| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 1,145,792 | G→A | 5.0% | A285T (GCA→ACA) | rluC → | 23S rRNA pseudouridine(955/2504/2580) synthase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 1,145,792 | 0 | G | A | 5.0% | 257.9 / 2.0 | 79 | A285T (GCA→ACA) | rluC | 23S rRNA pseudouridine(955/2504/2580) synthase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (41/34); new base A (2/2); total (43/36) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.96e-01 | |||||||||||
CCCGGTAACAGGGCGTACTCACCAGATCCGTGTGCATACACAATATGCGGGTCATCCGATTGCCTTTGACGATCGCTACGGTGACCGTGAATTTGACAGGCAGCTCACTGAAGCAGGCACGGGATTAAATCGCCTGTTCCTGCACGCTGCAGCGTTGAAGTTTACTCATCCGGGGACCGGTGAGGTGATGCGTATCGAAGCTCCGATGGATGAAGGTTTGAAGCGTTGTTTGCAAAAGCTGCGTAACGCGCGCTAATACAAGCATATAAACCTGATAATGGGCGGTTGGC > NC_000913/1145644‑1145933 | cccGGTAACAGGGCGTACTCACCAGATCCGTGTGCATACACAATATGCGGGTCATCCGATTGCCTTTGACGATCGCTACGGTGACCGTGAATTTGACAGGCAGCTCACTGAAGCAGGCACGGGATTAAATCGCCTGTTCCTGCACGCTGc < 1:1276632/150‑1 (MQ=255) tAACAGGGCGTACTCACCAGATCCGTGTGCATACACAATATGCGGGTCATCCGATTGCCTTTGACGATCGCTACGGTGACCGTGAATTTGACAGGCAGCTCACTGAAGCAGGCACGGGATTAAATCGCCTGTTCCTGCACGCTGCAGCGt < 2:59375/150‑1 (MQ=255) cAGGGCGTACTCACCAGATCCGTGTGCATACACAATATGCGGGTCATCCGATTGCCTTTGACGATCGCTACGGTGACCGTGAATTTGACAGGCAGCTCACTGAAGCAGGCACGGGATTAAATCGCCTGTTCCTGCACGCTGCAGCGTTGa > 2:9303/1‑150 (MQ=255) cAGGGCGTACTCACCAGATCCGTGTGCATACACAATATGCGGGTCATCCGATTGCCTTTGACGATCGCTACGGTGACCGTGAATTTGACAGGCAGCTCACTGAAGCAGGCACGGGATTAAATCGCCTGTTCCTGCACGCTGCAGCGTTGa > 1:1172436/1‑150 (MQ=255) cAGGGCGTACTCACCAGATCCGTGTGCATACACAATATGCGGGTCATCCGATTGCCTTTGACGATCGCTACGGTGACCGTGAATTTGACAGGCAGCTCACTGAAGCAGGCACGGGATTAAATCGCCTGTTCCTGCACGCTACAGCGTTGa > 2:353588/1‑150 (MQ=255) cAGGGCGTACTCACCAGATCCGTGTGCATACACAATATGCGGGTCATCCGATTGCCTTTGACGATCGCTACGGTGACCGTGAATTTGACAGGCAGCTCACTGAAGCAGGCACGGGATTAAATCGCCTGTTCCTGCACGCTACAGCGTTGa > 2:359177/1‑150 (MQ=255) gggCGTACTCACCAGATCCGTGTGCATACACAATATGCGGGTCATCCGATTGCCTTTGACGATCGCTACGGTGACCGTGAATTTGACAGGCAGCTCACTGAAGCAGGCACGGGATTAAATCGCCTGTTCCTGCACGCTGCAGCGTTGAAg < 1:1272231/150‑1 (MQ=255) aCTCACCAGATCCGTGTGCATACACAATATGCGGGTCATCCGATTGCCTTTGACGATCGCTACGGTGGCCGTGAATTTGACAGGCAGCTCACTGAAGCAGGCACGGGATTAAATCGCCTGTTCCTGCACGCTGCAGCGTTGAAGTTTACt < 1:961233/150‑1 (MQ=255) cACCAGATCCGTGTGCATACACAATATGCGGGTCATCCGATTGCCTTTGACGATCGCTACGGTGACCGTGAATTTGACAGGCAGCTCACTGAAGCAGGCACGGGATTAAATCGCCTGTTCCTGCACGCTGCAGCGTTGAAGTTTACTCAt > 2:567212/1‑150 (MQ=255) aGATCCGTGTGCATAAACAATATGCGGGTCATCCGATTGCCTTTGACGATCGCTACGGTGACCGTGAATTTGACAGGCAGCTCACTGAAGCAGGCACGGGATTAAATCGCCTGTTCCTGCACGCTGCAGCGTTGAAGTTTACTCATCCgg < 2:236736/150‑1 (MQ=255) gATCCGTGTGCATACACAATATGCGGGTCATCCGATTGCCTTTGACGATCGCTACGGTGACCGTGAATTTGACAGGCAGCTCACTGAAGCAGGCACGGGATTAAATCGCCTGTTCCTGCACGCTGCAGCGTTGAAGTTTACTCATCCggg > 2:774324/1‑150 (MQ=255) gATCCGTGTGCATACACAATATGCGGGTCATCCGATTGCCTTTGACGATCGCTACGGTGACCGTGAATTTGACAGGCAGCTCACTGAAGCAGGCACGGGATTAAATCGCCTGTTCCTGCACGCTGCAGCGTTGAAGTTTACTCATCCggg > 2:484960/1‑150 (MQ=255) tCCGTGTGCATACACAATATGCGGGTCATCCGATTGCCTTTGACGATCGCTACGGTGACCGTGAATTTGACAGGCAGCTCACTGAAGCAGGCACGGGATTAAATCGCCTGTTCCTGCACGCTGCAGCGTTGa < 2:987511/132‑1 (MQ=255) tCCGTGTGCATACACAATATGCGGGTCATCCGATTGCCTTTGACGATCGCTACGGTGACCGTGAATTTGACAGGCAGCTCACTGAAGCAGGCACGGGATTAAATCGCCTGTTCCTGCACGCTGCAGCGTTGa > 1:987511/1‑132 (MQ=255) cGTGTGCATACACAATATGCGGGTCATCCGATTGCCTTTGACGATCGCTACGGTGACCGTGAATTTGACAGGCAGCTCACTGAAGCAGGCACGGGATTAAATCGCCTGTTCCTGCACGCTGCAGCGTTGAAGTTTACTCATCCGGGGAcc > 2:804042/1‑150 (MQ=255) cGTGTGCATACACAATATGCGGGTCATCCGATTGCCTTTGACGATCGCTACGGTGACCGTGAATTTGACAGGCAGCTCACTGAAGCAGGCACGGGATTAAATCGCCTGTTCCTGCACGCTGCAGCGTTGAAGTTTACTCATCCGGGGAcc < 1:748655/150‑1 (MQ=255) tgCATACACAATATGCGGGTCATCCGATTGCCTTTGACGATCGCTACGGTGACCGTGAATTTGACAGGCAGCTCACTGAAGCAGGCACGGGATTAAATCGCCTGTTCCTGCACGCTGCAGCGTTGAAGTTTACTCATCCGGGGACCggtg > 2:586808/1‑150 (MQ=255) gCATACACAATATGCGGGTCATCCGATTGCCTTTGACGATCGCTACGGTGACCGTGAATTTGACAGGCAGCTCACTGAAGCAGGCACGGGATTAAATCGCCTGTTCCTGCACGCTGCAGCGTTGAAGTTTACTCATCCGGGGACCggtga > 2:687247/1‑150 (MQ=255) gCATACACAATATGCGGGTCATCCGATTGCCTTTGACGATCGCTACGGTGACCGTGAATTTGACAGGCAGCTCACTGAAGCAGGCACGGGATTAAATCGCCTGTTCCTGCACGCTGCAGCGTTGAAGTTTACTCATCCGGGGACCggtga > 2:739784/1‑150 (MQ=255) gCATACACAATATGCGGGTCATCCGATTGCCTTTGACGATCGCTACGGTGACCGTGAATTTGACAGGCAGCTCACTGAAGCAGGCACGGGATTAAATCGCCTGTTCCTGCACGCTGCAGCGTTGAAGTTTACTCATCCGGGGACCggtga < 1:1438996/150‑1 (MQ=255) tACACAATATGCGGGTCATCCGATTGCCTTTGACGATCGCTACGGTGACCGTGAATTTGACAGGGAGCTCACTGAAGCAGGCACGGGATTAAATCGCCTGTTCCTGCACGCTGCAGCGTTGAAGTTTACTCATCCGGGGACCggtgaggt < 2:419833/150‑1 (MQ=255) tACACAATATGCGGGTCATCCGATTGCCTTTGACGATCGCTACGGTGACCGTGAATTTGACAGGCAGCTCACTGAAGCAGGCACGGGATTAAATCGCCTGTTCCTGCACGCTGCAGCGTTGAAGTTTACTCATCCGGGGACCggtgaggt < 1:1010861/150‑1 (MQ=255) tACACAATATGCGGGTCATCCGATTGCCTTTGACGATCGCTACGGTGACCGTGAATTTGACAGGCAGCTCACTGAAGCAGGCACGGGATTAAATCGCCTGTTCCTGCACGCTGCAGCGTTGAAGTTTACTCATCCGGGGACCggtgaggt > 1:235843/1‑150 (MQ=255) cacaATATGCGGGTCATCCGATTGCCTTTGACGATCGCTACGGTGACCGTGAATTTGACAGGCAGCTCACTGAAGCAGGCACGGGATTAAATCGCCTGTTCCTGCACGCTGCAGCGTTGAAGTTTACTCATCCGGGGACCggtgaggtga > 2:1414055/1‑150 (MQ=255) acaATATGCGGGTCATCCGATTGCCTTTGACGATCGCTACGGTGACCGTGAATTTGACAGGCAGCTCACTGAAGCAGGCACGGGATTAAATCGCCTGTTCCTGCACGCTGCAGCGTTGAAGTTTACTCATCCGGGGACCGGTGAGGTGAt > 1:1009593/1‑150 (MQ=255) gCGGGTCATCCGATTGCCTTTGACGATCGCTACGGTGACCGTGAATTTGACAGGCAGCTCACTGAAGCAGGCACGGGATTAAATCGCCTGTTCCTGCACGCTGCAGCGTTGAAGTTTACTCATCCGGGGACCGGTGAGGTGATGCGTATc < 1:519348/150‑1 (MQ=255) gggTCATCCGATTGCCTTTGACGATCGCTACGGTGACCGTGAATTTGACAGGCAGCTCACTGAAGCAGGCACGGGATTAAATCGCCTGTTCCTGCACGCTGCAGCGTTGAAGTTTACTCATCCGGGGACCGGTGAGGTGATGCGTATCGa > 1:252146/1‑150 (MQ=255) tCATCCGATTGCCTTTGACGATCGCTACGGTGACCGTGAATTTGACAGACAGCTCACTGAAGCAGGCACGGGATTAAATCGCCTGTTCCTGCACGCTGCAGCGTTGAAGTTTACTCATCCGGGGACCGGTGAGGTGATGCGTATCGAAGc < 2:789056/150‑1 (MQ=255) aTCCGATTGCCTTTGACGATCGCTACGGTGACCGTGAATTTGACAGGCAGCTCACTGAAGCAGGCACGGGATTAAATCGCCTGTTCCTGCACGCTGCAGCGTTGAAGTTTACTCATCCGGGGACCGGTGAGGTGATGCGTATCGAAGCTc < 1:9303/150‑1 (MQ=255) ccGATTGCCTTTGACGATCGCTACGGTGACCGTGAATTTGACAGGCAGCTCACTGAAGCAGGCACGGGATTAAATCGCCTGTTCCTGCACGCTGCAGCGTTGAAGTTTACTCATCCGGGGACCGGTGAGGTGATGCGTATCGAAGCTCCg < 2:107054/150‑1 (MQ=255) gATTGCCTTTGACGATCGCTACGGTGACCGTGAATTTGACAGGCAGCTCACTGAAGCAGGCACGGGATTAAATCGCCTGTTCCTGCACGCTGCAGCGTTGAAGTTTACTCATCCGGGGACCGGTGAGGTGATGCGTATCGAAGCTCCgat < 1:774324/150‑1 (MQ=255) ttGCCTTTGACGATCGCTACGGTGACCGTGAATTTGACAGGCAGCTCACTGAAGCAGGCACGGGATTAAATCGCCTGTTCCTGCACGCTGCAGCGTTGAAGTTTACTCATCCGGGGACCGGTGAGGTGATGCGTATCGAAGCTCCgatgg < 2:400566/150‑1 (MQ=255) tGCCTTTGACGATCGCTACGGTGACCGTGAATTTGACAGGCAGCTCACTGAAGCAGGCACGGGATTAAATCGCCTGTTCCTGCACGCTGCAGCGTTGAAGTTTACTCATCCGGGGACCGGTGAGGTGATGCGTATCGAAGCTCCgatgga > 1:296782/1‑150 (MQ=255) ccTTTGACGATCGCTACGGTGACCGTGAATTTGACAGGCAGCTCACTGAAGCAGGCACGGGATTAAATCGCCTGTTCCTGCACGCTGCAGCGTTGAAGTTTACTCATCCGGGGACCGGTGAGGTGATGCGTATCGAAGCTCCgatggatg > 2:363793/1‑150 (MQ=255) gATCGCTACGGTGACCGTGAATTTGACAGGCAGCTCACTGAAGCAGGCACGGGATTAAATCGCCTGTTCCTGCACGCTGCAGCGTTGAAGTTTACTCATCCGGGGACCGGTGAGGTGATGCGTATCGAAGCTCCGATGGATGAAGGTTTg < 2:1111218/150‑1 (MQ=255) gTGACCGTGAATTTGACAGGCAGCTCACTGAAGCAGGCACGGGATTAAATCGCCTGTTCCTGCACGCTGCAGCGTTGAAGTTTACTCATCCGGGGACCGGTGAGGTGATGCGTATCGAAGCTCCGATGGATGAAGGTTTGAAGCgttgtt > 1:212223/1‑150 (MQ=255) tGACCGTGAATTTGACAGGCAGCTCACTGAAGCAGGCACGGGATTAAATCGCCTGTTCCTGCACGCTGCAGCGTTGAAGTTTACTCATCCGGGGACCGGTGAGGTGATGCGTATCGAAGCTCCGATGGATGAAGGTTTGAAGCGTTGttt > 1:292380/1‑150 (MQ=255) ccGTGAATTTGACAGGCAGCTCACTGAAGCAGGCACGGGATTAAATCGCCTGTTCCTGCACGCTGCAGCGTTGAAGTTTACTCATCCGGGGACCGGTGAGGTGATGCGTATCGAAGCTCCGATGGATGAAGGTTTGAAGCGTTGTTTGCa < 2:296782/150‑1 (MQ=255) cGTGAATTTGACAGGCAGCTCACTGAAGCAGGCACGGGATTAAATCGCCTGTTCCTGCACGCTGCAGCGTTGAAGTTTACTCATCCGGGGACCGGTGAGGTGATGCGTATCGAAGCTCCGATGGATGAAGGTTTGAAGCGTTGTTTGCaa > 1:64450/1‑150 (MQ=255) cGTGAATTTGACAGGCAGCTCACTGAAGCAGGCACGGGATTAAATCGCCTGTTCCTGCACGCTGCAGCGTTGAAGTTTACTCATCCGGGGACCGGTGAGGTGATGCGTATCGAAGCTCCGATGGATGAAGGTTTGAAGCGTTGTTTGCaa > 2:1118199/1‑150 (MQ=255) tGAATTTGACAGGCAGCTCACTGAAGCAGGCACGGGATTAAATCGCCTGTTCCTGCACGCTGCAGCGTTGAAGTTTACTCATCCGGGGACCGGTGAGGTGATGCGTATCGAAGCTCCGATGGATGAAGGTTTGAAGCGTTGTTTGCaaaa > 2:337173/1‑150 (MQ=255) tGACAGGCAGCTCACTGAAGCAGGCACGGGATTAAATCGCCTGTTCCTGCACGCTGCAGCGTTGAAGTTTACTCATCCGGGGACCGGTGAGGTGATGCGTATCGAAGCTCCGATGGATGAAGGTTTGAAGCGTTGTTTGCAAAAGCTGCg > 2:553044/1‑150 (MQ=255) tGACAGGCAGCTCACTGAAGCAGGCACGGGATTAAATCGCCTGTTCCTGCACGCTGCAGCGTTGAAGTTTACTCATCCGGGGACCGGTGAGGTGATGCGTATCGAAGCTCCGATGGATGAAGGTTTGAAGCGTTGTTTGCAAAAGCTGCg > 1:930444/1‑150 (MQ=255) cAGGCAGCTCACTGAAGCAGGCACGGGATTAAATCGCCTGTTCCTGCACGCTGCAGCGTTGAAGTTTACTCATCCGGGGACCGGTGAGGTGATGCGTATCGAAGCTCCGATGGATGAAGGTTTGAAGCGTTGTTTGCAAAAGCTGCGTaa > 1:1021307/1‑150 (MQ=255) cAGGCAGCTCACTGAAGCAGGCACGGGATTAAATCGCCTGTTCCTGCACGCTGCAGCGTTGAAGTTTACTCATCCGGGGACCGGTGAGGTGATGCGTATCGAAGCTCCGATGGATGAAGGTTTGAAGCGTTGTTTGCAAAAGCTGCGTaa > 2:616417/1‑150 (MQ=255) aGGCAGCTCACTGAAGCAGGCACGGGATTAAATCGCCTGTTCCTGCACGCTGCAGCGTTGAAGTTTACTCATCCGGGGACCGGTGAGGTGATGCGTATCGAAGCTCCGATGGATGAAGGTTTGAAGCGTTGTTTGCAAAAGCTGCGTAAc > 2:187166/1‑150 (MQ=255) ggCAGCTCACTGAAGCAGGCACGGGATTAAATCGCCTGTTCCTGCACGCTGCAGCGTTGAAGTTTACTCATCCGGGGACCGGTGAGGTGATGCGTATCGAAGCTCCGATGGATGAAGGTTTGAAGCGTTGTTTGCAAAAGCTGCGTAAcg > 2:746631/1‑150 (MQ=255) gCAGCTCACTGAAGCAGGCACGGGATTAAATCGCCTGTTCCTGCACGCTGCAGCGTTGAAGTTTACTCATCCGGGGACCGGTGAGGTGATGCGTATCGAAGCTCCGATGGATGAAGGTTTGAAGCGTTGTTTGCAAAAGCTGCGTAAcgc > 1:1312693/1‑150 (MQ=255) aGCTCACTGAAGCAGGCACGGGATTAAATCGCCTGTTCCTGCACGCTGCAGCGTTGAAGTTTACTCATCCGGGGACCGGTGAGGTGATGCGTATCGAAGCTCCGATGGATGAAGGTTTGAAGCGTTGTTTGCAAAAGCTGCGTAAcgcgc > 1:699552/1‑150 (MQ=255) gCTCACTGAAGCAGGCACGGGATTAAATCGCCTGTTCCTGCACGCTGCAGCGTTGAAGTTTACTCATCCGGGGACCGGTGAGGTGATGCGTATCGAAGCTCCGATGGATGAAGGTTTGAAGCGTTGTTTGCAAAAGCTGCGTAAcgcgcg < 1:215246/150‑1 (MQ=255) 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cTGAAGCAGGCACGGGATTAAATCGCCTGTTCCTGCACGCTGCAGCGTTGAAGTTTACTCATCCGGGGACCGGTGAGGTGATGCGTATCGAAGCTCCGATGGATGAAGGTTTGAAGCGTTGTTTGCAAAAGCTGCGTAACGCGCGCTAAt < 2:428984/150‑1 (MQ=255) gAAGCAGGCACGGGATTAAATCGCCTGTTCCTGCACGCTGCAGCGTTGAAGTTTACTCATCCGGGGACCGGTGAGGTGATGCGTATCGAAGCTCCGATGGATGAAGGTTTGAAGCGTTGTTTGCAAAAGCTGCGTAACGCGCGCTAATAc > 1:286286/1‑150 (MQ=255) aGCAGGCACGGGATTAAATCGCCTGTTCCTGCACGCTGCAGCGTTGAAGTTTACTCATCCGGGGACCGGTGAGGTGATGCGTATCGAAGCTCCGATGGATGAAGGTTTGAAGCGTTGTTTGCAAAAGCTGCGTAACGCGCGCTAATACaa < 2:212223/150‑1 (MQ=255) aGGCACGGGATTAAATCGCCTGTTCCTGCACGCTGCAGCGTTGAAGTTTACTCATCCGGGGACCGGTGAGGTGATGCGTATCGAAGCTCCGATGGATGAAGGTTTGAAGCGTTGTTTGCAAAAGCTGCGTAACGCGCGCTAATACAAGCa < 1:586808/150‑1 (MQ=255) ggCACGGGATTAAATCGCCTGTTCCTGCACGCTGCAGCGTTGAAGTTTACTCATCCGGGGACCGGTGAGGTGATGCGTATCGAAGCTCCGATGGATGAAGGTTTGAAGCGTTGTTTGCAAAAGCTGCGTAACGCGCGCTAATACAAGCa > 2:1506971/1‑149 (MQ=255) ggCACGGGATTAAATCGCCTGTTCCTGCACGCTGCAGCGTTGAAGTTTACTCATCCGGGGACCGGTGAGGTGATGCGTATCGAAGCTCCGATGGATGAAGGTTTGAAGCGTTGTTTGCAAAAGCTGCGTAACGCGCGCTAATACAAGCa < 1:1506971/149‑1 (MQ=255) cACGGGATTAAATCGCCTGTTCCTGCACGCTGCAGCGTTGAAGTTTACTCATCCGGGGACCGGTGAGGTGATGCGTATCGAAGCTCCGATGGATGAAGGGTTGAAGCGTTTTTTGCAAAAGCTGCGTAACGCGCGCTAATACAAGCatat > 1:819565/1‑150 (MQ=255) aCGGGATTAAATCGCCTGTTCCTGCACGCTGCAGCGTTGAAGTTTACTCATCCGGGGACCGGTGAGGTGATGCGTATCGAAGCTCCGATGGATGAAGGTTTGAAGCGTTGTTTGCAAAAGCTGCGTAACGCGCGCTAATACAAGCAtata > 2:736376/1‑150 (MQ=255) cGGGATTAAATCGCCTGTTCCTGCACGCTGCAGCGTTGAAGTTTACTCATCCGGGGACCGGTGAGGTGATGCGTATCGAAGCTCCGATGGATGAAGGTTTGAAGCGTTGTTTGCAAAAGCTGCGTAACGCGCGCTAATACAAGCATATaa > 2:1112610/1‑150 (MQ=255) gggATTAAATCGCCTGTTCCTGCACGCTGCAGCGTTGAAGTTTACTCATCCGGGGACCGGTGAGGTGATGCGTATCGAAGCTCCGATGGATGAAGGTTTGAAGCGTTGTTTGCAAAAGCTGCGTAACGCGCGCTAATACAAGCATATaaa > 2:481268/1‑150 (MQ=255) ggATTAAATCGCCTGTTCCTGCACGCTGCAGCGTTGAAGTTTACTCATCCGGGGACCGGTGAGGTGATGCGTATCGAAGCTCCGATGGATGAAGGTTTGAAGCGTTGTTTGCAAAAGCTGCGTAACGCGCGCTAATACAAGCATATAAAc < 1:337173/150‑1 (MQ=255) aTTAAATCGCCTGTTCCTGCACGCTGCAGCGTTGAAGTTTACTCATCCGGGGACCGGTGAGGTGATGCGTATCGAAGCTCCGATGGATGAAGGTTTGAAGCGTTGTTTGCAAAAGCTGCGTAACGCGCGCTAATACAAGCATATAAACCt < 1:363793/150‑1 (MQ=255) tAAATCGCCTGTTCCTGCACGCTGCAGCGTTGAAGTTTACTCATCCGGGGACCGGTGAGGTGATGCGTATCGAAGCTCCGATGGATGAAGGTTTGAAGCGTTGTTTGCAAAAGCTGCGTAACGCGCGCTAATACAAGCATATAAACCTGa > 1:1262978/1‑150 (MQ=255) tCGCCTGTTCCTGCACGCTGCAGCGTTGAAGTTTACTCATCCGGGGACCGGTGAGGTGATGCGTATCGAAGCTCCGATGGATGAAGGTTTGAAGCGTTGTTTGCAAAAGCTGCGTAACGCGCGCTAATACAAGCATATAAACCTGATAAt < 1:563571/150‑1 (MQ=255) gCCTGTTCCTGTACGCTGCAGCGTTGAAGTTTACTCATCCGGGGACCGGTGAGGTGATGCGTATCGAAGCGCCGATGGATGAAGGTTTGAAGCGTTGTTTGCAAAAGCTGCGTAACGCGCGCTAATACAAGCATATAAACCTGATAATgg < 2:776886/150‑1 (MQ=255) gCCTGTTCCTGCACGCTGCAGCGTTGAAGTTTACTCATCCGGGGACCGGTGAGGTGATGCGTATCGAAGCTCCGATGGATGAAGGTTTGAAGCGTTGTTTGCAAAAGCTGCGTAACGCGCGCTAATACAAGCATATAAACCTGATAATgg > 1:589402/1‑150 (MQ=255) cTGTTCCTGCACGCTGCAGCGTTGAAGTTTACTCATCCGGGGACCGGTGAGGTGATGCGTATCGAAGCTCCGATGGATGAAGGTTTGAAGCGTTGTTTGCAAAAGCTGCGTAACGCGCGCTAATACAAGCATATAAACCTGATAATGGGc < 1:687247/150‑1 (MQ=255) cTGTTCCTGCACGCTACAGCGTTGAAGTTTACTCATCCGGGGACCGGTGAGGTGATGCGTATCGAAGCTCCGATGGATGAAGGTTTGAAGCGTTGTTTGCAAAAGCTGCGTAACGCGCGCTAATACAAGCATATAAACCTGATAATGGGc < 1:353588/150‑1 (MQ=255) cTGTTCCTGCACGCTACAGCGTTGAAGTTTACTCATCCGGGGACCGGTGAGGTGATGCGTATCGAAGCTCCGATGGATGAAGGTTTGAAGCGTTGTTTGCAAAAGCTGCGTAACGCGCGCTAATACAAGCATATAAACCTGATAATGGGc < 1:359177/150‑1 (MQ=255) ccTGCACGCTGCAGCGTTGAAGTTTACTCATCCGGGGACCGGTGAGGTGATGCGTATCGAAGCTCCGATGGATGAAGGTTTGAAGCGTTGTTTGCAAAAGCTGCGTAACGCGCGCTAATACAAGCATATAAACCTGATAATGGGCGGTTg > 2:911185/1‑150 (MQ=255) cTGCACGCTGCAGCGTTGAAGTTTACTCATCCGGGGACCGGTGAGGTGATGCGTATCGAAGCTCCGATGGATGAAGGTTTGAAGCGTTGTTTGCAAAAGCTGCGTAACGCGCGCTAATACAAGCATATAAACCTGATAATGGGCGGTTgg < 1:553044/150‑1 (MQ=255) cTGCACGCTGCAGCGTTGAAGTTTACTCATCCGGGGACCGGTGAGGTGATGCGTATCGAAGCTCCGATGGATGAAGGTTTGAAGCGTTGTTTGCAAAAGCTGCGTAACGCGCGCTAATACAAGCATATAAACCTGATAATGGGCGGTTgg < 1:391078/150‑1 (MQ=255) tGCACGCTGCAGCGTTGAAGTTTACTCATCCGGGGACCGGTGAGGTGATGCGTATCGAAGCTCCGATGGATGAAGGTTTGAAGCGTTGTTTGCAAAAGCTGCGTAACGCGCGCTAATACAAGCATATAAACCTGATAATGGGCGGTTGGc < 2:879972/150‑1 (MQ=255) cgCACGCTGCAGCGTTGAAGGTTACTCATCCGGGGACCGGTGAGGTGACGCGTATCGAAGCTCCGATGGATGAAGGTTTGAAGCGTTGTTTGCAAAAGCTGCGTAACGCGCGCTAATACAAGCATATAAACCTGATAATGGGCGGTTGGc < 2:233680/149‑1 (MQ=255) | CCCGGTAACAGGGCGTACTCACCAGATCCGTGTGCATACACAATATGCGGGTCATCCGATTGCCTTTGACGATCGCTACGGTGACCGTGAATTTGACAGGCAGCTCACTGAAGCAGGCACGGGATTAAATCGCCTGTTCCTGCACGCTGCAGCGTTGAAGTTTACTCATCCGGGGACCGGTGAGGTGATGCGTATCGAAGCTCCGATGGATGAAGGTTTGAAGCGTTGTTTGCAAAAGCTGCGTAACGCGCGCTAATACAAGCATATAAACCTGATAATGGGCGGTTGGC > NC_000913/1145644‑1145933 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |