| Predicted mutation | |||||||
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_000913 | 1,211,612 | 0 | A | T | 11.9% | 352.5 / 30.0 | 125 | intergenic (+35/+68) | icdC/iraM | protein IcdC/anti‑adaptor protein IraM, inhibitor of sigma(S) proteolysis |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (64/46); new base T (10/5); total (74/51) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.88e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.91e-01 | |||||||||||
Only 100 of 138 total aligned reads displayed.
TATGGAAGGCGCAATCAATGCCAAGACCGTAACTTATGACTTCGAACGTCTGATGGAAGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCATCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGAAACGGGCGTATAACACGCCCGTTGTTTTATTTATGTGGATATTATTAATAGCATATCGAGCATATTTATATGAAGCCCATTACTTGAGCCCATATGGGCATATTTTTATAATGCAACTATTATGTAAACATTTATTTGTTATTTTGCTTTCTCCTGGAGGA > NC_000913/1211463‑1211761 | tATGGAAGGCTCAATCAATGCCAAGACCGTAACTTATGACTTCGAACGTCTGATGGAAGGCGCTAAGCTGATGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCATCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGAAACGGGCGtata < 2:974197/150‑1 (MQ=255)tATGGAAGGCGCAATCAATGCCAAGACCGTAACTTATGACTTCGAACGTCTGATGGAAGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCATCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGAAACGGGCGtata > 1:1037131/1‑150 (MQ=255) ggAAGGCGCAATCAATGCCAAGACCGTAACTTATGACTTCGAACGTCTGATGGAAGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCATCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGAAACGGGCGTATAaca > 1:247993/1‑150 (MQ=255) 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taACACGCCCGTTGTTTTATTTATGTGGATATTATTAATAGCATATCGAGCATATTTATATCAAGCCCATTACTTGAGCCCATATGGGCATATTTTTATAATGCAAATATTATGTAAACATTTATTTGTTTTTTTGCTTTCTACTggagg > 1:1450904/1‑150 (MQ=255) aaCACGCCCGTTGTTTTATTTATGTGGATATTATTAATAGCATATCGAGCATATTTATATGAAGCCCATTACTTGAGCCCATATGGGCATATTTTTATAATGCAACTATTATGTAAACATTTATTTGTTATTTTGCTTTCTCCTggagga < 1:1139953/150‑1 (MQ=255) | TATGGAAGGCGCAATCAATGCCAAGACCGTAACTTATGACTTCGAACGTCTGATGGAAGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCATCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGAAACGGGCGTATAACACGCCCGTTGTTTTATTTATGTGGATATTATTAATAGCATATCGAGCATATTTATATGAAGCCCATTACTTGAGCCCATATGGGCATATTTTTATAATGCAACTATTATGTAAACATTTATTTGTTATTTTGCTTTCTCCTGGAGGA > NC_000913/1211463‑1211761 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |