| Predicted mutation | |||||||
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| RA | NC_000913 | 2,788,671 | A→T | 6.4% | intergenic (+22/‑314) | ygaQ → / → csiD | putative uncharacterized protein YgaQ/PF08943 family protein CsiD |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_000913 | 2,788,671 | 0 | A | T | 6.4% | 489.4 / 16.9 | 155 | intergenic (+22/‑314) | ygaQ/csiD | putative uncharacterized protein YgaQ/PF08943 family protein CsiD |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (74/71); new base T (2/8); total (76/79) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 9.86e-02 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.89e-01 | |||||||||||
Only 100 of 158 total aligned reads displayed.
CCCGAAAAATTATCCCCCCTGGTAAAGTATTTACGCTTAGAGGCGGAACTCTAAATATCAATATTCCTGGGCGTAGCGCTCTTCTTTTAGGGAAAACAGGAGAACCGCCGAACTATCTCTATTTATAATTTAATGTTATATCTGCCCCGATAAAACGGGGCAGATAATATGTTTAGTTTACTAACGGTCATTTTGCAGTGAAGCCATTTACTGTTTTTTATCGACCAGATAATCTGTTCTCTAATGTTAACTCCCCCTAACCTGTTGCTTTAGTTATTCATTTCCTGTCTCACTTTGCC > NC_000913/2788522‑2788820 | cGAAAAATTATCCCCCCTTGTAAAGTATTTACGCTTAGAGTCTGAACTCTAAATATCAATATTCCTGGGCGTAGCGCTCTTCTTTTAGGGAAAACAGGAGAACCGCCGAACTATCTCTATTTATAATTTAATGTTATATCTGCCCCGATa < 2:893391/150‑1 (MQ=255) cGAAAAATTATCCCCCCTGGTAAAGTATTTACGCTTAGAGGCGGAACTCTAAATATCAATATTCCTGGGCGTAGCGCTCTTCTTTTAGGGAAAACAGGAGAACCGCCGAACTATCTCTATTTATAATTTAATGTTATATCTGCCCCGATa > 2:982746/1‑150 (MQ=255) cGAAAAATTATCCCCCCTGGTAAAGTATTTACGCTTAGAGGCGGAACTCTAAATATCAATATTCCTGGGCGTAGCGCTCTTCTTTTAGGGAAAACAGGAGAACCGCCGAACTATCTCTATTTATAATTTAATGTTATATCTGCCCCGATa > 1:824305/1‑150 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |