Predicted mutation | |||||||
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Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_000913 | 4,242,546 | 0 | G | A | 7.7% | 396.0 / 12.1 | 128 | intergenic (‑292/+80) | xylE/malG | D‑xylose:H(+) symporter/maltose ABC transporter membrane subunit MalG |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (54/64); new base A (5/5); total (59/69) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 130 total aligned reads displayed.
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aaaaaaaGGCGCTCCGTGGAGCGCCGAATAACAGTCACAAGTTGGGATAACGTAAGTTGAGGGTGCAGCGGCATAACATTGGCAGAACAACATCTTTAACCTTTCACACCACCTGCCGTCAGGCCGTTGACCAGCCAGCGTTGAGCCAGc > 1:412277/1‑150 (MQ=255) ttattcggCGCTCCACGGAGCGCCGAATAACAGTCACAAGTTGGGATAACGTAAGTTGAGGGTGCAGCGGCATAACATTGGCAGAACAACATCTTTAACCTTTCACACCACCTGCCGTCAGGCCGTTGACCAGCCAGCGTTGAGCCAGCa > 1:842608/7‑150 (MQ=255) aaaaaaGGCGCTCCGTGGAGCGCCGAATAACAGTCACAAGTTGGGATAACGTAAGTTGAGGGTGCAGCGGCATAACATTGGCAGAACAACATCTTTAACCTTTCACACCACCTGCCGTCAGGCCGTTGACCAGCCAGCGTTGAGCCAGCa < 2:1179805/150‑1 (MQ=255) tattcggCGCTCCACGGAGCGCCTAATAACAGTCACAAGTTGGGATAACGTAAGTTGAGGGTGCAGCGGCATAACATTGGCAGAACAACATCTTTAACCTTTCACACCACCTGCCGTCAGGCCGTTGACCAGCCAGCGTTGAGCCAGCaa > 1:156225/6‑150 (MQ=255) attcggCGCTCCACGGAGCGCCGAATAACAGTCACAAGTTGGGATAACGTAAGTTGAGGGTGCAGCGGCATAACATTGGCAGAACAACATCTTTAACCTTTCACACCACCTGCCGTCAGGCCGTTGACCAGCCAGCGTTGAGCCAGCaag < 2:842608/146‑1 (MQ=255) 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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |