Predicted mutation | |||||||
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RA | NC_000913 | 397,273 | C→T | 6.7% | A212V (GCC→GTC) | sbmA → | peptide antibiotic/peptide nucleic acid transporter |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_000913 | 397,273 | 0 | C | T | 6.7% | 365.8 / 10.8 | 119 | A212V (GCC→GTC) | sbmA | peptide antibiotic/peptide nucleic acid transporter |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (55/55); new base T (6/2); total (61/58) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.74e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.84e-01 |
Only 100 of 121 total aligned reads displayed.
CGTGTTCCGCTGGCGTACAGCGATGAACGAATATTACATGGCGAACTGGCAACAACTGCGTCATATCGAAGGGGCCGCACAGCGTGTGCAGGAAGACACCATGCGTTTTGCTTCAACGCTGGAGAATATGGGCGTCAGTTTTATCAACGCCATCATGACGTTGATCGCCTTCCTGCCGGTGCTGGTAACGCTCTCCGCGCATGTGCCGGAGCTGCCGATTATCGGGCACATTCCGTATGGTCTGGTGATTGCCGCAATCGTCTGGTCGCTGATGGGGACCGGATTGCTGGCAGTGGTAG > NC_000913/397124‑397422 | cGTGTTCCGCTGGCGTACAGCGATGAACGAATATTACATGGCGAACTGGCAACAACTGCGTCATATCGAAGGGGCCGCACAGCGTGTGCAGGAAGACACCATGCGTTTTGCTTCAACGCTGGAGAATATGGGCGTCAGTTTTATCAACGc < 1:1002632/150‑1 (MQ=255) tgtTCCGCTGGCGTACAGCGATGAACGAATATTACATGGCGAACTGGCAACAACTGCGTCATATCGAAGGGGCCGCACAGCGTGTGCAGGAAGACACCATGCGTTTTGCTTCAACGCTGGAGAATATGGGCGTCAGTTTTATCAACGCca > 2:631031/1‑150 (MQ=255) gtTCCGCTGGCGTACAGCGATGAACGAATATTACATGGCGAACTGGCAACAACTGCGTCATATCGAAGGGGCCGCACAGCGTGTGCAGGAAGACACCATGCGTTTTGCTTCAACGCTGGAGAATATGGGCGTCAGTTTTATCAACGCcat > 1:1025697/1‑150 (MQ=255) gCTGGCGTACAGCGATGAACGAATATTACATGGCGAACTGGCAACAACTGCGTCATATCGAAGGGGCCGCACAGCGTGTGCAGGAAGACACCATGCGTTTTGCTTCAACGCTGGAGAATATGGGCGTCAGTTTTATCAACGCCATCATGa > 1:1025451/1‑150 (MQ=255) cTGGCGTACAGCGATGAACGAATATTACATGGCGAACTGGCAACAACTGCGTCATATCGAAGGGGCCGCACAGCGTGTGCAGGAAGACACCATGCGTTTTGCTTCAACGCTGGAGAATATGGGCGTCAGTTTTATCAACGCCATCATgcc > 1:919680/1‑148 (MQ=255) gCGTACAGCGATGAACGAATATTACATGGCGAACTGGCAACAACTGCGTCATATCGAAGGGGCCGCACAGCGTGTGCAGGAAGACACCATGCGTTTTGCTTCAACGCTGGAGAATATGGGCGTCAGTTTTATCAACGCCATCATGACGtt < 2:168161/150‑1 (MQ=255) cGTACAGCGATGAACGAATATTACATGGCGAACTGGCAACAACTGCGTCATATCGAAGGGGCCGCACAGCGTGTGCAGGAAGACACCATGCGTTTTGCTTCAACGCTGGAGAATATGGGCGTCAGTTTTATCAACGCCATCATGACGTTg > 1:945988/1‑150 (MQ=255) aCAGCGATGAACGAATATTACATGGCGAACTGGCAACAACTGCGTCATATCGAAGGGGCCGCACAGCGTGTGCAGGAAGACACCATGCGTTTTGCTTCAACGCTGGAGAATATGGGCGTCAGTTTTATCAACGTCATGATGGCGTTGAta < 1:453714/150‑2 (MQ=255) 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tATCAACTCCATGATGACGTTGATCGCCTTCCTGCCGGTGATGGTATCGCTCTTCGCGCATGTGCTTGAGCTTACTATTATCGGGCACATTCCGTATTGTCTGGTGATTGCCGCAATCGTCTGGTCGCTTATGGGTACCGGATTGGTGGc < 2:851789/150‑1 (MQ=255) gaTCAACGTCATGATGGCGTTGATCGCCTTCCTGCCGGTGCTGGTAACGCTCTCCGCGCATGTGCCGGAGCTGCCGATTATCGGGCACATTCCGTATGGTCTGGTGATTGCCGCAATCGTCTGGTCGCTGATGGGGACCGGATTGCTGGc > 2:761986/2‑150 (MQ=255) gaTCAACGTCATGATGGCGTTGATCGCCTTCCTGCCGGTGCTGGTAACGCTCTCCGCGCATGTGCCGGAGCTGCCGATTATCGGGCACATTCCGTATGGTCTGGTGATTGCCGCAATCGTCTGGTCGCTGATGGGGACCGGATTGCTGGc > 1:1469506/2‑150 (MQ=255) tCAACGCCATCATGACGTTGATCGCCTTCCTGCCGGTGCTGGTAACGCTCTCCGCGCATGTGCCGGAGCTGCCGATTATCGGGCACATTCCGTATGGTCTGGTGATTGCCGCAATCGTCTGGTCGCTGATGGGGACCGGATTGCTGGCAg > 1:933998/1‑150 (MQ=255) cAACGCCATCATGACGTTGATCGCCTTCCTGCCGGTGCTGGTAACGCTCTCCGCGCATGTGCCGGAGCTGCCGATTATCGGGCACATTCCGTATGGTCTGGTGATTGCCGCAATCGTCTGGTCGCTGATGGGGACCGGATTGCTGGc > 2:1283980/1‑147 (MQ=255) 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CGTGTTCCGCTGGCGTACAGCGATGAACGAATATTACATGGCGAACTGGCAACAACTGCGTCATATCGAAGGGGCCGCACAGCGTGTGCAGGAAGACACCATGCGTTTTGCTTCAACGCTGGAGAATATGGGCGTCAGTTTTATCAACGCCATCATGACGTTGATCGCCTTCCTGCCGGTGCTGGTAACGCTCTCCGCGCATGTGCCGGAGCTGCCGATTATCGGGCACATTCCGTATGGTCTGGTGATTGCCGCAATCGTCTGGTCGCTGATGGGGACCGGATTGCTGGCAGTGGTAG > NC_000913/397124‑397422 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |