Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 928,458 | C→T | 10.2% | L246L (TTG→TTA) | cydC ← | glutathione/L‑cysteine ABC exporter subunit CydC |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 928,458 | 0 | C | T | 10.2% | 280.6 / 15.8 | 98 | L246L (TTG→TTA) | cydC | glutathione/L‑cysteine ABC exporter subunit CydC |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (45/43); new base T (6/4); total (51/47) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.43e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.56e-01 |
GGTGCCAGTGCTTCAAACGCGGCTAACGCGCAGAAGACAAACAGGGCAATTAACGCGCCGGGTTGAGCATTGCCGCCAACGCCGCCAGACGCCATCCACAGCATCAGGATCACCGCTAACGCGCCAATGAGCAGCATTATCGCTTGCGACAATGCGGTCAGTTCAGATTGACGGCGTTGCGCTTCCAGCCATTGAATTTCTGTATTCTCTAGTTGCGTGCGATAACGATCGCTGGCACCAAAAATGGTCAGCTCAGCTTGCCCTTGCAGCCAGGCCGTCAGTTGTTGGCGATACTG > NC_000913/928309‑928604 | ggTGCCAGTGCTTCAAACGCGGCTAACGCGCAGAAGACAAACAGGGCAATTAACGCGCCGGGTTGAGCATTGCCGCCAACGCCGCCAGACGCCATCCACAGCATCAGGATCACCGCTAACGCGCCAATGAGCAGCATTATCGCTTGCGAc < 1:310737/150‑1 (MQ=255) ggTGCCAGTGCTTCAAACGCGGCTAACGCGCAGAAGACAAACAGGGCAATTAACGCGCCGGGTTGAGCATTGCCGCCAACGCCGCCAGACGCCATCCACAGCATCAGGATCACCGCTAACGCGCCAATGAGCAGCATTATCGCTTGCGAc < 1:1042870/150‑1 (MQ=255) gTGCCAGTGCTTCAAACGCGGCTAACGCGCAGAAGACAAACAGGGCAATTAACGCGCCGGGTTGAGCATTGCCGCCAACGCCGCCAGACGCCATCCACAGCATCAGGATCACCGCTAACGCGCCAATGAGCAGCGTTATCGCTTGCGACa > 1:1371806/1‑150 (MQ=255) gCCAGTGCTTCAAACGCGGCTAACGCGCAGAAGACAAACAGGGCAATTAACGCGCCGGGTTGAGCATTGCCGCCAACGCCGCCAGACGCCATCCACAGCATCAGGATCACCGCTAACGCGCCAATGAGCAGCATTATCGCTTGCGACAAt < 1:929569/150‑1 (MQ=255) cAGTGCTTCAAACGCGGCTAACGCGCAGAAGACAAACAGGGCAATTAACGCGCCGGGTTGAGCATTGCCGCCAACGCCGCCAGACGCCATCCACAGCATCAGGATCACCGCTAACGCGCCAATGAGCAGCATTATCGCTTGCGACAATGc > 1:1143878/1‑150 (MQ=255) cAGTGCTTCAAACGCGGCTAACGCGCAGAAGACAAACAGGGCAATTAACGCGCCGGGTTGAGCATTGCCGCCAACGCCGCCAGACGCCATCCACAGCATCAGGATCACCGCTAACGCGCCAATGAGCAGCATTATCGCTTGCGACAATGc > 1:1149197/1‑150 (MQ=255) cAGTGCTTCAAACGCGGCTAACGCGCAGAAGACAAACAGGGCAATTAACGCGCCGGGTTGAGCATTGCCGCCAACGCCGCCAGACGCCATCCACAGCATCAGGATCACCGCTAACGCGCCAATGAGCAGCATTATCGCTTGCGACAATGc < 1:1364709/150‑1 (MQ=255) gTGCTTCAAACGCGGCTAACGCGCAGAAGACAAACAGGGCAATTAACGCGCCGGGTTGAGCATTGCCGCCAACGCCGCCAGACGCCATCCACAGCATCAGGATCACCGCTAACGCGCCAATGAGCAGCATTGTCGCAAGCGATAATGctg < 2:1443434/150‑3 (MQ=255) tGCTTCAAACGCGGCTAACGCGCAGAAGACAAACAGGGCAATTAACGCGCCGGGTTGAGCATTGCCGCCAACGCCGCCAGACGCCATCCACAGCATCAGGATCACCGCTAACGCGCCAATGAGCAGCATTGTCGCAAGCGATAATGctgc < 1:1298812/150‑4 (MQ=255) tGCTTCAAACGCGGCTAACGCGCAGAAGACAAACAGGGCAATTAACCCGCCGGGTTGAGCATTGCCGCCAACGCCGCCAGACGCCATCCACAGCATCAGGATCACCGCTAACGCGCCAATGAGCAGCATTGTCGCAAGCGATAATGctgc < 1:1261497/150‑4 (MQ=255) aaCGCGGCTAACGCGCAGAAGACAAACAGGGCAATTAACGCGCCGGGTTGAGCATTGCCGCCAACGCCGCCAGACGCCATCCACAGCATCAGGATCACCGCTAACGCGCCAATGAGCAGCATTATCGCTTGCGACAATGCGGTCAGTTCa > 2:1015722/1‑150 (MQ=255) aaCGCGGCTAACGCGCAGAAGACAAACAGGGCAATTAACGCGCCGGGTTGAGCATTGCCGCCAACGCCGCCAGACGCCATCCACAGCATCAGGATCACCGCTAACGCGCCAATGAGCAGCATTATCGCTTGCGACAATGCGGTCAGTTCa > 1:1447459/1‑150 (MQ=255) gCTAACGCGCAGAAGACAAACAGGGCAATTAACGCGCCGGGTTGAGCATTGCCGCCAACGCCGCCAGACGCCATCCACAGCATCAGGATCACCGCTAACGCGCCAATGAGCAGCATTATCGCTTGCGACAATGCGGTCAGTTCAGATTGa < 1:1522912/150‑1 (MQ=255) cTAACGCGCAGAAGACAAACAGGGCAATTAACGCGCCGGGTTGAGCATTGCCGCCAACGCCGCCAGACGCCATCCACAGCATCAGGATCACCGCTAACGCGCCAATGAGCAGCATTATCGCTTGCGACAATGCGGTCAGTTCAGATTGAc > 1:621068/1‑150 (MQ=255) cTAACGCGCAGAAGACAAACAGGGCAATTAACGCGCCGGGTTGAGCATTGCCGCCAACGCCGCCAGACGCCATCCACAGCATCAGGATCACCGCTAACGCGCCAATGAGCAGCATTATCGCTTGCGACAATGCGGTCAGTTCAGATTGAc > 1:72153/1‑150 (MQ=255) tAACGCGCAGAAGACAAACAGGGCAATTAACGCGCCGGGTTGAGCATTGCCGCCAACGCCGCCAGACGCCATCCACAGCATCAGGATCACCGCTAACGCGCCAATGAGCAGCATTATCGCTTGCGACAATGCGGTCAGTTCAGATTGACg > 1:862594/1‑150 (MQ=255) aaCGCGCAGAAGACAAACAGGGCAATTAACGCGCCGGGTTGAGCATTGCCGCCAACGCCGCCAGACGCCATCCACAGCATCAGGATCACCGCTAACGCGCCAATGAGCAGCATTATCGCTTGCGACAATGCGGTCAGTTCAGATTGACgg < 2:91351/150‑1 (MQ=255) aaCGCGCAGAAGACAAACAGGGCAATTAACGCGCCGGGTTGAGCATTGCCGCCAACGCCGCCAGACGCCATCCACAGCATCAGGATCACCGCTAACGCGCCAATGAGCAGCATTATCGCTTGCGACAATGCGGTCAGTTCAGATTGACgg > 1:1275554/1‑150 (MQ=255) cgcAGAAGACAAACAGGGCAATTAACGCGCCGGGTTGAGCATTGCCGCCAACGCCGCCAGACGCCATCCACAGCATCAGGATCACCGCTAACGCGCCAATGAGCAGCATTATCGCTTGCGACAATGCGGTCAGTTCAGATTGACGGCGtt < 2:190775/150‑1 (MQ=255) cgcAGAAGACAAACAGGGCAATTAACGCGCCGGGTTGAGCATTGCCGCCAACGCCGCCAGACGCCATCCACAGCATCAGGATCACCGCTAACGCGCCAATGAGCAGCATTATCGCTTGCGACAATGCGGTCAGTTCAGATTGACGGCGtt > 1:513814/1‑150 (MQ=255) cAAACAGGGCAATTAACGCGCCGGGTTGAGCATTGCCGCCAACGCCGCCAGACGCCATCCACAGCATCAGGATCACCGCTAACGCGCCAATGAGCAGCATTATCGCTTGCGACAATGCGGTCAGTTCAGATTGACGGCGTTGCGCTTCCa < 1:1129037/150‑1 (MQ=255) aCAGGGCAATTAACGCGCCGGGTTGAGCATTGCCGCCAACGCCGCCAGACGCCATCCACAGCATCAGGATCACCGCTAACGCGCCAATGAGCAGCATTATCGCTTGCGACAATGCGGTCAGTTCAGATTGACGGCGTTGCGCTTCCAGcc > 1:646764/1‑150 (MQ=255) cAATTAACGCGCCGGGTTGAGCATTGCCGCCAACGCCGCCAGACGCCATCCACAGCATCAGGATCACCGCTAACGCGCCAATGAGCAGCATTATCGCTTGCGACAATGCGGTCAGTTCAGATTGACGGCGTTGCGCTTCCAGCCATTGaa < 2:900067/150‑1 (MQ=255) aaTTAACGCGCCGGGTTGAGCATTGCCGCCAACGCCGCCAGACGCCATCCACAGCATCAGGATCACCGCTAACGCGCCAATGAGCAGCATTATCGCTTGCGACAATGCGGTCAGTTCAGATTGACGGCGTTGCGCTTCCAGCCATTGAAt > 2:373703/1‑150 (MQ=255) aTTAACGCGCCGGGTTGAGCATTGCCGCCAACGCCGCCAGACGCCATCCACAGCATCAGGATCACCGCTAACGCGCCAATGAGCAGCATTATCGCTTGCGACAATGCGGTCAGTTCAGATTGACGGCGTTGCGCTTCCAGCCATTGAAtt < 1:1243402/150‑1 (MQ=255) tAACGCGCCGGGTTGAGCATTGCCGCCAACGCCGCCAGACGCCATCCACAGCATCAGGATCACCGCTAACGCGCCAATGAGCAGCATTATCGCTTGCGACAATGCGGTCAGTTCAGATTGACGGCGTTGCGCTTCCAGCCATTGAATTTc < 1:1015722/150‑1 (MQ=255) tAACGCGCCGGGTTGAGCATTGCCGCCAACGCCGCCAGACGCCATCCACAGCATCAGGATCACCGCTAACGCGCCAATGAGCAGCATTATCGCTTGCGACAATGCGGTCAGTTCAGATTGACGGCGTTGCGCTTCCAGCCATTGAATTTc < 2:1447459/150‑1 (MQ=255) aCGCGCCGGGTTGAGCATTGCCGCCAACGCCGCCAGACGCCATCCACAGCATCAGGATCACCGCTAACGCGCCAATGAGCAGCGTTATCGCTTGCGACAATGCGGTCAGTTCAGATTGACGGCGTTGCGCTTCCAGCCATTGAATTTCTg < 2:1371806/150‑1 (MQ=255) cgcgCCGGGTTGAGCATTGCCGCCAACGCCGCCAGACGCCATCCACAGCATCAGGATCACCGCTAACGCGCCAATGAGCAGCATTATCGCTTGCGACAATGCGGTCAGTCCAGATTGACGGCGTTGCGCTTCCAGCCATTGAATTTCTGt > 1:1284215/1‑150 (MQ=255) gcgcCGGGTTGAGCATTGCCGCCAACGCCGCCAGACGCCATCCACAGCATCAGGATCACCGCTAACGCGCCAATGAGCAGCATTATCGCTTGCGACAATGCGGTCAGTTCAGATTGACGGCGTTGCGCTTCCAGCCATTGAATTTCTGTa < 2:1185904/150‑1 (MQ=255) cgcCGGGTTGAGCATTGCCGCCAACGCCGCCAGACGCCATCCACAGCATCAGGATCACCGCTAACGCGCCAATGAGCAGCATTATCGCTTGCGACAATGCGGTCAGTTCAGATTGACGGCGTTGCGCTTCCAGCCATTGAATTTCTGTAt > 1:6350/1‑150 (MQ=255) cGGGTTGAGCATTGCCGCCAACGCCGCCAGACGCCATCCACAGCATCAGGATCACCGCTAACGCGCCAATGAGCAGCATTATCGCTTGCGACAATGCGGTCAGTTCAGATTGACGGCGTTGCGCTTCCAGCCATTGAATTTCTGTATtct < 2:1275554/150‑1 (MQ=255) gggTTGAGCATTGCCGCCAACGCCGCCAGACGCCATCCACAGCATCAGGATCACCGCTAACGCGCCAATGAGCAGCATTATCGCTTGCGACAATGCGGTCAGTTCAGATTGACGGc < 2:131294/116‑1 (MQ=255) gggTTGAGCATTGCCGCCAACGCCGCCAGACGCCATCCACAGCATCAGGATCACCGCTAACGCGCCAATGAGCAGCATTATCGCTTGCGACAATGCGGTCAGTTCAGATTGACGGc > 1:131294/1‑116 (MQ=255) ggTTGAGCATTGCCGCCAACGCCGCCAGACGCCATCCACAGCATCAGGATCACCGCTAACGCGCCAATGAGCAGCATTATCGCTTGCGACAATGCGGTCAGTTCAGATTGACGGCGTTGCGCTTCCAGCCATTGAATTTCTGTATTctct < 1:1505948/150‑1 (MQ=255) ggTTGAGCATTGCCGCCAACGCCGCCAGACGCCATCCACAGCATCAGGATCACCGCTAACGCGCCAATGAGCAGCATTATCGCTTGCGACAATGCGGTCAGTTCAGATTGACGGCGTTGCGCTTCCAGCCATTGAATTTCTGTATTctct < 1:1217466/150‑1 (MQ=255) gAGCATTGCCGCCAACGCCGCCAGACGCCATCCACAGCATCAGGATCACCGCTAACGCGCCAATGAGCAGCATTATCGCTTGCGACAATGTGGTCAGTTCAGATTGACGGCGTTGCGCTTCCAGCCATTGAATTTCTGTATTCTCTAGtt > 1:453980/1‑150 (MQ=255) aGCATTGCCGCCAACGCCGCCAGACGCCATCCACAGCATCAGGATCACCGCTAACGCGCCAATGAGCAGCATTATCGCTTGCGACAATGCGGTCAGTTCAGATTGACGGCGTTGCGCTTCCAGCCATTGAATTTCTGTATTCTCTAGTtg < 1:396907/150‑1 (MQ=255) aGCATTGCCGCCAACGCCGCCAGACGCCATCCACAGCATCAGGATCACCGCTAACGCGCCAATGAGCAGCATTATCGCTTGCGACAATGCGGTCAGTTCAGATTGACGGCGTTGCGCTTCCAGCCATTGAATTTCTGTATTCTCTAGTtg < 2:130526/150‑1 (MQ=255) aGCATTGCCGCCAACGCCGCCAGACGCCATCCACAGCATCAGGATCACCGCTAACGCGCCAATGAGCAGCATTATCGCTTGCGACAATGCGGTCAGTTCAGATTGACGGCGTTGCGCTCCCAGCCATTGAATTTCTGTATTCTCTAGTtg < 1:524730/150‑1 (MQ=255) ttGCCGCCAACGCCGCCAGACGCCATCCACAGCATCAGGATCACCGCTAACGCGCCAATGAGCAGCATTATCGCTTGCGACAATGCGGTCAGTTCAGATTGACGGCGTTGCGCTTCCAGCCATTGAATTTCTGTATTCTCTAGTtgcgtg > 1:1415709/1‑150 (MQ=255) ccgccAACGCCGCCAGACGCCATCCACAGCATCAGGATCACCGCTAACGCGCCAATGAGCAGCATTATCGCTTGCGACAATGCGGTCAGTTCAGATTGACGGCGTTGCGCTTCCAGCCATTGAATTTCTGTATTCTCTAGTTGCGTGCGa > 2:820820/1‑150 (MQ=255) ccgccAGACGCCATCCACAGCATCAGGATCACCGCTAACGCGCCAATGAGCAGCATTATCGCTTGCGACAATGCGGTCAGTTCAGATTGACGGCGTTGCGCTTCCAGCCATTGAATTTCTGTATTCTCTAGTTGCGTGCGATAACGATCg < 1:912901/150‑1 (MQ=255) gccAGACGCCATCCACAGCATCAGGATCACCGCTAACGCGCCAATGAGCAGCATTATCGCTTGCGACAATGCGGTCAGTTCAGATTGACGGCGTTGCGCTTCCAGCCATTGAATTTCTGTATTCTCTAGTTGCGTGCGATAACGATCGCt > 1:1402361/1‑150 (MQ=255) gccAGACGCCATCCACAGCATCAGGATCACCGCTAACGCGCCAATGAGCAGCATTATCGCTTGCGACAATGCGGTCAGTTCAGATTGACGGCGTTGCGCTTCCAGCCATTGAATTTCTGTATTCTCTAGTTGCGTGCGATAACGATCGCt > 1:1459774/1‑150 (MQ=255) cAGACGCCATCCACAGCATCAGGATCACCGCTAACGCGCCAATGAGCAGCATTATCGCTTGCGACAATGCGGTCAGTTCATATTGACGGCGTTGCGCTTCCAGCCATTGAATTTCTGTATTCTCTAGTTGCGTGCGATAACGATCGCTgg < 2:511522/150‑1 (MQ=255) aGACGCCATCCACAGCATCAGGATCACCGCTAACGCGCCAATGAGCAGCATTATCGCTTGCGACAATGTGGTCAGTTCAGATTGACGGCGTTGCGCTTCCAGCCATTGAATTTCTGTATTCTCTAGTTGCGTGCGATAACGATCGCTGGc < 2:453980/150‑1 (MQ=255) gACGCCATCCACAGCATCAGGATCACCGCTAACGCGCCAATGAGCAGCATTATCGCTTGCGACAATGCGGTCAGTTCAGATTGACGGCGTTGCGCTTCCAGCCATTGAATTTCTGTATTCTCTAGTTGCGTGCGATAACGATCGCTGGCa > 1:1056897/1‑150 (MQ=255) gACGCCATCCACAGCATCAGGATCACCGCTAACGCGCCAATGAGCAGCATTATCGCTTGCGACAATGCGGTCAGTTCAGATTGACGGCGTTGCGCTTCCAGCCATTGAATTTCTGTATTCTCTAGTTGCGTGCGATAACGATCGCTGGCa < 2:6350/150‑1 (MQ=255) gACGCCATCCACAGCATCAGGATCACCGCTAACGCGCCAATGAGCAGCATTATCGCTTGCGACAATGCGGTCAGTTCAGATTGACGGCGTTGCGATTCCAGCCATTGAATTTCTGTATTCTCTAGTTGCGTGCGATAACGTTCGCTGTCa < 2:1499237/150‑1 (MQ=255) gCCATCCACAGCATCAGGATCACCGCTAACGCGCCAATGAGCAGCATTATCGCTTGCGACAATGCGGTCAGTTCAGATTGACGGCGTTGCGCTTCCAGCCATTGAATTTCTGTATTCTCTAGTTGCGTGCGATAACGATCGCTGGCACCa > 1:1095052/1‑150 (MQ=255) gCCATCCACAGCATCAGGATCACCGCTAACGCGCCAATGAGCAGCATTATCGCTTGCGACAATGCGGTCAGTTCAGATTGACGGCGTTGCGCTTCCAGCCATTGAATTTCTGTATTCTCTAGTTGCGTGCGATAACGATCGCTGGCACCa > 2:1035156/1‑150 (MQ=255) ccACAGCATCAGGATCACCGCTAACGCGCCAATGAGCAGCATTATCGCTTGCGACAATGCGGTCAGTTCAGATTGACGGCGTTGCGCTTCCAGCCATTGAATTTCTGTATTCTCTAGTTGCGTGCGATAACGATCGCTGGCACCAAAAAt > 2:14576/1‑150 (MQ=255) ccACAGCATCAGGATCACCGCTAACGCGCCAATGAGCAGCATTATCGCTTGCGACAATGCGGTCAGTTCAGATTGACGGCGTTGCGCTTCCAGCCATTGAATTTCTGTATTCTCTAGTTGCGTGCGATAACGATCGCTGGCACCAAAAAt < 2:1262351/150‑1 (MQ=255) ccACAGCATCAGGATCACCGCTAACGCGCCAATGAGCAGCATTATCGCATGCGACAAAGCGGTCAGTTCAGATTGACGGCGTTGCGCTTCCAGCCATTGAATTTCTGTATTCTCTAGTTGCGTGCGATAACGATCGCTGGCACCAAAAAt > 2:779047/1‑150 (MQ=255) ccACAGCATAAGGATCACCGCTAACGCGCCAATCAGCAGCATTATCGCTTGCGACAATGCGGTCAGTTCAGATTGACGGCGTTGCGCTTCCAGCCATTGAATTTCTGTATTCTCTAGTTGCGTGCGATAACGATCGCTGGCACCAAAAAt > 2:335831/1‑150 (MQ=255) cacaGCATCAGGATCACCGCTAACGCGCCAATGAGCAGCATTATCGCTTGCGACAATGCGGTCAGTTCAGATTGACGGCGTTGCGCTTCCAGCCATTGAATTTCTGTATTCTCTAGTTGCGTGCGATAACGCTCGCTGGCACCAAAAATg > 2:879270/1‑150 (MQ=255) aGCATCAGGATCACCGCTAACGCGCCAATGAGCAGCATTATCGCTTGCGACAATGCGGTCAGTTCAGATTGACGGCGTTGCGCTTCCAGCCTTTGAATTTCTGTATTCTCTAGTTGCGTGCGATAACGATCGCTGGCACCAAAAATGGtc < 1:1075060/150‑1 (MQ=255) gCATCAGGATCACCGCTAACGCGCCAATGAGCAGCATTATCGCTTGCGACAATGCGGTCAGTTCAGATTGACGGCGTTGCGCTTCCAGCCATTGAATTTCTGTATTCTCTAGTTGCGTGCGATAACGATCGCTGGCACCAAAAATGGtca < 1:694242/150‑1 (MQ=255) gCATCAGGATCACCGCTAACGCGCCAATGAGCAGCATTATCGCTTGCGACAATGCGGTCAGTTCAGATTGACGGCGTTGCGCTTCCAGCCATTGAATTTCTGTATTCTCTAGTTGCGTGCGATAACGATCGCTGGCACCAAAAATGGtca > 1:462019/1‑150 (MQ=255) aTCAGGATCACCGCTAACGCGCCAATGAGCAGCATTATCGCTTGCGACAATGCGGTCAGTTCAGATTGACGGCGTTGCGCTTCCAGCCATTGAATTTCTGTATTCTCTAGTTGCGTGCGATAACGATCGCTGGCACCAAAAATGTtcagc < 2:646764/150‑1 (MQ=255) aTCACCGCTAACGCGCCAATGAGCAGCATTATCGCTTGCGACAATGCGGTCAGTTCAGATTGACGGCGTTGCGCTTCCAGCCATTGAATTTCTGTATTCTCTAGTTGCGTGCGATAACGATCGCTGGCACCAAAAATGGTcagctcagct < 2:513814/150‑1 (MQ=255) cACCGCTAACGCGCCAATGAGCAGCATTATCGCTTGCGACAATGCGGTCAGTTCAGATTGACGGCGTTGCGCTTCCAGCCATTGAATTTCTGTATTCTCTAGTTGCGTGCGATAACGATCGCTGGCACCAAAAATGGTCAGCTCAGCTTg < 2:462019/150‑1 (MQ=255) ccGCTAACGCGCCAATGAGCAGCATTATCGCTTGCGACAATGCGGTCAGTTCAGATTGACGGCGTTGCGCTTCCAGCCATTGAATTTCTGTATTCTCTAGTTGCGTGCGATAACGATCGCTGGCACCAAAAATGGTCAGCTCAGCTTGcc > 1:1455502/1‑150 (MQ=255) 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aTGAGCAGCATTATCGCTTGCGACAATGCGGTCAGTTCAGATTGACGGCGTTGCGCTTCCAGCCATTGAATTTCTGTATTCTCTAGTTGCGTGCGATAACGATCGCTGGCACCAAAAATGGTCAGCTCAGCTTGCCCTTGCAGCCAGGcc > 2:1299462/1‑150 (MQ=255) tGAGCAGCATTATCGCTTGCGACAATGCGGTCAGTTCAGATTGACGGCGTTGCGCTTCCAGCCATTGAATTTCTGTATTCTCTAGTTGCGTGCGATAACGATCGCTGGCACCAAAAATGGTCAGCTCAGCTTGCCCTTGCAGCCAGGccn < 1:73669/150‑2 (MQ=255) gAGCAGCATTATCGCTTGCGACAATGCGGTCAGTTCAGATTGACGGCGTTGCGCTTCCAGCCATTGAATTTCTGTATTCTCTAGTTGCGTGCGATAACGATCGCTGGCACCAAAAATGGTCAGCTCAGCTTGCCCTTGCa < 2:697220/140‑1 (MQ=255) gAGCAGCATTATCGCTTGCGACAATGCGGTCAGTTCAGATTGACGGCGTTGCGCTTCCAGCCATTGAATTTCTGTATTCTCTAGTTGCGTGCGATAACGATCGCTGGCACCAAAAATGGTCAGCTCAGCTTGCCCTTGCa > 1:697220/1‑140 (MQ=255) agcagcATTATCGCTTGCGACAATGCGGTCAGTTCAGATTGACGGCGTTGCGCTTCCAGCCATTGAATTTCTGTATTCTCTAGTTGCGTGCGATAACGATCGCTGGCACCAAAAATGGTCAGCTCAGCTTGCCCTTGCAGCCAGGCCGTc > 2:1014026/1‑150 (MQ=255) ccgcaTTGTCGCAAGCGATAATGCGGTCAGTTCAGATTGACGGCGTTGCGCTTCCAGCCATTGAATTTCTGTATTCTCTAGTTGCGTGCGATAACGATCGCTGGCACCAAAAATGGTCAGCTCAGCTTGCCCTTGCAGCCAGGCCGTCAg > 2:47486/3‑150 (MQ=255) ccgcaTTGTCGCAAGCGATAATGCGGTCAGTTCAGATTGAAGGAGTTGCGATTCCAGCAATTGAATTTCTGTATTCTCTAGTTGCGTGCGATAACGATCGCTGGCACCAACAATGGTCAGCTCAGCTTGCCCTTGCAGCCAGGGCGTCAg > 2:968275/3‑150 (MQ=255) cagcaTTATCGCTTGCGACAATGCGGTCAGTTCAGATTGACGGCGTTGCGCTTCCAGCCATTGAATTTCTGTATTCTCTAGTTGCGTGCGATAACGATCGCTGGCACCAAAAATGGTCAGCTCAGCTTGCCCTTGCAGCCAGGCCGTCAg < 1:335831/150‑1 (MQ=255) cagcaTTATCGCTTGCGACAATGCGGTCAGTTCAGATTGACGGCGTTGCGCTTCCAGCCATTGAATTTCTGTATTCTCTAGTTGCGTGCGATAACGATCGCTGGCACCAAAAATGGTCAGCTCAGCTTGCCCTTGCAGCCAGGCCGTCAg < 1:100634/150‑1 (MQ=255) cagcaTTATCGCTTGCGACAATGCGGTCAGTTCAGATTGACGGCGTTGCGCTTCCAGCCATTGAATTTCTGTATTCTCTAGTTGCGTGCGATAACGATCGCTGGCACCAAAAATGGTCAGCTCAGCTTGCCCTTGCAGCCAGGCCGTCAg < 2:773138/150‑1 (MQ=255) cgcaTTGTCGCAAGCGATAATGCGGTCAGTTCAGATTGACGGCGTTGCGCTTCCAGCCATTGAATTTCTGTATTCTCTAGTTGCGTGCGATAACGATCGCTGGCACCAAAAATGGTCAGCTCAGCTTGCCCTTGCAGCCAGGCCGTCAgt > 2:369050/2‑150 (MQ=255) agcaTTATCGCTTGCGACAATGCGGTCAGTTCAGATTGACGGCGTTGCGCTTCCAGCCATTGAATTTCTGTATTCTCTAGTTGCGTGCGATAACGATCGCTGGCACCAAAAATGGTCAGCTCAGCTTGCCCTTGCAGCCAGGCCGTCAgt > 2:30023/1‑150 (MQ=255) agcaTTATCGCTTGCGACAATGCGGTCAGTTCAGATTGACGGCGTTGCGCTTCCAGCCATTGAATTTCTGTATTCTCTAGTTGCGTGCGATAACGATCGCTGGCACCAAAAATGGTCAGCTCAGCTTGCCCTTGCAGCCAGGCCGTCAgt > 1:619220/1‑150 (MQ=255) agcaTTATCGCTTGCGACAATGCGGTCAGTTCAGATTGACGGCGTTGCGCTTCCAGCCATTGAATTTCTGTATTCTCTAGTTGCGTGCGATAACGATCGCTGGCACCAAAAATGGTCAGCTCAGCTTGCCCTTGCAGCCAGGCCGTCAgt < 2:1402361/150‑1 (MQ=255) agcaTTATCGCTTGCGACAATGCGGTCAGTTCAGATTGACGGCGTTGCGCTTCCAGCCATTGAATTTCTGTATTCTCTAGTTGCGTGCGATAACGATCGCTGGCACCAAAAATGGTCAGCTCAGCTTGCCCTTGCAGCCAGGCCGTCAgt > 1:1442452/1‑150 (MQ=255) gcaTTGTCGCAAGCGATAATGCGGTCAGTTCAGATTGACGGCGTTGCGCTTCCAGCCATTGAATTTCTGTATTCTCTAGTTGCGTGCGATAACGATCGCTGGCACCAAAAATGGTCAGCTCAGCTTGCCCTTGCAGCCAGGCCGTc < 2:1482320/146‑1 (MQ=255) gcaTTGTCGCAAGCGATAATGCGGTCAGTTCAGATTGACGGCGTTGCGCTTCCAGCCATTGAATTTCTGTATTCTCTAGTTGCGTGCGATAACGATCGCTGGCACCAAAAATGGTCAGCTCAGCTTGCCCTTGCAGCCAGGCCGTc > 1:1482320/1‑146 (MQ=255) gcaTTGTCGCAAGCGATAATGCGGTCAGTTCAGATTGACGGCGTTGCGCTTCCAGCCATTGAATTTCTGTATTCTCTAGTTGCGTGCGATAACGATCGCTGGCACCAAAAATGGTCAGCTCAGCTTGCCCTTGCAGCCAGGCCGTCAgtt > 2:1387/1‑150 (MQ=255) gcaTTGTCGCAAGCGATAATGCGGTCAGTTCAGATTGACGGCGTTGCGCTTCCAGCCATTGAATTTCTGTATTCTCTAGTTGCGTGCGATAACGATCGCTGGCACCAAAAATGGTCAGCTCAGCTTGCCCTTGCAGCCAGGCCGTCAgtt > 1:151875/1‑150 (MQ=255) gcaTTATCGCTTGCGACAATGCGGTCAGTTCAGATTGACGGCGTTGCGCTTCCAGCCATTGAATTTCTGTATTCTCTAGTTGCGTGCGATAACGATCGCTGGCACCAAAAATGGTCAGCTCAGCTTGCCCTTGCAGCCAGGCCGTCAgtt > 2:817207/1‑150 (MQ=255) caTTATCGCTTGCGACAATGCGGTCAGTTCAGATTGACGGCGTTGCGCTTCCAGCCATTGAATTTCTGTATTCTCTAGTTGCGTGCGATAACGATCGCTGGCACCAAAAATGGTCAGCTCAGCTTGCCCTTGCAGCCAGGCCGTCAgttg < 1:503177/150‑1 (MQ=255) caTTATCGCTTGCGACAATGCGGTCAGTTCAGATTGACGGCGTTGCGCTTCCAGCCATTGAATTTCTGTATTCTCTAGTTGCGTGCGATAACGATCGCTGGCACCAAAAATGGTCAGCTCAGCTTGCCCTTGCAGCCAGGCCGTCAgttg < 1:1035156/150‑1 (MQ=255) ttATCGCTTGCGACAATGCGGTCAGTTCAGATTGACGGCGTTGCGCGTCCAGCCATTGAATTTCTGTATTCTCTAGTTGCGTGCGATAACGATCGCTGGCACCAAAAATGGTCAGCTCAGCTTGCCCTTGCAGCCAGGCCGTCAgtggtt > 2:651030/1‑150 (MQ=255) tCGCTTGCGACAATGCGGTCAGTTCAGATTGACGGCGTTGCGCTTCCAGCCATTGAATTTCTGTATTCTCTAGTTGCGTGCGATAACGATCGCTGGCACCAAAAATGGTCAGCTCAGCTTGCCCTTGCAGCCAGGCCGTCAGTTGTTGGc > 1:933778/1‑150 (MQ=255) tCGCTTGCGACAATGCGGTCAGTCCAGATTGACGGCGTTGCGCTTCCAGCCATTGAATTTCTGTATTCTCTAGTTGCGTGCGATAACGATCGCTGGCACCAAAAATGGTCAGCTCAGCTTGCCCTTGCAGCCAGGCCGTCAGTTGTTGGc < 2:1284215/150‑1 (MQ=255) gCTTGCGACAATGCGGTCAGTTCAGATTGACGGCGTTGCGCTTCCAGCCATTGAATTTCTGTATTCTCTAGTTGCGTGCGATAACGATCGCTGGCACCAAAAATGGTCAGCTCAGCTTGCCCTTGCAGCCAGGCCGTCAGTTGTTGGCGa > 1:269028/1‑150 (MQ=255) gCTTGCGACAATGCGGTCAGTTCAGATTGACGGCGTTGCGCTTCCAGCCATTGAATTTCTGTATTCTCTAGTTGCGTGCGATAACGATCGCTGGCACCAAAAATGGTCAGCTCAGCTTGCCCTTGCAGCCAGGCCGTCAGTTGTTGGCGa > 1:1271149/1‑150 (MQ=255) tGCGACAATGCGGTCAGTTCAGATTGACGGCGTTGCGCTTCCAGCCATTGAATTTCTGTATTCTCTAGTTGCGTGCGATAACGATCGCTGGCACCAAAAATGGtcagctc > 1:926521/1‑110 (MQ=255) tGCGACAATGCGGTCAGTTCAGATTGACGGCGTTGCGCTTCCAGCCATTGAATTTCTGTATTCTCTAGTTGCGTGCGATAACGATCGCTGGCACCAAAAATGGtcagctc < 2:926521/110‑1 (MQ=255) gCGACAATGCGGTCAGTTCAGATTGACGGCGTTGCGCTTCCAGCCATTGAATTTCTGTATTCTCTAGTTGCGTGCGATAACGATCGCTGGCACCAAAAATGGTCAGCTCAGCTTGCCCTTGCAGCCAGGCCGTCAGTTGTTGGCGATACt > 1:1060626/1‑150 (MQ=255) cGACAATGCGGTCAGTTCAGATTGACGGCGTTGCGCTTCCAGCCATTGAATTTCTGTATTCTCTAGTTGCGTGCGATAACGATCGCTGGCACCAAAAATGGTCAGCTCAGCTTGCCCTTGCAGCCAGGCCGTCAGTTGTTGGCGATACTg > 2:1188932/1‑150 (MQ=255) | GGTGCCAGTGCTTCAAACGCGGCTAACGCGCAGAAGACAAACAGGGCAATTAACGCGCCGGGTTGAGCATTGCCGCCAACGCCGCCAGACGCCATCCACAGCATCAGGATCACCGCTAACGCGCCAATGAGCAGCATTATCGCTTGCGACAATGCGGTCAGTTCAGATTGACGGCGTTGCGCTTCCAGCCATTGAATTTCTGTATTCTCTAGTTGCGTGCGATAACGATCGCTGGCACCAAAAATGGTCAGCTCAGCTTGCCCTTGCAGCCAGGCCGTCAGTTGTTGGCGATACTG > NC_000913/928309‑928604 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |