Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 4,410,026 | G→A | 5.7% | intergenic (+20/‑107) | rlmB → / → yjfI | 23S rRNA 2'‑O‑ribose G2251 methyltransferase/conserved protein YjfI |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 4,410,026 | 0 | G | A | 5.7% | 385.2 / 7.9 | 126 | intergenic (+20/‑107) | rlmB/yjfI | 23S rRNA 2'‑O‑ribose G2251 methyltransferase/conserved protein YjfI |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (53/63); new base A (4/3); total (57/69) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.03e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.28e-01 |
Only 100 of 129 total aligned reads displayed.
TATGCGTCGCCTGACTCGTGAACATTGCGATGAGTTGATCAGCATCCCGATGGCTGGAAGCGTTTCTTCCCTGAACGTTTCGGTTGCGACCGGAATTTG‑CTTATTTGAAGCGGTGCGCCAGCGCA‑GCTAATTTCTCAGAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGG‑TTTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGATAATTACGTATTGCAAATATTCATTTTATTAATATTTAAACTTAATCTATATGGAATAATATATGACATGGAATCCGTTGGCGCTAGCGACGGCGCTGCAAACTG > NC_000913/4409877‑4410175 | tATGCGTCGCCTGACTCGTGAACATTGCGATGAGTTGATCAGCATCCCGATGGCTGGAAGCGTTTCTTCCCTGAACGTTTCGGTTGCGACCGGAATTTG‑CTTATTTGAAGCGGTGCGCCAGCGCA‑GCTAATTTCTCAGAATTATGAAAAg > 1:272554/1‑150 (MQ=255) tATGCGTCGCCTGACTCGTGAACATTGCGATGAGTTGATCAGCATCCCGATGGCTGGAAGCGTTTCTTCCCTGAACGTTTCGGTTGCGACCGGAATTTG‑CTTATTTGAAGCGGTGCGCCAGCGCA‑GCTAATTTCTCAGAATTATGAAAAg < 2:913198/150‑1 (MQ=255) aTGCGTCGCCTGACTCGTGAACATTGCGATGAGTTGATCAGCATCCCGATGGCTGGAAGCGTTTCTTCCCTGAACGTTTCGGTTGCGACCGGAATTTG‑CTTATTTGAAGCGGTGCGCCAGCGCA‑GCTAATTTCTCAGAATTATGAAAAGc > 2:113466/1‑150 (MQ=255) aTGCGTCGCCTGACTCGTGAACATTGCGATGAGTTGATCAGCATCCCGATGGCTGGAAGCGTTTCTTCCCTGAACGTTTCGGTTGCGACCGGAACTTG‑CTTATTTGAAGCGGTGCGCCAGCGCA‑GCTAATTTCTCAGAATTATGAAAAGc < 1:790033/150‑1 (MQ=255) aTGCGTCGCCTGACTCGTGAACATTGCGATGAGTTGATCAGCATCCCGATGGCAGGAAGCGTTTCTTCCCTGAACGTTTCGGTTGCGACCGGAATTTG‑CTTATTTGAAGCGGTGCGCCAGCGCA‑GCTAATTTCTCAGAATTATGAAAAGc < 2:641347/150‑1 (MQ=255) gCGTCGCCTGACTCCTGAACATTGCGATGAGTTGATCAGCATCCCGATGGCTGGAAGCGTTTCTTCCCTGAACGTTTCGGTTGCGACCGGAATTTG‑CTTATTTGAAGCGGTGCGCCAGCGCA‑GCTAATTTCTCAGAATTATGAAAAGCCa > 2:440111/1‑150 (MQ=255) cGTCGCCTGACTCGTGAACATTGCGATGAGTTGATCAGCATCCCGATGGCTGGAAGCGTTTCTTCCCTGAACGTTTCGGTTGCGACCGGAATTTG‑CTTATTTGAAGCGGTGCGCCAGCGCA‑GCTAATTTCTCAGAATTATGAAAAGCCAt > 1:1272982/1‑150 (MQ=255) gTCGCCTGACTCGTGAACATTGCGATGAGTTGATCAGCATCCCGATGGCTGGAAGCGTTTCTTCCCTGAACGTTTCGGTTGCGACCGGAATTTG‑CTTATTTGAAGCGGTGCGCCAGCGCA‑GCTAATTTCTCAGAATTATGAAAAGCCATc < 2:1519766/150‑1 (MQ=255) gTCGCCTGACTCGTGAACATTGCGATGAGTTGATCAGCATCCCGATGGCTGGAAGCGTTTCTTCACTGAACGTTTCGGTTGCGACCGGAATTTG‑CTTATTTGAAGCGGTGCGCCAGCGCA‑GCTAATTTCTCAGAATTATGAAAAGCCATc > 2:320940/1‑150 (MQ=255) tCGCCTGACTCGTGAACATTGCGATGAGTTGATCAGCATCCCGATGGCTGGAAGCGTTTCTTCCCTGAACGTTTCGGTTGCGACCGGAATTTG‑CTTATTTGAAGCGGTGCGCCAGCGCA‑GCTAATTTCTCAGAATTATGAAAAGCCATcc < 2:644046/150‑1 (MQ=255) cGCCTGACTCGTGAACATTGCGATGAGTTGATCAGCATCCCGATGGCTGGAAGCGTTTCTTCCCTGAACGTTTCGGTTGCGACCGGAATTTG‑CTTATTTGAAGCGGTGCGCCAGCGCA‑GCTAATTTCTCAGAATTATGAAAAGCCATCCa > 1:622873/1‑150 (MQ=255) gACTCGTGAACATTGCGATGAGTTGATCAGCATCCCGATGGCTGGAAGCGTTTCTTCCCTGAACGTTTCGGTTGCGACCGGAATTTG‑CTTATTTGAAGCGGTGCGCCAGCGCA‑GCTAATTTCTCAGAATTATGAAAAGCCATCCAGAttt < 2:523245/150‑1 (MQ=255) cTCGTGAACATTGCGATGAGTTGATCAGCGTCCCGATGGCTGGAAGAGTTTCTTCCCTGAACGTTTCGGTTGCGACCGGAATTTG‑CTTATTTGAAGCGGTGCGCCAGCGCA‑GCTAATTTCTCAGAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTgg > 1:609991/1‑150 (MQ=255) tCGTGATCATTGCGATGAGTTGATCAGCATCCCGATGGCTGGAAGCGTTTCTTCCCTGAACGTTTCGGTTGCGACCGGAATTTG‑CTTATTTGAAGCGGTGCGCCAGCGCA‑GCTAATTTCTCAGAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTGGa > 1:1116343/1‑150 (MQ=255) cGTGAACATTGCGATGAGTTGATCAGCATCCCGATGGCTGGAAGCGTTTCTTCCCTGAACGTTTCGGTTGCGACCGGAATTTG‑CTTATTTGAAGCGGTGCGCCAGCGCA‑GCTAATTTCTCAGAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTGGAt < 1:390752/150‑1 (MQ=255) gAACATTGCGATGAGTTGATCAGCATCCCGATGGCTGGAAGCGTTTCTTCCCTGAACGTTTCGGTTGCGACCGGAATTTG‑CTTATTTGAAGCGGTGCGCCAGCGCA‑GCTAATTTCTCAGAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGG‑t > 1:69032/1‑150 (MQ=255) aTTGCGATGAGTTGATCAGCATCCCGATGGCTGGAAGCGTTTCTTCCCTGAACGTTTCGGTTTCGACCGGAATTTG‑CTTATTTGAAGCGGTGCGCCAGCGCA‑GCTAATTTCTCAGAATTATGAAAAACCATCCAAATCTGGATGG‑ctttt < 1:735739/150‑1 (MQ=255) aTTGCGATGAGTTGATCAGCATCCCGATGGCTGGAAGCGTTTCTTCCCTGAACGTTTCGGTTGCGACCGTAATTTT‑CTTATTTGAATCGGTGCGCCAGCGCA‑GCTAATTTCTCAGAATTATGAAAAACCATCCAAATCTGGATGG‑ctttt < 2:1167710/150‑1 (MQ=255) tGCGATGAGTTGATCAGCATCCCGATGGCTGGAAGGGTTTCTTCCCTGAACGTTTCGGTTGCGACCGGAATTTG‑CTTATTTGAAGCGGTGCGCCAGCGCA‑TCTAATTTCTCATAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGG‑ttttttt < 2:712566/150‑1 (MQ=255) gCGATGAGTTGATCAGCATCCCGATGGCTGGAAGCGTTTCTTCCCTGAACGTTTCGGTTGCGACCGGAATTTG‑CTTATTTGAAGCTGTGCGCCAGCGCA‑GCTAATTTCTCAGAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGG‑tttttttt < 2:138839/150‑1 (MQ=255) gCGATGAGTTGATCAGCATCCCGATGGCTGGAAGCGTTTCTTCCCTGAACGTTTCGGTTGCGACCGGAATTTG‑CTTATTTGAAGCGGTGCGCCAGCGCA‑GCTAATTTCTCAGAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGG‑tttttttt > 1:1001814/1‑150 (MQ=255) gCGATGAGTTGATCAGCATCCCGATGGCTGGAAGCGTTTCTTCCCTGAACGTTTCGGTTGCGACCGGAATTTG‑CTTATTTGAAGCGGTGCGCCAGCGCA‑GCTAATTTCTCAGAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGG‑tttttttt > 1:662594/1‑150 (MQ=255) gCGATGAGTTGATCAGCATCCCGATGGCTGGAAGCGTTTCTTCCCTGAACGTTTCGGTTGCGACCGGAATTTG‑CTTATTTGAAGCGGTGCGCCAGCGCA‑GCTAATTTCTCAGAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGG‑tttttttt < 1:874893/150‑1 (MQ=255) gCGATGAGTTGATCAGCATCCCGATGGCTGGAAGCGTTTCTTCCCTGAACGTTTCGGTTGCGACCGGAATTTG‑CTTATTTGAAGCGGTGCGCCAGCGCA‑GCTAATTTCTCAGAATTATGAAAAACCATCCAAATCTGGATGG‑cttttcat < 1:940626/150‑4 (MQ=255) cGATGAGTTGATCAGCATCCCGATGGCTGGAAGCGGTTCTTCACTGCCCGTTTCGGTTTCGACCGGAATTTG‑CTTATTTGAAGCGGTGCGCCAGCGCA‑GATAATTTCTCAGAATTATTAAAAGCCATCCAGATTTGGATTG‑ttttttttt < 2:189495/150‑1 (MQ=255) gATGAGTTGATCAGCATCCCGATGGCTGGAAGCGTTTCTTCCCTGAACGTTTCGGTTGCGACCGGAATTTG‑CTTATTTGAAGCGGTGCGCCAGCGCA‑GCTAATTTCTCAGAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGG‑TTTTTTTTTg < 2:515257/150‑1 (MQ=255) gATGAGTTGATCAGCATCCCGATGGCTGGAAGCGTTTCTTCCCTGAACGTTTCGGTTGCGACCGGAATTTG‑CTTATTTGAAGCGGTGCGCCAGCGCA‑GCTAATTTCTCAGAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGG‑TTTTTTTTTg < 1:1109831/150‑1 (MQ=255) aTGAGTTGATCAGCATCCCGATGGCTGGAAGCGTTTCTTCCCTGAACGTTTCGGTTGCGACCGGAATTTG‑CTTATTTGAAGCGGTGCGCCAGCGCA‑GCTAATTTCTCAGAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGG‑ttttttttttg < 1:730253/150‑3 (MQ=255) tGAGTTGATCAGCATCCCGATGGCTGGAAGCGTTTCTTCCCTGAACGTTTCGGTTGCGACCGGAATTTG‑CTTATTTGAAGCGGTGCGCCAGCGCA‑GCTAATTTCTCAGAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGG‑TTTTTTTTTGTc < 1:481139/150‑1 (MQ=255) gAGTTGATCAGCATCCCGATGGCTGGAAGCGTTTCTTCCCTGAACGTTTCGGTTGCGACCGGAATTTG‑CTTATTTGAAGCGGTGCGCCAGCGCA‑GCTAATTTCTCAGAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGG‑TTTTTTTTTGTCt > 2:925035/1‑150 (MQ=255) aGTTGATCAGCATCCCGATGGCTGGAAGCGTTTCTTCCCTGAACGTTTCGGTTGCGACCGGAATTTG‑CTTATTTGAAGCGGTGCGCCAGCGCA‑GCTAATTTCTCAGAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGG‑TTTTTTTTTGTCta > 1:1386578/1‑150 (MQ=255) aGTTGATCAGCATCCCGATGGCTGGAAGCGTTTCTTCCCTGAACGTTTCGGTTGCGACCGGAATTTG‑CTTATTTGAAGCGGTGCGCCAGCGCA‑GCTAATTTCTCAGAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGG‑TTTTTTTTTGTCta > 1:820647/1‑150 (MQ=255) aGTTGATCAGCATCCCGATGGCTGGAAGCGTTTCTTCCCTGAACGTTTCGGTTGCGACCGGAATTTG‑CTTATTTGAAGCGGTGCGCCAGCGCA‑GCTAATTTCTCAGAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGG‑TTTTTTTTTGTCta > 1:736879/1‑150 (MQ=255) aTCAGCATCCCGATGGCTGGAAGCGTTTCTTCCCTGAACGTTTCGGTTGCGACCGGAATTTG‑CTTATTTGAAGCGGTGCGCCAGCGCA‑GCTAATTTCTCAGAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGG‑TTTTTTTTTGTCTATAGCt < 1:867054/150‑1 (MQ=255) aGCATCCCGATGGCTGGAAGCGTTTCTTCCCTGAACGTTTCGGTTGCGACCGGAATTTG‑CTTATTTGAAGCGGTGCGCCAGCGCA‑GCTAATTTCTCAGAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGG‑TTTTTTTTTGTCTATAGCTGGt < 1:113466/150‑1 (MQ=255) aGCATCCCGATGGCTGGAAGCGTTTCTTCCCTGAACGTTTCGGTTGCGACCGGAATTTG‑CTTATTTGAAGCGGTGCGCCAGCGCA‑GCTAATTTCTCAGAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGG‑TTTTTTTTTGTCTATAGCTGGt > 2:622261/1‑150 (MQ=255) aGCATCCCGATGGCTGGAAGCGTTTCTTCCCTGAACGTTTCGGTTGCGACCGGAATTTG‑CTTATTTGAAGCGGTGCGCCAGCGCA‑GCTAATTTCTCAGAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGG‑TTTTTTTTTGTCTATAGCTGGt > 2:919769/1‑150 (MQ=255) aGCATCCCGATGGCTGGAAGCGTTTCTTCCCTGAACGTTTCGGTTGCGACCGGAATTTG‑CTTATTTGAAGCGGTGCGCCAGCGCA‑GCTAATTTCTCAGAATTATGAAAAGCCATCCAAATCTGGATGG‑cttttca < 1:1008017/135‑3 (MQ=255) aGCATCCCGATGGCTGGAAGCGTTTCTTCCCTGAACGTTTCGGTTGCGACCGGAATTTG‑CTTATTTGAAGCGGTGCGCCAGCGCA‑GCTAATTTCTCAGAATTATGAAAAGCCATCCAAATCTGGATGG‑cttttca > 2:1008017/1‑133 (MQ=255) ccGATGGCTGGAAGCGTTTCTTCCCTGAACGTTTCGGTTGCGACCGGAATTTG‑CTTATTTGAAGCGGTGCGCCAGCGCA‑GCTAATTTCTCAGAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGG‑TTTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGATa < 2:1439404/150‑1 (MQ=255) cTGGAAGCGTTTCTTCCCTGAACGTTTCGGTTGCGACCGGAATTTG‑CTTATTTGAAGCGGTGCGCCAGCGCA‑GCTAATTTCTCAGAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGGTTTTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGATAATTACg > 1:165817/1‑150 (MQ=255) tGGAAGCGTTTCTTCCCTGAACGTTTCGGTTGCGACCGGAATTTG‑CTTATTTGAAGCGGTGCGCCAGCGCA‑GCTAATTTCTCAGAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGG‑TTTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGATAATTACGTa < 1:241135/150‑1 (MQ=255) tGGAAGCGTTTCTTCCCTGAACGTTTCGGTTGCGACCGGAATTTG‑CTTATTTGAAGCGGTGCGCCAGCGCA‑GCTAATTTCTCAGAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGG‑TTTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGATAATTACGTa < 2:373097/150‑1 (MQ=255) tttCTTCCCTGAACGTTTCGGTTGCGACCGGAATTTG‑CTTATTTGAAGCGGTGCGCCAGCGCA‑GCTAATTTCTCAGAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGG‑TTTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGATAATTACGTATTGCAAat < 1:1157554/150‑1 (MQ=255) tttCTTCCCTGAACGTTTCGGTTGCGACCGGAATTTG‑CTTATTTGAAGCGGTGCGCCAGCGCA‑GCTAATTTCTCAGAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGG‑TTTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGATAATTACGTATTGCAAat > 1:159699/1‑150 (MQ=255) tttCTTCCCTGAACGTTTCGGTTGCGACCGGAATTTG‑CTTATTTGAAGCGGTGCGCCAGCGCA‑GCTAATTTCTCAGAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGG‑TTTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGATAATTACGTATTGCAAat < 1:1302455/150‑1 (MQ=255) cTGAACGTTTCGGTTGCGACCGGAATTTG‑CTTATTTGAAGCGGTGCGCCAGCGCA‑GCTAATTTCTCAGAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGG‑TTTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGATAATTACGTAt > 2:54193/1‑135 (MQ=255) cTGAACGTTTCGGTTGCGACCGGAATTTG‑CTTATTTGAAGCGGTGCGCCAGCGCA‑GCTAATTTCTCAGAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGG‑TTTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGATAATTACGTAt < 1:54193/135‑1 (MQ=255) tGAACGTTTCGGTTGCGACCGTAATTTG‑CTTATTTGAAGCGTTGCGCCAGCGCA‑GCTAATTTCTCAGAATTGTGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGG‑TTTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGATAATTACGTATTGCAAATATTCAtttt < 1:906570/150‑1 (MQ=255) tGAACGTTTCGGTTGCGACCGGAATTTG‑CTTATTTGAAGCGGTGCGCCAGCGCA‑GCTAATTTCTCAGAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGG‑TTTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGATAATTACGTATTGCAAATATTCAtttt < 2:896635/150‑1 (MQ=255) acggTTTC‑GTTGCGCACGGTATTTGCCTTATTT‑TACCGGGGCGCCAAGGCACGATAATTTTTCTTAATAATTAAATCCCATCCA‑CTTTTGTTGG‑TTTTTTTTTTTCAAATTCAGGTAAGATAATTACGTATTGCAAATATTCATTttatt < 2:1507108/147‑1 (MQ=255) ggTTTCGGTTGCGACCGGAATTTG‑CTTATTTGAAGCGGTGCGCCAGCGCA‑GCTAATTTCTCAGAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGG‑TTTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGATAATTACGTATTGCAAATATTCATTttatta < 2:1217091/149‑1 (MQ=255) cGTTTCGGTTGCGACCGGAATTTG‑CTTATTTGAAGCGGTGCGCCAGCGCA‑GCTAATTTCTCAGAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGG‑TTTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGATAATTACGTATTGCAAATATTCATTttatta > 2:1187610/1‑150 (MQ=255) tCGGTTGCGACCGGAATTTG‑CTTATTTGAAGCGGTGCGCCAGCGCA‑GCTAATTTCTCAGAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGG‑TTTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGATAATTACGTATTGCAAATATTCATTTTATTAatat > 1:1341988/1‑150 (MQ=255) cGGTTGCGACCGGAATTTG‑CTTATTTGCAGCGGTGCGCCAGCGCA‑GCTAATTTCTCAGAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGG‑TTTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGATAATTACGTATTGCAAATATTCATTTTATTAATAtt < 2:233469/150‑1 (MQ=255) gTTGCGACCGGAATTTG‑CTTATTTGAAGCGGTGCGCCAGCGCA‑GCTAATTTCTCAGAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGG‑TTTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGATAATTACGTATTGCAAATATTCATTTTATTAATATTTa < 1:1202549/150‑1 (MQ=255) cGACCGGAATTTG‑CTTATTTGAAGCGGTGCGCCAGCGCA‑GCTAATTTCTCAGAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGG‑TTTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGATAATTACGTATTGCAAATATTCATTTTATTAATATTTAAACt < 2:333714/150‑1 (MQ=255) gACCGGAATTTG‑CTTATTTGAAGCGGTGCGCCAGCGCA‑GCTAATTTCTCAGAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGG‑TTTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGATAATTACGTATTGCAAATATTCATTTTATTAATATTTAAAGtt < 2:1033234/150‑1 (MQ=255) aCCGGAATTTG‑CTTATTTGAAGCGGTGCGCCAGCGCA‑GCTAATTTCTCAGAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGG‑TTTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGATAATTACGTATTGCAAATATTCATTTTATTAATATTTAAACTTa < 1:925035/150‑1 (MQ=255) ccGGAATTTG‑CTTATTTGAAGCGGTGCGCCAGCGCA‑GCTAATTTCTCAGAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGG‑TTTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGATAATTACGTATTGCAAATATTCATTTTATTAATATTTAAACTTaa > 1:902075/1‑150 (MQ=255) cggcaattG‑CTTATTTGTATCGGTGCGCCATCGCA‑TCTAATTTCTCATTATTATTAAAACCCATCCATATTTTGAATG‑TTTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGATAATTACGTATTGCAAATATTCATTTTATTAATATTTAAACTTAAt < 1:785082/144‑1 (MQ=255) ggAATTTG‑CTTATTTGAAGCGGTGCGCCAGCGCA‑GCTAATTTCTCAGAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGG‑TTTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGATAATTACGTATTGCAAATATTCATTTTATTAATATTTAAACTTAATc < 2:902075/150‑1 (MQ=255) gAATTTG‑CTTATTTGAAGCGGTGCGCCAGCGCA‑GCTAATTTCTCAGAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGG‑TTTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGATAATTACGTATTGCAAATATTCATTTTATTAATATTTAAACTTAATCt < 2:1272982/150‑1 (MQ=255) aaTTTG‑CTTATTTGAAGCGGTGCGCCAGCGCA‑GCTAATTTCTCAGAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGG‑TTTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGATAATTACGTATTGCAAATATTGATTTTATTAATATTTAAACTTAATCta < 1:440111/150‑1 (MQ=255) tttG‑CTTATTTGAAGCGGTGCGCCAGCGCA‑GCTAATTTCTCAGAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGG‑TTTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGATAATTACGTATTGCAAATATTCATTTTATTAATATTTAAACTTAATCtata > 1:1285572/1‑150 (MQ=255) ttG‑CTTATTTGAAGCGGTGCGCCAGCGCA‑GCTAATTTCTCAGAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGG‑TTTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGATAATTACGTATTGCAAATATTCATTTTATTAATATTTAAACTTAATCTatat < 1:1534766/150‑1 (MQ=255) tG‑CTTATTTGAAGCGGTGCGCCAGCGCA‑GCTAATTTCTCAGAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGG‑TTTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGATAATTACGTATTGCAAATATTCATTTTATTAATATTTAAACTTAATCTATATg < 2:867412/150‑1 (MQ=255) tG‑CTTATTTGAAGCGGTGCGCCAGCGCA‑GCTAATTTCTCAGAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGG‑TTTTTTTTTGTCTATAGCAGGTAAGATAATTACGTATTGCAAATATTCATTTTATTAATATTTAAACTTAATCTATATg > 1:1438112/1‑150 (MQ=255) g‑CTTATTTGAAGCGGTGCGCCAGCGCA‑GCTAATTTCTCAGAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGG‑TTTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGATAATTACGTATTGCAAATATTCATTTTATTAATATTTAAACTTAATCTATATgg < 2:159699/150‑1 (MQ=255) cTTATTTGAATCGGTGCGCCAGCGCA‑GCTAATTTCTCAGAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGG‑TTTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGATAATTACGTATTGCAAATATTCATTTTATTAATATTTaa < 1:1007334/134‑1 (MQ=255) cTTATTTGAAGCGGTGCGCCAGCGCA‑GCTAATTTCTCAGAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGG‑TTTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGATAATTACGTATTGCAAATATTCATTTTATTAATATTTaa > 2:1007334/1‑134 (MQ=255) tATTTGAAGCGGTGCGCCAGCGCA‑GCTAATTTCTCAGAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGG‑TTTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGATAATTACGTATTGCAAATATTCATTTTATTAATATTTAAACTTAATCTATATGGaat < 1:1187610/150‑1 (MQ=255) tATTTGAAGCGGTGCGCCAGCGCA‑GCTAATTTCTCAGAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGG‑TTTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGATAATTACGTATTGCAAATATTCATTTTATTAATATTTAAACTTAATCTATATGGaat > 1:1230599/1‑150 (MQ=255) ttGAAGCGGTGCGCCAGCGCA‑GCTAATTTCTCAGAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGGTTTTTTTTTTGTCTATAGCTGTTAAGATAATTACGTATTGCAAATATTCATTTTATTAATATTTAAACTTTATCTTTATGGaataa > 1:647787/1‑150 (MQ=255) tGAAGCGGTGCGCCAGCGCA‑GCTAATTTCTCAGAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTGGATTG‑TTTTTTTTTGTCTATAGCTTGTAAGATAATTACGTATTGCAAATATTCATTTTATTAATATTTAAACTTAATCTATATGGAataata < 1:662583/150‑1 (MQ=255) gAAGCGGTGCGCCAGCGCA‑GCTAATTTCTCAGAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGG‑TTTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGATAATTACGTATTGCAAATATTCATTTTATTAATATTTAAACTTAATCTATATGGAATAatat > 2:1506268/1‑150 (MQ=255) aGCGGTGCGCCAGCGCA‑GCTAATTTCTCAGAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGGTTTTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGATAATTACGTATTGCAAATATTCATTTTATTAATATTTAAACTTAATCTATATGGAATAatata < 2:165817/150‑1 (MQ=255) gCGGTGCGCCAGCGCA‑GCTAATTTCTCAGAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGG‑TTTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGATAATTACGTATTGCAAATATTCATTTTATTAATATTTAAACTTAATCTATATGGAATAATATATg < 2:272554/150‑1 (MQ=255) cgcCAGCGCA‑GCTATTTTCTCAGAAATATGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGG‑TTTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGATAATTACGTATTGCAAATTTTCATTTTATTAATATTTAAACTTAATCTATATGGAATAATATATGACATgg < 2:1002089/150‑1 (MQ=255) cgcCAGCGCA‑GCTAATTTCTCAGAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGG‑TTTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGATAATTACGTATTGCAAATATTCATTTTATTAATATTTAAACTTAATCTATATGGAATAATATATGACATgg < 2:1458355/150‑1 (MQ=255) cgcCAGCGCA‑GCTAATTTCTCAGAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGG‑TTTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGATAATTACGTATTGCAAATATTCATTTTATTAATATTTAAACTTAATCTATATGGAATAATATATGACATgg > 2:728436/1‑150 (MQ=255) aGCGCA‑GCTAATTTCTCAGAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGG‑TTTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGATAATTACGTATTGCAAATATTCATTTTATTAATATTTAAACTTAATCTATATGGAATAATATATGACATGGAATc < 2:820647/150‑1 (MQ=255) gcA‑GCTAATTTCTCAGAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGG‑TTTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGATAATTACGTATTGCAAATATTCATTTTATTAATATTTAAACTTAATCTATATGGAATAATATATGACATGGAATCCGt > 2:759614/1‑150 (MQ=255) ctcAGAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGG‑TTTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGATAATTACGTATTGCAAATATTCATTTTATTAATATTTAAACTTAATCTATATGGAATAATATATGACATGGAATCCGTTGGCGCTAGCg > 1:634272/1‑150 (MQ=255) cAGAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGG‑TTTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGATAATTACGTATTGCAAATATTCATTTTATTAATATTTAAACTTAATCTATATGGAATAATATATGACATGGAATCCGTTGGCGCTAGCGAc > 2:1227412/1‑150 (MQ=255) cAGAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGG‑TTTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGATAATTACGTATTGCAAATATTCATTTTATTAATATTTAAACTTAATCTATATGGAATAATATATGACATGGAATCCGTTGGCGCTAGCGAc > 1:641114/1‑150 (MQ=255) aGAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGG‑TTTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGATAATTACGTATTGCAAATATTCATTTTATTAATATTTAAACTTAATCTATATGGAATAATATATGACATGGAATCCGTTGGCGCTAGCGACg > 2:230817/1‑150 (MQ=255) aaatATGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGG‑TTTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGATAATTACGTATTGCAAATATTCATTTTATTAATATTTAAACTTAATCTATATGGAATAATATATGACATGGAATCCGTTGGCGCTAGCGACGgc < 1:835761/147‑1 (MQ=255) aatATGAAAAGCCATCCAGATTTGGCTGG‑TTTTTTTTTGACTATAGCTGGTAAGACAATTACGTATTGCAAATATTCATTTTATTAATATTTAAACTTAATCTATATGGAATAATATATGACATGGAATCCGTTGGCGCTAGCGACGgcg < 2:1356407/148‑1 (MQ=255) caaaaaaaaACCATCCAAATCTGGATGGCTTTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGATAATTACGTATTGCAAATATTCATTTTATTAATATTTAAACTTAATCTATATGGAATAATATATGACATGGAATCCGTTGGCGCTAGCGACGgcg > 1:1468837/6‑150 (MQ=255) caaaaaaaaACCATCCAAATCTGGATGG‑TTTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGATAATTACGTATTGCAAATATTCATTTTATTAATATTTAAACTTAATCTATATGGAATAATATATGACATGGAATCCGTTGGCGATAGCGACGgcgc > 2:816840/6‑150 (MQ=255) aTGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGG‑TTTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGATAATTACGTATTGCAAATATTCATTTTATTAATATTTAAACTTAATCTATATGGAATAATATATGACATGGAATCCGTTGGCGCTAGCGACGGCGCTg > 1:804350/1‑150 (MQ=255) tGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGG‑TTTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGATAATTACGTATTGCAAATATTCATTTTATTAATATTTAAACTTAATCTATATGGAATAATATATGACATGGAATCCGTTGGCGCTAGCGACGGCGCTGc > 1:14048/1‑150 (MQ=255) aaaaaaACCATCCAAATCTGGATGG‑‑TTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGATAATTACGTATTGCAAATATTCATTTTATTAATATTTAAACTTAATCTATAAGGAATAATATATGACATGGAATCCGTTGGCGCTAGCGACGGCGCTGCa > 2:606967/3‑150 (MQ=255) gAAAAGCCATCCAGATTTGGATGG‑TTTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGATAATTACGTATTGCAAATATTCATTTTATTAATATTTAAACTTAATCTATATGGAATAATATATGACATGGAATCCGTTGGCGCTAGCGACGGCGCTGCa > 2:505095/1‑150 (MQ=255) aaaaACCATCCAAATCTGGATGG‑TTTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGATAATTACGTATTGCAAATATTCATTTTATTAATATTTAAACTTAATCTATATGGAATAATATATGACATGGAATCCGTTGGCGCTAGCGACGGCGCTGCaa > 2:897172/1‑150 (MQ=255) aaaCCCATCCAGATTTGGATGG‑TTTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGATAATTACGTATTGCAAATATTCATTTTATTAATATTTAAACTTAATCTATATGGAATAATATATGACATGGAATCCGTTGGCGCTAGCGACGGCGCTGCaaa < 2:333793/150‑1 (MQ=255) aGCCATCCAGATTTGGATGG‑TTTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGATAATTACGTATTGCAAATATTCATTTTATTAATATTTAAACTTAATCTATATGGAATAATATATGACATGGAATCCGTTGGCGCTAGCGACGGCGCTGCAAACt > 2:787644/1‑150 (MQ=255) aGCCATCCAGATTTGGATGG‑TTTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGATAATTACGTATTGCAAATATTCATTTTATTAATATTTAAACTTAATCTATATGGAATAATATATGACATGGAATCCGTTGGCGCTAGCGACGGCGCTGCAAACt < 2:622873/150‑1 (MQ=255) gCCATCCAGATTTGGATGG‑TTTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGATAATTACGTATTGCAAATATTCATTTTATTAATATTTAAACTTAATCTATATGGAATAATATATGACATGGAATCCGTGGGCGCTAGCGACGGCGCTGCAAACTg < 2:272416/150‑1 (MQ=255) | TATGCGTCGCCTGACTCGTGAACATTGCGATGAGTTGATCAGCATCCCGATGGCTGGAAGCGTTTCTTCCCTGAACGTTTCGGTTGCGACCGGAATTTG‑CTTATTTGAAGCGGTGCGCCAGCGCA‑GCTAATTTCTCAGAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGG‑TTTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGATAATTACGTATTGCAAATATTCATTTTATTAATATTTAAACTTAATCTATATGGAATAATATATGACATGGAATCCGTTGGCGCTAGCGACGGCGCTGCAAACTG > NC_000913/4409877‑4410175 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |