| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 2,758,920 | C→T | 6.5% | intergenic (+64/‑65) | alpA → / → yfjI | CP4‑57 prophage; DNA‑binding transcriptional activator AlpA/CP4‑57 prophage; protein YfjI |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 2,758,920 | 0 | C | T | 6.5% | 379.0 / 10.5 | 122 | intergenic (+64/‑65) | alpA/yfjI | CP4‑57 prophage; DNA‑binding transcriptional activator AlpA/CP4‑57 prophage; protein YfjI |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (60/54); new base T (5/3); total (65/57) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.22e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.53e-01 | |||||||||||
Only 100 of 123 total aligned reads displayed.
GCGAATGCTCGGCGTGAAATCTGTCGGATGGATTGAGGCCGAGATTGATGAGTGGTTATCACAACGCTGTAAACTTATTTGAGGGTGTTACATGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCATGTTCAATGGTCGTCCTTTCCCTGTAGATGCATTTCCTAAAATTATCAGGAATGCAATTTATGAAGTGGAACAGCATACGCAGG > NC_000913/2758775‑2759069 | gCGAATGCTCGGCGTGAAATCTGTCGGATGGATTGAGGCCGAGATTGATGAGTGGTTATCACAACGCTGTAAACTTATTTGAGGGTGTTACATGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTa < 2:1294352/150‑1 (MQ=255)gCGAATGCTCGGCGTGAAATCTGTCGGATGGATTGAGGCCGAGATTGATGAGTGGTTATCACAACGCTGTAAACTTATTTGAGGGTGTTACATGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTa < 2:1158246/150‑1 (MQ=255) cGAATGCTCGGCGTGAAATCTGTCGGATGGATTGAGGCCGAGATTGATGAGTGGTTATCACAACGCTGTAAACTTATTTGAGGGTGTTACATGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTaa > 1:134693/1‑150 (MQ=255) cGAATGCTCGGCGTGAAATCTGTCGCATGGATTGAGGCCGAGATTGATGAGTGGTTATCACAACGCTGTAAACTTATTTGAGGGTGTTACATGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTaa > 2:534441/1‑150 (MQ=255) gCTCGGCGTGAAATCTGTCGGATGGATTGAGGCCGAGATTGATGAGTGGTTATCACAACGCTGTAAACTTATTTGAGGGTGTTACATGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCg < 1:624723/150‑1 (MQ=255) cTCGGCGTGAAATCTGTCGGATGGATTGAGGCCGAGATTGATGAGTGGTTATCACAACGCTGTAAACTTATTTGAGGGTGTTACATGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCgg < 2:1390621/150‑1 (MQ=255) gCGTGAAATCTGTCGGATGGATTGAGGCCGAGATTGATGAGTGGTTATCACAACGCTGTAAACTTATTTGAGGGTGTTACATGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTTTAAACATACTGCTATTTCACCTATTAATGGCGG‑aaat > 1:543198/1‑148 (MQ=255) gAAATCTGTCGGATGGATTGAGGCCGAGATTGATGAGTGGTTATCACAACGCTGTAAACTTATTTGAGGGTGTTACATGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCa < 1:411072/150‑1 (MQ=255) aaaTCTGTCGGATGGATTGAGGCCGAGATTGATGAGTGGTTATCACAACGCTGTAAACTTATTTGAGGGTGTTACATGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCTATTAATGGCGG‑aaatagcag < 2:110461/150‑8 (MQ=255) aaaTCTGTCGGATGGATTGAGGCCGAGATTGATGAGTGGTTATCACAACGCTGTAAACTTATTTGAGGGTGTTACATGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCTATTAATGGCGG‑aaatagcag < 1:347053/150‑8 (MQ=255) aaTCTGTCGGATGGATTGAGGCCGAGATTGATGAGTGGTTATCACAACGCTGTAAACTTATTTGAGGGTGTTACATGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCata < 1:1117936/150‑1 (MQ=255) tGTCGGATGGATTGAGGCCGAGATTGATGAGTGGTTATCACAACGCTGTAAACTTATTTGAGGGTGTTACATGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTg > 1:1125470/1‑150 (MQ=255) tGTCGGATGGATTGAGGCCGAGATTGATGAGTGGTTATCACAACGCTGTAAACTTATTTGAGGGTGTTACATGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTg > 2:1169267/1‑150 (MQ=255) cGGATGGATTGAGGCCGAGATTGATGAGTGGTTATCACAACGCTGTAAACTTATTTGAGGGTGTTACATGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTa > 1:1456816/1‑150 (MQ=255) gatggatTGAGGCCGAGATTGATGAGTGGTTATCACAACGCTGTAAACTTATTTGAGGGTGTTACATGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTaaa > 2:27704/1‑150 (MQ=255) gatggatTGAGGCCGAGATTGATGAGTGGTTATCACAACGCTGTAAACTTATTTGAGGGTGTTACATGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTaaa > 2:22540/1‑150 (MQ=255) atggatTGAGGCCGAGATTGATGAGTGGTTATCACAACGCTGTAAACTTATTTGAGGGTGTTACATGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAAc < 2:1301697/150‑1 (MQ=255) tggatTGAGGCCGAGATTGATGAGTGGTTATCACAACGCTGTAAACTTATTTGAGGGTGTTACATGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACa < 2:1102806/150‑1 (MQ=255) tGAGGCCGAGATTGATGAGTGGTTATCACAACGCTGTAAACTTATTTGAGGGTGTTACATGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTc < 1:817177/150‑1 (MQ=255) gAGGCCGAGATTGATGAGTGGTTATCACAACGCTGTAAACTTATTTGAGGGTGTTACATGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCt > 1:500714/1‑150 (MQ=255) gAGGCCGAGATTGATGAGTGGTTATCACAACGCTGTAAACTTATTTGAGGGTGTTACATGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCt > 2:854041/1‑150 (MQ=255) ggCCGAGATTGATGAGTGGTTATCACAACGCTGTAAACTTATTTGAGGGTGTTACATGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCtta > 2:1325586/1‑150 (MQ=255) ggCCGAGATTGATGAGTGGTTATCACAACGCTGTAAACTTATTTGAGGGTGTTACATGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCtta > 1:1302092/1‑150 (MQ=255) ccGAGATTGATGAGTGGTTATCACAACGCTGTAAACTTATTTGAGGGTGTTACATGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCttaat > 2:1023061/1‑150 (MQ=255) ccGAGATTGATGAGTGGTTATCACAACGCTGTAAACTTATTTGAGGGTGTTACATGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCttaat < 2:372000/150‑1 (MQ=255) cGAGATTGATGAGTGGTTATCACAACGCTGTAAACTTATTTGAGGGTGTTACATGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCttaatt < 1:79708/150‑1 (MQ=255) ttGATGAGTGGTTATCACAACGCTGTAAACTTATTTGAGGGTGTTACATGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTtaatttaatt < 2:702886/150‑1 (MQ=255) tgatgaGTGGTTATCACAACGCTGTAAACTTATTTGAGGGTGTTACATGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATttaatta > 2:1327695/1‑150 (MQ=255) tgatgaGTGGTTATCACAACGCTGTAAACTTATTTGAGGGTGTTACATGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATttaatta < 2:16234/150‑1 (MQ=255) gatgaGTGGTTATCACAACGCTGTAAACTTATTTGAGGGTGTTACATGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGATAAACAATTTCTTAATttaattaa > 1:658288/1‑150 (MQ=255) gaGTGGTTATCACAACGCTGTAAACTTATTTGAGGGTG‑TACATGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATaa > 2:533153/1‑150 (MQ=255) aGTGGTTATCACAACGCTGTAAACTTATTTGAGGGTGTTACATGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATaa > 2:1379988/1‑150 (MQ=255) tGGTTATCACAACGCTGTAAACTTATTTGAGGGTGTTACATGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAaga > 2:1129309/1‑150 (MQ=255) gTTATCACAACGCTGTAAACTTATTTGAGGGTGTTACATGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAgg > 1:1453188/1‑150 (MQ=255) tATCACAACGCTGTAAACTTATTTGAGGGTGTTACATGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCa < 2:197182/150‑1 (MQ=255) tATCACAACGCTGTAAACTTATTTGAGGGTGTTACATGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCa > 1:224593/1‑150 (MQ=255) acaACGCTGTAAACTTATTTGAGGGTGTTACATGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGc > 2:84678/1‑150 (MQ=255) acaACGCTGTAAACTTATTTGAGGGTGTTACATGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGc < 1:845023/150‑1 (MQ=255) caACGCTGTAAACTTATTTGAGGGTGTTACATGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCa < 2:7577/150‑1 (MQ=255) caACGCTGTAAACTTATTTGAGGGTGTTACATGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCa < 1:1023061/150‑1 (MQ=255) caACGCTGTAAACTTATTTGAGGGTGTTACATGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCa > 2:1508396/1‑150 (MQ=255) tGTAAACTTATTTGAGGGTGTTACATGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCATGTTCa > 1:188112/1‑150 (MQ=255) tGTAAACTTATTTGAGGGTGTTACATGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCATGTTCa > 2:1015273/1‑150 (MQ=255) aaCTTATTTGAGGGTGTTACATTAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCATGTTCAATgg < 1:522930/150‑1 (MQ=255) cTTATTTGAGGGTGTTACATGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCTG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCATGTTCAATGgtc < 1:1241148/150‑1 (MQ=255) cTTATTTGAGGGTGTTACATGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCATGTTCAATGgtc > 1:500462/1‑150 (MQ=255) tATTTGAGGGTG‑TACATGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCATGTTCAATGgtcgtc < 1:533153/150‑1 (MQ=255) ttGAGGGTGTTACATGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTCAATTAAATAAGAGGCATTGCATGTTCAATGGTCGTCCt < 2:134693/150‑1 (MQ=255) gggTGTTACATGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCATGTTCAATGGTCGTCCTTTcc > 2:753400/1‑150 (MQ=255) gggTGTTACATGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCATGTTCAATGGTCGTCCTTTcc < 2:252859/150‑1 (MQ=255) ggTGTTACATGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCATGTTCAATGGTCGTCCTTTccc < 1:75863/150‑1 (MQ=255) ggTGTTACATGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCATGTTCAATGGTCGTCCTTTccc < 2:496433/150‑1 (MQ=255) gtgtTACATGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCATGTTCAATGGTCGTCCTTTCCCt > 2:833729/1‑150 (MQ=255) tgtTACATGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCATGTTCAATGGTCGTCCTTTCCCTg < 1:129547/150‑1 (MQ=255) ttACATGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCATGTTCAATGGTCGTCCTTTCCCTGTa < 1:654039/150‑1 (MQ=255) ttACATGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCATGTTCAATGGTCGTCCTTTCCCTGTa < 1:27704/150‑1 (MQ=255) tACATGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTTATTAAATAAGAGGCATTGCATGTTCAATGGTCGTCCTTTCCCTGTAg > 1:874994/1‑150 (MQ=255) tACATGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCAGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCATGTTCAATGGTCGTCCTTTCCCTGTAg > 2:382921/1‑150 (MQ=255) aCATGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCATGTTCAATGGTCGTCCTTTCCCTGTAGa > 2:505661/1‑150 (MQ=255) tGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCATGTTCAATGGTCGTCCTTTCCCTGTAGATGc < 1:538771/150‑1 (MQ=255) aaTTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCttaatt > 2:249804/1‑95 (MQ=255) aaTTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCttaatt < 1:249804/95‑1 (MQ=255) aTTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCATGTTCAATGGTCGTCCTTTCCCTGTAGATGCAtt < 1:1015273/150‑1 (MQ=255) tCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCATGTTCAATGGTCGTCCTTTCCCTGTAGATGCATTTc > 2:1208031/1‑150 (MQ=255) aTACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCATGTTCAATGGTCGTCCTTTCCCTGTAGATGCATTTCCt < 1:833729/150‑1 (MQ=255) tACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCATGTTCAATGGTCGTCCTTTCCCTGTAGATGCa < 2:1492504/143‑1 (MQ=255) tACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCATGTTCAATGGTCGTCCTTTCCCTGTAGATGCa > 1:1492504/1‑143 (MQ=255) aCTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCATGTTCAATGGTCGTCCTTTCCCTGTAGATGCATTTCCTaa < 1:1169267/150‑1 (MQ=255) cTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCATGTTAAATGGTCGTCCTTTCACTGTAGATGCAGTTCGTaaa > 2:647655/1‑150 (MQ=255) cAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCATGTTCAATGGTCGTCCTTTCCCTGTAGATGCATTTCCTAAAAt > 1:364126/1‑150 (MQ=255) aaaTTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCATGTTCAATGGTCGTCCTTTCCCTGTAGATGCATTTCCTAAAAt < 1:854041/149‑1 (MQ=255) ttGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCATGTTCAATGGTCGTCCTTTCCCTGTAGATGCATTTCCTAAAATTAt < 2:1415904/150‑1 (MQ=255) ttGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCATGTTCAATGGTCGTCCTTTCCCTGTAGATGCATTTCCTAAAATTAt < 2:1421267/150‑1 (MQ=255) tccTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCATGTTCAATGGTCGTCCTTTCCCTGTAGATGCATTTCCTAAAATTAta > 1:114499/3‑149 (MQ=255) gCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCATGTTCAATGGTCGTCCTTTCCCTGTAGATGCATTTCCTAAAATTATCa < 1:753400/150‑1 (MQ=255) tGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCATGTTCAATGGTCGTCCTTTCCCTGTAGATGCATTTCCTAAAATTATCAgg > 1:706974/1‑150 (MQ=255) tCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCATGTTCAATGGTCGTCCTTTCCCTGTAGATGCATTTCCTAAAATTATCAGGaa < 1:298321/150‑1 (MQ=255) cATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCATGTTCAATGGTCGTCCTTTCCCTGTAGATGCATTTCCTAAAATTATCAGGAAt > 2:269355/1‑150 (MQ=255) gAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCATGTTCAATGGTCGTCCTTTCCCTGTAGATGCATTTCCTAAAATTATCAGGAATGCAAt < 2:1456816/150‑1 (MQ=255) gtAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCATGTTCAATGGTCGTCCTTTCCCTGTAGATGCATTTCCTAAAATTATCAGGAATGCAATTTAt > 2:421160/1‑150 (MQ=255) tAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCATGTTCAATGGTCGTCCTTTCCCTGTAGATGCATTTCCTAAAATTa < 1:450329/132‑1 (MQ=255) tAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCATGTTCAATGGTCGTCCTTTCCCTGTAGATGCATTTCCTAAAATTATCAGGAATGCAATTTATg < 1:1508396/150‑1 (MQ=255) tAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCATGTTCAATGGTCGTCCTTTCCCTGTAGATGCATTTCCTAAAATTATCAGGAATGCAATTTATg > 1:273842/1‑150 (MQ=255) tAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCATGTTCAATGGTCGTCCTTTCCCTGTAGATGCATTTCCTAAAATTATCAGGAATGCAATTTATg > 1:1403327/1‑150 (MQ=255) aaCATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCATGTTCAATGGTCGTCCTTTCCCTGTAGATGCATTTcc < 2:476442/122‑1 (MQ=255) aaCATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCATGTTCAATGGTCGTCCTTTCCCTGTAGATGCATTTCCTAAAATTATCAGGAATGCAATTTATGaa > 1:765313/1‑150 (MQ=255) aTCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCATGTTCAATGGTCGTCCTTTCCCTGTAGATGCATTTCCTAAAATTATCAGGAATGCAATTTATGAAGTg < 2:224593/150‑1 (MQ=255) tCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCATGTTCAATGGTCGTCCTTTCCCTGTAGATGCATTTCCTAAAATTATCAGGAATGCAATTTATGAAGTgg < 1:829206/150‑1 (MQ=255) atggctattCCGCTATTAATGGCGGAAATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCATGTTCAATGGTCGTCCTTTCCCTGTAGATGCATTTCCTAAAATTATCAGGAATGCAATTTATGAAGTGGa > 2:1151841/8‑150 (MQ=255) atggctattCCGCTATTAATGGCGGAAATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCATGTTCAATGGTCGTCCTTTCCCTGTAGATGCATTTCCTAAAATTATCAGGAATGCAATTTATGAAGTGGa > 1:511970/8‑150 (MQ=255) tGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCATGTTCAATGGTCGTCCTTTCCCTGTAGATGCATTTCCTAAAATTATCAGGAATGCAATTTATGAAGTGGAAc < 2:341516/150‑1 (MQ=255) gCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCATGTTCAATGGTCGTCCTTTCCCTGTAGATGCATTTCCTAAAATTATCAGGAATGCAATTTATGAAGTGGAACa > 1:1427518/1‑150 (MQ=255) tattCCGCTATTAATGGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCATGTTCAATGGTCGTCCTTTCCCTGTAGATGCATTTCCTAAAATTATCAGGAATGCAATTTATGAAGTGGAACAGCa > 1:45796/3‑150 (MQ=255) ttCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCATGTTCAATGGTCGTCCTTTCCCTGTAGATGCATTTCCTAAAATTATCAGGAATGCAATTTATGAAGTGGAACAGCATa < 1:857818/150‑1 (MQ=255) ttCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCATGTTCAATGGTCGTCCTTTCCCTGTAGATGCATTTCCTAAAATTATCAGGAATGCAATTTATGAAGTGGAACAGCATa > 1:573076/1‑150 (MQ=255) tCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCATGTTCAATGGTCGTCCTTTCCCTGTAGATGCATTTCCTAAAATTATCAGGAATGCAATTTATGAAGTGGAACAGCATAc > 2:1453659/1‑150 (MQ=255) ccGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCATGTTCAATGGTCGTCCTTTCCCTGTAGATGCATTTCCTAAAATTATCAGGAATGCAATTTATGAAGTGGAACAGCATACg > 2:146819/1‑150 (MQ=255) ccGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCATGTTCAATGGTCGTCCTTTCCCTGTAGATGCATTTCCTAAAATTATCAGGAATGCAATTTATGAAGTGGAACAGCATACg > 2:741116/1‑150 (MQ=255) cGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCATGTTCAATGGTCGTCCTTTCCCTGTAGATGCATTTCCTAAAATTATCAGGAATGCAATTTATGAAGTGGAACAGCATACGc > 1:811010/1‑150 (MQ=255) cATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCATGTTCAATGGTCGTCCTTTCCCTGTAGATGCATTTCCTAAAATTATCAGGAATGCAATTTATGAAGTGGAACAGCATACGCAgg > 2:1193442/1‑150 (MQ=255) | GCGAATGCTCGGCGTGAAATCTGTCGGATGGATTGAGGCCGAGATTGATGAGTGGTTATCACAACGCTGTAAACTTATTTGAGGGTGTTACATGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCATGTTCAATGGTCGTCCTTTCCCTGTAGATGCATTTCCTAAAATTATCAGGAATGCAATTTATGAAGTGGAACAGCATACGCAGG > NC_000913/2758775‑2759069 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |