| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 3,100,878 | G→T | 9.0% | intergenic (‑150/+26) | ansB ← / ← yggN | L‑asparaginase 2/putative EcfF |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 3,100,878 | 0 | G | T | 9.0% | 458.4 / 22.9 | 139 | intergenic (‑150/+26) | ansB/yggN | L‑asparaginase 2/putative EcfF |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (57/69); new base T (2/11); total (59/80) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.29e-02 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.99e-01 | |||||||||||
Only 100 of 140 total aligned reads displayed.
TTCATTCCTCCAGTTACGTGAACGCTACGCATTATCCCTTAGCTCTGTATGGGAAATTTGACGTTAAACAATTTACAACGTGAATATATTTTGGAGATCTACAAAGTTAGAGGCAGGTAACAAAACGAAGAATTAAACGGCATAAAAAAGTATTATGCCGTCTTAAAATAGAGGATTATTTTAAATTCCCGACCAGGGCTTTGCGGCTATCTTCCAGAGTCACAACGCGGCTACAAACATCTTTGCCAAACTGCTGGAAATCTTTTTCCTGCTTTTTCCACTCGGTTTGGATTGAG > NC_000913/3100729‑3101024 | ttCATTCCTCCAGTTACGTGAACGCTACGCATTATCCCTTAGCTCTGTATGGGAAATTTGACGTTAAACAATTTACAACGTGAATATATTTTGGAGATCTACAAAGTTAGAGGCAGGTAACAAAACGAAGAATTAAACGGCATAAAAAAg > 1:1406877/1‑150 (MQ=255) cctccAGTTACGTGAACGCTACGCATTATCCCTTAGCTCTGTATGGGAAATTTGACGTTAAACAATTTACAACGTGAATATATTTTGGAGATCTACAAAGTTAGAGGCAGGTAACAAAAAGAAGAATTAAACGGCATAAAAAAGtattat > 1:676608/1‑150 (MQ=255) ctccAGTTACGTGAACGCTACGCATTATCCCTTAGCTCTGTATGGGAAATTTGACGTTAAACAATTTACAACGTGAATATATTTTGGAGATCTACAAAGTTAGAGGCAGGTAACAAAACGAAGAATTAAACGGCATAAAAAAGTATTATg > 2:1233389/1‑150 (MQ=255) tccAGTTACGTGAACGCTACGCATTATCCCTTAGCTCTGTATGGGAAATTTGACGTTAAACAATTTACAACGTGAATATATTTTGGAGATCTACAAAGTTAGAGGCAGGTAACAAAACGAAGAATTAAACGGCATAAAAAAGTATTATGc < 1:912211/150‑1 (MQ=255) tccAGTTACGTGAACGCTACGCATTATCCCTTAGCTCTGTATGGGAAATTTGACGTTAAACAATTTACAACGTGAATATATTTTGGAGATCTACAAAGTTAGAGGCAGGTAACAAAACGAAGAATTAAACGGCATAAAAAAGTATTATGc < 1:288162/150‑1 (MQ=255) ccAGTTACGTGAACGCTACGCATTATCCCTTAGCTCTGTATGGGAAATTTGACGTTAAACAATTTACAACGTGAATATATTTTGGAGATCTACAAAGTTAGAGGCAGGTAACAAAACGAAGAATTAAACGGCATAAAAAAGTATTATGcc < 1:1347892/150‑1 (MQ=255) ccAGTTACGTGAACGCTACGCATTATCCCTTAGCTCTGTATGGGAAATTTGACGTTAAACAATTTACAACGTGAATATATTTTGGAGATCTACAAAGTTAGAGGCAGGTAACAAAACGAAGAATTAAACGGCATAAAAAAGTATTATGcc > 2:29160/1‑150 (MQ=255) aGTTACGTGAACGCTACGCATTATCCCTTAGCTCTGTATGGGAAATTTGACGTTAAACAATTTACAACGTGAATATATTTTGGAGATCTACAAAGTTAGAGGCAGGTAACAAAACGAAGAATTAAACGGCATAATACTTTTTTATGCCGt < 2:20991/150‑1 (MQ=255) aGTTACGTGAACGCTACGCATTATCCCTTAGCTCTGTATGGGAAATTTGACGTTAAACAATTTACAACGTGAATATATTTTGGAGATCTACAAAGTTAGAGGCAGGTAACAAAACGAAGAATTAAACGGCATAAAAAAGTATTATGCCGt > 1:1128573/1‑150 (MQ=255) tACGTTAACTCTACGCATTATCCCTTAGCTCTGTATGGGAAATTTGACGTTAAACAATTTACAACTTGAATATATTTTGGAGATCTACAAAGTTAGAGGCAGGTAACAAAACGAAGAATTAAACGTCATAATACTTTTTTATGCCGttta < 2:654497/150‑4 (MQ=255) cGTTAACGGTACGCATTATCCCTTAGCTGTGTATGGGAAATTTGACGTTAAACTATTTACAACGTGAATATATTTTGGAGATCTACAAAGTTAGAGGCAGGTAACAAAACGAAGAATTAAACGGCATAATACTTTTTTATGCCGtttaat < 2:1066698/150‑6 (MQ=255) cGTGAACGCTACGCATTATCCCTTAGCTCTGTATGGGAAATTTGACGTTAAACAATTTACAACGTGAATATATTTTGGAGATCTACAAAGTTAGAGGCAGGTAACAAAACGAAGAATTAAACGGCATAATACTTTTTTATGCCGtttaat < 1:271383/150‑6 (MQ=255) cGTGAACGCTACGCATTATCCCTTAGCTCTGTATGGGAAATTTGACGTTAAACAATTTACAACGTGAATATATTTTGGAGATCTACAAAGTTAGAGGCAGGTAACAAAACGAAGAATTAAACGGCATAAAAAAGTATTATGCCGTCTTaa < 2:964349/150‑1 (MQ=255) cGTGAACGCTACGCATTATCCCTTAGCTCTGTATGGGAAATTTGACGTTAAACAATTTACAACGTGAATATATTTTGGAGATCTACAAAGTTAGAGGCAGGTAACAAAACGAAGAATTAAACGGCATAAAAAAGTATTATGCCGTCTTaa < 1:493821/150‑1 (MQ=255) gTGAACGCTACGCATTATCCCTTAGCTCTGTATGGGAAATTTGACGTTAAACAATTTACAACGTGAATATATTTTGGAGATCTACAAAGTTAGAGGCAGGTAACAAAACGAAGAATTAAACGGCATAAAAAAGTATTATGCCGTCTTaaa < 1:620636/150‑1 (MQ=255) tGAACGCTACGCATTATCCCTTAGCTCTTTATGGGAAATTTGACGTTAAACAATTTACAACGTGAATATATTTTGGAGATCTACAAAGTTAGAGGCAGGTAACAAAACGAAGAATTAAACGGCATAAAAAAGTATTATGCCGTCTTaaaa < 2:1371162/150‑1 (MQ=255) tGAACGCTACGCATTATCCCTTAGCTCTGTATGGGAAATTTGACGTTAAACAATTTACAACGTGAATATATTTTGGAGATCTACAAAGTTAGAGGCAGGTAACAAAACGAAGAATTAAACGGCATAATACTTTTTTATGCCGtttaattc < 1:868788/150‑8 (MQ=255) gAACGCTACGCATTATCCCTTAGCTCTGTATGGGAAATTTGACGTTAAACAATTTACAACGTGAATATATTTTGGAGATCTACAAAGTTAGAGGCAGGTAACAAAACGAAGAATTAAACGGCATAAAAAAGTATTATGCCGTCTTAAGAt > 2:36060/1‑150 (MQ=255) aCGCTACGCATTATCCCTTAGCTCTGTATGGGAAATTTGACGTTAAACAATTTACAACGTGAATATATTTTGGAGATCTACAAAGTTAGAGGCAGGTAACAAAACGAAGAATTAAACGGCATAAAAAAGTATTATGCCGTCTTAAAATag > 1:224897/1‑150 (MQ=255) cGCTACGCATTATCCCTTAGCTCTGTATGGGAAATTTGACGTTAAACAATTTACAACGTGAATATATTTTGGAGATCTACAAAGTTAGAGGCAGGTAACAAAACGAAGAATTAAACGGCATAAAAAAGTATTATGCCGTCTTAAAATaga < 1:1434027/150‑1 (MQ=255) gCTACGCATTATCCCTTAGCTCTGTATGGGAAATTTGACGTTAAACAATTTACAACGTGAATATATTTTGGAGATCTACAAAGTTAGAGGCAGGTAACAAAACGAAGAATTAAACGGCATAAAAAAGTATTATGCCGTCTTAAAATagag < 1:1020033/150‑1 (MQ=255) ccTACGCATTATCCCTTAGCTCTGTATGGGAAATTTGACGTTAAACAATTTACAACGTGAATATATTTTGGAGATCTACAAAGTTAGAGGCAGGTAACAAAACGAAGAATTAAACGGCATAAAAAAGTATTATGCCGTCTTAAAATagag < 1:315822/149‑1 (MQ=255) cTACGCATTATCCCTTAGCTCTGTATGGGAAATTTGACGTTAAACAATTTACAACGTGAATATATTTTGGAGATCTACAAAGTTAGAGGCAGGTAACAAAACGAAGAATTAAACGGCATAAAAAAGTATTATGCCGTCTTAAAATAGAgg > 1:1472333/1‑150 (MQ=255) tACGCATTATCCCTTAGCTCTGTATGGGAAATTTGACGTTAAACAATTTACAACGTGAATATATTTTGGAGATCTACAAAGTTAGAGGCAGGTAACAAAACGAAGAATTAAACGGCATAAAAAAGTATTATGCCGTCTTAAAATAGAGGa > 2:1525012/1‑150 (MQ=255) aCGCATTATCCCTTAGCTCTGTATGGGAAATTTGACGTTAAACAATTTACAACGTGAATATATTTTGGAGATCTACAAAGTTAGAGGCAGGTAACAAAACGAAGAATTAAACGGCATAAAAAAGTATTATGCCGTCTTAAAATAGAGGat > 2:111918/1‑150 (MQ=255) cATTATCCCTTAGCTCTGTATGGGAAATTTGACGTTAAACAATTTACAACGTGAATATATTTTGGAGATCTACAAAGTTAGAGGCAGGTAACAAAACGAAGAATTAAACGGCATAAAAAAGTATTATGCCGTCTTAAAATAGAGGattat > 2:1454622/1‑150 (MQ=255) cATTATCCCTTAGCTCTGTATGGGAAATTTGACGTTAAACAATTTACAACGTGAATATATTTTGGAGATCTACAAAGTTAGAGGCAGGTAACAAAACGAAGAATTAAACGGCATAAAAAAGTATTATGCCGTCTTAAAATAGAGGattat > 1:599044/1‑150 (MQ=255) ttATCCCTTAGCTCTGTATGGGAAATTTGACGTTAAACAATTTACAACGTGAATATATTTTGGAGATCTACAAAGTTAGAGGCAGGTAACAAAACGAAGAATTAAACGGCATAAAAAAGTATTATGCCGTCTTAAAATAGAGGATTAttt < 1:1152360/150‑1 (MQ=255) tCCCTTAGCTCTGTATGGGAAATTTGACGTTAAACAATTTACAACGTGAATATATTTTGGAGATCTACAAAGTTAGAGGCAGGTAACAAAACGAAGAATTAAACGGCATAAAAAAGTATTATGCCGTCTTAAAATAGAGGATTATTTTaa < 1:69005/150‑1 (MQ=255) ccTTAGCTCTGTATGGGAAATTTGACGTTAAACAATTTACAACGTGAATATATTTTGGAGATCTACAAAGTTAGAGGCAGGTAACAAAACGAAGAATTAAACGGCATAAAAAAGTATTATGCCGTCTTAAAATAGAGGATTATTTTAAAt > 2:536239/1‑150 (MQ=255) ccTTAGCTCTGTATGGGAAATTTGACGTTAAACAATTTACAACGTGAATATATTTTGGAGATCTACAAAGTTAGAGGCAGGTAACAAAACGAAGAATTAAACGGCATAAAAAAGTATTATGCCGTCTTAAAATAGAGGATTATTTTAAAt < 2:690426/150‑1 (MQ=255) aGCTCTGTATGGGAAATTTGACGTTAAACAATTTACAACGTGGATATATTTTGGAGATCTACAAAGTTAGAGGCAGGTAACAAAACGAAGAATTAAACGGCATAAAAAAGTATTATGCCGTCTTAAAATAGAGGATTATTTTAAATTccc < 1:17334/150‑1 (MQ=255) aGCTCTGTATGGGAAATTTGACGTTAAACAATTTACAACGTGAATATATTTTGGAGATCTACAAAGTTAGAGGCAGGTAACAAAACGAAGAATTAAACGGCATAAAAAAGTATTATGCCGTCTTAAAATAGAGGATTATTTTAAATTccc > 2:1157113/1‑150 (MQ=255) aGCTCTGTATGGGAAATTTGACGTTAAACAATTTACAACGTGAATATATTTTGGAGATCTACAAAGTTAGAGGCAGGTAACAAAACGAAGAATTAAACGGCATAAAAAAGTATTATGCCGTCTTAAAATAGAGGATTATTTTAAATTccc > 1:1093012/1‑150 (MQ=255) gCTCTGTATGGGAAATTTGACGTTAAACAATTTACAACGTTAATATATTTTGGAGATCTACAAAGTTAGAGGCAGGTAACAAAACGAAGAATTAAACGGCATAAAAAAGTATTATGCCGTCTTAAAATAGAGGATTATTTTAAATTCCCg < 2:751559/150‑1 (MQ=255) ctctGTATGGGAAATTTGACGTTAAACAATTTACAACGTGAATATATTTTGGAGATCTACAAAGTTAGAGGCAGGTAACAAAACGAAGAATTAAACGGAATAAAAAAGTATTATGCCGTCTTAAAATAGAGGATTATTTTAAATTCCCGa > 1:665719/1‑150 (MQ=255) tGTATGGGAAATTTGACGTTAAACAATTTACAACGTGAATATATTTTGGAGATCTACAAAGTTAGAGGCAGGTAACAAAACGAAGAATTAAACGGCATAAAAAAGTATTATGCCGTCTTAAAATAGAGGATTATTTTAAATTCCCGACCa > 2:419085/1‑150 (MQ=255) gTATGGGAAATTTGACGTTAAACAATTTACAACGTGAATATATTTTGGAGATCTACAAAGTTAGAGGCAGGTAACAAAACGAAGAATTAAACGGCATAAAAAAGTATTATGCCGTCTTAAAATAGAGGATTATTTTAAATTCCCGACCAg > 2:762534/1‑150 (MQ=255) gTATGGGAAATTTGACGTTAAACAATTTACAACGTGAATATATTTTGGAGATCTACAAAGTTAGAGGCAGGTAACAAAACGAAGAATTAAACGGCATAAAAAAGTATTATGCCGTCTTAAAATAGAGGATTATTTTAAATTCCCGACCAg < 1:1163082/150‑1 (MQ=255) aTGGGAAATTTGACGTTAAACAATTTACAACGTGAATATATTTTGGAGATCTACAAAGTTAGAGGCAGGTAACAAAACGAAGAATTAAACGGCATAAAAAAGTATTATGCCGTCTTAAAATAGAGGATTATTTTAAATTCCCGACCAggg > 1:116304/1‑150 (MQ=255) tGGGAAATTTGACGTTAAACAATTTACAACGTGAATATATTTTGGAGATCTACAAAGTTAGAGGCAGGTAACAAAACGAAGAATTAAACGGCATAAAAAAGTATTATGCCGTCTTAAAATAGAGGATTATTTTAAATTCCCGACCAGGGc > 1:1016932/1‑150 (MQ=255) aaTTTGACGTTAAACAATTTACAACGTGAATATATTTTGGAGATCTACAAAGTTAGAGGCAGGTAACAAAACGAAGAATTAAACGGCATAAAAAAGTATTATGCCGTCTTAAAATAGAGGATTATTTTAAATTCCCGACCAGGGCTTTGc < 1:294004/150‑1 (MQ=255) ttGACGTTAAACAATTTACAACGTGAATATATTTTGGAGATCTACAAAGTTAGAGGCAGGTAACAAAACGAAGAATTAAACGGCATAAAAAAGTATTATGCCGTCTTAAAATAGAGGATTATTTTAAATTCCCGACCAGGGCTTTGCGGc < 1:1336299/150‑1 (MQ=255) aCGTTAAACAATTTACAACGTGAATATATTTTGGAGATCTACAAAGTTAGAGGCAGGTAACAAAACGAAGAATTAAACGGCATAAAAAAGTATTATGCCGTCTTAAAATAGAGGATTATTTTAAATTCCCGACCAGGGCTTTGCGGCTAt < 2:1200827/150‑1 (MQ=255) aCGTTAAACAATTTACAACGTGAATATATTTTGGAGATCTACAAAGTTAGAGGCAGGTAACAAAACGAAGAATTAAACGGCATAAAAAAGTATTATGCCGTCTTAAAATAGAGGATTATTTTAAATTCCCGACCAGGGCTTTGCGGCTAt < 1:312618/150‑1 (MQ=255) ttAAACAATTTACAACGTGAATATATTTTGGAGATCTACAAAGTTAGAGGCAGGTAACAAAACGAAGAATTAAACGGCATAAAAAAGTATTATGCCGTCTTAAAATAGAGGATTATTTTAAATTCCCGACCAGGGCTTTGCGGCTATCtt > 1:1535576/1‑150 (MQ=255) ttAAACAATTTACAACGTGAATATATTTTGGAGATCTACAAAGTTAGAGGCAGGTAACAAAACGAAGAATTAAACGGCATAAAAAAGTATTATGCCGTCTTAAAATAGAGGATTATTTTAAATTCCCGACCAGGGCTTTGCGGCTATCtt > 1:1129759/1‑150 (MQ=255) aaCAATTTACAACGTGAATATATTTTGGAGATCTACAAAGTTAGAGGCAGGTAACAAAACGAAGAATTAAACGGCATAAAAAAGTATTATGCCGTCTTAAAATAGAGGATTATTTTAAATTCCCGACCAGGGCTTTGCGGCTATCTTCCa < 1:1407699/150‑1 (MQ=255) aCAATTTACAACGTGAATATATTTTGGAGATCTACAAAGTTAGAGGCAGGTAACAAAACGAAGAATTAAACGGCATAAAAAAGTATTATGCCGTCTTAAAATAGAGGATTATTTTAAATTCCCGACCAGGGCTTTGCGGCTATCTTCCag < 1:1446258/150‑1 (MQ=255) aCAATTTACAACGTGAATATATTTTGGAGATCTACAAAGTTAGAGGCAGGTAACAAAACGAAGAATTAAACGGCATAAAAAAGTATTATGCCGTCTTAAAATAGAGGATTATTTTAAATTCCCGACCAGGGCTTTGCGGCTATCTTCCag > 1:755607/1‑150 (MQ=255) aCAATTTACAACGTGAATATATTTTGGAGATCTACAAAGTTAGAGGCAGGTAACAAAACGAAGAATTAAACGGCATAAAAAAGTATTATGCCGTCTTAAAATAGAGGATTATTTTAAATTCCCGACCAGGGCTTTGCGGCTATCTTCCag < 1:877390/150‑1 (MQ=255) cAATTTACAACGTGAATATATTTTGGAGATCTACAAAGTTAGAGGCAGGTAACAAAACGAAGAATTAAACGGCATAAAAAAGTATTATGCCGTCTTAAAATAGAGGATTATTTTAAATTCCCGACCAGGGCTTTGCGGCTATCTTCCaga < 2:1163454/150‑1 (MQ=255) ttACAACGTGAATATATTTTGGAGATCTACAAAGTTAGAGGCAGGTAACAAAACGAAGAATTAAACGGCATAAAAAAGTATTATGCCGTCTTAAAATAGAGGATTATTTTAAATTCCCGACCAGGGCTTTGCGGCTATCTTCCAGAGTca < 1:536239/150‑1 (MQ=255) gTGAATATATTTTGGAGATCTACAAAGTTAGAGGCAGGTAACAAAACGAAGAATTAAACGGCATAAAAAAGTATTATGCCGTCTTAAAATAGAGGATTATTTTAAATTCCCGACCAGGGCTTTGCGGCTAt < 1:558399/131‑1 (MQ=255) gTGAATATATTTTGGAGATCTACAAAGTTAGAGGCAGGTAACAAAACGAAGAATTAAACGGCATAAAAAAGTATTATGCCGTCTTAAAATAGAGGATTATTTTAAATTCCCGACCAGGGCTTTGCGGCTAt > 2:558399/1‑131 (MQ=255) taaTATATTTTGGAGATCTACAAAGTTAGAGGCAGGTAACAAAACGAAGAATTAAACGGCATAAAAAAGTATTATGCCGTCTTAAAATAGAGGATTATTTTAAATTCCCGACCAGGGCTTTGCGGCTATCTTCCAGCGTCACAACGCGGc < 2:708165/149‑1 (MQ=255) gAATATATTTTGGAGATCTACAAAGTTAGAGGCAGGTAACAAAACGAAGAATTAAACGGCATAAAAAAGTATTATGCCGTCTTAAAATAGAGGATTATTTTAAATTCCCGACCAGGGCTTTGCGGCTATCTTCCAGAGTCACAACGCGGc < 2:316769/150‑1 (MQ=255) gAATATATTTTGGAGATCTACAAAGTTAGAGGCAGGTAACAAAACGAAGAATTAAACGGCATAAAAAAGTATTATGCCGTCTTAAAATAGAGGATTATTTTAAATTCCCGACCAGGGCTTTGCGGCTATCTTCCAGAGTCACAACGCGGc < 1:1045066/150‑1 (MQ=255) atTTTGGAGATCTACAAAGTTAGAGGCAGGTAACAAAACGAAGAATTAAACGGCATAAAAAAGTATTATGCCGTCTTAAAATAGAGGATTATTTTAAATTCCCGACCAGGGCTTTGCGGCTATCTTCCAGAGTCACAACGCGGCTACaaa > 1:1489259/1‑150 (MQ=255) ttttGGAGATCTACAAAGTTAGAGGCAGGTAACAAAACGAAGAATTAAACGGCATAAAAAAGTATTATGCCGTCTTAAAATAGAGGATTATTTTAAATTCCCGACCAGGGCTTTGCGGCTATCTTCCAGAGTCACAACGCGGCTACAAAc < 2:1406877/150‑1 (MQ=255) ttttGGAGATCTACAAAGTTAGAGGCAGGTAACAAAACGAAGAATTAAACGGCATAAAAAAGTATTATGCCGTCTTAAAATAGAGGATTATTTTAAATTCCCGACCAGGGCTTTGCGGCTATCTTCCAGAGTCACAACGCGGCTACAAAc < 1:1233389/150‑1 (MQ=255) ttttGGAGATCTACAAAGTTAGAGGCAGGTAACAAAACGAAGAATTAAACGGCATAAAAAAGTATTATGCCGTCTTAAAATAGAGGATTATTTTAAATTCCCGACCAGGGCTTTGCGGCTATCTTCCAGAGTCACAACGCGGCTACAAAc < 2:1089428/150‑1 (MQ=255) tttGGAGATCTACAAAGTTAGAGGCAGGTAACAAAACGAAGAATTAAACGGCATAAAAAAGTATTATGCCGTCTTAAAATAGAGGATTATTTTAAATTCCCGACCAGGGCTTTGCGGCTATCTTCCAGAGTCACAACGCGGCTACAAACa < 1:1454622/150‑1 (MQ=255) tttGGAGATCTACAAAGTTAGAGGCAGGTAACAAAACGAAGAATTAAACGGCATAAAAAAGTATTATGCCGTCTTAAAATAGAGGATTATTTTAAATTCCCGACCAGGGCTTTGCGGCTATCTTCCAGAGTCACAACGCGGCTACAAACa < 1:105236/150‑1 (MQ=255) tttGGAGATCTACAAAGTTAGAGGCAGGTAACAAAACGAAGAATTAAACGGCATAAAAAAGTATTATGCCGTCTTAAAATAGAGGATTATTTTAAATTCCCGACCAGGGCTTTGCGGCTATCTTCCAGAGTCACAACGCGGCTACAAACa > 2:461760/1‑150 (MQ=255) tGGAGATCTACAAAGTTAGAGGCAGGTAACAAAACGAAGAATTAAACGGCATAAAAAAGTATTATGCCGTCTTAAAATAGAGGATTATTTTAAATTCCCGACCAGGGCTTTGCGGCTATCTTCCAGAGTCACAACGCGGCTACAAACATc > 2:1009358/1‑150 (MQ=255) aaGTTAGAGGCAGGTAACAAAACGAAGAATTAAACGGCATAAAAAAGTATTATGCCGTCTTAAAATAGAGGATTATTTTAAATTCCCGACCAGGGCTTTGCGGCTATCTTCCAGAGTCACAACGCGGCTACAAACATCTTTGCCAAActg > 1:10630/1‑150 (MQ=255) tAGAGGCAGGTAACAAAACGAAGAATTAAACGGCATAAAAAAGTATTATGCCGTCTTAAAATAGAGGATTATTTTAAATTCCCGACCAGGGCTTTGCGGCTATCTTCCAGAGTCACAACGCGGCTACAAACATCTTTGCCAAACTGCTgg < 2:676608/150‑1 (MQ=255) gagGCAGGTAACAAAACGAAGAATTAAACGGCATAAAAAAGTATTATGCCGTCTTAAAATAGAGGATTATTTTAAATTCCCGACAAGGGCTTTGCGGCTATCTTCCAGAGTCACAACGCGGCTACAAACATCTTTGCCAAACTGCTGGaa > 1:653948/1‑150 (MQ=255) ggCAGGTAACAAAACGAAGAATTAAACGGCATAAAAAAGTATTATGCCGTCTTAAAATAGAGTATTATTTTAAATTCCCGACCAGGGCTTTCCCGATATCATCCAGAGTCACAACCCGGCTACAAACATCTTTGCCAAACTGCTGGaaaa > 2:1431322/1‑149 (MQ=255) ggCAGGTAACAAAACGAAGAATTAAACGGCATAAAAAAGTATTATGCCGTCTTAAAATAGAGGATTATTTTAAATTCCCGACCAGGGCTTTGCTGCTATCTTCCAGAGTCACAACGCGGCTACAAACATCTTTGCCAAACTGCTGGAAAt > 1:978252/1‑150 (MQ=255) ggCAGGTAACAAAACGAAGAATTAAACGGCATAAAAAAGTATTATGCCGTCTTAAAATAGAGGATTATTTTAAATTCCCGACCAGGGCTTTGCGGCTATCTTCCAGAGTCACAACGCGGCTACAAACATCTTTGCCAAACTGCTGGAAAt > 2:304772/1‑150 (MQ=255) cAGGTAACAAAACGAAGAATTAAACGGCATAAAAAAGTATTATGCCGTCTTAAAATAGAGGATTATTTTAAATTCCCGACCAGGGCTTTGCGGCTATCTTCCAGAGTCACAACGCGGCTACAAACATCTTTGCCAAACTGCTGGa < 1:72090/145‑1 (MQ=255) cAGGTAACAAAACGAAGAATTAAACGGCATAAAAAAGTATTATGCCGTCTTAAAATAGAGGATTATTTTAAATTCCCGACCAGGGCTTTGCGGCTATCTTCCAGAGTCACAACGCGGCTACAAACATCTTTGCCAAACTGCTGGa > 2:72090/1‑145 (MQ=255) cAGGTAACAAAACGAAGAATTAAACGGCATAAAAAAGTATTATGCCGTCTTAAAATAGAGGATTATTTTAAATTACCGACCAGGGAGTTGCGGCTATCTTCCACACTCACAACGCCGATACAAACATCTTTGCCACACTCCTGGaaaaca > 1:496781/1‑147 (MQ=255) aCAAAACGAAGAATTAAACGGCATAAAAAAGTATTATGCCGTCTTAAAATAGAGGATTATTTTAAATTCCCGACCAGGGCTTTGCGGCTATCTTCCAGAGTCACAACGCGGCTACAAACATCTTTGCCAAACTGCTGGAAATCTTTTTcc > 2:340572/1‑150 (MQ=255) aCAAAACGAAGAATTAAACGGCATAAAAAAGTATTATGCCGTCTTAAAATAGAGGATTATTTTAAATTCCCGACCAGGGCTTTGCGGCTATCTTCCAGAGTCACAACGCGGCTACAAACATCTTTGCCAAACTGCTGGAAATCTTTTTcc < 1:1009358/150‑1 (MQ=255) aCAAAACGAAGAATTAAACGGCATAAAAAAGTATTATGCCGTCTTAAAATAGAGGATTATTTTAAATTACCGACCAGGGCTTTGCGGCTATCTTACAGAGTAACAAAGCGGCTACAAAAATATTTGCCAAACTGCTGGAAATCTTTTTca > 2:349689/1‑149 (MQ=255) aCAAAACGAAGAATTAAACGGCATAAAAAAGTATTATGAAGTCTTAAAATAGAGGATTATTTTAAATTCCCGACCAGGGCTTTGCGGCTATCTTCCAGAGTCACACCGCGGCTAAAAACATCTTTGCCAAACTGGTGTAAATCttttaac > 2:741019/1‑147 (MQ=255) cAAAACGAAGAATTAAACGGCATAAAAAAGTATTATGCCGTCTTAAAATAGAGGATTATTTTAAATTCCCGACCAGGGCTTTGCGGCTATCTTCCAGAGTCACAACGCGGCTACAAACATCTTTGCCAAACTGCTGGAAATCTTTTTCCt > 1:370289/1‑150 (MQ=255) aCGAAGAATTAAACGGCATAAAAAAGTATTATGCCGTCTTAAAATAGAGGATTATTTTAAATTCCCGACCAGGGCTTTGCGGCTATCTTCCAGAGTCACAACGCGGCTACAAACATCTTTGCCAAACTGCTGGAAATCTTTTTCCTGCtt < 2:1421875/150‑1 (MQ=255) cGAAGAATTAAACGGCATAAAAAAGTATTATGCCGTCTTAAAATAGAGGATTATTTTAAATTCCCGACCAGGGCTTTGCGGCTATCTTCCAGAGTCACAACGCGGCTACAAACATCTTTGCCAAACTGCTGGAAATCTTTTTCCTGCttt > 1:360514/1‑150 (MQ=255) taaTTAAACGTCATAAAAAAGTATTATGCCGTCTTAAAATAGAGGATTATTTTAAATTCCCGACCAGGGCTTTGCGGCTATCTTCCAGAGTCACAACGCGGCTACAAACATCTTTGCCAAACTGCTGGAAATCTTTTTGCTGCTTTTTcc < 2:212737/149‑1 (MQ=255) gaaTTAAACGGCATAAAAAAGTATTATGCCGTCTTAAAATAGAGGATTATTTTAAATTCCCGACCAGGGCTTTGCGGCTATCTTCCAGATTAACAACGTGGTTAGATATATCTTTTCCAAACTGGTGGAATTCTTTTTCCTTCTTTTTcg < 2:97152/150‑2 (MQ=255) gaaTTAAACGGCATAAAAAAGTATTATGCCGTCTTAAAATAGAGGATTATTTTAAATTCCCGACCAGGGCTTTGCGGCTATCTTCCAGAGTCACAACGCGGCTACAAACATCTTTGCCAAACTGCTGGAAATCTTTTTCCTGCTTTTTcc < 1:1112062/150‑1 (MQ=255) gaaTTAAACGGCATAAAAAAGTATTATGCCGTCTTAAAATAGAGGATTATTTTAAATTCCCGACCAGGGCTTTGCGGCTATCTTCCAGAGTCACAACGCGGCTACAAACATCTTTGCCAAACTGCTGGAAATCTTTTTCCTGCTTTTTcc < 1:384459/150‑1 (MQ=255) gaaTTAAACGGCATAAAAAAGTATTATGCCGTCTTAAAATAGAGGATTATTTTAAATTCCCGACCAGGGCTTTGCGGCTATCTTCCAGAGTCACAACGCGGCTACAAACATCTTTGCCAAACTGCTGGAAATCTTTTTCCTGCTTTTTcc < 2:116304/150‑1 (MQ=255) aaTTAAACGGCATAAAAAAGTATTATGCCGTCTTAAAATAGAGGATTATTTTAAATTCCCGACCAGGGCTTTGCGGCTATCTTCCAGAGTCACAACGCGGCTACAAACATCTTTGCCAAACTGCTGGAAATCTTTTTCCTGCTTTTTCCa > 1:427567/1‑150 (MQ=255) aaaCGGCATAAAAAAGTATTATGCCGTCTTAAAATAGAGGATTATTTTAAATTCCCGACCAGGGCTTTGCGGCTATCTTCCAGAGTCACAACGCGGCTACAAACATCTTTGCCAAACTGCTGGAAATCTTTTTCCTGCTTTTTCCACTCg > 1:1256547/1‑150 (MQ=255) gaCGGCATAATACTTTTTTATGCCGTCTTAAAATAGAGGATTATTTTAAATTCCCGACCAGGGCTTTGCGGCTATCTTCCAGAGTCACAACGCGGCTACAAACATCTTTGCCAAACTGCTGGAAATCTTTTTCCTGCTTTTTCCACTCgg > 2:392109/2‑150 (MQ=255) aCGGCATAAAAAAGTATTATGCCGTCTTAAAATAGAGGATTATTTTAAATTCCCGACCAGGGCTTTGCGGCTATCTTCCAGAGTCACAACGCGGCTACAAACATCTTTGCCAAACTGCTGGAAATCTTTTTCCTGCTTTTTCCACTCGGt < 1:762534/150‑1 (MQ=255) gCATAAAAAAGTATTATGCCGTCTTAAGATAGAGGATTATTTTAAATTCCCGACCAGGGCTTTGCGGCTATCTTCCAGAGTCACAACGCGGCTACAAACATCTTTGCCAAACTGCTGGAAATCTTTTTCCTGCTTTTTCCACTCGGTTTg < 1:36060/150‑1 (MQ=255) aTAAAAAAGTATTATGCCGTCTTAAAATAGAGGATTATTTTAAATTCCCGACCAGGGCTTTGCGGCTATCTTCCAGAGTCACAACGCGGCTACAAACATCTTTGCCAAACTGCTGGAAATCTTTTTCCTGCTTTTTCCACTCGGTTTGGa < 2:208746/150‑1 (MQ=255) aTAAAAAAGTATTATGCCGTCTTAAAATAGAGGATTATTTTAAATTCCCGACCAGGGCTTTGCGGCTATCTTCCAGAGTCACAACGCGGCTACAAACATCTTTGCCAAACTGCTGGAAATCTTTTTCCTGCTTTTTCCACTCGGTTTGGa < 1:632071/150‑1 (MQ=255) tAAAAAATAATTAAGCCATATTAAAATACAGTATTAATATAAATTACCTACCAGTAAAATTCAACAAACTAAAAGAGTCACAAAGCGGCTACAAACATCTTTGCCAAACTGCTGGAAATCTTTTTCCTGGTTTTTCCACTCGGTTTGGAt > 2:362550/1‑150 (MQ=255) tAAAAAAGTATTATGCCGTCTTAAAATAGAGGATTATTTTAAATTCCCGACCAGGGCTTTGCGGCTATCTTCCAGAGTCACAACGCGGCTACAAACATCTTTGCCAAACTGCTGGAAATCTTTTTCCTGCTTTTTCCACTCGGTTTGGAt > 1:293927/1‑150 (MQ=255) tAAAAAAGTATTATGCCGTCTTAAAATAGAGGATTATTTTAAATTCCCGACCAGGGCTTTGCGGCTATCTTCCAGAGTCACAACGCGGCTACAAACATCTTTGCCAAACTGCTGGAAATCTTTTTCCTGCTTTTTCCACTCGGTTTGGAt < 1:34173/150‑1 (MQ=255) aaaaGTATTATGCCGTCTTAAAATAGAGGATTATTTTAAATTCCCGACCAGGGCTTTGCGGCTATCTTCCAGAGTCACAACGCGGCTACAAACATCTTTGCCAAACTGCTGGAAATCTTTTTCCTGCTTTTTCCACTCGGTTTGGATTGa > 1:1355047/1‑150 (MQ=255) aaaTTATTTTGCCGTCTTAAAATATAGGATTATTTTAAATTCCCGACCAGGGCTTTGCGGCTATCTTCCAGAGTCACAACGCGGCTACAAACATCTTTGCCAAACTGCTGGAAATGTTTTTCCTGCTTTTTCCACTCGGTTTGGATTgtg < 2:1472333/150‑3 (MQ=255) aaaGTATTATGCCGTCTTAAAATAGAGGATTATTTTAAATTCCCGACCAGGGCTTTGCGGCTATCTTCCAGAGTCACAACGCGGCTACAAACATCTTTGCCAAACTGCTGGAAATCTTTTTCCTGCTTTTTCCACTCGGTTTGGATTGAg < 1:304833/150‑1 (MQ=255) | TTCATTCCTCCAGTTACGTGAACGCTACGCATTATCCCTTAGCTCTGTATGGGAAATTTGACGTTAAACAATTTACAACGTGAATATATTTTGGAGATCTACAAAGTTAGAGGCAGGTAACAAAACGAAGAATTAAACGGCATAAAAAAGTATTATGCCGTCTTAAAATAGAGGATTATTTTAAATTCCCGACCAGGGCTTTGCGGCTATCTTCCAGAGTCACAACGCGGCTACAAACATCTTTGCCAAACTGCTGGAAATCTTTTTCCTGCTTTTTCCACTCGGTTTGGATTGAG > NC_000913/3100729‑3101024 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |