| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 3,066,293 | T→C | 6.5% | D294G (GAC→GGC) | ygfI ← | putative LysR‑type DNA‑binding transcriptional regulator YgfI |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 3,066,293 | 0 | T | C | 6.5% | 416.9 / 12.4 | 137 | D294G (GAC→GGC) | ygfI | putative LysR‑type DNA‑binding transcriptional regulator YgfI |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (66/62); new base C (2/7); total (68/69) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.65e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 138 total aligned reads displayed.
GTGCACATCCTATGTATCGGGATTATCTGCATCGCTATCTGGAAAATGCGCCTGGCGGACATATTCACCACGATCTTAGCCACGTCTTCGACTTACACCGTAATTTAATTGCAACCGGCTCGATGCTGGGTTAATGACTCGTCCCGTCACGA‑T‑CTTCAGCAATATGCTGAAGCATCGTGGCGGTATAACGATGATTTCTGATTGAATAAAGATATTCCTGCATATACATCGGCCTGTGCGGTGCATCAAAATATTTCAGCGTTGCCGGATTCACCAGTCGCCAGGCAAAATGCGGG > NC_000913/3066147‑3066442 | gtgCACATCCTATGTATCGGGATTATCTGCATCGCTATCTGGAAAATGCGCCTGGAGGACATATTCACCACGATCTTAGCCACGTCTTCGACTTACACCGTAATTTAATTGAAACCGGCTCGATGCTGGGTTAATGACTCGTCCCGTCAc > 1:1167781/1‑150 (MQ=255) gCACATCCTATGTATCGGGATTATCTGCATCGCTATCTGGAAAATGCGCCTGGCGGACATATTCACCACGATCTTAGCCACGTCTTCGACTTACACCGTAATTTAATTGCAACCGGCTCGATGCTGGGTTAATGACTCGTCCCGTCACGa > 2:1099276/1‑150 (MQ=255) gCACATCCTATGTATCGGGATTATCTGCATCGCTATCTGGAAAATGCGCCTGGCGGACATATTCACCACGATCTTAGCCACGTCTTCGACTTACACCGTAATTTAATTGCAACCGGCTCGATGCTGGGTTAATGACTCGTCCCGTCACGa > 2:391319/1‑150 (MQ=255) caTCCTATGTATCGGGATTATCTGCATCGCTATCTGGAAAATGCGCCTGGCGGACATATTCACCACGATCTTAGCCACGTCTTCGACTTACACCGTAATTTAATTGCAACCGGCTCGATGCTGGGTTAATGACTCGTCCCGTCACGA‑T‑c < 1:1234509/149‑1 (MQ=255) caTCCTATGTATCGGGATTATCTGCATCGCTATCTGGAAAATGCGCCTGGCGGACATATTCACCACGATCTTAGCCACGTCTTCGACTTACACCGTAATTTAATTGCAACCGGCTCGATGCTGGGTTAATGACTCGTCCCGTCACGA‑T‑c > 2:1234509/1‑149 (MQ=255) ccTATGTATCGGGATTATCTGCATCGCTATCTGGAAAATGCGCCTGGCGGACATATTCACCACGATCTTAGCCACGTCTTCGACTTACACCGTAATTTAATTGCAACCGGCTCGATGCTGGGTTAATGACTCGTCCCGTCACGA‑T‑CTTCa > 1:1132221/1‑150 (MQ=255) cTATGTATCGGGATTATCTGCATCGCTATCTGGAAAATGCGCCTGGCGGACATATTCACCACGATCTTAGCCACGTCTTCGACTTACACCGTAATTTAATTGCAACCGGCTCGATGCTGGGTTAATGACTCGTCCCGTCACGA‑T‑CTTCAg < 1:536993/150‑1 (MQ=255) cTATGTATCGGGATTATCTGCATCGCTATCTGGAAAATGCGCCTGGCGGACATATTCACCACGATCTTAGCCACGTCTTCGACTTACACCGTAATTTAATTGCAACCGGCTCGATGCTGGGTTAATGACTCGTCCCGTCACGA‑T‑CTTCAg < 1:398556/150‑1 (MQ=255) tATGTATCGGGATTATCTGCATCGCTATCTGGAAAATGCGCCTGGCGGACATATTCACCACGATCTTAGCCACGTCTTCGACTTACACCGTAATTTAATTGCAACCGGCTCGATGCTGGGTTAATGACTCGTCCCGTCACGA‑T‑CTTCAGc > 2:1492650/1‑150 (MQ=255) gTATCGGGATTATCTGCATCGCTATCTGGAAAATGCGCCTGGCGGACATATTCACCACGATCTTAGCCACGTCTTCGACTTACACCGTAATTTAATTGCAACCGGCTCGATGCTGGGTTAATGACTCGTCCCGTCACGa < 1:1102240/139‑1 (MQ=255) gTATCGGGATTATCTGCATCGCTATCTGGAAAATGCGCCTGGCGGACATATTCACCACGATCTTAGCCACGTCTTCGACTTACACCGTAATTTAATTGCAACCGGCTCGATGCTGGGTTAATGACTCGTCCCGTCACGA‑T‑CTTCAGCAat > 2:909305/1‑150 (MQ=255) gTATCGGGATTATCTGCATCGCTATCTGGAAAATGCGCCTGGCGGACATATTCACCACGATCTTAGCCACGTCTTCGACTTACACCGTAATTTAATTGCAACCGGCTCGATGCTGGGTTAATGACTCGTCCCGTCACGA‑T‑CTTCAGCAat > 2:1001159/1‑150 (MQ=255) gTATCGGGATTATCTGCATCGCTATCTGGAAAATGCGCCTGGCGGACATATTCACCACGATCTTAGCCACGTCTTCGACTTACACCGTAATTTAATTGCAACCGGCTCGATGCTGGGTTAATGACTCGTCCCGTCACGA‑T‑CTTCAGCAat > 2:1483340/1‑150 (MQ=255) aTCGGGATTATCTGCATCGCTATCTGGAAAATGCGCCTGGCGGACATATTCACCACGATCTTAGCCACGTCTTCGACTTACACCGTAATTTAATTGCAACCGGCTCGATGCTGGGTTAATGACTCGTCCCGTCACGA‑T‑CTTCAGCAatat > 1:91393/1‑150 (MQ=255) aTCGGGATTATCTGCATCGCTATCTGGAAAATGCGCCTGGCGGACATATTCACCACGATCTTAGCCACGTCTTCGACTTACACCGTAATTTAATTGCAACCGGCTCGATGCTGGGTTAATGACTCGTCCCGTCACGA‑T‑CTTCAGCAatat > 2:1506282/1‑150 (MQ=255) aTCGGGATTATCTGCATCGCTATCTGGAAAATGCGCCTGGCGGACATATTCACCACGATCTTAGCCACGTCTTCGACTTACACCGTAATTTAATTGCAACCGGCTCGATGCTGGGTTAATGACTCGTCCCGTCACGA‑T‑CTTCAGCAatat > 2:1061748/1‑150 (MQ=255) cGGGATTATCTGCATCGCTATCTGGAAAATGCGCCTGGCGGACATATTCACCACGATCTTAGCCACGTCTTCGACTTACACCGTAATTTAATTGCAACCGGCTCGATGCTGGGTTAATGACTCGTCCCGTCACGA‑T‑CTTCAGCAATATGc < 2:1247998/150‑1 (MQ=255) gggATTATCTGCATCGCTATCTGGAAAATGCGCCTGGCGGACATATTCACCACGATCTTAGCCACGTCTTCGACTTACACCGTAATTTAATTGCAACCGGCTCGATGCTGGGTTAATGACTCGTCCCGTCACGA‑TGCTTCAGCatattgc < 1:1081801/150‑7 (MQ=255) gggATTATCTGCATCGCTATCTGGAAAATGCGCCTGGCGGACATATTCACCACGATCTTAGCCACGTCTTCGACTTACACCGTAATTTAATTACAACCGGCTCGATGCTGGGTTAATGACTCGTCCCGCCACGA‑TGCTTCAGCatattgc < 1:706938/150‑7 (MQ=255) gATTATCTGCATCGCTATCTGGAAAATGCGCCTGGCGGACATATTCACCACGATCTTAGCCACGTCTTCGACTTACACCGTAATTTAATTGCAACCGGCTCGATGCTGGGTTAATGACTCGTCCCGTCACGA‑T‑CTTCAGCAATATGCTGa < 1:1225865/150‑1 (MQ=255) ttATCTGCATCGCTATCTGGAAAATGCGCCTGGCGGACATATTCACCACGATCTTAGCCACGTCTTCGACTTACACCGTAATTTAATTGCAACCGGCTCGATGCTGGGTTAATGACTCGTCCCGTCACGA‑T‑CTTCAGCAATATGCTGAAg < 2:168374/150‑1 (MQ=255) ttATCTGCATCGCTATCTGGAAAATGCGCCTGGCGGACATATTCACCACGATCTTAGCCACGTCTTCGACTTACACCGTAATTTAATTGCAACCGGCTCGATGCTGGGTTAATGACTCGTCCCGTCACGA‑T‑CTTCAGCAATATGCTGAAg < 1:1283807/150‑1 (MQ=255) cTGCATCGCTATCTGGAAAATGCGCCTGGCGGACATATTCACCACGATCTTAGCCACGTCTTCGACTTACACCGTAATTTAATTGCAACCGGCTCGATGCTGGGTTAATGACTCGTCCCGCCACGA‑TGCTTCAGCATATTGCTGAAgatc < 1:666072/150‑4 (MQ=255) tGCATCGCTATCTGTAAAATGCGCCTGGCGGACATATTCACCACGATCTTAGCCACGTCTTCGACTTACACCGTAATTTAATTGCAACCGGCTCGATGCTGGGTTAATGACTCGTCCCGTCACGA‑T‑CTTCAGCAATATGCTGAAGCATCg > 1:847338/1‑150 (MQ=255) tGCATCGCTATCTGGAAAATGCGCCTTGCGGACATATTCTCCACGATCTTAGGCACTTCTTGGACTTACACCGTAATTTAATTGCTACCGGCTCGATGCTGTGTTAATGACTCGTCCAGCCACTA‑TGCTTCAGCATATTGCTGAAgatgg < 2:650306/150‑5 (MQ=255) aTCGCTATCTGGAAAATGCGCCTGGCGGACATATTCACCACGATCTTAGCCACGTCTTCGACTTACACCGTAATTTAATTGCAACCGGCTCGATGCTGGGTTAATGACTCGTCCCGTCACGA‑T‑CTTCAGCATATTGCTGAAG‑ATCGTgac < 1:362711/150‑3 (MQ=255) cGCTATCTGGAAAATGCGCCTGGCGGACATATTCACCACGATCTTAGCCACGTCTTCGACTTACACCGTAATTTAATTGCAACCGGCTCGATGCTGGGTTAATGACTCGTCCCGCCACGACG‑CTTCAGCATATTGCTGAAG‑ATCGTGACg < 2:1113482/150‑1 (MQ=38) gCTATCTGGAAAATGCGCCTGGCGGACATATTCACCACGATCTTAGCCACGTCTTCGACTTACACCGTAATTTAATTGCAACCGGCTCGATGCTGGGTTAATGACTCGTCCCGTCACGA‑T‑CTTCAGCAATATGCTGAAGCATCGTGGCgg > 1:586800/1‑150 (MQ=255) tATCTGGAAAATGCGCCTGGCGGACATATTCACCACGATCTTAGCCACGTCTTCGACTTACACCGTAATTTAATTGCAACCGGCTCGATGCTGGGTTAATGACTCGTCCCGTCACGA‑T‑CTTCAGTAATATGCGGAAGCATCGTGGCGGta < 1:297420/150‑1 (MQ=255) tCTGGAAAATGCGCCTGGCGGACATATTCACCACGATCTTAGCCACGTCTTCGACTTACACCGTAATTTAATTGCAACCGGCTCGATGCTGGGTTAATGACTCGTCCCGCCACGA‑TGCTTCAGCATATTGCTGAAG‑ATCGTGACgggacg < 1:101875/150‑5 (MQ=37) tCTGGAAAATGCGCCTGGCGGACATATTCACCACGATCTTAGCCACGTCTTCGACTTACACCGTAATTTAATTGCAACCGGCTCGATGCCGGGTTAATGACTCGTCCCGTCACGA‑T‑CTTCACCAATATGCTGAAGCATCGTGGCGGtata > 1:1403437/1‑150 (MQ=255) cTGGAAAATGCGCCTGGCGGACATATTCACCACGATCTTAGCCACGTCTTCGACTTACACCGTAATTTAATTGCAACCGGCTCGATGCTGGGTTAATGACTCGTCCCGTCACGA‑T‑CTTCAGCAATATGCTGAAGCATCGTGGCGGTATaa > 1:1484788/1‑150 (MQ=255) tGGAAAATGCGCCTGGCGGACATATTCACCACGATCTTAGCCACGTCTTCGACTTACACCGTAATTTAATTGCAACCGGCTCGATGCTGGGTTAATGACTCGTCCCGTCACGA‑T‑CTTCAGCAATATGCTGAAGCATCGTGGCGGTATAAc < 2:1182558/150‑1 (MQ=255) tGGAAAATGCGCCTGGCGGACATATTCACCACGATCTTAGCCACGTCTTCGACTTACACCGTAATTTAATTGCAACCGGCTCGATGCTGGGTTAATGACTCGTCCCGTCACGA‑T‑CTTCAGCAATATGCTGAAGCATCGTGGCGGTATAAc > 2:259319/1‑150 (MQ=255) tGGAAAATGCGCCTGGCGGACATATTCACCACGATCTTAGCCACGTCTTCGACTTACACCGTAATTTAATTGCAACCGGCTCGATGCTGGGTTAATGACTCGTCCCGTCACGA‑T‑CTTCAGCAATATGCTGAAGCATCGTGGCGGTATAAc < 1:1132991/150‑1 (MQ=255) tGGAAAATGCGCCTGGCGGACATATTCACCACGATCTTAGCCACGTCTTCGACTTACACCGTAATTTAATTGCAACCGGCTCGATGCTGGGTTAATGACTCGTCCCGTCACGA‑T‑CTTCAGCAATATGCTGAAGCATCGTGGCGGTATAAc < 1:682909/150‑1 (MQ=255) aaaaTGCGCCTGGCGGACATATTCACCACGATCTTAGCCACGTCTTCGACTTACACCGTAATTTAATTGCAACCGGCTCGATGCTGGGTTAATGACTCGTCCCGTCACGA‑T‑CTTCAGCAATATGCTGAAGCATCGTGGCGGTATAACgat > 1:1025173/1‑150 (MQ=255) cgcCTGGCGGACATATTCACCACGATCTTAGCCACGTCTTCGACTTACACCGTAATTTAATTGCAACCGGCTCGATGCTGGGTTAATGACTCGTCCCGTCACGA‑T‑CTTCAGCAATATGCTGAAGCATCGTGGCGGTATAACGATGATTTc < 1:985731/150‑1 (MQ=255) cgcCTGGCGGACATATTCACCACGATCTTAGCAACGTCTTAGACTTACACCGTAATTTAATTGCAACCGCCTCGATGCAGGGTTAATGACTCGTCCCGTCACGA‑T‑CATCAGCAATATTCTCAAGCATCGTGGCGGTATAACGATGATATc > 1:844129/1‑150 (MQ=255) gcCTGGCGGACATATTCACCACGATCTTAGCCACGTCTTCGACTTACACCGTAATTTAATTGCAACCGGCTCGATGCTGGGTTAATGACTCGTCCCGTCACGA‑T‑CTTCAGCAATATGCTGAAGCATCGTGGCGGTATAACGATGATTTCt > 1:330928/1‑150 (MQ=255) ccTGGCGGACATATTCACCACGATCTTAGCCACGTCTTCGACTTACACCGTAATTTAATTGCAACCGGCTCGATGGTGGGTTAATGACTCGTCCCGTCACGA‑T‑CTTCAGCAATATTCTGAAGCATAGTGGAGGTATTACGATGATTTCTg > 2:506427/1‑150 (MQ=255) tGGCGGACATATTCACCACGATCTTAGCCACGTCTTCGACTTACACCGTAATTTAATTGCAACCGGCTCGATGCTGGGTTAATGACTCGTCCCGTCACGA‑T‑CTTCAGCAATATGCTGAAGCATCGTGGCGGTATAACGATGATTTCTGAt < 2:551904/150‑1 (MQ=255) tGGCGGACATATTCACCACGATCTTAGCCACGTCTTCGACTTACACCGTAATTTAATTGCAACCGGCTCGATGCTGGGTTAATGACTCGTCCCGTCACGA‑T‑CTTCAGCAATATGCTGAAGCATCGTGGCGGTATAACGATGATTTCTGAt < 1:794818/150‑1 (MQ=255) tGGCGGACATATTCACCACGATCTTAGCCACGTCTTCGACTTACACCGTAATTAAATTGCAACCGGCTCGATGCTGGGTTAATGACTCGTCCCGTCACGA‑T‑CTTCAGCAATATGCTGAAGCATCGTGGCGGTATAACGATGATTTCTGAt < 1:108552/150‑1 (MQ=255) gACATATTCACCACGATCTTAGCCACGTCTTCGACTTACACCGTAATTTAATTGCAACCGGCTCGATGCTGGGTTAATGACTCGTCCCGTCACGA‑T‑CTTCAGCAATATGCTGAAGCATCGTGGCGGTATAACGATGATTTCTGATTGAAt < 1:1537951/150‑1 (MQ=255) tatTCTCCACGATGTTAGTGTCGTCGTCGAGTTACTCCGTAATTTAATTGGAACCGGCTCGATGCTGGGTTAATGACTCGTCCCGTCACTA‑T‑CTTCAGCAATATGCTGAAGCATCGTTGCGGTATAACGATGATTTCTGATTGAATAAAg < 2:1167781/150‑1 (MQ=255) tatTCACCACGATCTTAGCCACGTCTTCGACTTACACCGTAATTTAATTGCAACCGGCTCGATGCTGGGTTAATGACTCGTCCCGTCACGA‑T‑CTTCAGCAATATGCTGAAGCATCGTGGCGGTATAACGATGATTTCTGATTGAATAAAg > 2:141268/1‑150 (MQ=255) tatTCACCACGATCTTAGCCACGTCTTCGACTTACACCGTAATTTAATTGCAACCGGCTCGATGCTGGGTTAATGACTCGTCCCGTCACGA‑T‑CTTCAGCAATATGCTGAAGCATCGTGGCGGTATAACGATGATTTCTGATTGAATAAAg > 1:1215104/1‑150 (MQ=255) tatTCACCACGATCTTAGCCACGTCTTCGACTTACACCGTAATTTAATTGCAACCGGCTCGATGCTGGGTTAATGACTCGTCCCGTCACGA‑T‑CTTCAGCAATATGCTGAAGCATCGTGGCGGTATAACGATGATTTCTGATTGAATAAAg < 2:1204712/150‑1 (MQ=255) tatTCACCACGATCTTAGCCACGTCTTCGACTTACACCGTAATTTAATTGCAACCGGCTCGATGCTGGGTTAATGACTCGTCCCGTCACGA‑T‑CTTCAGCAATATGCTGAAGCATCGTGGCGGTATAACGATGATTTCTGATTGAATAAAg < 2:1346589/150‑1 (MQ=255) tatTCACCACGATCTTAGCCACGTCTTCGACTTACACCGTAATTTAATTGCAACCGGCTCGATGCTGGGTTAATGACTCGTCCCGTCACGA‑T‑CTTCAGCAATATGCTGAAGCATCGTGGCGGTATAACGATGATTTCTGATTGAATAAAg < 1:141268/150‑1 (MQ=255) atTCACCACGATCTTAGCCACGTCTTCGACTTACACCGTAATTTAATTGCAACCGGCTCGATGCTGGGTTAATGACTCGTCCCGTCACGA‑T‑CTTCAGCAATATGCTGAAGCATCGTGGCGGTATAACGATGATTTCTGATTGAATAAAGa < 1:1391853/150‑1 (MQ=255) ttCACCACGATCTTAGCCACGTCTTCGACTTACACCGTAATTTAATTGCAACCGGCTCGATGCTGGGTTAATGACTCGTCCCGTCACGA‑T‑CTTCAGCAATATGCTGAAGCATCGTGGCGGTATAACGATGATTTCTGATTGAATAAAGat < 1:958946/150‑1 (MQ=255) ttCACCACGATCTTAGCCACGTCTTCGACTTACACCGTAATTTAATTGCAACCGGCTCGATGCTGGGTTAATGACTCGTCCCGTCACGA‑T‑CTTCAGCAAAATGCTGAAGCATCGTGGCGGTATAACGATGATTTCTGATTGAATAAAGa < 1:1060492/149‑1 (MQ=255) cGATCTTAGCCACGTCTTCGACTTACACCGTAATTTAATTGCAACCGGCTCGATGCTGGGTTAATGACTCGTCCCGTCACGA‑T‑CTTCAGCAATATGCTGAAGCATCGTGGCGGTATAACGATGATTTCTGATTGAATAAAGATATTCCTg < 2:586800/150‑1 (MQ=255) cGATCTTAGCCACGTCTTCGACTTACACCGTAATTTAATTGCAACCGGCTCGATGCTGGGTTAATGACTCGTCCCGTCACGA‑T‑CTTCAGCAATATGCTGAAGCATCGTGGCGGTATAACGATGATTTCTGATTGAATAAAGATATTCCTg < 1:1483340/150‑1 (MQ=255) cGATCTTAGCCACGTCTTCGACTTACACCGTAATTTAATTGCAACCGGCTCGATGCTGGGTTAATGACTCGTCCCGTCACGA‑T‑CTTCAGCAATATGCTGAAGCATCGTGGCGGTATAACGATGATTTCTGATTGAATAAAGATATTCCTg < 1:445500/150‑1 (MQ=255) cGATCTTAGCCACGTCTTCGACTTACACCGTAATTTAATTGCAACCGGCTCGAGGCTGGGTTAATGACTCGTCCCGTCACGA‑T‑CTTCAGCAATATGCTGAAGCATCGTGGCGGTATAACGATGATTTCTGATTGAATAAAGATATTCCTg > 2:659326/1‑150 (MQ=255) gATCTTAGCCACGTCTTCGACTTACACCGTAATTTAATTGCAACCGGCTCGATGCTGGGTTAATGACTCGTCCCGTCACGA‑T‑CTTCAGCAATATGCTGAAGCATCGTGGCGGTATAACGATGATTTCTGATTGAATAAAGATATTCCTGc < 2:380302/150‑1 (MQ=255) tCTTAGCCACGTCTTCGACTTACACCGTAATTTAATTGCAACCGGCTCGATGCTGGGTTAATGACTCGTCCCGTCACGA‑T‑CTTCAGCAATATGCTGAAGCATCGTGGCGGTATAACGATGATTTCTGATTGAATAAAGATATTCTTGCat < 1:465108/150‑1 (MQ=255) cTTAGCCACGTCTTCGACTTACACCGTAATTTAATTGCAACCGGCTCGATGCTGGGTTAATGACTCGTCCCGTCACGA‑T‑CTTCAGCAATATGCTGAAGCATCGTGGCGGTATAACGATGATTTCTGATTGAATAAAGATATTCCTGCata < 1:930222/150‑1 (MQ=255) tAGCCACGTCTTCGACTTACACCGTAATTTAATTGCAACCGGCTCGATGCTGGGTTAATGACTCGTCCCGTCACGA‑T‑CTTCAGCAATATGCTGAAGCATCGTGGCGGTATAACGATGATTTCTg < 2:21260/124‑1 (MQ=255) tAGCCACGTCTTCGACTTACACCGTAATTTAATTGCAACCGGCTCGATGCTGGGTTAATGACTCGTCCCGTCACGA‑T‑CTTCAGCAATATGCTGAAGCATCGTGGCGGTATAACGATGATTTCTg > 1:21260/1‑124 (MQ=255) tAGCCACGTCTTCGACTTACACCGTAATTTAATTGCAACCGGCTCGATGCTGGGTTAATGACTCGTCCCGTCACGA‑T‑CTTCAGCAATATGCTGAAGCATCGTGGCGGTATAACGATGATTTCTGATTGAATAAAGATATTCCTGCAtata > 2:909508/1‑150 (MQ=255) gCCACGTCTTCGACTTACACCGTAATTTAATTGCAACCGGCTCGATGCTGGGTTAATGACTCGTCCCGTCACGA‑T‑CTTCAGCAATATGCTGAAGCATCGTGGCGGTATAACGATGATTTCTGATTGAATAAAGATATTCCTGCATATACa > 2:395650/1‑150 (MQ=255) aCGTCTTCGACTTACACCGTAATTTAATTGCAACCGGCTCGATGCTGGGTTAATGACTCGTCCCGTCACGA‑T‑CTTCAGCAATATGCTGAAGCATCGTGGCGGTATAACGATGATTTCTGATTGAATAAAGATATTCCTGCATATACATCg > 1:638842/1‑150 (MQ=255) cGTCTTCGACTTACACCGTAATTTAATTGCAACCGGCTCGATGCTGGGTTAATGACTCGTCCCGTCACGA‑T‑CTTCAGCAATATGCTGAAGCATCGTGGCGGTATAACGATGATTTCTGATTGAATAAAGATATTCCTGCATATACATCgg < 2:1484788/150‑1 (MQ=255) ttACACCGTAATTTAATTGCAACCGGCTCGATGCTGGGTTAATGACTCGTCCCGTCACGA‑T‑CTTCAGCAATATGCTGAAGCATCGTGGCGGTATAACGATGATTTCTGATTGAATAAAGATATTCCTGCATATACATCGGCCTGTGCggg < 1:1508345/150‑2 (MQ=255) ttACACCGTAATTTAATTGCAACCGGCTCGATGCTGGGTTAATGACTCGTCCCGTCACGA‑T‑CTTCAGCAATATGCTGAAGCATCGTGGCGGTATAACGATGATTTCTGATTGAATAAAGATATTCCTGCATATACATCGGCCTGTGCGGt < 2:1111744/150‑1 (MQ=255) cacCGTAATTTAATTGCAACCGGCTCGATGCTGGGTTAATGACTCGTCCCGTCACGA‑T‑ATTCAGCAATATGCTGAAGCATCGTGGCGGTATAACGATGATTTCTGATTGAATAAAGATATTCCTGCATATACATCGGCCTGTGCGGTGCa > 1:251448/1‑150 (MQ=255) cacCGTAATTTAATTGCAACCGGCTCGATGCTGGGTGAATGACTCGTCCCGTCACGA‑T‑CTTCAGCAATATGCTGAAGCATCGTGGCGGTATAACGATGATTTCAGATTGAATAAAGATATTCCTGAATATACATCTGCATGTGCGGTGCa > 2:1354798/1‑150 (MQ=255) ccGTAATTTAATTGCAACCGGCTCGATGCTGGGTTAATGACTCGTCCCGTCACGA‑T‑CTTCAGCAATATGCTGAAGCATCGTGGCGGTATAACGATGATTTCTGATTGAATAAAGATATTCCTGCATATACATCGGCCTGTGCGGTGCATc > 1:910425/1‑150 (MQ=255) gTAATTTAATTGCAACCGGCTCGATGCTGGGTTAATGACTCGTCCCGTCACGA‑T‑CTTCAGCAATATGCTGAAGCATCGTGGCGGTATAACGATGATTTCTGATTGAATAAAGATATTCCTGCATATACATCGGCCTGTGCGGTGCATCaa > 1:998511/1‑150 (MQ=255) aatttaattGCAACCGGCTCGATGCTGGGTTAATGACTCGTCCCGTCACGA‑T‑CTTCAGCAATATGCTGAAGCATCGTGGCGGTATAACGATGATTTCTGATTGAATAAAGATATTCCTGCATATACATCGGCCTGTGCGGTGCATCaaaa < 1:1469684/150‑1 (MQ=255) tttaattGCAACCGGCTCGATGCTGGGTTAATGACTCGTCCCGTCACGA‑T‑CTTCAGCAATATGCTGAAGCATCGTGGCGGTATAACGATGATTTCTGATTGAATAAAGATATTCCTGCATATACATCGGCCTGTGCGGTGCATCAAAata > 2:816313/1‑150 (MQ=255) tttaattGCAACCGGCTCGATGCTGGGTTAATGACTCGTCCCGTCACGA‑T‑CTTCAGCAATATGCTGAAGCATCGTGGCGGTATAACGATGATTTCTGATTGAATAAAGATATTCCTGCATATACATCGGCCTGTGCGGTGCATCAAAata > 2:805307/1‑150 (MQ=255) ttaattGCAACCGGCTCGATGCTGGGTTAATGACTCGTCCCGTCACGA‑T‑CTTCAGCAATATGCTGAAGCAACGTGGCGGTATAACGATGATTTCTGATTGAATAAAGATATTCCTGCATATACATCGGCCTGTGCGGTGCATCAAAatat > 1:358053/1‑150 (MQ=255) attGCAACCGGCTCGATGCTGGGTTAATGACTCGTCCCGTCACGA‑T‑CTTCAGCAATATGCTGAAGCATCGTGGCGGTATAACGATGATTTCTGATTGAATAAAGATATTCCTGCATATACATCGGCCTGTGCGGTGCATCAAAATATTTc < 2:575016/150‑1 (MQ=255) tGCAACCGGCTCGATGCTGGGTTAATGACTCGTCCCGTCACGA‑T‑CTTCAGCAATATGCTGAAGCATCGTGGCGGTATAACGATGATTTCTGATTGAATAAAGATATTCCTGCATATACATCGGCCTGTGCGGTGCATCAAAATATTTCAg > 2:715775/1‑150 (MQ=255) gCAACCGGCTCGATGCTGGGTTAATGACTCGTCCCGTCACGA‑T‑CTTCAGCAATATGCTGAAGCATCGTGGCGGTATAACGATGATTTCTGATTGAATAAAGATATTCCTGCATATACATCGGCCTGTGCGGTGCATCAAAATATTTCAGc > 2:1017071/1‑150 (MQ=255) gCAACCGGCTCGATGCTGGGTTAATGACTCGTACCGTCACGA‑T‑CTTCAGCAATATGCTGAAGCATCGTGGCGGTATAACGATGATTTCTGATTGAATAAAGATATTCCTGCATATACATCGGCCTGTGCGGTGCATCAAAATATTTCAGc > 2:438316/1‑150 (MQ=255) cAACCGGCTCGATGCTGGGTTAATGACTCGTCCCGTCACGA‑T‑CTTCAGCAATATGCTGAAGCATCGTGGCGGTATAACGATGATTTCTGATTGAATAAAGATATTCCTGCATATACATCGGCCTGTGCGGTGCATCAAAATATTTCAGCg > 1:342147/1‑150 (MQ=255) aaCCGGCTCGATGCTGGGTTAATGACTCGTCCCGTCACGA‑T‑CTTCAGCAATATGCTGAAGCATCGTGGCGGTATAACGATGATTTCTGATTGAATAAAGATATTCCTGCATATACATCGGCCTGTGCGGTGCATCAAAATATTTCAGCGt > 2:286783/1‑150 (MQ=255) aaCCGGCTCGATGCTGGGTTAATGACTCGTCCCGTCACGA‑T‑CTTCAGCAATATGCTGAAGCATCGTGGCGGTATAACGATGATTTCTGATTGAATAAAGATATTCCTGCATATACATCGGCCTGTGCGGTGCATCAAAATATTTCAGCGt < 2:913578/150‑1 (MQ=255) aCCGGCTCGATGCTGGGTTAATGACTCGTCCCGTCACGA‑T‑CTTCAGCAATATGCTGAAGCATCGTGGCGGTATAACGATGATTTCTGATTGAATAAAGATATTCCTGCATATACATCGGCCTGTGCGGTGCATCAAAATATTTCAGCGtt < 1:637668/150‑1 (MQ=255) aCCGGCTCGATGCTGGGTTAATGACTCGTCCCGTCACGA‑T‑CTTCAGCAATATGCTGAAGCATCGTGGCGGTATAACGATGATTTCTGATTGAATAAAGATATTACTGCATATACATCGGCCTGTGCGGTGCATCAAAATATTTCAGCGtt > 1:1257712/1‑150 (MQ=255) ggCTCGATGCTGGGTTAATGACTCGTCCCGTCACGA‑T‑CTTCAGCAATATGCTGAAGCATCGTGGCGGTATAACGATGATTTCTGATTGAATAAAGATATTCCTGCATATACATCGGCCTGTGCGGTGCATCAAAATATTTCAGCGTTGcc > 2:1110663/1‑150 (MQ=255) cTCGATGCTGGGTTAATGACTCGTCCCGTCACGA‑T‑CTTCAGCAATATGCTGAAGCATCGTGGCGGTATAACGATGATTTCTGATTGAATAAAGATATTCCTGCATATACATCGGCCTGTGCGGTGCATCAAAATATTTCAGCGTTGCCgg > 1:2198/1‑150 (MQ=255) tCGATGCTGGGTTAATGACTCGTCCCGTCACGA‑T‑CTTCAGCAATATGCTGAAGCATCGTGGCGGTATAACGATGATTTCTGATTGAATAAAGATATTCCTGCATATACATCGGCCTGTGCGGTGCATCAAAATATTTCAGCGTTGCCGGa < 1:805307/150‑1 (MQ=255) gATGCTGGGTTAATGACTCGTCCCGTCACGA‑T‑CTTCAGCAATATGCTGAAGCATCGTGGCGGTATAACGATGATTTCTGATTGAATAAAGATATTCCTGCATATACATCGGCCTGTGCGGTGCATCAAAATATTTCAGCGTTGCCGGAtt > 1:517606/1‑150 (MQ=255) cTGGGTTAATGACTCGTCCCGTCACGA‑T‑CTTCAGCAATATGCTGAAGCATCGTGGCGGTATAACGATGATTTCTGATTGAATAAAGATATTCCTGCATATACATCGGCCTGTGCGGTGCGTCAAAATATTTCAGCGTTGCCGGATTCAcc < 2:914398/150‑1 (MQ=255) cTGGGTTAATGACTCGTCCCGTCACGA‑T‑CTTCAGCAATATGCTGAAGCATCGTGGCGGTATAACGATGATTTCTGATTGAATAAAGATATTCCTGCATATACATCGGCCTGTGCGGTGCGTCAAAATATTTCAGCGTTGCCGGATTCAcc < 2:920141/150‑1 (MQ=255) gTTAATGACTCGTCCCGTCACGA‑T‑CTTCAGCAATATGCTGAAGCATCGTGGCGGTATAACGATGATTTCTGATTGAATAAAGATATTCCTGCATATACATCGGCCTGTGCGGTGCATCAAAATATTTCAGCGTTGCCGGATTCACCAGTc > 1:1349632/1‑150 (MQ=255) tGACTCGTCCCGTCACGA‑T‑CTTCATCAATATGCTGAAGCATCGTGGCTGTATATCGATGATTTCTGATTGAATAAAGATATTCCTGCATATACATCGGCCTGTGCGGTGCATCAAAATATTTCAGCGTTGCCGGATTCACCAGTCGCCAg < 2:1363231/150‑1 (MQ=255) tGACTCGTCCCGTCACGA‑T‑CTTCAGCAATATGCTGAAGCATCGTGGCGGTATAACGATGATTTCTGATTGAATAAAGATATTCCTGCATATACATCGGCCTGTGCGGTGCATCAAAATATTTCAGCGTTGCCGGATTCACCAGTCGCCAg > 2:377742/1‑150 (MQ=255) cTCGTCCCGTCACGA‑T‑CTTCAGCAATATGCTGAAGCATCGTGGCGGTATAACGATGATTTCTGATTGAATAAAGATATTCCTGCATATACATCGGCCTGTGCGGTGCATCAAAATATTTCAGCGTTGCCGGATTCACCAGTCGCCAGGCa > 1:1353631/1‑150 (MQ=255) cGTCCCGTCACGA‑T‑CTTCAGCAATATGCTGAAGCATCGTGGCGGTATAACGATGATTTCTGATTGAATAAAGATATTCCTGCATATACATCGGCCTGTGCGGTGCATCAAAATATTTCAGCGTTGCCGGATTCACCAGTCGCCAGGCaaa > 2:1312060/1‑150 (MQ=255) taccGCCACGA‑TGCTTCAGCATATTGCTGAAGCATCGTGGCGGTATAACGATGATTTCTGATTGAATAAAGATATTCCTGCATATACATCGGCCTGTGCGGTGCATCAAAATATTTCAGCGTTGCCGGATTCACCAGTCGCCAGGCaaaa > 2:517507/3‑150 (MQ=255) cccGTCACGA‑T‑CTTCAGCAATATGCTGAAGCATCGTGGCGGTATAACGATGATTTCTGATTGAATAAAGATATTCCTGCATATACATCGGCCTGTGCGGTGCATCAAAATATTTCAGCGTTGCCGGATTCACCAGTCGCCAGGCAAAATg > 2:1373609/1‑150 (MQ=255) cGTCACGA‑T‑CTTCAGCAATATGCTGAAGCATCGTGGCGGTATAACGATGATTTCTGATTGAATAAAGATATTCCTGCATATACATCGGCCTGTGCGGTGCATCAAAATATTTCAGCGTTGCCGGATTCACCAGTCGCCAGGCAAAATGCg < 1:820633/150‑1 (MQ=255) | GTGCACATCCTATGTATCGGGATTATCTGCATCGCTATCTGGAAAATGCGCCTGGCGGACATATTCACCACGATCTTAGCCACGTCTTCGACTTACACCGTAATTTAATTGCAACCGGCTCGATGCTGGGTTAATGACTCGTCCCGTCACGA‑T‑CTTCAGCAATATGCTGAAGCATCGTGGCGGTATAACGATGATTTCTGATTGAATAAAGATATTCCTGCATATACATCGGCCTGTGCGGTGCATCAAAATATTTCAGCGTTGCCGGATTCACCAGTCGCCAGGCAAAATGCGGG > NC_000913/3066147‑3066442 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |