| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 2,516,423 | A→T | 5.1% | H470Q (CAT→CAA) | pdeA ← | putative c‑di‑GMP phosphodiesterase PdeA |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 2,516,423 | 0 | A | T | 5.1% | 256.3 / 2.8 | 79 | H470Q (CAT→CAA) | pdeA | putative c‑di‑GMP phosphodiesterase PdeA |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (48/27); new base T (2/2); total (50/29) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.22e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.49e-01 | |||||||||||
CATAACCTTCACCCTCTTTGTTGCGAATTGGCTGGGCGTAGAGCAGCAAATCACCCTGATCTAACGCCGTGCGAATGGTATTCAGCAATAGCACCTGTTTAGTGGTCTGCCCGGAAACCATCTCCTCTCTGCTATCCAGCGCCAGCACATGATGATGTGCGCAGGATTGCTCCGCCAGCCAGCTTAACTGCCCCAACAAGGGTTGCAGGGTTTCCTGATTTCCATCAAAACGCCCCCAGGCAGCACCATAGCCCATATCCAGCCCGGTATTGTTCCAGTGAATTTGCCGACTATTCA > NC_000913/2516275‑2516571 | catAACCTTCACCCTCTTTGTTGCGAATTGGCTGGGCGTAGAGCAGCAAATCACCCTGATCTAACGCCGTGCGAATGGTATTCAGCAATAGCACCTGTTTAGTGGTCTGCCCGGAAACCATCTCCTCTCTGCTATCCAGCGCCAGCACat < 1:361658/150‑1 (MQ=255)catAACCTTCACCCTCTTTGTTGCGAATTGGCTGGGCGTAGAGCAGCAAATCACCCTGATCTAACGCCGTGCGAATGGTATTCAGCAATAGCACCTGTTTAGTGGTCTGCCCGGAAACCATCTCCTCTCTGCTATCCAGCGCCAGCACat > 2:1437795/1‑150 (MQ=255)catAACCTTCACCCTCTTTGTTGCGAATTGGCTGGGCGTAGAGCAGCAAATCACCCTGATCTAACGCCGTGCGAATGGTATTCAGCAATAGCACCTGTTTAGTGGTCTGCCCGGAAACCATCTCCTCTCTGCTATCCAGCGCCAGCACat > 2:361658/1‑150 (MQ=255) atAACCTTCACCCTCTTTGTTGCGAATTGGCTGGGCGTAGAGCAGCAAATCACCCTGATCTAACGCCGTGCGAATGGTATTCAGCAATAGCACCTGTTTAGTGGGCTGCCCGGAAACCATCTCCTCTCTGCTATCCAGCGCCAGCACatg < 2:453362/150‑1 (MQ=255) aaCCTTCACCCTCTTTGTTGCGAATTGGCTGGGCGTAGAGCAGCAAATCACCCTGATCTAACGCCGTGCGAATGGTATTCAGCAATAGCACCTGTTTAGTGGTCTGCCCGGAAACCATCTCCTCTCTGCTATCCAGCGCCAGCACatgat < 2:93929/150‑1 (MQ=255) aCCTTCACCCTCTTTGTTGCGAATTGGCTGGGCGTAGAGCAGCAAATCACCCTGATCTAACGCCGTGCGAATGGTATTCAGCAATAGCACCTGTTTAGTGGTCTGCCCGGAAACCATCTCCTCTCTGCTATCCAGCGCCAGCACatgatg < 1:979606/150‑1 (MQ=255) ccTTCACCCTCTTTGTTGCGAATTGGCTGGGCGTAGAGCAGCAAATCACCCTGATCTAACGCCGTGCGAATGGTATTCAGCAATAGCACCTGTTTAGTGGTCTGCCCGGAAACCATCTCCTCTCTGCTATCCAGCGCCAGCACatgatga < 1:672389/150‑1 (MQ=255) ttCACCCTCTTTGTTGCGAATTGGCTGGGCGTAGAGCAGCAAATCACCCTGATCTAACGCCGTGCGAATGGTATTCAGCAATAGCACCTGTTTAGTGGTCTGCCCGGAAACCATCTCCTCTCTGCTATCCAGCGCCAGCACatgatgatg < 1:1402072/150‑1 (MQ=255) tCACCCTCTTTGTTGCGAATTGGCTGGGCGTAGAGCAGCAAATCACCCTGATCTAACGCCGTGCGAATGGTATTCAGCAATAGCACCTGTTTAGTGGTCTGCCCGGAAACCATCTCCTCTCTGCTATCCAGCGCCAGCACATGATGAtgt > 1:504261/1‑150 (MQ=255) tCACCCTCTTTGTTGCGAATTGGCTGGGCGTAGAGCAGCAAATCACCCTGATCTAACGCCGTGCGAATGGTATTCAGCAATAGCACCTGTTTAGTGGTCTGCCCGGAAACCATCTCCTCTCTGCTATCCAGCGCCAGCACATGATGAtgt > 2:1391580/1‑150 (MQ=255) aCCCTCTTTGTTGCGAATTGGCTGGGCGTAGAGCAGCAAATCACCCTGATCTAACGCCGTGCGAATGGTATTCAGCAATAGCACCTGTTTAGTGGTCTGCCCGGAAACCATCTCCTCTCTGCTATCCAGCGCCAGCACATGATGATGTgc > 2:1045897/1‑150 (MQ=255) cGAATTGGCTGGGCGTAGAGCAGCAAATCACCCTGATCTAACGCCGTGCGAATGGTATTCAGCAATAGCACCTGTTTAGTGGTCTGCCCGGAAACCATCTCCTCTCTGCTATCCAGCGCCAGCACATGATGATGTGCGCAGGATTGCTcc > 2:345374/1‑150 (MQ=255) cGAATTGGCTGGGCGTAGAGCAGCAAATCACCCTGATCTAACGCCGTGCGAATGGTATTCAGCAATAGCACCTGTTTAGTGGTCTGCCCGGAAACCATCTCCTCTCTGCTATCCAGCGCCAGCACATGATGATGTGCGCAGGATTGCTcc > 2:11264/1‑150 (MQ=255) gAATTGGCTGGGCGTAGAGCAGCAAATCACCCTGATCTAACGCCGTGCGAATGGTATTCAGCAATAGCACCTGTTTAGTGGTCTGCCCGGAAACCATCTCCTCTCTGCTATCCAGCGCCAGCACATGATGATGTGCGCAGGATTGCTCCg < 1:1426560/150‑1 (MQ=255) aaTTGGCTGGGCGTAGAGCAGCAAATCACCCTGATCTAACGCCGTGCGAATGGTATTCAGCAATAGCACCTGTTTAGTGGTCTGCCCGGAAACCATCTCCTCTCTGCTATCCAGCGCCAGCACTTGATGATGTGCGCAGGATTGCTCCgc > 1:1504945/1‑150 (MQ=255) aaTTGGCTGGGCGTAGAGCAGCAAATCACCCTGATCTAACGCCGTGCGAATGGTATTCAGCAATAGCACCTGTTTAGTGGTCTGCCCGGAAACCATCTCCTCTCTGCTATCCAGCGCCAGCACTTGATGATGTGCGCAGGATTGCTCCgc > 1:1510060/1‑150 (MQ=255) ggCTGGGCGTAGAGCAGCAAATCACCCTGATCTAACGCCGTGCGAATGGTATTCAGCAATAGCACCTGTTTAGTGGTCTGCCCGGAAACCATCTCCTCTCTGCTATCCAGCGCCAGCACATGATGATGTGCGCAGGATTGCTCCgccagc > 1:34285/1‑150 (MQ=255) ggCTGGGCGTAGAGCAGCAAATCACCCTGATCTAACGCCGTGCGAATGGTATTCAGCAATAGCACCTGTTTAGTGGTCTGCCCGGAAACCATCTCCTCTCTGCTATCCAGCGCCAGCACATGATGATGTGCGCAGGATTGCTCCgccagc < 2:1055971/150‑1 (MQ=255) ggCTGGGCGTAGAGCAGCAAATCACCCTGATCTAACGCCGTGCGAATGGTATTCAGCAATAGCACCTGTTTAGTGGTCTGCCCGGAAACCATCTCCTCTCTGCTAACCAGCGCCAGCACATGATGATGTGCGCAGGATTGCTACgccagc > 2:464356/1‑150 (MQ=255) gggCGTAGAGCAGCAAATCACCCTGATCTAACGCCGTGCGAATGGTATTCAGCAATAGCACCTGTTTAGTGGTCTGCCCGGAAACCATCTCCTCTCTGCTATCCAGCGCCAGCACATGATGATGTGCGCAGGATTGCTCCGCcagccagc < 2:504261/150‑1 (MQ=255) cGTAGAGCAGCAAATCACACTGATCTAACGCCGTGCGAATGGTATTCAGCAATAGCACCTGTTTAGTGGTCTGCCCGGAAACCATCTCCTCTCTGCTATCCAGCGCCAGCACATGATGATGTGCGCAGGATTGCTCCGCCAGCCAGCTTa > 1:1288997/1‑150 (MQ=255) gcagcaAATCACCCTGATCTAACGCCGTGCGAATGGTATTCAGCAATAGCACCTGTTTAGTGGTCTGCCCGGAAACCATCTCCTCTCTGCTATCCAGCGCCAGCACATGATGATGTGCGCAGGATTGCTCCGCCAGCCAGCTTAACTGcc > 1:178783/1‑150 (MQ=255) gcagcaAATCACCCTGATCTAACGCCGTGCGAATGGTATTCAGCAATAGCACCTGTTTAGTGGTCTGCCCGGAAACCATCTCCTCTCTGCTATCCAGCGCCAGCACATGATGATGTGCGCAGGATTGCTCCGCCAGCCAGCTTAACTGcc > 2:514669/1‑150 (MQ=255) gcaAATCACCCTGATCTAACGCCGTGCGAATGGTATTCAGCAATAGCACCTGTTTAGTGGTCTGCCCGGAAACCATCTCCTCTCTGCTATCCAGCGCCAGCACATGATGATGTGCGCAGGATTGCTCCGCCAGCCAGCTTAACTGCCCca < 2:105943/150‑1 (MQ=255) caAATCACCCTGATCTAACGCCGTGCGAATGGTATTCAGCAATAGCACCTGTTTAGTGGTCTGCCCGGAAACCATCTCCTCTCTGCTATCCAGCGCCAGCACATGATGATGTGCGCAGGATTGCTCCGCCAGCCAGCTTAACTGCCCcaa > 2:614057/1‑150 (MQ=255) aaTCACCCTGATCTAACGCCGTGCGAATGGTATTCAGCAATAGCACCTGTTTAGTGGTCTGCCCGGAAACCATCTCCTCTCTGCTATCCAGCGCCAGCACATGATGATGTGCGCAGGATTGCTCCGCCAGCCAGCTTAACTGCCCcaaca > 1:1225604/1‑150 (MQ=255) aaTCACCCTGATCTAACGCCCTCCGCATGGTATTACGCAATAGCACCTGTTTAGTGGTCTCCCCGCTACCCATCTCCTCTCAGCTATCCAGCGCCAGCACATGATGATGTGCCCAGGATTGCTCCGACAGCCCGATTAACTGCCCcaaca > 2:1164655/1‑150 (MQ=255) cccTGATCTAACGCCGTGCGAATGGTATTCAGCAATAGCACCTGTTTAGTGGTCTGCCCGGAAACCATCTCCTCTCTGCTATCCAGCGCCAGCACATGATGATGTGCGCAGGATTGCTCCGCCAGCCAGCTTAACTGCCCCAACAAGGGt > 2:570105/1‑150 (MQ=255) cccTGATCTAACGCCGTGCGAATGGTATTCAGCAATAGCACCTGTTTAGTGGTCTGCCCGGAAACCATCTCCTCTCTGCTATCCAGCGCCAGCACATGATGATGTGCGCAGGATTGCTCCGCCAGCCAGCTTAACTGCCCCAACAAGGGt < 1:1045897/150‑1 (MQ=255) cTGATCTAACGCCGTGCGAATGGTATTCAGCAATAGCACCTGTTTAGTGGTCTGCCCGGAAACCATCTCCTCTCTGCTATCCAGCGCCAGCACATGATGATGTGCGCAGGATTGCTCCGCCAGCCAGCTTAACTGCCCCAACAAGGGTTg > 2:1532110/1‑150 (MQ=255) tGATCTAACGCCGTGCGAATGGTATTCAGCAATATCACCTGTTTAGTGTTCTGCCCGGAAACCATCTCCTCTCTGCTATCCAGCGCCAGCACATGATGATGTGCGCAGGATTGCTCCGCCAGCCAGCTTAACTGCCCCAACAAGGGTTGc > 1:58422/1‑150 (MQ=255) tCTAACGCCGTGCGAATGGTATTCAGCAATAGCACCTGTTTAGTGGTCTGCCCGGAAACCATCTCCTCTCTGCTATCCAGCGCCAGCACATGATGATGTGCGCAGGATTGCTCCGCCAGCCAGCTTAACTGCCCCAACAAGGGTTGCAgg < 2:178783/150‑1 (MQ=255) tAACGCCGTGCGAATGGTATTCAGCAATAGCACCTGTTTAGTGGTCTGCCCGGAAACCATCTCCTCTCTGCTATCCAGCGCCAGCACATGATGATGTGCGCAGGATTGCTCCGCCAGCCAGCTTAACTGCCCCAACAAGGGTTGCAGGGt > 2:1327033/1‑150 (MQ=255) cGTGCGAATGGTATTCAGCAATAGCACCTGTTTAGTGGTCTGCCCGGAAACCATCTCCTCTCTGCTATCCAGCGCCAGCACATGATGATGTGCGCAGGATTGCTCCGCCAGCCAGCTTAACTGCCCCAACAAGGGTTGCAGGGTTTCCTg < 1:402132/150‑1 (MQ=255) gTGCGAATGGTATTCAGCAATAGCACCTGTTTAGTGGTCTGCCCGGAAACCATCTCCTCTCTGCTATCCAGCGCCAGCACATGATGATGTGCGCAGGATTGCTCCGCCAGCCAGCTTAACTGCCCCAACAAGGGTTGCAGGGTTTCCTGa > 1:615688/1‑150 (MQ=255) cGAATGGTATTCAGCAATATCACCTGTTTAGTGGTCTGCCAGGAAACCATCTCCTCTCTGCTATCAAGAGCCATAAAATGAGGATGTGCGCAGGATTTCTCCGCCATCCAGCTTAACTGCCCCAACAAGGGTTGCAGGGTTTCCTTAttt < 2:1048277/150‑1 (MQ=255) cGAATGGTATTCAGCAATAGCACCTGTTTAGTGGTCTGCCCGGAAACCATCTCCTCTCTGCTATCCAGCGCCAGCACATGATGATGTGCGCAGGATTGCTCCGCCAGCCAGCTTAACTGCCCCAACAAGGGTTGCAGGGTTTCCTGAttt < 1:1201960/150‑1 (MQ=255) gAATGGTATTCAGCAATAGCACCTGTTTAGTGGTCTGCCCGGAAACCATCTCCTCTCTGCTATCCAGCGCCAGCACTTGATGATGTGCGCAGGATTGCTCCGCCAGCCAGCTTAACTGCCCCAACAAGGGTTGCAGGGTTTCCTGATTTc < 2:1504945/150‑1 (MQ=255) gAATGGTATTCAGCAATAGCACCTGTTTAGTGGTCTGCCCGGAAACCATCTCCTCTCTGCTATCCAGCGCCAGCACTTGATGATGTGCGCAGGATTGCTCCGCCAGCCAGCTTAACTGCCCCAACAAGGGTTGCAGGGTTTCCTGATTTc < 2:1510060/150‑1 (MQ=255) ggTATTCAGCAATAGCACCTGTTTAGTGGTCTGCCCGGAAACCATCTCCTCTCTGCTATCCAGCGCCAGCACATGATGATGTGCGCAGGATTGCTCCGCCAGCCAGCTTAACTGCCCCAACAAGGGTTGCAGGGTTTCCTGATTTCCATc < 2:1218020/150‑1 (MQ=255) aTTCAGCAATAGCACCTGTTTAGTGGTCTGCCCGGAAACCATCTCCTCTCTGCTATCCAGCGCCAGCACATGATGATGTGCGCAGGATTGCTCCGCCAGCCAGCTTAACTGCCCCAACAAGGGTTGCAGGGTTTCCTGATTTCCATCaaa > 1:1491597/1‑150 (MQ=255) ttCAGCAATAGCACCTGTTTAGTGGTCTGCCCGGAAACCATCTCCTCTCTGCTATCCAGCGCCAGCACATGATGATGTGCGCAGGATTGCTCCGCCAGCCAGCTTAACTGCCCCAACAAGGGTTGCAGGGTTTCCTGATTTCCATCaaaa > 2:1071806/1‑150 (MQ=255) tCAGCAATAGCACCTGTTTAGTGGTCTGCCCGGAAACCATCTCCTCTCTGCTATCCAGCGCCAGCACATGATGATGTGCGCAGGATTGCTCCGCCAGCCAGCTTAACTGCCCCAACAAGGGTTGCAGGGTTTCCTGATTTCCATCAAAAc > 1:681766/1‑150 (MQ=255) cAGCAATAGCACCTGTTTAGTGGTCTGCCCGGAAACCATCTCCTCTCTGCTATCCAGCGCCAGCACATGATGATGTGCGCAGGATTGCTCCGCCAGCCAGCTTAACTGCCCCAACAAGGGTTGCAGGGTTTCCTGATTTCCATCAAAACg > 2:1325191/1‑150 (MQ=255) cAGCAATAGCACCTGTTTAGTGGTCTGCCCGGAAACCATCTCCTCTCTGCTATCCAGCGCCAGCACATGATGATGTGCGCAGGATTGCTCCGCCAGCCAGCTTAACTGCCCCAACAAGGGTTGCAGGGTTTCCTGATTTCCATCAAAACg > 2:363512/1‑150 (MQ=255) aaTAGCACCTGTTTAGTGGTCTGCCCGGAAACCATCTCCTCTCTGCTATCCAGCGCCAGCACATGATGATGTGCGCAGGATTGCTCCGCCAGCCAGCTTAACTGCCCCAACAAGGGTTGCAGGGTTTCCTGATTTCCATCAAAACGcccc < 1:345374/150‑1 (MQ=255) aTAGCACCTGTTTAGTGGTCTGCCCGGAAACCATCTCCTCTCTGCTATCCAGCGCCAGCACATGATGATGTGCGCAGGATTGCTCCGCCAGCCAGCTTAACTGCCCCAACAAGGGTTGCAGGGTTTCCTGATTTCCATCAAAACGccccc > 1:1226043/1‑150 (MQ=255) tAGTGGTCTGCCCGGAAACCATCTCCTCTCTGCTATCCAGCGCCAGCACATGATGATGTGCGCAGGATTGCTCCGCCAGCCAGCTTAACTGCCCCAACAAGGGTTGCAGGGTTTCCTGATTTCCATCAAAACGCCCCCAGGCAGCACCAt > 1:1513685/1‑150 (MQ=255) aGTGGTCTGCCCGGAAACCATCTCCTCTCTGCTATCCAGCGCCAGCACATGATGATGTGCGCAGGATTGCTCCGCCAGCCAGCTTAACTGCCCCAACAAGGGTTGCAGGGTTTCCTGATTTCCATCAAAACGCCCCCAGGCAGCACCATa > 2:372919/1‑150 (MQ=255) tGGTCTGCCCGGAAACCATCTCCTCTCTGCTATCCAGCGCCAGCACATGATGATGTGCGCAGGATTGCTCCGCCAGCCAGCTTAACTGCCCCAACAAGGGTTGCAGGGTTTCCTGATTTCCATCAAAACGCCCCCAGGCAGCACCATAGc < 1:1325191/150‑1 (MQ=255) ggTCTGCCCGGAAACCATCTCCTCTCTGCTATCCAGCGCCAGCACATGATGATGTGCGCAGGATTGCTCCGCCAGCCAGCTTAACTGCCCCAACAAGGGTTGCAGGGTTTCCTGATTTCCATCAAAACGCCCCCAGGCAGCACCATAGcc > 2:1474748/1‑150 (MQ=255) ggTCTGCCCGGAAACCATCTCCTCTCTGCTATCAAGCGCCAGCACATGATGATGTGCGCAGGATTGCTCCGCCCGCCACCTTAACTGCCCCAACAACGGATGCAGGGTTTCCTGATTTCCATCAAAACGCCCCCAGGCAGCACCATAGcc > 1:945099/1‑150 (MQ=255) gTCTGCCCGGAAACCATCTCCTCTCTGCTATCCAGCGCCAGCACATGATGATGTGCGCAGGATTGCTCCGCCAGCCAGCTTAACTGCCCCAACAAGGGTTGCAGGGTTTCCTGATTTCCATCAAAACGCCCCCAGGCAGCACCATAGccc > 1:1243380/1‑150 (MQ=255) tCTGCCCGGAAACCATCTCCTCTCTGCTATCCAGCGCCAGCACATGATGATGTGCGCAGGATTGCTCCGCCAGCCAGCTTAACTGCCCCAACAAGGGTTGCAGGGTTTCCTGATTTCCATCAAAACGCCCCCAGGCAGCACCATAGCCCa < 1:570105/150‑1 (MQ=255) cTGCCCGGAAACCATCTCCTCTCTGCTATCCAGCGCCAGCACATGATGATGTGCGCAGGATTGCTCCGCCAGCCAGCTTAACTGCCCCAACAAGGGTTGCAGGGTTTCCTGATTTCCATCAAAACGCCCCCAGGCAGCACCATAGCCCat < 2:1225604/150‑1 (MQ=255) gCCCGGAAACCATCTCCTCTCTGCTATCCAGCGCCAGCACATGATGATGTGCGCAGGATTGCTCCGCCAGCCAGCTTAACTGCCCCAACAAGGGTTGCAGGGTTTCCTGATTTCCATCAAAACGCCCCCAGGCAGCACCATAGCCCatat > 2:147910/1‑150 (MQ=255) cccGGAAACCATCTCCTCTCTGCTATCCAGCGCCAGCACATGATGATGTGCGCAGGATTGCTCCGCCAGCCAGCTTAACTGCCCCAACAAGGGTTGCAGGGTTTCCTGATTTCCATCAAAACGCCCCCAGGCAGCACCATAGCCCATATc < 1:11264/150‑1 (MQ=255) ccGGAAACCATCTCCTCTCTGCTATCCAGCGCCAGCACATGATGATGTGCGCAGGATTGCTCCGCCAGCCAGCTTAACTGCCCCAACAAGGGTTGCAGGGTTTCCTGATTTCCATCAAAACGCCCCCAGGCAGCACCATAGCCCATATcc > 1:9794/1‑150 (MQ=255) ggAAACCATCTCCTCTCTGCTATCCAGCGCCAGCACATGATGATGTGCGCAGGATTGCTCCGCCAGCCAGCTTAACTGCCCCAACAAGGGTTGCAGGGTTTCCTGATTTCCATCAAAACGCCCCCAGGCAGCACCATAGCCCATATCCAg < 2:935170/150‑1 (MQ=255) gAAACCATCTCCTCTCTGCTATCCAGCGCCAGCACATGATGATGTGCGCAGGATTGCTCCGCCAGCCAGCTTAACTGCCCCAACAAGGGTTGCAGGGTTTCCTGATTTCCATCAAAACGCCCCCAGGCAGCACCATAGCCCATATCCAGc > 1:503146/1‑150 (MQ=255) aCCATCTCCTCTCTGCTATCCAGCGCCAGCACATGATGATGTGCGCAGGATTGCTCCGCCAGCCAGCTTAACTGCCCCAACAAGGGTTGCAGGGTTTCCTGATTTCCATCAAAACGCCCCCAGGCAGCACCATAGCCCATATCCAGCCCg < 2:584258/150‑1 (MQ=255) aCCATCTCCTCTCTGCTATCCAGCGCCAGCACATGATGATGTGCGCAGGATTGCTCCGCCAGCCAGCTTAACTGCCCCAACAAGGGTTGCAGGGTTTCCTGATTTCCATCAAAACGCCCCCAGGCAGCACCATAGCCCATATCCAGCCCg < 2:578778/150‑1 (MQ=255) ccATCTCCTCTCTGCTATCCAGCGCCAGCACATGATGATGTGCGCAGGATTGCTCCGCCAGCCAGCTTAACTGCCCCAACAAGGGTTGCAGGGTTTCCTGATTTCCATCAAAACGCCCCCAGGCAGCACCATAGCCCATATCCAGCCCgg < 1:197936/150‑1 (MQ=255) cATCTCCTCTCTGCTATCCAGCGCCAGCACATGATGATGTGCGCAGGATTGCTCCGCCAGCCAGCTTAACTGCCCCAACAAGGGTTGCAGGGTTTCCTGATTTCCATCAAAACGCCCCCAGGCAGCACCATAGCCCATATCCAGCCCGGt > 1:754258/1‑150 (MQ=255) ctcctcTCTGCTATCCAGCGCCAGCACATGATGATGTGCGCAGGATTGCTCCGCCAGCCAGCTTAACTGCCCCAACAAGGGTTGCAGGGTTTCCTGATTTCCATCAAAACGCCCCCAGGCAGCACCATAGCCCATATCCAGCCCGGTAtt > 2:1531878/1‑150 (MQ=255) tcctcTCTGCTATCCAGCGCCAGCACATGATGATGTGCGCAGGATTGCTCCGCCAGCCAGCTTAACTGCCCCAACAAGGGTTGCAGGGTTTCCTGATTTCCATCAAAACGCCCCCAGGCAGCACCATAGCCCATATCCAGCCCGGTATTg < 1:1474748/150‑1 (MQ=255) tcctcTCTGCTATCCAGCGCCAGCACATGATGATGTGCGCAGGATTGCTCCGCCAGCCAGCTTAACTGCCCCAACAAGGGTTGCAGGGTTTCCTGATTTCCATCAAAACGCCCCCAGGCAGCACCATAGCCCATATCCAGCCCGGTATTg > 2:614654/1‑150 (MQ=255) tcctcTCTGCTATCCAGCGCCAGCACATGATGATGTGCGCAGGATTGCTCCGCCAGCCAGCTTAACTGCCCCAACAAGGGTTGCAGGGTTTCCTGATTTCCATCAAAACGCCCCCAGGCAGCACCATAGCCCATATCCAGCCCGGTATTg < 2:571/150‑1 (MQ=255) cctcTCTGCTATCCAGCGCCAGCACATGATGATGTGCGCAGGATTGCTCCGCCAGCCAGCTTAACTGCCCCAACAAGGGTTGCAGGGTTTCCTGATTTCCATCAAAACGCCCCCAGGCAGCACCATAGCCCATATCCAGCCCGGTATTGt > 1:866977/1‑150 (MQ=255) cctcTCTGCTATCCAGCGCCAGCACATGATGATGTGCGCAGGATTGCTCCGCCAGCCAGCTTAACTGCCCCAACAAGGGTTGCAGGGTTTCCTGATTTCCATCAAAACGCCCCCAGGCAGCACCATAGCCCATATCCAGCCCGGTATTGt > 2:44467/1‑150 (MQ=255) cctcTCTGCTATCCAGCGCCAGCACATGATGATGTGCGCAGGATTGCTCCGCCAGCCAGCTTAACTGCCCCAACAAGGGTTGCAGGGTTTCCTGATTTCCATCAAAACGCCCCCAGGCAGCACCATAGCCCATATCCAGCCCGGTATTGt > 2:1035010/1‑150 (MQ=255) ctctctGCTATCCAGCGCCAGCACATGATGATGTGCGCAGGATTGCTCCGCCAGCCAGCTTAACTGCCCCAACAAGGGTTGCAGGGTTTCCTGATTTCCATCAAAACGCCCCCAGGCAGCACCATAGCCCATATCCAGCCCGGTATTGtt > 2:268122/1‑150 (MQ=255) tctctGCTATCCAGCGCCAGCACATGATGATGTGCGCAGGATTGCTCCGCCAGCCAGCTTAACTGCCCCAACAAGGGTTGCAGGGTTTCCTGATTTCCATCAAAACGCCCCCAGGCAGCACCATAGCCCATATCCAGCCCGGTATTGTTc < 1:200961/150‑1 (MQ=255) ctGCTATCCAGCGCCAGCACATGATGATGTGCGCAGTATTGCTCCGCCAGCCAGCTTAACTGCCCCAACAAGGGTTGCAGGGTTTCCTGATTTCCATCAAAACGCCCCCAGGCAGCACCATAGCCCATATCCAGCCCGGTATTGTTCCAg > 1:1330384/1‑150 (MQ=255) ctGCTATCCAGCGCCAGCACATGATGATGTGCGCAGGATTGCTCCGCCAGCCAGCTTAACTGCCCCAACAAGGGTTGCAGGGTTTCCTGATTTCCATCAAAACGCCCCCAGGCAGCACCATAGCCCATATCCAGCCCGGTATTGTTCCAg < 1:933311/150‑1 (MQ=255) cTATCCAGCGCCAGCACATGATGATGTGCGCAGGATTGCTCCGCCAGCCAGCTTAACTGCCCCAACAAGGGTTGCAGGGTTTCCTGATTTCCATCAAAACGCCCCCAGGCAGCACCATAGCCCATATCCAGCCCGGTATTGTTCCAGTGa > 2:1488346/1‑150 (MQ=255) aTCCAGCGCCAGCACATGATGATGTGCGCAGGATTGCTCCGCCAGCCAGCTTAACTGCCCCAACAAGGGTTGCAGGGTTTCCTGATTTCCATCAAAACGCCCCCAGGCAGCACCATAGCCCATATCCAGCCCGGTATTGTTCCAGTGAAt < 1:113827/150‑1 (MQ=255) tCCAGCGCCAGCACATGATGATGTGCGCAGGATTGCTCCGCCAGCCAGCTTAACTGCCCCAACAAGGGTTGCAGGGTTTCCTGATTTCCATCAAAACGCCCCCAGGCAGCACCATAGCCCATATCCAGCCCGGTATTGTTCCAGTGAAtt > 2:863964/1‑150 (MQ=255) ccAGCGCCAGCACATGATGATGTGCGCAGGATTGCTCCGCCAGCCAGCTTAACTGCCCCAACAAGGGTTGCAGGGTTTCCTGATTTCCATCAAAACGCCCCCAGGCAGCACCATAGCCCATATCCAGCCCGGTATTGTTCCAGTGAAttt > 2:648535/1‑150 (MQ=255) cAGCGCCAGCACATGATGATGTGCGCAGGATTGCTCCGCCAGCCAGCTTAACTGCCCCAACAAGGGTTGCAGGGTTTCCTGATTTCCATCAAAACGCCCCCAGGCAGCACCATAGCCCATATCCAGCCCGGTATTGTTCCAGTGAATTTg > 2:627767/1‑150 (MQ=255) aGCGCCAGCACATGATGATGTGCGCAGGATTGCTCCGCCAGCCAGCTTAACTGCCCCAACAAGGGTTGCAGGGTTTCCTGATTTCCATCAAAACGCCCCCAGGCAGCACCATAGCCCATATCCAGCCCGGTATTGTTCCAGTGAATTTGc > 2:1289696/1‑150 (MQ=255) gcgcCAGCACATGATGATGTGCGCAGGATTGCTCCGCCAGCCAGCTTAACTGCCCCAACAAGGGTTGCAGGGTTTCCTGATTTCCATCAAAACGCCCCCAGGCAGCACCATAGCCCATATCCAGCCCGGTATTGTTCCAGTGAATTTccc < 1:965456/150‑1 (MQ=255) cgcCAGCACATGATGATGTGCGCAGGATTGCTCCGCCAGCCAGCTTAACTGCCCCAACAAGGGTTGCAGGGTTTCCTGATTTCCATCAAAACGCCCCCAGGCAGCACCATAGCCCATATCCAGCCCGGTATTGTTCCAGTGAATTTGCCg < 2:503146/150‑1 (MQ=255) ctgcgCACATCATCATGTGTGCAGGATTGCTCCGCCAGCCAGCTTAACTGCCCCAACAAGGGTTGCAGGGTTTCCTGATTTCCATCAAAACGCCCCCAGGCAGCACCATAGCCCATATCCAGCCCGGTATTGTTCCAGTGAATTTGCCGa > 1:601537/5‑150 (MQ=255) tgcgCACATCATCATGTGCGCAGGATTGCTCCGCCAGCCAGCTTAACTGCCCCAACAAGGGTTGCAGGGTTTCCTGATTTCCATCAAAACGCCCCCAGGCAGCACCATAGCCCATATCCAGCCCGGTATTGTTCCAGTGAATTTGCCGAc > 2:356402/4‑150 (MQ=255) ccAGCACATGATGATGTGCGCAGGATTGCTCCGCCAGCCAGCTTAACTGCCCCAACAAGGGTTGCAGGGTTTCCTGATTTCCATCAAAACGCCCCCAGGCAGCACCATAGCCCATATCCAGCCCGGTATTGTTCCAGTGAATTTGCCGAc > 2:1141719/1‑150 (MQ=255) aGCACATGATGATGTGCGCAGGATTGCTCCGCCAGCCAGCTTAACTGCCCCAACAAGGGTTGCAGGGTTTCCTGATTTCCATCAAAACGCCCCCAGGCAGCACCATAGCCCATATCCAGCCCGGTATTGTTCCAGTGAATTTGCCGACTa < 2:34285/150‑1 (MQ=255) acaTGATGATGTGCGCAGGATTGCTCCGCCAGCCAGCTTAACTGCCCCAACAAGGGTTGCAGGGTTTCCTGATTTCCATCAAAACGCCCCCAGGCAGCACCATAGCCCATATCCAGCCCGGTATTGTTCCAGTGAATTTGCCGACTATTc < 1:1532110/150‑1 (MQ=255) caTGATGATGTGCGCAGGATTGCTCCGCCAGCCAGCTTAACTGCCCCAACAAGGGTTGCAGGGTTTCCTGATTTCCATCAAAACGCCCCCAGGCAGCACCATAGCCCATATCCAGCCCGGTATTGTTCCAGTGAATTTGCCGACTATTCa > 2:439384/1‑150 (MQ=255) | CATAACCTTCACCCTCTTTGTTGCGAATTGGCTGGGCGTAGAGCAGCAAATCACCCTGATCTAACGCCGTGCGAATGGTATTCAGCAATAGCACCTGTTTAGTGGTCTGCCCGGAAACCATCTCCTCTCTGCTATCCAGCGCCAGCACATGATGATGTGCGCAGGATTGCTCCGCCAGCCAGCTTAACTGCCCCAACAAGGGTTGCAGGGTTTCCTGATTTCCATCAAAACGCCCCCAGGCAGCACCATAGCCCATATCCAGCCCGGTATTGTTCCAGTGAATTTGCCGACTATTCA > NC_000913/2516275‑2516571 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |