Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 2,780,552 | G→A | 6.0% | G725G (GGC→GGT) | ypjA ← | adhesin‑like autotransporter YpjA |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 2,780,552 | 0 | G | A | 6.0% | 254.1 / 3.4 | 82 | G725G (GGC→GGT) | ypjA | adhesin‑like autotransporter YpjA |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (42/34); new base A (3/2); total (45/37) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
GTTCGCCGCACCCTGCTCGATGCTGAACGCGACGCCATCCGCGCGTGTTCCTGTGACCCGCGTCGCCCTGGTGGTTGCAACCAAAGCGCCCTGGCTACTCTGCTGTATCCCCGTTGCGCTGCCTTTCTCCCGCACATCGAGTGTGCCGCCGTCATTAAGCACCGAGTTTTCAGCCAGGCCGCCCTCATTAACTACCTGTGAACCCCCATTAATAATGGAACCTTCCGCTGTCCCGTTTGCCATAATTTGTTGTAGGCCAGAGACGATATCGGTATTGATTGCCTTACCATAATT > NC_000913/2780408‑2780701 | gTTCGCCGCACCCTGCTCGATGCTGAACGCGACGCCATCCGCGCGTGTTCCTGTGACCCGCGTCGCCCTGGTGGTTGCAACCAAAGCGCCCTGGCTACTCTGCTGTATCCCCGTTGCGCTGCCTTTCTCCCGCACATCGAGTGTgccgcc > 1:121294/1‑150 (MQ=255) gccgcACCCTGCTCGATGCTGAACGCGACGCCATCCGCGCGTGTTGCTGTGACCCGCGTCGCCCTGGTGGTTGCAACCAACGCGCCCTGGCTACTCTGCGGTCTCCCCGTTGCGCGGCCTTTCTCCCGCACCTCGCGTGTGCCGCCGTcg > 2:1520529/1‑149 (MQ=255) gcACCCTGCTCGATGCTGAACGCGACGCCATCCGCGCGTGTTCCTGTGACCCGCGTCGCCCTGGTGGTTGCAACCAAAGCGCCCTGGCTACTCTGCTGTATCCCCGTTGCGCTGCCTTTCTCCCGCACATCGAGTGTGCCGCCGTCATTa < 1:910183/150‑1 (MQ=255) cACCCTGCGCGATGCTGAACGCGACGCCATCCGCGCGTGTTCCTGGGACCCGCGTCGCCCTGGTGGTTGCAACCAAAGCGCCCTGGCTACTCTGCTGTATCCCCGTTGCGCTGCCTTTCTCCCGCACATCGAGTGTGCCGCCGTCATTaa < 2:722173/150‑1 (MQ=255) ccTGCTCGATGCTGAACGCGACGCCATCCGCGCGTGTTCCTGTGACCCGCGTCGCCCTGGTGGTTGCAACCAAAGCGCCCTGGCTACTCTGCTGTATCCCCGTTGCGCTGCCTTTCTCCCGCACATCGAGTGTGCCGCCGTCATTAAGCa < 2:153683/150‑1 (MQ=255) gCTCGATGCTGAACGCGACGCCATCCGCGCGTGTTCCTGTGACCCGCGTCGCCCTGGTGGTCGCAACCAAAGCGCCCTGGCTACTCTGCTGTATCCCCGTTGCGCTGCCTTTCTCCCGCACATCGAGTGTGCCGCCGTCATTAAGCACCg > 1:147004/1‑150 (MQ=255) tCGATGCTGAACGCGACGCCATCCGCGCGTGTTCCTGTGCCCCGCGTCGCCCTGGTGGTTGCAACCAAAGCGCCCTGGCTACTCTGCTGTATCCCCGTTGCGCTGCCTTTCTCCCGCACATCGAGTGTGCCGCCGTCATTAAGCCCagag > 1:1167949/1‑150 (MQ=255) tCGATGCTGAACGCGACGCCATCCGCGCGTGTTCCTGTGACCCGCGTCGCCCTGGTGGTTGCAACCAAAGCGCCCTGGCTACTCTGCTGTATCCCCGTTGCGCTGCCTTTCTCCCGCACATCGAGTGTGCCGCCGTCATTAAGCACCGAg < 2:919499/150‑1 (MQ=255) cGATGCTGAACGCGACGCCATCCGCGCGTGTTCCTGTGACCCGCGTCGCCCTGGTGGTTGCAACCAAAGCGCCCTGGCTACTCTGCTGTATCCCCGTTGCGCTGCCTTTCTCCCGCACATCGAGTGTGCCGCCGTCATTAAGCACCGAGt > 1:1257768/1‑150 (MQ=255) aTGCTGAACGCGACGCCATCCGCGCGTGTTCCTGTGACCCGCGTCGCCCTGGTGGTTGCAACCAAAGCGCCCTGGCTACTCTGCTGTATCCCCGTTGCGCTGCCTTTCTCCCGCACATCGAGTGTGCCGCCGTCATTAAGCACCGAGttt < 1:1118882/150‑1 (MQ=255) cTGAACGCGACGCCATCCGCGCGTGTTCCTGTGACCCGCGTCGCCCTGGTGGTTGCAACCAAAGCGCCCTGGCTACTCTGCTGTATCCCCGTTGCGCTGCCTTTCTCCCGCACATCGAGTGTGCCGCCGTCATTAAGCACCGAGTTTTCa < 2:121294/150‑1 (MQ=255) tGAACGCGACGCCATCCGCGCGTGTTCCTGTGACCCGCGTCGCCCTGGTGGTTGCAACCAAAGCGCCCTGGCTACTCTGCTGTATCCCCGTTGCGCTGCCTTTCTCCCGCACATCGAGTGTGCCGCCGTCATTAAGCACCGAGTTTTCAg < 1:640884/150‑1 (MQ=255) tGAACGCGACGCCATCCGCGCGTGTTCCTGTGACCCGCGTCGCCCTGGTGGTTGCAACCAAAGCGCCCTGGCTACTCTGCTGTATCCCCGTTGCGCTGCCTTTCTCCCGCACATCGAGTGTGCCGCCGTCATTAAGCACCGAGTTTTCAg < 1:1168998/150‑1 (MQ=255) tGAACGCGACGCCATCCGCGCGTGTTACTGTGACCCGCGTCGCCCTGGTGGTTGCAACCAAAGCGCCCTGGCTACTCTGCTGTATCCCCGTTGCGCTGCCTTTCTCCCGCACATCGAGTGTGCCGCCGTCATTAAGCACCGAGTTTTCAg > 2:659011/1‑150 (MQ=255) gAACGCGACGCCATCCGCGCGTGTTCCTGTGACCCGCGTCGCCCTGGTGGTTGCAACCAAAGCGCCCTGGCTACTCTGCTGTATCCCCGTTGCGCTGCCTTTCTCCCGCACATCGAGTGTGCCGCCGTCATTAAGCACCGAGTTTTCAGc > 1:325178/1‑150 (MQ=255) gAACGCGACGCCATCCGCGCGTGTTCCTGTGACCCGCGTCGCCCTGGTGGTTGCAACCAAAGCGCCCTGGCTACTCTGCTGTATCCCCGTTGCGCTGCCTTTCTCCCGCACATCGAGTGTGCCGCCGTCATTAAGCACCGAGTTTTCAGc < 2:234354/150‑1 (MQ=255) cgACGCCATCCGCGCGTGTTCCTGTGACCCGCGTCGCCCTGGTGGTTGCAACCAAAGCGCCCTGGCTACTCTGCTGTATCCCCGTTGCGCTGCCTTTCTCCCGCACATCGAGTGTGCCGCCGTCATTAAGCACCGAGTTTTCAGCCAGgc < 2:928594/150‑1 (MQ=255) cgACGCCATCCGCGCGTGTTCCTGTGACCCGCGTCGCCCTGGTGGTTGCAACCAAAGCGCCCTGGCTACTCTGCTGTATCCCCGTTGCGCTGCCTTTCTCCCGCACATCGAGTGTGCCGCCGTCATTAAGCACCGAGTTTTCAGCCAGgc > 1:188509/1‑150 (MQ=255) cATCCGCGCGTGTTCCTGTGACCCGCGTCGCCCTGGTGGTTGCAACCAAAGCGCCCTGGCTACTCTGCTGTATCCCCGTTGCGCTGCCTTTCTCCCGCACATCGAGTGTGCCGCCGTCATTAAGCACCGAGTTTTCAGCCAGGCCGCCCt > 1:258038/1‑150 (MQ=255) aTCCGCGCGTGTTCCTGTGACCCGCGTCGCCCTGGTGGTTGCAACCAAAGCGCCCTGGCTACTCTGCTGTATCCCCGTTGCGCTGCCTTTCTCCCGCACATCGAGTGTGCCGCCGTCATTAAGCACCGAGTTTTCAGCCAGGCCGCCCTc < 1:1363206/150‑1 (MQ=255) cgcgcgTGTTCCTGTGACCCGCGTCGCCCTGGTGGGTGCAACCAAAGCGCCCTGGCTACTCTGCTGTATCCCCGTTGCGCTGCCTTTCTCCCGCACATCGAGTGTGCCGCCGTCATTAAGCACCGAGTTTTCAGCCAGGCCGCCCTCAtt < 2:160190/150‑1 (MQ=255) gcgcgTGTTCCTGTGACCCGCGTCGCCCTGGTGGTTGCAACCAAAGCGCCCTGGCTACTCTGCTGTATCCCCGTTGCGCTGCCTTTCTCCCGCACATCGAGTGTGCCGCCGTCATTAAGCACCGAGTTTTCAGCCAGGCCGCCCTCATTa < 1:1481670/150‑1 (MQ=255) cgcgTGTTCCTGTGACCCGCGTCGCCCTGGTGGTTGCAACCAAAGCGCCCTGGCTACTCTGCTGTATCCCCGTTGCGCTGCCTTTCTCCCGCACATCGAGTGTGCCGCCGTCATTAAGCACCGAGTTTTCAGCCAGGCCGCCCTCATTaa < 2:1257768/150‑1 (MQ=255) gcgTGTTCCTGTGACCCGCGTCGCCCTGGTGGTTGCAACCAAAGCGCCCTGGCTACTCTGCTGTATCCCCGTTGCGCTGCCTTTCTCCCACACATCGAGTGTGCCGCCGTCATTAAGCACCGAGTTTTCAGCCAGGCCGCCCTCATTAAc < 1:607482/150‑1 (MQ=255) ccTGTGACCCGCGTCGCCCTGGTGGTTGCAACCAAAGCGCCCTGGCTACTCTGCTGTATCCCCGTTGCGCTGCCTTTCTCCCGCACATCGAGTGTGCCGCCGTCATTAAGCACCGAGTTTTCAGCCAGGCCGCCCTCATTAACTACCtgt > 2:987239/1‑150 (MQ=255) ccTGTGACCCGCGTCGCCCTGGTGGTTGCAACCAAAGCGCCCTGGCTACTCTGCTGTATCCCCGTTGCGCTGCCTTTCTCCCGCACATCGAGTGTGCCGCCGTCATTAAGCACCCAGTTTTCAGCCAGGCCGCCCTCATTAACTACCtgt > 2:114515/1‑150 (MQ=255) gACCCGCGTCGCCCTGGTGGTTGCAACCAAAGCGCCCTGGCTACTCTGCTGTATCCCCGTTGCGCTGCCTTCCTCCCGCACATCGAGTGTACCGCCGTCATTAAGCACCGAGTTTTCAGCCAGGCCGCCCTCATTAACTACCTGTGAAcc > 2:1427482/1‑150 (MQ=255) gACCCGCGTCGCCCTGGTGGTTGCAACCAAAGCGCCCTGGCTACTCTGCTGTATCCCCGTTGCGCTGCCTTCCTCCCGCACATCGAGTGTACCGCCGTCATTAAGCACCGAGTTTTCAGCCAGGCCGCCCTCATTAACTACCTGTGAAcc > 2:1422182/1‑150 (MQ=255) cccGCGTCGCCCTGGTGGTTGCAACCAAAGCGCCCTGGCTACTCTGCTGTATCCCCGTTGCGCTGCCTTTCTCCCGCACATCGAGTGTGCCGCCGTCATTAAGCACCGAGTTTTCAGCCAGGCCGCCCTCATTAACTACCTGTGAAcccc > 1:1529523/1‑150 (MQ=255) ccGCGTCGCCCTGGTGGTTGCAACCAAAGCGCCCTGGCTACTCTGCTGTATCCCCGTTGCGCTGCCTTTCTCCCGCACATCGAGTGTGCCGCCGTCATTAAGCACCGAGTTTTCAGCCAGGCCGCCCTCATTAACTACCTGTGAAccccc > 1:622046/1‑150 (MQ=255) cGCCCTGGTGGTTGCAACCAAAGCGCCCTGGCTACTCTGCTGTATCCCCGTTGCGCTGCCTTTCTCCCGCACATCGAGTGTGCCGCCGTCATTAAGCACCGAGTTTTCAGCCAGGCCGCCCTCATTAACTACCTGTGAACCCCCATtaat > 2:135175/1‑150 (MQ=255) ccTGGTGGTTGCAACCAAAGCGCCCTGGCTACTCTGCTGTATCCCCGTTGCGCTGCCTTTCTCCCGCACATCGAGTGTGCCGCCGTCATTAAGCACCGAGTTTTCAGCCAGGCCGCCCTCATTAACTACCTGTGAACCCCCATTaataat > 1:401772/1‑150 (MQ=255) tggtggTTGCAACCAAAGCGCCCTGGCTACTCTGCTGTATCCCCGTTGCGCTGCCTTTCTCCCGCACATCGAGTGTGCCGCCGTCATTAAGCACCGAGTTTTCAGCCAGGCCGCCCTCATTAACTACCTGTGAACCCCCATTAATAATgg > 2:11272/1‑150 (MQ=255) ggtTGCAACCAAAGCGCCCTGGCTACTCTGCTGTATCCCCGTTGCGCTGCCTTTCTCCCGCACATCGAGTGTGCCGCCGTCATTAAGCACCGAGTTTTCAGCCAGGCCGCCCTCATTAACTACCTGTGAACCCCCATTAATAATGGAAcc > 1:1392609/1‑150 (MQ=255) gtTGCAACCAACGCGCCCTGGCTACTCTGCTGTATCCCCGTTGCGCTGCCTTTCTCCCGCACATCGAGTGTGCCGCCGTCATTAAGCACCGAGTTTTCAGCCAGGCCGCCCTCATTAACTACCTGTGACCCCCCATTAATAATGGAACCt > 2:1329498/1‑150 (MQ=255) ttGCAACCAAAGCGCCCTGGCTACTCTGCTGTATCCCCGTTGCGCTGCCTTTCTCCCGCACATCGAGTGTACCGCCGTCATTAAGCACCGAGTTTTCAGCCAGGCCGCCCTCATTAACTACCTGTGAACCCCCATTAATAATGGAACCtt > 2:1050787/1‑150 (MQ=255) gCAACCAAAGCGCCCTGGCTACTCTGCTGTATCCCCGTTGCGCTGCCTTTCTCCCGCACATCGAGTGTGCCGCCGTCATTAAGCACCGAGTTTTCAGCCAGGCCGCCCTCATTAACTACCTGTGAACCCCCATTAATAATGGAACCTTcc < 1:706481/150‑1 (MQ=255) aaCCAAAGCGCCCTGGCTACTCTGCTGTATCCCCGTTGCGCTGCCTTTCTCCCGCACATCGAGTGTGCCGCCGTCATTAAGCACCGAGTTTTCAGCCAGGCCGCCCTCATTAACTACCTGTGAACCCCCATTAATAATGGAACCTTCCGc < 1:390525/150‑1 (MQ=255) ccAAAGCGCCCTGGCTACTCTGCTGTATCCCCGTTGCGCTGCCTTTCTCCCGCACATCGAGTGTGCCGCCGTCATTAAGCACCGAGTTTTCAGCCAGGCCGCCCTCATTAACTACCTGTGAACCCCCATTAATAATGGAACCTTCCGCTg > 1:455269/1‑150 (MQ=255) aaaGCGCCCTGGCTACTCTGCTGTATCCCCGTTGCGCTGCCTTTCTCCCGCACATCGAGTGTGCCGCCGTCATTAAGCACCGAGTTTTCAGCCAGGCCGCCCTCATTAACTACCTGTGAACCCCCATTAATAATGGAACCTTCCGCTGTc < 2:568126/150‑1 (MQ=255) aaGCGCCCTGGCTACTCTGCTGTATCCCCGTTGCGCTGCCTTTCTCCCGCACATCGAGTGTGCCGCCGTCATTAAGCACCGAGTTTTCAGCCAGGCCGCCCTCATTAACTACCTGTGAACCCCCATTAATAATGGAACCTTCCGCTGTcc < 1:444569/150‑1 (MQ=255) aGCGCCCTGGCTACTCTGCTGTATCCCCGTTGCGCTGCCTTTCTCCCGCACATCGAGTGTGCCGCCGTCATTAAGCACCGAGTTTTCAGCCAGGCCGCCCTCATTAACTACCTGTGAACCCCCATTAATAATGGAACCTTCCGCTGTccc > 1:185585/1‑150 (MQ=255) gcgcCCTGGCTACTCTGCTGTATCCCCGTTGCGCTGCCTTTCTCCCGCACATCGAGTGTGCCGCCGTCATTAAGCACCGAGTTTTCAGCCAGGCCGCCATCATTAACTACCTGTGAACCCCCATTAATAATGGAACCTTCCGCTGTCCCg > 1:179563/1‑150 (MQ=255) cccTGGCTACTCTGCTGTATCCCCGTTGCGCTGCCTTTCTCCCGCACATCGAGTGTGCCGCCGTCATTAAGCACCGAGTTTTCAGCCAGGCCGCCCTCATTAACTACCTGTGAACCCCCATTAATAATGGAACCTTCCGCTGTCCCGttt < 2:622046/150‑1 (MQ=255) cTGGCTACTCTGCTGTATCCCCGTTGCGCTGCCTTTCTCCCGCACATCGAGTGTGCCGCCGTCATTAAGCACCGAGTTTTCAGCCAGGCCGCCCTCATTAACTACCTGTGAACCCCCATTAATAATGGAACCTTCCGCTGTCCCGTTTGc > 2:881514/1‑150 (MQ=255) tGGCTACTCTGCTGTATCCCCGTTGCGCTGCCTTTCTCCCGCACATCGAGTGTGCCGCCGTCATTAAGCACCGAGTTTTCAGCCAGGCCGCCCTCATTAACTACCTGTGAACCCCCATTAATAATGGAACCTTCCGCTGTCCCGTTTGcc < 2:258038/150‑1 (MQ=255) gCTACTCTGCTGTATCCCCGTTGCGCTGCCTTTCTCCCGCACATCGAGTGTGCCGCCGTCATTAAGCACCGAGTTTTCAGCCAGGCCGCCCTCATTAACTACCTGTGAACCCCCATTAATAATGGAACCTTCCGCTGTCCCGTTTGCCAt < 2:465011/150‑1 (MQ=255) tACTCTGCTGTATCCCCGTTGCGCTGCCTTTCTCCCGCACATCGAGTGTGCCGCCGTCATTAAGCACCGAGTTTTCAGCCAGGCCGCCCTCATTAACTACCTGTGAACCCCCATTAATAATGGAACCTTCCGCTGTCCCGTTTGCCATaa > 1:994781/1‑150 (MQ=255) aCTCTGCTGTATCCCCGTTGCGCTGCCTTTCTCCCGCACATCGAGTGTGCCGCCGTCATTAAGCACCGAGTTTTCAGCCAGGCCGGCGTCATTAACTACCTGTGAACCCCCATTAATAATGGAAGCTTCCGCTGTCCCGTTTGCCATAAt < 1:800164/150‑1 (MQ=255) aCTCTGCTGTATCCCCGTTGCGCTGCCTTTCTCCCGCACATCGAGTGTGCCGCCGTCATTAAGCACCGAGTTTTCAGCCAGGCCGCCCTCATTAACTACCTGTGAACCCCCATTAATAATGGAACCTTCCGCTGTCCCGTTTGCCATAAt > 1:611833/1‑150 (MQ=255) ctctGCTGTATCCCCGTTGCGCTGCCTTTCTCCCGCACATCGAGTGTGCCGCCGTCATTAAGCACCGAGTTTTCAGCCAGGCCGCCCTCATTAACTACCTGTGAACCCCCATTAATAATGGAACCTTCCGCTGTCCCGTTTGCCATAAtt > 2:336060/1‑150 (MQ=255) gctgTATCCCCGTTGCGCTGCCTTTCTCCCGCACATCGAGTGTGCCGCCGTCATTAAGCACCGAGTTTTCAGCCAGGCCGCCCTCATTAACTACCTGTGAACCCCCATTAATAATGGAACCTTCCGCTGTCCCGTTTGCCATAATttgtt > 1:740093/1‑150 (MQ=255) tgTATCCCCGTTGCGCTGCCTTTCTCCCGCACATCGAGTGTGCCGCCGTCATTAAGCACCGAGTTTTCAGCCAGGCCGCCCTCATTAACTACCTGTGAACCCCCATTAATAATGGAACCTTCCGCTGTCCCGTTTGCCATAATTtgttgt > 2:1274836/1‑150 (MQ=255) tATCCCCGTTGCGCTGCCTTTCTCCCGCACATCGAGTGTGCCGCCGTCATTAAGCACCGAGTTTTCAGCCAGGCCGCCCTCATTAACTACCTGTGAACCCCCATTAATAATGGAACCTTCCGCTGTCCCGTTTGCCATAATTTGTTGTAg < 2:347596/150‑1 (MQ=255) tATCCCCGTTGCGCTGCCTTTCTCCCGCACATCGAGTGTGCCGCCGTCATTAAGCACCGAGTTTTCAGCCAGGCCGCCCTCATTAACTACCTGTGAACCCCCATTAATAATGGAACCTTCCGCTGTCCCGTTTGCCATAATTTGTTGTAg < 1:1329498/150‑1 (MQ=255) tATCCCCGTTGCGCTGCCTTTCTCCCGCACATCGAGTGTGCCGCCGTCATTAAGCACCGAGTTTTCAGCCAGGCCGCCCTCATTAACTACCTGTGAACCCCCATTAATAATGGAACCTTCCGCTGTCCCGTTTGCCATAATTTGTTGTAg < 1:457732/150‑1 (MQ=255) ccccGTTGCGCTGCCTTTCTCCCGCACATCGAGTGTGCCGCCGTCATTAGGCACCGAGTTTTCAGCCAGGCCGCCCTCATTAACTACCTGTGAACCCCCATTAATAATGGAACCTTCCGCTGTCCCGTTTGCCATAATTTGTTGTAGGcc > 2:465026/1‑150 (MQ=255) ccccGTTGCGCTGCCTTTCTCCCGCACATCGAGTGTGCCGCCGTCATTAAGCACCGAGTTTTCAGCCAGGCCGCCCTCATTAACTACCTGTGAACCCCCATTAATAATGGAACCTTCCGCTGTCCCGTTTGCCATAATTTGTTGTAGGcc < 2:147004/150‑1 (MQ=255) ccccGTTGCGCTGCCTTTCTCCCGCACATCGAGTGTGCCGCCGTCATTAAGCACCGAGTTTTCAGCCAGGCCGCCCTCATTAACTACCTGTGAACCCCCATTAATAATGGAACCTTCCGCTGTCCCGTTTGCCATAATTTGTTGTAGGcc < 2:994781/150‑1 (MQ=255) ccccGTTGCGCTGCCTTTCTCCCGCACATCGAGTGTGCCGCCGTCATTAAGCACCGAGTTTTCAGCCAGGCCGCCCTCATTAACTACCTGTGAACCCCCATTAATAATGGAACCTTCCGCTGTCCCGTTTGCCATAATTTGTTGTAGGcc > 2:1145836/1‑150 (MQ=255) ccccGTTGCGCTGCCTTCCTCCCGCACATCGAGTGTACCGCCGTCATTAAGCACCGAGTTTTCAGCCAGGCCGCCCTCATTAACTACCTGTGAACCCCCATTAATAATGGAACCTTCCGCTGTCCCGTTTGCCATAATTTGTTGTAGGcc < 1:1422182/150‑1 (MQ=255) ccccGTTGCGCTGCCTTCCTCCCGCACATCGAGTGTACCGCCGTCATTAAGCACCGAGTTTTCAGCCAGGCCGCCCTCATTAACTACCTGTGAACCCCCATTAATAATGGAACCTTCCGCTGTCCCGTTTGCCATAATTTGTTGTAGGcc < 1:1427482/150‑1 (MQ=255) cccGTTGCGCTGCCTTTCTCCCGCACATCGAGTGTGCCGCCGTCATTAAGCACCGAGTTTTCAGCCAGGCCGCCCTCATTAACTACCTGTGAACCCCCATTAATAATGGAACCTTCCGCTGTCCCGTTTGCCATAATTTGTTGTAGGCCa > 1:929687/1‑150 (MQ=255) ccGTTGCGCTGCCTTTCTCCCGCACATCGAGTGTTCCGCCGTCATTAAGCACCGAGTTTTCAGCCAGGCCGCCCTCATTAACTACCTGTGAACCCCCATTAATAATGGAACCTTCCGCTGTCCCGTTTGCCATAATTTGTTGTAGGCCag < 1:1050787/150‑1 (MQ=255) ccGTTGCGCTGCCTTTCTCCCGCACATCGAGTGTGCCGCCGTCATTAAGCACCGAGTTTTCAGCCAGGCCGCCCTCATTAACTACCTGTGAACCCCCATTAATAATGGAACCTTCCGCTGTCCCGTTTGCCATAATTTGTTGTAGGCCag < 1:1482170/150‑1 (MQ=255) cgcTGCCTTTCTCCCGCACATCGAGTGTGCCGCCGTCATTAAGCACCGAGTTTTCAGCCAGGCCGCCCTCATTAACTCCCTGTGAACCCCCATTAATAATGGAACCTTCCGCTGTCCCGTTTGCCATAATTTGTTGTAGGCCAGAGACGa > 1:985192/1‑150 (MQ=255) gcTGCCTTTCTCCCGCACATCGAGTGTGCCGCCGTCATTAAGCACCGAGTTTTCAGCCAGGCCGCCCTCATTAACTACCTGTGAACCCCCATTAATAATGGAACCTTCCGCTGTCCCGTTTGCCATAATTTGTTGTAGGCCAgaga > 1:722766/1‑146 (MQ=255) gcTGCCTTTCTCCCGCACATCGAGTGTGCCGCCGTCATTAAGCACCGAGTTTTCAGCCAGGCCGCCCTCATTAACTACCTGTGAACCCCCATTAATAATGGAACCTTCCGCTGTCCCGTTTGCCATAATTTGTTGTAGGCCAgaga < 2:722766/146‑1 (MQ=255) gcTGCCTTTCTCCCGCACATCGAGTGTGCCGCCGTCATTAAGCACCGAGTTTTCAGCCAGGCCGCCCTCATTAACTACCTGTGAACCCCCATTAATAATGGAACCTTCCGCTGTCCCGTTTGCCATAATTTGTTGTAGGCCAGAGACGat > 1:314947/1‑150 (MQ=255) cTTTCTCCCGCACATCGAGTGTGCCGCCGTCATTAAGCACCGAGTTTTCAGCCAGGCCGCCCTCATTAACTACCTGTGAACCCCCATTAATAATGGAACCTTCCGCTGTCCCGTTTGCCATAATTTGTTGTAGGCCAGAGACGATATCgg < 2:1312261/150‑1 (MQ=255) ctcCCGCACATCGAGTGTGCCGCCGTCATTAAGCACCGAGTTTTCAGCCAGGCCGCCCTCATTAACTACCTGTGAACCCCCATTAATAATGGAACCTTCCGCTGTCCCGTTTGCCATAATTTGTTGTAGGCCAGAGACGATATCGGTgtt < 1:386384/150‑1 (MQ=255) ctcCCGCACATCGAGTGTGCCGCCGTCATTAAGCACCGAGTTTTCAGCCAGGCCGCCCTCATTAACTACCTGTGAACCCCCATTAATAATGGAACCTTCCGCTGTCCCGTTTGCCATAATTTGTTGTAGGCCAGAGACGATATCGGTatt > 1:351581/1‑150 (MQ=255) ctcCCGCACATCGAGTGTGCCGCCGTCATTAAGCACCGAGTTTTCAGCCAGGCCACCCTCATTAACTACCTGTGAACCCCCATTAATAATGGAACCTTCCGCTGTCCCGTTTGCCATAATTTGTTGTAGGCCAGAGACGATATCGGTatt > 1:1092478/1‑150 (MQ=255) cccGCACATCGAGTGTGCCGCCGTCATTAAGCACCGAGTTTTCAGCCAGGCCGCCCTCATTAACTACCTGTGAACCCCCATTAATAATGGAACCTTCCGCTGTCCCGTTTGCCATAATTTGTTGTAGGCCAGAGACGATCTCGGTattga > 2:889039/1‑150 (MQ=255) cccGCACATCGAGTGTGCCGCCGTCATTAAGCACCGAGTTTTCAGCCAGGCCGCCCTCATTAACTACCTGTGAACCCCCATTAATAATGGAACCTTCCGCTGTCCCGTTTGCCATAATTTGTTGTAGGCCAGAGACGATATCGGTattga > 1:1122729/1‑150 (MQ=255) cccGCACATCGAGTGTGCCGCCGTCATTAAGCAACGAGTTTTAAGCCAGGCCGCCCTCATTAACTACCAGTGAACCCCCATTAATAATGGAACCTTACGCTGTCCCGTTTGCCATAATTTCTTGTAGGCCAGAGACGATATCGGTattga > 1:1255857/1‑150 (MQ=255) ccGCACATCGAGTGTGCCGCCGTCATTAAGCACCGAGTTTTCAGCCAGGCCGCCCTCATTAACTACCTGTGCACCCCCATTAATAATGGAACCTTCCGCTGTCCCGTTTGCCATAATTTGTTGTAGGCCAGAGACGATATCGGTattgat > 1:713148/1‑150 (MQ=255) cGCACATCGAGTGTGCCGCCGTCATTAAGCACCGAGTTTTCAGCCAGGCCGCCCTCATTAACTACCTGTGAACCCCCATTAATAATGGAACCTTCCGCTGTCCCGTTTGCCATAATTTGTTGTAGGCCAGAGACGATATCGGTattgatt > 2:454702/1‑150 (MQ=255) cacaTCGAGTGTGCCGCCGTCATTAGGCACCGAGTTTTCAGCCAGGCCGCCCTCATTAACTACCTGTGAACCCCCATTAATAATGGAACCTTCCGCTGTCCCGTTTGCCATAATTTGTTGTAGGCCAGAGACGATATCGATATTGATTGc < 1:465026/150‑1 (MQ=255) caTCGAGTGTGCCGCCGTCATTAAGCACCGAGTTTTCAGCCAGGCCGCCCTCATTAACTACCTGTGAACCCCCATTAATAATGGAACCTTCCGCTGTCCCGTTTGCCATAATTTGTTGTAGGCCAGAGACGATATCGGTATTGATTGCCt > 1:372413/1‑150 (MQ=255) aTCGAGTGTGCCGCCGTCATTAAGCACCGAGTTTTCAGCCAGGCCGCCCTCATTAACTACCTGTGAACCCCCATTAATAATGGAACCTTCCGCTGTCCCGTTTGCCATAATTTGTTGTAGGCCAGAGACGATATCGGTATTGATTGCCtt < 1:1133915/150‑1 (MQ=255) tCGAGTGTGCCGCCGTCATTAAGCACCGAGTTTTCAGCCAGGCCGCCCTCATTAACTACCTGTGAACCCCCATTAATAATGGAACCTTCCGCTGTCCCGTTTGCCATAATTTGTTGTAGGCCAGAGACGATATCGGTATTGATTGCCTTa > 2:975467/1‑150 (MQ=255) gAGTGTGCCGCCGTCATTAAGCACCGAGTTTTCAGCCAGGCCGCCCTCATTAACTACCTGTGAACCCCCATTAATAATGGAACCTTCCGCTGTCCCGTTTGCCATAATTTGTTGTAGGCCAGAGACGATATCGGTATTGATTGCCTTAcc > 2:149396/1‑150 (MQ=255) tgtgCCGCCGTCATTAAGCACCGAGTTTTCAGCCAGGCCGCCCTCATTAACTACCTGTGAACCCCCATTAATAATTGAACCTTCCGCTGTCCCGTTTGCCATAATTTGTTGTAGGCCAGAGACGATATCGGTATTGATTGCCTTACCATa < 1:262287/150‑1 (MQ=255) tgCCGCCGTCATTAAGCACCGAGTTTTCAGCCAGGCCGCCCTCATTAACTACCTGTGAACCCCCATTAATAATGGAACCTTCCGCTGTCCCGTTTGCCATAATTTGTTGTAGGCCAGAGACGATATCGGTATTGATTGCCTTACCATAAt < 2:188509/150‑1 (MQ=255) gccgccGTCATTAAGCACCGAGTTTTCAGCCAGGCCGCCCTCATTAACTACCTGTGAACCCCCATTAATAATGGAACCTTCCGCTGTCCCGTTTTCCATAATTTGTTGTAGGCCAGAGACGATATCGGTATTGATTGCCTTACCATAAtt < 1:616154/150‑1 (MQ=255) | GTTCGCCGCACCCTGCTCGATGCTGAACGCGACGCCATCCGCGCGTGTTCCTGTGACCCGCGTCGCCCTGGTGGTTGCAACCAAAGCGCCCTGGCTACTCTGCTGTATCCCCGTTGCGCTGCCTTTCTCCCGCACATCGAGTGTGCCGCCGTCATTAAGCACCGAGTTTTCAGCCAGGCCGCCCTCATTAACTACCTGTGAACCCCCATTAATAATGGAACCTTCCGCTGTCCCGTTTGCCATAATTTGTTGTAGGCCAGAGACGATATCGGTATTGATTGCCTTACCATAATT > NC_000913/2780408‑2780701 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |