Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 3,182,806 | C→A | 5.6% | P86Q (CCA→CAA) | zupT → | heavy metal divalent cation transporter ZupT |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 3,182,806 | 0 | C | A | 5.6% | 236.9 / 2.8 | 71 | P86Q (CCA→CAA) | zupT | heavy metal divalent cation transporter ZupT |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (30/36); new base A (2/2); total (32/39) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.79e-01 |
CTAGGTTTTGCGGCGGGGATCATGTTGCTCATCTCATTAATGGAAATGCTTCCTGCCGCACTAGCAGCTGAAGGAATGTCGCCTGTGTTGGGTTATGGAATGTTTATCTTCGGTCTGCTTGGCTATTTTGGCCTGGACCGCATGTTGCCACATGCTCATCCGCAGGATTTAATGCAAAAATCGGTGCAGCCGTTGCCAAAATCGATCAAGCGCACAGCCATTCTGCTCACTCTCGGCATCAGTCTGCATAACTTCCCGGAAGGGATTGCCACCTTTGTCACGGCGAGCAGCAACCT > NC_000913/3182658‑3182953 | cTAGGTTTTGCGGCGGGGATCATGTTGCTCATCTCATTAATGGAAATGCTTCCTGCCGCACTAGCAGCTGAAGGAATGTCGCCTTTGTTGTGTTATGGAATGTTTATCTTCGGTCTGCTTGGCTATTTTGTCCTTGACCGCATGTTGCca < 2:449807/150‑1 (MQ=255) tAGGTTTTGCGGCGGGGATCATGTTGCTGATCTCATTAATGGAAATGCTTCCTGCCGCACTAGCAGCTGAAGGAATGTCGCCTGTGTTGGGTTATGGAATGTTTATCTTCGGTCTGCTTGGCTATTTTGGCCTGGACCGCATGTTGCcac < 2:288425/150‑1 (MQ=255) aGGTTTTGCGGCGGGGATCATGTTGCTCATCTCATTACTGGAAATGCTTCCTGCCGCACTAGCAGCTGAAGGAATGTCGCCTGTGTTGGGTTATGGAATGTTTATCTTCGGTCTGCTTGGCTATTTTGGCCTGGACCGCATGTTGCcaca < 2:800694/150‑1 (MQ=255) tgtGCGGCGGGGATCATGTTGCTCATCTCATTAATGGAAATGCTTCCTGCCGCACTAGCAGCTGAAGGAATGTCGCCTGTGTTGGGTTATGGAATGTTTATCTTCGGTCTGCTTGGCTATTTTGGCCTGGACCGCATGTTGCCACATGCt < 2:1093132/148‑1 (MQ=255) tgtggcggGGATCATGTTGCTCATCTCATTAATGGAAATGCTTCCTGCCGCACTAGCAGCTGAAGGAATGTCGCCTGTGTTGGGTTATGGAATGTTTATCTTCGGTCTGCTTGGCTATTTTGGCCTGGACCGCATGTGGCAACATGcggt < 1:880733/147‑4 (MQ=255) tGCGGCGGGGATCATGTTGCTCATCACATTAAGGGAAATGCTTCCTGCCGCACTAGCAGCTGAAGGAATGTCGCCTGTGTTGGGTTATGGAATGTTTATCTTCGGTCTGCTTGGCTATTTTGGCCTGGACCGCATGTGGCAACATGcggt < 2:782507/150‑4 (MQ=255) cggcggGGATCATGTTGCTCATCTCATTAATGGAAATGCTTCCTGCCGCACTAGCAGCTGAAGGAATGTCGCCTGTGTTGGGTTATGGAATGTTTATCTTCGGTCTGCTTGGCTATTTTGGCCTGGACCGCATGTTGCCACATGCTCAta > 1:1492598/1‑149 (MQ=255) cggcggGGATCATGTTGCTCATCTCATTAATGGAAATGCTTCCTGCCGCACTAGCAGCTGAAGGAATGTCGCCTGTGTTGGGTTATGGAATGTTTATCTTCGGTCTGCTTGGCTATTTTGGCCTGGACCGCATGTTGCCACATGCTCATc < 1:110543/150‑1 (MQ=255) ggggATCATGTTGCTCATCTCATTAATGGAAATGCTTCCTGCCGCACTAGCAGCTGAAGGAATGTCGCCTGTGTTGGGTTATGGAATGTTTATCTTCGGTCTGCTTGGCTATTTTGGCCTGGACCGCATGTTGCGACATGCTCATCCTCa < 1:1089617/150‑1 (MQ=255) gggATCATGTTGCTCATCTCATTAATGGAAATGCTTCCTGCCGCACTAGCAGCTGAAGGAATGTCGCCTGTGTTGGGTTATGGAATGTTTATCTTCGGTCTGCTTGGCTATTTTGGCCTGGACCGCATGTTGCCACATGCTCATCCGCAg < 2:270515/150‑1 (MQ=255) gggATCATGTTGCTCATCTCATTAATGGAAATGCTTCCTGCCGCACTAGCAGCTGAAGGAATGTCGCCTGTGTTGGGTTATGGAATGTTTATCTTCGGGCTGCTTGGCTATTTTGGCCTGGACCGCATGTTGCCACATGCTCATCCGCAg < 1:1062334/150‑1 (MQ=255) ggATCATGTTGCTCATCTCATTAATGGAAATGCTTCCTGCCGCACTAGCAGCTGAAGGAATGTCGCCTGTGTTGGGTTATGGAATGTTTATCTTCGGTCTGCTTGGCTATTTTGGCCTGGACCGCATGTTGCCACATGCTCATCCGCAgg > 1:82559/1‑150 (MQ=255) cATGTTGCTCATCTCATTAATGGAAATGCTTCCTGCCGCACTAGCAGCTGAAGGAATGTCGCCTGTGTTGGGTTATGGAATGTTTATCTTCGGTCTGCTTGGCTATTTTGGCCTGGACCGCATGTTGCCACATGCTCATCCGCAGGAttt > 2:463518/1‑150 (MQ=255) aTGTTGCTCATCTCATTAATGGAAATGCTTCCTGCCGCACTAGCAGCTGAAGGAATGTCGCCTGTGTTGGGTTATGGAATGTTTATCTTCGGTCTGCTTGGCTATTTTGGCCTGGACCGCATGTTGCCACATGCTCATCCGCAGGATTTa < 1:1457763/150‑1 (MQ=255) gTTGCTCATCTCATTAATGGAAATGCTTCCTGCCGCACTAGCAGCTGAAGGAATGTCGCCTGTGTTGGGTTATGGAATGTTTATCTTCGGTCTGCTTGGCTATTTTGGCCTGGACCGCATGTTGCCACATGCTCATCCGCAGGATTTAAt < 2:190949/150‑1 (MQ=255) gTTGCTCATCTCATTAATGGAAATGCTTCCTGCCGCACTAGCAGCTGAAGGAATGTCGCCTGTGTTGGGTTATGGAATGTTTATCTTCGGTCTGCTTGGCTATTTTGGCCTGGACCGCATGTTGCCACATGCTCATCCGCAGGATTTAAt < 2:1425711/150‑1 (MQ=255) tGCTCATCTCATTAATGGAAATGCTTCCTGCCGCACTAGCAGCTGAAGGAATGTCGCCTGTGTTGGGTTATGGAATGTTTATCTTCGGTCTGCTTGGCTATTTTGGCCTGGACCGCATGTTGCCACATGCTCATCCGCAGGATTTAATGc > 2:601054/1‑150 (MQ=255) ctcatctcatTAATGGAAATGCTTCCTGCCGCACTAGCAGCTGAAGGAATGTCGCCTGTGTTGGGTTATGGAATGTTTATCTTCGGTCTGCTTGGCTATTTTGGCCTGGACCGCATGTTGCCACATGCTCATCCGCAGGATTTAATGCaa > 1:621165/1‑150 (MQ=255) tctcatTAATGGAAATGCTTCCTGCCGCACTAGCAGCTGAAGGAATGTCGCCTGTGTTGGGTTATGGAATGTTTATCTTCGGTCTGCTTGGCTATTTTGGCCTGGACCGCATGTTGCCACATGCTCATCCGCAGGATTTAATGCAAAAAt > 1:798954/1‑150 (MQ=255) ctcatTAATGGAAATGCTTCCTGCCGCACTAGCAGCTGAAGGAATGTCGCCTGTGTTGGGTTATGGAATGTTTATCTTCGGTCTGCTTGGCTATTTTGGCCTGGACCGCATGTTGCCACATGCTCATCCGCAGGATTTAATGCAAAAATc < 1:639621/150‑1 (MQ=255) tAATGGAAATGCTTCCTGCCGCACTAGCAGCTGAAGGAATGTCGCCTGTGTTGGGTTATGGAATGTTTATCTTCGGTCTGCTTGGCTATTTTGGCCTGGACCGCATGTTGCCACATGCTCATCCGCAGGATTTAATGCAAAAATCGGTGc < 1:832460/150‑1 (MQ=255) tAATGGAAATGCTTCCTGCCGCACTAGCAGCTGAAGGAATGTCGCCTGTGTTGGGTTATGGAATGTTTATCTTCGGTCTGCTTGGCTATTTTGGCCTGGACCGCATGTTGCCACATGCTCATCCGCAGGATTTAATGCAAAAATCGGTGc < 2:1221262/150‑1 (MQ=255) aaTGGAAATGCTTCCTGCCGCACTACCAGCTGAAGGAATGTCGCCTGTGTTGGGTTATGGAATGTTTATCTACGGTCTGCTTGGCTATTTTGGCCTGGACCGCATGTTGCCACATGCTCATCCGCAGGATTTAATGCAAAAATCGGTGCa > 1:1247319/1‑150 (MQ=255) tGGAAATGCTTCCTGCCGCACTAGCAGCTGAAGGAATGTCGCCTGTGTTGGGTTATGGAATGTTTATCTTCGGTCTGCTTGGCTATTTTGGCCTGGACCGCATGTTGCCACATGCTCATCCGCAGGATTTAATGCAAAAATCGGTGCAGc > 2:509350/1‑150 (MQ=255) ccTGCCGCACTAGCAGCTGAAGGAATGTCGCCTGTGTTGGGTTATGGAATGTTTATCTTCGGTCTGCTTGGCTATTTTGGCCTGGACCGCATGTTGCCACATGCTCATCCGCAGGATTTAATGCAAAAATCGGTGCAGCCGTTGCCaaaa > 1:1257286/1‑150 (MQ=255) tGCCGCACTAGCAGCTGAAGGAATGTCGCCTGTGTTGGGTTATGGAATGTTTATCTTCGGTCTGCTTGGCTATTTTGGCCTGGACCGCATGTTGCCACATGCTCATCCGCAGGATTTAATGCAAAAATCGGTGCAGCCGTTGCCAAAATc > 1:552434/1‑150 (MQ=255) gCCGCACTAGCAGCTGAAGGAATGTCGCCTGTGTTGGGTTATGGAATGTTTATCTTCGGTCTGCTTGGCTATTTTGGCCTGGACCGCATGTTGCCACATGCTCATCCGCAGGATTTAATGCAAAAATCGGTGCAGCCGTTGCCAAAATCg < 2:935394/150‑1 (MQ=255) gCACTAGCAGCTGAAGGAATGTCGCCTGTGTTGGGTTATGGAATGTTTATCTTCGGTCTGCTTGGCTATTTTGGCCTGGCCCGCATGTTGCCACATGCTCATCCGCAGGATTTAATGCAAAAATCGGTGCAGCCGTTGCCAAAATCGATc > 2:56564/1‑150 (MQ=255) gCACTAGCAGCTGAAGGAATGTCGCCTGTGTTGGGTTATGGAATGTTTATCTTCGGTCTGCTTGGCTATTTTGGCCTGGACCGCATGTTGCCACATGCTCATCCGCAGGATTTAATGCAAAAATCGGTGCAGCCGTTGCCAAAATCGATc < 1:719828/150‑1 (MQ=255) gCACTAGCAGCTGAAGGAATGTCGCCTGTGATGGGTTATGGAATGTTTATCTTCGGTCTGCTTGGCTATTTTGGCCTGGACCGCATGTTGCCACATGCTCATCCGCAGGATTTAATGCAAAAATCGGTGCAGCCGTTGCCAAAATCGATc < 2:954098/150‑1 (MQ=255) agcagcTGAAGGAATGTCGCCTGTGTTGGGTTATGGAATGTTTATCTTCGGTCTGCTTGGCTATTTTGGCCTGGACCGCATGTTGCCACATGCTCATCCGCAGGATTTAATGCAAAAATCGGTGCAGCCGTTGCCAAAATCGATCAAgcg > 1:1134493/1‑150 (MQ=255) agcTGAAGGAATGTCGCCTGTGTTGGGTTATGGAATGTTTATCTTCGGTCTGCTTGGCTATTTTGGCCTGGACCGCATGTTGCCACATGCTCATCCGCAGGATTTAATGCAAAAATCGGTGCAGCCGTTGCCAAAATCGATCAAGCGcac > 1:974773/1‑150 (MQ=255) cTGAAGGAATGTCGCCTGTGTTGGGTTATGGAATGTTTATCTTCGGTCTGCTTGGCTATTTTGGCCTGGACCGCATGTTGCCACATGCTCATCCGCAGGATTTAATGCAAAAATCGGTGCAGCCGTTGCCAAAATCGATCAAGCGCACAg < 1:463518/150‑1 (MQ=255) tGAAGGAATGTCGCCTGTGTTGGGTTATGGAATGTTTATCTTCGGTCTGCTTGGCTATTTTGGCCTGGACCGCATGTTGCCACATGCTCATCCGCAGGATTTAATGCAAAAATCGGTGCAGCCGTTGCCAAAATCGATCAAGCGCACAGc > 1:68870/1‑150 (MQ=255) tGAAGGAATGTCGCCGGTGTTGGGTTATGGAATGTTTATCTTCGGTCTGCTTGGCTATTTTGGCCTGGACCGCATGTTGCCACATGCTCATCCGCAGGATTTAATGCAAAAATCGGTGCAGCCGTTGCCAAAATCGATCAAGCGCACAGc < 2:941067/150‑1 (MQ=255) gAAGGAATGTCGCCTGTGTTGGGTTATGGAATGTTTATCTTCGGTCTGCTTGGCTATTTTGGCCTGGACCGCATGTTGCCACATGCTCATCCGCAGGATTTAATGCAAAAATCGGTGCAGCCGTTGCCAAAATCGATCAAGCGCACAGcc > 2:689495/1‑150 (MQ=255) gTCGCCTGTGTTGGGTTATGGAATGTTTATCTTCGGTCTGCTTGGCTATTTTGGCCTGGACCGCATGTTGCCACATGCTCATCCGCAGGATTTAATGCAAAAATCGGTGCAGCCGTTGCCAAAATCGATCAAGCGCACAGCCATTCTGCt > 1:1288764/1‑150 (MQ=255) gTCGCCTGTGTTGGGTTATGGAATGTTTATCTTCGGTCTGCTTGGCTATTTTGGCCTGGACCGCATGTTGCCACATGCTCATCCGCAGGATTTAATGCAAAAATCGGTGCAGCCGTTGCCAAAATCGATCAAGCGCACAGCCATTCTGCt < 1:718136/150‑1 (MQ=255) tCGCCTGTGTTGGGTTATGGAATGTTTATCTTCGGTCTGCTTGGCTATTTTGGCCTGGACCGCATGTTGCCACATGCTCATCCGCAGGATTTAATGCAAAAATCGGTGCAGCCGTTGCCAAAATCGATCAAGCGCACAGCCATTCTGCTc < 1:509350/150‑1 (MQ=255) gCCTGTGTTGGGTTATGGAATGTTTATCTTCGGTCTGCTTGGCTATTTTGGCCTGGACCGCATGTTGCCACATGCTCATCCGCAGGATTTAATGCAAAAATCGGTGCAGCCGTTGCCAAAATCGATCAAGCGCACAGCCATTCTGCTCAc < 2:798954/150‑1 (MQ=255) cTGTGTTGGGTTATGGAATGTTTATCTTCGGTCTGCTTGGCTATTTTGGCCTGGACCGCATGTTGCCACATGCTCATCCGCAGGATTTAATGCAAAAATCGGTGCAGCCGTTGCCAAAATCGATCAAGCGCACAGCCATTCTGCTCActc < 2:621165/150‑1 (MQ=255) tgtgTTGGGTTATGGAATGTTTATCTTCGGTCTGCTTGGCTATTTTGGCCTGGACCGCATGTTGCCACATGCTCATCCGCAGGATTTAATGCAAAAATCGGTGCAGCCGTTGCCAAAATCGATCAAGCGCACAGCCATTCTGCTCActct < 1:190343/150‑1 (MQ=255) ttGGGTTATGGAATGTTTATCTTCGGTCTGCTTGGCTATTTTGGCCTGGACCGCATGTTGCCACATGCTCATCCGCAGGATTTAATGCAAAAATCGGTGCAGCCGTTGCCAAAATCGATCAAGCGCACAGCCATTCTGCTCACTCTCGGc < 1:1370172/150‑1 (MQ=255) tGGGTTATGGAATGTTTATCTTCGGTCTGCTTGGCTATTTTGGCCTGGACCGCATGTTGCCACATGCTCATCCGCAGGATTTAATGCAAAAATCGGTGCAGCCGTTGCCAAAATCGATCAAGCGCACAGCCATTCTGCTCACTCTCGGCa < 1:152051/150‑1 (MQ=255) ggAATGTTTATCTTCGGTCTGCTTGGCTATTTTGGCCTGGACCGCATGTTGCCACATGCTCATCCGCAGGATTTAATGCAAAAATCGGTGCAGCCGTTGCCAAAATCGATCAAGCGCACAGCCATTCTGCTCACTCTCGGCATCAGTCTg < 1:912946/150‑1 (MQ=255) gAATGTTTATCTTCGGTCTGCTTGGCTATTTTGGCCTGGACCGCATGTTGCCACATGCTCATCCGCAGGATTTAATGCAAAAATCGGTGCAGCCGTTGCCAAAATCGATCAAGCGCACAGCCATTCTGCTCACTCTCGGCATCAGTCTGc > 1:239965/1‑150 (MQ=255) aTGTTTATCTTCGGTCTGCTTGGCTATTTTGGCCTGGACCGCATGTTGCCACATGCTCATCCGCAGGATTTAATGCAAAAATCGGTGCAGCCGTTGCCAAAATCGATCAAGCGCACAGCCATTCTGCTCACTCTCGGCATCAGTCTGCAt < 2:452792/150‑1 (MQ=255) gTTTATCTTCGGTCTGCTTGGCTATTTTGGCCTGGACCGCATGTTGCCACATGCTCATCCGCAGGATTTAATGCAAAAATCGGTGCAGCCGTTGCCAAAATCGATCAAGCGCACAGCCATTCTGCTCACTCTCGGCATCAGTCTGCATa < 2:869230/149‑1 (MQ=255) gTTTATCTTCGGTCTGCTTGGCTATTTTGGCCTGGACCGCATGTTGCCACATGCTCATCCGCAGGATTTAATGCAAAAATCGGTGCAGCCGTTGCCAAAATCGATCAAGCGCACAGCCATTCTGCTCACTCTCGGCATCAGTCTGCATa > 1:869230/1‑149 (MQ=255) tttATCTTCGGTCTGCTTGGCTATTTTGGCCTGGACCGCATGTTGCCACATGCTCATCCGCAGGATTTAATGCAAAAATCGGTGCAGCCGTTGCCAAAATCGATCAAGCGCACAGCCATTCTGCTCACTCTCGGCATCAGTCTGCATAAc < 2:1288764/150‑1 (MQ=255) tttATCTTCGGTCTGCTTGGCTATTTTGGCCTGGACCGCATGTTGCCACATGCTCATCCGCAGGATTTAATGCAAAAATCGGTGCAGCCGTTGCCAAAATCGATCAAGCGCACAGCCATTCTGCTCACTCTCGGCATCAGTCTGCATAAc < 1:601054/150‑1 (MQ=255) cTTCGGTCTGCTTGGCTATTTTGGCCTGGACCGCATGTTGCCACATGCTCATCCGCAGGATTTAATGCAAAAATCGGTGCAGCCGTTGCCAAAATCGATCAAGCGCACAGCCATTCTGCTCACTCTCGGCATCAGTCTGCATAACTTccc > 2:1391127/1‑150 (MQ=255) cTTCGGTCTGCTTGGCTATTTTGGCCTGGACCGCATGTTGCCACATGCTCATCCGCAGGATTTAATGCAAAAATCGGTGCAGCCGTTGCCAAAATCGATCAAGCGCACAGCCATTCTGCTCACTCTCGGCATCAGTCTGCATAACTTccc < 1:1267736/150‑1 (MQ=255) cTTCGGTCTGCTTGGCTATTTTGGCCTGGACCGCATGTTGCCACATGCTCATCCGCAGGATTTAATGCAAAAATCGGTGCAGCCGTTGCCAAAATCGATCAAGCGCACAGCCATTCTGCTCACTCTCGGCATCAGTCTGCATAACTTccc > 1:312877/1‑150 (MQ=255) ttCGGTCTGCTTGGCTATTTTGGCCTGGACCGCATGTTGCCACATGCTCATCCGCAGGATTTAATGCAAAAATCGGTGCATCCGTTGCCAAAATCGATCAAGCGCACAGCCATTCTGCTCACTCTCGGCATCAGTCTGCATAACTTCCCg < 2:408009/150‑1 (MQ=255) ttCGGTCTGCTTGGCTATTTTGGCCTGGACCGCATGTTGCCACATGCTCATCCGCAGGATTTAATGCAAAAATCGGTGCAGCCGTTGCCAAAATCGATCAAGCGCACAGCCATTCTGCTCACTCTCGGCATCAGTCTGCATAACTTCCCg > 1:1138359/1‑150 (MQ=255) tCGGTCTGCTTGGCTATTTTGGCCTGGACCGCATGTTGCCACATGCTCATCCGCAGGATTTAATGCAAAAATCGGTGCAGCCGTTGCCAAAATCGATCAAGCGCACAGCCATTCTGCTCACTCTCGGCATCAGTCTGCATAACTTCCCgg < 2:1257286/150‑1 (MQ=255) tCGGTCTGCTTGGCTATTTTGGCCTGGACCGCATGTTGCCACATGCTCATCCGCAGGATTTAATGCAAAAATCGGTGCAGCCGTTGCCAAAATCGATCAAGCGCACAGCCATTCTGCTCACTCTCGGCATCAGTCTGCATAACTTCCCgg < 2:974773/150‑1 (MQ=255) cTGCTTGGCTATTTTGGCCTGGACCGCATGTTGCCACATGCTCATCCGCAGGATTTAATGCAAAAATCGGTGCAGCCGTTGCCAAAATCGATCAAGCGCACAGCCATTCTGCTCACTCTCGGCATCAGTCTGCATAACTTCCCGGAAggg < 2:552434/150‑1 (MQ=255) cTGCTTGGCTATTTTGGCCTGGACCGCATGTTGCCACATGCTCATCCGCAGGATTTAATGCAAAAATCGGTGCAGCCGTTGCCAAAATCGATCAAGCGCACAGCCATTCTGCTCACTCTCGGCATCAGTCCGCATAACTTCCCGGAAggg > 2:11564/1‑150 (MQ=255) tGCTTGGCTATTTTGGCCTGGACCGCATGTTGCCACATGCTCATCCGCAGGATTTAATGCAAAAATCGGTGCAGCCGTTGCCAAAATCGATCAAGCGCACAGCCATTCTGCTCACTCTCGGCATCAGTCTGCATAACTTCCCGGAAGGGa > 1:1367824/1‑150 (MQ=255) gCTTGGCTATTTTGGCCTGGACCGCATGTTGCCACATGCTCATCCGCAGGATTTAATGCAAAAATCGGTGCAGCCGTTGCCAAAATCGATCAAGCGCACAGCCATTCTGCTCACTCTCGGCATCAGTCTGCATAACTTCCCGGAAGGGAt > 1:1536560/1‑150 (MQ=255) gCTTGGCTATTTTGGCCTGGACCGCATGTTGCCACATGCTCATCCGCAGGATTTAATGCAAAAATCGGTGCAGCCGTTGCCAAAATCGATCAAGCGCACAGCCATTCTGCTCACTCTCGGCATCAGTCTGCATAACTTCCCGGAAGGGAt > 1:976094/1‑150 (MQ=255) gCTTGGCTATTTTGGCCTGGACCGCATGTTGCCACATGCTCATCCGCAGGATTTAATGCAAAAATCGGTGCAGCCGTTGCCAAAATCGATCAAGCGCACAGCCATTCTGCTCACTCTCGGCATCAGCCTGCATAACTTCCCGGAAGGGAt > 2:1003509/1‑150 (MQ=255) ttGGCTATTTTGGCCTGGACCGCATGTTGCCACATGCTCATCCGCAGGATTTAATGCAAAAATCGGTGCAGCCGTTGCCAAAATCGATCAAGCGCACAGCCATTCTGCTCACTCTCGGCATCAGTCTGCATAACTTCCCGGAAGGGATTg < 1:279090/150‑1 (MQ=255) ttGGCCTGGACCGCATGTTGCCACATGCTCATCCGCAGGATTTAATGCAAAAATCGGTGCAGCCGTTGCCAAAATCGATCAAGCGCACAGCCATTCTGCTCACTCTCGGCATCAGTCTGCATAACTTCCCGGAAGGGATTGCCACCTTTg < 2:51497/150‑1 (MQ=255) ttGGCCTGGACCGCATGTTGCCACATGCTCATCCGCAGGATTTAATGCAAAAATCGGTGCAGCCGTTGCCAAAATCGATCAAGCGCACAGCCATTCTGCTCACTCTCGGCATCAGTCTGCATAACTTCCCGGAAGGGATTGCCACCTTTg < 2:395408/150‑1 (MQ=255) gCCTGGACCGCATGTTGCCACATGCTCATCCGCAGGATTTAATGCAAAAATCGGTGCAGCCGTTGCCAAAATCGATCAAGCGCACAGCCATTCTGCTCACTCTCGGCATCAGTCTGCATAACTTCCCGGAAGGGATTGCCACCTTTGTCa > 1:575889/1‑150 (MQ=255) ggatgagCATGTGGCAACATGCTCATCCGCAGGATTTAATGCAAAAATCGGTGCAGCCGTTGCCAAAATCGATCAAGCGCACAGCCATTCTGCTCACTCTCGGCATAAGTCTGCATAACTTCCCGGAAGGGATTGCCACCTTTGTCACgg > 2:1223872/7‑150 (MQ=255) aCCGCATGTTGCCACATGCTCATCCGCAGGATTTAATGCAAAAATCGGTGCAGCCGTTGCCAAAATCGATCAAGCGCACAGCCATTCTGCTCCCTCTCGGCATCAGTCTGCATAACTTCCCGGAAGGGATTGCCACCTTTGTCACGGCgc > 1:1533178/1‑149 (MQ=255) gagCATGTGGCAACATGCTCATCCGCAGGATTTAATGCAAAAATCGGTGCAGCCGTTGCCAAAATCGATCAAGCGCACAGCCATTCTGCTCACTCTCGGCATCAGTCTGCATAACTTCCCGGAAGGGATTGCCACCTTTGTCACGGCGag > 2:80056/3‑150 (MQ=255) cGCATGTTGCCACATGCTCATCCGCAGGATTTAATGCAAAAATCGGTGCAGCCGTTGCCAAAATCGATCAAGCGCACAGCCATTCTGCTCACTCTCGGCATCAGTCTGCATAACTTCCCGGAAGGGATTGCCACCTTTGTCACGGCGagc < 1:1143086/150‑1 (MQ=255) gCCACATGCTCATCCGCAGGATTTAATGCAAAAATCGGTGCAGCCGTTGCCAAAATCGATCAAGCGCACAGCCATTCTGCTCACTCTCGGCATCAGTCTGCATAACTTCCCGGAAGGGATTGCCACCTTTGTCACGGCGAGCAGCAACCt > 1:94105/1‑150 (MQ=255) gCCACATGCTCATCCGCAGGATTTAATGCAAAAATCGGTGCAGCCGTTGCCAAAATCGATCAAGCGCACAGCCATTCTGCTCACTCTCGGCATCAGTCTGCATAACTTCCCGGAAGGGATTGCCACCTTTGTCACGGCGAGCAGCAACCt > 1:1352692/1‑150 (MQ=255) | CTAGGTTTTGCGGCGGGGATCATGTTGCTCATCTCATTAATGGAAATGCTTCCTGCCGCACTAGCAGCTGAAGGAATGTCGCCTGTGTTGGGTTATGGAATGTTTATCTTCGGTCTGCTTGGCTATTTTGGCCTGGACCGCATGTTGCCACATGCTCATCCGCAGGATTTAATGCAAAAATCGGTGCAGCCGTTGCCAAAATCGATCAAGCGCACAGCCATTCTGCTCACTCTCGGCATCAGTCTGCATAACTTCCCGGAAGGGATTGCCACCTTTGTCACGGCGAGCAGCAACCT > NC_000913/3182658‑3182953 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |