| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 4,448,425 | T→A | 8.8% | intergenic (‑180/‑22) | yzfA ← / → chpS | putative YjfA/ChpS antitoxin of the ChpB‑ChpS toxin‑antitoxin system |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 4,448,425 | 0 | T | A | 8.8% | 327.6 / 11.5 | 109 | intergenic (‑180/‑22) | yzfA/chpS | putative YjfA/ChpS antitoxin of the ChpB‑ChpS toxin‑antitoxin system |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (43/56); new base A (5/5); total (48/61) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.47e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 110 total aligned reads displayed.
GACGACTCGCATTCTGTTTTGTAATTCCCTCACCTTTTGCTTTTCTCTCCGAGCCGCTTTCCATATCTATTAACGCATAAAAAACTCTGCTGGCATTCACAAATGCGCAGGGGTAAAACGTTTCCTGTAGCACCGTGAGTTATACTTTGTATAACTTAAGGAGGTGCAGATGCGTATTACCATAAAAAGATGGGGGAACAGTGCAGGTATGGTCATTCCCAATATCGTAATGAAAGAACTTAACTTACAGCCGGGGCAGAGCGTGGAGGCGCAAGTGAGCAACAATCAACTGATTC > NC_000913/4448278‑4448573 | gacgacTCGCATTCTGTTTTGTAATTCCCTCACCTTTTGCTTTTCTCTCCGAGCCGCTTTCCATATCTATTAACGCATAAAAAACTCTGCTGGCATTCACAAATGCGCAGGGGTAAAACGTTTCCTGTAGCACCGTGAGTTATACTTTGt < 2:483692/150‑1 (MQ=255) ccgacTCGCATTCTGTTTTGTAATTCCCTCACCTTTTGCTTTTCTCTCCGAGCCGCTTTCCATATCTATTAACGCATAAAAAACTCTGCTGGCATTCACAAATGCGCAGGTGTAAAACGTTTCCTGTAGCACCGTGAGTTATACTTTGta < 2:1124578/149‑1 (MQ=255) acgacTCGCATTCTGTTTTGTAATTCCCTCACCTTTTGCTTTTCTCTCCGAGCCGCTTTCCATATCTATTAACGCATAAAAAACTCTGCTGGCATTCACAAATGCGCAGGGGTAAAACGTTTCCTGTAGCACCGTGAGTTATACTTTGta < 1:9346/150‑1 (MQ=255) gacTCGCATTCTGTTTTGTAATTCCCTCACCTTTTGCTTTTCTCTCCGAGCCGCTTTCCATATCTATTAACGCATAAAAAACTCTGCTGGCATTCACAAATGCGCAGGGGTAAAACGTTTCCTGTAGCACCGTGAGTTATACTTTGtata < 1:879238/150‑1 (MQ=255) cTCGCATTCTGTTTTGTAATTCCCTCACCTTTTGCTTTTCTCTCCGAGCCGCTTTCCATATCTATTAACGCATAAAAAACTCTGCTGGCATTCACAAATGCGCAGGGGTAAAACGTTTCCTGTAGCACCGTGAGTTATACTTTGTATAAc < 1:1508009/150‑1 (MQ=255) cGCATTCTGTTTTGTAATTCCCTCACCTTTTGCTTTTCTCTCCGAGCCGCTTTCCATATCTATTAACGCATAAAAAACTCTGCTGGCATTCACAAATGCGCAGGGGTAAAACGTTTCCTGTAGCACCGTGAGTTATACTTTGta < 1:397857/144‑1 (MQ=255) cGCATTCTGTTTTGTAATTCCCTCACCTTTTGCTTTTCTCTCCGAGCCGCTTTCCATATCTATTAACGCATAAAAAACTCTGCTGGCATTCACAAATGCGCAGGGGTAAAACGTTTCCTGTAGCACCGTGAGTTATACTTTGta > 2:397857/1‑144 (MQ=255) gCATTCTGTTTTGTAATTCCCTCACCTTTTGCTTTTCTCTCCGAGCCGCTTTCCATATCTATTAACGCATAAAAAACTCTGCTGGCATTCACAAATGCGCAGGGGTAAAACGTTTCCTGTAGCACCGTGAGTTATACTTTGTATAACTTa > 1:243590/1‑150 (MQ=255) gCATTCTGTTTTGTAATTCCCTCACCTTTTGCTTTTCTCTCCGAGCCGCTTTCCATATCTATTAACGCATAAAAAACTCTGCTGGCATTCACAAATGCGCAGGGGTAAAACGTTTCCTGTAGCACCGTGAGTTATACAAAGTATAACtca < 1:1125065/150‑3 (MQ=255) cATTCTGTTTTGTAATTCCCTCACCTTTTGCTTTTCTCTCCGAGCCGCTTTCCATATCTATTAACGCATAAAAAACTCTGCTGGCATTCACAAATGCGCAGGGGTAAAACGTTTCCTGTAGCACCGTGAGTTATACAAAGTATAACtcac < 2:1345252/150‑4 (MQ=255) cATTCTGTTTTGTAATTCCCTCACCTTTTGCTTTTCTCTCCGAGCCGCTTTCCATATCTATTAACGCATAAAAAACTCTGCTGGCATTCACAAATGCGCAGGGGTAAAACGTTTCCTGTAGCACCGTGAGTTATACAAAGTATAACtcac < 1:1443610/150‑4 (MQ=255) aTTCTGTTTTGTAATTCCCTCACCTTTTGCTTTTCTCTCCGAGCCGCTTTCCATATCTATTAACGCATAAAAAACTCTGCTGGCATTCACAAATGCGCAGGGGTAAAACGTTTCCTGTAGCACCGTGAGTTATACTTTGTATAACTTAag > 1:1340009/1‑150 (MQ=255) aTTCTGATTTGTAATTCCCTCACCTTTTCCTTTTCTCTCCGAGCCGCTTTCCATATCTATTAACTCATAAAAAACTCTGCTGGCATTCACAAATGCGCAGGCGTAAAACGTTTCCTGTAGCACCGTGAGTTATACAAAGTATAACtcacg < 2:407539/150‑5 (MQ=255) ttCTGTTTTGTAATTCACTCACCTTTTGCTTTTCTCTCCGAGCCGCTTTCCATATCTATTAACGCATAAAAAACTCTGCTGGCATTCACAAATGCGCAGGGGTAAAACGTTTCCTGTAGCACCGTGAGTTATACTTTGTATAACTTAagg < 2:1414413/150‑1 (MQ=255) gTTTTGTAATTCCCTCACCTTTTGCTTTTCTCTCCGAGCCGCTTTCCATATCTATTAACGCATAAAAAACTCTGCTGGCATTCACAAATGCGCAGGGGTAAAACGTTTCCTGTAGCACCGTGAGTTATACTTTGTATAACTTAAGGAGGt > 1:1450970/1‑150 (MQ=255) tttGTAATTCCCTCACCTTTTGCTTTTCTCTCCGAGCCGCTTTCCATATCTATTAACGCATAAAAAACTCTGCTGGCATTCACAAATGCGCAGGGGTAAAACGTTTCCTGTAGCACCGTGAGTTATACTTTGTATAACTTAAGGAGGTGc < 1:291630/150‑1 (MQ=255) tttGTAATTCCCTCACCTTTTGCTTTTCTCTCCGAGCCGCTTTCCATATCTATTAACGCATAAAAAACTCTGCTGGCATTCACAAATGCGCAGGGGTAAAACGTTTCCTGTAGCACCGTGAGTTATACTTTGTATAACTTAAGGAGGTGc > 1:315074/1‑150 (MQ=255) aaTTCCCTCACCTTTTGCTTTTCTCTCCGAGCCGCTTTCCATATCTATTAACGCATAAAAAACTCTGCTGGCATTCACAAATGCGCAGGGGTAAAACGTTTCCTGTAGCACCGTGAGTTATACTTTGTATAACTTAAGGAGGTGCAGATg < 2:1519635/150‑1 (MQ=255) cccTCACCTTTTGCTTTTCTCTCCGAGCCGCTTTCCATATCTATTAACGCATAAAAAACTCTGCTGGCATTCACAAATGCGCAGGGGTAAAACGTTTCCTGTAGCACCGTGAGTTATACTTTGTATAACTTAAGGAGGTGCAGATGCGTa > 1:106342/1‑150 (MQ=255) ccTCACCTTTTGCTTTTCTCTCCGAGCCGCTTTCCATATCTATTAACGCATAAAAAACTCTGCTGGCATTCACAAATGCGCAGGGGTAAAACGTTTCCTGTAGCACCGTGAGTTATACTTTGTATAACTTAAGGAGGTGCAGATGCGTAt > 1:803785/1‑150 (MQ=255) cACCTTTTGCTTTTCTCTCCGAGCCGCTTTCCATATCTATTAACGCATAAAAAACTCTGCTGGCATTCACAAATGCGCAGGGGTAAAACGTTTCCTGTAGCACCGTGAGTTATACTTTGTATAACTTAAGGAGGTGCAGATGCGTATTAc < 2:333919/150‑1 (MQ=255) ccTTTTGCTTTTCTCTCCGAGCCGCTTTCCATATCTATTAACGCATAAAAAACTCTGCTGGCATTCACAAATGCGCAGGGGTAAAACGTTTCCTGTAGCACCGTGAGTTATACTTTGTATAACTTAAGGAGGTGCAGATGc > 2:103432/1‑141 (MQ=255) ccTTTTGCTTTTCTCTCCGAGCCGCTTTCCATATCTATTAACGCATAAAAAACTCTGCTGGCATTCACAAATGCGCAGGGGTAAAACGTTTCCTGTAGCACCGTGAGTTATACTTTGTATAACTTAAGGAGGTGCAGATGc < 1:103432/141‑1 (MQ=255) ccTTTTGCTTTTCTCTCCGAGCCGCTTTCCATATCTATTAACGCATAAAAAACTCTGCTGGCATTCACAAATGCGCAGGGGTAAAACGTTTCCTGTAGCACCGTGAGTTATACTTTGTATAACTTAAGGAGGTGCAGATGCGTATTACCa < 2:1138132/150‑1 (MQ=255) ttttGCTTTTCTCTCCGAGCCGCTTTCCATATCTATTAACGCATAAAAAACTCTGCTGGCATTCACAAATGCGCAGGGGTAAAACGTTTCCTGTAGCACCGTGAGTTATACTTTGTATAACTTAAGGAGGTGCAGATGCGTATTACCATa > 2:291709/1‑150 (MQ=255) ttttGCTTTTCTCTCCGAGCCGCTTTCCATATCTATTAACGCATAAAAAACTCTGCTGGCATTCACAAATGCGCAGGGGTAAAACGTTTCCTGTAGCACCGTGAGTTATACTTTGTATAACTTAAGGAGGTGCAGATGCGTATTACCATa > 1:465572/1‑150 (MQ=255) gCTTTTCTCTCCGAGCCGCTTTCCATATCTATTAACGCATAAAAAACTCTGCTGGCATTCACAAATGCGCAGGGGTAAAACGTTTCCTGTAGCACCGTGAGTTATACTTTGTATAACTTAAGGAGGTGCAGATGCGTATTACCATaaaaa > 1:174462/1‑150 (MQ=255) gCTTTTCTCTCCGAGCCGCTTTCCATATCTATTAACGCATAAAAAACTCTGCTGGCATTCACAAATGCGCAGGGGTAAAACGTTTCCTGTAGCACCATGAGTTATACTTTGTATAACTTAAGGAGGTGCAGATGCGTATTACCATaaaaa < 1:642359/150‑1 (MQ=255) tctctcCGAGCCGCTTTCCATATCTATTAACGCATAAAAAACTCTGCTGGCATTCACAAATGCGCAGGGGTAAAACGTTTCCTGTAGCACGGTGTGTTATACTTTGTATATCTTAAGGAGGTGCAGATGCGTATTACCATAAAAAGATgg < 2:287652/150‑1 (MQ=255) ctctcCGAGCCGCTTTCCATATCTATTAACGCATAAAAAACTCTGCTGGCATTCACAAATGCGCAGGGGTAAAACGTTTCCTGTAGCACCGTGAGTTATACTTTGTATAACTTAAGGAGGTGCAGATGCGTATTACCATAAAAAGATggg < 1:915829/150‑1 (MQ=255) ctcCGAGCCGCTTTCCATATCTATTAACGCATAAAAAACTCTGCTGGCATTCACAAATGCGCAGGGGTAAAACGTTTCCTGTAGCACCGTTAGTTATACTTTGTATAACTTAAGGAGGTGCAGATGCGTATTACCATAAAAAGATggggg < 2:1447285/150‑1 (MQ=255) ctcCGAGCCGCTTTCCATATCTATTAACGCATAAAAAACTCTGCTGGCATTCACAAATGCGCAGGGGTAAAACGTTTCCTGTAGCACCGTGAGTTATACTTTGTATAACTTAAGGAGGTGCAGATGCGTATTACCATAAAAAGATggggg < 2:283259/150‑1 (MQ=255) ctcCGAGCCGCTTTCCATATCTATTAACGCATAAAAAACTCTGCTGGCATTCACAAATGCGCAGGGGTAAAACGTTTCCTGTAGCACCGTGAGTTATACTTTGTATAACTTAAGGAGGTGCAGATGCGTATTACCATAAAAAGATggggg > 1:983695/1‑150 (MQ=255) ctcCGAGCCGCTTTCCATATCTATTAACGCATAAAAAACTCTGCTGGCATTCACAAATGCGCAGGGGTAAAACGTTTACTGTAGCACCGTGAGTTATACTTTGTATAACTTAAGGAGGTGCAGATGCGTATTACCATAAAAAGATggggg > 2:64587/1‑150 (MQ=255) ccGAGCCGCTTTCCATATCTATTAACGCATAAAAAACTCTGCTGGCATTCACAAATGCGCAGGGGTAAAACGTTTCCTGTAGCACCGTGAGTTATACTTTGTATAACTTAAGGAGGTGCAGATGCGTATTACCATAAAAAGATGGGGGaa < 2:1382801/150‑1 (MQ=255) cGAGCCGCTTTCCATATCTATTAACGCATAAAAAACTCTGCTGGCATTCACAAATGCGCAGGGGTAAAACGTTTCCTGTAGCACCGTGAGTTATACTTTGTATAACTTAAGGAGGTGCAGATGCGTATTACCATAAAAAGATGGGGGAAc < 2:193176/150‑1 (MQ=255) gCTTTCCATATCTATTAACGCATAAAAAACTCTGCTGGCATTCACAAATGCGCAGGGGTAAAACGTTTCCTGTAGCACCGTGAGTTATACTTTGTATAACTTAAGGAGGTGCAGATGCGTATTACCATAAAAAGATGGGGGAACAGTGCa < 1:1301456/150‑1 (MQ=255) tttCCATATCTATTAACGCATAAAAAACTCTGCTGGCATTCACAAATGCGCAGGGGTAAAACGTTTCCTGTAGCACCGTGAGTTATACTTTGTATAACTTAAGGAGGTGCAGATGCGTATTACCATAAAAAGATGGGGGAACAGTGCAgg < 2:1538682/150‑1 (MQ=255) tCCATATCTATTAACGCATAAAAAACTCTGGTGGCATTCACAAATGCGCAGGGGTAAAACGTTTCCTGTAGCACCGTGAGTTATACTTTGTATAACTTAAGGAGGTGCAGATGCGTATTACCATAAAAAGATGGGGGAACAGTGCAGGTa < 1:1208272/150‑1 (MQ=255) tCCATATCTATTAACGCATAAAAAACTCTGCTGGCATTCACAAATGCGCAGGGGTAAAACGTTTCCTGTAGCACCGTGAGTTATACTTTGTATAACTTAAGGAGGTGCAGATGCGTATTACCATAAAAAGATGGGGGAACAGTGCAGGtg < 1:1073239/150‑2 (MQ=255) tCCATATCTATTAACGCATAAAAAACTCTGCTGGCATTCACAAATGCGCAGGGGTAAAACGTTTCCTGTAGCACCGTGAGTTATACTTTGTATAACTTAAGGAGGTGCAGATGCGTATTACCATAAAAAGATGGGGGAACAGTGCAGGTa < 2:931058/150‑1 (MQ=255) cATATCTATTAACGCATAAAAAACTCTGCTGGCATTCACAAATGCGCAGGGGTAAAACGTTTCCTGTAGCACCGTGAGTTATACTTTGTATAACTTAAGGAGGTGCAGATGCGTATTACCATAAAAAGATGGGGGAACAGTGCAGGTATg > 1:832979/1‑150 (MQ=255) atatCTATTAACGCATAAAAAACTCTGCTGGCATTCACAAATGCGCAGGGGTAAAACGTTTCCTGTAGCACCGTGAGTTATACTTTGTATAACTTAAGGAGGTGCAGATGCGTATTACCATAAAAAGATGGGGGAACAGTGCAGGTATgg > 2:398471/1‑150 (MQ=255) ttAACGCATAAAAAACTCTGCTGGCATTCACAAATGCGCAGGGGTAAAACGTTTCCTGTAGCACCGTGAGTTATACTTTGTATAACTTAAGGAGGTGCAGATGCGTATTACCATAAAAAGATGGGGGAACAGTGCAGGTATGGTCATTcc > 1:1180962/1‑150 (MQ=255) aaCGCATAAAAAACTCTGCTGGCATTCACAAATGCGCAGGGGTAAAACGTTTCCTGTAGCACCGTGAGTTATACTTTGTATAACTTAAGGAGGTGCAGATGCGTATTACCATAAAAAGATGGGGGAACAGTGCAGGTATGGTCATTCCCa > 1:311847/1‑150 (MQ=255) aaCGCATAAAAAACTCTGCTGGCATTCACAAATGCGCAGGGGTAAAACGTTTCCTGTAGCACCGTGAGTTATACTTTGTATAACTTAAGGAGGTGCAGATGCGTATTACCATAAAAAGATGGGGGAACAGTGCAGGTATGGTCATTCCCa > 1:306351/1‑150 (MQ=255) cATAAAAAACTCTGCTGGCATTCACAAATGCGCAGGGGTAAAACGTTTCCTGTAGCACCGTGAGTTATACTTTGTATAACTTAAGGAGGTGCAGATGCGTATTACCATAAAAAGATGGGGGAACAGTGCAGGTATGGTCATTCCCAatat > 1:1121026/1‑150 (MQ=255) aaaaaaaaATCTGAAGGCAAACACAAAAGCGCAGGGGTAAAAACTTTCCTCTAGAACACAGAAATATAAATTGTATAACTTAAGTAGGTGCAGATGCGTATTACCATAAAAAGATGGGGGAACAGTGAAGGAATGGTCATTCCCAATATc > 2:21141/3‑150 (MQ=255) aTAAAAAACTCTGCTGGCATTCACAAATGCGCAGGGGTAAAACGTTTCCTGTAGCACCGTGAGTTATACTTTGTATAACTTAAGGAGGTGCAGATGCGCATTACCATAAAAAGATGGGGGAACAGTGCAGGTATGGTCATTCCCAATATc > 1:404513/1‑150 (MQ=255) tAAAAAACTCTGCTGGCATTCATAAATGCGCAGGGGTAAAACGTTTCCTGTAGCACCGTGAGTTATACTTTGTATAACTTAAGGAGGTGCAGATGCGTATTACCATAAAAAGATGGGGGAACAGTGCAGGTATGGTCATTCCCAATATCg < 2:200686/150‑1 (MQ=255) tAAAAAACTCTGCTGGCATTCACAAATGCGCATGGGTAAAACGTTTCCTGTACCACCGTGAGTTATACTTTGTATAACTTAAGGATGTGCATATGCGTATTACCATAAAAAGATGGGGGAACAGTGCAGGTATGGTCATTCCCAATATCg < 1:714058/150‑1 (MQ=255) tAAAAAACTCTGCTGGCATTCACAAATGCGCAGGGGTAAAACGTTTCCTGTAGCACCGTGAGTTATACTTTGTATAACTTAAGGAGGTGCAGATGCGTATTACCATAAAAAGATGGGGGAACAGTGCAGGTATGGTCATTCCCAATATCg > 1:1505542/1‑150 (MQ=255) aaaaaCTCTGCTGGCATTCACAAATGCGCAGGGGTAAAACGTTTCCTGTAGCACCGTGAGTTATACTTTGTATAACTTAAGGAGGTGCAGATGCGTATTACCATAAAAAGATGGGGGAACAGTGCAGGTATGGTCATTCCCAATATCGTa < 1:349440/150‑1 (MQ=255) aaaaaCTCTGCTGGCATTCACAAATGCGCAGGGGTAAAACGTTTCCTGTAGCACCGTGAGTTATACTTTGTATAACTTAAGGAGGTGCAGATGCGTATTACCATAAAAAGATGGGGGAACAGTGCAGGTATGGTCATTCCCAATATCGTa > 2:508227/1‑150 (MQ=255) aaCTCTGCTGGCATTCACAAATGCGCATGGGTAAAACGTTTCCTGTAGCACCGTGAGTTATACTTTGTATAACTTAAGGAGGTGCAGATGCGTATTACCATAAAAAGATGGGGGAACAGTGCAGGTATGGTCATTCCCAATATCGTAATg < 1:533667/150‑1 (MQ=255) aaCTCTGCTGGCATTCACAAATGCGCAGGGGTAAAACGTTTCCTGTAGCACCGTGAGTTATACTTTGTATAACTTAAGGAGGTGCAGATGCGTATTACCATAAAAAGATGGGGGAACAGTGCAGGTATGGTCATTCCCAATATCGTAATg < 1:508227/150‑1 (MQ=255) aCTCTGCTGGCATTCACAAATGCGCAGGGGTAAAACGTTTCCTGTAGCACCGTGAGTTATACTTTGTATAACTTAAGGAGGTGCAGATGCGTATTACCATAAAAAGATGGGGGAACAGTGCAGGTATGGTCATTCCCAATATCGTAATGa < 2:383644/150‑1 (MQ=255) ctctGCTGGCATTCACAAATGCGCAGGGGTAAAACGTTTCCTGTAGCACCGTGAGTTATACTTTGTATAACTTAAGGAGGTGCAGATGCGTATTACCATAAAAAGATGGGGGAACAGTGCAGGTATGGTCATTCCCAATATCGTAATGaa > 2:1147872/1‑150 (MQ=255) ctgctgGCATTCACAAATGCGCAGGGGTAAAACGTTTCCTGTAGCACCGTGAGTTATACTTTGTATAACTTAAGGAGGTGCAGATGCGTATTACCATAAAAAGATGGGGGAACAGTGCAGGTATGGTCATTCCCAATATCGTAATGAAAg < 2:315074/150‑1 (MQ=255) gctgGCATTCACAAATGCGCAGGGGTAAAACGTTTCCTGTAGCACCGTGAGTTATACTTTGTATAACTTAAGGAGGTGCAGATGCGTATTACCATAAAAAGATGGGGGAACAGTGCAGGTATGGTCATTCCCAATATCGTAATGAAAGaa > 2:1032178/1‑150 (MQ=255) gctgGCATTCACAAATGCGCAGGGGTAAAACGTTTCCTGTAGCACCGTGAGTTATACTTTGTATAACTTAAGGAGGTGCAGATGCGTATTACCATAAAAAGATGGGGGAACAGTGCAGGTATGGTCATTCCCAATATCGTAATGAAAGaa > 1:1425186/1‑150 (MQ=255) ctgGCATTCACAAATGCGCAGGGGTAAAACGTTTCCTGTAGCACCGTGAGTTATACTTTGTATAACTTAAGGAGGTGCAGATGCGTATTACCATAAAAAGATGGGGGAACAGTGCAGGTATGGTCATTCCCAATATCGTAATGAAAGaac < 1:291709/150‑1 (MQ=255) tgGCATTCACAAATGCGCAGGGGTAAAACGTTTCCTGTAGCACCGTGAGTTATACTTTGTATAACTTAAGGAGGTGCAGATGCGTATTACCATAAAAAGATGGGGGAACAGTGCAGGTATGGTCATTCCCAATATCGTAATGAAAGaact < 2:1355940/150‑1 (MQ=255) gCATTCACAAATGCGCAGGGGTAAAACGTTTCCTGTAGCACCGTGAGTTATACTTTGTATAACTTAAGGAGGTGCAGATGCGTATTACCATAAAAAGATGGGGGAACAGTGCAGGTATGGTCATTCCCAATATCGTAATGAAAGaactta < 2:1340892/150‑1 (MQ=255) aTTCACAAATGCGCAGGGGTAAAACGTTTCCTGTAGCACCGTGAGTTATACTTTGTATAACTTAAGGAGGTGCAGATGCGTATTACCATAAAAAGATGGGGGAACAGTGCAGGTATGGTCATTCCCAATATCGTAATGAAAGaacttaac < 2:1450970/150‑1 (MQ=255) tCACAAATGCGCAGGGGTAAAACGTTTCCTGTAGCACCGTGAGTTATACTTTGTATAACTTAAGGAGGTGCAGATGCGTATTACCATAAAAAGATGGGGGAACAGTGCAGGTATGGTCATTCCCAATATCGTAATGAAAGaacttaactt < 2:263064/150‑1 (MQ=255) cacaAATGCGCAGGGGTAAAACTTTTCCTGTAGCACCGTGAGTTATACTTTGTATAACTTAAGGAGGTGCAGATGCGTATTACAATAAAAAGATGGGGGAACAGTGCAGGTATGGTCATTCCCAATATCGTAATGAAAGAacttaactta > 2:539275/1‑150 (MQ=255) cacaAATGCGCAGGGGTAAAACGTTTCCTGTAGCACCGTGAGTTATACTTTGTATAACTTAAGGAGGTGCAGATGCGTATTACCAt < 2:541573/86‑1 (MQ=255) cacaAATGCGCAGGGGTAAAACGTTTCCTGTAGCACCGTGAGTTATACTTTGTATAACTTAAGGAGGTGCAGATGCGTATTACCAt > 1:541573/1‑86 (MQ=255) caAATGCGCAGGGGTAAAACGTTTCCTGTAGCACCGTGAGTTATACTTTGTATAACTTAAGGAGGTGCAGATGCGTATTACCATAAAAAGATGGGGGAACAGTGCAGGTATGGTCATTCCCAATATCGTAATGAAAGAACTTAACTTACa < 2:465572/150‑1 (MQ=255) caAATGCGCAGGGGTAAAACGTTTCCTGTAGCACCGTGAGTTATACTTTGTATAACTTAAGGAGGTGCAGATGCGTATTACCATAAAAAGATGGGGGAACAGTGCAGGTATGGTCATTCCCAATATCGTAATGAAAGAACTTAACTTACa > 2:969825/1‑150 (MQ=255) aaaTGCGCAGGGGTAAAACGTTTCCTGTAGCACCGTGAGTTATACTTTGTATAACTTAAGGAGGTGCAGATGCGTATTACCATAAAAAGATGGGGGAACAGTGCAGGTATGGTCATTCCCAATATCGTAATGAAAGAACTTAACTTACAg < 1:620226/150‑1 (MQ=255) cgcAGGGGTAAAACGTTTCCTGTAGCACCGTGAGTTATACTTTGTATAACTTAAGGAGGTGCAGATGCGTATTACCATAAAAAGATGGGGGAACAGTGCAGGTATGGTCATTCCCAATATCGTAATGAAAGAACTTAACTTACAGCCggg > 2:1143201/1‑150 (MQ=255) ggggTAAAACGTTTCCTGTAGCACCGTGAGTTATACTTTGTATAACTTAAGGAGGTGCAGATGCGTATTACCATAAAAAGATGGGGGAACAGTGCAGGTATGGTCATTCCCAATATCGTAATGAAAGAACTTAACTTACAGCCGGGGCag > 1:43038/1‑150 (MQ=255) ggggTAAAACGATTCCTGAAGCACCGTGAGTTATACTTTGAATAACTTAAGGAGGTGCAGATGCGTATGACCATAAAAAGATGCGGGAACAGTGCAGGTATGGTCATTCCGAATATCGTAATGAAAGAACTTAACTTCCAGCCGGGGCag > 2:464441/1‑150 (MQ=255) tAAAACGTTTCCTGTAGCACCGTGAGTTATACTTTGTATAACTTAAGGAGGTGCAGATGCGTATTACCATAAAAAGATGGGGGAACAGTGCAGGTATGGTCATTCCCAATATCGTAATGAAAGAACTTAACTTACAGCCGGGGCAGAGCg > 1:552384/1‑150 (MQ=255) tAAAACGTTTCCTGTAGCACCGTGAGTTATACTTTGTATAACTTAAGGAGGTGCAGATGCGTATTACCATAAAAAGATGGGGGAACAGTGCAGGTATGGTCATTCCCAATATCGTAATGAAAGAACTTAACTTACAGCCGGGGCAGAGCg > 1:557724/1‑150 (MQ=255) aaaaCGTTTCCTGTAGCACCGTGAGTTATACTTTGTATAACTTAAGGAGGTGCAGATGCGTATTACCATAAAAAGATGGGGGAACAGTGCAGGTATGGTCATTCCCAATATCGTAATGAAAGAACTTAACTTACAGCCGGGGCAGAGCGt > 2:1188381/1‑150 (MQ=255) aaCGTTTCCTGTAGCACCGTGAGTTATACTTTGTATAACTTAAGGAGGTGCAGATGCGTATTACCATAAAAAGATGGGGGAACAGTGCAGGTATGGTCATTCCCAATATCGTAATGAAAGAACTTAACTTACAGCCGGGGCAGAGCGTgg > 1:1150508/1‑150 (MQ=255) aaCGTTTCCTGTAGCACCGTGAGTTATACTTTGTATAACTTAAGGAGGTGCAGATGCGTATTACCATAAAAAGATGGGGGAACAGTGCAGGTATGGTCATTCCCAATATCGTAATGAAAGAACTTAACTTACAGCCGGGGCAGAGCGTgg < 2:243590/150‑1 (MQ=255) aCGTTTCCTGTAGCACCGTGAGTTATACTTTGTATAACTTAAGGAGGTGCAGATGCGTATTACCATAAAAAGATGGGGGAACAGTGCAGGTATGGTCATTCCCAATATCGTAATGAAAGAACTTAACTTACAGCCGGGGCAGAGCGTGGa < 2:103012/150‑1 (MQ=255) cGTTTCCTGTAGCACCGTGAGTTATACTTTGTATAACTTAAGGAGGTGCAGATGCGTATTACCATAAAAAGATGGGGGAACAGTGCAGGTATGGTCATTCCCAATATCGTAATGAAAGAACTTAACTTACAGCCGGGGCAGAGCGTGGAg < 2:803785/150‑1 (MQ=255) gTTTCCTGTAGCACCGTGAGTTATACTTTGTATAACTTAAGGAGGTGCAGATGCGTATTACCATAAAAAGATGGGGGAACAGTGCAGGTATGGTCATTCCCAATATCGTAATGAAAGAACTTAACTTACAGCCGGGGCAGAGCGTGGAgg < 2:1340009/150‑1 (MQ=255) tCCTGTAGCACCGTGAGTTATACTTTGTATAACTTAAGGAGGTGCAGATGCGTATTACCATAAAAAGATGGGGGAACAGTGCAGGTATGGTCATTCCCAATATCGTAATGAAAGaact > 1:1103904/1‑118 (MQ=255) tCCTGTAGCACCGTGAGTTATACTTTGTATAACTTAAGGAGGTGCAGATGCGTATTACCATAAAAAGATGGGGGAACAGTGCAGGTATGGTCATTCCCAATATCGTAATGAAAGaact < 2:1103904/118‑1 (MQ=255) ccTGTAGCACCGTGAGTTATACTTTGTATAACTTAAGGAGGTGCAGATGCGTATTACCATAAAAAGATGGGGGAACAGTGCAGGTATGGTCATTCCCAATATCGTAATGAAAGAACTTAACTTACAGCCGGGGCAGAGCGTTGAGGCGCa < 2:1121026/150‑1 (MQ=255) ccTGTAGCACCGTGAGTTATACTTTGTATAACTTAAGGAGGTGCAGATGCGTATTACCATAAAAAGATGGGGGAACAGTGCAGGTATGGTCATTCCCAATATCGTAATGAAAGAACTTAACTTACAGCCGGGGCAGAGCGTGGAGGCGCa > 1:97396/1‑150 (MQ=255) cTGTAGCACCGTGAGTTATACTTTGTATAACTTAAGGAGGTGCAGATGCGTATTACCATAAAAAGATGGGGGAACAGTGCAGGTATGGTCATTCCCAATATCGTAATGAAAGAACTTAACTTACAGCCGGGGCagag > 2:9033/1‑137 (MQ=255) cTGTAGCACCGTGAGTTATACTTTGTATAACTTAAGGAGGTGCAGATGCGTATTACCATAAAAAGATGGGGGAACAGTGCAGGTATGGTCATTCCCAATATCGTAATGAAAGAACTTAACTTACAGCCGGGGCagag < 1:9033/137‑1 (MQ=255) tccttaaGTTATACAAAGTATAACTTAAGGAGGTGCAGATGCGTATTACCATAAAAAGATGGGGGAACAGTGCAGGTATGGTCATTCCCAATATCGTAATGAAAGAACTTAACTTACAGCCGGGGCAGAGCGTGGAGGCGCAAGTGAGca > 2:1391377/7‑150 (MQ=255) aCCGTGAGTTATACTTTGTATAACTTAAGGAGGTGCAGATGCGTATTACCATAAAAAGATGGGGGAACAGTGCAGGTATGGTCATTCCCAATATCGTAATGAAAGAACTTAACTTACAGCCGGGGCAGAGCGTGGAGGCGCAAGTGAGca < 2:571968/150‑1 (MQ=255) cttaaGTTATACAAAGTATAACTTAAGGAGGTGCAGATGCGTATTACCATAAAAAGATGGGGGAACAGTGCAGGTATGGTCATTCCCAATATCGTAATGAAAGAACTTAACTTACAGCCGGGGCAGAGCGTgg > 1:1236331/5‑133 (MQ=255) gTGAGTTATACTTTGTATAACTTAAGGAGGTGCAGATGCGTATTACCATAAAAAGATGGGGGAACAGTGCAGGTATGGTCATTCCCAATATCGTAATGAAAGAACTTAACTTACAGCCGGGGCAGAGCGTGGAGGCGCAAGTGAGcaaca > 1:807230/1‑150 (MQ=255) gAGTTATACTTTGTATAACTTAAGGAGGTGCAGATGCGTATTACCATAAAAAGATGGGGGAACAGTGCAGGTATGGTCATTCCCAATATCGTAATGAAAGAACTTAACTTACAGCCGGGGCAGAGCGTGGAGGCGCAAGTGAGCAACAAt < 2:9690/150‑1 (MQ=255) aGTTATACTTTGTATAACTTAAGGAGGTGCAGATGCGTATTACCATAAAAAGATGGGGGAACAGTGCAGGTATGGTCATTCCCAATATCGTAATGAAAGAACTTAACTTACAGCCGGGGCAGAGCGTGGAGGCGCAAGTGAGCAACAATc < 1:1032178/150‑1 (MQ=255) aGTTATACAAAGTATAACTTAAGGAGGTGCAGATGCGTATTACCATAAAAAGATGGGGGAACAGTGCAGGTATGGTCATTCCCAATATCGTAATGAAAGAACTTAACTTACAGCCGGGGCAGAGCGTGGAGGCGCAAGTGAGCAACAATc > 1:1447615/1‑150 (MQ=255) gTTATACAAAGTATAACTTAAGGAGGTGCAGATGCGTATTACCATAAAAAGATGGGGGAACAGTGCAGGTATGGTCATTCCCAATATCGTAATGAAAGAACTTAACTTACAGCCGGGGCAGAGCGTGGAGGCGCAAGTGAGCAACAATCa > 1:405414/1‑150 (MQ=255) tataCTTTGTATAACTTAAGGAGGTGCAGATGCGTATTACCATAAAAAGATGGGGGAACAGTGCAGGTATGGTCATTCCCAATATCGTAATGAAAGAACTTAACTTACAGCCGGGGCAGAGCGTGGAGGCGCAAGTGAGCAACAATCAAc < 2:1425186/150‑1 (MQ=255) ataCTTTGTATAACTTAAGGAGGTGCAGATGCGTATTACCATAAAAAGATGGGGGAACAGTGCAGGTATGGTCATTCCCAATATCGTAATGAAAGAACTTAACTTACAGCCGGGGCAGAGCGTGGAGGCGCAAGTGAGCAACAATCAACt > 2:853818/1‑150 (MQ=255) ttGTATAACTTAAGGAGGTGCAGATGCGTATTACCATAAAAAGATGGGGGAACAGTGCAGGTATGGTCATTCCCAATATCGTAATGAAAGAACTTAACTTACAGCCGGGGCAGAGCGTGGAGGCGCAAGTGAGCAACAATCAACTGATTc > 1:880408/1‑150 (MQ=255) | GACGACTCGCATTCTGTTTTGTAATTCCCTCACCTTTTGCTTTTCTCTCCGAGCCGCTTTCCATATCTATTAACGCATAAAAAACTCTGCTGGCATTCACAAATGCGCAGGGGTAAAACGTTTCCTGTAGCACCGTGAGTTATACTTTGTATAACTTAAGGAGGTGCAGATGCGTATTACCATAAAAAGATGGGGGAACAGTGCAGGTATGGTCATTCCCAATATCGTAATGAAAGAACTTAACTTACAGCCGGGGCAGAGCGTGGAGGCGCAAGTGAGCAACAATCAACTGATTC > NC_000913/4448278‑4448573 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |