Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 3,239,124 | G→A | 7.8% | R182H (CGC→CAC) ‡ | alx → | putative membrane‑bound redox modulator Alx |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 3,239,124 | 0 | G | A | 7.8% | 312.1 / 10.5 | 102 | R182H (CGC→CAC) ‡ | alx | putative membrane‑bound redox modulator Alx |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (43/51); new base A (4/4); total (47/55) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.37e-01 |
Only 100 of 106 total aligned reads displayed.
TGGCAGCTGGCTAATTTCGCAGTTCGACTGGATCCTGTATATCTTCGGTGCCTTCCTGCTGTTTACCGGCGTGAAGATGGCGCTCGCCCATGAAGATGAATCAGGCATTGGCGACAAGCCGCTGGTGCGCTGGCTACGCGGTCATTTGCGCATGACCGACACCATCGACAACGAGCATTTCTTTGTGCGTAAGAATGGATTGCTGTACGCCACACCGCTGATGCTGGTACTGATTCTGGTGGAATTGAGCGACGTGATTTTCGCCGTGGATAGCATTCCGGCTATCTTCGCCGTGACC > NC_000913/3238975‑3239272 | tGGCAGCTGGCTAATTTCGCAGTTCGACTGGATCCTGTATATCTTCGGTGCCTTCCTGCTGTTTACCGGCGTGAAGATGGCGCTCGCCCATGAAGATGAATCAGGCATTGGCGACAAGCCGCTGGTGCGCTGGCTACGCGGTCATTTgcg < 1:529812/150‑1 (MQ=255) ggCAGCTGGCTAATTTCGCAGTTCGACTGGATCCTGTATATCTTCGGTGCCTTCCTGCTGTTTACCGGCGTGAAGATGGCGCTCGCCCATGAAGATGAATCAGGCATTGGCGACAAGCCGCTGGTGCGCTGGCTACGCGGTCATTTgcgc > 1:416953/1‑150 (MQ=255) gCTGGCTAATTTCGCAGTTCGACTGGATCCTGTATATCTTCGGTGCCTTCCTGCTGTTTACCGGCGTGAAGATGGCGCTCGCCCATGAAGATGAATCAGGCATTGGCGACAAGCCGCTGGTGCGCTGGCTACGCGGTCATTTGCGCATGa > 2:1312021/1‑150 (MQ=255) cTGGCTAATTTCGCAGTTCGACTGGATCCTGTATATCTTCGGTGCCTTCCTGCTGTTTACCGGCGTGAAGATGGCGCTCGCCCATGAAGATGAATCAGGCATTGGCGACAAGCCGCTGGTGCGCTGGCTACGCGGTCATTTGCGCATGAc < 1:1269298/150‑1 (MQ=255) tGGCTAATTTCGCAGTTCGACTGGATCCTGTATATCTTCGGTGCCTTCCTGCTGTTTACCGGCGTGAAGATGGCGCTCGCCCATGAAGATGAATCAGGCATTGGCGACAAGCCGCTGGTGCGCTGGCTACGCGGTCATTTGCGCATGAcc < 1:1232660/150‑1 (MQ=255) ggCTAATTTCGCAGTTCGACTGGATCCTGTATATCTTCGGTGCCTTCCTGCTGTTTACCGGCGTGAAGATGGCGCTCGCCCATGAAGATGAATCAGGCATTGGCGACAAGCCGCTGGTGCGCTGGCTACGCGGTCATTTGCGCATGACCg < 1:1533358/150‑1 (MQ=255) ggCTAATTTCGCAGTTCGACTGGATCCTGTATATCTTCGGTGCCTTCCTGCTGTTTACCGGCGTGAAGATGGCGCTCGCCCATGAAGATGAATCAGGCATTGGCGACAAGCCGCTGGTGCGCTGGCTACGCGGTCATTTGCGCATGACCg > 1:189204/1‑150 (MQ=255) cTAATTTCGCAGTTCGACTGGATCCTGTATATCTTCGGTGCCTTCCTGCTGTTTACCGGCGTGAAGATGGCGCTCGCCCATGAAGATGAATCAGGCATTGGCGACAAGCCGCTGGTGCGCTGGCTACGCGGTCATTTGCGCATGACCGac < 1:284891/150‑1 (MQ=255) cTAATTTCGCAGTTCGACTGGATCCTGTATATCTTCGGTGCCTTCCTGCTGTTTACCGGCGTGAAGATGGCGCTCGCCCATGAAGATGAATCAGGCATTGGCGACAAGCCGCTGGTGCGCTGGCTACGCGGTCATGCGCAAATGACCgcg < 1:1175837/150‑3 (MQ=255) tAATTTCGCAGTTCGACTGGATCCTGTATATCTTCGGTGCCTTCCTGCTGTTTACCGGCGTGAAGATGGCGCTCGCCCATGAAGATGAATCAGGCATTGGCGACAAGCCGCTGGTGCGCTGGCTACGCGGTCATGCGCAAATGACCgcgt < 1:1155217/150‑4 (MQ=255) aTTTCGCAGTTCGACTGGATCCTGTATATCTTCGGTGCCTTCCTGCTGTTTACCGGCGTGAAGATGGCGCTCGCCCATGAAGATGAATCAGGCATTGGCGACAAGCCGCTGGTGCGCTGGCTACGCGGTCATGCGCAAATGACCgcgtag < 2:630861/150‑6 (MQ=255) tttCGCAGTTCGACTGGATCCTGTATATCTTCGGTGCCTTCCTGCTGTTTACCGGCGTGAAGATGGCGCTCGCCCATGAAGATGAATCAGGCATTGGCGACAAGCCGCTGGTGCGCTGGCTACGCGGTCATTTGCGCATGACCGACACCa < 1:421093/150‑1 (MQ=255) tttCGCAGTTCGACTGGATCCTGTATATCTTCGGTGCCTTCCTGCTGTTTACCGGCGTGAAGATGGCGCTCGCCCATGAAGATGAATCAGGCATTGGCGACAAGCCGCTGGTGCGCTGGCTACGCGGTCATTTGCGCATGACCGACACCa > 2:869296/1‑150 (MQ=255) tCGCAGTTCGACTGGATCCTGTATATCTTCGGTGCCTTCCTGCTGTTTACCGGCGTGAAGATGGCGCTCGCCCATGAAGATGAATCAGGCATTGGCGACAAGCCGCTGGTGCGCTGGCTACGCGGTCATTTGCGCATGACCGACACCATc < 1:1131970/150‑1 (MQ=255) tCGCAGTTCGACTGGATCCTGTATATCTTCGGTGCCTTCCTGCTGTTTACCGGCGTGAAGATGGCGCTCGCCCATGAAGATGAATCAGGCATTGGCGACAAGCCGCTGGTGCGCTGGCTACGCGGTCATTTGCGCATGACCGACACCATc < 1:1058430/150‑1 (MQ=255) cGCAGTTCGACTGGATCCTGTATATCTTCGGTGCCTTCCTGCTGTTTAGCGGCGTGAAGATGGCGCTCGCCCATGAAGATGAATCAGGCATTGGCGACAAGCCGCTGGTGCGCTGGCTACGCGGTCATTTGCGCATGACCGACACCATCg < 2:676922/150‑1 (MQ=255) cGCAGTTCGACTGGATCCTGTATATCTTCGGTGCCTTCCTGCTGTTTACCGGCGTGAAGATGGCGCTCGCCCATGAAGATGAATCAGGCATTGGCGACAAGCCGCTGGTGCGCTGGCTACGCGGTCATTTGCGCATGACCGACACCATCg < 1:846089/150‑1 (MQ=255) cGCAGTTCGACTGGATCCTGTATATCTTCGGTGCCTTCCTGCTGTTTACCGGCGTGAAGATGGCGCTCGCCCATGAAGATGAATCAGGCATTGGCGACAAGCCGCTGGTGCGCTGGCTACGCGGTCATTTGCGCATGACCGACACCATCg > 2:1061881/1‑150 (MQ=255) gCAGTTCGACTGGATCCTGTATATCTTCGGTGCCTTCCTGCTGTTTACCGGCGTGAAGATGGCGCTCGCCCATGAAGATGAATCAGGCATTGGCGACAAGCCGCTGGTGCGCTGGCTACGCGGTCATTTGCGCATGACCGACACCATCGa > 1:1030711/1‑150 (MQ=255) tCGACTGGATCCTGTATATCTTCGGTGCCTTCCTGCTGTTTACCGGCGTGAAGATGGCGCTCGCCCATGAAGATGAATCAGGCATTGGCGACAAGCCGCTGGTGCGCTGGCTACGCGGTCATTTGCGCATGACCGACACCATCGACAACg < 2:806843/150‑1 (MQ=255) aCTGGATCCTGTATATCTTCGGTGCCTTCCTGCTGTTTACCGGCGTGAAGATGGCGCTCGCCCATGAAGATGAATCAGGCATTGGCGACAAGCCGCTGGTGCGCTGGCTACGCGGTCATTTGCGCATGCCCGACCCCATCGACAACGAGc > 2:835022/1‑150 (MQ=255) aCTGGATCCTGTATATCTTCGGTGCCTTCCTGCTGTTTACCGGCGTGAAGATGGCGCTCGCCCATGAAGATGAATCAGGCATTGGCGACAAGCCGCTGGTGCGCTGGCTACGCGGTCATTTGCGCATGACCGACACCATCGACAACGAGc < 1:45397/150‑1 (MQ=255) aCTGGATCCTGTATATCTTCGGTGCCTTCCTGCTGTTTACCGGCGTGAAGATGGCGCTCGCCCATGAAGATGAATCAGGCATTGGCGACAAGCCGCTGGTGCGCTGGCTACGCGGTCATTTGCGCATGACCGACACCATCGACAACGAGc > 1:294761/1‑150 (MQ=255) cTGGATCCTGTATATCTTCGGTGCCTTCCTGCTGTTTACCGGCGTGAAGATGGCGCTCGCCCATGAAGATGAATCAGGCATTGGCGACAAGCCGCTGGTGCGCTGGCTACGCGGTCATTTGCGCATGACCGACACCATCGACAACGAGCa > 1:342942/1‑150 (MQ=255) cTGGATCCTGTATATCTTCGGTGCCTTCCTGCTGTTTACCGGCGTGAAGATGGCGCTCGCCCATGAAGATGAATCAGGCATTGGCGACAAGCCGCTGGTGCGCTGGCTACGCGGTCATTTGCGCATGACCGACACCATCGACAACGAGCa < 1:673778/150‑1 (MQ=255) aTCCTGTATATCTTCGGTGCCTTCCTGCTGTTTACCGGCGCGAAGATGGCGCTCGCCCATGAAGATGAATCAGGCATTGGCGACAAGCCGCTGGTGCGCTGGCTACGCGCTCATTTGCGCATGACCGACACCATCGACAACGAGCATTTc > 1:503052/1‑150 (MQ=255) ccTGTATATCTTCGGAGCCTTCCTGCTGTTTACCGGCGTGAAGATGGCGCTCGCCCATGAAGATGAATCAGGCATTGGCGACAAGCCGCTGGTGCGCTGGCTACGCGGTCATTTGCGCATGACCGACACCATCGACCACGAGCATTTCtt > 2:520797/1‑150 (MQ=255) atatCTTCGGTGCCTTCCTGCTGTTTACCGGCGTGAAGATGGCGCTCGCCCATGAAGATGAATCAGGCATTGGCGACAAGCCGCTGGTGCGCTGGCTACGCGGTCATTTGCGCATGACCGACACCATCGACAACGAGCATTTCTTTGTGc < 2:1503251/150‑1 (MQ=255) atCTTCGGTGCCTTCCTGCGGTTTACCGGCGTGAAGATGGCGCTCGCCCATGAAGATGAATCAGGCATTGGCCACAAGCAGCTGGTGCGCTGGCTACGAGGTCATTTGCGCATGACCGACACCATCGACAACGATCATTTCTTTGTGCGt > 2:934361/1‑150 (MQ=255) tCTTCGGTGCCTTCCTGCTGTTTACCGGCGTGAAGATGGCGCTCGCCCATGAAGATGAATCAGGCATTGGCGACAAGCCGCTGGTGCGCTGGCTACGCGGTCATTTGCGCATGACCGACACCATCGACAACGAGCATTTCTTTGTGCGTa < 1:1324767/150‑1 (MQ=255) tCTTCGGTGCCTTCCTGCTGTTTACCGGCGTGAAGATGGCGCTCGCCCATGAAGATGAATCAGGCATTGGCGACAAGCCGCTGGTGCGCTGGCTACGCGGTCATTTGCGCATGACCGACACCATCGACAACGAGCATTTCTTTGTGCGTa > 1:735811/1‑150 (MQ=255) cTTCGGTGCCTTCCTGCTGTTTACCGGCGTGAAGATGGCGCTCGCCCATGAAGATGAATCAGGCATTGGCGACAAGCCGCTGGTGCGCTGGCTACGCGGTCATTTGCGCATGACCGACACCATCGACAACGAGCATTTCTTTGTGCGTaa < 2:189204/150‑1 (MQ=255) cTTCGGTGCCTTCCTGCTGTTTACCGGCGTGAAGATGGCGCTCGCCCATGAAGATGAATCAGGCATTGGCGACAAGCCGCTGGTGCGCTGGCTACGCGGTCATTTGCGCATGACCGACACCATCGACAACGAGCATTTCTTTGTGCGTaa > 2:1035479/1‑150 (MQ=255) gTGCCTTCCTGCTGTTTACCGGCGTGAAGATGGCGCTCGCCCATGAAGATGAATCAGGCATTGGCGACAAGCCGCTGGTGCGCTGGCTACGCGGTCATTTGCGCATGACCGACACCATCGACAACGAGCATTTCTTTGTGCGTAAGAATg < 1:1339076/150‑1 (MQ=255) gTGCCTTCCTGCTGTTTACCGGCGTGAAGATGGCGCTCGCCCATGAAGATGAATCAGGCATTGGCGACAAGCCGCTGGTGCGCTGGCTACGCGGTCATTTGCGCATGACCGACACCATCGACAACGAGCATTTCTTTGTGCGTAAGAATg < 2:416953/150‑1 (MQ=255) gTGCCTTCCTGCTGTTTACCGGCGTGAAGATGGCGCTCGCCCATGAAGATGAATCAGGCATTGGCGACAAGCCGCTGGTGCGCTGGCTACGCGGTCATTTGCGCATGACCGACACCATCGACAACGAGCATTTCTTTGTGCGTAAGAATg < 2:63478/150‑1 (MQ=255) ccTTCCTGCTGTTTACCGGCGTGAAGATGGCGCTCGCCCATGAAGATGAATCAGGCATTGGCGACAAGCCGCTGGTGCGCTGGCTACGCGGTCATTTGCGCATGACCGACACCATCGACAACGAGCATTTCTTTGTGCGTAAGAATGGAt > 1:953784/1‑150 (MQ=255) tCCTGCTGTTTACCGGCGTGAAGATGGCGCTCGCCCATGAAGATGAATCAGGCATTGGCGACAAGCCGCTGGTGCGCTGGCTACGCGGTCATTTGCGCATGACCGACACCATCGACAACGAGCATTTCTTTGTGCGTAAGAATGGATTGc < 1:1035479/150‑1 (MQ=255) tCCTGCTGTTTACCGGCGTGAAGATGGCGCTCGCCCATGAAGATGAATCAGGCATTGGCGACAAGCCGCTGGTGCGCTGGCTACGCGGTCATTTGCGCATGACCGACACCATCGACAACGAGCATTTCTTTGTGCGTAAGAATGGATTGc < 1:1246507/150‑1 (MQ=255) ctgctgTTTACCGGCGTGAAGATGGCGCTCGCCCATGAAGATGAATCAGGCATTGGCGACAAGCCGCTGGTGCGCTGGCTACGCGGTCATTTGCGCATGACCGACACCATCGACAACGAGCATTTCTTTGTGCGTAAGAATGGATTGCTg > 2:321637/1‑150 (MQ=255) ctgctgTTTACCGGCGTGAAGATGGCGCTCGCCCATGAAGATGAATCAGGCATTGGCGACAAGCCGCTGGTGCGCTGGCTACGCGGTCATTTGCGCATGACCGACACCATCGACAACGAGCATTTCTTTGTGCGTAAGAATGGATTGCTg < 1:869296/150‑1 (MQ=255) gctgTTTACCGGCGTGAAGATGGCGCTCGCCCATGAAGATGAATCAGGCATTGGCGACAAGCCGCTGGTGCGCTGGCTACGCGGTCATTTGCGCATGACCGACACCATCGACAACGAGCATTTCTTTGTGCGTAAGAATGGATTGCTGTa > 1:1301503/1‑150 (MQ=255) gTTTACCGGCGTGAAGATGGCGCTCGCCCATGAAGATGAATCAGGCATTGGCGACAAGCCGCTGGTGCGCTGGCTACGCGGTCATTTGCGCATGACCGACACCATCGACAACGAGCATTTCTTTGTGCGTAAGAATGGATTGCTGTACGc > 2:672538/1‑150 (MQ=255) tttACCGGCGTGAAGATGGCGCTCGCCCATGAAGATGAATCAGGCATTGGCGACAAGCCGCTGGTGCGCTGGCTACGCGGTCATTTGCGCATGACCGACACCATCGACAACGAGCATTTCTTTGTGCGTAAGAATGGATTGCTGTACGcc < 1:950501/150‑1 (MQ=255) tttACCGGCGTGAAGATGGCGCTCGCCCATGAAGATGAATCAGGCATTGGCGACAAGCCGCTGGTGCGCTGGCTACGCGGTCATTTGCGCATGACCGACACCATCGACAACGAGCATTTCTTTGTGCGTAAGAATGGATTGCTGTACGcc < 2:327653/150‑1 (MQ=255) tttACCGGCGTGAAGATGGCGCTCGCCCATGAAGATGAATCAGGCATTGGCGACAAGCCGCTGGTGCGCTGGCTACGCGGTCATTTGCGCATGACCGACACCATCGACAACGAGCATTTCTTTGTGCGTAAGAATGGATTGCTGTACGcc < 1:835603/150‑1 (MQ=255) tACCGGCGTGAAGATGGCGCTCGCCCATGAAGATGAATCAGGCATTGGCGACAAGCCGCTGGTGCGCTGGCTACGCGGTCATTTGCGCATGACCGACACCATCGACAACGAGCATTTCTTTGTGCGTAAGAATGGATTGCTGTACGCcac > 1:614022/1‑150 (MQ=255) aCCGGCGTGAAGATGGCGCTCGCCCATGAAGATGAATCAGGCATTGGCGACAAGCCGCTGGTGCGCTGGCTACGCGGTCATTTGCGCATGACCGACACCATCGACAACGAGCATTTCTTTGTGCGTAAGAATGGATTGCTGTACGCcaca > 1:862911/1‑150 (MQ=255) ccGGCGTGAAGATGGCGCTCGCCCATGAAGATGAATCAGGCATTGGCGACAAGCCGCTGGTGCGCTGGCTACGCGGTCATTTGCGCATGACCGACACCATCGACAACGAGCATTTCTTTGTGCGTAAGAATGGATTGCTGTACGCCacac > 1:599921/1‑150 (MQ=255) ggCGTGAAGATGGCGCTCGCCCATGAAGATGAATCAGGCATTGGCGACAAGCCGCTGGTGCGCTGGCTACGCGGTCATTTGCGCATGACCGACACCATCGACAACGAGCATTTCTTTGTGCGTAAGAATGGATTGCTGTACGCCACACCg > 1:1049900/1‑150 (MQ=255) gCGTGAAGATGGCGCTCGCCCATGAAGATGAATCAGGCATTGGCGACAAGCCGCTGGTGCGCTGGCTACGCGGTCATTTGCGCATGACCGACACCATCGACAACGAGCATTTCTTTGTGCGTAAGAATGGATTGCTGTACGCCACACCGc > 2:994300/1‑150 (MQ=255) gTGAAGATGGCGCTCGCCCATGAAGATGAATCAGGCATTGGCGACAAGCCGCTGGTGCGCTGGCTACGCGGTCATTTGCGCATGACCGACACCATCGACAACGAGCATTTCTTTGTGCGTATGAATGGATTGCTGTACGCCACACCGCTg > 1:584485/1‑150 (MQ=255) gTGAAGATGGCGCTCGCCCATGAAGATGAATCAGGCATTGGCGACAAGCCGCTGGTGCGCTGGCTACGCGGTCATTTGCGCATGACCGACACCATCGACAACGAGCATTTCTTTGTGCGTAAGAATGGATTGCTGTACGCCACACCGCTg > 1:864578/1‑150 (MQ=255) tGAAGATGGCGCTCGCCCATGAAGATGAATCAGGCATTGGCGACAAGCCGCTGGTGCGCTGGCTACGCGGTCATTTGCGCATGACCGACACCATCGACAACGAGCATTTCTTTGTGCGTAAGAATGGATTGCTGTACGCCACACCGCTGa > 2:1346657/1‑150 (MQ=255) aaGATGGCGCTCGCCCATGAAGATGAATCAGGCATTGGCGACAAGCCGCTGGTGCGCTGGCTACGCGGTCATTTGCGCATGACCGACACCATCGACAACGAGCATTTCTTTGTGCGTAAGAATGGATTGCTGTACGCCACACCGCTGATg > 1:1232171/1‑150 (MQ=255) gATGGCGCTCGCCCATGAAGATGAATCAGGCATTGGCGACAAGCCGCTGGGGCGCTGGCTACGCGGTCATTTGCGCATGACCGACACCATCGACAACGAGCATTTCTTTGTGCGTAAGAATGGATTGCTGTACGCCACACCGCTGATGCt < 1:1433639/150‑1 (MQ=255) tGGCGCTCGCCCATGAAGATGAATCAGGCATTGGCGACAAGCCGCTGGTGCGCTGGCTACGCGGTCATTTGCGCATGACCGACACCATCGACAACGAGCATTTCTTTGTGCGTAAGAATGGATTGCTGTACGCCACACCGCTGATGCTgg < 1:339503/150‑1 (MQ=255) gcgcTCGCCCATGAAGATGAATCAGGCATTGGCGACAAGCCGCTGGTGCGCTGGCTACGCGGTCATTTGCGCATGACCGACACCATCGACAACGAGCATTTCTTTGTGCGTAAGAATGGATTGCTGTACGCCACACCGCTGATGCTGGTa < 2:1049900/150‑1 (MQ=255) cgcTCGCCCATGAAGATGAATCAGGCATTGGCGACAAGCCGCTGGTGCGCTGGCTACGCGGTCATTTGCGCATGACCGACACCATCGACAACGAGCATTTCTTTGTGCGTAAGAATGGATTGCTGTACGCCACACCGCTGATGCTGGTAc < 2:818257/150‑1 (MQ=255) gcTCGCCCATGAAGATGAATCAGGCATTGGCGACAAGCCGCTGGTGCGCTGGCTACGCGGTCATTTGCGCATGACCGACACCATCGACAACGAGCATTTCTTTGTGCGTAAGAATGGATTGCTGTACGCCACACCGCTGATGCTGGTACt < 1:1166074/150‑1 (MQ=255) gcTCGCCCATGAAGATGAATCAGGCATTGGCGACAAGCCGCTGGTGCGCTGGCTACGCGGTCATTTGCGCATGACCGACACCATCGACAACGAGCATTTCTTTGTGCGTAAGAATGGATTGCTGTACGCCACACCGCTGATGCTGGTACt < 1:1315594/150‑1 (MQ=255) cccATGAAGATGAATCAGGCATTGGCGACAAGCCGCTGGTGCGCTGGCTACGCGGTCATTTGCGCATGACCGACACCATCGACAACGAGCATTTCTTTGTGCGTAAGAATGGATTGCTGTACGCCACACCGCTGATGCTGGTACTGATTc < 1:996669/150‑1 (MQ=255) cccATGAAGATGAATCAGGCATTGGCGACAAGCCGCTGGTGCGCTGGCTACGCGGTCATTTGCGCATGACCGACACCATCGACAACGAGCATTTCTTTGTGCGTAAGAATGGATTGCTGTACGCCACACCGCTGATGCTGGTACTGATTc > 1:1082525/1‑150 (MQ=255) aTGAAGATGAATCAGGCATTGGCGACAAGCCGCTGGTGCGCTGGCTACGCGGTCATTTGCGCATGACCGACACCATCGACAACGAGCATTTCTTTGTGCGTAAGAATGGATTGCTGTACGCCACACCGCTGATGCTGGTACTGATTCtgg < 1:888977/150‑1 (MQ=255) tGAAGATGAATCAGGCATTGGCGACAAGCCGCTGGTGCGCTGGCTACGCGGTCATTTGCGCATGACCGACACCATCGACAACGAGCATTTCTTTGTGCGTAAGAATGGATTGCTGTACGCCACACCGCTGATGCTGGTACTGATTCtggt < 1:1312021/150‑1 (MQ=255) gAAGATGAATCAGGCATTGTCGACAAGCCGCTGGTGCGCTGGCTACGCGGTCATTTGCGCATGACCGACACCATCGACTACGAGCATTTCTTTGTGCGTAAGAATGGATTGCTGTACGCCACACCGCTGATGCTGGTACTGATTCtggtg < 2:1348369/150‑1 (MQ=255) aTGAATCAGGCATTGGCGACAAGCCGCTGGTGCGCTGGCTACGCGGTCATTTGCGCATGACCGACACCATCGACAACGAGCATTTCTTTGTGCGTAAGAATGGATTGCTGTACGCCACACCGCTGATGCTGGTACTGATTCTGGTGGAAt < 2:148332/150‑1 (MQ=255) gAATCAGGCATTGGCGACAAGCCGCTGGTGCGCTGGCTACGCGGTCATTTGCGCATGACCGACACCATCGACAACGAGCATTTCTTTGTGCGTAAGAATGGATTGCTGTACGCCACACCGCTGATGCTGGTACTGATTCTGGTGGAATTg < 1:1360142/150‑1 (MQ=255) gAATCAGGCATTGGCGACAAGCCGCTGGTGCGCTGGCTACGCGGTCATTTGCGCATGACCGACACCATCGACAACGAGCATTTCTTTGTGCGTAAGAATGGATTGCTGTACGCCACACCGCTGATGCTGGTACTGATTCTGGTGGAATTg < 1:994300/150‑1 (MQ=255) ggCATTGGCGACAAGCCGCTGGTGCGCTGGCTACGCGGTCATTTGCGCATGACCGACACCATCGACAACGAGCATTTCTTTGTGCGTAAGAATGGATTGCTGTACGCCACACCGCTGATGCTGGTACTGATTCTGGTGGAATTGAGCGAc > 1:1175/1‑150 (MQ=255) cATTGGCGACAAGCCGCTGGTGCGCTGGCTACGCGGTCATTTGCGCATGACCGACACCATCGACAACGAGCATTTCTTTGTGCGTAAGAATGGATTGCTGTACGCCACACCGCTGATGCTGGTACTGATTCTGGTGGAATTGAGCGACGt > 2:513595/1‑150 (MQ=255) aTTGGCGACAAGCCGCTGGTGCGCTGGCTACGCGGTCATTTGCGCATGACCGACACCATCGACAACGAGCATTTCTTTGTGCGTAAGAATGGATTGCTGTACGCCACACCGCTGATGCTGGTAc > 2:120210/1‑124 (MQ=255) aTTGGCGACAAGCCGCTGGTGCGCTGGCTACGCGGTCATTTGCGCATGACCGACACCATCGACAACGAGCATTTCTTTGTGCGTAAGAATGGATTGCTGTACGCCACACCGCTGATGCTGGTAc < 1:120210/124‑1 (MQ=255) tGGCGACAAGCCGCTGGTGCGCTGGCTACGCGGTCATTTGCGCATGACCGACACCATCGACAACGAGCATTTCTTTGTGCGTAAGAATGGATTGCTGTACGCCACACCGCTGATGCTGGTACTGATTCTGGTGGAATTGAGCGACGTGAt < 2:953784/150‑1 (MQ=255) cGACAAGCCGCTGGTGCGCTGGCTACGCGGTCATTTGCGCATGACCGACACCATCGACAACGAGCATTTCTTTGTGCGTAAGAATGGATTGCTGTACGCCACACCGCTGATGCTGGTACTGATTCTGGTGGAATTGAGCGACGTGAtttt > 2:781351/1‑150 (MQ=255) aCAAGCCGCTGGTGCGCTGGCTACGCGGTCATTTGCGCATGACCGACACCATCGACAACGAGCATTTCTTTGTGCGTAAGAATGGATTGCTGTACGCCACACCGCTGATGCTGGTACTGATTCTGGTGGAATTGAGCGACGTGATTTTCg > 1:208665/1‑150 (MQ=255) cAAGCCGCTGGTGCGCTGGCTACGCGGTCATTTGCGCATGACCGACACCATCGACAACGAGCATTTCTTTGTGCGTAAGAATGGATTGCTGTACGCCACACCGCTGATGCTGGTACTGATTCTGGTGGAATTGAGCGACGTGATTTTCGc < 1:1333459/150‑1 (MQ=255) cAAGCCGCTGGTGCGCTGGCTACGCGGTCATTTGCGCATGACCGACACCATCGACAACGAGCATTTCTTTGTGCGTAAGAATGGATTGCTGTACGCCACACCGCTGATGCTGGTACTGATTCTGGTGGAATTGAGCGACGTGATTTTCGc < 2:862911/150‑1 (MQ=255) aaGCCGCTGGTGCGCTGGCTACGCGGTCATTTGCGCATGACCGACACCATCGACAACGAGCATTTCTTTGTGCGTAAGAATGGATTGCTGTACGCCACACCGCTGATGCTGGTACTGATTCTGGTGGAATTGAGCGACGTGATTTTCGcc < 2:1301503/150‑1 (MQ=255) gCTGGTGCGCTGGCTACGCGGTCATTTGCGCATGACCGACACCATCGACAACGAGCATTTCTTTGTGCGTAAGAATGGATTGCTGTACGCCACACCGCTGATGCTGGTACTGATTCTGGTGGAATTGAGCGACGTGATTTTCGCCGTGGa < 2:294761/150‑1 (MQ=255) gCTGGTGCGCTGGCTACGCGGTCATTTGCGCATGACCGACACCATCGACAACGAGCATTTCTTTGTGCGTAAGAATGGATTGCTGTACGCCACACCGCTGATGCTGGTACTGATTCTGGTGGAATTGAGCGACGTGATTTTCGCCGTGGa > 2:1155721/1‑150 (MQ=255) ggTGCGCTGGCTACGCGGTCATTTGCGCATGACCGACACCATCGACAACGAGCATTTCTTTGTGCGTAAGAATGGATTGCTGTACGCCACACCGCTGATGCTGGTACTGATTCTGGTGGAATTGAGCGACGTGATTTTCGCCGTGGATAg > 2:389904/1‑150 (MQ=255) ggTGCGCTGGCTACGCGGTCATTTGCGCATGACCGACACCATCGACAACGAGCATTTCTTTGTGCGTAAGAATGGATTGCTGTACGCCACACCGCTGATGCTGGTACTGATTCTGGTGGAATTGAGCGACGTGATTTTCGCCGTGGATAg < 1:672538/150‑1 (MQ=255) gcgcTGGCTACGCGGTCATTTGCGCATGACCGACACCATCGACAACGAGCATTTCTTTGTGCGTAAGAATGGATTGCTGTACGCCACACCGCTGATGCTGGTACTGATTCTGGTGGAATTGAGCGACGTGATTTTCGCCGTGGATAGCAt > 1:267702/1‑150 (MQ=255) cgcTGGCTACGCGGTCATTTGCGCATGACCGACACCATCGACAACGAGCATTTCTTTGTGCGTAAGAATGGATTGCTGTACGCCACCCCGCTGATGCTGGTACTGATTCTGGTGGAATTGCGCGACGTGATTTTCGCCGTGGATAGCAtt > 2:1368453/1‑150 (MQ=255) gcTGGCTACGCGGTCATTTGCGCATGACCGACACCATCGACAACGAGCATTTCTTTGTGCGTAAGAATGGATTGCTGTACGCCACACCGCTGATGCTGGTACTGATTCTGGTGGAATTGAGCGACGTGATTTTCGCCGTGGATAGCATTc > 2:1428217/1‑150 (MQ=255) ggCTACGCGGTCATTTGCGCATGACCGACACCATCGACAACGAGCATTTCTTTGTGCGTAAGAATGGATTGCTGTACGCCACACCGCTGATGCTGGTACTGATTCTGGTGGAATTGAGCGACGTGATTTTCGCCGTGGATAGCATTCCgg < 2:342942/150‑1 (MQ=255) ggCTACGCGGTCATTTGCGCATGACCGACACCATCGACAACGAGCATTTCTTTGTGCGTAAGAATGGATTGCTGTACGCCACACCGCTGATGCTGGTACTGATTCTGGTGGAATTGAGCGACGTGATTTTCGCCGTGGATAGCATTCCgg > 2:528991/1‑150 (MQ=255) ggCTACGCGGTCATTTGCGCATGACCGACACCATCGACAACGAGCATTTCTTTGTGCGTAAGAATGGATTGCTGTACGCCACACCGCTGATGCTGGTACTGATTCTGGTGGAATTGAGCGACGTGATTTTCGCCGTGGATAGCATTCCgg < 1:536159/150‑1 (MQ=255) tggtgtcgGTCATGCGCAAATGACCGACACCATCGACAACGAGCATTTCTTTGTGCGTAAGAATGGATTGCTGTACGCCACACCGCTGATGCTGGTACTGATTCTGGTGGAATTGAGCGACGTGATTTTCGCCGTGGATAGCATTCCGGc > 1:176828/7‑150 (MQ=255) gCTACGCGGTCATTTGCGCATGACCGACACCATCGACAACGAGCATTTCTTTGTGCGTAAGAATGGATTGCTGTACGCCACACCGCTGATGCTGGTACTGATTCTGGTGGAATTGAGCGACGTGATTTTCGCCGTGGATAGCATTCCGGc > 2:644165/1‑150 (MQ=255) tACGCGGTCATTTGCGCATGACCGACACCATCGACAACGAGCATTTCTTTGTGCGTAAGAATGGATTGCTGTACGCCACACCGCTGATGCTGGTACTGATTCTGGTGGAATTGAGCGACGTGATTTTCGCCGTGGATAGCATTCCGGCTa > 1:580355/1‑150 (MQ=255) gtgtcgGTCATGCGCAAATGACCGACACCATCGACAACGAGCATTTCTTTGTGCGTAAGAATGGATTGCTGTACGCCACACCGCTGATGCTGGTACTGATTCTGGTGGAATTGAGCGACGTGATTTTCGCCGTGGATAGCATTCCGGCTa > 1:133980/5‑150 (MQ=255) gtcgGTCATGCGCAAATGACCGACACCATCGACAACGAGCATTTCTTTGTGCGTAAGAATGGATTGCTGTACGCCACACCGCTGATGCTGGTACTGATTCTGGTGGAATTGAGCGACGTGATTTTCGCCGTgg < 2:1076167/131‑1 (MQ=255) gtcgGTCATGCGCAAATGACCGACACCATCGACAACGAGCATTTCTTTGTGCGTAAGAATGGATTGCTGTACGCCACACCGCTGATGCTGGTACTGATTCTGGTGGAATTGAGCGACGTGATTTTCGCCGTgg > 1:1076167/3‑133 (MQ=255) cgcgGTCATTTGCGCATGACCGACACCATCGACAACGAGCATTTCTTTGTGCGTAAGAATGGATTGCTGTACGCCACACCGCTGATGCTGGTACTGATTCTGGTGGAATTGAGCGACGTGATTTTCGCCGTGGATAGCATTCCGGCTATc < 2:735811/150‑1 (MQ=255) gcgGGCATTTGCGCATGACCGACACCATCGACAACGAGCATTTCTTTGTGCGTAAGAATGGATTGCTGTACGCCACACCGCTGATGCTGGTACTGATTCTGGTGGAATTGAGCGACGTGATTTTCGCCGTGGATAGCATTCCGGCTATCt < 1:1355615/150‑1 (MQ=255) cgGTCATTTGCGCATGACCGACACCATCGACAACGAGCATTTCTTTGTGCGTAAGAATGGATTGCTGTACGCCACACCGCTGATGCTGGTACTGATTCTGGTGGAATTGAGCGACGTGATTTTCGCCGTGGATAGCATTCCGGCTATCtt < 1:528991/150‑1 (MQ=255) cgGTCATGCGCAAATGACCGACACCATCGACAACGAGCATTTCTTTGTGCGTAAGAATGGATTGCTGTACGCCACACCGCTGATGCTGGTACTGATTCTGGTGGAATTGAGCGACGTGATTTTCGCCGTGGATAGCATTCCGGCTATCtt > 1:1222456/1‑150 (MQ=255) cgcATGACCGACACCATCGACAACGAGCATTTCTTTGTGCGTAAGAATGGATTGCTGTACGCCACACCGCTGATGCTGGTACTGATTCTGGTGGAATTGAGCGACGTGATTTTCGCCGTGGATAGCATTCCGGCTATCTTCGCCGTGAcc > 2:70393/1‑150 (MQ=255) | TGGCAGCTGGCTAATTTCGCAGTTCGACTGGATCCTGTATATCTTCGGTGCCTTCCTGCTGTTTACCGGCGTGAAGATGGCGCTCGCCCATGAAGATGAATCAGGCATTGGCGACAAGCCGCTGGTGCGCTGGCTACGCGGTCATTTGCGCATGACCGACACCATCGACAACGAGCATTTCTTTGTGCGTAAGAATGGATTGCTGTACGCCACACCGCTGATGCTGGTACTGATTCTGGTGGAATTGAGCGACGTGATTTTCGCCGTGGATAGCATTCCGGCTATCTTCGCCGTGACC > NC_000913/3238975‑3239272 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |