTCATCGTATCGGGCAACTGAt > 2:1454038/1‑150 (MQ=255) cgggcgcgggcAGTGGTAAGACGCGCGTACTGGTGCATCGTATCGCCTGGTTGATGAGCGTGGAAAACTGCTCGCCATACTCGATTATGGCGGTGACGTTTACCAACAAAGCGGCGGCGGAGATGCGTCATCGTATCGGGCAACTGATgg > 2:655277/1‑150 (MQ=255) gggcgcgggcAGTGGTAAGACGCGCGTACTGGTGCATCGTATCGCCTGGTTGATGAGCGTGGAAAACTGCTCGCCATACTCGATTATGGCGGTGACGTTTACCAACAAAGCGGCGGCGGAGATGCGTCATCGTATCGGGCAACTGATggg < 2:1241273/150‑1 (MQ=255) cgcgggcAGTGGTAAGACGCGCGTACTGGTGCATCGTATCGCCTGGTTGATGAGCGTGGAAAACTGCTCGCCATACTCGATTATGGCGGTGACGTTTACCAACAAAGCGGCGGCGGAGATGCGTCATCGTATCGGGCAACTGATGGGCAc > 1:748359/1‑150 (MQ=255) | TTTGGCGGAGGGCGTTGCGCTTCTCCGCCCAACCTATTTTTACGCGGCGGTGCCAATGGACGTTTCTTACCTGCTCGACAGCCTTAATGACAAACAGCGCGAAGCGGTGGCCGCGCCACGCAGCAACCTTCTGGTGCTGGCGGGCGCGGGCAGTGGTAAGACGCGCGTACTGGTGCATCGTATCGCCTGGTTGATGAGCGTGGAAAACTGCTCGCCATACTCGATTATGGCGGTGACGTTTACCAACAAAGCGGCGGCGGAGATGCGTCATCGTATCGGGCAACTGATGGGCAC > NC_000913/3997928‑3998221 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |