| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 4,332,531 | G→T | 6.5% | Q248K (CAG→AAG) ‡ | basS ← | sensory histidine kinase BasS |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 4,332,531 | 0 | G | T | 6.5% | 311.6 / 8.3 | 92 | Q248K (CAG→AAG) ‡ | basS | sensory histidine kinase BasS |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (43/43); new base T (3/3); total (46/46) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 6.45e-01 | |||||||||||
CCTGGTCCTTCATCTTCAACTGCCATGACCGCTCCGTCATCTTCTTGCAGCTTAATCATAATGTTGCTGCCTTGCGGGCTGTAACGATGGGCGTTTTCTACCAGGTTTCGCAATAACATCCGCAGCAGGGTTGCATCACCCTGAACGGTGATGTCGGCGGCGCTCTCTGGCAATAGCAGGGTTTGCTGTCGCTGGTCGAGCATGGTACTGAGTTCGTCATACGAGGGGAGAATGACATCTTCCAGCAGTTTTACATGTTGATAATTACCGGAAGAAAATGACTGTCCGG > NC_000913/4332389‑4332677 | ccTTGTCCTTCATCTTCAAGTGCCATGTCCGCTGCGTCATCTTCTTGCAGGTTAATCTTATTGTTGCTGCCTTGTGGGCTGTATCGATGGGTGTTTTCTAGCAGGTTTCGCAATTACATCCGCAGCAGGGTTGCATCACCCTGAACGGTg < 2:1114471/150‑1 (MQ=255)ccTGGTCCTTCATCTTCAACTGCCATGACCGCTCCGTCATCTTCTTGCAGCTTAATCATAATGTTGCTGCCTTGCGGGCTGTAACGATGGGCGTTTTCTACCAGGTTTCGCAATAACATCCGCAGCAGGGTTGCATCACCCTGAACGGTg > 1:448859/1‑150 (MQ=255) cTGGTCCTTCATCTTCAACTGCCATGACCGCTCCGTCATCTTCTTGCAGCTTAATCATAATGTTGCTGCCTTGCGGGCTGTAACGATGGGCGTTTTCTACCAGGTTTCGCAATAACATCCGCAGCAGGGTTGCATCACCCTGAACGGTGa < 1:554294/150‑1 (MQ=255) cTGGTCCTTCATCTTCAACTGCCATGACCGCTCCGTCATCTTCTTGCAGCTTAATCATAATGTTGCTGCCTTGCGGGCTGTAACGATGGGCGTTTTCTACCAGGTTTCGCAATAACATCCGCAGCAGGGTTGCATCACCCTGAACGGTGa < 1:433420/150‑1 (MQ=255) tGGTCCTTCATCTTCAACTGCCATGACCGCTCCGTCATCTTCTTGCAGCTTAATCATAATGTTGCTGCCTTGCGGGCTGTAACGATGGGCGTTTTCTACCAGGTTTCGCAATAACATCCGCAGCAGGGTTGCATCACCCTGAACGGTGAt < 1:919641/150‑1 (MQ=255) ggTCCTTCATCTTCAACTGCCATGACCGCTCCGTAATCTTCTTGCAGCTTAATCATAATTTTGCTGCCTTGCGGGATGTAACGATGGGCTTTTTCTACCAGGTTTCGGAATTACATCCCCAGCATGGTTGCATCACCCTGAACTGTGATg < 1:162480/150‑1 (MQ=255) tCCTTCATCTGCAACTGCCATGACCGCTCCGTCATCTTCTTGCAGCTTAATCATAATGTTGCTGCCTTGCGGGCGGTAACGATGGGCGTTTTCTACCAGGTTTCGCAATAACATCCGCAGCAGGGTTGCATCACCGTTCAGGGTGATgca < 1:1196548/150‑3 (MQ=255) cTTCATCTTCAACTGCCATGACCGCTCCGTCATCTTCTTGCAGCTTAATCATAATGTTGCTGCCTTGCGGGCTGTAACGATGGGCGTTTTCTACCAGGTTTCGCAATAACATCCGCAGCAGGGTTGCATCACCGTTCAGGGTGATgcaac < 1:272973/150‑5 (MQ=255) ttCATCTTCAACTGCCATGACCGCTCCGTCATCTTCTTGCAGCTTAATCATAATGTTGCTGCCTTGCGGGCTGTAACGATGGGCGTTTTCTACCAGGTTTCGCAATAACATCCGCAGCAGGGTTGCATCACCGTTCAGGGTGATgcaacc < 2:308337/150‑6 (MQ=255) tCTTCAACTGCCATGCCCGCTCCGTCATCTTCTTGCAGCTTAATCATAATGTTGCTGCCTTGCGGGCTGTAACGATGGGCGTTTTCTACCAGGTTTCGCAATAACATCCGCAGCAGGGTTGCATCACCCTGAACGGTGATGTCGgcggcg > 2:479821/1‑150 (MQ=255) tCAACTGCCATGACCGCTCCGTCATCTTCTTGCAGCTTAATCATAATGTTGCTGCCTTGCGGGCTGTAACGATGGGCGTTTTCTACCAGGTTTCGCAATAACATCCGCAGCAGGGTTGCATCACCCTGAACGGTGATGTCGGCGGCGctc > 1:904788/1‑150 (MQ=255) cAACTCCCATGACCACTAAATCATCTTCTTGCAGCTTAAACACAAACTTGCTGCCTTGACAAAAATAAACATCCCCGTTTACTACAATGTTAAGAAATAACATCCGCAGCAGGGTTGCATCACCCTGAACGGTGATGTCCGCGTCGctca > 2:1396484/1‑149 (MQ=255) aaCTGCCATGACCGCTCCGTCATCTTCTTGCAGCTTAATCATAATGTTGCTGCCTTGCGGGCTGTAACGATGGGCGTTTTCTACCAGGTTTCGCAATAACATCCGCAGCAGGGTTGCATCACCCTGAACGGTGATGTCGGCGGCGctctc < 1:1491693/150‑1 (MQ=255) aaCTGCCATGACCGCTCCGTCATCTTCTTGCAGCTTAATCATAAAGTTGCTGCCTTGCGGGCTGTAACGATGGGCGTTTTCTACCAGGTTTCGCAATAACATCCGCAGCAGGGTTGCATCACCCTGAACGGTGATGTCGGCGGCGctctc > 1:1308275/1‑150 (MQ=255) aCTGCCATGACCGCTCCGTCATCTTCTTGCAGCTTAATCATAATGTTGCTGCCTTGCGGGCTGTAACGATGGGCGTTTTCTACCAGGTTTCGCAATAACATCCGCAGCAGGGTTGCATCACCCTGAACGGTGATGTCGGCGGCGctctct > 2:1165615/1‑150 (MQ=255) cTGCCATGACCGCTCCGTCATCTTCTTGCAGCTTAATCATAATGTTGCTGCCTTGCGGGCTGTAACGATGGGCGTTTTCTACCAGGTTTCGCAATAACATCCGCAGCAGGGTTGCATCACCCTGAACGGTGATGTCGGCGGCGCTCTCTg < 2:904788/150‑1 (MQ=255) cTGCCATGACCGCTCCGTCATCTTCTTGCAGCTTAATCATAATGTTGCTGCCTTGCGGGCTGTAACGATGGGCGTTTTCTACCAGGTTTCGCAATAACATCCGCAGCAGGGTTGCATCACCCTGAACGGTGATGTCGGCGGCGCTCTCTg > 1:1144341/1‑150 (MQ=255) gCCATGACCGCTCCGTCATCTTCTTGCAGCTTAATCATAATGTTGCTGCCTTGCGGGCTGTAACGATGGGCGTTTTCTACCAGGTTTCGCAATAACATCCGCAGCAGGGTTGCATCACCCTGAACGGTGATGTCGGCGGCGCTCTCTGGc < 1:661357/150‑1 (MQ=255) gCCATGACCGCTCCGTCATCTTCTTGCAGCTTAATCATAATGTTGCTGCCTTGCGGGCTGTAACGATGGGCGTTTTCTACCAGGTTTCGCAATAACATCCGCAGCAGGGTTGCATCACCCTGAACGGTGATGTCGGCGGCGCTCTCTGGc > 1:815146/1‑150 (MQ=255) gCCATGACCGCTCCGTCATCTTCTTGCAGCTTAATCATAATGTTGCTGCCTTGCGGGCTGTAACGATGGGCGTTTTCTACCAGGTTTCGCAATAACATCCGCAGCAGGGTTGCATCACCCTGAACGGTGATGTCGGCGGCGCTCTCTGGc < 2:1171985/150‑1 (MQ=255) gCCATGACCGCTCCGTCATCTTCATGCAGCTTAATCATAATGTTGCTGCCTTGCGGGCTGTAACGATGGGCGTTTTCTCCCAGGTTTCGCAATAACATCCGCAGCAGGGTTGCATCACCCTGAACGGTGATGTCGGCGGCGCTCTCTGGc < 2:1449164/150‑1 (MQ=255) tGACCGCTCCGTCATCTTCTTGCAGCTTAATCATAATGTTGCTGCCTTGCGGGCTGTAACGATGGGCGTTTTCTACCAGGTTTCGCAATAACATCCGCAGCAGGGTTGCATCACCCTGAACGGTGATGTCGGCGGCGCTCTCTGGCAATa < 1:1147468/150‑1 (MQ=255) ccGCTCCGTCATCTTCTTGCAGCTTAATCATAATGTTGCTGCCTTGCGGGCTGTAACGATGGGCGTTTTCTACCAGGTTTCGCAATAACATCCGCAGCAGGGTTGCATCACCCTGAACGGTGATGTCGGCGGCGCTCTCTGGCAATAGCa > 2:9190/1‑150 (MQ=255) gTCATCTTCTTGCAGCTTAATCATAATGTTGCTGCCTTGCGGGCTGTAACGATGGGCGTTTTCTACCAGGTTTCGCAATAACATCCGCAGCAGGGTTGCATCACCCTGAACGGTGATGTCGGCGGCGCTCTCTGGCAATAGCAGGGTTTg > 2:640583/1‑150 (MQ=255) gTCATCTTCTTGCAGCTTAATCATAATGTTGCTGCCTTGCGGGCTGTAACGATGGGCGTTTTCTACCAGGTTTCGCAATAACATCCGCAGCAGGGTTGCATCACCCTGAACGGTGATGTCGGCGGCGCTCTCTGGCAATAGCAGGGTTTg < 2:371397/150‑1 (MQ=255) cATCTTCTTGCAGCTTAATCATAATGTTGCTGCCTTGCGGGCTGTAACGATGGGCGTTTTCTACCAGGTTTCGCAATAACATCCGCAGCAGGGTTGCATCACCCTGAACGGTGATGTCGGCGGCGCTCTCTGGCAATAGCAGGGTTTGCt > 1:299245/1‑150 (MQ=255) tcttGCAGCTTAATCATAATGTTGCTGCCTTGCGGGCTGTAACGATGGGCGTTTTCTACCAGGTTTCGCAATAACATCCGCAGCAGGGTTGCATCACCCTGAACGGTGATGTCGGCGGCGCTCTCTGGCAATAGCAGGGTTTGCTGTCGc < 1:1160935/150‑1 (MQ=255) cttGCAGCTTAATCATAATGTTGCTGCCTTGCGGGCTGTAACGATGGGCGTTTTCTACCAGGTTTCGCAATAACATCCGCAGCAGGGTTGCATCACCCTGAACGGTGATGTCGGCGGCGCTCTCTGGCAATAGCAGGGTTTGCTGTCGCt > 1:138351/1‑150 (MQ=255) cttGCAGCTTAATCATAATGTTGCTGCCTTGCGGGCTGTAACGATGGGCGTTTTCTACCAGGTTTCGCAATAACATCCGCAGCAGGGTTGCATCACCCTGAACGGTGATGTCGGCGGCGCTCTCTGGCAATAGCAGGGTTTGCTGTCGCt > 1:1378607/1‑150 (MQ=255) tGCAGCTTAATCATAATGTTGCTGCCTTGCGGGCTGTAACGATGGGCGTTTTCTACCAGGTTTCGCAATAACATCCGCAGCAGGGTTGCATCACCCTGAACGGTGATGTCGGCGGCGCTCTCTGGCAATAGCAGGGTTTGCTGTCGCTgg > 2:118437/1‑150 (MQ=255) tGCAGCTTAATCATAATGTTGCTGCCTTGCGGGCTGTAACGATGGGCGTTTTCTACCAGGTTTCGCAATAACATCCGCAGCAGGGTTGCATCACCCTGAACGGTGATGTCGGCGGCGCTCTCTGGCAATAGCAGGGTTTGCTGTCGCTgg > 2:763267/1‑150 (MQ=255) cAGCTTAATCATAATGTTGCTGCCTTGCGGGCTGTAACGATGGGCGTTTTCTACCAGGTTTCGCAATAACATCCGCAGCAGGGTTGCATCACCCTGAACGGTGATGTCGGCGGCGCTCTCTGGCAATAGCAGGGTTTGCTGTCGCTGGTc < 2:299245/150‑1 (MQ=255) aGCTTAATCATAATGTTGCTGCCTTGCGGGCTGTAACGATGGGCGTTTTCTACCAGGTTTCGCAATAACATCCGCAGCAGGGTTGCATCACCCTGAACGGTGATGTCGGCGGCGCTCTCTGGCAATAGCAGGGTTTGCTGTCGCTGGTCg > 2:997966/1‑150 (MQ=255) aGCTTAATCATAATGTTGCTGCCTTGCGGGCTGTAACGATGGGCGTTTTCTACAAGGTTTCGCAATAACATCCGCAGCAGGGTTGCATCACCCTGAACGGTGATGTCGGCGGCGCTCTCTGGCAATAGCAGGGTTTGCTGTCGCTGGTCg > 2:745999/1‑150 (MQ=255) cTTAATCATAATGTTGCTGCCTTGCGGGCTGTAACGATGGGCGTTTTCTACCAGGTTTCGCAATAACATCCGCAGCAGGGTTGCATCACCCTGAACGGTGATGTCGGCGGCGCTCTCTGGCAATAGCAGGGTTTGCTGTCGCTGGTCGAg < 2:1077094/150‑1 (MQ=255) ttAATCATAATGTTGCTGCCTTGCGGGCTGTAACGATGGGCGTTTTCTACCAGGTTTCGCAATAACATCCGCAGCAGGGTTGCATCACCCTGAACGGTGATGTCGGCGGCGCTCTCTGGCAATAGCAGGGTTTGCTGTCGCTGGTCGAGc < 2:334380/150‑1 (MQ=255) aTCATAATGTTGCTGCCTTGCGGGCTGTAACGATGGGCGTTTTCTACCAGGTTTCGCAATAACATCCGCAGCAGGGTTGCATCACCCTGAACGGTGATGTCGGCGGCGCTCTCTGGCAATAGCAGGGTTTGCTGTCGCTGGTCGAGCATg > 2:1299495/1‑150 (MQ=255) tCATAATGTTGCTGCCTTGCGGGCTGTAAGGATGGGCGTTTTCTACCAGGTTTCGCAATAACATCCGGAGCAGGGTTGCATCACCCTGAACGGTGATGTCGGCGGCGCTCTCTGGCAATAGCAGGGTTTGCTGTCGCTGGTCGAGCATgg < 2:785433/150‑1 (MQ=255) cATAATGTTGCTGCCTTGCGGGCTGTAACGATGGGCGTTTTCTACCAGGTTTCGCAATAACATCCGCAGCAGGGTTGCATCACCCTGAACGGTGATGTCGGCGGCGCTCTCTGGCAATAGCAGGGTTTGCTGTCGCTGGTCGAGCATGGt < 1:580566/150‑1 (MQ=255) cATAATGTTGCTGCCTTGCGGGCTGTAACGATGGGCGTTTTCTACCAGGTTTCGCAATAACATCCGCAGCAGGGTTGCATCACCCTGAACGGTGATGTCGGCGGCGCTCTCTGGCAATAGCAGGGTTTGCTGTCGCTGGTCGAGCATGGt > 1:239454/1‑150 (MQ=255) tAATGTTGCTGCCTTGCGGGCTGTAACGATGGGCGTTTTCTACCAGGTTTCGCAATAACATCCGCAGCAGGGTTGCATCACCCTGAACGGTGATGTCGGCGGCGCTCTCTGGCAATAGCAGGGTTTGCTGTCGCTGGTCGAGCATGGTAc > 1:2408/1‑150 (MQ=255) aTGTTGCTGCCTTGCGGGCTGTAACGATGGGCGTTTTCTACCAGGTTTCGCAATAACATCCGCAGCAGGGTTGCATCACCCTGAACGGTGATGTCGGCGGCGCTCTCTGGCAATAGCAGGGTTTGCTGTCGCTGGTCGAGCATGGTACTg < 2:448859/150‑1 (MQ=255) ttGCTGCCTTGCGGGCTGTAACGATGGGCGTTTTCTACCAGGTTTCGCAATAACATCCGCAGCAGGGTTGCATCACCCTGAACGGTGATGTCGGCGGCGCTCTCTGGCAATAGCAGGGTTTGCTGTCGCTGGTCGAGCATGGTACTGAGt < 1:300840/150‑1 (MQ=255) gctgcCTTGCGGGCTGTAACGATGGGCGTTTTCTACCAGGTTTCGCAATAACATCCGCAGCAGGGTTGCATCACCCTGAACGGTGATGTCGGCGGCGCTCTCTGGCAATAGCAGGGTTTGCTGTCGCTGGTCGAGCATGGTACTGAGTTc > 1:1538851/1‑150 (MQ=255) tGCGGGCTGTAACGATGGGCGTTTTCTACCAGGTTTCGCAATAACATCCGCAGCAGGGTTGCATCACCCTGAACGGTGATGTCGGCGGCGCTCTCTGGCAATAACAGGGTTTGCTGTCGCTGGTCGAGCATGGTACTGAGTTCGTCATAc > 1:499032/1‑150 (MQ=255) gCGGGCTGTAACGATGGGCGTTTTCTACCAGGTTTCGCAATAACATCCGCAGCAGGGTTGCATCACCCTGAACGGTGATGTCGGCGGCGCTCTCTGGCAATAGCAGGGTTTGCTGTCGCTGGTCGAGCATGGTACTg > 2:571314/1‑137 (MQ=255) gCGGGCTGTAACGATGGGCGTTTTCTACCAGGTTTCGCAATAACATCCGCAGCAGGGTTGCATCACCCTGAACGGTGATGTCGGCGGCGCTCTCTGGCAATAGCAGGGTTTGCTGTCGCTGGTCGAGCATGGTACTg < 1:571314/137‑1 (MQ=255) gggCTGTAACGATGGGCGTTTTCTACCAGGTTTCGCAATAACATCCGCAGCAGGGTTGCATCACCCTGAACGGTGATGTCGGCGGCGCTCTCTGGCAATAGCAGGGTTTGCTGTCGCTGGTCGAGCATGGTACTGAGTTCGTCATACGAg > 2:284057/1‑150 (MQ=255) gCTGTAACGATGGGCGTTTTCTACCAGGTTTCGCAATAACATCCGCAGCAGGGTTGCATCACCCTGAACGGTGATGTCGGCGGCGCTCTCTGGCAATAGCAGGGTTTGCTGTCGCTGGTCGAGCATGGTACTGAGTTCGTCATACGAggg < 1:284057/150‑1 (MQ=255) tGTAACGATGGGCGTTTTCTACCAGGTTTCGCAATAACATCCGCAGCAGGGTTGCATCACCCTGAACGGTGATGTCGGCGGCGCTCTCTGGCAATAGCAGGGTTTGCTGTCGCTGGTCGAGCATGGTACTGAGTTCGTCATACGAGGGga < 2:1538851/150‑1 (MQ=255) aaCGATGGGCGTTTTCTACCAGGTTTCGCAATAACATCCGCAGCAGGGTTGCATCACCCTGAACGGTGATGTCGGCGGCGCTCTCTGGCAATAGCAGGGTTTGCTGTCGCTGGTCGAGCATGGTACTGAGTTCGTCATACGAGGGGAGaa > 2:1275030/1‑150 (MQ=255) aCGATGGGCGTTTTCTACCAGGTTTCGCAATAACATCCGCAGCAGGGTTGCATCACCCTGAACGGTGATGTCGGCGGCGCTCTCTGGCAATAGCAGGGTTTGCTGTCGCTGGTCGAGCATGGTACTGAGTTCGTCATACGAGGGGAGAAt > 1:1146569/1‑150 (MQ=255) cGATGGGCGTTTTCTACCAGGTTTCGCAATAACATCCGCAGCAGGGTTGCATCACCCTGAACGGTGATGTCGGCGGCGCTCTCTGGCAATAGCAGGGTTTGCTGTCGc < 2:245548/108‑1 (MQ=255) cGATGGGCGTTTTCTACCAGGTTTCGCAATAACATCCGCAGCAGGGTTGCATCACCCTGAACGGTGATGTCGGCGGCGCTCTCTGGCAATAGCAGGGTTTGCTGTCGc > 1:245548/1‑108 (MQ=255) cGATGGGCGTTTTCTACCAGGTTTCGCAATAACATCCGCAGCAGGGTTGCATCACCCTGAACGGTGATGTCGGCGGCGCTCTCTGGCAATAGCAGGGTTTGCTGTCGCTGGTCGAGCATGGTACTGAGTTCGTCATACGAGGGGAGAATg < 2:815146/150‑1 (MQ=255) gATGGGCGTTTTCTACCAGGTTTCGCAATAACATCCGCAGCAGGGTTGCATCACCCTGAACGGTGATGTCGGCGGCGCTCTCTGGCAATAGCAGGGTTTGCTGTCGCTGGTCGAGCATGGTACTGAGTTCGTCATACGAGGGGAGAATGa < 2:1144341/150‑1 (MQ=255) ggCGTTTTCTACCAGGTTTGGCAATAACATCCGCAGCAGGGTTGCATCACCCTGAACGGTGATGTCGGCGGCGCTCTCTGGCAATAGCAGGGTTTGCTGTCGCTGGTCGAGCATGGTACTGAGTTCGTCATACGAGGGGAGAATGACATc < 1:662625/150‑1 (MQ=255) ggCGTTTTCTACCAGGTTTCGCAATAACATCCGCAGCAGGGTTGCATCACCCTGAACGGTGATGTCGGCGGCGCTCTCTGGCAATAGCAGGGTTTGCTGTCGCTGGTCGAGCATGGTACTGAGTTCGTCATACGAGGGGAGAATGACAta > 2:221178/1‑149 (MQ=255) cggtttCTACCAGGTTTCTCCATAACATCCGCTGCAGGGTTGCATCACCGTGATCGGTGATGTCGGCGGCGCTCTCTGGCAATAGCAGGGTTTGCTGTCGCTGGTCGAGCATGGTACTGAGTTCGTCATTCGAGGGGAGAATGACATCtt < 2:293731/147‑1 (MQ=255) 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gcagGGTTGCATCACCCTGAACGGTGATGTCGGCGGCGCTCTCTGGCAATAGCAGGGTTTGCTGTCGCTGGTCGAGCATGGTACTGAGTTCGTCATACGAGGGGAGAATGACATCTTCCAGCAGTTTTACATGTTGATAATTACCGgaag < 2:2408/150‑1 (MQ=255) agGGTTGCATCACCCTGAACGGTGATGTCGGCGGCGCTCTCTGGCAATAGCAGGGTTTGCTGTCGCTGGTCGAGCATGGTACTGAGTTCGTCATACGAGGGGAGAATGACATCTTCCAGCAGTTTTACATGTTGATAATTACCGgaagaa > 2:884182/1‑150 (MQ=255) gccgacATCACCGTTCAGGGTGATGTCGGCGGCGCTCTCTGGCAATAGCAGGGTTTGCTGTCGCTGGTCGAGCATGGTACTGAGTTCGTCATACGAGGGGAGAATGACATCTTCCAGCAGTTTTACATGTTGATAATTACCGGAAGaaaa > 1:1034373/6‑150 (MQ=255) cgacATCACCGTTCAGGGTGATGTCGGCGGCGCTCTCTGGCAATAGCAGGGTTTGCTGTCGCTGGTCGAGCATGGTACTGAGTTCGTCATACGAGGGGAGAATGACATCTTCCAGCAGTTTTACATGTTGATAATTACCGGAAGAAAATg > 1:1332682/4‑150 (MQ=255) gacATCACCGTTCAGGGTGATGTCGGCGGCGCTCTCTGGCAATAGCAGGGTTTGCTGTCGCTGGTCGAGCATGGTACTGAGTTCGTCATACGAGGGGAGAATGACATCTTCCAGCAGTTTTACATGTTGATAATTACCGGAAGAAAATGa > 1:799162/3‑150 (MQ=255) gCATCACCCTGAACGGTGATGTCGGCGGCGCTCTCTGGCAATAGCAGGGTTTGCTGTCGCTGGTCGAGCATGGTACTGAGTTCGTCATACGAGGGGAGAATGACATCTTCCAGCAGTTTTACATGTTGATTATTACCGGAAGAAAATGAc > 2:1470296/1‑150 (MQ=255) aTCACCCTGAACGGTGATGTCGGCGGCGCTCTCTGGCAATAGCAGGGTTTGCTGTCGCTGGTCGAGCATGGTACTGAGTTCGTCATACGAGGGGAGAATGACATCTTCCAGCAGTTTTACATGTTGATAATTACCGGAAGAAAATGACTg < 2:968900/150‑1 (MQ=255) tCACCCTGAACGGTGATGTCGGCGGCGCTCTCTGGCAATAGCAGGGTTTGCTGTCGCTGGTCGAGCATGGTACTGAGTTCGTCATACGAGGGGAGAATGACATCTTCCAGCAGTTTTACATGTTGATAATTACCGGAAGAAAATGACTGt > 1:601523/1‑150 (MQ=255) cACCCTGAACGGTGATGTCGGCGGCGCTCTCTGGCAATAGCAGGGTTTGCTGTCGCTGGTCGAGCATGGTACTGAGTTCGTCATACTAGGGGAGAATGACATCTTCCAGCAGTTTTACATGTTGATAATTACCGGAAGAAAATGACTGTc > 2:984647/1‑150 (MQ=255) aCCCTGAACGGTGATGTTGGCGGCGCTCTCTGGCAATAGCAGGGTTTGCTGTCGCTGGTCGAGCATGGTACTGAGTTCGTCATACGAGGGGAGAATGACATCTTCCAGCAGTTTTACATGTTGATAATTACCGGAAGAAAATGACTGTcc > 1:513244/1‑150 (MQ=255) aCCCTGAACGGTGATGTCGGCGGCGCTCTCTGGCAATAGCAGGGTTTGCTGTCGCTGGTCGAGCATGGTACTGAGTTCGTCATACGAGGGGAGAATGACATCTTCCAGCAGTTTTACATGTTGATAATTACCGGAAGAAAATGACTGTcc < 2:9728/150‑1 (MQ=255) cccTGAACGGTGATGTCGGCGGCGCTCTCTGGCAATAGCAGGGTTTGCTGTCGCTGGTCGAGCATGGTACTGAGTTCGTCATACGAGGGGAGAATGACATCTTCCAGCAGTTTTACATGTTGATAATTACCGGAAGAAAATGACTGTCCg > 2:537544/1‑150 (MQ=255) ccTGAACGGTGATGTCGGCGGCGCTCTCTGGCAATAGCAGGGTTTGCTGTCGCTGGTCGAGCATGGTACTGAGTTCGTCATACGAGGGGAGAATGACATCTTCCAGCAGTTTTACATGTTGATAATTACCGGAAGAAAATGACTGTCCgg < 1:857804/150‑1 (MQ=255) | CCTGGTCCTTCATCTTCAACTGCCATGACCGCTCCGTCATCTTCTTGCAGCTTAATCATAATGTTGCTGCCTTGCGGGCTGTAACGATGGGCGTTTTCTACCAGGTTTCGCAATAACATCCGCAGCAGGGTTGCATCACCCTGAACGGTGATGTCGGCGGCGCTCTCTGGCAATAGCAGGGTTTGCTGTCGCTGGTCGAGCATGGTACTGAGTTCGTCATACGAGGGGAGAATGACATCTTCCAGCAGTTTTACATGTTGATAATTACCGGAAGAAAATGACTGTCCGG > NC_000913/4332389‑4332677 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |