| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 4,280,219 | A→C | 5.1% | E80D (GAA→GAC) | yjcE → | putative transporter YjcE |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 4,280,219 | 0 | A | C | 5.1% | 297.1 / 7.4 | 99 | E80D (GAA→GAC) | yjcE | putative transporter YjcE |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (48/46); new base C (2/3); total (50/49) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.78e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 4.31e-01 | |||||||||||
CGCTTATGCAAATCGCCATCGGTGCGCTACTGGCGTGGCCGACGTTTGGTTTGCATGTGGAGTTTGATCCTGAACTCTTTTTAGTCTTGTTTATCCCGCCGTTGCTGTTCGCTGATGGCTGGAAAACGCCGACCCGTGAATTTCTCGAACATGGTCGAGAGATTTTCGGCCTCGCGCTGGCGCTGGTGGTGGTCACCGTGGTCGGCATTGGCTTCCTTATTTACTGGGTGGTGCCGGGCATTCCGCTGATCCCTGCCTTTGCGCTGGCGGCGGTGCTTTCTCCGACCGATGCTGTGG > NC_000913/4280071‑4280367 | cgcttATGCAAATCGCCATCGGTGCGCTACTGGCGTGGCCGACGTTTGGTTTGCATGTGGAGTTTGATCCTGAACTCTTTTTAGTCTTGTTTATCCCGCCGTTGCTGTTCGCTGATGGCTGGAAAACGCCGACCCGTGAATTTCTCGAAc > 1:1050008/1‑150 (MQ=255) gcttATGCAAATCGCCATCGGTGCGCTACTGGCGTGGCCGACGTTTGGTTTGCATGTGGAGTTTGATCCTGAACTCTTTTTAGTCTTGTTTATCCCGCCGTTGCTGTTCGCTGATGGCTGGAAAACGCCGACCCGTGAATTTCTCGAACa < 2:465099/150‑1 (MQ=255) cttATGCAAATCGCCATCGGTGCGCTACTGGCGTGGCCGACGTTTGGTTTGCATGTGGAGTTTGATCCTGAACTCTTTTTAGTCTTGTTTATCCCGCCGTTGCTGTTCGCTGATGGCTGGAAAACGCCGACCCGTGAATTTCTCGAACAt < 1:682006/150‑1 (MQ=255) gCAAATCGCCCTCGGTGCGCTACTGGCGTGGCCGACGTTTGGTTTGCATGTGGAGTTTGATCCTGAACTCTTTTTAGTCTTGTTTATCCCGCCGTTGCTGTTCGCTGATGGCTGGAAAACGCCGACCCGTGAATTTCTCGAACATGGTCg < 1:1537394/150‑1 (MQ=255) cAAATCGCCATCGGTGCGCTACTGGCGTGGCCGACGTTTGGTTTGCATGTGGAGTTTGATCCTGAACTCTTTTTAGTCTTGTTTATCCCGCCGTTGCTGTTCGCTGATGGCTGGAAAACGCCGACCCGTGAATTTCTCGAACATGGTCga > 2:1249873/1‑150 (MQ=255) aaaTCGCCATCGGTGCGCTACTGGCGTGGCCGACGTTTGGTTTGCATGTGGAGTTTGATCCTGAACTCTTTTTAGTCTTGTTTATCCCGCCGTTGCTGTTCGCTGATGGCTGGAAAACGCCGACCCGTGAATTTCTCGACCATGTTCgag < 2:116691/150‑1 (MQ=255) aaaTCGCCATCGGTGCGCTACTGGCGTGGCCGACGTTTGGTTTGCATGTGGAGTTTGATCCTGAACTCTTTTTAGTCTTGTTTATCCCGCCGTTGCTGTTCGCTGATGGCTGGAAAACGCCGACCCGTGAATTTCTCGAACATGGTCgag < 1:625598/150‑1 (MQ=255) tCGCCATCGGTGCGCTACTGGCGTGGCCGACGTTTGGTTTGCATGTGGAGTTTGATCCTGAACTCTTTTTAGTCTTGTTTATCCCGCCGTTGCTGTTCGCTGATGGCTGGAAAACGCCGACCCGTGAATTTCTCGAACATGGTCgagaga < 1:510831/150‑1 (MQ=255) tCGCCATCGGTGCGCTACTGGCGTGGCCGACGTTTGGTTTGCATGTGGAGTTTGATCCTGAACTCTTTTTAGTCTTGTTTATCCCGCCGTTGCTGTTCGCTGATGGCTGGAAAACGCCGACCCGTGAATTTCTCGAACATGGTCgagaga < 1:396709/150‑1 (MQ=255) cGCCATCGGTGCGCTACTGGCGTGGCCGACGTTTGGTTTGCATGTGGAGTTTGATCCTGAACTCTTTTTAGTCTTGTTTATCCCGCCGTTGCTGTTCGCTGATGGCTGGAAAACGCCGACCCGTGAATTTCTCGAACATGGTCGAGAGAt > 2:1312989/1‑150 (MQ=255) ccATCGGTGCGCTACTGGCGTGGCCGACGTTTGGTTTGCATGTGGAGTTTGATCCTGAACTCTTTTTAGTCTTGTTTATCCCGCCGTTGCTGTTCGCTGATGGCTGGAAAACGCCGACCCGTGAATTTCTCGAACATGGTCGAGAGAttt > 1:557233/1‑150 (MQ=255) aTCGGTGCGCTACTGGCGTGGCCGACGTTTGGTTTGCATGTGGAGTTTGATCCTGAACTCTTTTTAGTCTTGTTTATCCCGCCGTTGCTGTTCGCTGATGGCTGGAAAACGCCGACCCGTGAATTTCTCGACCATGTTCGAGAAAttcac < 2:199671/150‑4 (MQ=255) tCGGTGCGCTACTGGCGTGGCCGACGTTTGGTTTGCATGTGGAGTTTGATCCTGAACTCTTTTTAGTCTTGTTTATCCCGCCGTTGCTGTTCGCTGATGGCTGGAAAACGCCGACCCGAAAATCTCTCGACCATGTTCGAGAAAttcacg < 1:521225/150‑5 (MQ=255) cGGTGCGCTACTGGCGTGGCCGACGTTTGGTTTGCATGTGGAGTTTGATCCTGAACTCTTTTTAGTCTTGTTTATCCCGCCGTTGCTGTTCGCTGATGGCTGGAAAACGCCGACCCGTGAATTTCTCGAACATGGTCGAGAGATTTTCgg > 1:739757/1‑150 (MQ=255) gcgcTACTGGCGTGGCCGACGTTTGGTTTGCATGTGGAGTTTGATCCTGAACTCTTTTTAGTCTTGTTTATCCCGCCGTTGCTGTTCGCTGATGGCTGGAAAACGCCGACCCGTGAATTTCTCGAACATGGTCGAGAGATTTTCGGCCTc > 2:445536/1‑150 (MQ=255) gcTACTGGCGTGGCCGACGTTTGGTTTGCATGTGGAGTTTGATCCTGAACTCTTTTTAGTCTTGTTTATCCCGCTGTTGCTGTTCGCTGATGGCTGGAAAACGCCGACCCGTGAATTTCTCGAACATGGTCGAGAGATTTTCGGCCTcgc > 2:800810/1‑150 (MQ=255) gcTACTGGCGTGGCCGACGTTTGGTTTGCATGTGGAGTTTGATCCTGAACTCTTTTTAGTCTTGTTTATCCCGCCGTTGCTGTTCGTTGATGGCTGGAAAACGCCGACCCGTGAATTTCTCGAACATGGTCGAGAGA‑TTTCGGCCTcgcg > 1:388012/1‑150 (MQ=255) tGGCGTGGCCGACGTTTGGTTTGCATGTGGAGTTTGATCCTGAACTCTTTTTAGTCTTGTTTATCCCGCCGTTGCTGTTCGCTGATGGCTGGAAAACGCCGACCCGTGAATTTCTCGAACATGGTCGAGAGATTTTCGGCCTCgcgctgg < 2:176772/150‑1 (MQ=255) ggCGTGGCCGACGTTTGGTTTGCATGTGGAGTTTGATCCTGAACTCTTTTTAGTCTTGTTTATCCCGCCGTTGCTGTTCGCTGATGGCTGGAAAACGCCGACCCGTGAATTTCTCGAACATGGTCGAGAGATTTTCGGCCTCgcgctggc > 2:1135051/1‑150 (MQ=255) cGTGGCCGACGTTTGGTTTGCATGTGGAGTTTGATCCTGAACTCTTTTTAGTCTTGTTTATCCCGCCGTTGCTGTTCGCTGATGGCTGGAAAACGCCGACCCGTGAATTTCTCGAACATGGTCGAGAGATTTTCGGCCTCgcgctggcgc < 2:114101/150‑1 (MQ=255) tGGCCGACGTTTGGTTTGCATGTGGAGTTTGATCCTGAACTCTTTTTAGTCTTGTTTATCCCGCCGTTGCTGTTCGCTGATGGCTGGAAAACGCCGACCCGTGAATTTCTCGAACATGGTCGAGAGATTTTCGGCCTCgcgctggcgctg > 2:637097/1‑150 (MQ=255) gCCGACGTTTGGTTTGCATGTGGAGTTTGATCCTGAACTCTTTTTAGTCTTGTTTATCACGCCGTTGCTGTTCGCTGATGGCTGGAAAACGCCGACCCGTGAATTTCTCGAACATGGTCGAGAGATTTTCGGCCTCGCGCTGGCGCtggt > 2:1275644/1‑150 (MQ=255) ccGACGTTTGGTTTGCATGTGGAGTTTGATCCTGAACTCTTTTTAGTCTTGTTTATCCCGCCGTTGCTGTTCGCTGATGGCTGGAAAACGCCGACCCGTGAATTTCTCGAACATGGTCGAGAGATTTTCGGCCTCGCGCTGGCGCtggtg > 2:1506051/1‑150 (MQ=255) cGACGTTTGGTTTGCATGTGGAGTTTGATCCTGAACTCTTTTTAGTCTTGTTTATCCCGCCGTTGCTGTTCGCTGATGGCTGGAAAACGCCGACCCGTGAATTTCTCGAACATGGTCGAGAGATTTTCGGCCTCGCGCTGGCGCtggtgg < 2:528352/150‑1 (MQ=255) cGACGTTTGGTTTGCATGTGGAGTTTGATCCTGAACTCTTTTTAGTCTTGTTTATCCCGCCGTTGCTGTTCGCTGATGGCTGGAAAACGCCGACCCGTGAATTTCTCGAACATGGTCGAGAGATTTTCGGCCTCGCGCTGGCGCtggtgg < 1:615658/150‑1 (MQ=255) aCGTTTGGTTTGCATGTGGAGTTTGATCCTGAACTCTTTTTAGTCTTGTTTATCCCGCCGTTGCTGTTCGCTGATGGCTGGAAAACGCCGACCCGTGAATTTCTCGAACATGGTCGAGAGATTTTCGGCCTCGCGCTGGCGCtggtggtg > 2:760428/1‑150 (MQ=255) cGTTTGGTTTGCATGTGGAGTTTGATCCTGAACTCTTTTTAGTCTTGTTTATCCCGCCGTTGCTGTTCGCTGATGGCTGGAAAACGCCGACCCGTGAATTTCTCGAACATGGTCGAGAGATTTTCGGCCTCGCGCTGGCGCtggtggtgg < 1:1152994/150‑1 (MQ=255) cGTTTGGTGTGCATGTGGAGTTTGATCCTGAACTCTTTTTAGTCTTGTTTATCCCGCCGTTGCTGTTCGCTGATGGCTGGAAAACGCCGACCCGTGAATTTCTCGAACATGGGCGAGAGATTTTCGGCCTCGCGCTGGCGCtggtggtgg < 2:806307/150‑1 (MQ=255) gtttggtttgCATGTGGAGTTTGATCCTGAACTCTTTTTAGTCTTGTTTATCCCGCCGTTGCTGTTCGCTGATGGCTGGAAAACGCCGACCCGTGAATTTCTCGAACATGGTCGAGAGATTTTCGTCCTCGCGCTGGCGCTggtggtggt > 2:710898/1‑150 (MQ=255) tggtttgCATGTGGAGTTTGATCCTGAACTCTTTTTAGTCTTGTTTATCCCGCCGTTGCTGTTCGCTGATGGCTGGAAAACGCCGACCCGTGAATTTCTCGAACATGGTCGAGAGATTTTCGGCCTCGCGCTGGCGCTGGTGGTGGTCAc < 1:1506051/150‑1 (MQ=255) ggtttgCATGTGGAGTTTGATCCTGAACTCTTTTTAGTCTTGTTTATCCCGCCGTTGCTGTTCGCTGATGGCTGGAAAACGCCGACCCGTGAATTTCTCGAACATGGTCGAGAGATTTTCGGCCTCGCGCTGGCGCTGGTGGTGGTCAcc > 2:1089506/1‑150 (MQ=255) ggtttgCATGTGGAGTTTGATCCTGAACTCTTTTTAGTCTTGTTTATCCCGCCGTTGCTGTTCGCTGATGGCTGGAAAACGCCGACCCGTGAATTTCTCGAACATGGTCGAGAGATTTTCGGCCTCGCGCTGGCGCTGGTGGTGGTCAcc < 1:414681/150‑1 (MQ=255) tttgCATCTGGAGTTTGATCCTGAAATCATTTTAGTCTTATTTATCCCGCCGTTGCTGTTCGCTGATGGCTGGAAAACGCCGACCCGTGAATTTCTCGAACATGGTCGAGAGATTTTAGGCCTCGCGCTGGCGCTGGTGGTGGTCACCGt > 2:1400843/1‑150 (MQ=255) tgCATGTGGAGTTTGATCCTGAACTCTTTTTAGTCTTGTTTATCCCGCCGTTGCTGTTCGCTGATGGCTGGAAAACGCCGACCCGTGAATTTCTCGAACATGGTCGAGAGATTTTCGGCCTCGCGCTGGCGCTGGTGGTGGTCACCGTgg < 2:1076794/150‑1 (MQ=255) gCATGTGGAGTTTGATCCTGAACTCTTTTTAGTCTTGTTTATCCCGCCGTTGCTGTTCGCTGATGGCTGGAAAACGCCGACCCGTGAATTTCTCGAACATGGTCGAGAGATTTTCGGCCTCGCGCTGGCGCTGGTGGTGGTCACCGTGGt > 2:708551/1‑150 (MQ=255) aTGTGGAGTTTGATCCTGAACTCTTTTTAGTCTTGTTTATCCCGCTGTTGCTGTTCGCTGATGGCTGGAAAACGCCGACCCGTGAATTTCTCGAACATGGTCGAGAGATTTTCGGCCTCGCGCTGGCGCTGGTGGTGGTCACCGTGGTCg < 1:800810/150‑1 (MQ=255) ggAGTTTGATCCTGAACTCTTTTTAGTCTTGTTTATCCCGCCGTTGCTGTTCGCTGATGGCTGGAAAACGCCGACCCGTGAATTTCTCGAACATGGTCGAGAGATTTTCGGCCTCGCGCTGGCGCTGGTGGTGGTCACCGTGGTCGGCAt > 1:621656/1‑150 (MQ=255) ggAGTTTGATCCTGAACTCTTTTTAGTCTTGTTTATCCCGCCGTTGCTGTTCGCTGATGGCTGGAAAACGCCGACCCGTGAATTTCTCGAACATGGTCGAGAGATTTTCGGCCTCGCGCTGGCGCTGGTGGTGGTCACCGTGGTCGGCAt > 1:464081/1‑150 (MQ=255) aGTTTGATCCTGAACTCTTTTTAGTCTTGTTTATCCCGCCGTTGCTGTTCGTTGATGGCTGGAAAACGCCGACCCGTGAATTTCTCGAACATGGTCGAGAGA‑TTTCGGCCTCGCGCTGGCGCTGGTGGTGGTCACCGTGGTCGGCATTgg < 2:388012/150‑1 (MQ=255) aGTTTGATCCGTACCTCTTTTTTGTCTTGTTTATTCCTCCGTTGCTGTTCGCTGATTGCTGTAAAACGCCGACCCGTGAATTTCTCGAAAATTTTCTAGATATTTTCGTCCTCGCGCTGGCGCTGGTGGTGGTCACCGTGGTCGGCATTg < 2:1395059/150‑1 (MQ=255) gTTTGATCCTGAACTCTTTTTAGTCTTGTTTATCCCGCCGTTGCTGTTCGCTGATGGCTGGAAAACGCCGACCCGTGAATTTCTCGAACATTGTCTAGAGATTTTCGGCCTCGTGCTGTCGCTGTTGGTGGTGACCTTGGTCGGGATTgg < 2:373591/150‑1 (MQ=255) gTTTGATCCTGAACTCTTTTTAGTCTTGTTTATCCCGCCGTTGCTGTTCGCTGATGGCTGGAAAACGCCGACCCGTGAATTTCTCGAACATGGTCGAGAGATTTTCGGCCTCGCGCTGGCGCTGGTGGTGGTCACCGTGGTCGGCATTgg > 1:678288/1‑150 (MQ=255) gTTTGATCCTGAACTCTTTTTAGTCTTGTTTATCCCGCCGTTGCTGTTCGCTGATGGCTGGAAAACGCCGACCCGTGAATTTCTCGAACATGGTCGAGAGATTTTCGGCCTCGCGCTGGCGCTGGTGGTGGTCACCGTGGTCGGCATTgg > 1:268530/1‑150 (MQ=255) ttGATCCTGAACTCTTTTTAGTCTTGTTTATCCCGCCGTTGCTGTTCGCTGATGGCTGGAAAACGCCGACCCGTGAATTTCTCGAACATGGTCGAGAGATTTTCGGCCTCGCGCTGGCGCTGGTGGTGGTCACCGTGGTCGGCATTGGCt > 1:458117/1‑150 (MQ=255) ttGATCCTGAACTCTTTTTAGTCTTGTTTATCCCGCCGTTGCTGTTCGCTGATGGCTGGAAAACGCCGACCCGTGAATTTCTCGAACATGGTCGAGAGATTTTCGGCCTCGCGCTGGCGCTGGTGGTGGTCACCGTGGTCGGCATTGGCt < 1:546789/150‑1 (MQ=255) ccTGAACTCTTTTTAGTCTTGTTTATCCCGCCGTTGCTGTTCGCTGATGGCTGGAAAACGCCGACCCGTGAATTTCTCGAACATGGTCGAGAGATTTTCGGCCTCGCGCTGGCGCTGGTGGTGGTCACCGTGGTCGGCATTGGCTTCCtt < 1:637097/150‑1 (MQ=255) cTGAACTCTTTTTAGTCTTGTTTATCCCGCCGTTGCTGTTCGCTGATGGCTGGAAAACGCCGACCCGTGAATTTCTCGAACATGGTCGAGAGATTTTCGGCCTCGCGCTGGCGCTGGTGGTGGTCACCGTGGTCGGCATTGGCTTCCTTa > 1:588424/1‑150 (MQ=255) aaCTCTTTTTAGTCTTGTTTATCCCGCCGTTGCTGTTCGCTGATGGCTGGAAAACGCCGACCCGTGAATTTCTCGAACATGGTCGAGAGATTTTCGGCCTCGCGCTGGCGCTGGTGGTGGTCACCGTGGTc < 2:1190976/131‑1 (MQ=255) aaCTCTTTTTAGTCTTGTTTATCCCGCCGTTGCTGTTCGCTGATGGCTGGAAAACGCCGACCCGTGAATTTCTCGAACATGGTCGAGAGATTTTCGGCCTCGCGCTGGCGCTGGTGGTGGTCACCGTGGTc > 1:1190976/1‑131 (MQ=255) aaCTCTTTTTAGTCTTGTTTATCCCGCCGTTGCTGTTCGCTGATGGCTGGAAAACGCCGACCCGTGAATTTCTCGAACATGGTCGAGAGATTTTCGGCCTCGCGCTGGCGCTGGTGGTGGTCACCGTGGTCGGCATTGGCTTCCTTAttt < 2:866312/150‑1 (MQ=255) aCTCTTTTTAGTCTTGTTTATCCCGCCGTTGCTGTTCGCTGATCGCTGGAAAACGCCGACCCGTGAGTTTCTCGAACATGCTCGAGAGATTTTCGGCCTCGCGCTGGCGCTGGTGGTGGTCACCGTGGTCGGCATTGGCTTCCTTATTTa > 1:1129476/1‑150 (MQ=255) gTCTTGTTTATCCCGCCGTTGCTGTTCGCTGATGGCTGGAAAACGCCGACCCGTGAATTTCTCGAACATGGTCGAGAGATTTTCGGCCTCGCGCTGGCGCTGGTGGTGGTCACCGTGGTCGGCATTGGCTTCCTTATTTACTGGgtggtg < 2:464081/150‑1 (MQ=255) tGTTTATCCCGCCGTTGCTGTTCGCTGATGGCTGGAAAACGCCGACCCGTGAATTTCTCGAACATGGTCGAGAGATTTTCGGCCTCGCGCTGGCGCTGGTGGTGGTCACCGTGGTCGGCATTGGATTCCTTATTTACTGGGTGGTGCCgg > 2:1007419/1‑150 (MQ=255) gTTTATCCCGCCGTTGCTGTTCGCTGATGGCTGGAAAACGCCGACCCGTGAATTTCTCGAACATGGTCGAGAGATTTTCGGCCTCGCGCTGGCGCTGGTGGTGGTCACCGTGGTCGGCATTGGCTTCCTTATTTACTGGGTGGTGCCggg < 2:173677/150‑1 (MQ=255) gTTTATCCCGCCGTTGCTGTTCGCTGATGGCTGGAAAACGCCGACCCGTGAATTTCTCGAACATGGTCGAGAGATTTTCGGCCTCGCGCTGGCGCTGGTGGTGGTCACCGTGGTCGGCATTGGCTTCCTTATTTACTGGGTGGTGCCggg < 1:484204/150‑1 (MQ=255) gTTTATCCCGCCGTTGCTGTTCGCTGATGGCTGGAAAACGCCGACCCGTGAATTTCTCGAACATGGTCGAGAGATTTTCGGCCTCGCGCTGGCGCTGGTGGTGGTCACCGTGGTCGGCATTGGCTTCCTTATTTACTGGGTGGTGCCggg < 1:1364042/150‑1 (MQ=255) tttATCCCGCCGTTGCTGTTCGCTGATGGCTGGAAAACGCCGACCCGTGAATTTCTCGAACATGGTCGAGAGATTTTCGGCCTCGCGCTGGCGCTGGTGGTGGTCACCGTGGTCGGCATTGGCTTCCTTATTTACTGGGTGGGGCCGGGc < 2:1286122/150‑1 (MQ=255) ttATCCCGCCGTTGCTGTTCGCTGATGGCTGGAAAACGCCGACCCGTGAATTTCTCGAACATGGTCGAGAGATTTTCGGCCTCGCGCTGGCGCTGGTGGTGGTCACCGTGGTCGGCATTGGCTTCCTTATTTACTGGGTGGTGCCGGGCa < 1:1523212/150‑1 (MQ=255) tATCCCGCCGTTGCTGTTCGCTGATGGCTGGAAAACGCCGACCCGTGAATTTCTCGAACATGGTCGAGAGATTTTCGGCCTCGCGCTGGCGCTGGTGGTGGTCACCGTGGTCGGCATTGGCTTCCTTATTTACTGGGTGGTGCCGGGCAt > 2:967371/1‑150 (MQ=255) aTCCCGCCGTTGCTGTTCGCTGATGGCTGGAAAACGCCGACCCGTGAATTTCTCGAACATGGTCGAGAGATTTTCGGCCTCGCGCTGGCGCTGGTGGTGGTCACCGTGGTCGGCATTGGCTTCCTTATTTACTGGGTGGTGCCGGGCAtt > 2:188822/1‑150 (MQ=255) cgccgTTGCTGTTCGCTGATGGCTGGAAAACGCCGACCCGTGAATTTCTCGAACATGGTCGAGAGATTTTCGGCCTCGCGCTGGCGTTGTTTGTTGTCTCCGTGGTCGTCATTGTGTTACTTATTTACTGTGTGGTGCCGTGCATTCCGc < 2:1050008/150‑1 (MQ=255) gccgTTGCTGTTCGCTGATGGCTGGAAAACGCCGACCCGTGAATTTCTCGAACATGGTCGAGAGATTTTCGGCCTCGCGCTGGCGCTGGTGGTGGTCACCGTGGTCGGCATTGGCTTCCTTATTTACTGGGTGGTGCCGGGCATTCCGCt > 2:734004/1‑150 (MQ=255) gccgTTGCTGTTCGCTGATGGCTGGAAAACGCCGACCCGGGAATTTCTCGAACCTGGTCGAGAGATTTTCGGCCTCGCGCTGGCGCTGGTGGGGGGCACCGTGGTCGGCATTGGCTTCCTTATTTACTGGGTGGTGCCGGGCATTCCGCt < 1:1249873/150‑1 (MQ=255) gCTGTTCGCTGATGGCTGGAAAACGCCGACCCGTGAATTTCTCGAACATGGTCGAGAGATTTTCGGCCTCGCGCTGGCGCTGGTGGTGGTCACCGTGGTCGGCATTGGCTTCCTTATTTACTGGGTGGTGCCGGGCATTCCGCTGATccc > 1:1017010/1‑150 (MQ=255) 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cTGATGGCTGGAAAACGCCGACCCGTGAATTTCTCGAACATGGTCGAGAGATTTTCGGCCTCGCGCTGGCGCTGGTGGTGGTCACCGTGGTCGGCATTGGCTTCCTTATTTACTGGGTGGTGCCGGGCATTCCGCTGATCCCTGCCTTTg > 2:1046650/1‑150 (MQ=255) cTGATGGCTGGAAAACGCCGACCCGTGAATTTCTCGAACATGGTCGAGAGATTTTCGGCCTCGCGCTGGCGCTGGTGGTGGTCACCGTGGTCGGCATTGGCTTCCTTATTTACTGGGTGGTGCCGGGCATTCCGCTGATCCCTGCCTTTg > 2:1041318/1‑150 (MQ=255) gCTGGAAAACGCCGACCCGTGAATTTCTCGAACATGGTCGAGAGATTTTCGGCCTCGCGCTGGCGCTGGTGGTGGTCACCGTGGTCGGCATTGGCTTCCTTATTTACTGGGTGGTGCCGGGCATTCCGCTGATCCCTGCCTTTGCGCTgg > 2:540480/1‑150 (MQ=255) gCTGGAAAACGCCGACCCGTGAATTTCTCGAACATGGTCGAGAGATTTTCGGCCTCGCGCTGGCGCTGGTGGTGGTCACCGTGGTCGGCATTGGCTTCCTTATTTACTGGGTGGTGCCGGGCATTCCGCTGATCCCTGCCTTTGCGCTgg > 1:1022144/1‑150 (MQ=255) gCTGGAAAACGCCGACCCGTGAATTTCTCGAACATGGTCGAGAGATTTTCGGCCTCGCGCTGGCGCTGGTGGTGGTCACCGTGGTCGGCATTGGCTTCCTTATTTACTGGGTGGTGCCGGGCATTCCGCTGATCCCTGCCTTTGCGCTgg < 2:1118128/150‑1 (MQ=255) 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tGGAAAACGCCGACCCGTGAATTTCTCGAACATGGTCGAGAGATTTTCGGCCTCGCGCTGGCGCTGGTGGTGGTCACCGTGGTCGGCATTGGCTTCCTTATTTACTGGGTGGTGCCGGGCATTCCGCTGATCCCTGCCTTTGCGCTggcg < 2:108835/150‑1 (MQ=255) ggAAAACGCCGACCCGTGAATTTCTCGAACATGGTCGAGAGATTTTCGGCCTCGCGCTGGCGCTGGTGGTGGTCACCGTGGTCGGCATTGGCTTCCTTATTTACTGGGTGGTGCCGGGCATTCCGCTGATCCCTGCCTTTGTGCTggcgg > 1:994634/1‑150 (MQ=255) ggAAAACGCCGACCCGTGAATTTCTCGAACATGGTCGAGAGATTTTCGGCCTCGCGCTGGCGCTGGTGGTGGTCACCGTGGTCGGCATTGGCTTCCTTATTTACTGGGTGGTGCCGGGCATTCCGCTGATCCCTGCCTTTGCGCTggcgg > 2:1107458/1‑150 (MQ=255) aaCGCCGACCCGTGAATTTCTCGAACATGGTCGAGAGATTTTCGGCCTCGCGCTGGCGCTGGTGGTGGTCACCGTGGTCGGCAATGGCTTCCTTATTTACTGGGTGGTGCCGGGCATTCCGCTGATCCCTGCCTTTGCGCTGGCGGCGGt > 2:948843/1‑150 (MQ=255) aCGCCGACCCGTGAATTTCTCGAACATGGTCGAGAGATTTTCGGCCTCGCGCTGGCGCTGGTGGTGGTCACCGTGGTCGGCATTGGCTTCCTTATTTACTGGGTGGTGCCGGGCATTCCGTTGATCCCTGCCTTTGCGCTGGCGGCGGTg < 1:227758/150‑1 (MQ=255) 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atctctcGACCATGTTCGAGAGATTTTCGGCCTCGCGCTGGCGCTGGTGGTGGTCACCGTGGTCGGCATTGGCTTCCTTATTTACTGGGTGGTGCCGGGCATTCCGCTGATCCCTGCCTTTGCGCTGGCGGCGGTGCTTTCTccgaccga > 1:722544/4‑150 (MQ=255) tctcGAACATGGTCGAGAGATTTTCGGCCTCGCGCTGGCGCTGGTGGTGGTCACCGTGGTCGGCATTGGCTTCCTTATTTACTGGGTGGTGCCGGGCATTCCGCTGATCCCTGCCTTTGCGCTGGCGGCGGTGCTTTCTCCGACCGATGc < 1:1089506/150‑1 (MQ=255) tcGAACATGGTCGAGAGATTTTCGGCCTCGCGCTGGCGCTGGTGGTGGTCACCGTGGTCGGCATTGGCTTCCTTATTTACTGGGTGGTGCCGGGCATTCCGCTGATCCCTGCCTTTGCGCTGGCGGCGGTGCTTTCTCCGACCGATGCtg < 2:1017010/150‑1 (MQ=255) cGAACATGGTCGAGAGATTTTCGGCCTCGCGCTGGCGCTGGTGGTGGTCACCGTGGTCGGCATTGGCTTCCTTATTTACTGGGTGGTGCCGGGCATTCCGCTGATCCCTGCCTTTGCGCTGGCGGCGGTGCTTTCTCCGACCGATGCtgt < 2:1242778/150‑1 (MQ=255) gAACATCGTCGAGAGATTTTCGGCCTCGCGCTGGCGCTGGAGGTGGTCACCGTCGTCGGAATTGGCTTCCTTATTTACTGGGTGGTGCCGGGCATTCCGCTGATCCCTGCCTTTGCGCTGGCGGCGGTGCTTTCTCCGACCGATGCtgtg > 2:1134856/1‑150 (MQ=255) aaCATGGTCGAGAGATTTTCGGCCTCGCGCTGGCGCTGGTGGTGGTCACCGTGGTCGGCATTGGCTTCCTTATTTACTGGGTGGTGCCGGGCATTCCGCTGATCCCTGCCTTTGCGCTGGCGGCGGTGCTTTCTCCGACCGATGCTGTgg < 2:1022144/150‑1 (MQ=255) | CGCTTATGCAAATCGCCATCGGTGCGCTACTGGCGTGGCCGACGTTTGGTTTGCATGTGGAGTTTGATCCTGAACTCTTTTTAGTCTTGTTTATCCCGCCGTTGCTGTTCGCTGATGGCTGGAAAACGCCGACCCGTGAATTTCTCGAACATGGTCGAGAGATTTTCGGCCTCGCGCTGGCGCTGGTGGTGGTCACCGTGGTCGGCATTGGCTTCCTTATTTACTGGGTGGTGCCGGGCATTCCGCTGATCCCTGCCTTTGCGCTGGCGGCGGTGCTTTCTCCGACCGATGCTGTGG > NC_000913/4280071‑4280367 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |