| Predicted mutation | |||||||
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_000913 | 3,192,129 | 0 | T | A | 5.7% | 1085.8 / 33.1 | 331 | intergenic (‑190/‑79) | glgS/yqiJ | surface composition regulator/putative inner membrane protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (156/156); new base A (3/16); total (159/172) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.90e-03 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.68e-01 | |||||||||||
Only 100 of 355 total aligned reads displayed.
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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |