Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 2,776,135 | A→C | 6.7% | N73H (AAT→CAT) | yfjX → | CP4‑57 prophage; putative antirestriction protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 2,776,135 | 0 | A | C | 6.7% | 275.8 / 10.8 | 90 | N73H (AAT→CAT) | yfjX | CP4‑57 prophage; putative antirestriction protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (57/27); new base C (3/3); total (60/30) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.96e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.96e-01 |
AGGTACCCGATGAACAGCATATCCGCTTCTGGCCGCAGCACTTTGGCACCATCCCGCAGTGGATAACGCTGGAACCGCGCATTTTCGCCTGGATGGACCGCTTCTGTGATGAGTACTGCGGGGGTATCTGGTCCTTTTACACGCTCAGCAATGGCGGAGCGTTTATGGCTCCTGATGCTGACGGTGACGATAAATGGCATTTGCTCAACGGCATGAATGGCAATGGTGCGGAAATGAGCGCGGAAGCCGCAGGTATCGCTGTCTGCCTGATTGAATATAGCCATCACGCCTGCCTCA > NC_000913/2775986‑2776282 | aGGTACCCGATGAACAGCATATCCGCTTCTGGCCGCAGCACTTTGGCACCATCCCGCAGTGGATAACGCTGGAACCGCGCATTTTCGCCTGGATGGACCGCTTCTGTGATGAGTACTGCGGGGGTATCTGGTCCTTTTACACGCTCAGCa < 2:944543/150‑1 (MQ=255) aCCCGATGAACAGCATATCCGCTTCTGGCCGCAGCACTTTGGCACCATCCCGCAGTGGATAACGCTGGAACCGCGCATTTTCGCCTGGATGGACCGCTTCTGTGATGAGTACTGCGGGGGTATCTGGTCCTTTTACACGCTCAGCAATgg > 2:22164/1‑150 (MQ=255) cGATGAACAGCATATCCGCTTCTGGCCGCAGCACTTTGGCACCATCCCGCAGTGGATAACGCTGGAACCGCGCATTTTCGCCTGGATGGACCGCTTCTGTGATGAGTACTGCGGGGGTATCTGGTCCTTTTACACGCTCAGCAATGGCgg > 1:210650/1‑150 (MQ=255) aCAGCATATCCGCTTCTGGCCGCAGCACTTTGGCACCATCCCGCAGTGGATAACGCTGGAACCGCGCATTTTCGCCTGGATGGACCGCTTCTGTGATGAGTACTGCGGGGGTATCTGGTCCTTTTACACGCTCCGCCATTGCTGAGCGtg < 2:233144/150‑2 (MQ=255) gCATATCCGCTTCTGGCCGCAGCACTTTGGCACCATCCCGCAGTGGATAACGCTGGAACCGCGCATTTTCGCCTGGATGGACCGCTTCTGTGATGAGTACTGCGGGGGTATCTGGTCCTTTTACACGCTCAGCAATGGCGGAGCGTTTAt > 1:606972/1‑150 (MQ=255) atatCCGCTTCTGGCCGCAGCACTTTGGCACCATCCCGCAGTGGATAACGCTGGAACCGCGCATTTTCGCCTGGATGGACCGCTTCTGTTATGAGTACTGCGGGGGTATCTGGTCCTTTTACACGCTCCGCCATTGCTGAGCGTGTaaaa < 2:1458573/150‑4 (MQ=37) tatCCGCTTCTGTCCGCAGCACTTTGGCACCATCCCGCAGTGTATAACGCTGTAAACGCGCATTTTCGCCTGGATGGACCGCTTCTGTGATGAGTACTGCGGGGGTATCTTGTCCTTTTACACGCTCCGCCATTGCTGAGCGTGTaaaag < 2:1001048/150‑5 (MQ=37) tatCCGCTTCTGGCCGCAGCACTTTGGCACCATCCCGCAGTGGATAACGCTGGAACCGCGCATTTTCGCCTGGATGGACCGCTTCTGTGATGAGTACTGCGGGGGTATCTGGTCCTTTTACACGCTCAGCAATGGCGGAGCGTTTATGGc > 2:766187/1‑150 (MQ=255) atCCGCTTCTGGCCGCAGCACTTTGGCACCATCCCGCAGTGGATAACGCTGGAACCGCGCATTTTCGCCTGGATGGACCGCTTCTGTGATGAGTACTGCGGGGGTATCTGGTCCTTTTACACGCTCAGCAATGGCGGCGCGTTTATGGcg > 2:1428115/1‑149 (MQ=255) atCCGCTTCTGGCCGCAGCACTTTGGCACCATCCCGCAGTGGATAACGCTGGAACCGCGCATTTTCGCCTGGATGGACCGCTTCTGTGATGAGTACTGCGGGGGTATCTGGTCCTTTTACACGCTCAGCAATGGCGGAGCGTTTATGGCt > 1:713584/1‑150 (MQ=255) atCCGCTTCTGGCCGCAGCACTTTGGCACCATCCCGCAGTGGATAACGCTGGAACCGCGCATTTTCGCCTGGATGGACCGCTTCTGTGATGAGTACTGCGGGGGTATCTGGTCCTTTTACACGCTCAGCAATGGCGGAGCGTTTATGGCt > 2:760076/1‑150 (MQ=255) ccGCTTCTGGCCGCAGCACTTTGGCACCATCCCGCAGTGGATAACGCTGGAACCGCGCATTTTCGCCTGGATGGACCGCTTCTGTGATGAGTACTGCGGGGGTATCTGGTCCTTTTACACGCTCAGCAATGGCGGAGCGTTTATGGCTcc < 2:568060/150‑1 (MQ=255) cGCTTCTGGCCGCAGCACTTTGGCACCATCCCGCAGTGGATAACGCTGGAACCGCGCATTTTCGCCTGGATGGACCGCTTCTGTGATGAGTACTGCGGGGGTATCTGGTCCTTTTACACGCTCAGCAATGGCGGAGCGTTTATGGCTCCt < 2:1467398/150‑1 (MQ=255) tCTGGCCGCAGCACTTTGGCACCATCCCGCAGTGGATAACGCTGGAACCGCGCATTTTCGCCTGGATGGACCGCTTCTGTGATGAGTACTGCGGGGGTATCTGGTCCTTTTACACGCTCAGCAATGGCGGAGCGTTTATGGCTCCTGATg > 2:1331657/1‑150 (MQ=255) cTGGCCGCAGCACTTTGGCACCATCCCGCAGTGGATAACGCTGGAACCGCGCATTTTCGCCTGGATGGACCGCTTCTGTGATGAGTACTGCGGGGGTATCTGGTCCTTTTACACGCTCAGCAATGGCGGAGCGTTTATGGCTCCTGATGc > 2:1111244/1‑150 (MQ=255) cTGGCCGCAGCACTTTGGCACCATCCCGCAGTGGATAACGCTGGAACCGCGCATTTTCGCCTGGATGGACCGCTTCTGTGATGAGTACTGCGGGGGTATCTGGTCCTTTTACACGCTCAGCAATGGCGGAGCGTTTATGGCTCCTGATGc < 1:1002521/150‑1 (MQ=255) cagcaCTTTGGCACCATCCCGCAGTGGATAACGCTGGAACCGCGCATTTTCGCCTGGATGGACCGCTTCTGTGATGAGTACTGCGGGGGTATCTGGTCCTTTTACACGCTCAGCAATGGCGGAGCGTTTATGGCTCCTGATGCTGACGGt < 2:919464/150‑1 (MQ=255) cagcaCTTTGGCACCATCCCGCAGTGGATAACGCTGGAACCGCGCATTTTCGCCTGGATGGACCGCTTCTGTGATGAGTACTGCGGGGGTATCTGGTCCTTTTACACGCTCAGCAATGGCGGAGCGTTTATGGCTCCTGATGCTGACGGt < 2:213589/150‑1 (MQ=255) caCTTTGGCACCATCCCGCAGTGGATAACGCTGGAACCGCGCATTTTCGCCTGGATGGACCGCTTCTGTGATGAGTACTGCGGGGGTATCTGGTCCTTTTACACGCTCAGCAATGGCGGAGCGTTTATGGCTCCTGATGCTGACGGTGAc < 1:1329444/150‑1 (MQ=255) caCTTTGGCACCATCCCGCAGTGGATAACGCTGGAACCGCGCATTTTCGCCTGGATGGACCGCTTCTGTGATGAGTACTGCGGGGGTATCTGGTCCTTTTACACGCTCAGCAATGGCGGAGCGTTTATGGCTCCTGATGCTGACGGTGAc > 1:39657/1‑150 (MQ=255) gCACCATCCCGCAGTGGATAACGCTGGAACCGCGCATTTTCGCCTGGATGGACCGCTTCTGTGATGAGTACTGCGGGGGTATCTGGTCCTTTTACACGCTCAGCAATGGCGGAGCGTTTATGGCTCCTGATGCTGACGGTGACGATAAAt > 1:1431381/1‑150 (MQ=255) cACCATCCCGCAGTGGATAACGCTGGAACCGCGCATTTTCGCCTGGATGGACCGCTTCTGTGATGAGTACTGCGGGGGTATCTGGTCCTTTTACACGCTCAGCAATGGCGGAGCg > 2:559417/1‑115 (MQ=255) cACCATCCCGCAGTGGATAACGCTGGAACCGCGCATTTTCGCCTGGATGGACCGCTTCTGTGATGAGTACTGCGGGGGTATCTGGTCCTTTTACACGCTCAGCAATGGCGGAGCg < 1:559417/115‑1 (MQ=255) cACCATCCCGCAGTGGATAACGCTGGAACCGCGCATTTTCGCCTGGATGGACCGCTTCTGTGATGAGTACTGCGGGGGTATCTGGTCCTTTTACACGCTCAGCAATGGCGGAGCGTTTATGGCTCCTGATGCTGACGGTGACGATAAATg > 1:475449/1‑150 (MQ=255) cACCATCCCGCAGTGGATAACGCTGGAACCGCGCATTTTCGCCTGGATGGACCGCTTCTGTGATGAGTACTGCGGGGGTATCTGGTCCTTTTACACGCTCAGCAATGGCGGAGCGTTTATGGCTCCTGATGCTGACGGTGACGATAAATg < 2:683174/150‑1 (MQ=255) ccATCCCGCAGTGGATAACGCTGGAACCGCGCATTTTCGCCTGGATGGACCGCTTCTGTGATGAGTACTGCGGGGGTATCTGGTCCTTTTACACGCTCAGCAATGGCGGAGCGTTTATGGCTCCTGATGCTGACGGTGACGATAAATGGc > 1:1156472/1‑150 (MQ=255) ccATCCCGCAGTGGATAACGCTGGAACCGCGCATTTTCGCCTGGATGGACCGCTTCTGTGATGAGTACTGCGGGGGTATCTGGTCCTTTTACACGCTCAGCAATGGCGGAGCGTTTATGGCTCCTGATGCTGACGGTGACGATAAATGGc < 2:713584/150‑1 (MQ=255) tCCCGCAGTGGATAACGCTGGAACCGCGCATTTTCGCCTGGATGGACCGCTTCTGTGATGAGTACTGCGGGGGTATCTGGTCCTTTTACACGCTCAGCAATGGCGGAGCGTTTATGGCTCCTGATGCTGACGGTGACGATAAATGGCAtt > 1:788834/1‑150 (MQ=255) cGCAGTGGATAACGCTGGAACCGCGCATTTTCGCCTGGATGGACCGCTTCTGTGATGAGTACTGCGGGGGTATCTGGTCCTTTTACACGCTCAGCAATGGCGGAGCGTTTATGGCTCCTGATGCTGACGGTGACGATAAATGGCATTTGc < 1:1111244/150‑1 (MQ=255) gCAGTGGATAACGCTGGAACCGCGCATTTTCGCCTGGATGGACCGCTTCTGTGATGAGTACTGCGGGGGTATCTGGTCCTTTTACACGCTCAGCAATGGCGGAGCGTTTATGGCTCCTGATGCTGACGGTGACGATAAATGGCATTTGCt > 2:981504/1‑150 (MQ=255) cAGTGGATAACGCTGGAACCGCGCATTTTCGCCTGGATGGACCGCTTCTGTGATGAGTACTGCGGGGGTATCTGGTCCTTTTACACGCTCAGCAATGGCGGAGCGTTTATGGCTCCTGATGCTGACGGTGACGATAAATGGCATTTGCTc < 1:283633/150‑1 (MQ=255) aGTGGATAACGCTGGAACCGCGCATTTTCGCCTGGATGGACCGCTTCTGTGATGAGTACTGCGGGGGTATCTGGTCCTTTTACACGCTCAGCAATGGCGGAGCGTTTATGGCTCCTGATGCTGACGGTGACGATAAATGGCATTTGCTCa > 1:508457/1‑150 (MQ=255) tGGATAACGCTGGAACCGCGCATTTTCGCCTGGATGGACCGCTTCTGTGATGAGTACTGCGGGGGTATCTGGTCCTTTTACACGCTCAGCAATGGCGGAGGGTTTATGGCTCCTGATGCTGACGGTGACGATAAATGGCATTTGCTCAAc > 1:1492971/1‑150 (MQ=255) ggATAACGCTGGAACCGCGCATTTTCGCCTGGATGGACCGCTTCTGTGATGAGTACTGCGGGGGTATCTGGTCCTTTTACACGCTCAGCAATGGCGGAGCGTTTATGGCTCCTGATGCTGACGGTGACGATAAATGGCATTTGCTCAACg > 2:16045/1‑150 (MQ=255) ggATAACGCTGGAACCGCGCATTTTCGCCTGGATGGACCGCTTCTGTGATGAGTACTGCGGGGGTATCTGGTCCTTTTACACGCTCAGCAATGGCGGAGCGTTTATGGCTCCTGATGCTGACGGTGACGATAAATGGCATTTGCGCAAcc > 2:683021/1‑149 (MQ=255) aTAACGCTGGAACCGCGCATTTTCGCCTGGATGGACCGCTTCTGTGATGAGTACTGCGGGGGTATCTGGTCCTTTTACACGCTCAGCAATGGCGGAGCGTTTATGGCTCCTGATGCTGACGGTGACGATAAATGGCATTTGCTCAACGGc > 1:481189/1‑150 (MQ=255) tAACGCTGGAACCGCGCATTTTCGCCTGGATGGACCGCTTCTGTGATGAGTACTGCGGGGGTATCTGGTCCTTTTACACGCTCAGCAATGGCGGAGCGTTTATGGCTCCTGATGCTGAc < 1:1082825/119‑1 (MQ=255) tAACGCTGGAACCGCGCATTTTCGCCTGGATGGACCGCTTCTGTGATGAGTACTGCGGGGGTATCTGGTCCTTTTACACGCTCAGCAATGGCGGAGCGTTTATGGCTCCTGATGCTGAc > 2:1082825/1‑119 (MQ=255) tAACGCTCGAACCGCGCATTTTCGCCTGGATGGACCGCTTCTGTGATGAGTACTGCGGGGGTATCTGCTCCTTTTACACGCTCAGCAATGGCGGAGCGTTTATGGCTCCTGATGCTGACGGTGACGATAAATGGCATTTGCTCAACGGCa > 2:43818/1‑150 (MQ=255) aCGCTGGAACCGCGCATTTTCGCCTGGATGGACCGCTTCTGTGATGAGTACTGCGGGGGTATCTGGTCCTTTTACACGCTCAGCAATGGCGGAGCGTTTATGGCTCCTGATGCTGACGGTGACGATAAATGGCATTTGCTCAACGGCATg > 2:246951/1‑150 (MQ=255) cTGGAACCGCGCATTTTCGCCTGGATGGACCGCTTCTGTGATGAGTACTGCGGGGGTATCTGGTCCTTTTACACGCTCAGCAATGGCGGAGCGTTTATGGCTCCTGATGCTGACGGTGACGATAAATGGCATTTGCTCAACGGCATGAAt > 1:1453546/1‑150 (MQ=255) aCCGCGCATTTTCGCCTGGATGGACCGCTTCTGTGATGAGTACTGCGGGGGTATCTGGTCCTTTTACACGCTCAGCAATGGCGGAGCGTTTATGGCTCCTGATGCTGACGGTGACGATAAATGGCATTTGCTCAACGGCATGAATGGCaa > 1:566782/1‑150 (MQ=255) aCCGCGCATTTTCGCCTGGATGGACCGCTTCTGTGATGAGTACTGCGGGGGTATCTGGTCCTTTTACACGCTCAGCAATGGCGGAGCGTTTATGGCTCCTGATGCTGACGGTGACGATAAATGGCATTTGCTCAACGGCATGAATGGCaa > 1:911967/1‑150 (MQ=255) cgcgCATTTTCGCCTGGATGGACCGCTTCTGTGATGAGTACTGCGGGGGTATCTGGTCCTTTTACACGCTCAGCAATGGCGGAGCGTTTATGGCTCCTGATGCTGACGGTGACGATAAATGGCATTTGCTCAACGGCATGAATGGCAATg > 1:900685/1‑150 (MQ=255) cgcgCATTTTCGCCTGGATGGACCGCTTCTGTGATGAGTACTGCGGGGGTATCTGGTCCTTTTACACGCTCAGCAATGGCGGAGCGTTTATGGCTCCTGATGCTGACGGTGACGATAAATGGCATTTGCTCAACGGCATGAATGGCAATg > 2:1294687/1‑150 (MQ=255) ttttCGCCTGGATGGACCGCTTCTGTGATGAGTACTGCGGGGGTATCTGGTCCTTTTACACGCTCAGCAATGGCGGAGCGTTTATGGCTCCTGATGCTGACGGTGACGATAAATGGCATTTGCTCAACGGCATGAATGGCAATGGTGCgg > 2:582462/1‑150 (MQ=255) ttttCGCCTGGATGGACCGCTTCTGTGATGAGTACTGCGGGGGTATCTGGTCCTTTTACACGCTCAGCAATGGCGGAGCGTTTATGGCTCCTGATGCTGACGGTGACGATAAATGGCATTTGCTCAACGGCATGAATGGCAATGGTGCgg > 2:1374133/1‑150 (MQ=255) tggatggaCCGCTTCTGTGATGAGTACTTCGGGGGTATCTGGTCCTTTTACACCCTCAGCAATGGCGGAGCGTTTATCGCTCCTGATGCTGACGGTGACGATAAATGGCATTTCCTCAACGGCATGAATGTCAATCGTGACGAAATAAgc > 2:1156381/1‑150 (MQ=37) ggatggaCCGCTTCTGGGATGAGTACTGCGGGGGTATCTGGTCCTTTTACACGCTCAGCAATGGCGGAGCGTTTATGGCTCCTGATGCTGACGGTGACGATAAATGGCATTTGCTCAACGGCATGAATGGCAATGGTGCGGAAATGAgcg < 1:747292/150‑1 (MQ=255) gatggaCCGCTTCTGTGATGAGTACTGCGGGGGTATCTGGTCCTTTTACACGCTCAGCAATGGCGGAGCGTTTATGGCTCCTGATGCTGACGGTGACGATAAATGGCATTTGCTCAACGGCATGAATGGCAATGGTGCGGAAATGAgcgc > 1:203495/1‑150 (MQ=255) tggaCCGCTTCTGTGATGAGTACTGCGGGGGTATCTGGTCCTTTTACACGCTCAGCAATGGCGGAGCGTTTATGGCTCCTGATGCTGACGGTGACGATAAATGGCATTTGCTCAACGGCATGAATGGCAATGGTGCGGAAATGAGCGCgg > 1:754289/1‑150 (MQ=255) aCCGCTTCTGTGATGAGTACTGCGGGGGTATCTGGTCCTTTTACACGCTCAGCAATGGCGGAGCGTTTATGGCTCCTGATGCTGACGGTGACGATAAATGGCATTTGCTCAACGGCATGAATGGCAATGGTGCGGAAATGAGCGCGGAAg > 2:902711/1‑150 (MQ=255) gCTTCTGTGATGAGTACTGCGGGGGTATCTGGTCCTTTTACACGCTCAGCAATGGCGGAGCGTTTATGGCTCCTGATGCTGACGGTGACGATAAATGGCATTTGCTCAACGGCATGAATGGCAATGGTGCGGAAATGAGCGCGGAAGCCg > 2:571756/1‑150 (MQ=255) cTTCTGTGATGAGTACTGCGGGGGTATCTGGTCCTTTTACACGCTCAGCAATGGCGGAGCGTTTATGGCTCCTGATGCTGACGGTGACGATAAATGGCATTTGCTCAACGGCATGAATGGCAATGGTGCGGAAATGAGCGCGGAAGCCGc < 2:754289/150‑1 (MQ=255) ttCTGTGATGAGTACTGCGGGGGTATCTGGTCCTTTTACACGCTCAGCAATGGCGGAGCGTTTATGGCTCCTGATGCTGACGGTGACGATAAATGGCATTTGCTCAACGGCATGAATGGCAATGGTGCGGAAATGAGCGCGGAAGCCGCa < 2:1302466/150‑1 (MQ=255) tCTGTGATGAGTACTGCGGGGGTATCTGGTCCTTTTACACGCTCAGCAATGGCGGAGCGTTTATGGCTCCTGATGCTGACGGTGACGATAAATGGCATTTGCTCAACGGCATGAATGGCAATGGTGCGGAAATGAGCGCGGAAGCCGCAg > 1:724232/1‑150 (MQ=255) gtgATGAGTACTGCGGGGGTATCTGGTCCTTTTACACGCTCAGCAATGGCGGAGCGTTTATGGCTCCTGATGCTGACGGTGACGATAAATGGCATTTGCTCAACGGCATGAATGGCAATGGTGCGGAAATGAGCGCGGAAGCCGCAGGTa < 2:1431381/150‑1 (MQ=255) gtgATGAGTACTGCGGGGGTATCTGGTCCTTTTACACGCTCAGCAATGGCGGAGCGTTTATGGCTCCTGATGCTGACGGTGACGATAAATGGCATTTGCTCAACGGCATGAATGGCAATGGTGCGGAAATGAGCGCGGAAGCCGCAGGTa > 1:1114685/1‑150 (MQ=255) tgatgaGTACTGCGGGGGTATCTGGTCCTTTTACACGCTCAGCAATGGCGGAGCGTTTATGGCTCCTGATGCTGACGGTGACGATAAATGGCATTTGCTCAACGGCATGAATGGCAATGGTGCGGAAATGAGCGCGGAAGCCGCAGGTAt < 1:766187/150‑1 (MQ=255) gTACTGCGGGGGTATCTGGTCCTTTTACACGCTCAGCAATGGCGGAGCGTTTATGGCTCCTGATGCTGACGGTGACGATAAATGGCATTTGCTCAACGGCATGAATGGCAATGGTGCGGAAATGAGCGCGGAAGCCGCAGGTATCGCTGt > 2:742543/1‑150 (MQ=255) cTGCGGGGGTATCTGGTCCTTTTACACGCTCAGCAATGGCGGAGCGTTTATGGCTCCTGATGCTGACGGTGACGATAAATGGCATTTGCTCAACGGCATGAATGGCAATGGTGCGGAAATGAGCGCGGAAGCCGCAGGTATCGCTGTCTg > 2:56166/1‑150 (MQ=255) tGCGGGGGTATCTGGTCCTTTTACACGCTCAGCAATGGCGGAGCGTTTATGGCTCCTGATGCTGACGGTGACGATAAATGGCATTTGCTCAACGGCATGAATGGCAATGGTGCGGAAATGAGCGCGGAAGCCGCAGGTATCGCTGTCTGc > 1:712627/1‑150 (MQ=255) gCGGGGGTATCTGGTCCTTTTACACGCTCAGCAATGGCGGAGCGTTTATGGCTCCTGATGCTGACGGTGACGATAAATGGCATTTGCTCAACGGCATGAATGGCAATGGTGCGGAAATGAGCGCGGAAGCCGCAGGTATCGCTGTCTGcc < 2:1453546/150‑1 (MQ=255) ggTATCTGGTCCTTTTACACGCTCAGCAATGGCGGAGCGTTTATGGCTCCTGATGCTGACGGTGACGATAAATGGCATTTGCTCAACGGCATGAATGGCAATGGTGCGGAAATGAGCGCGGAAGCCGCAGGTATCGCTGTCTGCCTGAtt < 1:16045/150‑1 (MQ=255) ggTATCTGGTCCTTTTACACGCTCAGCAATGGCGGAGCGTTTATGGCTCCTGATGCTGACGGTGACGATAAATGGCATTTGCTCAACGGCATGAATGGCAATGGTGCGGAAATGAGCGCGGAAGCCGCAGGTATCGCTGTCTGCCTGAtt < 2:210650/150‑1 (MQ=255) tATCTGGTCCTTTTACACGCTCAGCAATGGCGGAGCGTTTATGGCTCCTGATGCTGACGGTGACGATAAATGGCATTTGCTCAACGGCATGAATGGCAATGGTGCGGAAATGAGCGCGGAAGCCGCAGGTATCGCTGTCTGCCTGATTGa > 1:508930/1‑150 (MQ=255) tCTGGTCCTTTTACACGCGCAGCAATGGCGGAGCGTTTATGGCTCCTGATGCTGACGGTGACGATAAATGGCATTTGCTCAACGGCATGAATGGCAATGGTGCGGAAATGAGCGCGGAAGCCGCAGGTATCGCTGTCTGCCTGATTGAat < 2:1219877/150‑1 (MQ=255) cTGGTCCTTTTACACGCTCAGCAATGGCGGAGCGTTTATGGCTCCTGATGCTGACGGTGACGATAAATGGCATTTGCTCAACGGCATGAATGGCAATGGTGCGGAAATGAGCGCGGAAGCCGCAGGTATCGCTGTCTGCCTGATTGAata < 2:788834/150‑1 (MQ=255) cTGGTCCTTTTACACGCTCAGCAATGGCGGAGCGTTTATGGCTCCTGATGCTGACGGTGACGATAAATGGCATTTGCTCAACGGCATGAATGGCAATGGTGCGGAAATGAGCGCGGAAGCCGCAGGTATCGCTGTCTGCCTGATTGAata > 2:1408473/1‑150 (MQ=255) tGGTCCTTTTACACGCTCAGCAATGGCGGAGCGTTTATGGCTCCTGATGCTGACGGTGACGATAAATGGCATTTGCTCAACGGCATGAATGGCAATGGTGCGGAAATGAGCGCGGAAGCCGCAGGTATCGCTGTCTGCCTGATTGAatat > 2:714439/1‑150 (MQ=255) ggTCCTTTTACACGCTCAGCAATGGCGGAGCGTTTATGGCTCCTGATGCTGACGGTGACGATAAATGGCATTTGCTCAACGGCATGAATGGCAATGGTGCGGAAATGAGCGCGGAAGCCGCAGGTATCGCTGTCTGCCTGATTGAAtata > 2:551799/1‑150 (MQ=255) agTCCTTTTAAAAGCTCAACAATTGCGGATCTTTTATGGATACTGATGCTGACGTTTAATATAAATAGAATTTGCTCAACGGCATGAATGGCAATGGTGCGGAAATGAGCGCGGAAGCCGCAGGTATCGCTGTCTGCCTGATTGAAtata > 2:735328/2‑150 (MQ=255) gccataaacGCTCCGCCATTGCTGAGCGTTTATGGCTCCTGATGCTGACGGTGACGATAAATGGCATTTGCTCAACGGCATGAATGGCAATGGTGCGGAAATGAGCGCGGAAGCCGCAGGTATCGCTGTCTGCCTGATTGAATATAGCCa > 2:896955/8‑150 (MQ=255) cTTTTACACGCTCAGCAATGGCGGAGCGTTTATGGCTCCTGATGCTGACGGTGACGATAAATGGCATTTGCTCAACGGCATGAATGGCAATGGTGCGGAAATGAGCGCGGAAGCCGCAGGTATCGCTGTCTGCCTGATTGAATATAGCCa > 2:301211/1‑150 (MQ=255) ttttACACGCTCAGCAATGGCGGAGCGTTTATGGCTCCTGATGCTGACGGTGACGATAAATGGCATTTGCTCAACGGCATGAATGGCAATGGTGCGGAAATGAGCGCGGAAGCCGCAGGTATCGCTGTCTGCCTGATTGAATATAGCCAt < 1:474756/150‑1 (MQ=255) tttACACGCTCAGCAATGGCGGAGCGTTTATGGCTCCTGATGCTGACGGTGACGATAAATGGCATTTGCTCAACGGCATGAATGGCAATGGTGCGGAAATGAGCGCGGAAGCCGCAGGTATCGCTGTCTGCCTGATTGAATATAGCCATc > 2:1032625/1‑150 (MQ=255) tttACACGCTCAGCAATGGCGGAGCGTTTATGGCTCCTGATGCTGACGGTGACGATAAATGGCATTTGCTCAACGGCATGAATGGCAATGGTGCGGAAATGAGCGCGGAAGCCGCAGGTATCGCTGTCTGCCTGATTGAATATAGCCATc > 1:507035/1‑150 (MQ=255) cataaacGCTCCGCCATTGCTGAGCGTTTATGGCTCCTGATGCTGACGGTGACGATAAATGGCATTTGCTCAACGGCATGAATGGCAATGGTGCGGAAATGAGCGCGGAAGCCGCAGGTATCGCTGTCTGCCTGATTGAATATAGCCATc > 1:1531510/6‑150 (MQ=255) cataaacGCTCCGCCATTGCTGAGCGTTTATGGCTCCTGATGCTGACGGTGACGATAAATGGCATTTGCTCAACGGCATGAATGGCAATGGTGCGGAAATGAGCGCGGAAGCCGCAGGTATCGCTGTCTGCCTGATTGAATATAGCCATc > 1:1193294/6‑150 (MQ=255) acacGCTCAGCAATTGCTGAGCGTTTATATCTCCTGATTCTCACTATCAAGAAAAAAAAAATTTGCTCAACGGCATGAATGGCAATGGTGCGGAAATGAGCGCGGAAGCCGCAGGTATCGCTGTCAGCCTGATTGAATATAGACATCAcc > 2:1179007/1‑149 (MQ=255) acacGCTCAGCAATGGCGGAGCGTTTATGTCTCCTGATTCTGACGGTCAAGATAAAAAGCATTTGCTCAACGGCATGAATGGCAATGGTGCGGAAATGAGCGCGGAAGCCGCAGGTATCGCTGTCTGCCTGATTGAATATAGCCATCACg > 2:421698/1‑150 (MQ=255) acacGCTCAGCAATGGCGGAGCGTTTATGTCTCCTGATGCTGACGTTGACGATAAATGTCATTTGCTCAACGGCATGAATGGCAATGGTGCGGAAATGAGCGCGGAAGCCGCAGGTATCGCTGTCTGCCTGATTGAATATAGCCATCACg > 2:1050678/1‑150 (MQ=255) acacGCTCAGCAATGGCGGAGCGTTTATGGCTCCTGATGCTGACGGTGACGATAAATGGCATTTGCTCAACGGCATGAATGGCAATGGTGCGGAAATGAGCGCGGAAGCCGCAGGTATCGCTGTCTGCCTGATTGAATATAGCCATCACg < 2:39657/150‑1 (MQ=255) acacGCTCAGCAATGGCGGAGCGTTTATGGCTCCTGATGCTGACGGTGACGATAAATGGCATTTGCTCAACGGCATGAATGGCAATGGTGCGGAAATGAGCGCGGAAGCCGCAGGTATCGCTGTCTGCCTGATTGAATATAGCCATCACg < 1:325927/150‑1 (MQ=255) acacGCTCAGCAATGGCGGAGCGTTTATGGCTCCTGATGCTGACCGTGACGATAAATGCCATTTGCTCAACGGCATGAATGGCAATGGTGCGGAAATGAGCGCGGAAGCCGCAGGTATCGCTGTCTGCCTGATTGAATATAGCCATCACg > 2:385136/1‑150 (MQ=255) cGCTCAGCAATGGCGGAGCGTTTATGGCTCCTGATGCTGACGGTGACGATAAATGGCATTTGCTCAACGGCATGAATGGCAATGGTGCGGAAATGAGCGCGGAAGCCGCAGGTATCGCTGTCTGCCTGATTGAATATAGCCATCACgcct > 1:1509148/1‑150 (MQ=255) cGCTCAGCAATGGCGGAGCGTTTATGGCTCCTGATGCTGACGGTGACGATAAATGGCATTTGCTCAACGGCATGAATGGCAATGGTGCGGAAATGAGCGCGGAAGCCGCAGGTATCGCTGTCTGCCTGATTGAATATAGCCATCACgcct > 1:304849/1‑150 (MQ=255) cGCTCAGCAATGGCGGAGCGTTTATGGCTCCTGATGCTGACGGTGACGATAAATGGCATTTGCTCAACGGCATGAATGGCAATGGTGCGGAAATGAGCGCGGAAGCCGCAGGTATCGCTGTCTGCCTGATTGAATATAGCCATCACgcct > 1:1353432/1‑150 (MQ=255) cTCAGCAATGGCGGAGCGTTTATGGCTCCTGATGCTGACGGTGACGATAAATGGCATTTGCTCAACGGCATGAATGGCAATGGTGCGGAAATGAGCGCGGAAGCCGCAGGTATCGCTGTCTGCCTGATTGAATATAGCCATCACgcctgc < 1:990875/150‑1 (MQ=255) tCAGCAATGGCGGAGCGTTTATGGCTCCTGATGCTGACGGTGACGATAAATGGCATTTGCTCATCGGCATGAATGGCAATGGTGCGGAAATGAGCGCGGAAGCCGCAGGTATCGCTGTCTGCCTGATTGAATATAGCCATCACgcctgcc < 1:518643/150‑1 (MQ=255) gCAATGGCGGAGCGTTTATGGCTCCTGATGCTGACGGTGACGATAAATGGCATTTGCTCAACGGCATGAATGGCAATGGTGCGGAAATGAGCGCGGAAGCCGCAGGTATCGCTGTCTGCCTGATTGAATATAGCCATCACGCCTGCCTCa > 2:1107989/1‑150 (MQ=255) | AGGTACCCGATGAACAGCATATCCGCTTCTGGCCGCAGCACTTTGGCACCATCCCGCAGTGGATAACGCTGGAACCGCGCATTTTCGCCTGGATGGACCGCTTCTGTGATGAGTACTGCGGGGGTATCTGGTCCTTTTACACGCTCAGCAATGGCGGAGCGTTTATGGCTCCTGATGCTGACGGTGACGATAAATGGCATTTGCTCAACGGCATGAATGGCAATGGTGCGGAAATGAGCGCGGAAGCCGCAGGTATCGCTGTCTGCCTGATTGAATATAGCCATCACGCCTGCCTCA > NC_000913/2775986‑2776282 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |