| Predicted mutation | |||||||
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| RA | NC_000913 | 3,276,891 | T→G | 6.6% | intergenic (+38/‑111) | garD → / → prlF | galactarate dehydratase/antitoxin PrlF |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_000913 | 3,276,891 | 0 | T | G | 6.6% | 343.1 / 11.5 | 116 | intergenic (+38/‑111) | garD/prlF | galactarate dehydratase/antitoxin PrlF |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (51/56); new base G (4/4); total (56/60) | |||||||||||
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Only 100 of 117 total aligned reads displayed.
AAGTTGTTCCACTTTATTCTCGACGTCGCCAGCGGGAAGAAGAAAACCTTCTCGGATCAATGGGGGCTGCATAACCAGCTGGCGGTGTTTAACCCGGCACCGGTGACCTGATTTCTTTTGGAACGTCCCTCGCAAAACATGGCCTTAGTGCCATGTTTTTATTGTTTAAAGCCCCCACGTCCATTAATAATGCATTTGCATTACCTTAGTTCAAGCTTATAATTTGAGCAGAAAACAGGCTGTAAAAGGACAGTGAATCATGCCCGCTAATGCTCGCTCTCACGCTGTACTGACCACT > NC_000913/3276743‑3277040 | aaGTTGTTCCACTTTATTCTCGACGTCGCCAGCGGGAAGAAGAAAACCTTCTCGGATCAATGGGGGCTGCATAACCAGCTGGCGGTGTTTAACCCGGCACCCGTGACCTGATTTCTTTTGGAACGTCCCTCGCAAAACATGGCCTTAGTg < 2:669231/150‑1 (MQ=255) tgttCCACTTTATTCTCGACGTCGCCAGCGGGAAGAAGAAAACCTTCTCGGATCAATGGGGGCTGCATAACCAGCTGGCGGTGTTTAACCCGGCACCGGTGACCTGATTTCTTTTGGAACGTCCCTCGCAAAACATGGCCTTAGTGCCAt < 1:1375137/150‑1 (MQ=255) tCCACTTTATTCTCGACGTCGCCAGCGGGAAGAAGAAAACCTTCTCGGATCAATGGGGGCTGCATAACCAGCTGGCGGTGTTTAACCCGGCACCGGTGGCCTGATTTCTTTTGGAACGTCCCTCGCAAAACATGGCCTTAGTGCCATGtt > 2:263305/1‑150 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |