Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 87,881 | A→G | 5.1% | intergenic (+33/‑147) | ilvH → / → cra | acetolactate synthase/acetohydroxybutanoate synthase, regulatory subunit/DNA‑binding transcriptional dual regulator Cra |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 87,881 | 0 | A | G | 5.1% | 368.1 / 6.1 | 118 | intergenic (+33/‑147) | ilvH/cra | acetolactate synthase/acetohydroxybutanoate synthase, regulatory subunit/DNA‑binding transcriptional dual regulator Cra |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (53/59); new base G (2/4); total (55/63) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.84e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 122 total aligned reads displayed.
GGCACCAGCGGTAAGCTTGATGCATTTTTAGCATCGATTCGCGATGTGGCGAAAATTGTGGAGGTTGCTCGCTCTGGTGTGGTCGGACTTTCGCGCGGCGATAAAATAATGCGTTGAGAATGATCTCAATGCGCAATTTACAGCCCAACATGTCACGTTGGGCTTTTTTTGCGAAATCAGTGGGAACCTGGAATAAAAGCAGTTGCCGCAGTTAATTTTCTGCGCTTAGATGTTAATGAATTTAACCCATACCAGTACAATGGCTATGGTTTTTACATTTTACGCAAGGGGCAATTGTG > NC_000913/87732‑88030 | ggCACCAGCGGTAAGCTTGATGCATTTTTAGCATCGATTCGCGATGTGGCGAAAATTGTGGAGGTTGCTCGCTCTGGTGTGGTCGGACTTTCGCGCGGCGATAAAATAATGCGTTGAGAATGATCTCAATGCGCAATTTACAGCCCAACa > 2:929502/1‑150 (MQ=255) ggCACCAGCGGTAAGCTTGATGCATTTTTAGCACCGATTCGCGATGTGGCGAAAATTGTGGAGGTTGCTCGCTCTGGTGTGGTCGGACTTTCGCGCGGCGATAAAATAATGCGTTGAGAATGATCTCAATGCGCAATTTACAGCCCAACa > 1:253930/1‑150 (MQ=255) ggTAAGCTTGATGAATTTTTAGCATCGATTCGGGATGTGGCGAAAATTGTGGAGGTTGCTCGCTCTGGTGTGGTCGGACTTTCGCGCGTCGATAAAATAATGCGTTGAGAATGATCTCAATGCGCAATTTACAGCCCAACATGTCACGtt < 2:221561/150‑1 (MQ=255) gTAAGCTTGATGCATTTTTAGCATCGATTCGCGATGTGGCGAAAATTGTGGAGGGTGCGCGCTCTTGTGTGGGCGGACTTGCGCGCGGCGATAAAATAATGCGTTGAGAATGATCTCAATGCGCAATTTACAGCCCAACATGTCACGTTg < 2:182690/150‑1 (MQ=255) tAAGCTTGATGCATTTTTAGCATCGATTCGCGATGTGGCGAAAATTGTGGAGGTTGCTCGCTCTGGTGTGGTCGGACTTTCGCGCGGCGATAAAATAATGCGTTGAGAATGATCTCAATGCGCAATTTACAGCCCAACATGTCACGTTgg < 2:1200166/150‑1 (MQ=255) aGCTTGATGCATTTTTAGCATCGATTCGCGATGTGGCGAAAATTGTGGAGGTTGCTCGCTCTGGTGTGGTCGGACTTTCGCGCGGCGATAAAATAATGCGTTGAGAATGATCTCAATGCGCAATTTACAGCCCAACATGTCACGTTGGGc < 2:438684/150‑1 (MQ=255) aGCTTGATGCATTTTTAGCATCGATTCGCGATGTGGCGAAAATTGTGGAGGTTGCTCGCTCTGGTGTGGGCGGACTTTCGCGCGGCGATAAAATAATGCGTTGAGAATGATCTCAATGCGCAATTTACAGCCCAACATGTCACGTTGGGc < 2:1096719/150‑1 (MQ=255) gCTTGATGCATTTTTAGCATCGATTCGCGATGTGGCGAAAATTGTGGAGGTTGCTCGCTCTGGTGTGGTCGGACTTTCGCGCGGCGATAAAATAATGCGTTGAGAATGATCTCAATGCGCAATTTACAGCCCAACGTGACATGTTGGGCt < 1:1483867/150‑1 (MQ=255) gCTTGATGCATTTTTAGCATCGATTCGCGATGTGGCGAAAATTGTGGAGGTTGCTCGCTCTGGTGTGGTCGGACTTTCGCGCGGCGATAAAATAATGCGTTGAGAATGATCTCAATGCGCAATTTACAGCCCAACATGTCACGTTGGGCt > 1:120096/1‑150 (MQ=255) ttGATGCATTTTTAGCATCGATTCGCGATGTGGCGAAAATTGTGGAGGTTGCTCGCTCTGGTGTGGTCGGACTTTCGCGCGGCGATAAAATAATGCGTTGAGAATGATCTCAATGCGCAATTTACAGCCCAACGTGACATGTTGGGCtgt < 1:408925/150‑3 (MQ=255) ttGATGCATTTTTAGCATCGATTCGCGATGTGGCGAAAATTGTGGAGGTTGCTCGCTCTGGTGTGGTCGGACTTTCGCGCGGCGATAAAATAATGCGTTGAGAATGATCTCAATGCGCAATTTACAGCCCAACGTGACATGTTGGGCtgt < 1:1482732/150‑3 (MQ=255) gATGCATTTTTAGCATCGATTCGCGATGTGGCGAAAATTGTGGAGGTTGCTCGCTCTGGTGTGGTCGGACTTTCGCGCGGCGATAAAATAATGCGTTGAGAATGATCTCAATGCGCAATTTACAGCCCAACATGTCACGTTGGGCttttt < 1:596014/150‑1 (MQ=255) aTGCATTTTTAGCATCGATTCGCGATGTGGCGAAAATTGTGGAGGTTGCTCGCTCTGGTGTGGTCGGACTTTCGCGCGGCGATAAAATAATGCGTTGAGAATGATCTCAATGCGCAATTTACAGCCCAACATGTCACGTTGGGCtttttt > 2:1016933/1‑150 (MQ=255) aTGCATTTTTAGCATCGATTCGCGATGTGGCGAAAATTGTGGAGGTTGCTCGCTCTGGTGTGGTCGGACTTTCGCGCGGCGATAAAATAATGCGTTGAGAATGATCTCAATGCGCAATTTACAGCCCAACATGTCACGTTGGGCtttttt < 2:1322017/150‑1 (MQ=255) gCATTTTTAGCATCGATTCGCGATGTGGCGAAAATTGTGGAGGTTGCTCGCTCTGGTGTGGTCGGACTTTCGCGCGGCGATAAAATAATGCGTTGAGAATGATCTCAATGCGCAATTTACAGCCCAACATGTCACGTTGGGCTTTTTTTg < 1:835880/150‑1 (MQ=255) gCATTTTTAGCATCGATTCGCGATGTGGCGAAAATTGTGGAGGTTGCTCGCTCTGGTGTGGTCGGACTTTCGCGCGGCGATAAAATAATGCGTTGAGAATGATCTCAATGCGCAATTTACAGCCCAACATGTCACGTTGGGCTTTTTTTg > 2:1202425/1‑150 (MQ=255) cATTTTTAGCATCGATTCGCGATGTGGCGAAAATTGTGGAGGCTGCTCGCTCTGGTGTGGTCGGACTTGCGCGCGGCGATAAAATAATGCGTTGAGAATGATCTCAATGCGCAATTTACAGCCCAACATGTCACGGTGGGCTTTTTTTGc < 1:192409/150‑1 (MQ=255) aTTTTTAGCATCGATTCGCGATGTGGCGAAAATTGTGGAGGTTGCTCGCTCTGGTGTGGTCGGACTTTCGCGCGGCGATAAAATAATGCGTTGAGAATGATCTCAATGCGCAATTTACAGCCCAACATGTCACGTTGGGCTTTTTTTGCg < 2:202766/150‑1 (MQ=255) tttttAGCATCGATTCGCGATGTGGCGAAAATTGTGGAGGTTGCTCGCTCTGGTGTGGTCGGACTTTCGCGCGGCGATAAAATAATGCGTTGAGAATGATCTCAATGCGCAATTTACAGCCCAACATGTCACGTTGGGCTTTTTTTGCGa < 1:91876/150‑1 (MQ=255) tttttAGCATCGATTCGCGATGTGGCGAAAATTGTGGAGGTTGCTCGCTCTGGTGTGGTCGGACTTTCGCGCGGCGATAAAATAATGCGTTGAGAATGATCTCAATGCGCAATTTACAGCCCAACATGTCACGTTGGGCTTTTTTTGCGa < 1:247115/150‑1 (MQ=255) tAGCATCGATTCGCGATGTGGCGAAAATTGTGGAGGTTGCTCGCTCTGGTGTGGTCGGACTTTCGCGCGGCGATAAAATAATGCGTTGAGAATGATCTCAATGCGCAATTTACAGCCCAACATGTCACGTTGGGCTTTTTTTGCGAAATc < 1:1501111/150‑1 (MQ=255) tAGCATCGATTCGCGATGTGGCGAAAATTGTGGAGGTTGCTCGCTCTGGTGTGGTCGGACTTTCGCGCGGCGATAAAATAATGCGTTGAGAATGATCTCAATGCGCAATTTACAGCCCAACATGTCACGTTGGGCTTTTTTTGCGAAATc < 1:456343/150‑1 (MQ=255) aGCATCGATTCGCGATGTGGCGAAAATTGTGGAGGTTGCTCGCTCTGGTGTGGTCGGACTTTCGCGCGGCGATAAAATAATGCGTTGAGAATGATCTCAATGCGCAATTTACAGCCCAACATGTCACGTTGGGCTTTTTTTGCGAAATCa > 2:750421/1‑150 (MQ=255) gCATCGATTCGCGATGTGGCGAAAATTGTGGAGGTTGCTCGCTCTGGTGTGGTCGGACTTTCGCGCGGCGATAAAATAATGCGTTGAGAATGATCTCAATGCGCAATTTACAGCCCAACATGTCACGTTGGGCTTTTTTTGCGAAATCAg > 2:1372255/1‑150 (MQ=255) cATCGATTCGCGATGTGGCGAAAATTGTGGAGGTTGCTCGCTCTGGTGTGGTCGGACTTTCGCGCGGCGATAAAATAATGCGTTGAGAATGATCTCAATGCGCAATTTACAGCCCAACATGTCACGTTGGGCTTTTTTTGCGAAATCAGt > 1:1060305/1‑150 (MQ=255) aTCGATTCGCGATGTGGCGAAAATTGTGGAGGTTGCTCGCTCTGGTGTGGTCGGACTTTCGCGCGGCGATAAAATAATGCGTTGAGAATGATCTCAATGCGCAATTTACAGCCCAACATGTCACGTTGGGCTTTTTTTGCGAAATCAGTg < 1:968399/150‑1 (MQ=255) tCGATTCGCGATGTGGCGAAAATTGTGGAGGTTGCTCGCTCTGGTGTGGTCGGACTTTCGCGCGGCGATAAAATAATGCGTTGAGAATGATCTCAATGCGCAATTTACAGCCCAACATGTCACGTTGGGCTTTTTTTGCGAAATCAGTgg > 2:597010/1‑150 (MQ=255) cGATTCGCGATGTGGCGAAAATTGTGGAGGTTGCTCGCTCTGGTGTGGTCGGACTTTCGCGCGGCGATAAAATAATGCGTTGAGAATGATCTCAATGCGCAATTTACAGCCCAACATGTCACGTTGGGCTTTTTTTGCGAAATCAGTggg > 1:1535752/1‑150 (MQ=255) aTTCGCGATGTGGCGAAAATTGTGGAGGTTGCTCGCTCTGGTGTGGTCGGACTTTCGCGCGGCGATAAAATAATGCGTTGAGAATGATCTCAATGCGCAATTTACAGCCCAACATGTCACGTTGGGCTTTTTTTGCGAAATCAGTGGGaa > 2:843588/1‑150 (MQ=255) ttCGCGATGTGGCGAAAATTGTGGAGGTTGCTCGCTCTGGTGTGGTCGGACTTTCGCGCGGCGATAAAATAATGCGTTGAGAATGATCTCAATGCGCAATTTACAGCCCAACATGTCACGTTGGGCTTTTTTTGCGAAATCAGTGGGAAc > 1:541522/1‑150 (MQ=255) ttCGCGATGTGGCGAAAATTGTGGAGGTTGCTCGCTCTGGTGTGGTCGGACTTTCGCGCGGCGATAAAATAATGCGTTGAGAATGATCTCAATGCGCAATTTACAGCCCAACATGTCACGTTGGGCTTTTTTTGCGAAATCAGTGGGAAc > 2:149082/1‑150 (MQ=255) cgATGTGGCGAAAATTGTGGAGGTTGCTCGCTCTGGTGTGGTCGGACTTTCGCGCGGCGATAAAATAATGCGTTGAGAATGATCTCAATGCGCAATTTACAGCCCAACATGTCACGTTGGGCTTTTTTTGCGAAATCAGTGGGAACCTgg < 1:1079565/150‑1 (MQ=255) aTGTGGCGAAAATTGTGGAGGTTGCTCGCTCTGGTGTGGTCGGACTTTCGCGCGGCGATAAAATAATGCGTTGAGAATGATCTCAATGCGCAATTTACAGCCCAACATGTCACGTTGGGCTTTTTTTGCGAAATCAGTGGGAACCTGGaa < 2:358279/150‑1 (MQ=255) ggCGAAAATTGTGGAGGTTGCTCGCTCTGGTGTGGTCGGACTTTCGCGCGGCGATAAAATAATGCGTTGAGAATGATCTCAATGCGCAATTTACAGCCCAACATGTCACGTTGGGCTTTTTTTGCGAAATCAGTGGGAACCTGGAATaaa > 2:435439/1‑150 (MQ=255) gCGAAAATTGTGGAGGTTGCTCGCTCTGGTGTGGTCGGACTTTCGCGCGGCGATAAAATAATGCGTTGAGAATGATCTCAATGCGCAATTTACAGCCCAACATGTCACGTTGGGCTTTTTTTGCGAAATCAGTGGGAACCTGGAATaaaa < 1:991912/150‑1 (MQ=255) cGAAAATTGTGGAGGTTGCTCGCTCTGGTGTGGTCGGACTTTCGCGCGGCGATGAAATAATTCGTTGAGAATGATCTCAATGCGCAATTTACAGCCCAACATGTCACGTTGGGCTTTTTTTGCGAAATCAGTGGGAACCTGGAATAAAAg > 1:206926/1‑150 (MQ=255) cGAAAATTGTGGAGGTTGCTCGCTCTGGTGTGGTCGGACTTTCGCGCGGCGATAAAATAATGCGTTGAGAATGATCTCAATGCGCAATTTACAGCCCAACATGTCACGTTGGGCTTTTTTTGCGAAATCAGTGGGAACCTGGAATAAAAg > 1:1493315/1‑150 (MQ=255) cGAAAATTGTGGAGGTTGCTCGCTCTGGTGTGGTCGGACTTTCGCGCGGCGATAAAATAATGCGTTGAGAATGATATCAATTCGCAATTTACAGCACAACATGTCACGTTGGGCTTTTTTTTCGAAATCAGTGGGAAACTGGAATaaaaa > 2:779559/1‑149 (MQ=255) aTTGTGGAGGTTGCTCGCTCTGGTGTGGTCGGACTTTCGCGCGGCGATAAAATAATGCGTTGAGAATGATCTCAATGCGCAATTTACAGCCCAACATGTCACGTTGGGCTTTTTTTGCGAAATCAGTGGGAACCTGGAATAAAAGCAGtt > 1:551490/1‑150 (MQ=255) gAGGTTGCTCGCTCTGGTGTGGTCGGACTTTCGCGCGGCGATAAAATAATGCGTTGAGAATGATCTCAATGCGCAATTTACAGCCCAACATGTCACGTTGGGCTTTTTTTGCGAAATCAGTGGGAACCTGGAATAAAAGCAGTTGCCGCa < 1:321428/150‑1 (MQ=255) ggTTGCTCGCTCTGGTGTGGTCGGACTTTCGCGCGGCGATAAAATAATGCGTTGAGAATGATCTCAATGCGCAATTTACAGCCCAACATGTCACGTTGGGCTTTTTTTGCGAAATCAGTGGGAACCTGGAATAAAAGCAGTTGCCGCAGt > 2:1515052/1‑150 (MQ=255) gTTGCTCGCTCTGGTGTGGTCGGACTTTCGCGCGGCGATAAAATAATGCGTTGAGAATGATCTCAATGCGCAATTTACAGCCCAACATGTCACGTTGGGCTTTTTTTGCGAAATCAGTGGGAACCTGGAATAAAAGCAGTTGCCGCAGtt < 1:1367412/150‑1 (MQ=255) ctcgctcTGGTGTGGTCGGACTTTCGCGCGGCGATAAAATAATGCGTTGAGAATGATCTCAATGCGCAATTTACAGCCCAACATGTCACGTTGGGCTTTTTTTGCGAAATCAGTGGGAACCTGGAATAAAAGCAGTTGCCGCAGTTAAtt > 1:102559/1‑150 (MQ=255) ctcgctcTGGTGTGGTCGGACTTTCGCGCGGCGATAAAATAATGCGTTGAGAATGATCTCAATGCGCAATTTACAGCCCAACATGTCACGTTGGGCTTTTTTTGCGAAATCAGTGGGAACCTGGAATAAAAGCAGTTGCCGCAGTTAAtt > 1:22039/1‑150 (MQ=255) ctcgctcTGGTGTGGTCGGACTTTCGCGCGGCGATAAAATAATGCGTTGAGAATGATCTCAATGCGCAATTTACAGCCCAACATGTCACGTTGGGCTTTTTTTGCGAAATCAGTGGGAACCTGGAATAAAAGCAGTTGCCGCAGTTAAtt > 1:765201/1‑150 (MQ=255) ctcgctcTGGTGTGGTCGGACTTTCGCGCGGCGATAAAATAATGCGTTGAGAATGATCTCAATGCGCAATTTACAGCCCAAAATGTCACGTTGGGCTTTTTTTGCGAAATCAGTGGGAACCTGGAATAAAAGCAGTTGCCGCAGTTAAtt > 1:1462049/1‑150 (MQ=255) tcgctcTGTTGTTGTCGGACTTTCGCGCTGCTATAAAATAATGCGTTGAGAATGATCTCAATGCGCAATTTACAGCCCAACATGTCACGTTGGGCTTTTTTTGCGAAATCAGTGGGAACCTGGAATAAAAGCAGTTGCCGCAGTTAAttt < 1:663400/150‑1 (MQ=255) tcgctcTGGTGTGGTCGGACTTTCGCGCGGCGATAAAATAATGCGTTGAGAATGATCTCAATGCGCAATTTACAGCCCAACATGTCACGTTGGGCTTTTTTTGCGAAATCAGTGGGAACCTGGAATAAAAGCAGTTGCCGCAGTTAAttt < 2:1355860/150‑1 (MQ=255) ctctGGTGTGGTCGGACTTTCGCGCGGCGATAAAATAATGCGTTGAGAATGATCTCAATGCGCAATTTACAGCCCAACATGTCACGTTGGGCTTTTTTTGCGAAATCAGTGGGAACCTGGAATAAAAGCAGTTGCCGCAGTTAATTTTCt > 2:936355/1‑150 (MQ=255) tgtgGTCGGACTTTCGCGCGGCGTTAAAATAATGCGTTGAGAATGATCTCAATGCGCAATTTACAGCCCAACATGTCACGTTGGGCTTTTTTTGCGAAATCAGTGGGAACCTGGAATAAAAGCAGTTGCCGCAGTTAATTTTCTGCGCtt < 2:386143/150‑1 (MQ=255) tgtgGTCGGACTTTCGCGCGGCGATAAAATAATGCGTTGAGAATGATCTCAATGCGCAATTTACAGCCCAACATGTCACGTTGGGCTTTTTTTGCGAAATCAGTGGGAACCTGGAATAAAAGCAGTTGCCGCAGTTAATTTTCTGCGCtt < 1:1402715/150‑1 (MQ=255) gtgGTCGGACTTTCGCGCGGCGATAAAATAATGCGTTGAGAATGATCTCAATGCGCAATTTACAGCCCAACATGTCACGTTGGGCTTTTTTTGCGAAATCAGTGGGAACCTGGAATAAAAGCAGTTGCCGCAGTTAATTTTCTGCGCttt > 2:86543/1‑149 (MQ=255) gTCGGACTTTCGCGCGGCGATAAAATAATGCGTTGAGAATGATCTCAATGCGCAATTTACAGCCCAACATGTCACGTTGGGCTTTTTTTGCGAAATCAGTGGGAACCTGGAATAAAAGCAGTTGCCGCAGTTAATTTTCTGCGCTTAGAt > 1:568046/1‑150 (MQ=255) gTCGGACTTTCGCGCGGCGATAAAATAATGCGTTGAGAATGATCTCAATGCGCAATTTACAGCCCAACATGTCACGTTGGGCTTTTTTTGCGAAATCAGTGGGAACCTGGAATAAAAGCAGTTGCCGCAGTTAATTTTCTGCGCTTAGAt > 2:1335569/1‑150 (MQ=255) cGGACTTTCGCGCGGCGATAAAATAATGCGTTGAGAATGATCTCAATGCGCAATTTACAGCCCAACATGTCACGTTGGGCTTTTTTTGCGAAATCAGTGGGAACCTGGAATAAAAGCAGTTGCCGCAGTTAATTTTCTGCGCTTAGATGt > 2:760209/1‑150 (MQ=255) ggACTTTCGCGCGGCGATAAAATAATGCGTTGAGAATGATCTCAATGCGCAATTTACAGCCCAACATGTCACGTTGGGCTTTTTTTGCGAAATCAGTGGGAACCTGGAATAAAAGCAGTTGCCGCAGTTAATTTTCTGCGCTTAGATGtt < 2:120096/150‑1 (MQ=255) ggACTTTCGCGCGGCGATAAAATAATGCGTTGAGAATGATCTCAATGCGCAATTTACAGCCCAACATGTCACGTTGGGCTTTTTTTGCGAAATCAGTGGGAACCTGGAATAAAAGCAGTTGCCGCAGTTAATTTTCTGCGCTTAGATGtt < 1:843588/150‑1 (MQ=255) ggACTTTCGCGCGGCGATAAAATAATGCGTTGAGAATGATCTCAATGCGCAATTTACAGCCCAACATGTCACGTTGGGCTTTTTTTGCGAAATCAGTGGGAACCTGGAATAAAAGCAGTTGCCGCAGTTAATTTTCTGCGCTTAGATGtt < 2:1479293/150‑1 (MQ=255) ttCGCGCGGCGATAAAATAATGCGTTGAGAATGATCTCAATGCGCAATTTACAGCCCAACATGTCACGTTGGGCTTTTTTTGCGAAATCAGTGGGAACCTGGAATAAAAGCAGTTGCCGCAGTTAATTTTCTGCGCTTAGATGTTAATGa < 1:1515052/150‑1 (MQ=255) tCGCGCGGCGATAAAATAATGCGTTGAGAATGATCTCAATGCGCAATTTACAGCCCAACATGTCACGTTGGGCTTTTTTTGCGAAATCAGTGGGAACCTGGAATAAAAGCAGTTGCCGCAGTTAATTTTCTGCGCTTAGATGTTAATGaa > 1:103190/1‑150 (MQ=255) cgcgcgGCGATAAAATAATGCGTTGAGAATGATCTCAATGCGCAATTTACAGCCCAACATGTCACGTTGGGCTTTTTTTGCGAAATCAGTGGGAACCTGGAATAAAAGCAGTTGCCGCAGTTAATTTTCTGCGCTTAGATGTTAATGAAt > 1:971309/1‑150 (MQ=255) gcgATAAAATAATGCGTTGAGAATGATCTCAATGCGCAATTTACAGCCCAACATGTCACGTTGGGCTTTTTTTGCGAAATCAGTGGGAACCTGGAATAAAAGCAGTTGCCGCAGTTAATTTTCTGCGCTTAGATGTTAATGAATTTAAcc < 2:357358/150‑1 (MQ=255) cgATAAAATAATGCGTTGAGAATGATCTCAATGCGCAATTTACAGCCCAACATGTCACGTTGGGCTTTTTTTGCGAAATCAGTGGGAACCTGGAATAAAAGCAGTTGCCGCAGTTAATTTTCTGCGCTTAGATGTTAATGAATTTAAccc < 2:541522/150‑1 (MQ=255) cgATAAAATAATGCGTTGAGAATGATCTCAATGCGCAATTTACAGCCCAACATGTCACGTTGGGCTTTTTTTGCGAAATCAGTGGGAACCTGGAATAAAAGCAGTTGCCGCAGTTAATTTTCTGCGCTTAGATGTTAATGAATTTAAccc < 1:1164963/150‑1 (MQ=255) aaaaTAATGCGTTGAGAATGATCTCAATGCGCAATTTACAGCCCAACATGTCACGTTGGGCTTTTTTTGCGAAATCAGTGGGAACCTGGAATAAAAGCAGTTGCCGCAGTTAATTTTCTGCGCTTAGATGTTAATGAATTTAAACCATAc > 2:795884/1‑150 (MQ=255) aaaTAATGCGTTGAGAATGATCTCAATGCGCAATTTACAGCCCAACATGTCACGTTGGGCTTTTTTTGCGAAATCAGTGGGAACCTGGAATAAAAGCAGTTGCCGCAGTTAATTTTCTGCGCTTAGATGTTAATGAATTTAACCCATAcc > 1:830184/1‑150 (MQ=255) aaaTAATGCGTTGAGAATGATCTCAATGCGCAATTTACAGCCCAACATGTCACGTTGGGCTTTTTTTGCGAAATCAGTGGGAACCTGGAATAAAAGCAGTTGCCGCAGTTAATTTTCTGCGCTTAGATGTTAATGAATTTAACCCATAcc > 2:913322/1‑150 (MQ=255) aaaTAATGCGTTGAGAATGATCTCAATGCGCAATTTACAGCCCAACATGTCACGTTGGGCTTTTTTTGCGAAATCAGTGGGAACCTGGAATAAAAGCAGTTGCCGCAGTTAATTTTCTGCGCTTAGATGTTAATGAATTTAACCCATAcc < 1:1016933/150‑1 (MQ=255) ataatGCGTTGAGAATGATCTCAATGCGCAATTAACAGCCCCACATGTCACGTTGGGCTTTTTTTGCGAAATCAGTGGGAACCTGGAATAAAAGCAGTTGCCGCAGTTAATTTTCTGCGCTTAGATGTTAATGAATTTAACCCATACCAg < 2:1299795/150‑1 (MQ=255) atGCGTTGAGAATGATCTCAATGCGCAATTTACAGCCCAACATGTCACGTTCGGCTTTTTTTGCGAATTCATTTTGAACCTTGAATTATAGCAGTTTGATCAGTTAATTTTCTGCGTTTAGATGTTAATGAATTTAAACCATACCATTAc < 2:1299227/150‑1 (MQ=255) atGCGTTGAGAATGATCTCAATGCGCAATTTACACCCCAACATGTCACGTTGGGCTTTTTTTGCGAAATCAGTGTGAACCTGGAATAATAGCAGTTGCCGCAGTTAATTTTCAGCGGTTAGATGTTAATGAATTTAAGCCTTACCAGTAc < 2:1293949/150‑1 (MQ=255) cGTTGAGAATGATCTCAATGCGCAATTTACAGCCCAACATGTCACGTTGGGCTTTTTTTGCGAAATCAGTGGGAACCTGGAATAAAAGCAGTTGCCGCAGTTAATTTTCTGCGCTTAGATGTTAATGAATTTAACCCATACCAGTACAAt > 2:1058437/1‑150 (MQ=255) tagaATGATCTCAATGCGCAATTTACAGCCCAACATGTCACGTTGGGCTTTTTTTGCGAAATCAGTGGGAACCTGGAATAAAAGCAGTTGCCGCAGTTAATTTTCTGCGCTTAGATGTTAATGAATTTAACCCATACCAGTACAATGGCt < 1:725639/149‑1 (MQ=255) gagaATGATCTCAATGCGCAATTTACAGCCCAACATGTCACGTTGGGCTTTTTTTGCGAAATCAGTGGGAACCTGGAATAAAAGCAGTTGCCGCAGTTAATTTTCTGCGCTTAGATGTTAATGAATTTAACCCATACCAGTACAATGGCt > 2:70265/1‑150 (MQ=255) gATCTCAATGCGCAATTTACAGCCCAACATGTCACGTTGGGCTTTTTTTGCGAAATCAGTGGGAACCTGGAATAAAAGCAGTTGCCGCAGTTAATTTTCTGCGCTTAGATGTTAATGAATTTTACGCTTACCAGTACTATTGATTTGGtt < 2:1393183/150‑1 (MQ=255) gATCTCAATGCGCAATTTACAGCCCAACATGTCACGTTGGGCTTTTTTTGCGAAATCAGTGGGAACCTGGAATAAAAGCAGTTGCCGCAGTTAATTTTCTGCGCTTAGATGTTAATGAATTTAACCCATACCAGTACAATGGCTATGGtt > 1:1058404/1‑150 (MQ=255) ctcAATGCGCAATTTACAGCCCAACATGTCACGTTGGGTTTTTTTTGCGAAATCAGTGGGAACCTGGAATAAAAGCAGTTGCCGCAGTTAATTTTCTGCGCTTAGATGTTAATGAATTTAACCCATACCAGTACAATGGCTATGGttttt < 2:796223/150‑1 (MQ=255) ctcAATGCGCAATTTACAGCCCAACATGTCACGTTGGGCTTTTTTTGCGAAATCAGTGGGAACCTGGAATAAAAGCAGTTGCCGCAGTTAATTTTCTGCGCTTAGATGTTAATGAATTTAACCCATACCAGTACAATGGCTATGGttttt < 1:582668/150‑1 (MQ=255) tcAATGCGCAATTTACAGCCCAACATGTCACGTTGGGCTTTTTTTGCGAAATCAGTGGGAACCTGGAATAAAAGCAGTTGCCGCAGTTAATTTTCTGCGCTTAGATGTTAATGAATTTAACCCATACCAGTACAATGGCTATGGTTTTTa < 1:589669/150‑1 (MQ=255) ctaTGCTCAATTTACAGCCCAACATGTCACGTTTGGCTTTTTTTGCGAAATCAGTGGGAACCTGGAATAAAAGCAGTTGCCTCAGTTAATTTTCTGCGCTTAGATGTTAATGAATTTAAACCATACCAGTACAATGGCTATGGTTTTTAc < 1:779559/148‑1 (MQ=255) cAATGCGCAATTTACAGCCCAACATGTCACGTTGGGCTTTTTTTGCGAAATCAGTGGGAACCTGGAATAAAAGCAGTTGCCGCAGTTAATTTTCTGCGCTTAGATGTTAATGAATTTAACCCATACCAGTACAATGGCTATGGTTTTTAc < 2:987720/150‑1 (MQ=255) cAATGCGCAATTTACAGCCCAACATGTCACGTTGGGCTTTTTTTGCGAAATCAGTGGGAACCTGGAATAAAAGCAGTTGCCGCAGTTAATTTTCTGCGCTTAGATGTTAATGAATTTAACCCATACCAGTACAATGGCTATGGTTTTTAc < 2:568046/150‑1 (MQ=255) aaTGCGCAATTTACAGCCCAACATGTCACGTTGGGCTTTTTTTGCGAAATCAGTGGGAACCTGGAATAAAAGCAGTTGCCGCAGTTAATTTTCTGCGCTTAGATGTTAATGAATTTAACCCATACCAGTACAATGGCTATGGTTTTTACa < 2:1216907/150‑1 (MQ=255) gcgcAATTTACAGCCCAACATGTCACGTTGGGCTTTTTTTGCGAAATCAGTGGGAACCTGGAATAAAAGCAGTTGCCGCAGTTAATTTTCTGCGCTTAGATGTTAATGAATTTAACCCATACCAGTACAATGGCTATGGTTTTTACAttt > 2:135233/1‑150 (MQ=255) aaTTTACAGCCCAACATGTCACGTTGGGCTTTTTTTGCGAAATCAGTGGGAACCTGGAATAAAAGCAGTTGCCGCAGTTAATTTTCTGCGCTTAGATGTTAATGAATTTAACCCATACCAGTACAATGGCTATGGTTTTTACATTTTACg < 2:162993/150‑1 (MQ=255) aaTTTACAGCCCAACATGTCACGTTGGGCTTTTTTTGCGAAATCAGTGGGAACCTGGAATAAAAGCAGTTGCCGCAGTTAATTTTCTGCGCTTAGATGTTAATGAATTTAACCCATACCAGTACAATGGCTATGGTTTTTACATTTTACg < 1:1084320/150‑1 (MQ=255) aTTTACAGCCCAACATGTCACGTTGGGCTTTTTTTGCGAAATCAGTGGGAACCTGGAATAAAAGCAGTTGCCGCAGTTAATTTTCTGCGATTAGATGTTAATGAATTTAACACATACCAGTACAATGGCTATGGTTTTTACATTTTACGc < 2:1493315/150‑1 (MQ=255) tACAGCCCAACATGTCACGTTGGGCTTTTTTTGCGAAATCAGTGGGAACCTGGAATAAAAGCAGTTGCCGCAGTTAATTTTCTGCGCTTAGATGTTAATGAATTTAACCCATACCAGTACAATGGCTATGGTTTTTACATTTTACGCAAg > 1:1255570/1‑150 (MQ=255) aCAGCCCAACATGTCACGTTGGGCTTTTTTTGCGAAATCAGTGGGACCCTGGAATAAAAGCAGTTGCCGCAGTTAATTTTCTGCGCTTAGATGTTAATGAATTTAACCCATACCAGTACAATGGCTATGGTTTTTACATTTTACGCAAgg > 1:1343611/1‑150 (MQ=255) cAGCCCAACATGTCACGTTGGGCTTTTTTTGCGAAATCAGTGGGAACCTGGAATAAAAGCAGTTGCCGCAGTTAATTTTCTGCGCTTAGATGTTAATGAATTTAACCCATACCAGTACAATGGCTATGGTTTTTACATTTTACGCAAggg < 1:999049/150‑1 (MQ=255) aGCCCAACGTGACATGTTGGGCTTTTTTTGCGAAATCAGTGGGAACCTGGAATAAAAGCAGTTGCCGCAGTTAATTTTCTGCGCTTAGATGTTAATGAATTTAACCCATACCAGTACAATGGCTATGGTTTTTACATTTTACGCAAgggg > 2:1506730/1‑150 (MQ=255) aGCCCAACATGTCACGTTGGGCTTTTTTTGCGAAATCAGTGGGAACCTGGAATAAAAGCAGTTGCCGCAGTTAATTTTCTGCGCTTAGATGTTAATGAATTTAACCCATACCAGTACAATGGCTATGGTTTTTACATTTTACGCAAgggg > 1:674995/1‑150 (MQ=255) gCCCAACATGTCACGTTGGGCTTTTTTTGCGAAATCAGTGGGAACCTGGAATAAAAGCAGTTGCCGCAGTTAATTTTCTGCGCTTAGATGTTAATGAATTTAACCCATACCAGTACAATGGCTATGGTTTTTACATTTTACGCAAGGGGc > 2:1470446/1‑150 (MQ=255) gCCCAACATGTCACGTTGGGCTTTTTTTGCGAAATCAGTGGGAACCTGGAATAAAAGCAGTTGCCGCAGTTAATTTTCTGCGCTTAGATGTTAATGAATTTAACCCATACCAGTACAATGGCTATGGTTTTTACATTTTACGCAAGGGGc > 2:1011717/1‑150 (MQ=255) gCCCAACATGTCACGTTGGGCTTTTTTTGCGAAATCAGTGGGAACCTGGAATAAAAGCAGTTGCCGCAGTTAATTTTCTGCGCTTAGATGTTAATGAATTTAACCCATACCAGTACAATGGCTATGGTTTTTACATTTTACGCAAGGGGc > 1:558395/1‑150 (MQ=255) cccAACGTGACATGTTGGGCTTTTTTTGCGAAATCAGTGGGAACCTGGAATAAAAGCAGTTGCCGCAGTTAATTTTCTGCGCTTAGATGTTAATGAATTTAACCCATACCAGTACAATGGCTATGGTTTTTACATTTTACGCAAGGGGCa > 1:1346050/1‑150 (MQ=255) ccAACATGTCACGTTGGGCTTTTTTTGCGAAATCAGTGGGAACCTGGAATAAAAGCAGTTGCCGCAGTTAATTTTCTGCGCTTAGATGTTAATGAATTTAACCCATACCAGTACAATGGCTATGGTTTTTACATTTTACGCAAGGGGCaa > 2:563853/1‑150 (MQ=255) cAACATGTCACGTTGGGCTTTTTTTGCGAAATCAGTGGGAACCTGGAATAAAAGCAGTTGCCGCAGTTAATTTTCTGCGCTTAGATGTTAATGAATTTAACCCATACCAGTACAATGGCTATGGTTTTTACATTTTACGCAAGGGGCAAt < 1:234165/150‑1 (MQ=255) aCATGTCACGTTGGGCTTTTTTTGCGAAATCAGTGGGAACCTGGAATAAAAGCAGTTGCCGCAGTTAATTTTCTGCGCTTAGATGTTAATGAATTTAACCCATACCAGTACAATGGCTATGGTTTTTACATTTTACGCAAGGGGCAATtg > 1:1487544/1‑150 (MQ=255) aTGTCACGTTGGGCTTTTTTTGCGAAATCAGTGGGAACCTGGAATAAAAGCAGTTGCCGCAGTTAATTTTCTGCGCTTAGATGTTAATGAATTTAACCCATACCAGTACAATGGCTATGGTTTTTACATTTTACGCAAGGGGCAATtgtg < 1:922903/150‑1 (MQ=255) | GGCACCAGCGGTAAGCTTGATGCATTTTTAGCATCGATTCGCGATGTGGCGAAAATTGTGGAGGTTGCTCGCTCTGGTGTGGTCGGACTTTCGCGCGGCGATAAAATAATGCGTTGAGAATGATCTCAATGCGCAATTTACAGCCCAACATGTCACGTTGGGCTTTTTTTGCGAAATCAGTGGGAACCTGGAATAAAAGCAGTTGCCGCAGTTAATTTTCTGCGCTTAGATGTTAATGAATTTAACCCATACCAGTACAATGGCTATGGTTTTTACATTTTACGCAAGGGGCAATTGTG > NC_000913/87732‑88030 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |