| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 4,178,483 | G→C | 6.1% | V13L (GTT→CTT) ‡ | rplK → | 50S ribosomal subunit protein L11 |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 4,178,483 | 0 | G | C | 6.1% | 450.4 / 14.7 | 132 | V13L (GTT→CTT) ‡ | rplK | 50S ribosomal subunit protein L11 |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (60/64); new base C (3/5); total (63/69) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.20e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 6.50e-01 | |||||||||||
Only 100 of 132 total aligned reads displayed.
GATTGGAATACAATTTCGCGCCTTTTGTTTTTATGGGCCTTGCCCGTAAAACGATTTTTTATATCACGGGGAGCCTCTCAGAGGCGTTATTACCCAACTTGAGGAATTTATAATGGCTAAGAAAGTACAAGCCTATGTCAAGCTGCAGGTTGCAGCTGGTATGGCTAACCCGAGTCCGCCAGTAGGTCCGGCTCTGGGTCAGCAGGGCGTAAACATCATGGAATTCTGCAAAGCGTTCAACGCAAAAACTGATTCCATCGAAAAAGGTCTGCCGATTCCGGTAGTAATCACCGTTT > NC_000913/4178335‑4178630 | gaTTGGAATACAATTTCGCGCCTTTTGTTTTTATGGGCCTTGCCCGTAAAACGATTTTTTATATCACGGGGAGCCTCTCAGAGGCGTTATTACCCAACTTGAGGAATTTATAATGGCTAAGAAAGTACAAGCCTATGTCAAGCTGCAGGt < 1:1190172/150‑1 (MQ=255)gaTTGGAATACAATTTCGCCCCTTTTGTTTTTATGGGCCTTGCCCGTAAAACGATTTTTTATATCACGGGGAGCCTCTCAGAGGCGTTATTACCCAACTTGAGGAATTTATAATGGCTAAGAAAGTACAAGCCTATGTCAAGCTGCAGGt > 2:1384145/1‑150 (MQ=255) ggAATACAATTTCGCGCCTTTTGTTTTTATGGGCCTTGCCCGTAAAACGATTTTTTATATCACGGGGAGCCTCTCAGAGGCGTTATTACCCAACTTGAGGAATTTATAATGGCTAAGAAAGTACAAGCCTATGTCAAGCTGCAGGTTGCa < 2:768845/150‑1 (MQ=255) aCAATTTCGCGCCTTTTGTTTTTATGGGCCTTGCCCGTAAAACGATTTTTTATATCACGGGGAGCCTCTCAGAGGCGTTATTACCCAACTTGAGGAATTTATAATGGCTAAGAAAGTACAAGCCTATGTCAAGCTGCAGGTTGCAGCTgg < 1:851946/150‑1 (MQ=255) aCAATTTCGCGCCTTTTGTTTTTATGGGCCTTGCCCGTAAAACGATTTTTTATATCACGGGGAGCCTCTCAGAGGCGTTATTACCCAACTTGAGGAATTTATAATGGCTAAGAAAGTACAAGCCTATGTCAAGCTGCAACCTGCAGCttg < 1:529264/150‑3 (MQ=255) cAATTTCGCGCCTTTTGTTTTTATGGGCCTTGCCCGTAAAACGATTTTTTATATCACGGGGAGCCTCTCAGAGGCGTTATTACCCAACTTGAGGAATTTATAATGGCTAAGAAAGTACAAGCCTATGTCCAGCTGCAACCTGCAGCttga < 2:540364/150‑4 (MQ=255) cAATTTCGCGCCTTTTGTTTTTATGGGCCTTGCCCGTAAAACGATTTTTTATATCACGGGGAGCCTCTCAGAGGCGTTATTACCCAACTTGAGGAATTTATAATGGCTAAGAAAGTACAAGCCTATGTCAAGCTGCAGGTTGGAggtggt > 1:668198/1‑150 (MQ=255) cAATTTCGCGCCTTTTGTTTTTATGGGCCTTGCCCGTAAAACGATTTTTTATATCACGGGGAGCCTCTCAGAGGCGTTATTACCCAACTTGAGGAATTTATAATGGCTAAGAAAGTACAAGCCTATGTCAAGCTGCAGGTTGCAGCTGGt > 2:1397581/1‑150 (MQ=255) cAATTTCGCGCCTTTTGTTTTTATGGGCCTTGCCCGTAAAACGATTTTTTATATCACGGGGAGCCTCTCAGAGGCGTTATTACCCAACTTGAGGAATTTATAATGGCTAAGAAAGTACAAGCCTATGTCAAGCTGCAGGTTGCAGCTGGt > 2:1285759/1‑150 (MQ=255) cAATTTCGCGCCTTTTGTTTTTATGGGCCTTGCCCGTAAAACGATTTTTTATATCACGGGGAGCCTCTCAGAGGCGTTATTACCCAACTTGAGGAATTTATAATGGCTAAGAAAGTACAAGCCTATGTCAAGCTGCAACCTGCAGCttga < 1:1089836/150‑4 (MQ=255) aTTTCGCGCCTTTTGTTTTTATGGGCCTTGCCCGTAAAACGATTTTTTATATCACGGGGAGCCTCTCAGAGGCGTTATTACCCAACTTGAGGAATTTATAATGGCTAAGAAAGTACAAGCCTATGTCAAGCTGCAGGTTGCAGCTGGTAt > 2:315216/1‑150 (MQ=255) tttCGCGCCTTTTGTTTTTATGGGCCTTGCCCGTAAAACGATTTTTTATATCACGGGGAGCCTCTCAGAGGCGTTATTACCCAACTTGAGGAATTTATAATGGCTAAGAAAGTACAAGCCTATGTCAAGCTGCAGGTTGCAGCTGGTATg < 1:922630/150‑1 (MQ=255) tCGCGCCTTTTGTTTTTATGGGCCTTGCCCGTAAAACGATTTTTTATATCACGGGGAGCCTCTCAGAGGCGTTATTACCCAACTTGAGGAATTTATAATGGCTAAGAAAGTACAAGCCTATGTCAAGCTGCAGGTTGCAGCTGGTATGGc < 1:265945/150‑1 (MQ=255) tCGCGCCTTTTGTTTTTATGGGCCTTGCCCGTAAAACGATTTTTTATATCACGGGGAGCCTCTCAGAGGCGTTATTACCCAACTTGAGGAATTTATAATGGCTAAGAAAGTACAAGCCTATGTCAAGCTGCAGGTTGCAGCTGGTATGGc < 2:1226264/150‑1 (MQ=255) cgcCTTTTGTTTTTATGGGCCTTGCCCGTAAAACGATTTTTTATATCACGGGGAGCCTCTCAGAGGCGTTATTACCCAACTTGAGGAATTTATAATGGCTAAGAAAGTACAAGCCTATGTCAAGCTGCAGGTTGCAGCTGGTATGGCTAA < 2:627611‑M1/150‑1 (MQ=255) cgcCTTTTGTTTTTATGGGCCTTGCCCGTAAAACGATTTTTTATATCACGGGGAGCCTCTCAGAGGCGTTATTACCCAACTTGAGGAATTTATAATGGCTAAGAAAGTACAAGCCTATGTCAAGCTGCAGGTTGCAGCTGGTATGGCTAA > 1:325699‑M1/1‑150 (MQ=255) gcCTTTTGTTTTTATGGGCCTTGCCCGTAAAACGATTTTTTATATCACGGGGAGCCTCTCAGAGGCGTTATTACCCAACTTGAGGAATTTATAATGGCTAAGAAAGTAGAAGCCTATGTCAAGCTGCAGGTTGCAGCTGGTATGGCTAAC < 2:22143‑M1/150‑1 (MQ=255) ccTTTTGTTTTTATGGGCCTTGCCCGTAAAACGATTTTTTATATCACGGGGAGCCTCTCAGAGGCGTTATTACCCAACTTGAGGAATTTATAATGGCTAAGAAAGTACAAGCCTATGTCAAGCTGCAGGTTGCAGCTGGTATGGCTAACC < 2:1110001‑M1/150‑1 (MQ=255) ttttGTTTTTATGGGCCTTGCCCGTAAAACGATTTTTTATATCACGGGGAGCCTCTCAGAGGCGGTATTACCCAACTTGAGGAATTTATAATGGCTAAGAAAGTACAAGCCTATGTCAAGCTGCAGGTTGCAGCTGGTATGGCTAACCCg < 1:1418677/150‑1 (MQ=255) tGTTTTTATGGGCCTTGCCCGTAAAACGATTTTTTATATCACGGGGAGCCTCTCAGAGGCGTTATTACCCAACTTGAGGAATTTATAATGGCTAAGAAAGTACAAGCCTATGTCAAGCTGCAGGTTGCAGCTGGTATGGCTAACCCGAGt > 1:1120711/1‑150 (MQ=255) gTTTTTATGGGCCTTGCCCGTAAAACGATTTTTTATATCACGGGGAGCCTCTCAGAGGCGTTATTACCCAACTTGAGGAATTTATAATGGCTAAGAAAGTACAAGCCTATGTCAAGCTGCAGGTTGCAGCTGGTATGGCTAACCCGAGTc > 1:820464/1‑150 (MQ=255) gTTTTTATGGGCCTTGCCCGTAAAACGATTTTTTATATCACGGGGAGCCTCTCAGAGGCGTTATTACCCAACTTGAGGAATTTATAATGGCTAAGAAAGTACAAGCCTATGTCAAGCTGCAGGTTGCAGCTGGTATGGCTAACCCGAGTc < 1:762516/150‑1 (MQ=255) gTTTTTATGGGCCTTGCCCGTAAAACGATTTTTTATATCACGGGGAGCCTCTCAGAGGCGTTATTACCCAACTTGAGGAATTTATAATGGCTAAGAAAGTACAAGCCTATGTCAAGCTGCAGGTTGCAGCTGGTATGGCTAACCCGAGTc > 1:285687/1‑150 (MQ=255) gTTTTTATGGGCCTTGCCCGTAAAACGATTTTTTATATCACGGGGAGCCTCTCAGAGGCGTTATTACCCAACTTGAGGAATTTATAATGGCTAAGAAAGTACAAGCCTATGTCAAGCTGCAGGTTGCAGCTGGTATGGCTAACCCGAGTc < 1:994762/150‑1 (MQ=255) ttATGGGCCTTGCCCGTAAAACGATTTTTTATATCACGGGGAGCCTCTCATAGGCGTTATTACCCAACTTGAGTAATTTATAATGGCTAAGAAAGTACAAGCCTATGTCAAGCTGCAGGTTGCAGCTGGTATGGCTAACCCGAGTCCGcc < 2:1492923/150‑1 (MQ=255) ttATGGGCCTTGCCCGTAAAACGATTTTTTATATCACGGGGAGCCTCTCAGAGGCGTTATTACCCAACTTGAGGAATTTATAATGGCTAAGAAAGTACAAGCCTATGTCAAGCTGCAGGTTGCAGCTGGTATGGCTAACCCGAGTCCGcc < 1:942450/150‑1 (MQ=255) ttATGGGCCTTGCCCGTAAAACGATTTTTTATATCACGGGGAGCCTCTCAGAGGCGTTATTACCCAACTTGAGGAATTTATAATGGCTAAGAAAGTACAAGCCTATGTCAAGCTGCAGGTTGCAGCTGGTATGGCTAACCCGAGTCCGcc < 1:1285759/150‑1 (MQ=255) gggCCTTGCCCGTAAAACGATTTTTTATATCACGGGGAGCCTCTCAGAGGCGTTATTACCCAACTTGAGGAATTTATAATGGCTAAGAAAGTACAAGCCTATGTCAAGCTGCAGGTTGCAGCTGGTATGGCTAACCCGAGTCCGCCAGTa > 2:744429/1‑150 (MQ=255) gggCCTTGCCCGTAAAACGATTTTTTATATCACGGGGAGCCTCTCAGAGGCGTTATTACCCAACTTGAGGAATTTATAATGGCTAAGAAAGTACAAGCCTATGTCAAGCTGCAGGTTGCAGCTGGTATGGCTAACCCGAGTCCGCCAGTa < 2:1161055/150‑1 (MQ=255) ggCCTTGCCCGTAAAACGATTTTTTATATCACGGGGAGCCTCTCAGAGGCGTTATTACCCAACTTGAGGAATTTATAATGGCTAAGAAAGTACAAGCCTATGTCAAGCTGCAGGTTGCAGCTGGTATGGCTAACCCGAGTCCGCCAGTAg < 2:973982/150‑1 (MQ=255) ggCCTTGCCCGTAAAACGATTTTTTATATCACGGGGAGCCTCTCAGAGGCGTTATTACCCAACTTGAGGAATTTATAATGGCTAAGAAAGTACAAGCCTATGTCAAGCTGCAGGTTGCAGCTGGTATGGCTAACCCGAGTCCGCCAGTAg > 1:764976/1‑150 (MQ=255) ccTTGCCCGTAAAACGATTTTTTATATCACGGGGAGCCTCTCAGAGGCGTTATTACCCAACTTGAGGAATTTATAATGGCTAAGAAAGTACAAGCCTATGTCAAGCTGCAGGTTGCAGCTGGTATGGCTAACCCGAGTCCGCCAGTAGGt > 2:1139892/1‑150 (MQ=255) ttGCCCGTAAAACGATTTTTTATATCACGGGGAGCCTCTCAGAGGCGTTATTACCCAACTTGAGGAATTTATAATGGCTAAGAAAGTACAAGCCTATGTCAAGCTGCAGGTTGCAGCTGGTATGGCTAACCCGAGTCCGCCAGTAGGTcc < 1:389951/150‑1 (MQ=255) tGCCCGTAAAACGATTTTTTATATCACGGGGAGCCTCTCAGAGGCGTTATTACCCAACTTGAGGAATTTATAATGGCTAAGAAAGTACAAGCCTATGTCAAGCTGCAGGTTGCAGCTGGTATGGCTAACCCGAGTCCGCCAGTAGGTCCg < 2:1169743/150‑1 (MQ=255) tgcccgtaaCGATTTTTTATATCACGGGGAGCCTCTCAGAGGCGTTATTACCCAACTTGAGGAATTTATAATGGCTAAGAAAGTACAAGCCTATGTCAAGCTGCAGGTTGCAGCTGGTATGGCTAACCCGAGTCCGCCAGTAGGTCCGGc > 1:324555/8‑150 (MQ=255) cGTAAAACGATTTTTTATATCACGGGGAGCCTCTCAGAGGCGTTATTACCCAACTTGAGGAATTTATAATGGCTAAGAAAGTACAAGCCTATGTCAAGCTGCAGGTTGCAGCTGGTATGGCTAACCCGAGTCCGCCAGTAGGTCCGGctc > 1:1338385/1‑150 (MQ=255) aaaCGATTTTTTATATCACGGGGAGCCTCTCAGAGGCGTTATTACCCAACTTGAGGAATTTATAATGGCTAAGAAAGTACAAGCCTATGTCAAGCTGCAGGTTGCAGCTGGTATGGCTAACCCGAGTCCGCCAGTAGGTCCGGCTCTggg > 1:1015416‑M2/1‑147 (MQ=255) aTTTTTTATATCACGGGGAGCCTCTCAGAGGCGTTATTACCCAACTTGAGGAATTTATAATGGCTAAGAAAGTACAAGCCTATGTCAAGCTGCAGGGTGCAGCTGGTATGGCTAACCCGAGTCCGCCAGTAGGTCCGGCTCTGGGTcagc < 2:1446039/150‑1 (MQ=255) atCACGGGGAGCCTCTCAGAGGCGTTATTACCCAACTTGAGGAATTTATAATGGCTAAGAAAGTACAAGCCTATGTCAAGCTGCAGGTTGCAGCTGGTATGGCTAACCCGAGTCCGCCAGTAGGTCCGGCTCTGGGTCAGCAGGGCGTaa > 2:1334693/1‑150 (MQ=255) atCACGGGGAGCCTCTCAGAGGCGTTATTACCCAACTTGAGGAATTTATAATGGCTAAGAAAGTACAAGCCTATGTCAAGCTGCAGGTTGCAGCTGGTATGGCTAACCCGAGTCCGCCAGTAGGTCCGGCTCTGGGTCAGCAGGGCGTaa < 1:1410603/150‑1 (MQ=255) atCACGGGGAGCCTCTCAGAGGCGTTATTACCCAACTTGAGGAATTTATAATGGCTAAGAAAGTACAAGCCTATGTCAAGCTGCAGGTTGCAGCTGGTATGGCTAACCCGAGTCCGCCAGTAGGTCCGGCTCTGGGTCAGCAGGGCGTaa > 2:220739/1‑150 (MQ=255) cACGGGGAGCCTCTCAGAGGCGTTATTACCCAACTTGAGGAATTTATAATGGCTAAGAAAGTACAAGCCTATGTCAAGCTGCAGGTTGCAGCTGGTATGGCTAACCCGAGTCCGCCAGTAGGTCCGGCTCTGGGTCAGCAGGGCGTAAAc > 1:129369/1‑150 (MQ=255) aCGGGGAGCCTCTCAGAGGCGTTATTACCCAACTTGAGGAATTTATAATGGCTAAGAAAGTACAAGCCTATGTCAAGCTGCAGGTTGCAGCTGGTATGGCTAACCCGAGTCCGCCAGTAGGTCCGGCTCTGGGTCAGCCGGGCGTAAAca < 2:1022841/150‑1 (MQ=255) gggAGCCTCTCAGAGGCGTTATTACCCAACTTGAGGAATTTATAATGGCTAAGAAAGTACAAGCCTATGTCAAGCTGCAGGTTGCAGCTGGTATGGCTAACCCGAGTCCGCCAGTAGGTCCGGCTCTGGGTCAGCAGGGCGTAAAcatca > 1:1261945/1‑150 (MQ=255) ggAGCCTCTCAGAGGCGTTATTACCCAACTTGAGGAATTTATAATGGCTAAGAAAGTACAAGCCTATGTCAAGCTGCAGGTTGCAGCTGGTATGGCTAACCCGAGTCCGCCAGTAGGTCCGGCTCTGGGTCAGCAGGGCGTAAAcatcat < 2:324555/150‑1 (MQ=255) gAGCCTCTCAGAGGCGTTATTACCCAACTTGAGGAATTTATAATGGCTAAGAAAGTACAAGCCTATGTCAAGCTGCAGGTTGCAGCTGGTATGGCTAACCCGAGTCCGCCAGTAGGTCCGGCTCTGGGTCAGCAGGGCGTAAACATCATg < 1:236939/150‑1 (MQ=255) gAGCCTCTCAGAGGCGTTATTACCCAACTTGAGGAATTTATAATGGCTAAGAAAGTACAAGCCTATGTCAAGCTGCAGGTTGCAGCTGGTATGGCTAACCCGAGTCCGCCAGTAGGTCCGGCTCTGGGTCAGCAGGGCGTAAACATCATg > 2:278757/1‑150 (MQ=255) ccTCTCAGAGGCGTTATTACCCAACTTGAGGAATTTATAATGGCTAAGAAAGTACAAGCCTATGTCAAGCTGCAGGTTGCAGCTGGTATGGCTAACCCGAGTCCGCCAGTAGGTCCGGCTCTGGGTCAGCAGGGCGTAAACATCATGGaa > 2:841232/1‑150 (MQ=255) tctcAGAGGCGTTATTACCCAACTTGAGGAATTTATAATGGCTAAGAAAGTACAAGCCTATGTCAAGCTGCAGGTTGCAGCTGGTATGGCTAACCCGAGTCCGCCAGTAGGTCCGGCTCTGGGTTAGCAGTGCGTGAACATCATGGAAtt > 1:879045/1‑150 (MQ=255) ctcAGAGGCGTTATTACCCAACTTGAGGAATTTATAATGGCTAAGAAAGTACAAGCCTATGTCAAGCTGCAGGTTGCAGCTGGTATGGCTAACCCGAGTCCGCCAGTAGGTCCGGCTCTGGGTCAGCAGGGCGTAAACATCATGGAATTc > 2:788280/1‑150 (MQ=255) cAGAGGCGTTATTACCCAACTTGAGGAATTTATAATGGCTAAGAAAGTACAAGCCTATGTCAAGCTGCAGGTTGCAGCTGGTATGGCTAACCCagagccggacctactggcggactcgggttagccat > 1:120474‑M1/1‑93 (MQ=255) cAGAGGCGTTATTACCCAACTTGAGGAATTTATAATGGCTAAGAAAGTACAAGCCTATGTCAAGCTGCAGGTTGCAGCTGGTATGGCTAACCCagagccggacctactggcggactcgggttagccat < 2:120474‑M1/128‑36 (MQ=255) agagGCGTTATTACCCAACTTGAGGAATTTATAATGGCTAAGAAAGTACAAGCCTATGTCAAGCTGCAGGTTGCAGCTGGTATGGCTAACCCGAGTCCGCCAGTAGGTCCGGCTCTGGGTCAGCAGGGCGTAAACATCATGGAATTCTGc < 1:334082/150‑1 (MQ=255) agagGCGTTATTACCCAACTTGAGGAATTTATAATGGCTAAGAAAGTACAAGCCTATGTCAAGCTGCAGGTTGCAGCTGGTATGGCTAACCCGAGTCCGCCAGTAGGTCCGGCTCTGGGTCAGCAGGGCGTAAACATCATGGAATTCTGc > 2:120029/1‑150 (MQ=255) gagGCGTTATTACCCAACTTGAGGAATTTATAATGGCTAAGAAAGTACAAGCCTATGTCAAGCTGCAGGTTGCAGCTGGTATGGCTAACCCGAGTCCGCCAGTAGGTCCGGCTCTGGGTCAGCAGGGCGTAAACATCATGGAATTCTGCa < 1:568710/150‑1 (MQ=255) cccgCGTCATTACCCCACTTGAGGAATTTATAATGCCTAAGAAAGTACAAGCCTATGTCAACCTGCAGGTTGCAGCTGGTATGGCTAACCCGAGTCCGCCAGTAGGTCCGGCTCTGGGTCAGCAGGGCGTAAACATCATGGAATTCTGCa < 2:668198/147‑1 (MQ=255) agGCGTTATTACCCAACTTGAGGAATTTATAATGGCTAAGAAAGTACAAGCCTATGTCAAGCTGCAGGTTGCAGCTGGTATGGCTAACCCGAGTCCGCCAGTAGGTCCGGCTCTGGGTCAGCAGGGCGTAAACATCATGGAATTCTGCaa < 1:1360463/150‑1 (MQ=255) cGTTATTACCCAACTTGAGGAATTTATAATGGCTAAGAAAGTACAAGCCTATGTCAAGCTGCAGGTTGCAGCTGGTATGGCTAACCCGAGTCCGCCAGTAGGTCCGGCTCTGGGTCAGCAGGGCGTAAACATCATGGAATTCTGCAAAGc < 1:1092298/150‑1 (MQ=255) gTTATTACCCAACTTGAGGAATTTATAATGGCTAAGAAAGTACAAGCCTATGTCAAGCTGCAGGTTGCAGCTGGTATGGCTAACCCGAGTCCGCCAGTAGGTCCGGCTCTGGGTCAGCAGGGCGTAAACATCATGGAATTCTGCAAAGCg > 1:1529487/1‑150 (MQ=255) gTTATTACCCAACTTGAGGAATTTATAATGGCTAAGAAAGTACAAGCCTATGTCAAGCTGCAGGTTGCAGCTGGTATGGCTAACCCGAGTCCGCCAGTAGGTCCGGCTCTGGGTCAGCAGGGCGTAAACATCATGGAATTCTGCAAAGCg > 2:921191/1‑150 (MQ=255) ttattaCCCAACTTGAGGAATTTATAATGGCTAAGAAAGTACAAGCCTATGTCAAGCTGCAGGTTGCAGCTGGTATGGCTAACCCGAGTCCGCCAGTAGGTCCGGCTCTGGGTCAGCAGGGCGTAAACATCATGGAATTCTGCAAAGCGt > 1:1314018/1‑150 (MQ=255) attaCCCAACTTGAGGAATTTATAATGGCTAAGAAAGTACAAGCCTATGTCAAGCTGCAGGTTGCAGCTGGTATGGCTAACCCGAGTCCGCCAGTAGGTCCGGCTCTGGGTCAGCAGGGCGTAAACATTATGGAATTCTGCAAAGCGTTc > 2:859203/1‑150 (MQ=255) attaCCCAACTTGAGGAATTTATAATGGCTAAGAAAGTACAAGCCTATGTCAAGCTGCAGGTTGCAGCTGGTATGGCTAACCCGAGTCCGCCAGTAGGTCCGGCTCTGGGTCAGCAGGGCGTAAACATCATGGAATTCTGCAAAGCGTTc < 1:1334693/150‑1 (MQ=255) taCCCAACTTGAGGAATTTATAATGGCTAAGAAAGTACAAGCCTATGTCAAGCTGCAGGTTGCAGCTGGTATGGCTAACCCGAGTCCGCCAGTAGGTCCGGCTCTGGGTCAGCAGGGCGTAAACATCATGGAATTCTGCAAAGCGTTCaa < 1:152615/150‑1 (MQ=255) aCCCAACTTGAGGAATTTATAATGGCTAAGAAAGTACAAGCCTATGTCAAGCTGCAGGTTGCAGCTGGTATGGCTAACCCGAGTCCGCCAGTAGGTCCGGCTCTGGGTCAGCAGGGCGTAAACATCATGGAATTCTGCAAAGCGTTCAAc < 2:525042/150‑1 (MQ=255) aCCCAACTTGAGGAATTTATAATGGCTAAGAAAGTACAAGCCTATGTCAAGCTGCAGGTTGCAGCTGGTATGGCTAACCCGAGTCCGCCAGTAGGTCCGGCTCTGGGTCAGCAGGGCGTAAACATCATGGAATTCTGCAAAGCGTTCAAc > 2:823353/1‑150 (MQ=255) aCCCAACTTGAGGAATTTATAATGGCTAAGAAAGTACAAGCCTATGTCAAGCTGCAGGTTGAAGCTGGTATGGCTAACCCGACTCCGCCAGTAGGTCCGGCTCTGTGTCAGCAGGGCGTAAACATCAAGGAATTCTGCAAAGCGTTCAAc > 2:1021733/1‑150 (MQ=255) cccAACTTGAGGAATTTATAATGGCTAAGAAAGTACAAGCCTATGTCAAGCTGCAGGTTGCAGCTGGTATGGCTAACCCGAGTCCGCCAGTAGGTCCGGCTCTGGGTCAGCAGGGCGTAAACATCATGGAATTCTGCAAAGCGTTCAACg < 2:1534719/150‑1 (MQ=255) cccAACTTGAGGAATTTATAATGGCTAAGAAAGTACAAGCCTATGTCAAGCTGCAGGTTGCAGCTGGTATGGCTAACCCGAGTCCGCCAGTAGGTCCGGCTCTGGGTCAGCAGGGCGTAAACATCATGGAATTCTGCAAAGCGTTCAACg < 1:751920/150‑1 (MQ=255) cccAACTTGAGGAATTTATAATGGCTAAGAAAGTACAAGCCTATGTCAAGCTGCAGGTTGCAGCTGGTATGGCTAACCAGAGTCCGCCAGAACGTCCGGCTCTGGGTCAGCAGGGCGTAAACATCATGGAATTCTGCAAAGCGTTCAAcc > 2:1446177/1‑149 (MQ=255) cAACTTGAGGAATTTATAATGGCTAAGAAAGTACAAGCCTATGTCAAGCTGCAGGTTGCAGCTGGTATGGCTAACCCGAGTCCGCCAGTAGGTCCGGCTCTGGGTca < 2:751358/107‑1 (MQ=255) cAACTTGAGGAATTTATAATGGATAAGAAAGTACAAGCCTATGTCAAGCTGCAGGTTGCAGCTGGTATGGCTAACCCGAGTCCGCCAGTAGGTCCGGCTCTGGGTCAGCAGGGCGTAAACATCATGGAATTCTGCAAAGCGTTCAACGCa > 2:1375714/1‑150 (MQ=255) cTTGAGGAATTTATAATGGCTAAGAAAGTACAAGCCTATGTCAAGCTGCAGGTTGCAGCTGGTATGGCTAACCCGAGTCCGCCAGTAGGTCCGGCTCTGGGTCAGCAGGGCGTAAACATCATGGAATTCTGCAAAGCGTTCAACGCaaaa > 1:1375210/1‑150 (MQ=255) gAGGAATTTATAATGGCTAAGAAAGTACAAGCCTATGTCAAGCTGCAGGTTGCAGCTGGTATGGCTAACCCGAGTCCGCCAGTAGGTCCGGCTCTGGGTCAGCAGGGCGTAAACATCATGGAATTCTGCAAAGCGTTCAACGCAAAAACt > 1:73027/1‑150 (MQ=255) aaTTTATAATGGCTAAGAAAGTACAAGCCTATGTCAAGCTGCAGGTTGCAGCTGGTATGGCTAACCCGAGTCCGCCAGTAGGTCCGGCTCTGGGTCAGCAGGGCGTAAACATCATGGAATTCTGCAAAGCGTTCAACGCAAAAACTGAtt < 1:1153264/150‑1 (MQ=255) ttATAATGGCTAAGAAAGTACAAGCCTATGTCAAGCTGCAGGTTGCAGCTGGTATGGCTAACCCGAGTCCGCCAGTAGGTCCGGCTCTGGGTCAGCAGGGCGTAAACATCATGGAATTCTGCAAAGCGTTCAACGCAAAAACTGATTCCa < 2:1173815/150‑1 (MQ=255) tataATGGCTAAGAAAGTACAAGCCTATGTCAAGCTGCAGGTTGCAGCTGGTATGGCTAACCCGAGTCCGCCAGTAGGTCCGGCTCTGGGTCAGCAGGGCGTAAACATCATGGAATTCTGCAAAGCGTTCAACGCAAAAACTGATTCCAt > 1:153207/1‑150 (MQ=255) taATGGCTAAGAAAGTACAAGCCTATGTCAAGCTGCAGGTTGCAGCTGGTATGGCTAACCCGAGTCCGCCAGTAGGTCCGGCTCTGGGTCAGCAGGGCGTAAACATCATGGAATTCTGCAAAGCGTTCAACGCAAAAACTGATTCCATCg < 1:1397581/150‑1 (MQ=255) tAAGAAAGTACAAGCCTATGTCAAGCTGCAGGTTGCAGCTGGTATGGCTAACCCGAGTCCGCCAGTAGGTCCGGCTCTGGGTCAGCAGGGCGTAAACATCATGGAATTCTGCAAAGCGTTCAACGCAAAAACTGATTCCATCGAAAAAgg > 2:100775/1‑150 (MQ=255) aaGAAAGTACAAGCCTATGTCAAGCTGCAGGTTGCAGCTGGTATGGCTAACCCGAGTCCGCCAGTAGGTCCGGCTCTGGGTCAGCAGGGCGTAAACATCATGGAATTCTGCAAAGCGTTCAACGCAAAAACTGATTCCATCGAAAAAGGt > 2:575245/1‑150 (MQ=255) gAAAGTACAAGCCTATGTCAAGCTGCAGGTTGCAGCTGGTATGGCTAACCCGAGTCCGCCAGTAGGTCCGGCTCTGGGTCAGCAGGGCGTAAACATCATGGAATTCTGCAAAGCGTTCAACGCAAAAACTGATTCCATCGAAAAAGGTCt > 1:825424/1‑150 (MQ=255) aaGTACAAGCCTATGTCAAGCTGCAGGTTGCAGCTGGTATGGCTAACCCGAGTCCGCCAGTAGGTCCGGCTCTGGGTCAGCAGGGCGTAAACATCATGGAATTCTGCAAAGCGTTCAACGCAAAAACTGATTCCATCGAAAAAGGTCTGc < 1:575245/150‑1 (MQ=255) aGTACAAGCCTATGTCAAGCTGCAGGTTGCAGCTGGTATGGCTAACCCGAGTCCGCCAGTAGGTCCGGCTCTGGGTCAGCAGGGCGTAAACATCATGGAATTCTGCAAAGCGTTCAACGCAAAAACTGATTCCATCGAAAAAGGTCTGcc < 1:744429/150‑1 (MQ=255) gTACAAGCCTATGTCAAGCTGCAGGTTGCAGCTGGTATGGCTAACCCGAGTCCGCCAGTAGGTCCGGCTCTGGGTCAGCAGGGCGTAAACATCATGGAATTCTGCAAAGCGTTCAACGCAAAAACTGATTCCATCGAAAAAGGTCTGCCg > 2:219413/1‑150 (MQ=255) cAAGCCTATGTCAAGCTGCAGGTTGCAGCTGGTATGGCTAACCCGAGTCCGCTAGTAGGTCCGGCTCTGGGTCAGCAGGGCGTAAACATCATGGAATTCTGCAAAGCGTTCAACGCAAAAACTGATTCCATCGAAAAAGGTCTGCCGAtt < 1:315216/150‑1 (MQ=255) cAAGCCTATGTCAAGCTGCAGGTTGCAGCTGGTATGGCTAACCCGAGTCCGCCAGTAGGTCCGGCTCTGGGTCAGCAGGGCGTAAACATCATGGAATTCTGCAAAGCGTTCAACGCAAAAACTGATTCCATCGAAAAAGGTCTGCCGAtt > 1:378275/1‑150 (MQ=255) aGCCTATGTCAAGCTGCAGGTTGCAGCTGGTATGGCTAACCCGAGTCCGCCAGTAGGTCCGGCTCTGGGTCAGCAGGGCGTAAACATCATGGAATTCTGCAAAGCGTTCAACGCAAAAACTGATTCCATCGAAAAAGGTCTGCCGATTcc < 2:560498/150‑1 (MQ=255) aGCCTATGTCAAGCTGCAGGTTGCAGCTGGTATGGCTAACCCGAGTCCGCCAGTAGGTCCGGCTCTGGGTCAGCAGGGCGTAAACATCATGGAATTCTGCAAAGCGTTCAACGCAAAAACTGATTCCATCGAAAAAGGTCTGCCGATTcc < 2:1108105/150‑1 (MQ=255) ccTATGTCAAGCTGCAGGTTGCAGCTGGTATGGCTAACCCGAGTCCGCCAGTAGGTCCGGCTCTGGGTCAGCAGGGCGTAAACATCATGGAATTCTGCAAAGCGTTCAACGCAAAAACTGATTCCATCGAAAAAGGTCTGCCGATTCCgg < 2:1500724/150‑1 (MQ=255) cTATGTCAAGCTGCAGGTTGCAGCTGGTATGGCTAACCCGAGTCCGCCAGTAGGTCCGGCTCTGGGTCAGCAGGGCGTAAACATCATGGAATTCTGCAAAGCGTTCAACGCAAAAACTGATTCCATCGAAAAAGGTCTGCCGATTCCGgt > 1:1177447/1‑150 (MQ=255) cTATGTCAAGCTGCAGGTTGCAGCTGGTATGGCTAACCCGAGTCCGCCAGTAGGTCCGGCTCTGGGTCAGCAGGGCGTAAACATCATGGAATTCTGCAAAGCGTTCAACGCAAAAACTGATTCCATCGAAAAAGGTCTGCCGATTCCGgt < 2:1261945/150‑1 (MQ=255) cTATGTCAAGCTGCAGGTTGCAGCTGGTATGGCTAACCCGAGTCCGCCAGTAGGTCCGGCTCTGGGTCAGCAGGGCGTAAACATCATGGAATTCTGCAAAGCGTTCAACGCAAAAACTGATTCCATCGAAAAAGGTCTGCCGATTCCGgt < 1:1106772/150‑1 (MQ=255) cataccaGCTGCAACCTGCAGCTGGTATGGCTAACCCGAGTCCGCCAGTAGGTCCGGCTCTGGGTCAGCAGGGCGTAAACATCATGGAATTCTGCAAAGCGTTCAACGCAAAAACTGATTCCATCGAAAAAGGTCTGCCGATTCCGgtag > 1:1213010/7‑150 (MQ=255) ataccaGCTGCAACCTGCAGCTGGTATGGCTAACCCGAGTCCGCCAGTAGGTCCGGCTCTGGGTCAGCAGGGCGTAAACATCATGGAATTCTGCAAAGCGTTCAACGCAAAAACTGATTCCATCGAAAAAGGTCTGCCGAt < 2:1247734/136‑1 (MQ=255) gTCAAGCTGCAGGTTGCAGCTGGTATGGCTAACCCGAGTCCGCCAGTAGGTCCGGCTCTGGGTCAGCAGGGCGTAAACATCATGGAATTCTGCAAAGCGTTCAACGCAAAAACTGATTCCATCGAAAAAGGTCTGCCGATTCCGgtagta > 2:1524647/1‑150 (MQ=255) tCAAGCTGCAGGTTGCAGCTGGTATGGCTAACCCGAGTCCGCCAGTAGGTCCGGCTCTGGGTCAGCAGGGCGTAAACATCATGGAATTCTGCAAAGCGTTCAACGCAAAAACTGATTCCATCGAAAAAGGTCTGCCGATTCCGGTAGTaa < 1:1375714/150‑1 (MQ=255) cAAGCTGCAGGTTGCAGCTGGTATGGCTAACCCGAGTCCGCCAGTAGGTCCGGCTCTGGGTCAGCAGGGCGTAAACATCATGGAATTCTGCAAAGCGTTCAACGCAAAAACTGATTCCATCGAAAAAGGTCTGCCGATTCCGGTAGTAAt > 2:913379/1‑150 (MQ=255) gCTGCAGGTTGCAGCTGGTATGGCTAACCCGAGTCCGCCAGTAGGTCCGGCTCTGGGTCAGCAGGGCGTAAACATCATGGAATTCTGCAAAGCGTTCAACGCAAAAACTGATTCCATCGAAAAAGGTCTGCCGATTCCGGTAGTAATCAc > 2:866803/1‑150 (MQ=255) tGCAGGTTGCAGCTGGTATGGCTAACCCGAGTCCGCCAGTAGGTCCGGCTCTGGGTCAGCAGGGCGTAAACATCATGGAATTCTGCAAAGCGTTCAACGCAAAAACTGATTCCATCGAAAAAGGTCTGCCGATTCCGGTAGTAATCACCg > 2:732903/1‑150 (MQ=255) aGGTTGCAGCTTGTATGGCTAACCCGAGTCCGCCAGTAGGTCCGGCTCTGGGTCAGCAGGGCGTAAACATCATGGAATTCTGCAAAGCGTTCAACGCAAAAACTGATTCCATCGAAAAAGGTCTGCCGATTCCGGTAGTAATCACCGttt < 1:634955/150‑1 (MQ=255) | GATTGGAATACAATTTCGCGCCTTTTGTTTTTATGGGCCTTGCCCGTAAAACGATTTTTTATATCACGGGGAGCCTCTCAGAGGCGTTATTACCCAACTTGAGGAATTTATAATGGCTAAGAAAGTACAAGCCTATGTCAAGCTGCAGGTTGCAGCTGGTATGGCTAACCCGAGTCCGCCAGTAGGTCCGGCTCTGGGTCAGCAGGGCGTAAACATCATGGAATTCTGCAAAGCGTTCAACGCAAAAACTGATTCCATCGAAAAAGGTCTGCCGATTCCGGTAGTAATCACCGTTT > NC_000913/4178335‑4178630 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |